TRD/qaRec/run.C

   1 // Steer TRD QA train for Reconstruction (Clusterizer, Tracking and PID).
   2 //
   3 // Usage:
   4 //   run.C(tasks, files)
   5 //   tasks : "ALL" or one/more of the following:
   6 //     "EFF"  : TRD Tracking Efficiency
   7 //     "EFFC" : TRD Tracking Efficiency Combined (barrel + stand alone) - only in case of simulations
   8 //     "RES"  : TRD tracking Resolution
   9 //     "CLRES": clusters Resolution
  10 //     "CAL"  : TRD calibration
  11 //     "ALGN" : TRD alignment
  12 //     "PID"  : TRD PID - pion efficiency
  13 //     "PIDR" : TRD PID - reference data
  14 //     "DET"  : Basic TRD Detector checks
  15 //     "NOFR" : Data set does not have AliESDfriends.root
  16 //     "NOMC" : Data set does not have Monte Carlo Informations (real data), so all tasks which rely
  17 //              on MC information are switched off
  18 //
  19 // In compiled mode :
  20 // Don't forget to load first the libraries
  21 // gSystem->Load("libMemStat.so")
  22 // gSystem->Load("libMemStatGui.so")
  23 // gSystem->Load("libANALYSIS.so")
  24 // gSystem->Load("libTRDqaRec.so")
  25 // gSystem->Load("libNetx.so") ;
  26 // gSystem->Load("libRAliEn.so");
  27 //
  28 // Authors:
  29 //   Alex Bercuci (A.Bercuci@gsi.de)
  30 //   Markus Fasel (m.Fasel@gsi.de)
  31
  32 #ifndef __CINT__
  33 #include <Riostream.h>
  34
  35 #include "TStopwatch.h"
  36 #include "TMemStat.h"
  37 #include "TMemStatViewerGUI.h"
  38
  39 #include "TROOT.h"
  40 #include "TSystem.h"
  41 #include "TError.h"
  42 #include "TChain.h"
  43 #include "TGrid.h"
  44 #include "TAlienCollection.h"
  45 #include "TGridCollection.h"
  46 #include "TGridResult.h"
  47
  48 #include "AliMagFMaps.h"
  49 #include "AliTracker.h"
  50 #include "AliLog.h"
  51 #include "AliCDBManager.h"
  52 #include "AliGeomManager.h"
  53 #include "AliAnalysisManager.h"
  54 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
  55 #include "AliMCEventHandler.h"
  56 #include "AliESDInputHandler.h"
  57
  58 #include "TRD/AliTRDtrackerV1.h"
  59 #include "TRD/AliTRDcalibDB.h"
  60 #include "TRD/qaRec/AliTRDtrackInfo/AliTRDeventInfo.h"
  61 #include "TRD/qaRec/AliTRDtrackInfoGen.h"
  62 #include "TRD/qaRec/AliTRDtrackingEfficiency.h"
  63 #include "TRD/qaRec/AliTRDtrackingEfficiencyCombined.h"
  64 #include "TRD/qaRec/AliTRDtrackingResolution.h"
  65 #include "TRD/qaRec/AliTRDcalibration.h"
  66 #include "TRD/qaRec/AliTRDalignmentTask.h"
  67 #include "TRD/qaRec/AliTRDpidChecker.h"
  68 #include "TRD/qaRec/AliTRDpidRefMaker.h"
  69 #include "TRD/qaRec/AliTRDcheckDetector.h"
  70 #include "TRD/qaRec/AliTRDclusterResolution.h"
  71 #endif
  72
  73 #include "run.h"
  74
  75 Bool_t MEM = kFALSE;
  76
  77 TChain* MakeChainLST(const char* filename = 0x0);
  78 TChain* MakeChainXML(const char* filename = 0x0);
  79 void run(Char_t *tasks="ALL", const Char_t *files=0x0)
  80 {
  81   TMemStat *mem = 0x0;
  82   if(MEM){
  83     gSystem->Load("libMemStat.so");
  84     gSystem->Load("libMemStatGui.so");
  85     mem = new TMemStat("new, gnubuildin");
  86     mem->AddStamp("Start");
  87   }
  88
  89   TStopwatch timer;
  90   timer.Start();
  91
  92   if(gSystem->Load("libANALYSIS.so")<0) return;
  93   if(gSystem->Load("libTRDqaRec.so")<0) return;
  94
  95   Bool_t fHasMCdata = kTRUE;
  96   Bool_t fHasFriends = kTRUE;
  97   TObjArray *tasksArray = TString(tasks).Tokenize(" ");
  98
  99   Int_t fSteerTask = 0; SETBIT(fSteerTask, kInfoGen);
 100   for(Int_t isel = 0; isel < tasksArray->GetEntriesFast(); isel++){
 101     TString s = (dynamic_cast<TObjString *>(tasksArray->UncheckedAt(isel)))->String();
 102     if(s.CompareTo("ALL") == 0){
 103       for(Int_t itask = 1; itask < NQATASKS; itask++) SETBIT(fSteerTask, itask);
 104       continue;
 105     } else if(s.CompareTo("NOFR") == 0){
 106       fHasFriends = kFALSE;
 107     } else if(s.CompareTo("NOMC") == 0){
 108       fHasMCdata = kFALSE;
 109     } else {
 110       Bool_t foundOpt = kFALSE;
 111       for(Int_t itask = 1; itask < NTRDTASKS; itask++){
 112         if(s.CompareTo(fgkTRDtaskOpt[itask]) != 0) continue;
 113         SETBIT(fSteerTask, itask);
 114         foundOpt = kTRUE;
 115         break;
 116       }
 117       if(!foundOpt) Info("run.C", Form("Task %s not implemented (yet).", s.Data()));
 118     }
 119   }
 120   // extra rules for calibration tasks
 121   if(TSTBIT(fSteerTask, kClErrParam)) SETBIT(fSteerTask, kResolution);
 122   if(TSTBIT(fSteerTask, kPIDRefMaker)) SETBIT(fSteerTask, kPIDChecker);
 123   if(TSTBIT(fSteerTask, kAlignment)) SETBIT(fSteerTask, kResolution);
 124
 125   // define task list pointers;
 126   AliTRDrecoTask *taskPtr[NTRDTASKS], *task = 0x0;
 127   memset(taskPtr, 0, NTRDTASKS*sizeof(AliAnalysisTask*));
 128
 129   //____________________________________________//
 130   // DEFINE DATA CHAIN
 131   TChain *chain = 0x0;
 132   if(!files) chain = MakeChainLST();
 133   else{
 134     TString fn(files);
 135     if(fn.EndsWith("xml")) chain = MakeChainXML(files);
 136     else chain = MakeChainLST(files);
 137   }
 138   if(!chain) return;
 139
 140   //chain->SetBranchStatus("*", 0);
 141   chain->SetBranchStatus("*FMD*",0);
 142   chain->SetBranchStatus("*Calo*",0);
 143   chain->SetBranchStatus("Tracks", 1);
 144   chain->SetBranchStatus("ESDfriend*",1);
 145   chain->Lookup();
 146   chain->GetListOfFiles()->Print();
 147   printf("\n ----> CHAIN HAS %d ENTRIES <----\n\n", (Int_t)chain->GetEntries());
 148
 149   AliLog::SetGlobalLogLevel(AliLog::kError);
 150
 151   //____________________________________________
 152   // Make the analysis manager
 153   AliAnalysisManager *mgr = new AliAnalysisManager("TRD QA Reconstruction Manager");
 154   //mgr->SetSpecialOutputLocation(source); // To Be Changed
 155   AliVEventHandler *esdH = 0x0, *mcH = 0x0;
 156   mgr->SetInputEventHandler(esdH = new AliESDInputHandler);
 157   if(fHasMCdata) mgr->SetMCtruthEventHandler(mcH = new AliMCEventHandler());
 158   //mgr->SetDebugLevel(10);
 159
 160   //____________________________________________
 161   // TRD track summary generator
 162   mgr->AddTask(task = new AliTRDtrackInfoGen());
 163   taskPtr[(Int_t)kInfoGen] = task;
 164   task->SetDebugLevel(1);
 165   task->SetMCdata(fHasMCdata);
 166   // Create containers for input/output
 167   AliAnalysisDataContainer *cinput1 = mgr->CreateContainer("data", TChain::Class(), AliAnalysisManager::kInputContainer);
 168   AliAnalysisDataContainer *coutput1 = mgr->CreateContainer("trackInfo", TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kExchangeContainer);
 169   AliAnalysisDataContainer *coutput1a = mgr->CreateContainer("eventInfo", AliTRDeventInfo::Class(), AliAnalysisManager::kExchangeContainer);
 170   mgr->ConnectInput( task, 0, cinput1);
 171   mgr->ConnectOutput(task, 0, coutput1);
 172   mgr->ConnectOutput(task, 1, coutput1a);
 173
 174   //____________________________________________
 175   // TRD detector checker
 176         if(TSTBIT(fSteerTask, kCheckDetector)){
 177     mgr->AddTask(task = new AliTRDcheckDetector());
 178     taskPtr[(Int_t)kCheckDetector] = task;
 179     task->SetDebugLevel(4);
 180     task->SetMCdata(fHasMCdata);
 181
 182     // Create containers for input/output
 183     mgr->ConnectInput( task, 0, coutput1);
 184     mgr->ConnectInput( task, 1, coutput1a);
 185     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 186   }
 187
 188   //____________________________________________
 189   // TRD barrel tracking efficiency
 190   if(fHasMCdata && TSTBIT(fSteerTask, kTrackingEff)){
 191     mgr->AddTask(task = new AliTRDtrackingEfficiency());
 192     taskPtr[(Int_t)kTrackingEff] = task;
 193     task->SetDebugLevel(0);
 194
 195     //Create containers for input/output
 196     mgr->ConnectInput( task, 0, coutput1);
 197     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 198   }
 199
 200   //____________________________________________
 201   // TRD combined tracking efficiency
 202   if(fHasMCdata && TSTBIT(fSteerTask, kTrackingEffMC)){
 203     mgr->AddTask(task = new AliTRDtrackingEfficiencyCombined());
 204     taskPtr[(Int_t)kTrackingEffMC] = task;
 205     task->SetDebugLevel(0);
 206
 207     // Create containers for input/output
 208     mgr->ConnectInput( task, 0, coutput1);
 209     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 210   }
 211
 212   //____________________________________________
 213   // TRD tracking resolution
 214   if(TSTBIT(fSteerTask, kResolution)){
 215     mgr->AddTask(task = new AliTRDtrackingResolution());
 216     taskPtr[(Int_t)kResolution] = task;
 217     task->SetMCdata(fHasMCdata);
 218     task->SetPostProcess(kFALSE);
 219     task->SetDebugLevel(1);
 220
 221     // Create containers for input/output
 222     mgr->ConnectInput( task, 0, coutput1);
 223     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 224
 225     // Create output containers for calibration tasks
 226     const Int_t nc = 5;
 227     const Char_t *cn[nc] = {"Cl", "TrkltY", "TrkltPhi", "ClMC", "TrkltYMC"};
 228     AliAnalysisDataContainer *co[nc];
 229     for(Int_t ic = 0; ic<nc; ic++){
 230       co[ic] = mgr->CreateContainer(Form("%s%s", task->GetName(), cn[ic]), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kExchangeContainer);
 231       mgr->ConnectOutput(task, 1+ic, co[ic]);
 232     }
 233
 234     // test reconstruction calibration plugin
 235     if(TSTBIT(fSteerTask, kClErrParam)){
 236       mgr->AddTask(task = new AliTRDclusterResolution());
 237       taskPtr[(Int_t)kClErrParam] = task;
 238       mgr->ConnectInput(task, 0, co[0]);
 239       mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 240
 241       mgr->AddTask(task = new AliTRDclusterResolution());
 242       taskPtr[(Int_t)kClErrParam+1] = task;
 243       mgr->ConnectInput(task, 0, co[3]);
 244       mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(Form("%sMC", task->GetName()), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%sMC.root", task->GetName())));
 245     }
 246   }
 247
 248   //____________________________________________
 249   // TRD calibration
 250   if(TSTBIT(fSteerTask, kCalibration)){
 251     mgr->AddTask(task = new AliTRDcalibration());
 252     taskPtr[(Int_t)kCalibration] = task;
 253     ((AliTRDcalibration*)task)->SetLow(0);
 254     ((AliTRDcalibration*)task)->SetHigh(30);
 255     ((AliTRDcalibration*)task)->SetFillZero(kFALSE);
 256     task->SetDebugLevel(0);
 257
 258     // Create containers for input/output
 259     mgr->ConnectInput(task, 0, coutput1);
 260     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 261   }
 262
 263   //____________________________________________
 264   // TRD alignment
 265   if(TSTBIT(fSteerTask, kAlignment)){
 266     mgr->AddTask(task = new AliTRDalignmentTask());
 267     taskPtr[(Int_t)kAlignment] = task;
 268     task->SetDebugLevel(0);
 269
 270     // Create containers for input/output
 271     mgr->ConnectInput(task, 0, coutput1);
 272     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(Form("h%s", task->GetName()), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kExchangeContainer));
 273
 274     mgr->ConnectOutput(task, 1, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TTree::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 275   }
 276
 277   //____________________________________________
 278   // TRD PID
 279   if(TSTBIT(fSteerTask, kPIDChecker)){
 280     mgr->AddTask(task = new AliTRDpidChecker());
 281     taskPtr[(Int_t)kPIDChecker] = task;
 282     task->SetDebugLevel(0);
 283     task->SetMCdata(fHasMCdata);
 284
 285     // Create containers for input/output
 286     mgr->ConnectInput( task, 0, coutput1);
 287     mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 288
 289     //____________________________________________
 290     // TRD pid reference
 291     if(TSTBIT(fSteerTask, kPIDRefMaker)){
 292       mgr->AddTask(task = new AliTRDpidRefMaker());
 293       taskPtr[(Int_t)kPIDRefMaker] = task;
 294       task->SetDebugLevel(0);
 295       task->SetMCdata(fHasMCdata);
 296
 297       // Create containers for input/output
 298       mgr->ConnectInput( task, 0, coutput1);
 299       mgr->ConnectOutput(task, 0, mgr->CreateContainer(task->GetName(), TObjArray::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%s.root", task->GetName())));
 300       mgr->ConnectOutput(task, 1, mgr->CreateContainer(Form("%sNN", task->GetName()), TTree::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%sNN.root", task->GetName())));
 301       mgr->ConnectOutput(task, 2, mgr->CreateContainer(Form("%sLQ", task->GetName()), TTree::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, Form("TRD.Task%sLQ.root", task->GetName())));
 302     }
 303   }
 304
 305
 306   if (!mgr->InitAnalysis()) return;
 307   printf("\n\tRUNNING TRAIN FOR TASKS:\n");
 308   for(Int_t itask = 1; itask < NTRDTASKS; itask++){
 309     if(TSTBIT(fSteerTask, itask)) printf("\t   %s [%s]\n",  taskPtr[itask]->GetName(), taskPtr[itask]->GetTitle());
 310   }
 311   printf("\n\n");
 312   //mgr->PrintStatus();
 313
 314
 315   AliCDBManager *cdbManager = AliCDBManager::Instance();
 316   cdbManager->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT");
 317   cdbManager->SetRun(0);
 318   cdbManager->SetCacheFlag(kFALSE);
 319
 320   // initialize TRD settings
 321   AliMagFMaps *field = new AliMagFMaps("Maps","Maps", 2, 1., 10., AliMagFMaps::k5kG);
 322   AliTracker::SetFieldMap(field, kTRUE);
 323   AliTRDcalibDB *cal = AliTRDcalibDB::Instance();
 324   AliTRDtrackerV1::SetNTimeBins(cal->GetNumberOfTimeBins());
 325   AliGeomManager::LoadGeometry();
 326
 327
 328   mgr->StartAnalysis("local",chain);
 329
 330   timer.Stop();
 331   timer.Print();
 332
 333   cal->Terminate();
 334   delete field;
 335   delete cdbManager;
 336   for(Int_t it=NTRDTASKS; it--; ){
 337     if(taskPtr[it]){
 338       printf("Cleaning %s [%s] ...\n", fgkTRDtaskClassName[it], taskPtr[it]->GetTitle());
 339       delete taskPtr[it];
 340     }
 341   }
 342   if(mcH) delete mcH;
 343   delete esdH;
 344   delete mgr;
 345   delete chain;
 346   if(MEM) delete mem;
 347   if(MEM) TMemStatViewerGUI::ShowGUI();
 348 }
 349
 350 //____________________________________________
 351 TChain* MakeChainLST(const char* filename)
 352 {
 353   // Create the chain
 354   TChain* chain = new TChain("esdTree");
 355
 356   if(!filename){
 357     chain->Add(Form("%s/AliESDs.root", gSystem->pwd()));
 358     return chain;
 359   }
 360
 361
 362   // read ESD files from the input list.
 363   ifstream in;
 364   in.open(filename);
 365   TString esdfile;
 366   while(in.good()) {
 367     in >> esdfile;
 368     if (!esdfile.Contains("root")) continue; // protection
 369     chain->Add(esdfile.Data());
 370   }
 371
 372   in.close();
 373
 374   return chain;
 375 }
 376
 377 //____________________________________________
 378 TChain* MakeChainXML(const char* xmlfile)
 379 {
 380   if (!TFile::Open(xmlfile)) {
 381     Error("MakeChainXML", Form("No file %s was found", xmlfile));
 382     return 0x0;
 383   }
 384
 385   if(gSystem->Load("libNetx.so")<0) return 0x0;
 386   if(gSystem->Load("libRAliEn.so")<0) return 0x0;
 387   TGrid::Connect("alien://") ;
 388
 389   TGridCollection *collection = (TGridCollection*) TAlienCollection::Open(xmlfile);
 390   if (!collection) {
 391     Error("MakeChainXML", Form("No collection found in %s", xmlfile)) ;
 392     return 0x0;
 393   }
 394   //collection->CheckIfOnline();
 395
 396   TGridResult* result = collection->GetGridResult("",0 ,0);
 397   if(!result->GetEntries()){
 398     Error("MakeChainXML", Form("No entries found in %s", xmlfile)) ;
 399     return 0x0;
 400   }
 401   // Makes the ESD chain
 402   TChain* chain = new TChain("esdTree");
 403   for (Int_t idx = 0; idx < result->GetEntries(); idx++) {
 404     chain->Add(result->GetKey(idx, "turl"));
 405   }
 406   return chain;
 407 }