prod/cosmic/rawqa.sh

   1 #!/bin/sh
   2 #############################################################################
   3 # rawqa.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rawqa.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  July 2008 adapated from rec.C by M. Meoni
  10 # author Yves Schutz CERN
  11 #
  12
  13 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  14 # ---------------------------------------
  15 # ---------------------------------------
  16 kill -9 `ps | grep aliroot | awk '{print $1}'`
  17
  18 export RUNNUM=$1
  19
  20 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  21
  22 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  23
  24 #[ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  25 #echo 12==========================  $LD_LIBRARY_PATH
  26 alien-token-init
  27 source /tmp/gclient_env_$UID;
  28
  29 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  30
  31 VERSION=1.0
  32 TITLE="Standalone QA checking of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  33
  34 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  35 export BASEDIR="/alice/data/20*"
  36 PATTERN="$RUNNUM/raw/*${RUNNUM}*.root"
  37 aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" > collection.tmp
  38
  39 [ `ls -al collection.tmp | awk '{print $5}'` -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  40 rm -r collection.tmp2
  41 #
  42 for ifile in `cat collection.tmp | grep root` ; do printf $ifile" "\|" "0" " >> collection.tmp2 ; done
  43 list=`cat collection.tmp2`
  44 [ -e collection.tmp2 ] && { rm -f collection.tmp2 ; }
  45 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`
  46 rm -f collection.tmp
  47
  48 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  49 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  50 dialog --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  51         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available for run $RUNNUM (only the first 500 are shown). Select chunks for reconstruction" 18 80 10 \
  52         $list 2> $tempfile
  53
  54 CHUNKS=`cat $tempfile`
  55 echo "Selected chunks:"
  56 echo $CHUNKS
  57 echo
  58
  59 #dialog --clear --no-cancel \
  60 #        --ok-label OK --radiolist "Program to run:" 15 20 5 "aliroot -b" \| on alieve \| off 2> $tempfile
  61 PROGRAM=aliroot #`cat $tempfile`
  62
  63 #
  64 for filename in $CHUNKS; do
  65      CHUNK=`basename $filename | cut -d "." -f 1,2`
  66      BEG=`expr index "$CHUNK" .`
  67      echo !!!!!!!!!!!!! $BEG
  68      BEG=`expr $BEG - 4`
  69      SUBCHUNK=${CHUNK:$BEG}
  70      echo "Running QA for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK".   $SUBCHUNK"
  71      [ -e $RUNNUM"/"$CHUNK ] && { rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK ; }
  72      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  73      rm $RUNNUM"/"*.QA.$RUNNUM.$SUBCHUNK.root
  74      rm $RUNNUM"/"QA.$SUBCHUNK.root
  75      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  76 $PROGRAM -b<<EOF
  77 .L $ALICE_ROOT/prod/cosmic/rawqa.C+
  78 rawqa($filename, $RUNNUM)
  79 .q
  80 EOF
  81
  82 $PROGRAM -b <<EOF
  83 AliQAManager * qam = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRECMODE) ;
  84  qam.Merge(atoi(gSystem->Getenv("RUNNUM"))) ;
  85  .q
  86 EOF
  87      rm *QA.$RUNNUM.root
  88      cd ..
  89 done
  90 ls */Merged.QA.Data.root > merged.list
  91 outfile="Merged.QA.Data."$RUNNUM".root"
  92 $PROGRAM -b <<EOF
  93 .L $ALICE_ROOT/test/cosmic/MergeQAMerged.C
  94 MergeQAMerged("$outfile", "merged.list") ;
  95 .q
  96 EOF
  97 rm -f merged.list
  98 #$PROGRAM -b -q $ALICE_ROOT/test/cosmic/qasummary.C
  99 #$PROGRAM -b  $ALICE_ROOT/test/QA/menuQA.C
 100 cd ..