]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx
Formatting changes.
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALClusterizerv1.cxx
index c629f9cc90edbfe1c17cb4f86c81ea5b19359fb0..044b6b334dbfc97f051f8ec3878c520f20da8bb5 100644 (file)
 
 // --- ROOT system ---
 
-#include <TROOT.h>
+class TROOT;
 #include <TH1.h>
 #include <TFile.h> 
-#include <TFolder.h> 
+class TFolder;
 #include <TMath.h> 
 #include <TMinuit.h>
 #include <TTree.h> 
-#include <TSystem.h> 
+class TSystem; 
 #include <TBenchmark.h>
 #include <TBrowser.h>
+
 // --- Standard library ---
 
 
 // --- AliRoot header files ---
 #include "AliRunLoader.h"
 #include "AliRun.h"
+#include "AliESD.h"
 #include "AliEMCALLoader.h"
 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
 #include "AliEMCALRecPoint.h"
 #include "AliEMCAL.h"
 #include "AliEMCALGeometry.h"
 #include "AliEMCALHistoUtilities.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+
+class AliCDBStorage;
+#include "AliCDBEntry.h"
 
 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
 
-AliEMCALGeometry * geom = 0;
 //____________________________________________________________________________
   AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1() : AliEMCALClusterizer()
 {
@@ -81,8 +86,8 @@ AliEMCALGeometry * geom = 0;
   
   InitParameters() ; 
   fDefaultInit = kTRUE ;
-  geom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
-  geom->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
+  fGeom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
+  fGeom->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -109,10 +114,50 @@ const TString AliEMCALClusterizerv1::BranchName() const
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp) const
+Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Int_t AbsId) 
 {
-  //To be replased later by the method, reading individual parameters from the database 
-  return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ; 
+  // Convert digitized amplitude into energy.
+  // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
+  // or from digitizer parameters for simulated data.
+
+  if(fCalibData){
+
+    //JLK 13-Mar-2006
+    //We now get geometry at a higher level
+    //
+    // Loader
+    //    AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
+    
+    // Load EMCAL Geomtry
+    //    rl->LoadgAlice(); 
+    //AliRun   * gAlice = rl->GetAliRun(); 
+    //AliEMCAL * emcal  = (AliEMCAL*)gAlice->GetDetector("EMCAL");
+    //AliEMCALGeometry * geom = emcal->GetGeometry();
+    
+    if (fGeom==0)
+      AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader") ;
+    
+    Int_t iSupMod = -1;
+    Int_t nTower  = -1;
+    Int_t nIphi   = -1;
+    Int_t nIeta   = -1;
+    Int_t iphi    = -1;
+    Int_t ieta    = -1;
+    
+    Bool_t bCell = fGeom->GetCellIndex(AbsId, iSupMod, nTower, nIphi, nIeta) ;
+    if(!bCell)
+      Error("DigitizeEnergy","Wrong cell id number") ;
+    fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nTower,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
+
+    fADCchannelECA  = fCalibData->GetADCchannel (iSupMod,ieta,iphi);
+    fADCpedestalECA = fCalibData->GetADCpedestal(iSupMod,ieta,iphi);
+    return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;        
+  }
+  else //Return energy with default parameters if calibration is not available
+    return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ; 
+  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -129,10 +174,12 @@ void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
   if(strstr(option,"print"))
     Print("") ; 
 
-  //AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 
+  //Get calibration parameters from file or digitizer default values.
+  GetCalibrationParameters() ;
+
   if (fLastEvent == -1) 
     fLastEvent = rl->GetNumberOfEvents() - 1;
   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
@@ -141,11 +188,13 @@ void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
   rl->LoadDigits("EMCAL");
   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
     rl->GetEvent(ievent);
-    GetCalibrationParameters() ;
 
     fNumberOfECAClusters = 0;
-           
-    MakeClusters() ;
+
+    if(strstr(option,"pseudo"))
+      MakeClusters("pseudo") ;  //both types
+    else
+      MakeClusters("") ;  //only the real clusters
 
     if(fToUnfold)
       MakeUnfolding() ;
@@ -179,10 +228,6 @@ Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit **
 
   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
   TClonesArray *digits = emcalLoader->Digits();
-  /*
-  AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ; 
-  TClonesArray * digits = gime->Digits() ; 
-  */
 
   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
@@ -206,11 +251,12 @@ Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit **
   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
     digit = maxAt[iDigit]; 
 
-    Int_t relid[2] ;
     Float_t x = 0.;
     Float_t z = 0.;
-    geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
-    geom->PosInAlice(relid, x, z) ;
+    //   have to be tune for TRD1; May 31,06
+    //   Int_t relid[2] ;
+    //   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ; // obsolete method
+    //   fGeom->PosInAlice(relid, x, z) ;                  // obsolete method
 
     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 
@@ -265,17 +311,33 @@ Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit **
 //____________________________________________________________________________
 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters() 
 {
-  // Gets the parameters for the calibration from the digitizer
-  //AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
-  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-
-  if ( !emcalLoader->Digitizer() ) 
-    emcalLoader->LoadDigitizer();
-  AliEMCALDigitizer * dig = dynamic_cast<AliEMCALDigitizer*>(emcalLoader->Digitizer());
-
-  fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
-  fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
-//PH  cout<<"ChannelECA, peds "<<fADCchannelECA<<" "<<fADCpedestalECA<<endl;
+  // Set calibration parameters:
+  // if calibration database exists, they are read from database,
+  // otherwise, they are taken from digitizer.
+  //
+  // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction, 
+  // for example: 
+  // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
+
+  //Check if calibration is stored in data base
+   if(AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet()){
+     AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*) 
+     AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Data");
+     if (entry) fCalibData = (AliEMCALCalibData*) entry->GetObject();
+   }
+   if(!fCalibData)
+     {
+       //If calibration is not available use default parameters
+       //Loader
+       AliEMCALLoader *emcalLoader = 
+        dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+       if ( !emcalLoader->Digitizer() ) 
+        emcalLoader->LoadDigitizer();
+       AliEMCALDigitizer * dig = dynamic_cast<AliEMCALDigitizer*>(emcalLoader->Digitizer());
+       
+       fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
+       fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
+     }
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -285,17 +347,14 @@ void AliEMCALClusterizerv1::Init()
   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
   
   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
-  geom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
-  geom->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
-  AliInfo(Form("geom 0x%x",geom));
+  fGeom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
+  fGeom->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
+  AliInfo(Form("geom 0x%x",fGeom));
 
-//Sub  fNTowers = geom->GetNZ() *  geom->GetNPhi() ;
-  fNTowers =400; // ?
   if(!gMinuit) 
     gMinuit = new TMinuit(100) ;
- //Sub if ( !gime->Clusterizer() ) 
- //Sub   gime->PostClusterizer(this); 
- fHists = BookHists();
+
+  fHists = BookHists();
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -304,6 +363,8 @@ void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
   // Initializes the parameters for the Clusterizer
   fNumberOfECAClusters = 0;
 
+  fNTowerInGroup = 36;  //Produces maximum of 80 pseudoclusters per event
+
   fECAClusteringThreshold   = 0.5;  // value obtained from Alexei
   fECALocMaxCut = 0.03; // ??
 
@@ -312,6 +373,8 @@ void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
   fToUnfold = kFALSE ;
   fRecPointsInRun  = 0 ;
   fMinECut = 0.01; // have to be tune
+
+  fCalibData               = 0 ;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -330,12 +393,12 @@ Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d
   static Int_t rowdiff, coldiff;
   rv = 0 ; 
 
-  geom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
-  geom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod2,nTower2,nIphi2,nIeta2);
+  fGeom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
+  fGeom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod2,nTower2,nIphi2,nIeta2);
   if(nSupMod1 != nSupMod2) return 2; // different SM
 
-  geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
-  geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod2,nTower2,nIphi2,nIeta2, iphi2,ieta2);
+  fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
+  fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod2,nTower2,nIphi2,nIeta2, iphi2,ieta2);
 
   rowdiff = TMath::Abs(iphi1 - iphi2);  
   coldiff = TMath::Abs(ieta1 - ieta2) ;  
@@ -349,6 +412,54 @@ Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d
   return rv ; 
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreInGroup(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2) const
+{
+  // Tells whether two digits fall within the same supermodule and
+  // tower grouping.  The number of towers in a group is controlled by
+  // the parameter nTowersInGroup
+  //    = 0 are not in same group but continue searching 
+  //    = 1 same group
+  //    = 2 is in different SM, quit from searching
+  //    = 3 different tower group, quit from searching
+  //
+  // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit 
+  // already in a cluster which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster  
+
+  //JLK Question: does the quit from searching assume that the digits
+  //are ordered, so that once you are in a different SM, you'll not
+  //find another in the list that will match?  How about my TowerGroup search?
+
+  static Int_t rv;
+  static Int_t nSupMod1=0, nTower1=0, nIphi1=0, nIeta1=0, iphi1=0, ieta1=0;
+  static Int_t nSupMod2=0, nTower2=0, nIphi2=0, nIeta2=0, iphi2=0, ieta2=0;
+  static Int_t towerGroup1 = -1, towerGroup2 = -1;
+  rv = 0 ;
+
+  fGeom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
+  fGeom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod2,nTower2,nIphi2,nIeta2);
+  if(nSupMod1 != nSupMod2) return 2; // different SM
+
+  static Int_t nTowerInSM = fGeom->GetNCellsInSupMod()/fGeom->GetNCellsInTower();
+
+  //figure out which tower grouping each digit belongs to
+  for(int it = 0; it < nTowerInSM/fNTowerInGroup; it++) {
+    if(nTower1 <= nTowerInSM - it*fNTowerInGroup) towerGroup1 = it;
+    if(nTower2 <= nTowerInSM - it*fNTowerInGroup) towerGroup2 = it;
+  }
+  if(towerGroup1 != towerGroup2) return 3; //different Towergroup
+
+  //same SM, same towergroup, we're happy
+  if(towerGroup1 == towerGroup2 && towerGroup2 >= 0)
+    rv = 1;
+
+  if (gDebug == 2 && rv==1)
+  printf("AreInGroup: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
+         rv, d1->GetId(), iphi1,ieta1, d2->GetId(), iphi2,ieta2);
+
+  return rv ;
+}
+
 //____________________________________________________________________________
 void AliEMCALClusterizerv1::Unload() 
 {
@@ -402,12 +513,11 @@ void AliEMCALClusterizerv1::WriteRecPoints()
   treeR->Fill() ;
 
   emcalLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
-  //emcalLoader->WriteClusterizer("OVERWRITE");
-  //emcalLoader->WriteReconstructioner("OVERWRITE");
+
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
+void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters(char* option)
 {
   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
@@ -416,49 +526,128 @@ void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
 
   TObjArray * aECARecPoints = emcalLoader->RecPoints() ; 
     
-  if (geom==0) 
+  if (fGeom==0) 
      AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
 
   aECARecPoints->Clear();
 
+  //Start with pseudoclusters, if option
+  if(strstr(option,"pseudo")) {
+    TClonesArray * digits  = emcalLoader->Digits() ; 
+    TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone());
+
+    TIter nextdigit(digitsC) ;
+    AliEMCALDigit * digit;
+
+    AliEMCALRecPoint * recPoint = 0 ; 
+    int ineb=0;
+    nextdigit.Reset();
+
+    // PseudoClusterization starts    
+    while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
+      recPoint = 0 ; 
+      TArrayI clusterECAdigitslist(1000); // what is this   
+
+      if(fGeom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) ) { //Is this an EMCAL digit? Just maing sure...
+       Int_t iDigitInECACluster = 0; // start a new Tower RecPoint
+       if(fNumberOfECAClusters >= aECARecPoints->GetSize()) aECARecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
+       AliEMCALRecPoint * rp = new  AliEMCALRecPoint("") ; 
+       aECARecPoints->AddAt(rp, fNumberOfECAClusters) ;
+       recPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ; 
+       fNumberOfECAClusters++ ; 
+
+       recPoint->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kPseudoCluster);
+
+       recPoint->AddDigit(*digit, digit->GetAmp()) ; 
+       clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digit->GetIndexInList() ;    
+       iDigitInECACluster++ ; 
+       digitsC->Remove(digit) ; 
+       AliDebug(1,Form("MakePseudoClusters: OK id = %d, adc = %f \n", digit->GetId(), digit->GetAmp()));
+       nextdigit.Reset(); // will start from beggining
+      
+       AliEMCALDigit * digitN = 0; // digi neighbor
+       Int_t index = 0 ;
+
+       // Find the neighbours
+       while (index < iDigitInECACluster){ // scan over digits already in cluster 
+         digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterECAdigitslist[index]);
+         index++ ; 
+         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit())) { // scan over the reduced list of digits 
+           ineb = AreInGroup(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!! 
+           switch (ineb ) {
+              case 0 :   // not a neighbour
+              break ;
+             case 1 :   // are neighbours 
+              recPoint->AddDigit(*digitN, digitN->GetAmp() ) ;
+              clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digitN->GetIndexInList() ; 
+              iDigitInECACluster++ ; 
+              digitsC->Remove(digitN) ;
+              break ;
+             case 2 :   // different SM
+              break ;
+              case 3 :   // different Tower group
+              break ;
+           } // switch
+         } // scan over the reduced list of digits
+       } // scan over digits already in cluster
+       nextdigit.Reset() ;  // will start from beggining
+      }
+    }
+    if(recPoint)
+      AliDebug(1,Form("MakeClusters: cl.e %f \n", recPoint->GetEnergy())); 
+    //if(recPoint) cout << "cl.e " << recPoint->GetEnergy() << endl; 
+    delete digitsC ;
+  }
+
+  //Now do real clusters
   TClonesArray * digits  = emcalLoader->Digits() ; 
   TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone());
 
   TIter nextdigit(digitsC) ;
   AliEMCALDigit * digit;
+
+  AliEMCALRecPoint * recPoint = 0 ; 
+  int ineb=0;
+  nextdigit.Reset();
+
   double e=0.0, ehs = 0.0;
   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // clean up digits
-    e = Calibrate(digit->GetAmp());
+    e = Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId());
     AliEMCALHistoUtilities::FillH1(fHists, 10, digit->GetAmp());
     AliEMCALHistoUtilities::FillH1(fHists, 11, e);
     if(e < fMinECut ) digitsC->Remove(digit);
     else              ehs += e;
-  }  
-  cout << " Number of digits " << digits->GetEntries() << " -> (e>" <<fMinECut <<")";
-  cout << digitsC->GetEntries()<< " ehs "<<ehs<<endl; 
+  } 
+  AliDebug(1,Form("MakeClusters: Number of digits %d  -> (e %f), ehs %d\n",
+                 digits->GetEntries(),fMinECut,ehs));
+  //cout << " Number of digits " << digits->GetEntries() << " -> (e>" <<fMinECut <<")";
+  //cout << digitsC->GetEntries()<< " ehs "<<ehs<<endl; 
 
   // Clusterization starts    
   //  cout << "Outer Loop" << endl;
-  int ineb=0;
+  ineb=0;
   nextdigit.Reset();
-  AliEMCALRecPoint * recPoint = 0 ; 
+  recPoint = 0 ; 
   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
     recPoint = 0 ; 
     TArrayI clusterECAdigitslist(1000); // what is this   
 
-    if(geom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
+    if(fGeom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
       Int_t iDigitInECACluster = 0; // start a new Tower RecPoint
       if(fNumberOfECAClusters >= aECARecPoints->GetSize()) aECARecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
       AliEMCALRecPoint * rp = new  AliEMCALRecPoint("") ; 
       aECARecPoints->AddAt(rp, fNumberOfECAClusters) ;
       recPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ; 
       fNumberOfECAClusters++ ; 
-      recPoint->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp())) ; 
+
+      recPoint->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kClusterv1);
+
+      recPoint->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId())) ; 
       clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digit->GetIndexInList() ;     
       iDigitInECACluster++ ; 
       digitsC->Remove(digit) ; 
       AliDebug(1,Form("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),
-      Calibrate(digit->GetAmp()), fECAClusteringThreshold));  
+      Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()), fECAClusteringThreshold));  
       nextdigit.Reset(); // will start from beggining
       
       AliEMCALDigit * digitN = 0; // digi neighbor
@@ -469,13 +658,12 @@ void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
        digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterECAdigitslist[index]);
        index++ ; 
         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit())) { // scan over the reduced list of digits 
-         //          if( Calibrate(digitN->GetAmp()) < fMinECut  )  digitsC->Remove(digitN);
          ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!! 
           switch (ineb ) {
             case 0 :   // not a neighbour
              break ;
            case 1 :   // are neighbours 
-             recPoint->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp()) ) ;
+             recPoint->AddDigit(*digitN, Calibrate(digitN->GetAmp(),digitN->GetId()) ) ;
              clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digitN->GetIndexInList() ; 
              iDigitInECACluster++ ; 
              digitsC->Remove(digitN) ;
@@ -487,9 +675,12 @@ void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
       } // scan over digits already in cluster
       nextdigit.Reset() ;  // will start from beggining
     }
-  } // while digit  
-  if(recPoint) cout << "cl.e " << recPoint->GetEnergy() << endl; 
+  } // while digit 
+  if(recPoint)
+    AliDebug(1,Form("MakeClusters: cl.e %f \n", recPoint->GetEnergy())); 
+  //if(recPoint) cout << "cl.e " << recPoint->GetEnergy() << endl; 
   delete digitsC ;
+
   AliDebug(1,Form("total no of clusters %d from %d digits",fNumberOfECAClusters,digits->GetEntriesFast())); 
 }
 
@@ -617,21 +808,21 @@ void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
              maxL2=lambda[1];
              maxDis=rp->GetDispersion();
       }
-      pointE->Fill(rp->GetEnergy());
-      pointL1->Fill(lambda[0]);
-      pointL2->Fill(lambda[1]);
-      pointDis->Fill(rp->GetDispersion());
-      pointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
+      fPointE->Fill(rp->GetEnergy());
+      fPointL1->Fill(lambda[0]);
+      fPointL2->Fill(lambda[1]);
+      fPointDis->Fill(rp->GetDispersion());
+      fPointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
       ///////////// 
       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
        printf("%d ", primaries[iprimary] ) ; 
       } 
     }
 
-      MaxE->Fill(maxE);
-      MaxL1->Fill(maxL1);
-      MaxL2->Fill(maxL2);
-      MaxDis->Fill(maxDis);
+      fMaxE->Fill(maxE);
+      fMaxL1->Fill(maxL1);
+      fMaxL2->Fill(maxL2);
+      fMaxDis->Fill(maxDis);
 
 
     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
@@ -639,18 +830,20 @@ void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 }
 TList* AliEMCALClusterizerv1::BookHists()
 {
+  //set up histograms for monitoring clusterizer performance
+
   gROOT->cd();
 
-       pointE = new TH1F("pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
-       pointL1 = new TH1F("pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
-       pointL2 = new TH1F("pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
-       pointDis = new TH1F("pointDis","point Dis", 1000, 0.0, 3.);
-       pointMult = new TH1F("pointMult","point Mult", 100, 0.0, 100.);
-       digitAmp = new TH1F("digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
-       MaxE = new TH1F("maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
-       MaxL1 = new TH1F("maxL1","Max point L1", 1000, 0.0, 3.);
-       MaxL2 = new TH1F("maxL2","Max point L2", 1000, 0.0, 3.);
-       MaxDis = new TH1F("maxDis","Max point Dis", 1000, 0.0, 3.); // 9
+       fPointE = new TH1F("pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
+       fPointL1 = new TH1F("pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
+       fPointL2 = new TH1F("pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
+       fPointDis = new TH1F("pointDis","point Dis", 1000, 0.0, 3.);
+       fPointMult = new TH1F("pointMult","point Mult", 100, 0.0, 100.);
+       fDigitAmp = new TH1F("digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
+       fMaxE = new TH1F("maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
+       fMaxL1 = new TH1F("maxL1","Max point L1", 1000, 0.0, 3.);
+       fMaxL2 = new TH1F("maxL2","Max point L2", 1000, 0.0, 3.);
+       fMaxDis = new TH1F("maxDis","Max point Dis", 1000, 0.0, 3.); // 9
        //
         new TH1F("adcOfDigits","adc of digits(threshold control)", 1001, -0.5, 1000.5);   // 10
         new TH1F("energyOfDigits","energy of digits(threshold control)", 1000, 0.0, 1.);  // 11