]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALDigitizer.cxx
new non linearity function
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALDigitizer.cxx
index cf49406c42484357db683e106d758c2fbca2e93e..011b44194382f76ca44b1127ec51a5ad94cb126c 100644 (file)
@@ -66,6 +66,7 @@
 #include <TBrowser.h>
 #include <TObjectTable.h>
 #include <TRandom.h>
+#include <TF1.h>
 #include <cassert>
 
 // --- AliRoot header files ---
 #include "AliEMCALDigitizer.h"
 #include "AliEMCALSDigitizer.h"
 #include "AliEMCALGeometry.h"
-#include "AliEMCALTick.h"
+//#include "AliEMCALTick.h"
+#include "AliEMCALCalibData.h"
+#include "AliEMCALSimParam.h"
+#include "AliEMCALRawDigit.h"
+
+namespace
+{
+       Double_t HeavisideTheta(Double_t x)
+       {
+               Double_t signal = 0.;
+               
+               if (x > 0.) signal = 1.;  
+               
+               return signal;  
+       }
+       
+       Double_t AnalogFastORFunction(Double_t *x, Double_t *par)
+       {
+               Double_t v0 = par[0];
+               Double_t t0 = par[1];
+               Double_t tr = par[2];
+               
+               Double_t R1 = 1000.;
+               Double_t C1 = 33e-12;
+               Double_t R2 = 1800;
+               Double_t C2 = 22e-12;
+               
+               Double_t t  =   x[0];
+               
+               return (((0.8*(-((TMath::Power(C1,2)*C2*TMath::Power(TMath::E(),(-t + t0)/(C1*R1))*
+                                                 TMath::Power(R1,2)*R2)/(C1*R1 - C2*R2)) + 
+                                          C1*C2*R1*R2*(1 - (C2*TMath::Power(TMath::E(),(-t + t0)/(C2*R2))*R2)/(-(C1*R1) + C2*R2)))*v0*
+                                 HeavisideTheta(t - t0))/tr 
+                                - (0.8*(C1*C2*R1*R2 - 
+                                                (TMath::Power(C1,2)*C2*TMath::Power(TMath::E(),(-1.*t + t0 + 1.25*tr)/(C1*R1))*
+                                                 TMath::Power(R1,2)*R2)/(C1*R1 - C2*R2) + 
+                                                (C1*TMath::Power(C2,2)*TMath::Power(TMath::E(),(-1.*t + t0 + 1.25*tr)/(C2*R2))*
+                                                 R1*TMath::Power(R2,2))/(C1*R1 - C2*R2))*v0*
+                                       HeavisideTheta(t - t0 - 1.25*tr))/tr)/(C2*R1));
+       }
+}
 
 ClassImp(AliEMCALDigitizer)
 
@@ -97,12 +138,13 @@ AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer()
     fEventNames(0x0),
     fDigitThreshold(0),
     fMeanPhotonElectron(0),
-    fPedestal(0),
-    fSlope(0),
+//    fPedestal(0), //Not used, remove?
+//    fSlope(0),    //Not used, remove?
     fPinNoise(0),
+    fTimeDelay(0),
     fTimeResolution(0),
-    fTimeThreshold(0),    
-    fTimeSignalLength(0),
+//    fTimeThreshold(0),    //Not used, remove?
+//    fTimeSignalLength(0), //Not used, remove?
     fADCchannelEC(0),
     fADCpedestalEC(0),
     fNADCEC(0),
@@ -127,12 +169,13 @@ AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(TString alirunFileName, TString eventFolder
     fEventNames(0), 
     fDigitThreshold(0),
     fMeanPhotonElectron(0),
-    fPedestal(0),
-    fSlope(0),
+//    fPedestal(0),//Not used, remove?
+//    fSlope(0),   //Not used, remove?
     fPinNoise(0),
+    fTimeDelay(0),
     fTimeResolution(0),
-    fTimeThreshold(0),
-    fTimeSignalLength(0),
+//    fTimeThreshold(0),    //Not used, remove?
+//    fTimeSignalLength(0), //Not used, remove?
     fADCchannelEC(0),
     fADCpedestalEC(0),
     fNADCEC(0),
@@ -158,12 +201,13 @@ AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(const AliEMCALDigitizer & d)
     fEventNames(d.fEventNames),
     fDigitThreshold(d.fDigitThreshold),
     fMeanPhotonElectron(d.fMeanPhotonElectron),
-    fPedestal(d.fPedestal),
-    fSlope(d.fSlope),
+//    fPedestal(d.fPedestal), //Not used, remove?
+//    fSlope(d.fSlope),       //Not used, remove?
     fPinNoise(d.fPinNoise),
+    fTimeDelay(d.fTimeDelay),
     fTimeResolution(d.fTimeResolution),
-    fTimeThreshold(d.fTimeThreshold),
-    fTimeSignalLength(d.fTimeSignalLength),
+//    fTimeThreshold(d.fTimeThreshold),       //Not used, remove?
+//    fTimeSignalLength(d.fTimeSignalLength), //Not used, remove?
     fADCchannelEC(d.fADCchannelEC),
     fADCpedestalEC(d.fADCpedestalEC),
     fNADCEC(d.fNADCEC),
@@ -173,7 +217,7 @@ AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(const AliEMCALDigitizer & d)
     fCalibData(d.fCalibData)
 {
   // copyy ctor 
- }
+}
 
 //____________________________________________________________________________ 
 AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(AliRunDigitizer * rd)
@@ -184,14 +228,15 @@ AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(AliRunDigitizer * rd)
     fInput(0),
     fInputFileNames(0),
     fEventNames(0),
-    fDigitThreshold(0.),
+    fDigitThreshold(0),
     fMeanPhotonElectron(0),
-    fPedestal(0),
-    fSlope(0.),
-    fPinNoise(0),
+//    fPedestal(0), //Not used, remove?
+//    fSlope(0.),   //Not used, remove?
+    fPinNoise(0.),
+    fTimeDelay(0.),
     fTimeResolution(0.),
-    fTimeThreshold(0),
-    fTimeSignalLength(0),
+//    fTimeThreshold(0),    //Not used, remove?
+//    fTimeSignalLength(0), //Not used, remove?
     fADCchannelEC(0),
     fADCpedestalEC(0),
     fNADCEC(0),
@@ -211,22 +256,23 @@ AliEMCALDigitizer::AliEMCALDigitizer(AliRunDigitizer * rd)
   AliEMCALDigitizer::~AliEMCALDigitizer()
 {
   //dtor
-  if (AliRunLoader::GetRunLoader()) {
+  if (AliRunLoader::Instance()) {
     AliLoader *emcalLoader=0;
-    if ((emcalLoader = AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL")))
+    if ((emcalLoader = AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL")))
       emcalLoader->CleanDigitizer();
   }
   else
     AliDebug(1," no runloader present");
+  
   delete [] fInputFileNames ; 
   delete [] fEventNames ; 
-
+  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 void AliEMCALDigitizer::Digitize(Int_t event) 
 { 
-
+  
   // Makes the digitization of the collected summable digits
   // for this it first creates the array of all EMCAL modules
   // filled with noise and after that adds contributions from 
@@ -239,222 +285,286 @@ void AliEMCALDigitizer::Digitize(Int_t event)
   // back to an energy in GeV before adding it to the Digit
   //
   static int nEMC=0; //max number of digits possible
-
-  AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
+  
+  AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  
+  if(emcalLoader){
   Int_t readEvent = event ; 
   // fManager is data member from AliDigitizer
   if (fManager) 
     readEvent = dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(0))->GetCurrentEventNumber() ; 
   AliDebug(1,Form("Adding event %d from input stream 0 %s %s", 
-                 readEvent, GetTitle(), fEventFolderName.Data())) ; 
+                  readEvent, GetTitle(), fEventFolderName.Data())) ; 
   rl->GetEvent(readEvent);
-
+    
   TClonesArray * digits = emcalLoader->Digits() ; 
   digits->Delete() ;  //correct way to clear array when memory is
-                     //allocated by objects stored in array
-
+  //allocated by objects stored in array
+  
   // Load Geometry
   AliEMCALGeometry *geom = 0;
-  if (rl->GetAliRun()) {
+  if (!rl->GetAliRun()) {
+    AliFatal("Could not get AliRun from runLoader");
+  }
+  else{
     AliEMCAL * emcal  = (AliEMCAL*)rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL");
     geom = emcal->GetGeometry();
+    nEMC = geom->GetNCells();
+    AliDebug(1,Form("nEMC %i (number cells in EMCAL) | %s \n", nEMC, geom->GetName()));
   }
-  else 
-    AliFatal("Could not get AliRun from runLoader");
-
-  nEMC = geom->GetNCells();
-  AliDebug(1,Form("nEMC %i (number cells in EMCAL) | %s \n", nEMC, geom->GetName()));
   
-  Int_t absID ;
-
+  Int_t absID = -1 ;
+  
   digits->Expand(nEMC) ;
-
+  
   // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
   if ( !emcalLoader->SDigitizer() ) 
     emcalLoader->LoadSDigitizer();
   AliEMCALSDigitizer * sDigitizer = dynamic_cast<AliEMCALSDigitizer*>(emcalLoader->SDigitizer()); 
   
-  if ( !sDigitizer )
+  if (!sDigitizer )
+  {
     Fatal("Digitize", "SDigitizer with name %s %s not found", fEventFolderName.Data(), GetTitle() ) ; 
-
-  //take all the inputs to add together and load the SDigits
-  TObjArray * sdigArray = new TObjArray(fInput) ;
-  sdigArray->AddAt(emcalLoader->SDigits(), 0) ;
-  Int_t i ;
-
-  for(i = 1 ; i < fInput ; i++){
-    TString tempo(fEventNames[i]) ; 
-    tempo += i ;
-
-    AliRunLoader *  rl2 = AliRunLoader::GetRunLoader(tempo) ; 
-
-    if (rl2==0) 
-      rl2 = AliRunLoader::Open(fInputFileNames[i], tempo) ; 
-
-    if (fManager) 
-      readEvent = dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(i))->GetCurrentEventNumber() ; 
-    Info("Digitize", "Adding event %d from input stream %d %s %s", readEvent, i, fInputFileNames[i].Data(), tempo.Data()) ; 
-    rl2->LoadSDigits();
-    rl2->GetEvent(readEvent);
-    AliEMCALLoader *emcalLoader2 = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl2->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-    sdigArray->AddAt(emcalLoader2->SDigits(), i) ;
   }
-  
-  //Find the first tower with signal
-  Int_t nextSig = nEMC + 1 ; 
-  TClonesArray * sdigits ;  
-  for(i = 0 ; i < fInput ; i++){
-    sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
-    if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
-      continue ; 
-    Int_t curNext = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(sdigits->At(0))->GetId() ;
-     if(curNext < nextSig) 
-       nextSig = curNext ;
-     AliDebug(1,Form("input %i : #sdigits %i \n",
-                    i, sdigits->GetEntriesFast()));
-  }
-  AliDebug(1,Form("FIRST tower with signal %i \n", nextSig));
-
-  TArrayI index(fInput) ;
-  index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
-
-  AliEMCALDigit * digit ;
-  AliEMCALDigit * curSDigit ;
-
-  //  TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliEMCALTick",1000) ;
-
-  //Put Noise contribution
-  for(absID = 0; absID < nEMC; absID++){ // Nov 30, 2006 by PAI; was from 1 to nEMC
-    Float_t energy = 0 ;
-    // amplitude set to zero, noise will be added later
-    new((*digits)[absID]) AliEMCALDigit( -1, -1, absID, 0, TimeOfNoise() ); // absID-1->absID
-    //look if we have to add signal?
-    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(absID)); // absID-1->absID
-    
-    if(absID==nextSig){
-      //Add SDigits from all inputs    
-      //      ticks->Clear() ;
-      //Int_t contrib = 0 ;
-
-      //Follow PHOS and comment out this timing model til a better one
-      //can be developed - JLK 28-Apr-2008
-
-      //Float_t a = digit->GetAmp() ;
-      //Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
-      //Mark the beginning of the signal
-      //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime(),0, b);  
-      //Mark the end of the signal     
-      //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
-
-      // Calculate time as time of the largest digit
-      Float_t time = digit->GetTime() ;
-      Float_t aTime= digit->GetAmp() ;
+  else
+  {
+    //take all the inputs to add together and load the SDigits
+    TObjArray * sdigArray = new TObjArray(fInput) ;
+    sdigArray->AddAt(emcalLoader->SDigits(), 0) ;
+    
+    Int_t i ;
+    for(i = 1 ; i < fInput ; i++){
+      TString tempo(fEventNames[i]) ; 
+      tempo += i ;
       
-      // loop over input
-      for(i = 0; i< fInput ; i++){  //loop over (possible) merge sources
-       if(dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
-         curSDigit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->At(index[i])) ;      
-       else
-         curSDigit = 0 ;
-       //May be several digits will contribute from the same input
-       while(curSDigit && (curSDigit->GetId() == absID)){         
-         //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
-         Int_t primaryoffset ;
-         if(fManager)
-           primaryoffset = fManager->GetMask(i) ; 
-         else
-           primaryoffset = i ;
-         curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
-
-         //Remove old timing model - JLK 28-April-2008
-         //a = curSDigit->GetAmp() ;
-         //b = a /fTimeSignalLength ;
-         //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime(),0, b);  
-         //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b); 
-         if(curSDigit->GetAmp()>aTime) {
-           aTime = curSDigit->GetAmp();
-           time = curSDigit->GetTime();
-         }
-
-         *digit = *digit + *curSDigit ;  //adds amplitudes of each digit
-
-         index[i]++ ;
-         if( dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
-           curSDigit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i))->At(index[i])) ;
-         else
-           curSDigit = 0 ;
-       }
-      }
-      //Here we convert the summed amplitude to an energy in GeV
-      energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ; // GeV
-      // add fluctuations for photo-electron creation
-      energy *= static_cast<Float_t>(gRandom->Poisson(fMeanPhotonElectron)) / static_cast<Float_t>(fMeanPhotonElectron) ;
-  
-      //calculate and set time
-      //New timing model needed - JLK 28-April-2008
-      //Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
-      digit->SetTime(time) ;
-
-      //Find next signal module
-      nextSig = nEMC + 1 ;
-      for(i = 0 ; i < fInput ; i++){
-       sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
-       Int_t curNext = nextSig ;
-       if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
-         curNext = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(sdigits->At(index[i]))->GetId() ;       
-       }
-       if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
+      AliRunLoader *  rl2 = AliRunLoader::GetRunLoader(tempo) ; 
+      
+      if (rl2==0) 
+        rl2 = AliRunLoader::Open(fInputFileNames[i], tempo) ; 
+      
+      if (fManager) 
+        readEvent = dynamic_cast<AliStream*>(fManager->GetInputStream(i))->GetCurrentEventNumber() ; 
+      Info("Digitize", "Adding event %d from input stream %d %s %s", readEvent, i, fInputFileNames[i].Data(), tempo.Data()) ; 
+      rl2->LoadSDigits();
+      rl2->GetEvent(readEvent);
+      if(rl2->GetDetectorLoader("EMCAL"))
+      {
+        AliEMCALLoader *emcalLoader2 = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl2->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+        if(emcalLoader2) sdigArray->AddAt(emcalLoader2->SDigits(), i) ;
+        else             AliFatal("EMCAL Loader of second event not available!");
       }
+      else Fatal("Digitize", "Loader of second input not found");
     }
-    // add the noise now
-    energy += TMath::Abs(gRandom->Gaus(0., fPinNoise)) ;
-    // JLK 26-June-2008
-    //Now digitize the energy according to the sDigitizer method,
-    //which merely converts the energy to an integer.  Later we will
-    //check that the stored value matches our allowed dynamic ranges
-    digit->SetAmp(sDigitizer->Digitize(energy)) ;  
-    AliDebug(10,Form(" absID %5i energy %f nextSig %5i\n",
-                    absID, energy, nextSig));
-  } // for(absID = 0; absID < nEMC; absID++)
-  
-  //ticks->Delete() ;
-  //delete ticks ;
-
-  //JLK is it better to call Clear() here?
-  delete sdigArray ; //We should not delete its contents
-
-  //remove digits below thresholds
-  for(i = 0 ; i < nEMC ; i++){
-    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>( digits->At(i) ) ;
-    Float_t threshold = fDigitThreshold ; //this is in GeV
-    //need to calibrate digit amplitude to energy in GeV for comparison
-    if(sDigitizer->Calibrate( digit->GetAmp() ) < threshold)
-      digits->RemoveAt(i) ;
-    else 
-      digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
-  }
-  
-  digits->Compress() ;  
-  
-  Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ; 
-
-  //JLK 26-June-2008
-  //After we have done the summing and digitizing to create the
-  //digits, now we want to calibrate the resulting amplitude to match
-  //the dynamic range of our real data.  
-  Float_t energy=0;
-  for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) { 
-    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>( digits->At(i) ) ; 
-    digit->SetIndexInList(i) ; 
-    energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
-    digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy, digit->GetId()) ) ;
+    
+    //Find the first tower with signal
+    Int_t nextSig = nEMC + 1 ; 
+    TClonesArray * sdigits ;  
+    for(i = 0 ; i < fInput ; i++){
+      
+      sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
+      if(sdigits){
+        if (sdigits->GetEntriesFast() ){
+          AliEMCALDigit *sd = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(sdigits->At(0));
+          if(sd){
+            Int_t curNext = sd->GetId() ;
+            if(curNext < nextSig) 
+              nextSig = curNext ;
+            AliDebug(1,Form("input %i : #sdigits %i \n",
+                            i, sdigits->GetEntriesFast()));
+            
+          }//First entry is not NULL
+          else {
+            Info("Digitize", "NULL sdigit pointer");
+            continue;
+          }
+        }//There is at least one entry
+        else {
+          Info("Digitize", "NULL sdigits array");
+          continue;
+        }
+      }// SDigits array exists
+      else {
+        Info("Digitizer","Null sdigit pointer");
+        continue;
+      }
+    }// input loop
+    AliDebug(1,Form("FIRST tower with signal %i \n", nextSig));
+    
+    TArrayI index(fInput) ;
+    index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
+    
+    AliEMCALDigit * digit ;
+    AliEMCALDigit * curSDigit ;
+    
+    //  TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliEMCALTick",1000) ;
+    
+    //Put Noise contribution
+    for(absID = 0; absID < nEMC; absID++){ // Nov 30, 2006 by PAI; was from 1 to nEMC
+      Float_t energy = 0 ;
+      // amplitude set to zero, noise will be added later
+      new((*digits)[absID]) AliEMCALDigit( -1, -1, absID, 0., TimeOfNoise(),kFALSE); // absID-1->absID
+      //look if we have to add signal?
+      
+      digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(absID)); // absID-1->absID
+      
+      if (digit) {
+        
+        if(absID==nextSig){
+          //Add SDigits from all inputs    
+          //      ticks->Clear() ;
+          //Int_t contrib = 0 ;
+          
+          //Follow PHOS and comment out this timing model til a better one
+          //can be developed - JLK 28-Apr-2008
+          
+          //Float_t a = digit->GetAmplitude() ;
+          //Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
+          //Mark the beginning of the signal
+          //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime(),0, b);  
+          //Mark the end of the signal     
+          //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
+          
+          // Calculate time as time of the largest digit
+          Float_t time = digit->GetTime() ;
+          Float_t aTime= digit->GetAmplitude() ;
+          
+          // loop over input
+          for(i = 0; i< fInput ; i++){  //loop over (possible) merge sources
+            TClonesArray* sdtclarr = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i));
+            if(sdtclarr) {
+              Int_t sDigitEntries = sdtclarr->GetEntriesFast();
+              
+              if(sDigitEntries > index[i] )
+                curSDigit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(sdtclarr->At(index[i])) ;     
+              else
+                curSDigit = 0 ;
+              
+              //May be several digits will contribute from the same input
+              while(curSDigit && (curSDigit->GetId() == absID)){          
+                //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
+                Int_t primaryoffset ;
+                if(fManager)
+                  primaryoffset = fManager->GetMask(i) ; 
+                else
+                  primaryoffset = i ;
+                curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
+                
+                //Remove old timing model - JLK 28-April-2008
+                //a = curSDigit->GetAmplitude() ;
+                //b = a /fTimeSignalLength ;
+                //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime(),0, b);  
+                //new((*ticks)[contrib++]) AliEMCALTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b); 
+                if(curSDigit->GetAmplitude()>aTime) {
+                  aTime = curSDigit->GetAmplitude();
+                  time  = curSDigit->GetTime();
+                }
+                
+                *digit = *digit + *curSDigit ;  //adds amplitudes of each digit
+                
+                index[i]++ ;
+                if( sDigitEntries > index[i] )
+                  curSDigit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(sdtclarr->At(index[i])) ;
+                else
+                  curSDigit = 0 ;
+              }// while
+            }// source exists
+          }// loop over merging sources
+          
+          //Here we convert the summed amplitude to an energy in GeV
+          energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmplitude()) ; // GeV
+          // add fluctuations for photo-electron creation
+          energy *= static_cast<Float_t>(gRandom->Poisson(fMeanPhotonElectron)) / static_cast<Float_t>(fMeanPhotonElectron) ;
+          
+          //calculate and set time
+          //New timing model needed - JLK 28-April-2008
+          //Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
+          digit->SetTime(time) ;
+          
+          //Find next signal module
+          nextSig = nEMC + 1 ;
+          for(i = 0 ; i < fInput ; i++){
+            sdigits = dynamic_cast<TClonesArray *>(sdigArray->At(i)) ;
+            if(sdigits){
+              Int_t curNext = nextSig ;
+              AliEMCALDigit * tmpdigit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(sdigits->At(index[i]));
+              if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] && tmpdigit){
+                curNext = tmpdigit->GetId() ;    
+              }
+              if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
+            }// sdigits exist
+          } // input loop       
+          
+        }//absID==nextSig
+        
+        // add the noise now
+        energy += TMath::Abs(gRandom->Gaus(0., fPinNoise)) ;
+        // JLK 26-June-2008
+        //Now digitize the energy according to the sDigitizer method,
+        //which merely converts the energy to an integer.  Later we will
+        //check that the stored value matches our allowed dynamic ranges
+        digit->SetAmplitude(sDigitizer->Digitize(energy)) ;  
+        AliDebug(10,Form(" absID %5i energy %f nextSig %5i\n",
+                         absID, energy, nextSig));
+      }// Digit pointer exists
+      else{
+        Info("Digitizer","Digit pointer is null");
+      }
+    } // for(absID = 0; absID < nEMC; absID++)
+    
+    //ticks->Delete() ;
+    //delete ticks ;
+    
+    //JLK is it better to call Clear() here?
+    delete sdigArray ; //We should not delete its contents
+    
+    //remove digits below thresholds
+    // until 10-02-2010 remove digits with energy smaller than fDigitThreshold 3*fPinNoise
+    // now, remove digits with Digitized ADC smaller than fDigitThreshold = 3
+    Float_t energy=0;
+    for(i = 0 ; i < nEMC ; i++){
+      digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>( digits->At(i) ) ;
+      if(digit){
+        //First get the energy in GeV units.
+        energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmplitude()) ;
+        //Then digitize using the calibration constants of the ocdb
+        Float_t ampADC = DigitizeEnergy(energy, digit->GetId())  ;       
+        //if(ampADC>2)printf("Digit energy %f, amp %d, amp cal %d, threshold %d\n",energy,digit->GetAmplitude(),ampADC,fDigitThreshold);
+        if(ampADC < fDigitThreshold)
+          digits->RemoveAt(i) ;
+        else 
+          digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
+      }// digit exists
+    } // digit loop
+    
+    digits->Compress() ;  
+    
+    Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ; 
+    
+    //JLK 26-June-2008
+    //After we have done the summing and digitizing to create the
+    //digits, now we want to calibrate the resulting amplitude to match
+    //the dynamic range of our real data.  
+    for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) { 
+      digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>( digits->At(i) ) ; 
+      if(digit){
+        digit->SetIndexInList(i) ; 
+        energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmplitude()) ;
+        digit->SetAmplitude(DigitizeEnergy(energy, digit->GetId()) ) ;
+        //Add delay to time
+        digit->SetTime(digit->GetTime()+fTimeDelay) ;
+        // printf("digit amplitude set at end: i %d, amp %f\n",i,digit->GetAmplitude());
+      }// digit exists
+    }//Digit loop
+    
+  }//SDigitizer not null
   }
+  else AliFatal("EMCALLoader is NULL!") ;
 
 }
 
 // //_____________________________________________________________________
-Int_t AliEMCALDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t AbsId)
+Float_t AliEMCALDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t AbsId)
 { 
   // JLK 26-June-2008
   // Returns digitized value of the energy in a cell absId
@@ -466,31 +576,35 @@ Int_t AliEMCALDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t AbsId)
   // Load Geometry
   const AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
 
-  if (geom==0)
+  Float_t channel = -999; 
+  
+  if (geom==0){
     AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
-
-  Int_t iSupMod = -1;
-  Int_t nModule  = -1;
-  Int_t nIphi   = -1;
-  Int_t nIeta   = -1;
-  Int_t iphi    = -1;
-  Int_t ieta    = -1;
-  Int_t channel = -999; 
-
-  Bool_t bCell = geom->GetCellIndex(AbsId, iSupMod, nModule, nIphi, nIeta) ;
-  if(!bCell)
-    Error("DigitizeEnergy","Wrong cell id number : AbsId %i ", AbsId) ;
-  geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nModule,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
-  
-  if(fCalibData) {
-    fADCpedestalEC = fCalibData->GetADCpedestal(iSupMod,ieta,iphi);
-    fADCchannelEC = fCalibData->GetADCchannel(iSupMod,ieta,iphi);
   }
+  else {
+    Int_t iSupMod = -1;
+    Int_t nModule  = -1;
+    Int_t nIphi   = -1;
+    Int_t nIeta   = -1;
+    Int_t iphi    = -1;
+    Int_t ieta    = -1;
+    Bool_t bCell = geom->GetCellIndex(AbsId, iSupMod, nModule, nIphi, nIeta) ;
+    if(!bCell)
+      Error("DigitizeEnergy","Wrong cell id number : AbsId %i ", AbsId) ;
+    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nModule,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
   
-  channel = static_cast<Int_t> (TMath::Ceil( (energy + fADCpedestalEC)/fADCchannelEC ))  ;
+    if(fCalibData) {
+      fADCpedestalEC = fCalibData->GetADCpedestal(iSupMod,ieta,iphi);
+      fADCchannelEC = fCalibData->GetADCchannel(iSupMod,ieta,iphi);
+    }
+  
+    //channel = static_cast<Int_t> (TMath::Floor( (energy + fADCpedestalEC)/fADCchannelEC ))  ;
+    channel = (energy + fADCpedestalEC)/fADCchannelEC   ;
+
+    if(channel > fNADCEC ) 
+      channel =  fNADCEC ; 
+  }// geometry exists
   
-  if(channel > fNADCEC ) 
-    channel =  fNADCEC ; 
   return channel ;
   
 }
@@ -518,40 +632,69 @@ void AliEMCALDigitizer::Exec(Option_t *option)
   if(strstr(option,"tim"))
     gBenchmark->Start("EMCALDigitizer");
 
-  AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
+  AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
   AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-
-  // Post Digitizer to the white board
-  emcalLoader->PostDigitizer(this) ;
-  
-  if (fLastEvent == -1)  {
-    fLastEvent = rl->GetNumberOfEvents() - 1 ;
+  Int_t nEvents = 0;
+  if(!emcalLoader){
+    AliFatal("Did not get the  Loader");
   }
-  else if (fManager) 
-    fLastEvent = fFirstEvent ; // what is this ??
-
-  Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
-  Int_t ievent;
-
-  rl->LoadSDigits("EMCAL");
-  for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
+  else{
+    // Post Digitizer to the white board
+    emcalLoader->PostDigitizer(this) ;
     
-    rl->GetEvent(ievent);
-
-    Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
+    if (fLastEvent == -1)  {
+      fLastEvent = rl->GetNumberOfEvents() - 1 ;
+    }
+    else if (fManager) 
+      fLastEvent = fFirstEvent ; // what is this ??
+    
+    nEvents = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
+    Int_t ievent  = -1;
 
-    WriteDigits() ;
+    TClonesArray* digitsTMP = new TClonesArray("AliEMCALDigit",    32*96);
+    TClonesArray* digitsTRG = new TClonesArray("AliEMCALRawDigit", 32*96);
 
-    if(strstr(option,"deb"))
-      PrintDigits(option);
-    if(strstr(option,"table")) gObjectTable->Print();
+    rl->LoadSDigits("EMCAL");
+    for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
+      
+      rl->GetEvent(ievent);
+      
+      Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
+      
+      WriteDigits() ;
+      
+      //Trigger Digits
+      //-------------------------------------
+     
 
-    //increment the total number of Digits per run 
-    fDigitsInRun += emcalLoader->Digits()->GetEntriesFast() ;  
-  }
+      Digits2FastOR(digitsTMP, digitsTRG);  
+      
+      WriteDigits(digitsTRG);
+      
+      (emcalLoader->TreeD())->Fill();
+      
+      emcalLoader->WriteDigits(   "OVERWRITE");
+      emcalLoader->WriteDigitizer("OVERWRITE");
+      
+      Unload();
+      
+      digitsTRG  ->Delete();
+      digitsTMP  ->Delete();
+      
+      //-------------------------------------
+      
+      if(strstr(option,"deb"))
+        PrintDigits(option);
+      if(strstr(option,"table")) gObjectTable->Print();
+      
+      //increment the total number of Digits per run 
+      fDigitsInRun += emcalLoader->Digits()->GetEntriesFast() ;  
+    }//loop
+    
+    emcalLoader->CleanDigitizer() ;
+    
+  }//loader exists
   
-  emcalLoader->CleanDigitizer() ;
-
   if(strstr(option,"tim")){
     gBenchmark->Stop("EMCALDigitizer");
     AliInfo(Form("Exec: took %f seconds for Digitizing %f seconds per event", 
@@ -560,33 +703,157 @@ void AliEMCALDigitizer::Exec(Option_t *option)
 }
 
 //____________________________________________________________________________ 
-Float_t AliEMCALDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks) 
-{ 
-  //  Returns the shortest time among all time ticks
-
-  ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
-  TIter it(ticks) ;
-  AliEMCALTick * ctick = (AliEMCALTick *) it.Next() ;
-  Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
+void AliEMCALDigitizer::Digits2FastOR(TClonesArray* digitsTMP, TClonesArray* digitsTRG)
+{
+  // FEE digits afterburner to produce TRG digits 
+  // we are only interested in the FEE digit deposited energy
+  // to be converted later into a voltage value
   
-  AliEMCALTick * t ;  
-  while((t=(AliEMCALTick*) it.Next())){
-    if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
-      *ctick+=*t ;
-    else
-      return time ;
-    
-    time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
+  // push the FEE digit to its associated FastOR (numbered from 0:95)
+  // TRU is in charge of summing module digits
+  
+  AliRunLoader *runLoader = AliRunLoader::Instance();
+  
+  AliRun* run = runLoader->GetAliRun();
+  
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(runLoader->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  if(!emcalLoader){
+    AliFatal("Did not get the  Loader");
   }
-  return time ;
+  else {
+    AliEMCAL* emcal = dynamic_cast<AliEMCAL*>(run->GetDetector("EMCAL"));
+    if(emcal){
+      AliEMCALGeometry* geom = emcal->GetGeometry();
+      
+      // build FOR from simulated digits
+      // and xfer to the corresponding TRU input (mapping)
+      
+      TClonesArray* digits = emcalLoader->Digits();
+      
+      TIter NextDigit(digits);
+      while (AliEMCALDigit* digit = (AliEMCALDigit*)NextDigit())
+      {
+        Int_t id = digit->GetId();
+        
+        Int_t trgid;
+        if (geom && geom->GetFastORIndexFromCellIndex(id , trgid)) 
+        {
+          AliDebug(1,Form("trigger digit id: %d from cell id: %d\n",trgid,id));
+          
+          AliEMCALDigit* d = static_cast<AliEMCALDigit*>(digitsTMP->At(trgid));
+          
+          if (!d)
+          {
+            new((*digitsTMP)[trgid]) AliEMCALDigit(*digit);
+            d = (AliEMCALDigit*)digitsTMP->At(trgid);
+            d->SetId(trgid);
+          }    
+          else
+          {
+            *d = *d + *digit;
+          }
+        }
+      }
+      
+      if (AliDebugLevel()) printf("Number of TRG digits: %d\n",digitsTMP->GetEntriesFast());
+      
+      Int_t    nSamples = 32;
+      Int_t *timeSamples = new Int_t[nSamples];
+      
+      NextDigit = TIter(digitsTMP);
+      while (AliEMCALDigit* digit = (AliEMCALDigit*)NextDigit())
+      {
+        if (digit)
+        {
+          Int_t     id = digit->GetId();
+          Float_t time = digit->GetTime();
+          
+          Double_t depositedEnergy = 0.;
+          for (Int_t j = 1; j <= digit->GetNprimary(); j++) depositedEnergy += digit->GetDEPrimary(j);
+          
+          if (AliDebugLevel()) printf("Deposited Energy: %f\n", depositedEnergy);
+          
+          // FIXME: Check digit time!
+          if (depositedEnergy)
+          {
+            DigitalFastOR(time, depositedEnergy, timeSamples, nSamples);
+            
+            for (Int_t j=0;j<nSamples;j++) 
+            {
+              timeSamples[j] = ((j << 12) & 0xFF000) | (timeSamples[j] & 0xFFF);
+            }
+            
+            new((*digitsTRG)[digitsTRG->GetEntriesFast()]) AliEMCALRawDigit(id, timeSamples, nSamples);
+          }
+        }
+      }
+      
+      delete [] timeSamples;
+    }// AliEMCAL exists
+    else AliFatal("Could not get AliEMCAL");
+  }// loader exists
+  
 }
 
+//____________________________________________________________________________ 
+void AliEMCALDigitizer::DigitalFastOR( Double_t time, Double_t dE, Int_t timeSamples[], Int_t nSamples )
+{
+       // parameters:  
+       // id: 0..95
+       const Int_t    reso = 11;      // 11-bit resolution ADC
+       const Double_t vFSR = 1;       // Full scale input voltage range
+       const Double_t Ne   = 125;     // signal of the APD per MeV of energy deposit in a tower: 125 photo-e-/MeV @ M=30
+       const Double_t vA   = .136e-6; // CSP output range: 0.136uV/e-
+       const Double_t rise = 40e-9;   // rise time (10-90%) of the FastOR signal before shaping
+       
+       const Double_t kTimeBinWidth = 25E-9; // sampling frequency (40MHz)
+       
+       Double_t vV = 1000. * dE * Ne * vA; // GeV 2 MeV
+       
+       TF1 signalF("signal", AnalogFastORFunction, 0, nSamples * kTimeBinWidth, 3);
+       signalF.SetParameter( 0,   vV ); 
+       signalF.SetParameter( 1, time ); // FIXME: when does the signal arrive? Might account for cable lengths
+       signalF.SetParameter( 2, rise );
+       
+       for (Int_t iTime=0; iTime<nSamples; iTime++) 
+       {
+               // FIXME: add noise (probably not simply Gaussian) according to DA measurements
+               // probably plan an access to OCDB
+               
+               timeSamples[iTime] = int((TMath::Power(2, reso) / vFSR) * signalF.Eval(iTime * kTimeBinWidth) + 0.5);
+       }
+}
+
+
+//____________________________________________________________________________ 
+//Float_t AliEMCALDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks) 
+//{ 
+//  //  Returns the shortest time among all time ticks
+//
+//  ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
+//  TIter it(ticks) ;
+//  AliEMCALTick * ctick = (AliEMCALTick *) it.Next() ;
+//  Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
+//  
+//  AliEMCALTick * t ;  
+//  while((t=(AliEMCALTick*) it.Next())){
+//    if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
+//      *ctick+=*t ;
+//    else
+//      return time ;
+//    
+//    time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
+//  }
+//  return time ;
+//}
+//
+
 //____________________________________________________________________________ 
 Bool_t AliEMCALDigitizer::Init()
 {
   // Makes all memory allocations
   fInit = kTRUE ; 
-  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
 
   if ( emcalLoader == 0 ) {
     Fatal("Init", "Could not obtain the AliEMCALLoader");  
@@ -624,24 +891,39 @@ Bool_t AliEMCALDigitizer::Init()
 void AliEMCALDigitizer::InitParameters()
 { 
   // Parameter initialization for digitizer
-  // Tune parameters - 24-nov-04; Apr 29, 2007
-  // New parameters JLK 14-Apr-2008
-
-  fMeanPhotonElectron = 4400;  // electrons per GeV 
-  fPinNoise           = 0.037; // pin noise in GEV from analysis test beam data 
-  if (fPinNoise == 0. ) 
+  
+  // Get the parameters from the OCDB via the loader
+  AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  AliEMCALSimParam * simParam = 0x0;
+  if(emcalLoader) simParam = emcalLoader->SimulationParameters();
+       
+  if(!simParam){
+         simParam = AliEMCALSimParam::GetInstance();
+         AliWarning("Simulation Parameters not available in OCDB?");
+  }
+       
+  fMeanPhotonElectron = simParam->GetMeanPhotonElectron();//4400;  // electrons per GeV 
+  fPinNoise           = simParam->GetPinNoise();//0.012; // pin noise in GeV from analysis test beam data 
+  if (fPinNoise < 0.0001 ) 
     Warning("InitParameters", "No noise added\n") ; 
-  fDigitThreshold     = fPinNoise * 3; // 3 * sigma
-  fTimeResolution     = 0.3e-9 ; // 300 psc
-  fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
+  fDigitThreshold     = simParam->GetDigitThreshold(); //fPinNoise * 3; // 3 * sigma
+  fTimeResolution     = simParam->GetTimeResolution(); //0.6e-9 ; // 600 pc
+  fTimeDelay          = simParam->GetTimeDelay(); //600e-9 ; // 600 ns
 
   // These defaults are normally not used. 
   // Values are read from calibration database instead
-  fADCchannelEC    = 0.0153; // Update 24 Apr 2007: 250./16/1024 - width of one ADC channel in GeV
-  fADCpedestalEC   = 0.0 ;  // GeV
-  fNADCEC          = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in Tower ADC - 65536
+  fADCchannelEC       = 0.0153; // Update 24 Apr 2007: 250./16/1024 - width of one ADC channel in GeV
+  fADCpedestalEC      = 0.0 ;  // GeV
+
+  fNADCEC          = simParam->GetNADCEC();//(Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in Tower ADC - 65536
+
+  AliDebug(2,Form("Mean Photon Electron %d, Noise %f, Digit Threshold %d,Time Resolution %g,NADCEC %d",
+               fMeanPhotonElectron,fPinNoise,fDigitThreshold,fTimeResolution,fNADCEC));
 
-  fTimeThreshold      = 0.001*10000000 ; // Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude ??
+  // Not used anymore, remove?
+  // fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
+  // fTimeThreshold      = 0.001*10000000 ; // Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude ??
 
 }
 
@@ -673,8 +955,13 @@ void AliEMCALDigitizer::MixWith(TString alirunFileName, TString eventFolderName)
     return ; 
   }
   // looking for the file which contains SDigits
-  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-  TString fileName( emcalLoader->GetSDigitsFileName() ) ; 
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  
+  if(!emcalLoader){
+    AliFatal("Did not get the  Loader");
+  }
+  else{
+    TString fileName( emcalLoader->GetSDigitsFileName() ) ; 
     if ( eventFolderName != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name 
       fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + eventFolderName + ".root" ;
     if ( (gSystem->AccessPathName(fileName)) ) { 
@@ -687,15 +974,18 @@ void AliEMCALDigitizer::MixWith(TString alirunFileName, TString eventFolderName)
     delete [] fInputFileNames ; 
     fInputFileNames = new TString[fInput+1] ; 
     fInputFileNames[fInput-1] = tempo ; 
+    
     tempo = fEventNames[fInput-1] ; 
     delete [] fEventNames ; 
     fEventNames = new TString[fInput+1] ; 
     fEventNames[fInput-1] = tempo ; 
-
+    
     fInputFileNames[fInput] = alirunFileName ; 
     fEventNames[fInput]     = eventFolderName ;
     fInput++ ;
+    
+  }// Loader exits
+  
 }  
 
 //__________________________________________________________________
@@ -718,31 +1008,33 @@ void AliEMCALDigitizer::Print(Option_t*)const
       nStreams =  GetNInputStreams() ;
     else 
       nStreams = fInput ; 
+  
+    AliRunLoader *rl=0;
     
     Int_t index = 0 ;  
-
-    AliRunLoader *rl=0;
-
     for (index = 0 ; index < nStreams ; index++) {  
       TString tempo(fEventNames[index]) ; 
       tempo += index ;
       if ((rl = AliRunLoader::GetRunLoader(tempo)) == 0)
-       rl = AliRunLoader::Open(fInputFileNames[index], tempo) ; 
+        rl = AliRunLoader::Open(fInputFileNames[index], tempo) ; 
       AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-      TString fileName( emcalLoader->GetSDigitsFileName() ) ; 
-      if ( fEventNames[index] != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name 
-       fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + fEventNames[index]  + ".root" ;
-      printf ("Adding SDigits from %s %s\n", fInputFileNames[index].Data(), fileName.Data()) ; 
+      if(emcalLoader){
+        TString fileName( emcalLoader->GetSDigitsFileName() ) ; 
+        if ( fEventNames[index] != AliConfig::GetDefaultEventFolderName()) // only if not the default folder name 
+          fileName = fileName.ReplaceAll(".root", "") + "_" + fEventNames[index]  + ".root" ;
+        printf ("Adding SDigits from %s %s\n", fInputFileNames[index].Data(), fileName.Data()) ; 
+      }//loader
     }
 
-    AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+    AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+
+    if(emcalLoader) printf("\nWriting digits to %s", emcalLoader->GetDigitsFileName().Data()) ;
+    else printf("\nNULL LOADER");
 
-    printf("\nWriting digits to %s", emcalLoader->GetDigitsFileName().Data()) ;
-    
     printf("\nWith following parameters:\n") ;
     
     printf("    Electronics noise in EMC (fPinNoise) = %f\n", fPinNoise) ;
-    printf("    Threshold  in EMC  (fDigitThreshold) = %f\n", fDigitThreshold)  ;
+    printf("    Threshold  in Tower  (fDigitThreshold) = %d\n", fDigitThreshold)  ;
     printf("---------------------------------------------------\n")  ;
   }
   else
@@ -754,30 +1046,35 @@ void AliEMCALDigitizer::PrintDigits(Option_t * option)
 {
   //utility method for printing digit information
 
-  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-  TClonesArray * digits  = emcalLoader->Digits() ;
-  TClonesArray * sdigits = emcalLoader->SDigits() ;
-  
-  printf("\n #Digits: %d : sdigits %d ", digits->GetEntriesFast(), sdigits->GetEntriesFast()) ; 
-  printf("\n event %d", emcalLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber());
-  
-  if(strstr(option,"all")){  
-    //loop over digits
-    AliEMCALDigit * digit;
-    printf("\nEMC digits (with primaries):\n")  ;
-    printf("\n   Id  Amplitude    Time          Index Nprim: Primaries list \n") ;    
-    Int_t index ;
-    for (index = 0 ; index < digits->GetEntries() ; index++) {
-      digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(index)) ;
-      printf("\n%6d  %8d    %6.5e %4d      %2d : ",
-             digit->GetId(), digit->GetAmp(), digit->GetTime(), digit->GetIndexInList(), digit->GetNprimary()) ;  
-      Int_t iprimary;
-      for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++) {
-       printf("%d ",digit->GetPrimary(iprimary+1) ) ; 
-      }
-    }   
-  }
-  printf("\n");
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  if(emcalLoader){
+    TClonesArray * digits  = emcalLoader->Digits() ;
+    TClonesArray * sdigits = emcalLoader->SDigits() ;
+    
+    printf("\n #Digits: %d : sdigits %d ", digits->GetEntriesFast(), sdigits->GetEntriesFast()) ; 
+    printf("\n event %d", emcalLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber());
+    
+    if(strstr(option,"all")){  
+      //loop over digits
+      AliEMCALDigit * digit;
+      printf("\nEMC digits (with primaries):\n")  ;
+      printf("\n   Id  Amplitude    Time          Index Nprim: Primaries list \n") ;    
+      Int_t index ;
+      for (index = 0 ; index < digits->GetEntries() ; index++) {
+        digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(index)) ;
+        if(digit){
+          printf("\n%6d  %8f    %6.5e %4d      %2d : ",
+                 digit->GetId(), digit->GetAmplitude(), digit->GetTime(), digit->GetIndexInList(), digit->GetNprimary()) ;  
+          Int_t iprimary;
+          for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++) {
+            printf("%d ",digit->GetPrimary(iprimary+1) ) ; 
+          }
+        }// digit exists
+      }// loop
+    }
+    printf("\n");
+  }// loader exists
+  else printf("NULL LOADER, cannot print\n");
 }
 
 //__________________________________________________________________
@@ -801,14 +1098,15 @@ void AliEMCALDigitizer::Unload()
     if ((rl = AliRunLoader::GetRunLoader(tempo))) 
       rl->GetDetectorLoader("EMCAL")->UnloadSDigits() ; 
   }
-  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-  emcalLoader->UnloadDigits() ; 
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  if(emcalLoader)emcalLoader->UnloadDigits() ; 
+  else AliFatal("Did not get the loader");
 }
 
 //_________________________________________________________________________________________
 void AliEMCALDigitizer::WriteDigits()
 {
-
+  
   // Makes TreeD in the output file. 
   // Check if branch already exists: 
   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of 
@@ -816,33 +1114,69 @@ void AliEMCALDigitizer::WriteDigits()
   //   else creates branch with Digits, named "EMCAL", title "...",
   //      and branch "AliEMCALDigitizer", with the same title to keep all the parameters
   //      and names of files, from which digits are made.
-
-  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::GetRunLoader()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
-
-  const TClonesArray * digits = emcalLoader->Digits() ; 
-  TTree * treeD = emcalLoader->TreeD(); 
-  if ( !treeD ) {
-    emcalLoader->MakeDigitsContainer();
-    treeD = emcalLoader->TreeD(); 
-  }
-
-  // -- create Digits branch
-  Int_t bufferSize = 32000 ;    
-  TBranch * digitsBranch = 0;
-  if ((digitsBranch = treeD->GetBranch("EMCAL"))) {
-    digitsBranch->SetAddress(&digits);
-    AliWarning("Digits Branch already exists. Not all digits will be visible");
-  }
-  else
-    treeD->Branch("EMCAL","TClonesArray",&digits,bufferSize);
-  //digitsBranch->SetTitle(fEventFolderName);
-  treeD->Fill() ;
   
-  emcalLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
-  emcalLoader->WriteDigitizer("OVERWRITE");
-
-  Unload() ; 
+  AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+  
+  if(emcalLoader){
+    const TClonesArray * digits = emcalLoader->Digits() ; 
+    TTree * treeD = emcalLoader->TreeD(); 
+    if ( !treeD ) {
+      emcalLoader->MakeDigitsContainer();
+      treeD = emcalLoader->TreeD(); 
+    }
+    
+    // -- create Digits branch
+    Int_t bufferSize = 32000 ;    
+    TBranch * digitsBranch = 0;
+    if ((digitsBranch = treeD->GetBranch("EMCAL"))) {
+      digitsBranch->SetAddress(&digits);
+      AliWarning("Digits Branch already exists. Not all digits will be visible");
+    }
+    else
+      treeD->Branch("EMCAL","TClonesArray",&digits,bufferSize);
+    //digitsBranch->SetTitle(fEventFolderName);
+    
+    // treeD->Fill() ;
+    /*  
+     emcalLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
+     emcalLoader->WriteDigitizer("OVERWRITE");
+     
+     Unload() ; 
+     */
+    
+  }// loader exists
+  else AliFatal("Loader not available");
+}
 
+//__________________________________________________________________
+void AliEMCALDigitizer::WriteDigits(TClonesArray* digits, const char* branchName)
+{
+       //
+       AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("EMCAL"));
+       if(emcalLoader){
+    
+    TTree* treeD = emcalLoader->TreeD(); 
+    if (!treeD) 
+    {
+      emcalLoader->MakeDigitsContainer();
+      treeD = emcalLoader->TreeD(); 
+    }
+    
+    // -- create Digits branch
+    Int_t bufferSize = 32000;
+    
+    if (TBranch* triggerBranch = treeD->GetBranch(branchName)) 
+    {
+      triggerBranch->SetAddress(&digits);
+    }
+    else
+    {
+      treeD->Branch(branchName,"TClonesArray",&digits,bufferSize);
+    }
+    
+    // treeD->Fill();
+  }// loader exists
+  else AliFatal("Loader not available");
 }
 
 //__________________________________________________________________