]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALQAChecker.cxx
Option for patching of the omega dalitz decay.
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALQAChecker.cxx
index 519e7b88b314fe809bb88c49a9fc63e17145f05a..f8c2c49b564e129b89aa7294afdd632608d8103d 100644 (file)
 
   Based on PHOS code written by
   Y. Schutz CERN July 2007
-*/
+
+ For the moment we only implement the checking of raw data QA.
+ The checked for ESD and RecPoints will be implemented later.
+
+ */
+
 
 // --- ROOT system ---
 #include <TClass.h>
-#include <TH1F.h> 
+#include <TH1.h> 
+#include <TF1.h> 
 #include <TH1I.h> 
 #include <TIterator.h> 
 #include <TKey.h> 
 #include <TFile.h> 
+#include <TLine.h>
+#include <TPaveText.h>
+#include <TMath.h>
 
 // --- Standard library ---
 
 // --- AliRoot header files ---
 #include "AliLog.h"
-#include "AliQA.h"
+#include "AliQAv1.h"
 #include "AliQAChecker.h"
 #include "AliEMCALQAChecker.h"
 
 ClassImp(AliEMCALQAChecker)
 
+//__________________________________________________________________
+AliEMCALQAChecker::AliEMCALQAChecker() : 
+AliQACheckerBase("EMCAL","EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
+fLine(new TLine*[fknSM]),
+fHref(new TLine*[fknSM]),
+fText(NULL)
+{
+       /// ctor
+  for (Int_t sm = 0 ; sm < fknSM ; sm++){
+    fLine[sm] = NULL ; 
+    fHref[sm] = NULL ; 
+  }
+}          
+
+//__________________________________________________________________
+AliEMCALQAChecker::~AliEMCALQAChecker() 
+{
+       /// dtor
+  delete [] fLine ; 
+  delete [] fHref ;
+  if (fText) 
+    delete fText ; 
+}
+
+//__________________________________________________________________
+AliEMCALQAChecker::AliEMCALQAChecker(const AliEMCALQAChecker& qac) : 
+AliQACheckerBase(qac.GetName(), qac.GetTitle()), 
+fLine(new TLine*[fknSM]),
+fHref(new TLine*[fknSM]),
+fText(qac.fText)
+{
+       /// copy ctor 
+  for (Int_t sm = 0 ; sm < fknSM ; sm++){
+    fLine[sm] = qac.fLine[sm] ; 
+    fHref[sm] = qac.fHref[sm] ; 
+  }
+}   
+//__________________________________________________________________
+AliEMCALQAChecker& AliEMCALQAChecker::operator = (const AliEMCALQAChecker &qac)
+{
+  fText = qac.fText;
+
+  for (Int_t sm = 0 ; sm < fknSM ; sm++){
+    fLine[sm] = qac.fLine[sm] ; 
+    fHref[sm] = qac.fHref[sm] ; 
+  }
+  return *this ;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+Double_t *
+AliEMCALQAChecker::Check(AliQAv1::ALITASK_t index, TObjArray ** list, const AliDetectorRecoParam * /*recoParam*/)
+{
+       /// Check objects in list
+       
+       if ( index == AliQAv1::kRAW ) 
+       {
+               return CheckRaws(list);
+               printf ("checkers for task %d \n", index) ;             
+       }
+       
+       if ( index == AliQAv1::kREC)
+       {
+               return CheckRecPoints(list);
+       }
+       
+       if ( index == AliQAv1::kESD )
+       {
+               return CheckESD(list);
+       }
+       AliWarning(Form("Checker for task %d not implement for the moment",index));
+       return NULL;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+TH1* 
+AliEMCALQAChecker::GetHisto(TObjArray* list, const char* hname, Int_t specie) const
+{
+       /// Get a given histo from the list
+       TH1* h = static_cast<TH1*>(list->FindObject(Form("%s_%s",AliRecoParam::GetEventSpecieName(specie),hname)));
+       if (!h)
+       {
+               AliError(Form("Did not find expected histo %s",hname));
+       }
+       return h;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+Double_t 
+AliEMCALQAChecker::MarkHisto(TH1& histo, Double_t value) const
+{
+       /// Mark histo as originator of some QA error/warning
+       
+       if ( value != 1.0 )
+       {
+               histo.SetBit(AliQAv1::GetQABit());
+       }
+       
+       return value;
+}
+
+
+//______________________________________________________________________________
+Double_t *
+AliEMCALQAChecker::CheckRaws(TObjArray ** list)
+{
+//  Check RAW QA histograms    
+//  We count the times of the response for each tower, the propability for all towers should be the same (average is given value).
+//  We skip the first few cycles since the statistics is not enough, the average should be always larger than 1 at least.
+//  By calculating the difference between the counts for each tower and the average, we decide whether we should recalculate 
+//  the average depending the the gaus fitting on the divation distribution. 
+//  During the recalutation of the average, we count how many towers are used for the calculation.
+//  From the fraction of towers used, we decide whether each SM works fine or not
+//  From the divation of average, we set the QA flag for the full detetcor as INFO, WARNING, ERROR or FATAL.
+  
+//  -- Yaxian Mao, CCNU/CERN/LPSC
+                                       
+  Float_t kThreshold = 80. ; 
+  
+  Double_t * test = new Double_t[AliRecoParam::kNSpecies] ;
+  for (Int_t specie = 0 ; specie < AliRecoParam::kNSpecies ; specie++) {
+    test[specie] = 1.0 ; 
+    if ( !AliQAv1::Instance()->IsEventSpecieSet(specie)) 
+      continue ; 
+    if (list[specie]->GetEntries() == 0)  
+      test[specie] = 0. ; // nothing to check
+    else {
+      TH1 * hdata = (TH1*)list[specie]->At(kTowerHG) ; 
+      if(hdata->GetEntries()==0)
+       continue;
+      Int_t  nbin   = hdata->GetNbinsX() ;
+      Int_t  nTower = nbin/4 ;  // ! number of channels for each SM
+      if(fText) {
+        fText->DeleteText() ; 
+        fText->Clear() ;
+      }
+      else {
+        fText = new TPaveText(0.3,0.6,0.7,0.9,"NDC") ;
+      }
+      fText->AddText(Form("OK if more than %2.2f %% inside aver-sigma < HG counts < aver+sigma", kThreshold));
+      //TPaveText * fText[fknSM] = {0};
+      Double_t rv    = 0. ;   //value to define the flag for the full detector
+      for(Int_t iSM = 0 ; iSM < fknSM ; iSM++){  //number of SMs loop start
+        TString projname = Form("proj_%d",iSM);
+        Double_t aver  = 0. ;  //average calculated by the input histogram
+        Double_t recal = 0 ;   // recalculate the average if the divation is large
+        Double_t init  = 0. ;   // value to decide whether we should recalculate the average
+        Double_t mean  = 0. ;  //the divation from the average, from the gaus fitting peak 
+        Double_t width = 0. ;   // the sigma of the devation, from the gaus fitting
+        Int_t flag     = 0 ;  //counts for channels used for recalculation of average
+        Double_t ratio = 0. ;  //value to decide whether each SM works
+        TH1F * proj    = NULL  ;  //a temp histogram store the difference from the average for the fitting procedure       
+       
+       for(Int_t iTower = iSM*nTower ; iTower<(iSM+1)*nTower ; iTower++)  //channel loop to calculate the average
+          aver += hdata->GetBinContent(iTower);
+        
+        aver /=nTower;
+        AliInfo(Form("SM: %d has average = %f\n",iSM, aver));
+       Double_t ymin = hdata->GetBinContent(hdata->GetMinimumBin());
+       Double_t ymax = hdata->GetBinContent(hdata->GetMaximumBin());
+        proj = new TH1F(projname,projname,nbin,-aver,aver);
+       fLine[iSM] = dynamic_cast<TLine*>(hdata->GetListOfFunctions()->FindObject(fLine[iSM]));
+        //initialize the lines separate different SM
+       if (!fLine[iSM]) {
+          fLine[iSM] = new TLine((iSM+1)*nTower,ymin,(iSM+1)*nTower,ymax);
+          fLine[iSM]->SetLineColor(1);
+          fLine[iSM]->SetLineWidth(2);
+          hdata->GetListOfFunctions()->Add(fLine[iSM]);  
+          list[specie]->AddAt(hdata, kTowerHG) ; 
+        }          
+        else {
+          fLine[iSM]->SetX1((iSM+1)*nTower) ; 
+          fLine[iSM]->SetY1(ymin) ; 
+          fLine[iSM]->SetX2((iSM+1)*nTower) ; 
+          fLine[iSM]->SetY2(ymax) ; 
+        }
+        //filling the histogram with the difference and fitting with gaus function to obtain mean and sigma
+       for(Int_t iTower = iSM*nTower ; iTower<(iSM+1)*nTower ; iTower++){
+        proj->Fill(hdata->GetBinContent(iTower)-aver);
+       }       
+       proj->Fit("gaus","","QNO");
+       mean=proj->GetFunction("gaus")->GetParameter(1); // ! mean should be peaked at 0 in principal
+       width=proj->GetFunction("gaus")->GetParameter(2);
+       AliInfo(Form("aver = %f, mean = %f, sigma =%f\n",aver,mean, width));
+        
+       if(aver) init=TMath::Abs(mean/aver);  //calculate the divation from the average 
+       
+       //if mean or sigma is too huge or the sigma is too small, the fitting failed 
+        if((aver+mean) < 1. || width/aver >2. || width < 1.e-3) 
+          flag = -1 ;
+       else {   //recalculate the average if the fitting didn't give the initial average  
+              aver+=mean;  //average corrected after fitting is fitting works
+            //if(aver <= 1. ) break ;
+           // if divation is too large, we conside to recalate the average by excluding channels too far from the average
+         while(init>0.01 && aver >= 1.){
+          if(flag) flag = 0 ;    //for each time recalculation, reset flag 
+           for(Int_t iTower = iSM*nTower ; iTower < (iSM+1)*nTower ; iTower++){
+             if(hdata->GetBinContent(iTower)>(aver-width) && hdata->GetBinContent(iTower)<(aver+width)){
+               flag++ ;
+                    recal += hdata->GetBinContent(iTower);
+             }  
+           }  //end of channels loop 
+           
+           if(flag == 0 || recal < 1.) {
+             flag = -1 ;
+             break ;
+           }
+           else {
+             recal/=flag ;
+                  init=(aver-recal)/(aver+recal) ; //difference between the new average and the pervious one
+            aver =(aver+recal)/2 ; //recalculate the average by the last two values  
+           }  
+         } //out of while condition
+          
+         ratio=100.0*flag/nTower ;  //counting how many towers used for average recalculation
+              AliInfo(Form("SM %d has %2.2f %% chanhel works \n", iSM, ratio));
+       }  // end of recalculation
+        
+        rv+=init ; //define the deviation from the final average
+    
+        //define the average line on each SM
+       fHref[iSM] = dynamic_cast<TLine*>(hdata->GetListOfFunctions()->FindObject(fHref[iSM]));
+       if(!fHref[iSM]) {
+         fHref[iSM] = new TLine(iSM*nTower,aver,(iSM+1)*nTower,aver);
+              hdata->GetListOfFunctions()->Add(fHref[iSM]);  
+              list[specie]->AddAt(hdata, kTowerHG) ; 
+       }          
+       else {
+         fHref[iSM]->Clear() ; 
+              fHref[iSM]->SetX1(iSM*nTower) ; 
+         fHref[iSM]->SetY1(aver) ; 
+         fHref[iSM]->SetX2((iSM+1)*nTower) ; 
+         fHref[iSM]->SetY2(aver) ; 
+       }
+        
+        hdata->Paint() ; 
+        // if channels used for average recalculation smaller than the threshold,
+        // then too much noise channels or channels didn't work 
+        if(ratio<= kThreshold && flag >0){                             
+          //fText->SetFillColor(2);
+          fHref[iSM]->SetLineColor(2);
+               fHref[iSM]->SetLineWidth(2);
+               fText->SetFillColor(2);
+               fText->AddText(Form("SM %d: NOK = %2.0f %% channels OK!!!",iSM,ratio));
+               //fText[iSM]->AddText(Form("SM %d NOT OK, only %5.2f %% works!!!",iSM,flag/nTower));
+        }         
+        else if (flag == -1 || flag == 0 ) {  //fitting failed or recalculation didn't call
+          fText->SetFillColor(2);
+          fHref[iSM]->SetLineColor(2);
+          fHref[iSM]->SetLineWidth(2);
+          fText->SetFillColor(2);
+          fText->AddText(Form("SM %d: NOK Fitting failed",iSM,ratio));
+               //fText[iSM]->AddText(Form("SM %d has %5.2f %% towers wok normally",iSM,flag/nTower));
+        }  
+        else {
+          fText->SetFillColor(3);
+               fHref[iSM]->SetLineColor(3);
+               fHref[iSM]->SetLineWidth(2);
+               fText->AddText(Form("SM %d: OK = %2.0f %% channels OK",iSM,ratio));
+               //fText[iSM]->AddText(Form("SM %d has %5.2f %% towers wok normally",iSM,flag/nTower));
+        }
+        hdata->Paint() ; 
+       //hdata->GetListOfFunctions()->Add(fText[iSM]);
+       delete proj ; 
+      }  // end of SM loop
+      rv/=fknSM;
+      hdata->GetListOfFunctions()->Add(fText);
+      hdata->Paint() ;  
+      if ( rv <=0.1 ) {
+        AliInfo(Form("The deviation rv = %2.2f is small compared to average, detector works fine",rv));
+        test[specie] =  0.05;
+      }
+      
+      if ( rv <=0.5 && rv >0.1 )  {
+        AliWarning(Form("The deviation rv = %2.2f is acceptable from average,  the detector works not perfect!",rv));
+        test[specie] =  0.3;
+      }
+      
+      if ( rv <=0.8 && rv >0.5 ) {
+        AliError(Form("Got a large deviation of %2.2f from average, some error on the detector !!!",rv));
+        test[specie] =  0.7;
+      }
+      
+      if ( rv >0.8 ) {
+        AliError(Form("Got too large deviation of %2.2f from average, detector out of control ???",rv));
+        test[specie] =  0.9; 
+      }
+    
+    } //end of checking raw
+    
+  }  //species loop 
+  return test ;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliEMCALQAChecker::Init(const AliQAv1::DETECTORINDEX_t det) 
+{
+       /// intialises QA and QA checker settings
+       AliQAv1::Instance(det) ; 
+       Float_t hiValue[AliQAv1::kNBIT] ; 
+       Float_t lowValue[AliQAv1::kNBIT] ;
+       lowValue[AliQAv1::kINFO]      = 0.0   ; 
+       hiValue[AliQAv1::kINFO]       = 0.1 ; 
+       lowValue[AliQAv1::kWARNING]   = 0.1 ; 
+  hiValue[AliQAv1::kWARNING]    = 0.5 ; 
+       lowValue[AliQAv1::kERROR]     = 0.5   ; 
+       hiValue[AliQAv1::kERROR]      = 0.8 ; 
+       lowValue[AliQAv1::kFATAL]     = 0.8   ; 
+       hiValue[AliQAv1::kFATAL]      = 1.0 ; 
+       SetHiLo(&hiValue[0], &lowValue[0]) ; 
+}