]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - FMD/AliFMDReconstructor.cxx
o First Version of TRDnSigma implementation (Xianguo) o still requires some catching...
[u/mrichter/AliRoot.git] / FMD / AliFMDReconstructor.cxx
index 085c91a37e881db584de8724232cf6c9b0e0555b..38bf2945ade2ca479d7c0f32854d2571995a3076 100644 (file)
@@ -1,3 +1,16 @@
+//____________________________________________________________________
+//
+// This is a class that constructs AliFMDRecPoint objects from of Digits
+// This class reads either digits from a TClonesArray or raw data from 
+// a DDL file (or similar), and stores the read ADC counts in an
+// internal cache (fAdcs).   The rec-points are made via the naiive
+// method. 
+//
+//-- Authors: Evgeny Karpechev(INR) and Alla Maevsksia
+//  Latest changes by Christian Holm Christensen <cholm@nbi.dk>
+//
+//
+//____________________________________________________________________
 /**************************************************************************
  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
  *                                                                        *
  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
+/* $Id$ */
+/** 
+ * @file    AliFMDReconstructor.cxx
+ * @author  Christian Holm Christensen <cholm@nbi.dk>
+ * @date    Mon Mar 27 12:47:09 2006
+ * @brief   FMD reconstruction 
+*/
+
+// #include <AliLog.h>                        // ALILOG_H
+// #include <AliRun.h>                        // ALIRUN_H
+#include "AliFMDDebug.h"
+#include "AliFMDGeometry.h"                // ALIFMDGEOMETRY_H
+#include "AliFMDParameters.h"              // ALIFMDPARAMETERS_H
+#include "AliFMDAltroMapping.h"            // ALIFMDALTROMAPPING_H
+#include "AliFMDDigit.h"                   // ALIFMDDIGIT_H
+#include "AliFMDSDigit.h"                  // ALIFMDDIGIT_H
+#include "AliFMDReconstructor.h"           // ALIFMDRECONSTRUCTOR_H
+#include "AliFMDRecoParam.h"               // ALIFMDRECOPARAM_H
+#include "AliFMDRawReader.h"               // ALIFMDRAWREADER_H
+#include "AliFMDRecPoint.h"               // ALIFMDMULTNAIIVE_H
+#include "AliESDEvent.h"                  // ALIESDEVENT_H
+#include "AliESDVertex.h"                 // ALIESDVERTEX_H
+#include "AliESDTZERO.h"                  // ALIESDVERTEX_H
+#include <AliESDFMD.h>                    // ALIESDFMD_H
+#include <TMath.h>
+#include <TH1.h>
+#include <TH2.h>
+#include <TFile.h>
+#include <climits>
+#include "AliFMDESDRevertexer.h"
 
-//_________________________________________________________________________
-// This is a class that constructs ReconstParticles (reconstructed particles) 
-// out of Digits
-// 
-//-- Authors: Evgeny Karpechev(INR) and Alla Maevsksia
-//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-
-// --- ROOT system ---
-#include "TTask.h"
-#include "TTree.h"
-#include "TSystem.h"
-#include "TFile.h"
-#include "TROOT.h"
-#include "TFolder.h"
-#include "TH2F.h"
-
-// --- Standard library ---
-#include <stdlib.h>
-#include <Riostream.h>
-
-// --- AliRoot header files ---
-
-#include "AliRunLoader.h"
-#include "AliLoader.h"
-
-#include "AliFMDdigit.h"
-#include "AliFMDhit.h"
-#include "AliFMDReconstParticles.h"
-#include "AliFMD.h"
-#include "AliFMDv1.h"
-#include "AliFMDReconstructor.h"
-#include "AliRun.h"
-#include "AliConfig.h"
-#include "AliHeader.h"
-#include "AliGenEventHeader.h"
 
+class AliRawReader;
+
+//____________________________________________________________________
 ClassImp(AliFMDReconstructor)
+#if 0
+  ; // This is here to keep Emacs for indenting the next line
+#endif
+
+//____________________________________________________________________
+AliFMDReconstructor::AliFMDReconstructor() 
+  : AliReconstructor(),
+    fMult(0x0), 
+    fNMult(0),
+    fTreeR(0x0),
+    fCurrentVertex(0),
+    fESDObj(0x0),
+    fNoiseFactor(0),
+    fAngleCorrect(kTRUE),
+    fVertexType(kNoVertex),
+    fESD(0x0),
+    fDiagnostics(kFALSE),
+    fDiagStep1(0), 
+    fDiagStep2(0),
+    fDiagStep3(0),
+    fDiagStep4(0),
+    fDiagAll(0),
+    fBad(0), 
+    fZombie(false)
+{
+  // Make a new FMD reconstructor object - default CTOR.  
+  SetNoiseFactor();
+  SetAngleCorrect();
+  if (AliDebugLevel() > 0) fDiagnostics = kTRUE;
+  for(Int_t det = 1; det<=3; det++) {
+    fZS[det-1]       = kFALSE;
+    fZSFactor[det-1] = 0;
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________
+AliFMDReconstructor::~AliFMDReconstructor() 
+{
+  // Destructor 
+  if (fMult)   fMult->Delete();
+  if (fMult)   delete fMult;
+  if (fESDObj) delete fESDObj;
+}
 
-        
-//____________________________________________________________________________
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Init() 
+{
+  // Initialize the reconstructor 
 
-void AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliRunLoader* runLoader) const
-{ 
- //Collects all digits in the same active volume into number of particles
-  /*
-    Reconstruct number of particles 
-    in given group of pads for given FMDvolume
-    determine by numberOfVolume , 
-    numberOfMinSector,numberOfMaxSector,
-    numberOfMinRing, numberOgMaxRing
-    Reconstructor method choose dependence on number of empty pads  
-  */
+  // Initialize the geometry 
+  AliFMDGeometry* geom = AliFMDGeometry::Instance();
+  geom->Init();
+  geom->InitTransformations();
 
+  // Initialize the parameters
+  AliFMDParameters* param = AliFMDParameters::Instance();
+  if (param->Init() != 0) {
+    AliError("Failed to initialize parameters, making zombie");
+    fZombie = true;
+  }
+  else 
+    fZombie = false;
+  
+  // Current vertex position
+  fCurrentVertex = 0;
+  // Create array of reconstructed strip multiplicities 
+  // fMult = new TClonesArray("AliFMDRecPoint", 51200);
+  // Create ESD output object 
+  fESDObj = new AliESDFMD;
+  
+  // Check if we need diagnostics histograms 
+  if (!fDiagnostics) return;
+  AliInfo("Making diagnostics histograms");
+  if (!fDiagStep1) {
+    fDiagStep1   = new TH2I("diagStep1", "Read ADC vs. Noise surpressed ADC",
+                           1024, -.5, 1023.5, 1024, -.5, 1023.5);
+    fDiagStep1->SetDirectory(0);
+    fDiagStep1->GetXaxis()->SetTitle("ADC (read)");
+    fDiagStep1->GetYaxis()->SetTitle(Form("ADC (noise surpressed %4.f)", 
+                                         fNoiseFactor));
+  }
+  if (!fDiagStep2) {
+    fDiagStep2  = new TH2F("diagStep2",  "ADC vs Edep deduced",
+                          1024, -.5, 1023.5, 100, 0, 2);
+    fDiagStep2->SetDirectory(0);
+    fDiagStep2->GetXaxis()->SetTitle("ADC (noise surpressed)");
+    fDiagStep2->GetYaxis()->SetTitle("#Delta E [GeV]");
+  }
+  if (!fDiagStep3) {
+    fDiagStep3  = new TH2F("diagStep3",  "Edep vs Edep path corrected",
+                          100, 0., 2., 100, 0., 2.);
+    fDiagStep3->SetDirectory(0);
+    fDiagStep3->GetXaxis()->SetTitle("#Delta E [GeV]");
+    fDiagStep3->GetYaxis()->SetTitle("#Delta E/#Delta x #times #delta x [GeV]");
+  }
+  if (!fDiagStep4) {
+    fDiagStep4  = new TH2F("diagStep4",  "Edep vs Multiplicity deduced", 
+                          100, 0., 2., 100, -.1, 19.9);
+    fDiagStep4->SetDirectory(0);
+    fDiagStep4->GetXaxis()->SetTitle("#Delta E/#Delta x #times #delta x [GeV]");
+    fDiagStep4->GetYaxis()->SetTitle("Multiplicity");
+    fDiagAll    = new TH2F("diagAll",    "Read ADC vs Multiplicity deduced", 
+                          1024, -.5, 1023.5, 100, -.1, 19.9);
+  }
+  if (fDiagAll) {
+    fDiagAll->SetDirectory(0);
+    fDiagAll->GetXaxis()->SetTitle("ADC (read)");
+    fDiagAll->GetYaxis()->SetTitle("Multiplicity");
+  }
+}
 
-#ifdef DEBUG
-  Info("Exec ","Start");
-#endif
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* reader, 
+                                  TTree* digitsTree) const
+{
+  // Convert Raw digits to AliFMDDigit's in a tree 
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return;
+  }
+  AliFMDDebug(1, ("Reading raw data into digits tree"));
+  if (!digitsTree) { 
+    AliError("No digits tree passed");
+    return;
+  }
+  static TClonesArray* array = 0;
+  if (!array) array = new TClonesArray("AliFMDDigit");
+  digitsTree->Branch("FMD", &array);
+  array->Clear();
+  
+  AliFMDRawReader rawRead(reader, digitsTree);
+  // rawRead.SetSampleRate(fFMD->GetSampleRate());
+  // rawRead.Exec();
+  rawRead.ReadAdcs(array);
 
-  Int_t const knumVolumes=5;
-  Int_t padADC;
-  Float_t eta, etain,etaout,rad,theta;
-  Int_t ivol, iSector, iRing;
-  Float_t rin[5]={4.2,15.4,4.2,15.4,4.2};
-  Float_t rout[5]={17.4,28.4,17.4,28.4,17.4};
-  Float_t z[5]={-62.8, -75.2, 83.4, 75.2, 340.};
-  Int_t numberOfRings[5]={512,256,512,256,512};
-  Int_t numberOfSectors[5]=  {20,40,20,40,20};
-  Int_t numberOfEtaIntervals[5];
-  // number of ring for boundary 0.1 eta
+  Int_t nWrite = digitsTree->Fill();
+  AliDebugF(1, "Got a grand total of %d digits, wrote %d bytes to tree", 
+           array->GetEntriesFast(), nWrite);
 
   
-  if (runLoader == 0x0)
-   {
-    Error("Exec","Run Loader loader is NULL - Session not opened");
+  AliFMDAltroMapping* map = AliFMDParameters::Instance()->GetAltroMap();
+  for (UShort_t i = 1; i <= 3; i++) { 
+    fZS[i-1]       = rawRead.IsZeroSuppressed(map->Detector2DDL(i));
+    fZSFactor[i-1] = rawRead.NoiseFactor(map->Detector2DDL(i));
+    AliDebugF(2, "Noise factor for FMD%hu: %d", i, fZSFactor[i-1]);
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::GetVertex(AliESDEvent* esd) const
+{
+  // Return the vertex to use. 
+  // This is obtained from the ESD object. 
+  // If not found, a warning is issued.
+  fVertexType    = kNoVertex;
+  fCurrentVertex = 0;
+  if (!esd) return;
+  
+  const AliESDVertex* vertex = esd->GetPrimaryVertex();
+  if (!vertex)        vertex = esd->GetPrimaryVertexSPD();
+  if (!vertex)        vertex = esd->GetPrimaryVertexTPC();
+  if (!vertex)        vertex = esd->GetVertex();
+
+  if (vertex) {
+    AliFMDDebug(2, ("Got %s (%s) from ESD: %f", 
+                   vertex->GetName(), vertex->GetTitle(), vertex->GetZv()));
+    fCurrentVertex = vertex->GetZv();
+    fVertexType    = kESDVertex;
     return;
-   }
-
-  AliLoader* plFMD = runLoader->GetLoader("FMDLoader");
-  if (plFMD == 0x0)
-   {
-     Fatal("AliFMDReconstructor","Can not find FMD (loader) in specified event");
-     return;//never reached
-   }
-   
-  if (!runLoader->GetAliRun()) runLoader->LoadgAlice();
-  if (!runLoader->TreeE()) runLoader->LoadHeader();
-
-  TDirectory* cwd = gDirectory;
-  gDirectory = 0x0;
-  Text_t buf1[20];
-  TH2F* hTotal[10];
-  for (Int_t j=1; j<=5; j++){
-    sprintf(buf1,"hTotal%d",j);
+  }
+  else if (esd->GetESDTZERO()) { 
+    AliFMDDebug(2, ("Got primary vertex from T0: %f", esd->GetT0zVertex()));
+    fCurrentVertex = esd->GetT0zVertex();
+    fVertexType    = kESDVertex;
+    return;
+  }
+  AliWarning("Didn't get any vertex from ESD or generator");
+}
+  
+//____________________________________________________________________
+Int_t
+AliFMDReconstructor::GetIdentifier() const
+{
+  // Get the detector identifier. 
+  // Note the actual value is cached so that we do not 
+  // need to do many expensive string comparisons. 
+  static Int_t idx = AliReconstruction::GetDetIndex(GetDetectorName());
+  return idx;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+const AliFMDRecoParam*
+AliFMDReconstructor::GetParameters() const
+{
+  // Get the reconstruction parameters. 
+  // 
+  // Return: 
+  //   Pointer to reconstruction parameters or null if not found or wrong type
+  Int_t iDet = GetIdentifier(); // Was 12 - but changed on Cvetans request
+  const AliDetectorRecoParam* params = AliReconstructor::GetRecoParam(iDet);
+  if (!params || params->IsA() != AliFMDRecoParam::Class()) return 0;
+  return static_cast<const AliFMDRecoParam*>(params);
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::UseRecoParam(Bool_t set) const
+{
+  // 
+  // Set-up reconstructor to use values from reconstruction
+  // parameters, if present, for this event.   If the argument @a set
+  // is @c false, then restore preset values. 
+  // 
+  // Parameters:
+  //    set 
+  //  
+  static Float_t savedNoiseFactor  = fNoiseFactor;
+  static Bool_t  savedAngleCorrect = fAngleCorrect;
+  if (set) { 
+    const AliFMDRecoParam* params  = GetParameters();
+    if (params) { 
+      fNoiseFactor  = params->NoiseFactor();
+      fAngleCorrect = params->AngleCorrect();
+    }
+    return;
+  }
+  fNoiseFactor  = savedNoiseFactor;
+  fAngleCorrect = savedAngleCorrect;
+}
+  
+  
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::MarkDeadChannels(AliESDFMD* esd) const
+{
+  // Loop over all entries of the ESD and mark 
+  // those that are dead as such 
+  // - otherwise put in the zero signal. 
+  AliFMDParameters* param = AliFMDParameters::Instance();
+
+  for (UShort_t d = 1; d <= 3; d++) { 
+    UShort_t nR = (d == 1 ? 1 : 2);
+
+    for (UShort_t q = 0; q < nR; q++) {
+      Char_t   r  = (q == 0 ? 'I' : 'O');
+      UShort_t nS = (q == 0 ?  20 :  40);
+      UShort_t nT = (q == 0 ? 512 : 256);
+
+      for (UShort_t s = 0; s < nS; s++) { 
+       for (UShort_t t = 0; t < nT; t++) {
+         // A strip can be marked `bad' for two reasons: 
+         // 
+         // - The raw reader fails to read the value 
+         // - The strip is marked in OCDB as bad (IsDead) 
+         // 
+         // Hence, a dead strip will always be marked kInvalid here, 
+         // while a non-dead bad-read strip will be filled with 0. 
+         if (fBad(d, r, s, t)) { 
+           AliDebugF(5, "Marking FMD%d%c[%2d,%3d] as bad", d, r, s, t);
+           esd->SetMultiplicity(d, r, s, t, AliESDFMD::kInvalidMult);
+         }         
+         if (param->IsDead(d, r, s, t)) { 
+           AliDebugF(5, "Marking FMD%d%c[%2d,%3d] as dead", d, r, s, t);
+           esd->SetMultiplicity(d, r, s, t, AliESDFMD::kInvalidMult);
+           // esd->SetEta(d, r, s, t, AliESDFMD::kInvalidEta);
+         }
+         else if (esd->Multiplicity(d, r, s, t) == AliESDFMD::kInvalidMult) {
+           AliDebugF(20, "Setting null signal in FMD%d%c[%2d,%3d]", 
+                     d, r, s, t);
+           esd->SetMultiplicity(d, r, s, t, 0);
+         }
+         else {
+           AliDebugF(10, "Setting FMD%d%c[%2d,%3d]=%f",d,r,s,t,
+                     esd->Multiplicity(d, r, s, t));
+         }
+       }
+      }
+    }
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________
+Bool_t
+AliFMDReconstructor::PreReconstruct() const
+{
+  AliFMDDebug(1, ("Before reoconstructing"));
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return false;
+  }
+
+  // Get our vertex
+  GetVertex(fESD);
+
+  // Reset bad flags 
+  fBad.Reset(false);
+
+  // Reset the output ESD 
+  if (fESDObj) {
+    fESDObj->Clear();
     
-    hTotal[j] = new TH2F(buf1," Number of primary particles ",
-                        numberOfSectors[j-1],1,numberOfSectors[j-1],
-                        numberOfRings[j-1],1,numberOfRings[j-1]);
-  }   
-  gDirectory = cwd;
-  plFMD->LoadRecPoints("RECREATE");
-  Int_t retval=0;     
-  Int_t nevents=Int_t (runLoader->TreeE()->GetEntries()); 
-#ifdef DEBUG
-  cout<<" nevents "<<nevents<<endl;
-#endif
-   for(Int_t ievent=0;ievent<nevents;ievent++)
-    { 
-#ifdef DEBUG
-      cout<<" *** event "<<ievent<<endl; 
-#endif
-      runLoader->GetEvent(ievent) ;
-      //event z-vertex for correction eta-rad dependence      
-      AliHeader *header = runLoader->GetHeader();
-      AliGenEventHeader* genHeader = header->GenEventHeader();
-      TArrayF *o = new TArrayF(3); 
-      genHeader->PrimaryVertex(*o);
-      Float_t zVertex=o->At(2);
-
-      for (Int_t i=0; i<5; i++)
-        hTotal[i+1]->Reset();
-      
-      retval = plFMD->LoadDigits("READ"); 
-      if (retval)
-       {
-         Error("Exec","Error occured while loading digits. Exiting.");
-         return;
+    // Pre-set eta values 
+    for (UShort_t d=1; d<=3; d++) { 
+      UShort_t nQ = (d == 1 ? 1 : 2);
+      for (UShort_t q=0; q<nQ; q++) { 
+       UShort_t nStr = (q == 0 ? 512 : 256);
+       Char_t   r    = (q == 0 ? 'I' : 'O');
+       
+       for (UShort_t t = 0; t < nStr; t++) { 
+         Float_t eta, phi;
+         // Always use sector 0
+         PhysicalCoordinates(d, r, 0, t, eta, phi);
+         fESDObj->SetEta(d, r, 0, t, eta);
        }
-      
-      AliFMD * fFMD = (AliFMD *)gAlice->GetDetector("FMD");
-      TClonesArray *fReconParticles=fFMD->ReconParticles();
-      TClonesArray *fDigits=fFMD->Digits();
+      }
+    }
+  }
+
+
+  return true;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliFMDRawReader& rawReader) const
+{
+  // Reconstruct directly from raw data (no intermediate output on
+  // digit tree or rec point tree).  
+  // 
+  // Parameters: 
+  //   rawReader       FMD Raw event reader 
+  AliFMDDebug(1, ("Reconstructing from FMD raw reader"));
+  if (!PreReconstruct()) return;
+
+  UShort_t det, sec, str, fac;
+  Short_t  adc, oldDet = -1;
+  Bool_t   zs;
+  Char_t   rng;
  
-      TTree* treeD = plFMD->TreeD();
-      if (treeD == 0x0)
-       {
-         Error("Exec","Can not get Tree with Digits. Nothing to reconstruct - Exiting");
-         return;
-       }
-      
-      TBranch *brDigits=0;
-           
-      brDigits=treeD->GetBranch("FMD");
-
-      if (brDigits) {
-       brDigits->SetAddress(&fDigits);
-      }else{
-       cerr<<"EXEC Branch FMD digits not found"<<endl;
-       return;
-      } 
-         
-      if(plFMD->TreeR()==0) plFMD->MakeTree("R");
-
-      //Make branches
-      fFMD->MakeBranch("R");
-
-      
-      Int_t zeroADC=6;
-      // read Digits 
-      AliFMDdigit  *fmdDigit;
-       if (fFMD)
-       {
-         plFMD->TreeD()->GetEvent(0); 
-                 
-         Int_t nDigits=fDigits->GetEntries();
-         Int_t recParticles[6];
-         Int_t nRecPart=0 ;
-         Int_t zeroPads=0;
-         Int_t numberOfPads=0;
-         Int_t pedestal;
-         Float_t channelWidth=(22400*50)/1024;
-         for (Int_t digit=0;digit<nDigits;digit++) 
-           {
-             fmdDigit=(AliFMDdigit*)fDigits->UncheckedAt(digit);    
-             ivol=fmdDigit->Volume();
-             iSector=fmdDigit->NumberOfSector();
-             iRing=fmdDigit->NumberOfRing();
-             pedestal=Int_t(gRandom->Gaus(500,250));
-             padADC= fmdDigit->ADCsignal()
-               -Int_t(Float_t(pedestal)/channelWidth);
-             if (padADC<0) padADC=0;
-              hTotal[ivol]->Fill(iSector,iRing,padADC);
-           } //digit loop
-
-         //reconstruct multiplicity in 0.1 eta according Poisson distribution 
-
-         Int_t rmin=0; Int_t rmax=0; 
-         Int_t smin=0; Int_t smax=0; 
-         for (ivol=0; ivol<knumVolumes; ivol++)
-           {
-             Float_t ring2number=Float_t (numberOfRings[ivol])/
-               (rout[ivol]-rin[ivol]);
-             Float_t realZ=zVertex+z[ivol];
-             theta=TMath::ATan(rout[ivol]/TMath::Abs(realZ));
-             etain = - TMath::Log( TMath::Tan(theta/2.));
-             theta=TMath::ATan(rin[ivol]/TMath::Abs(realZ));
-             etaout=- TMath::Log( TMath::Tan(theta/2.));
-             numberOfEtaIntervals[ivol]=Int_t((etaout-etain)*10)-1;
-             eta=etain;
-             for (Int_t e1=0;e1<=numberOfEtaIntervals[ivol];e1++) 
-               {
-                 theta = 2.*TMath::ATan (TMath::Exp (-eta));
-                 Float_t radmin = TMath::Abs(realZ) * (TMath::Tan (theta));
-                 rmax= Int_t ( (radmin-rin[ivol])*ring2number+0.5);
-                 eta=eta+0.1;
-                 theta = 2.*TMath::ATan (TMath::Exp (-eta));
-                 rad = TMath::Abs(realZ) * (TMath::Tan (theta));
-                 rmin=Int_t( (rad-rin[ivol])*ring2number+0.5);
-                 
-                 zeroPads=0;
-                 smin=0;
-                 smax=numberOfSectors[ivol]; 
-                 numberOfPads=(rmax-rmin)*(smax-smin);
-                 for (Int_t iring=rmin; iring<rmax; iring++) 
-                   {
-                     for 
-                       (Int_t isector=0;
-                        isector<numberOfSectors[ivol]; 
-                        isector++) 
-                       {
-                         if(hTotal[ivol+1]->GetBinContent(isector+1,iring+1)
-                            <zeroADC) zeroPads++;}
-                     
-                   } //ring
-                 Float_t numberOfPads=Float_t(smax-smin)*Float_t(rmax-rmin);
-
-                 Double_t lambda=-TMath::Log(Double_t(zeroPads)/numberOfPads);
-                 Int_t fRecon=Int_t (lambda*numberOfPads+0.5);
-                 recParticles[0]=ivol+1;
-                 recParticles[1]=smin;
-                 recParticles[2]=smax;
-                 recParticles[3]=rmin;
-                 recParticles[4]=rmax;
-                 recParticles[5]= fRecon;
-                 new((*fReconParticles)[nRecPart++])   AliFMDReconstParticles(recParticles);             
-                 
-
-                } // eta
-            } // volume
-          
-       }//if FMD
-       plFMD->TreeR()->Reset();
-       plFMD->TreeR()->Fill(); 
-       plFMD->WriteRecPoints("OVERWRITE");
-       plFMD->UnloadDigits();
-    } //event loop
-  plFMD->UnloadRecPoints();
-#ifdef DEBUG
-  Info(" Exec"," finished");
+  UseRecoParam(kTRUE);
+  while (rawReader.NextSignal(det, rng, sec, str, adc, zs, fac)) { 
+    if (det != oldDet) { 
+      fZS[det-1]       = zs;
+      fZSFactor[det-1] = fac;
+      oldDet           = det;
+    }
+    ProcessSignal(det, rng, sec, str, adc);
+  }
+  UseRecoParam(kFALSE);
+
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliRawReader* reader, TTree*) const
+{
+  // Reconstruct directly from raw data (no intermediate output on
+  // digit tree or rec point tree).  
+  // 
+  // Parameters: 
+  //   reader  Raw event reader 
+  //   ctree    Not used - 'cluster tree' to store rec-points in. 
+  AliFMDDebug(1, ("Reconstructing from raw reader"));
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return;
+  }
+  AliFMDRawReader rawReader(reader, 0);
+  Reconstruct(rawReader);
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Digitize(AliRawReader* reader, TClonesArray* sdigits) const
+{
+  // Reconstruct directly from raw data (no intermediate output on
+  // digit tree or rec point tree).  
+  // 
+  // Parameters: 
+  //   reader  Raw event reader 
+  //   ctree    Not used. 
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return;
+  }
+  AliFMDRawReader rawReader(reader, 0);
+
+  UShort_t det, sec, str, sam, rat, fac;
+  Short_t  adc, oldDet = -1;
+  Bool_t   zs;
+  Char_t   rng;
+    
+  UseRecoParam(kTRUE);
+  while (rawReader.NextSample(det, rng, sec, str, sam, rat, adc, zs, fac)) { 
+    if (!rawReader.SelectSample(sam, rat)) continue;
+    if (det != oldDet) { 
+      fZS[det-1]       = zs;
+      fZSFactor[det-1] = fac;
+      oldDet           = det;
+    }
+    DigitizeSignal(sdigits, det, rng, sec, str, sam, adc);
+  }
+  UseRecoParam(kFALSE);
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, 
+                                TTree* clusterTree) const 
+{
+  // Reconstruct event from digits in tree 
+  // Get the FMD branch holding the digits. 
+  // FIXME: The vertex may not be known yet, so we may have to move
+  // some of this to FillESD. 
+  // 
+  // Parameters: 
+  //   digitsTree      Pointer to a tree containing digits 
+  //   clusterTree     Pointer to output tree 
+  // 
+  if (!PreReconstruct()) return;
+
+  if (!fMult) fMult = new TClonesArray("AliFMDRecPoint");
+
+  AliFMDDebug(1, ("Reconstructing from digits in a tree"));
+
+  // Get the digitis array 
+  static TClonesArray* digits      = new TClonesArray("AliFMDDigit");
+  TBranch*             digitBranch = digitsTree->GetBranch("FMD");
+  if (!digitBranch) {
+    Error("Exec", "No digit branch for the FMD found");
+    return;
+  }
+  digitBranch->SetAddress(&digits);
+
+  if (digits)  digits->Clear();
+  if (fMult)   fMult->Clear();
+
+  // Create rec-point output branch 
+  fNMult = 0;
+  fTreeR = clusterTree;
+  fTreeR->Branch("FMD", &fMult);
+  
+  AliDebug(5, "Getting entry 0 from digit branch");
+  digitBranch->GetEntry(0);
+  
+  AliDebugF(5, "Processing %d digits", digits->GetEntriesFast());
+  UseRecoParam(kTRUE);
+  ProcessDigits(digits);
+  UseRecoParam(kFALSE);
+
+  Int_t written = clusterTree->Fill();
+  AliFMDDebug(10, ("Filled %d bytes into cluster tree", written));
+  // digits->Delete();
+  // delete digits;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::ProcessDigits(TClonesArray* digits, 
+                                  const AliFMDRawReader& rawRead) const
+{
+  // For each digit, find the pseudo rapdity, azimuthal angle, and
+  // number of corrected ADC counts, and pass it on to the algorithms
+  // used. 
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    digits Array of digits
+  // 
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return;
+  }
+  AliFMDAltroMapping* map = AliFMDParameters::Instance()->GetAltroMap();
+  for (size_t i = 1; i <= 3; i++) { 
+    fZS[i-1]       = rawRead.IsZeroSuppressed(map->Detector2DDL(i));
+    fZSFactor[i-1] = rawRead.NoiseFactor(map->Detector2DDL(i));
+  }
+  UseRecoParam(kTRUE);
+  ProcessDigits(digits);
+  UseRecoParam(kFALSE);
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::ProcessDigits(TClonesArray* digits) const
+{
+  // For each digit, find the pseudo rapdity, azimuthal angle, and
+  // number of corrected ADC counts, and pass it on to the algorithms
+  // used. 
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    digits Array of digits
+  // 
+  Int_t nDigits = digits->GetEntries();
+  AliFMDDebug(2, ("Got %d digits", nDigits));
+  fESDObj->SetNoiseFactor(fNoiseFactor);
+  fESDObj->SetAngleCorrected(fAngleCorrect);
+  fBad.Reset(false);
+  for (Int_t i = 0; i < nDigits; i++) {
+    AliFMDDigit* digit = static_cast<AliFMDDigit*>(digits->At(i));
+    if (!digit) continue;
+    ProcessDigit(digit);
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::ProcessDigit(AliFMDDigit* digit) const
+{
+  // 
+  // Process a single digit 
+  // 
+  // Parameters:
+  //    digit Digiti to process
+  // 
+  UShort_t det = digit->Detector();
+  Char_t   rng = digit->Ring();
+  UShort_t sec = digit->Sector();
+  UShort_t str = digit->Strip();
+  Short_t  adc = digit->Counts();
+  // if (AliLog::GetDebugLevel("FMD","")>3) digit->Print();
+  ProcessSignal(det, rng, sec, str, adc);
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::ProcessSignal(UShort_t det, 
+                                  Char_t   rng, 
+                                  UShort_t sec, 
+                                  UShort_t str, 
+                                  Short_t  adc) const
+{
+  // Process the signal from a single strip 
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    adc     ADC counts
+  // 
+  Int_t  dbg = AliLog::GetDebugLevel("FMD","");
+  Bool_t dhr = dbg > 3 && dbg < 10;
+  if (dhr) printf("FMD%d%c[%2d,%3d] adc=%4d ", det, rng, sec, str, adc);
+  
+  if (adc >= AliFMDRawReader::kBadSignal) { 
+    AliFMDDebug(10, ("FMD%d%c[%2d,%3d] is marked bad", det, rng, sec, str));
+    if (dhr) Printf("bad");
+    fBad(det,rng,sec,str) = true;
+    return;
+  }
+
+  // Check that the strip is not marked as dead 
+  AliFMDParameters* param  = AliFMDParameters::Instance();
+  if (param->IsDead(det, rng, sec, str)) {
+    AliFMDDebug(10, ("FMD%d%c[%2d,%3d] is dead", det, rng, sec, str));
+    if (dhr) Printf("dead");
+    fBad(det,rng,sec,str) = true;
+    return;
+  }
+  
+  // digit->Print();
+  // Get eta and phi 
+  Float_t eta = fESDObj->Eta(det, rng, 0, str);
+    
+  // Substract pedestal. 
+  UShort_t counts   = SubtractPedestal(det, rng, sec, str, adc);
+  if(counts == USHRT_MAX)  { 
+    if (dhr) Printf("invalid");
+    return;
+  }
+  if (dhr) printf("counts=%4d ", counts);
+  
+    // Gain match digits. 
+  Double_t edep     = Adc2Energy(det, rng, sec, str, eta, counts);
+  // Get rid of nonsense energy
+  if(edep < 0)  { 
+    if (dhr) Printf("zero");
+    return;
+  }
+  if (dhr) printf("edep=%f ", edep);
+  
+  // Make rough multiplicity 
+  Double_t mult     = Energy2Multiplicity(det, rng, sec, str, edep);
+  // Get rid of nonsense mult
+  //if (mult > 20) { 
+  //  AliWarning(Form("The mutliplicity in FMD%d%c[%2d,%3d]=%f > 20 "
+  //               "(ADC: %d, Energy: %f)", det, rng, sec, str, mult, 
+  //               counts, edep));
+  // }
+  if (mult < 0)  {
+    if (dhr) Printf("not hit");
+    return; 
+  }
+
+  if (dhr) Printf("mult=%f ", mult);
+  AliFMDDebug(10, ("FMD%d%c[%2d,%3d]: "
+                   "ADC: %d, Counts: %d, Energy: %f, Mult: %f",
+                 det, rng, sec, str, adc, counts, edep, mult));
+  
+  // Create a `RecPoint' on the output branch. 
+  if (fMult) {
+    Float_t phi;
+    PhysicalCoordinates(det, rng, sec, str, eta, phi);
+
+    AliFMDRecPoint* m = 
+      new ((*fMult)[fNMult]) AliFMDRecPoint(det, rng, sec, str, 
+                                           eta, phi, edep, mult);
+    (void)m; // Suppress warnings about unused variables. 
+    fNMult++;
+  }
+  
+  fESDObj->SetMultiplicity(det, rng, sec, str, mult);
+  // fESDObj->SetEta(det, rng, sec, str, eta);
+  
+  if (fDiagAll) fDiagAll->Fill(adc, mult);  
+
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::DigitizeSignal(TClonesArray* sdigits, 
+                                   UShort_t det, 
+                                   Char_t   rng, 
+                                   UShort_t sec, 
+                                   UShort_t str, 
+                                   UShort_t /* sam */,
+                                   Short_t  adc) const
+{
+  // Process the signal from a single strip 
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    adc     ADC counts
+  // 
+  AliFMDParameters* param  = AliFMDParameters::Instance();
+  // Check that the strip is not marked as dead 
+  if (param->IsDead(det, rng, sec, str)) {
+    AliFMDDebug(10, ("FMD%d%c[%2d,%3d] is dead", det, rng, sec, str));
+    return;
+  }
+  
+  // Substract pedestal. 
+  UShort_t counts   = SubtractPedestal(det, rng, sec, str, adc);
+  if(counts == USHRT_MAX || counts == 0) return;
+  
+    // Gain match digits. 
+  Double_t edep     = Adc2Energy(det, rng, sec, str, counts);
+  // Get rid of nonsense energy
+  if(edep < 0)  return;
+
+  Int_t n = sdigits->GetEntriesFast();
+  // AliFMDSDigit* sdigit = 
+  new ((*sdigits)[n]) 
+    AliFMDSDigit(det, rng, sec, str, edep, counts, counts, counts, counts);
+  // sdigit->SetCount(sam, counts);
+}
+
+//____________________________________________________________________
+UShort_t
+AliFMDReconstructor::SubtractPedestal(UShort_t det, 
+                                     Char_t   rng, 
+                                     UShort_t sec, 
+                                     UShort_t str, 
+                                     UShort_t adc, 
+                                     Float_t  noiseFactor,
+                                     Bool_t   zsEnabled, 
+                                     UShort_t zsNoiseFactor) const
+{
+  // 
+  // Subtract the pedestal off the ADC counts. 
+  // 
+  // Parameters:
+  //    det           Detector number
+  //    rng           Ring identifier
+  //    sec           Sector number
+  //    str           Strip number
+  //    adc           ADC counts
+  //    noiseFactor   If pedestal substracted pedestal is less then
+  //        this times the noise, then consider this to be 0. 
+  //    zsEnabled     Whether zero-suppression is on.
+  //    zsNoiseFactor Noise factor used in on-line pedestal
+  //        subtraction. 
+  // 
+  // Return:
+  //    The pedestal subtracted ADC counts (possibly 0), or @c
+  //         USHRT_MAX in case of problems.
+  //  
+  AliFMDParameters* param  = AliFMDParameters::Instance();
+  Float_t           ped    = (zsEnabled ? 0 : 
+                             param->GetPedestal(det, rng, sec, str));
+  Float_t           noise  = param->GetPedestalWidth(det, rng, sec, str);
+  if (ped < 0 || noise < 0) { 
+    AliWarningClass(Form("Invalid pedestal (%f) or noise (%f) "
+                        "for FMD%d%c[%02d,%03d]", 
+                   ped, noise, det, rng, sec, str));
+    return USHRT_MAX;
+  }
+  AliDebugClass(10, Form("Subtracting pedestal for FMD%d%c[%2d,%3d]=%4d "
+                        "(%s w/factor %d, noise factor %f, "
+                        "pedestal %8.2f+/-%8.2f)",
+                        det, rng, sec, str, adc, 
+                        (zsEnabled ? "zs'ed" : "straight"), 
+                        zsNoiseFactor, noiseFactor, ped, noise));
+
+  Int_t counts = adc + Int_t(zsEnabled ? zsNoiseFactor * noise : - ped);
+  counts =  TMath::Max(Int_t(counts), 0);
+  // Calculate the noise factor for suppressing remenants of the noise
+  // peak.  If we have done on-line zero suppression, we only check
+  // for noise signals that are larger than the suppressed noise.  If
+  // the noise factor used on line is larger than the factor used
+  // here, we do not do this check at all.  
+  // 
+  // For example:
+  //    Online factor  |  Read factor |  Result 
+  //    ---------------+--------------+-------------------------------
+  //           2       |      3       | Check if signal > 1 * noise
+  //           3       |      3       | Check if signal > 0
+  //           3       |      2       | Check if signal > 0
+  //
+  // In this way, we make sure that we do not suppress away too much
+  // data, and that the read-factor is the most stringent cut. 
+  Float_t nf = zsNoiseFactor; // TMath::Max(0.F, noiseFactor - (zsEnabled ? zsNoiseFactor : 0));
+  if (counts <= noise * nf) counts = 0;
+  if (counts > 0) AliDebugClass(15, "Got a hit strip");
+
+  UShort_t ret = counts < 0 ? 0 : counts;
+  return ret;
+}
+
+
+//____________________________________________________________________
+UShort_t
+AliFMDReconstructor::SubtractPedestal(UShort_t det, 
+                                     Char_t   rng, 
+                                     UShort_t sec, 
+                                     UShort_t str, 
+                                     Short_t  adc) const
+{
+  // Member function to subtract the pedestal from a digit
+  //
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    adc     # of ADC counts
+  // Return:
+  //    Pedestal subtracted signal or USHRT_MAX in case of problems 
+  //
+  UShort_t counts = SubtractPedestal(det, rng, sec, str, adc, 
+                                    fNoiseFactor, fZS[det-1], 
+                                    fZSFactor[det-1]);
+  if (fDiagStep1) fDiagStep1->Fill(adc, counts);
+  
+  return counts;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+Float_t
+AliFMDReconstructor::Adc2Energy(UShort_t det, 
+                               Char_t   rng, 
+                               UShort_t sec, 
+                               UShort_t str, 
+                               UShort_t count) const
+{
+  // Converts number of ADC counts to energy deposited. 
+  // Note, that this member function can be overloaded by derived
+  // classes to do strip-specific look-ups in databases or the like,
+  // to find the proper gain for a strip. 
+  // 
+  // In the first simple version, we calculate the energy deposited as 
+  // 
+  //    EnergyDeposited = cos(theta) * gain * count
+  // 
+  // where 
+  // 
+  //           Pre_amp_MIP_Range
+  //    gain = ----------------- * Energy_deposited_per_MIP
+  //           ADC_channel_size    
+  // 
+  // is constant and the same for all strips.
+  //
+  // For the production we use the conversion measured in the NBI lab.
+  // The total conversion is then:
+  // 
+  //    gain = ADC / DAC
+  // 
+  //                  EdepMip * count
+  //      => energy = ----------------
+  //                  gain * DACPerADC
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    counts  Number of ADC counts over pedestal
+  // Return 
+  //    The energy deposited in a single strip, or -1 in case of problems
+  //
+  if (count <= 0) return 0;
+  AliFMDParameters* param = AliFMDParameters::Instance();
+  Float_t           gain  = param->GetPulseGain(det, rng, sec, str);
+  // 'Tagging' bad gains as bad energy
+  if (gain < 0) { 
+    AliDebugF(10, "Invalid gain (%f) for FMD%d%c[%02d,%03d]", 
+               gain, det, rng, sec, str);
+    return -1;
+  }
+  AliDebugF(10, "Converting counts %d to energy (factor=%f, DAC2MIP=%f)", 
+           count, gain,param->GetDACPerMIP());
+
+  Double_t edep  = ((count * param->GetEdepMip()) 
+                   / (gain * param->GetDACPerMIP()));
+  return edep;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+Float_t
+AliFMDReconstructor::Adc2Energy(UShort_t det, 
+                               Char_t   rng, 
+                               UShort_t sec, 
+                               UShort_t str, 
+                               Float_t  eta, 
+                               UShort_t count) const
+{
+  // Converts number of ADC counts to energy deposited. 
+  // Note, that this member function can be overloaded by derived
+  // classes to do strip-specific look-ups in databases or the like,
+  // to find the proper gain for a strip. 
+  // 
+  // In the first simple version, we calculate the energy deposited as 
+  // 
+  //    EnergyDeposited = cos(theta) * gain * count
+  // 
+  // where 
+  // 
+  //           Pre_amp_MIP_Range
+  //    gain = ----------------- * Energy_deposited_per_MIP
+  //           ADC_channel_size    
+  // 
+  // is constant and the same for all strips.
+  //
+  // For the production we use the conversion measured in the NBI lab.
+  // The total conversion is then:
+  // 
+  //    gain = ADC / DAC
+  // 
+  //                  EdepMip * count
+  //      => energy = ----------------
+  //                  gain * DACPerADC
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    eta     Psuedo-rapidity
+  //    counts  Number of ADC counts over pedestal
+  // Return 
+  //    The energy deposited in a single strip, or -1 in case of problems
+  //
+  Double_t edep = Adc2Energy(det, rng, sec, str, count);
+  
+  if (fDiagStep2) fDiagStep2->Fill(count, edep);  
+  if (fAngleCorrect) {
+    Double_t theta = 2 * TMath::ATan(TMath::Exp(-eta));
+    Double_t corr  = TMath::Abs(TMath::Cos(theta));
+    Double_t cedep = corr * edep;
+    AliDebugF(10, "correcting for path %f * %f = %f (eta=%f, theta=%f)",
+             edep, corr, cedep, eta, theta);
+    if (fDiagStep3) fDiagStep3->Fill(edep, cedep);  
+    edep = cedep;
+  }
+  return edep;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+Float_t
+AliFMDReconstructor::Energy2Multiplicity(UShort_t /*det*/, 
+                                        Char_t   /*rng*/, 
+                                        UShort_t /*sec*/, 
+                                        UShort_t /*str*/, 
+                                        Float_t  edep) const
+{
+  // Converts an energy signal to number of particles. 
+  // Note, that this member function can be overloaded by derived
+  // classes to do strip-specific look-ups in databases or the like,
+  // to find the proper gain for a strip. 
+  // 
+  // In this simple version, we calculate the multiplicity as 
+  // 
+  //   multiplicity = Energy_deposited / Energy_deposited_per_MIP
+  // 
+  // where 
+  //
+  //   Energy_deposited_per_MIP = 1.664 * SI_density * SI_thickness 
+  // 
+  // is constant and the same for all strips 
+  //
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    edep    Energy deposited in a single strip
+  // Return 
+  //    The "bare" multiplicity corresponding to the energy deposited
+  AliFMDParameters* param   = AliFMDParameters::Instance();
+  Double_t          edepMIP = param->GetEdepMip();
+  Float_t           mult    = edep / edepMIP;
+#if 0
+  if (edep > 0) 
+    AliFMDDebug(15, ("Translating energy %f to multiplicity via "
+                    "divider %f->%f", edep, edepMIP, mult));
 #endif
-  //  delete hTotal[10]; 
+  if (fDiagStep4) fDiagStep4->Fill(edep, mult);  
+  return mult;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::PhysicalCoordinates(UShort_t det, 
+                                        Char_t   rng, 
+                                        UShort_t sec, 
+                                        UShort_t str, 
+                                        Float_t& eta, 
+                                        Float_t& phi) const
+{
+  // Get the eta and phi of a digit 
+  // 
+  // Parameters: 
+  //    det    Detector ID
+  //    rng    Ring ID
+  //    sec    Sector ID
+  //    rng    Strip ID
+  //    eta    On return, contains the psuedo-rapidity of the strip
+  //    phi     On return, contains the azimuthal angle of the strip
+  // 
+  AliFMDGeometry* geom = AliFMDGeometry::Instance();
+  Double_t x, y, z, r, theta, deta, dphi;
+  geom->Detector2XYZ(det, rng, sec, str, x, y, z);
+
+  // Correct for vertex offset. 
+  z     -= fCurrentVertex;
+  AliFMDGeometry::XYZ2REtaPhiTheta(x, y, z, r, deta, dphi, theta);
+  eta = deta;
+  phi = dphi;
+}
 
+namespace { 
+  class ESDPrinter : public AliESDFMD::ForOne
+  {
+  public:
+    ESDPrinter() {}
+    Bool_t operator()(UShort_t d, Char_t r, UShort_t s, UShort_t t, 
+                     Float_t m, Float_t e)
+    {
+      if (m > 0 && m != AliESDFMD::kInvalidMult) 
+       printf("  FMD%d%c[%2d,%3d] = %6.3f / %6.3f\n", d, r, s, t, m, e);
+      return kTRUE;
+    }
+  };
 }
 
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliFMDReconstructor::FillESD(AliRunLoader* /*runLoader*/, 
-                                 AliESD* /*esd*/) const
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::FillESD(TTree*  /* digitsTree */, 
+                            TTree*  /* clusterTree */,
+                            AliESDEvent* esd) const
 {
-// nothing to be done
+  // nothing to be done
+  // FIXME: The vertex may not be known when Reconstruct is executed,
+  // so we may have to move some of that member function here. 
+  AliFMDDebug(2, ("Calling FillESD with two trees and one ESD"));
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return;
+  }
+  // fESDObj->Print();
+
+  // Fix up ESD so that only truely dead channels get the kInvalidMult flag. 
+  MarkDeadChannels(fESDObj);
+
+  Double_t oldVz = fCurrentVertex;
+  GetVertex(esd);
+  if (fVertexType != kNoVertex) { 
+    AliFMDDebug(2, ("Revertexing the ESD data to vz=%f (was %f)",
+                   fCurrentVertex, oldVz));
+    AliFMDESDRevertexer revertexer;
+    revertexer.Revertex(fESDObj, fCurrentVertex);
+  }
+  
+  if (AliDebugLevel() > 10) { 
+    ESDPrinter p;
+    fESDObj->ForEach(p);
+  }
+
+  if (esd) { 
+    AliFMDDebug(2, ("Writing FMD data to ESD tree"));
+    esd->SetFMDData(fESDObj);
+  }
 
+  if (!fDiagnostics || !esd) return;
+  static bool first = true;
+  // This is most likely NOT the event number you'd like to use. It
+  // has nothing to do with the 'real' event number. 
+  // - That's OK.  We just use it for the name of the directory -
+  // nothing else.  Christian
+  Int_t evno = esd->GetEventNumberInFile(); 
+  AliFMDDebug(3, ("Writing diagnostics histograms to FMD.Diag.root/%03d",evno));
+  TFile f("FMD.Diag.root", (first ? "RECREATE" : "UPDATE"));
+  first = false;
+  f.cd(); 
+  TDirectory* d = f.mkdir(Form("%03d", evno), 
+                         Form("Diagnostics histograms for event # %d", evno));
+  d->cd();
+  if (fDiagStep1) fDiagStep1->Write();
+  if (fDiagStep2) fDiagStep2->Write();
+  if (fDiagStep3) fDiagStep3->Write();
+  if (fDiagStep4) fDiagStep4->Write();
+  if (fDiagAll)   fDiagAll->Write();
+  d->Write();
+  f.Write();
+  f.Close();
+
+  if (fDiagStep1) fDiagStep1->Reset();
+  if (fDiagStep2) fDiagStep2->Reset();
+  if (fDiagStep3) fDiagStep3->Reset();
+  if (fDiagStep4) fDiagStep4->Reset();
+  if (fDiagAll)   fDiagAll->Reset();
 }
 
+//____________________________________________________________________
+void
+AliFMDReconstructor::FillESD(AliRawReader*, TTree* clusterTree, 
+                            AliESDEvent* esd) const
+{
+  // 
+  // Forwards to above member function 
+  //
+  if (fZombie) { 
+    AliWarning("I'm a zombie - cannot do anything");
+    return;
+  }
+  TTree* dummy = 0;
+  FillESD(dummy, clusterTree, esd);
+}
+//____________________________________________________________________
+//
+// EOF
+//