]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - HLT/TPCLib/AliHLTTPCClusterFinderComponent.cxx
updated SampleLib and tutorial, sample macros added
[u/mrichter/AliRoot.git] / HLT / TPCLib / AliHLTTPCClusterFinderComponent.cxx
index f9049381eff58fd2bfeb2bc6a494390f342402f9..23d6bcaba868a2e8a3c8396aea7aadc54aecd8f5 100644 (file)
@@ -1,72 +1,64 @@
 // $Id$
 
-/**************************************************************************
- * This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        * 
- * ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
- *                                                                        *
- * Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
- *                  Timm Steinbeck <timm@kip.uni-heidelberg.de>           *
- *                  Jochen Thaeder <thaeder@kip.uni-heidelberg.de>        *
- *                  for The ALICE HLT Project.                            *
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- * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
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- * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
- * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
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+//* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
+//*                                                                        *
+//* Primary Authors: Timm Steinbeck, Matthias Richter                      *
+//* Developers:      Kenneth Aamodt <kenneth.aamodt@student.uib.no>        *
+//*                  for The ALICE HLT Project.                            *
+//*                                                                        *
+//* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
+//* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
+//* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
+//* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
+//* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
+//* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
+//* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
+//**************************************************************************
 
 /** @file   AliHLTTPCClusterFinderComponent.cxx
-    @author Timm Steinbeck, Matthias Richter, Jochen Thaeder, Kenneth Aamodt
+    @author Kenneth Aamodt <kenneth.aamodt@student.uib.no>
     @date   
     @brief  The TPC cluster finder processing component
 */
 
-// see header file for class documentation                                   //
-// or                                                                        //
-// refer to README to build package                                          //
-// or                                                                        //
-// visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt                          //
-
 #if __GNUC__>= 3
 using namespace std;
 #endif
 #include "AliHLTTPCClusterFinderComponent.h"
 #include "AliHLTTPCDigitReaderPacked.h"
 #include "AliHLTTPCDigitReaderUnpacked.h"
-#include "AliHLTTPCDigitReaderRaw.h"
+#include "AliHLTTPCDigitReaderDecoder.h"
 #include "AliHLTTPCClusterFinder.h"
 #include "AliHLTTPCSpacePointData.h"
 #include "AliHLTTPCClusterDataFormat.h"
 #include "AliHLTTPCTransform.h"
 #include "AliHLTTPCClusters.h"
 #include "AliHLTTPCDefinitions.h"
+#include "AliCDBEntry.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+
 #include <cstdlib>
 #include <cerrno>
 #include "TString.h"
+#include "TObjString.h"
 #include <sys/time.h>
 
-// this is a global object used for automatic component registration, do not use this
-// use fPackedSwitch = true for packed inputtype "gkDDLPackedRawDataType"
-// use fPackedSwitch = false for unpacked inputtype "gkUnpackedRawDataType"
-AliHLTTPCClusterFinderComponent gAliHLTTPCClusterFinderComponentPacked(true);
-AliHLTTPCClusterFinderComponent gAliHLTTPCClusterFinderComponentUnpacked(false);
-
+/** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
 ClassImp(AliHLTTPCClusterFinderComponent)
 
-AliHLTTPCClusterFinderComponent::AliHLTTPCClusterFinderComponent(bool packed)
+AliHLTTPCClusterFinderComponent::AliHLTTPCClusterFinderComponent(int mode)
   :
   fClusterFinder(NULL),
   fReader(NULL),
   fClusterDeconv(true),
   fXYClusterError(-1),
   fZClusterError(-1),
-  fPackedSwitch(packed),
-  fPatch(0),
+  fModeSwitch(mode),
   fUnsorted(0),
-  fPadArray(NULL)
+  fPatch(0),
+  fGetActivePads(0)
 {
   // see header file for class documentation
   // or
@@ -75,29 +67,6 @@ AliHLTTPCClusterFinderComponent::AliHLTTPCClusterFinderComponent(bool packed)
   // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
 }
 
-AliHLTTPCClusterFinderComponent::AliHLTTPCClusterFinderComponent(const AliHLTTPCClusterFinderComponent&)
-  :
-  fClusterFinder(NULL),
-  fReader(NULL),
-  fClusterDeconv(true),
-  fXYClusterError(-1),
-  fZClusterError(-1),
-  fPackedSwitch(0),
-  fPatch(0),
-  fUnsorted(0),
-  fPadArray(NULL)
-{
-  // see header file for class documentation
-  HLTFatal("copy constructor untested");
-}
-
-AliHLTTPCClusterFinderComponent& AliHLTTPCClusterFinderComponent::operator=(const AliHLTTPCClusterFinderComponent&)
-{ 
-  // see header file for class documentation
-  HLTFatal("assignment operator untested");
-  return *this;
-}
-
 AliHLTTPCClusterFinderComponent::~AliHLTTPCClusterFinderComponent()
 {
   // see header file for class documentation
@@ -109,23 +78,51 @@ AliHLTTPCClusterFinderComponent::~AliHLTTPCClusterFinderComponent()
 const char* AliHLTTPCClusterFinderComponent::GetComponentID()
 {
   // see header file for class documentation
-  if (fPackedSwitch) return "TPCClusterFinderPacked";
-  else return "TPCClusterFinderUnpacked";
+  switch(fModeSwitch){
+  case kClusterFinderPacked:
+    return "TPCClusterFinderPacked";
+    break;
+  case kClusterFinderUnpacked:
+    return "TPCClusterFinderUnpacked";
+    break;
+  case kClusterFinderDecoder:
+    return "TPCClusterFinderDecoder";
+    break;
+  }
+  HLTFatal("unknown digit reader type");
+  return "";
 }
 
 void AliHLTTPCClusterFinderComponent::GetInputDataTypes( vector<AliHLTComponentDataType>& list)
 {
   // see header file for class documentation
   list.clear(); 
-  if (fPackedSwitch) list.push_back( AliHLTTPCDefinitions::fgkDDLPackedRawDataType );
-  else list.push_back( AliHLTTPCDefinitions::fgkUnpackedRawDataType );
-   
+  switch(fModeSwitch){
+  case kClusterFinderPacked:
+    list.push_back( kAliHLTDataTypeDDLRaw | kAliHLTDataOriginTPC );
+    break;
+  case kClusterFinderUnpacked:
+    list.push_back( AliHLTTPCDefinitions::fgkUnpackedRawDataType );
+    break;
+  case kClusterFinderDecoder:
+    list.push_back( kAliHLTDataTypeDDLRaw | kAliHLTDataOriginTPC );
+    break;
+  }
 }
 
 AliHLTComponentDataType AliHLTTPCClusterFinderComponent::GetOutputDataType()
 {
   // see header file for class documentation
-  return AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType;
+  return kAliHLTMultipleDataType;
+}
+
+int AliHLTTPCClusterFinderComponent::GetOutputDataTypes(AliHLTComponentDataTypeList& tgtList)
+
+{
+  // see header file for class documentation
+  tgtList.clear();
+  tgtList.push_back(AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType);
+  return tgtList.size();
 }
 
 void AliHLTTPCClusterFinderComponent::GetOutputDataSize( unsigned long& constBase, double& inputMultiplier )
@@ -133,14 +130,23 @@ void AliHLTTPCClusterFinderComponent::GetOutputDataSize( unsigned long& constBas
   // see header file for class documentation
   // XXX TODO: Find more realistic values.  
   constBase = 0;
-  if (fPackedSwitch)  inputMultiplier = (6 * 0.4);
-  else  inputMultiplier = 0.4;
+  switch(fModeSwitch){
+  case 0:
+    inputMultiplier = (6 * 0.4);
+    break;
+  case 1:
+    inputMultiplier = 0.4;
+    break;
+  case 2:
+    inputMultiplier = (6 * 0.4);
+    break;
+  }
 }
 
 AliHLTComponent* AliHLTTPCClusterFinderComponent::Spawn()
 {
   // see header file for class documentation
-  return new AliHLTTPCClusterFinderComponent(fPackedSwitch);
+  return new AliHLTTPCClusterFinderComponent(fModeSwitch);
 }
        
 int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
@@ -151,8 +157,8 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
 
   fClusterFinder = new AliHLTTPCClusterFinder();
 
-  Int_t rawreadermode =  -1;
   Int_t sigthresh = -1;
+  Double_t sigmathresh= -1;
   Float_t occulimit = 1.0;
   Int_t oldRCUFormat=0;
   // Data Format version numbers:
@@ -174,14 +180,7 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
        return ENOTSUP;
       }
 
-      // Decodes the rawreader mode: either number or string and returns the rawreadermode
-      // -1 on failure, -2 for offline
-      rawreadermode = AliHLTTPCDigitReaderRaw::DecodeMode( argv[i+1] );
-
-      if (rawreadermode == -1 ) {
-       Logging( kHLTLogError, "HLT::TPCClusterFinder::DoInit", "Missing rawreadermode", "Cannot convert rawreadermode specifier '%s'.", argv[i+1] );
-       return EINVAL;
-      }
+      Logging( kHLTLogWarning, "HLT::TPCClusterFinder::DoInit", "parameter rawreadermode is deprecated", "argument scan" );      
 
       i += 2;
       continue;
@@ -253,11 +252,22 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
       continue;
     }
       
-    // -- checking for unsorted clusterfinding
-    if ( !strcmp( argv[i], "patch" ) ) {
-      fPatch = strtoul( argv[i+1], &cpErr ,0);
+    // -- checking for active pads, used in 2007 December run
+    if ( !strcmp( argv[i], "activepads" ) ) {
+      fGetActivePads = strtoul( argv[i+1], &cpErr ,0);
       if ( *cpErr ){
-       HLTError("Cannot convert patch specifier '%s'. Should  be between 0 and 5, must be integer", argv[i+1]);
+       HLTError("Cannot convert activepads specifier '%s'. Should  be 0(off) or 1(on), must be integer", argv[i+1]);
+       return EINVAL;
+      }
+      i+=2;
+      continue;
+    }
+
+    // -- checking for nsigma-threshold, used in 2007 December run in ZeroSuppression
+    if ( !strcmp( argv[i], "nsigma-threshold" ) ) {
+       sigmathresh = strtoul( argv[i+1], &cpErr ,0);
+      if ( *cpErr ){
+       HLTError("Cannot convert nsigma-threshold specifier '%s'. Must be integer", argv[i+1]);
        return EINVAL;
       }
       i+=2;
@@ -270,10 +280,8 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
   }
 
   // Choose reader
-
-  if (fPackedSwitch) { 
-    if (rawreadermode == -2) {
-#if defined(HAVE_ALIRAWDATA) && defined(HAVE_ALITPCRAWSTREAM_H)
+  if (fModeSwitch==kClusterFinderPacked) {
+      HLTDebug("using AliHLTTPCDigitReaderPacked");
       fReader = new AliHLTTPCDigitReaderPacked();
       if(oldRCUFormat==1){
        fReader->SetOldRCUFormat(kTRUE);
@@ -281,29 +289,24 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
       else if(oldRCUFormat!=0){
        HLTWarning("Wrong oldrcuformat specifier %d; oldrcuformat set to default(kFALSE)",oldRCUFormat);
       }
-      if(fUnsorted){
+      if(fUnsorted==1){
        fReader->SetUnsorted(kTRUE);
       }
       fClusterFinder->SetReader(fReader);
-#else // ! defined(HAVE_ALIRAWDATA) && defined(HAVE_ALITPCRAWSTREAM_H)
-      HLTFatal("DigitReaderPacked not available - check your build");
-      return -ENODEV;
-#endif //  defined(HAVE_ALIRAWDATA) && defined(HAVE_ALITPCRAWSTREAM_H)
-    } else {
-#if defined(HAVE_TPC_MAPPING)
-      fReader = new AliHLTTPCDigitReaderRaw(rawreadermode);
-      fClusterFinder->SetReader(fReader);
-#else //! defined(HAVE_TPC_MAPPING)
-      HLTFatal("DigitReaderRaw not available - check your build");
-      return -ENODEV;
-#endif //defined(HAVE_TPC_MAPPING)
-    }
   }
-  else {
+  else if(fModeSwitch==kClusterFinderUnpacked){
+    HLTDebug("using AliHLTTPCDigitReaderUnpacked");
     fReader = new AliHLTTPCDigitReaderUnpacked();
     fClusterFinder->SetReader(fReader);
   }
-
+  else if(fModeSwitch==kClusterFinderDecoder){
+    HLTDebug("using AliHLTTPCDigitReaderDecoder");
+    fReader = new AliHLTTPCDigitReaderDecoder();
+    fClusterFinder->SetReader(fReader);
+  }
+  else{
+    HLTFatal("No mode set for clusterfindercomponent");
+  }
   // if pp-run use occupancy limit else set to 1. ==> use all 
   if ( !fClusterDeconv )
     fClusterFinder->SetOccupancyLimit(occulimit);
@@ -324,11 +327,7 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoInit( int argc, const char** argv )
   if ( (fXYClusterError>0) && (fZClusterError>0) )
     fClusterFinder->SetCalcErr( false );
   fClusterFinder->SetSignalThreshold(sigthresh);
-    
-  if(fUnsorted&&fPatch>-1&&fPatch<6){
-    fPadArray = new AliHLTTPCPadArray(fPatch);
-    fPadArray->InitializeVector();
-  }
+  fClusterFinder->SetNSigmaThreshold(sigmathresh);
 
   return 0;
 }
@@ -350,7 +349,7 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoDeinit()
 
 int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& evtData, 
                                              const AliHLTComponentBlockData* blocks, 
-                                             AliHLTComponentTriggerData& trigData, AliHLTUInt8_t* outputPtr, 
+                                             AliHLTComponentTriggerData& /*trigData*/, AliHLTUInt8_t* outputPtr, 
                                              AliHLTUInt32_t& size, 
                                              vector<AliHLTComponentBlockData>& outputBlocks )
 {
@@ -379,24 +378,28 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& ev
       offset = tSize;
 
 
-      if (fPackedSwitch) {     
-       char tmp1[14], tmp2[14];
-       DataType2Text( iter->fDataType, tmp1 );
-       DataType2Text( AliHLTTPCDefinitions::fgkDDLPackedRawDataType, tmp2 );
-       Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCClusterFinder::DoEvent", "Event received", 
-                "Event 0x%08LX (%Lu) received datatype: %s - required datatype: %s",
-                evtData.fEventID, evtData.fEventID, tmp1, tmp2 );
+      if (fModeSwitch==0 || fModeSwitch==2) {
+       HLTDebug("Event 0x%08LX (%Lu) received datatype: %s - required datatype: %s",
+                evtData.fEventID, evtData.fEventID, 
+                DataType2Text( iter->fDataType).c_str(), 
+                DataType2Text(kAliHLTDataTypeDDLRaw | kAliHLTDataOriginTPC).c_str());
 
-       if ( iter->fDataType != AliHLTTPCDefinitions::fgkDDLPackedRawDataType ) continue;
+       if (iter->fDataType == AliHLTTPCDefinitions::fgkDDLPackedRawDataType &&
+           GetEventCount()<2) {
+         HLTWarning("data type %s is depricated, use %s (kAliHLTDataTypeDDLRaw)!",
+                    DataType2Text(AliHLTTPCDefinitions::fgkDDLPackedRawDataType).c_str(),
+                    DataType2Text(kAliHLTDataTypeDDLRaw | kAliHLTDataOriginTPC).c_str());
+         }
+
+       if ( iter->fDataType != (kAliHLTDataTypeDDLRaw | kAliHLTDataOriginTPC) &&
+            iter->fDataType != AliHLTTPCDefinitions::fgkDDLPackedRawDataType ) continue;
 
       }
-      else {
-       char tmp1[14], tmp2[14];
-       DataType2Text( iter->fDataType, tmp1 );
-       DataType2Text( AliHLTTPCDefinitions::fgkUnpackedRawDataType, tmp2 );
-       Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCClusterFinder::DoEvent", "Event received", 
-                "Event 0x%08LX (%Lu) received datatype: %s - required datatype: %s",
-                evtData.fEventID, evtData.fEventID, tmp1, tmp2 );
+      else if(fModeSwitch==1){
+       HLTDebug("Event 0x%08LX (%Lu) received datatype: %s - required datatype: %s",
+                evtData.fEventID, evtData.fEventID, 
+                DataType2Text( iter->fDataType).c_str(), 
+                DataType2Text(AliHLTTPCDefinitions::fgkUnpackedRawDataType).c_str());
 
        if ( iter->fDataType != AliHLTTPCDefinitions::fgkUnpackedRawDataType ) continue;
 
@@ -406,43 +409,23 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& ev
       patch = AliHLTTPCDefinitions::GetMinPatchNr( *iter );
       row[0] = AliHLTTPCTransform::GetFirstRow( patch );
       row[1] = AliHLTTPCTransform::GetLastRow( patch );
-       
+
+
+      if(fUnsorted){
+       fClusterFinder->SetUnsorted(fUnsorted);
+       fClusterFinder->SetPatch(patch);
+      }
+
       outPtr = (AliHLTTPCClusterData*)outBPtr;
 
-#ifndef KENNETH
       maxPoints = (size-tSize-sizeof(AliHLTTPCClusterData))/sizeof(AliHLTTPCSpacePointData);
-#else
-      maxPoints = (size-tSize-sizeof(AliHLTTPCClusters))/sizeof(AliHLTTPCSpacePointData);
-#endif 
 
       fClusterFinder->InitSlice( slice, patch, row[0], row[1], maxPoints );
       fClusterFinder->SetOutputArray( (AliHLTTPCSpacePointData*)outPtr->fSpacePoints );
        
       if(fUnsorted){
+       fClusterFinder->ReadDataUnsorted(iter->fPtr, iter->fSize);
 
-
-       fClusterFinder->SetPadArray(fPadArray);
-         
-       double totalT=0;
-       struct timeval startT, endT;
-       gettimeofday( &startT, NULL );
-
-       fClusterFinder->ReadDataUnsorted(iter->fPtr, iter->fSize );
-
-       gettimeofday( &endT, NULL );
-       unsigned long long dt;
-       dt = endT.tv_sec-startT.tv_sec;
-       dt *= 1000000ULL;
-       dt += endT.tv_usec-startT.tv_usec;
-       double dtd = ((double)dt);
-       totalT += dtd;
-       //        dtd = dtd / (double)eventIterations;
-       //        if ( iterations<=1 )
-       cout<<endl;
-       printf( "Time needed to read data: %f microsec. / %f millisec. / %f s\n", 
-               dtd, dtd/1000.0, dtd/1000000.0 );
-         
-       cout<<endl;
        fClusterFinder->FindClusters();
       }
       else{
@@ -453,11 +436,7 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& ev
        
       outPtr->fSpacePointCnt = realPoints;
       nSize = sizeof(AliHLTTPCSpacePointData)*realPoints;
-#ifndef KENNETH
       mysize += nSize+sizeof(AliHLTTPCClusterData);
-#else
-      mysize += nSize+sizeof(AliHLTTPCClusters);
-#endif 
 
       Logging( kHLTLogDebug, "HLT::TPCClusterFinder::DoEvent", "Spacepoints", 
               "Number of spacepoints: %lu Slice/Patch/RowMin/RowMax: %d/%d/%d/%d.",
@@ -467,6 +446,7 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& ev
       bd.fOffset = offset;
       bd.fSize = mysize;
       bd.fSpecification = iter->fSpecification;
+      bd.fDataType = AliHLTTPCDefinitions::fgkClustersDataType;
       //AliHLTSubEventDescriptor::FillBlockAttributes( bd.fAttributes );
       outputBlocks.push_back( bd );
        
@@ -474,6 +454,7 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& ev
       outBPtr += mysize;
       outPtr = (AliHLTTPCClusterData*)outBPtr;
        
+
       if ( tSize > size )
        {
          Logging( kHLTLogFatal, "HLT::TPCClusterFinder::DoEvent", "Too much data", 
@@ -487,3 +468,25 @@ int AliHLTTPCClusterFinderComponent::DoEvent( const AliHLTComponentEventData& ev
 
   return 0;
 }
+
+int AliHLTTPCClusterFinderComponent::Reconfigure(const char* cdbEntry, const char* chainId)
+{
+  // see header file for class documentation
+  const char* path="HLT/ConfigTPC";
+  if (cdbEntry) path=cdbEntry;
+  if (path) {
+    HLTInfo("reconfigure from entry %s, chain id %s", path, (chainId!=NULL && chainId[0]!=0)?chainId:"<none>");
+    AliCDBEntry *pEntry = AliCDBManager::Instance()->Get(path/*,GetRunNo()*/);
+    if (pEntry) {
+      TObjString* pString=dynamic_cast<TObjString*>(pEntry->GetObject());
+      if (pString) {
+       HLTInfo("received configuration object: %s", pString->GetString().Data());
+      } else {
+       HLTError("configuration object \"%s\" has wrong type, required TObjString", path);
+      }
+    } else {
+      HLTError("can not fetch object \"%s\" from CDB", path);
+    }
+  }
+  return 0;
+}