]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITSClusterFinderSSD.cxx
Removing not used parameter and putting the correct flag for the ITS clusters
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSClusterFinderSSD.cxx
index f91ec692764943653ef35f8944d5a3123b4545c4..b818d81f62b62d899a45d6bf66b0e6477c1a1eb9 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/**************************************************************************
- * The package was revised and changed by Boris Batiounia in the time     *
- * period of March - June 2001                                            *
- **************************************************************************/
-
-#include <iostream.h>
+/**************************************************************************
+//  * The package was revised and changed by Boris Batiounia in the time     *
+//  * period of March - June 2001                                            *
+// **************************************************************************/
+//
+//#include <Riostream.h>
 #include <TArrayI.h>
-#include "AliRun.h"
-#include "AliITS.h"
-#include "AliITSdigit.h"
-#include "AliITSRawCluster.h"
-#include "AliITSRecPoint.h"
-#include "AliITSMapA1.h"
+
+//#include "AliRun.h"
+//#include "AliITS.h"
 #include "AliITSClusterFinderSSD.h"
+#include "AliITSDetTypeRec.h"
+#include "AliITSMapA1.h"
+#include "AliITSRawClusterSSD.h"
+#include "AliITSRecPoint.h"
+#include "AliITSdigitSSD.h"
 #include "AliITSclusterSSD.h"
 #include "AliITSpackageSSD.h"
-#include "AliITSsegmentation.h"
+#include "AliITSsegmentationSSD.h"
 #include "AliITSgeom.h"
+#include "AliITSCalibrationSSD.h"
+#include "AliLog.h"
 
 const Bool_t AliITSClusterFinderSSD::fgkSIDEP=kTRUE;
 const Bool_t AliITSClusterFinderSSD::fgkSIDEN=kFALSE;
-const Int_t debug=0;
+const Int_t AliITSClusterFinderSSD::fgkNoiseThreshold=5;
+//const Int_t debug=0;
 
 ClassImp(AliITSClusterFinderSSD)
+  
+  //____________________________________________________________________
+  //
+  //  Constructor
+  //______________________________________________________________________
+  AliITSClusterFinderSSD::AliITSClusterFinderSSD():
+AliITSClusterFinder(),
+fClusterP(0),
+fNClusterP(0),
+fClusterN(0),
+fNClusterN(0),
+fPackages(0),
+fNPackages(0),
+fDigitsIndexP(0),
+fNDigitsP(0),
+fDigitsIndexN(0),
+fNDigitsN(0),
+fPitch(0.0),
+fTanP(0.0),
+fTanN(0.0),
+fPNsignalRatio(0.0),
+fSFF(0),
+fSFB(0){
+    //Default constructor
+}
 
-//____________________________________________________________________
-//
-//  Constructor
 //______________________________________________________________________
-AliITSClusterFinderSSD::AliITSClusterFinderSSD(){
-    //Default constructor
+AliITSClusterFinderSSD::AliITSClusterFinderSSD(AliITSDetTypeRec* dettyp,
+                                               TClonesArray *digits):
+AliITSClusterFinder(dettyp,digits),
+fClusterP(0),
+fNClusterP(0),
+fClusterN(0),
+fNClusterN(0),
+fPackages(0),
+fNPackages(0),
+fDigitsIndexP(0),
+fNDigitsP(0),
+fDigitsIndexN(0),
+fNDigitsN(0),
+fPitch(0.0),
+fTanP(0.0),
+fTanN(0.0),
+fPNsignalRatio(0.0),
+fSFF(0),
+fSFB(0){
+    //Standard constructor
 
-    fSegmentation = 0;
-    fDigits       = 0;
-    fMap          = 0;
-    fITS = (AliITS*)gAlice->GetModule("ITS");
-    fClusterP     = 0;    
-    fNClusterP    =0;
-    fClusterN     = 0;
+    SetDigits(digits);
+    SetMap(new AliITSMapA1(GetSeg(),Digits()));
+    fClusterP     = new TClonesArray ("AliITSclusterSSD",200);
+    fNClusterP    = 0;
+    fClusterN     = new TClonesArray ("AliITSclusterSSD",200);
     fNClusterN    = 0;
-    fPackages     = 0;
+    fPackages     = new TClonesArray ("AliITSpackageSSD",200);    //packages
     fNPackages    = 0;
-    fDigitsIndexP = 0;
+    fDigitsIndexP = new TArrayI(800);
     fNDigitsP     = 0;
-    fDigitsIndexN = 0;
+    fDigitsIndexN = new TArrayI(800);
     fNDigitsN     = 0;
-    fPitch        = 0;
-    fPNsignalRatio= 0;
+    fPitch        = GetSeg()->Dpx(0);
+    fPNsignalRatio= 7./8.;    // warning: hard-wired number
 }
-//______________________________________________________________________}
-AliITSClusterFinderSSD::AliITSClusterFinderSSD(AliITSsegmentation *seg,
-                                              TClonesArray *digits){
+
+//______________________________________________________________________
+AliITSClusterFinderSSD::AliITSClusterFinderSSD(AliITSDetTypeRec* dettyp):
+AliITSClusterFinder(dettyp),
+fClusterP(0),
+fNClusterP(0),
+fClusterN(0),
+fNClusterN(0),
+fPackages(0),
+fNPackages(0),
+fDigitsIndexP(0),
+fNDigitsP(0),
+fDigitsIndexN(0),
+fNDigitsN(0),
+fPitch(0.0),
+fTanP(0.0),
+fTanN(0.0),
+fPNsignalRatio(0.0),
+fSFF(0),
+fSFB(0){
     //Standard constructor
 
-    fSegmentation = seg;
-    fDigits       = digits;
-    fMap          = new AliITSMapA1(fSegmentation,fDigits);
-    fITS          = (AliITS*)gAlice->GetModule("ITS");
-    fClusterP     = new TClonesArray ("AliITSclusterSSD",200);    
+    fClusterP     = new TClonesArray ("AliITSclusterSSD",200);
     fNClusterP    = 0;
-    fClusterN     = new TClonesArray ("AliITSclusterSSD",200);   
+    fClusterN     = new TClonesArray ("AliITSclusterSSD",200);
     fNClusterN    = 0;
-    fPackages     = new TClonesArray ("AliITSpackageSSD",200);    //packages  
+    fPackages     = new TClonesArray ("AliITSpackageSSD",200);    //packages
     fNPackages    = 0;
-    fDigitsIndexP = new TArrayI(300);
+    fDigitsIndexP = new TArrayI(800);
     fNDigitsP     = 0;
-    fDigitsIndexN = new TArrayI(300);
+    fDigitsIndexN = new TArrayI(800);
     fNDigitsN     = 0;
-    fPitch        = fSegmentation->Dpx(0);
+    fPitch        = GetSeg()->Dpx(0);
     fPNsignalRatio= 7./8.;    // warning: hard-wired number
 }
+
 //______________________________________________________________________
 AliITSClusterFinderSSD::~AliITSClusterFinderSSD(){
-    // Default destructor
-
-    delete fClusterP;
-    delete fClusterN;        
-    delete fPackages;        
-    delete fDigitsIndexP;        
-    delete fDigitsIndexN; 
-    delete fMap;
+  // Default destructor
+  
+  delete fClusterP;
+  delete fClusterN;        
+  delete fPackages;        
+  delete fDigitsIndexP;        
+  delete fDigitsIndexN; 
+  delete fMap;
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSClusterFinderSSD::InitReconstruction(){
-    // initialization of the cluster finder
-
-    register Int_t i; //iterator
-
+  // initialization of the cluster finder
+  
+  register Int_t i; //iterator
+  
     for (i=0;i<fNClusterP;i++) fClusterP->RemoveAt(i);
     fNClusterP  =0;
     for (i=0;i<fNClusterN;i++) fClusterN->RemoveAt(i);
@@ -109,100 +166,235 @@ void AliITSClusterFinderSSD::InitReconstruction(){
     fNPackages = 0;
     fNDigitsP  = 0;
     fNDigitsN  = 0;
-    Float_t StereoP,StereoN;
-    fSegmentation->Angles(StereoP,StereoN);
-    CalcStepFactor(StereoP,StereoN);
-    if (debug) cout<<"fSFF = "<<fSFF<<"  fSFB = "<<fSFB<<"\n";
+    Float_t stereoP,stereoN;
+    //fSegmentation->Angles(stereoP,stereoN);
+     GetSeg()->Angles(stereoP,stereoN);
+   CalcStepFactor(stereoP,stereoN);
+   //    if (debug) cout<<"fSFF = "<<fSFF<<"  fSFB = "<<fSFB<<"\n";
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSClusterFinderSSD::FindRawClusters(Int_t module){
-    // This function findes out all clusters belonging to one module
-    // 1. Zeroes all space after previous module reconstruction
-    // 2. Finds all neighbouring digits, create clusters
-    // 3. If necesery, resolves for each group of neighbouring digits 
-    //    how many clusters creates it.
-    // 4. Colculate the x and z coordinate  
-    Int_t lay, lad, detect;
-    AliITSgeom *geom = fITS->GetITSgeom();
-
-    geom->GetModuleId(module,lay, lad, detect);
-    if ( lay == 6 ) ((AliITSsegmentationSSD*)fSegmentation)->SetLayer(6);
-    if ( lay == 5 ) ((AliITSsegmentationSSD*)fSegmentation)->SetLayer(5);
-
-    InitReconstruction();  //ad. 1
-    fMap->FillMap();
-    FillDigitsIndex();
-    SortDigits();
-    FindNeighbouringDigits(); //ad. 2
-    //SeparateOverlappedClusters();  //ad. 3
-    ClustersToPackages();  //ad. 4
-    fMap->ClearMap();
+  // This function findes out all clusters belonging to one module
+  // 1. Zeroes all space after previous module reconstruction
+  // 2. Finds all neighbouring digits, create clusters
+  // 3. If necesery, resolves for each group of neighbouring digits 
+  //    how many clusters creates it.
+  // 4. Colculate the x and z coordinate  
+  Int_t lay, lad, detect;
+  
+  //cout<<"clusterfinder: this is module "<<module<<endl;
+  
+  //    AliITSgeom *geom = fITS->GetITSgeom();
+  
+  if(!fDetTypeRec->GetITSgeom()) {
+    Error("FindRawClusters","ITS geom is null!");
+    return;
+  }
+  
+  SetModule(module);
+  fDetTypeRec->GetITSgeom()->GetModuleId(GetModule(),lay, lad, detect);
+  //   geom->GetModuleId(module,lay, lad, detect);
+  
+  //cout<<"layer = "<<lay<<endl;
+  
+  if ( lay == 6 ) ((AliITSsegmentationSSD*)GetSeg())->SetLayer(6);
+  if ( lay == 5 ) ((AliITSsegmentationSSD*)GetSeg())->SetLayer(5);
+  
+  
+  InitReconstruction();  //ad. 1
+  fMap->FillMap();
+  
+  FillDigitsIndex();
+  if ( (fNDigitsP==0 )  || (fNDigitsN == 0 ))  return;
+  
+  SortDigits();
+  FindNeighbouringDigits(module); //ad. 2
+
+  //SeparateOverlappedClusters();  //ad. 3
+  ClustersToPackages();  //ad. 4
+
+  fMap->ClearMap();
+
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITSClusterFinderSSD::FindNeighbouringDigits(){
+void AliITSClusterFinderSSD::FindNeighbouringDigits(Int_t module){
     //If there are any digits on this side, create 1st Cluster,
     // add to it this digit, and increment number of clusters
-    register Int_t i;
 
-    if ((fNDigitsP>0 )  && (fNDigitsN > 0 )) {
-       Int_t currentstripNo;
-       Int_t *dbuffer = new Int_t [300];   //buffer for strip numbers
-       Int_t dnumber;    //curent number of digits in buffer
-       TArrayI      &lDigitsIndexP = *fDigitsIndexP;
-       TArrayI      &lDigitsIndexN = *fDigitsIndexN;
-       TObjArray    &lDigits       = *(Digits());
-       TClonesArray &lClusterP     = *fClusterP;
-       TClonesArray &lClusterN     = *fClusterN;
-       //process P side 
+    register Int_t i,j;
+    Int_t flag=0;
+
+    //if ( (fNDigitsP==0 )  || (fNDigitsN == 0 ))  return;
+    
+    Int_t currentstripNo;
+    Int_t *dbuffer = new Int_t [800];   //buffer for strip numbers
+    Int_t dnumber;    //curent number of digits in buffer
+    
+    TArrayI      &lDigitsIndexP = *fDigitsIndexP;
+    TArrayI      &lDigitsIndexN = *fDigitsIndexN;
+    
+    TObjArray    &lDigits       = *(Digits());
+    
+    TClonesArray &lClusterP     = *fClusterP;
+    TClonesArray &lClusterN     = *fClusterN;
+    
+    //process P side 
+    dnumber = 1;
+    dbuffer[0]=lDigitsIndexP[0];
+    
+    //If next digit is a neigh. of previous, adds to last clust. this digit
+    /*    
+    cout<<"----------------------------------------------------------------"<<endl;
+    cout<<"module="<<module<<" , # of Pdigits="<<fNDigitsP<<" , # of Ndigits="<<fNDigitsN<<endl;
+
+    cout<<"  Pside"<<endl;
+    cout<<"       "<<((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[0]])->GetStripNumber()<<" "<<
+      ((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[0]])->GetSignal()<<endl;
+    */
+
+    for (i=1; i<fNDigitsP; i++) {
+      
+      //reads new digit
+      currentstripNo = ((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[i]])->GetStripNumber(); 
+      //      cout<<"       "<<currentstripNo<<" "<<((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[i]])->GetSignal()<<endl;
+      
+      if((((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[i-1]])->GetStripNumber()) ==  (currentstripNo-1) ) 
+       dbuffer[dnumber++]=lDigitsIndexP[i];
+      
+      else{
+         
+       // check signal
+       for(j=0;j<dnumber;j++) {
+         
+         if( (((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetSignal())
+             > fgkNoiseThreshold* ((AliITSCalibrationSSD*)GetResp(module))->
+             GetNoiseP( ((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetStripNumber()) ) 
+           flag+=1; 
+         
+       }
+       
+       //if(flag==dnumber) {
+       if(flag>0) {
+         //create a new one side cluster
+
+         //      cout<<"          new cluster with "<<dnumber<<" digits"<<endl;
+
+         new(lClusterP[fNClusterP++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
+                                                       Digits(),
+                                                       fgkSIDEP); 
+         
+         flag=0;
+       }
+       
+       flag=0;
+       dbuffer[0]=lDigitsIndexP[i];
        dnumber = 1;
-       dbuffer[0]=lDigitsIndexP[0];
-       //If next digit is a neigh. of previous, adds to last clust. this digit
-       for (i=1; i<fNDigitsP; i++) {
-           //reads new digit
-           currentstripNo = ((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[i]])->
-                                                           GetStripNumber(); 
-           //check if it is a neighbour of a previous one
-           if((((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexP[i-1]])->
-                                                            GetStripNumber()) 
-              ==  (currentstripNo-1) ) dbuffer[dnumber++]=lDigitsIndexP[i];
-           else{
-               //create a new one side cluster
-               new(lClusterP[fNClusterP++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
-                                                             Digits(),
-                                                             fgkSIDEP); 
-               dbuffer[0]=lDigitsIndexP[i];
-               dnumber = 1;
-           } // end if else
-       } // end loop over fNDigitsP
-       new(lClusterP[fNClusterP++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
-                                                     Digits(),fgkSIDEP);
-       //process N side 
-       //for comments, see above
+       
+      } // end if else
+      
+    } // end loop over fNDigitsP
+    
+    // check signal
+    for(j=0;j<dnumber;j++) {
+      
+      if( (((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetSignal())
+         > fgkNoiseThreshold*((AliITSCalibrationSSD*)GetResp(module))->
+         GetNoiseP( ((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetStripNumber()) ) 
+       flag+=1; 
+      
+    }
+    
+    //if(flag==dnumber) {
+    if(flag>0) {
+      //create a new one side cluster
+
+      //      cout<<"          new cluster with "<<dnumber<<" digits"<<endl;
+
+      new(lClusterP[fNClusterP++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
+                                                   Digits(),
+                                                   fgkSIDEP); 
+      
+      flag=0;
+    }
+    
+    flag=0;
+    
+    //process N side 
+    //for comments, see above
+    dnumber = 1;
+    dbuffer[0]=lDigitsIndexN[0];
+    //If next digit is a neigh. of previous, adds to last clust. this digit
+    
+    //    cout<<"  Nside"<<endl;
+    //    cout<<"       "<<((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexN[0]])->GetStripNumber()<<" "<<
+    //      ((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexN[0]])->GetSignal()<<endl;
+
+    for (i=1; i<fNDigitsN; i++) { 
+      currentstripNo = ((AliITSdigitSSD*)(lDigits[lDigitsIndexN[i]]))->GetStripNumber();
+      //      cout<<"       "<<currentstripNo<<" "<<((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexN[i]])->GetSignal()<<endl;
+      
+      if ( (((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexN[i-1]])->GetStripNumber()) == (currentstripNo-1) ) 
+       dbuffer[dnumber++]=lDigitsIndexN[i];
+      
+      else {
+       
+       // check signal
+       for(j=0;j<dnumber;j++) {
+         
+         if( (((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetSignal())
+             > fgkNoiseThreshold*((AliITSCalibrationSSD*)GetResp(module))->
+             GetNoiseN( ((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetStripNumber()) ) 
+           flag+=1; 
+         
+       }
+       
+       //if(flag==dnumber) {
+       if(flag>0) {
+         //create a new one side cluster
+
+         //      cout<<"          new cluster with "<<dnumber<<" digits"<<endl;
+
+         new(lClusterN[fNClusterN++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
+                                                       Digits(),
+                                                       fgkSIDEN);
+         
+         flag=0;
+       }
+       
+       flag=0;
+       dbuffer[0]=lDigitsIndexN[i];
        dnumber = 1;
-       dbuffer[0]=lDigitsIndexN[0];
-       //If next digit is a neigh. of previous, adds to last clust. this digit
-       for (i=1; i<fNDigitsN; i++) { 
-           currentstripNo = ((AliITSdigitSSD*)(lDigits[lDigitsIndexN[i]]))->
-                                                            GetStripNumber();
-           if ( (((AliITSdigitSSD*)lDigits[lDigitsIndexN[i-1]])->
-                                                              GetStripNumber()) 
-                == (currentstripNo-1) ) dbuffer[dnumber++]=lDigitsIndexN[i];
-           else {
-               new(lClusterN[fNClusterN++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
-                                                             Digits(),
-                                                             fgkSIDEN);
-               dbuffer[0]=lDigitsIndexN[i];
-               dnumber = 1;
-           } // end if else
-       } // end loop over fNDigitsN
-       new(lClusterN[fNClusterN++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
-                                                     Digits(),fgkSIDEN);
-       delete [] dbuffer;
-
-    } // end condition on  NDigits 
-
-    if (debug) cout<<"\n Found clusters: fNClusterP = "<<fNClusterP
-                  <<"  fNClusterN ="<<fNClusterN<<"\n";
+      } // end if else
+    } // end loop over fNDigitsN
+    
+    // check signal
+    for(j=0;j<dnumber;j++) {
+      
+      if( (((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetSignal())
+         > fgkNoiseThreshold*((AliITSCalibrationSSD*)GetResp(module))->
+         GetNoiseN( ((AliITSdigitSSD*)lDigits[dbuffer[j]])->GetStripNumber()) ) 
+       flag+=1; 
+      
+    }
+    
+    //if(flag==dnumber) {
+    if(flag>0) {
+      //create a new one side cluster
+
+      //      cout<<"          new cluster with "<<dnumber<<" digits"<<endl;
+
+      new(lClusterN[fNClusterN++]) AliITSclusterSSD(dnumber,dbuffer,
+                                                   Digits(),
+                                                   fgkSIDEN);
+      
+      flag=0;
+    }
+    
+    flag=0;
+    delete [] dbuffer;
+    
+    //    if (debug) cout<<"\n Found clusters: fNClusterP = "<<fNClusterP
+    //            <<"  fNClusterN ="<<fNClusterN<<"\n";
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSClusterFinderSSD::SeparateOverlappedClusters(){
@@ -220,7 +412,7 @@ void AliITSClusterFinderSSD::SeparateOverlappedClusters(){
     Int_t    initNsize = fNClusterN; //we have to keep it because it will grow 
                                      // in this function and it doasn't make 
                                      // sense to pass through it again
-    splitlist = new TArrayI(300);
+    splitlist = new TArrayI(800);
 
     for (i=0;i<initPsize;i++){
        if (( ((AliITSclusterSSD*)(*fClusterP)[i])->
@@ -278,14 +470,14 @@ void AliITSClusterFinderSSD::SplitCluster(TArrayI *list, Int_t nsplits,
     register Int_t i; //iterator
     AliITSclusterSSD* curentcluster;
     Int_t   *tmpdigits = new Int_t[100];
-    Int_t    NN;
+    Int_t    nn;
 
     // side true means P side
     if (side) {
        curentcluster =((AliITSclusterSSD*)((*fClusterP)[index])) ;
        for (i = nsplits; i>0 ;i--) {  
-           NN=curentcluster->SplitCluster((*list)[(i-1)],tmpdigits);
-           new ((*fClusterP)[fNClusterP]) AliITSclusterSSD(NN,tmpdigits,
+           nn=curentcluster->SplitCluster((*list)[(i-1)],tmpdigits);
+           new ((*fClusterP)[fNClusterP]) AliITSclusterSSD(nn,tmpdigits,
                                                            Digits(),side);
            ( (AliITSclusterSSD*)((*fClusterP)[fNClusterP]) )->
                                                       SetLeftNeighbour(kTRUE);
@@ -300,8 +492,8 @@ void AliITSClusterFinderSSD::SplitCluster(TArrayI *list, Int_t nsplits,
     } else {
        curentcluster =((AliITSclusterSSD*)((*fClusterN)[index]));
        for (i = nsplits; i>0 ;i--) {  
-           NN=curentcluster->SplitCluster((*list)[(i-1)],tmpdigits);
-           new ((*fClusterN)[fNClusterN]) AliITSclusterSSD(NN,tmpdigits,
+           nn=curentcluster->SplitCluster((*list)[(i-1)],tmpdigits);
+           new ((*fClusterN)[fNClusterN]) AliITSclusterSSD(nn,tmpdigits,
                                                            Digits(),side);
            ((AliITSclusterSSD*)((*fClusterN)[fNClusterN]))->
                                                     SetRightNeighbour(kTRUE);
@@ -363,60 +555,36 @@ Int_t AliITSClusterFinderSSD::SortDigitsN(Int_t start, Int_t end){
 //______________________________________________________________________
 void AliITSClusterFinderSSD::FillDigitsIndex(){
     //Fill the indexes of the clusters belonging to a given ITS module
-    Int_t PNs=0, NNs=0;
-    Int_t tmp,bit,k;
-    Int_t N;
+
+    Int_t noentries;
     Int_t i;
+    Int_t gain=0;
+    Int_t signal=0;
 
-    N = fDigits->GetEntriesFast();
+    noentries = fDigits->GetEntriesFast();
 
-    Int_t* PSidx = new Int_t [N*sizeof(Int_t)];
-    Int_t* NSidx = new Int_t [N*sizeof(Int_t)]; 
-    if (fDigitsIndexP==NULL) fDigitsIndexP = new TArrayI(N);
-    if (fDigitsIndexN==NULL) fDigitsIndexN = new TArrayI(N);
+    if (fDigitsIndexP==NULL) fDigitsIndexP = new TArrayI(noentries);
+    if (fDigitsIndexN==NULL) fDigitsIndexN = new TArrayI(noentries);
 
     AliITSdigitSSD *dig;
 
-    for ( i = 0 ; i< N; i++ ) {
-       dig = (AliITSdigitSSD*)GetDigit(i);
-       if(dig->IsSideP()) { 
-           bit=1;
-           tmp=dig->GetStripNumber();
-           // I find this totally unnecessary - it's just a 
-           // CPU consuming double check
-           for( k=0;k<PNs;k++){
-               if (tmp==PSidx[k]){
-                   if (debug) cout<<"Such a digit exists \n";
-                   bit=0;
-               } // end if
-           } // end for k
-           // end comment 
-           if(bit) {
-               fDigitsIndexP->AddAt(i,fNDigitsP++);
-               PSidx[PNs++]=tmp;
-           } // end if bit
-       } else {
-           bit=1;
-           tmp=dig->GetStripNumber();
-           // same as above
-           for( k=0;k<NNs;k++){
-               if (tmp==NSidx[k]){
-                   if (debug) cout<<"Such a digit exists \n";
-                   bit=0;
-               } // end if
-           } // for k
-           // end comment
-           if (bit) {
-               fDigitsIndexN->AddAt(i,fNDigitsN++);
-               NSidx[NNs++] =tmp;
-           } // end if bit
-       } // end if
+    for ( i = 0 ; i< noentries; i++ ) {
+      
+      dig = (AliITSdigitSSD*)GetDigit(i);
+      
+      gain=(Int_t) ((AliITSCalibrationSSD*)GetResp(fModule))->GetGainP(dig->GetStripNumber());  
+      signal=gain*dig->GetSignal();
+      dig->SetSignal(signal);
+      
+      if(dig->IsSideP()) fDigitsIndexP->AddAt(i,fNDigitsP++);
+      else fDigitsIndexN->AddAt(i,fNDigitsN++);
+      
     } // end for i
+    
+    //    delete [] psidx;
+    //delete [] nsidx;
 
-    delete [] PSidx;
-    delete [] NSidx;
-
-    if (debug) cout<<"Digits :  P = "<<fNDigitsP<<"   N = "<<fNDigitsN<<endl;
+    //    if (debug) cout<<"Digits :  P = "<<fNDigitsP<<"   N = "<<fNDigitsN<<endl;
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSClusterFinderSSD::SortDigits(){
@@ -429,7 +597,7 @@ void AliITSClusterFinderSSD::SortDigits(){
        if(SortDigitsN(0,(fNDigitsN-1-i))==0) break;
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITSClusterFinderSSD::FillClIndexArrays(Int_t* arrayP, Int_t *arrayN){
+void AliITSClusterFinderSSD::FillClIndexArrays(Int_t* arrayP, Int_t *arrayN) const{
     // fill cluster index array
     register Int_t i;
 
@@ -553,15 +721,24 @@ Bool_t AliITSClusterFinderSSD::CreateNewRecPoint(Float_t P,Float_t dP,
     const Float_t kRMSz = 800.0*kconv;
     Int_t n=0;
     Int_t *tr;
-    Int_t NTracks;
+    Int_t ntracks;
+
+    Int_t lay,lad,det;
+    fDetTypeRec->GetITSgeom()->GetModuleId(fModule,lay,lad,det);
+    Int_t ind=(lad-1)*fDetTypeRec->GetITSgeom()->GetNdetectors(lay)+(det-1);
+    Int_t lyr=(lay-1);
 
     if (GetCrossing(P,N)) {
        //GetCrossingError(dP,dN);
+       dP = dN = prob = 0.0; // to remove unused variable warning.
        AliITSRawClusterSSD cnew;
        Int_t nstripsP=clusterP->GetNumOfDigits();
        Int_t nstripsN=clusterN->GetNumOfDigits();
        Float_t signal = 0;
        Float_t dedx = 0;
+       //      Float_t meannoiseP=clusterP->GetMeanNoise();
+       //Float_t meannoiseN=clusterN->GetMeanNoise();
+       //cout<<meannoiseP<<" "<<meannoiseN<<endl;
        if(SigP>SigN) {
            signal = SigP;
            dedx = SigP*kADCtoKeV;
@@ -570,25 +747,31 @@ Bool_t AliITSClusterFinderSSD::CreateNewRecPoint(Float_t P,Float_t dP,
            dedx = SigN*kADCtoKeV;
        } // end if SigP>SigN
      tr = (Int_t*) clusterP->GetTracks(n);
-     NTracks = clusterP->GetNTracks();
-     cnew.fSignalP=SigP;
-     cnew.fSignalN=SigN;
-     cnew.fMultiplicity=nstripsP;
-     cnew.fMultiplicityN=nstripsN;
-     cnew.fQErr=TMath::Abs(SigP-SigN);
-     cnew.fNtracks=NTracks;
-     fITS->AddCluster(2,&cnew);
-     AliITSRecPoint rnew;
-     rnew.SetX(P*kconv);
-     rnew.SetZ(N*kconv);
-     rnew.SetQ(signal);
-     rnew.SetdEdX(dedx);
-     rnew.SetSigmaX2( kRMSx* kRMSx); 
-     rnew.SetSigmaZ2( kRMSz* kRMSz);
-     rnew.fTracks[0]=tr[0];
-     rnew.fTracks[1]=tr[1];
-     rnew.fTracks[2]=tr[2];
-     fITS->AddRecPoint(rnew);
+     ntracks = clusterP->GetNTracks();
+
+     //cnew.SetDigitsClusterP(clusterP);
+     //cnew.SetDigitsClusterN(clusterN);
+
+     cnew.SetSignalP(SigP);
+     cnew.SetSignalN(SigN);
+     cnew.SetMultiplicity(nstripsP);
+     cnew.SetMultN(nstripsN);
+     cnew.SetQErr(TMath::Abs(SigP-SigN));
+     cnew.SetNTrack(ntracks);
+     //cnew.SetMeanNoiseP(meannoiseP);
+     //cnew.SetMeanNoiseN(meannoiseN);
+       fDetTypeRec->AddCluster(2,&cnew);
+       //fITS->AddCluster(2,&cnew);
+       //AliITSRecPoint rnew;
+       Int_t lab[4] = {tr[0],tr[1],tr[2],ind};
+       Float_t hit[5] = {P*kconv,N*kconv,kRMSx*kRMSx,kRMSz*kRMSz,signal};
+       Int_t info[3] = {nstripsP,nstripsN,lyr};
+
+       AliITSRecPoint rnew(lab,hit,info,kTRUE);
+       rnew.SetdEdX(dedx);
+
+       fDetTypeRec->AddRecPoint(rnew);
+       //    fITS->AddRecPoint(rnew);
      return kTRUE;
     } // end if
     return kFALSE;  
@@ -597,7 +780,8 @@ Bool_t AliITSClusterFinderSSD::CreateNewRecPoint(Float_t P,Float_t dP,
 void  AliITSClusterFinderSSD::CalcStepFactor(Float_t Psteo, Float_t Nsteo){
     // calculate the step factor for matching clusters
     // 95 is the pitch, 4000 - dimension along z ?
-    Float_t dz=fSegmentation->Dz();
+    //Float_t dz=fSegmentation->Dz();
+    Float_t dz=GetSeg()->Dz();
 
     fSFF = ( (Int_t)  (Psteo*dz/fPitch ) );// +1;
     fSFB = ( (Int_t)  (Nsteo*dz/fPitch ) );// +1;
@@ -634,35 +818,50 @@ AliITSclusterSSD* AliITSClusterFinderSSD::GetCluster(Int_t idx, Bool_t side){
 Bool_t AliITSClusterFinderSSD::GetCrossing (Float_t &P, Float_t &N){ 
     // get crossing
     // This function was rivised and changed by Boris Batiounia in March 2001
-    Float_t Dx = fSegmentation->Dx(); // detector size in x direction, microns
-    Float_t Dz = fSegmentation->Dz(); // detector size in z direction, microns
+    Float_t dx = GetSeg()->Dx(); // detector size in x direction, microns
+    Float_t dz = GetSeg()->Dz(); // detector size in z direction, microns
+    //Float_t dx = fSegmentation->Dx(); // detector size in x direction, microns
+    //Float_t dz = fSegmentation->Dz(); // detector size in z direction, microns
+    //cout<<dx<<" "<<dz<<endl;
     Float_t xL; // x local coordinate
     Float_t zL; // z local coordinate
-    Float_t x;  // x = xL + Dx/2
-    Float_t z;  // z = zL + Dz/2
+    Float_t x;  // x = xL + dx/2
+    Float_t z;  // z = zL + dz/2
     Float_t xP; // x coordinate in the P side from the first P strip
     Float_t xN; // x coordinate in the N side from the first N strip
-    Float_t StereoP,StereoN;
+    Float_t stereoP,stereoN;
+
+    //fSegmentation->Angles(stereoP,stereoN);
+    GetSeg()->Angles(stereoP,stereoN);
+
+    //cout<<stereoP<<" "<<stereoN<<" "<<P<<" "<<N<<endl;
 
-    fSegmentation->Angles(StereoP,StereoN);
-    fTanP=TMath::Tan(StereoP);
-    fTanN=TMath::Tan(StereoN);
+    //cout<<" P="<<P<<", N="<<N<<endl;
+
+    fTanP=TMath::Tan(stereoP);
+    fTanN=TMath::Tan(stereoN);
     Float_t kP = fTanP; // Tangent of 0.0075 mrad
     Float_t kN = fTanN; // Tangent of 0.0275 mrad
     P *= fPitch;
     N *= fPitch; 
 
-    xP = N;      // change the mistake for the P/N
-    xN = P;      // coordinates correspondence in this function
+    xP = P;
+    xN = N;
+    //    xP = N;      // change the mistake for the P/N
+    //xN = P;      // coordinates correspondence in this function
 
-    x = xP + kP*(Dz*kN-xP+xN)/(kP+kN);
-    z = (Dz*kN-xP+xN)/(kP+kN); 
-    xL = x - Dx/2;
-    zL = z - Dz/2;
+    z=(xN-xP+dz*kN)/(kP+kN);
+    x=xP+kP*z;
+    
+    xL = x - dx/2;
+    zL = z - dz/2;
     P = xL;
     N = zL;  
+    //cout<<"P= "<<P<<" , N= "<<N<<" , dx= "<<dx<<endl;
+
+    //cout<<"P="<<P<<", N="<<N<<endl;
 
-    if(TMath::Abs(xL) > Dx/2 || TMath::Abs(zL) > Dz/2) return kFALSE;
+    if(TMath::Abs(xL) > dx/2 || TMath::Abs(zL) > dz/2) return kFALSE;
     
     // Check that xL and zL are inside the detector for the 
     // correspondent xP and xN coordinates