]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITSFindClustersV2.C
from Ruediger
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSFindClustersV2.C
index aba52f2e7a10e426762a824113c9a99f35758b93..e8cba5ad628258c078d989c024b0211e651a8bd1 100644 (file)
-/****************************************************************
-*  This macro converts AliITSRecPoint(s) to AliITSclusterV2(s)  *
-*           Origin: I.Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch      *
-*****************************************************************/
-
-#ifndef __CINT__
-  #include <Riostream.h>
-
-  #include "AliRun.h"
-  #include "AliRunLoader.h"
-  #include "AliLoader.h"
-  #include "AliITS.h"
-  #include "AliITSgeom.h"
-  #include "AliITSclustererV2.h"
-
-  #include "TStopwatch.h"
+#if !defined(__CINT__) || defined(__MAKECINT__)
+
+#include <Riostream.h>
+#include <TROOT.h>
+#include <TString.h>
+#include "AliRawReader.h"
+#include "AliRawReaderDate.h"
+#include "AliRawReaderRoot.h"
+#include "AliRun.h"
+#include "AliRunLoader.h"
+#include "AliITSInitGeometry.h"
+#include "AliITSgeom.h"
+#include "AliITSLoader.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+#include "AliITSDetTypeRec.h"
+#include "AliGeomManager.h"
+
 #endif
 
-Int_t AliITSFindClustersV2(Char_t SlowOrFast='f')
-{
-
-    cerr<<"AliITSRecPoint(s) -> AliITSclusterV2(s)...\n";
-    
-    if (gAlice) 
-     {
-      delete gAlice->GetRunLoader();
-      delete gAlice; 
-      gAlice=0;
-     }
-    AliRunLoader* rl = AliRunLoader::Open("galice.root");
-    if (rl == 0x0)
-     {
-      cerr<<"AliITSHits2DigitsDefault.C : Can not open session RL=NULL"
-           << endl;
-       return 3;
-     }
-     
-    Int_t retval = rl->LoadgAlice();
-    if (retval)
-     {
-      cerr<<"AliITSHits2DigitsDefault.C : LoadgAlice returned error"
-           << endl;
-       delete rl;
-       return 3;
-     }
-    gAlice=rl->GetAliRun();
-    rl->LoadHeader();
-    retval = rl->LoadKinematics();
-    if (retval)
-     {
-      cerr<<"AliITSHits2DigitsDefault.C : LoadKinematics returned error"
-           << endl;
-       delete rl;
-       return 3;
-     }
-    
-    AliITSLoader* gime = (AliITSLoader*)rl->GetLoader("ITSLoader");
-    if (gime == 0x0)
-     {
-      cerr<<"AliITSHits2DigitsDefault.C : can not get ITS loader"
-           << endl;
-     }
-
-   rl->GetEvent(0);
-
-   AliITS *ITS  = (AliITS*)gAlice->GetModule("ITS");
-   if (!ITS) { cerr<<"Can't find the ITS !\n"; delete rl; return 3; }
-   AliITSgeom *geom=ITS->GetITSgeom();
-   TClonesArray *clusters=new TClonesArray("AliITSclusterV2",10000);
-  
-   gime->LoadRawClusters("recreate");
-
-   if (SlowOrFast=='f') 
-    {
-       gime->SetRecPointsFileName("ITS.FastRecPoints.root");
+/*
+$Id$ 
+*/
+/***************************************************************
+ *  This macro performs the ITS local reconstruction           *
+ *  It is intended for special purposes and tests.             *
+ *  The reccomended way to reconstruct ITs is via the          *
+ *  class STEER/AliReconstruction                              *
+ *  Present version: M.Masera - Previous version: J. Belikov   *
+ ***************************************************************/
+
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader,Option_t *opt);
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader, AliRawReader *rawreader,Option_t *opt);
+
+Int_t AliITSFindClustersV2(char *inputRawData = NULL,TString filename="galice.root",Option_t *opt="All"){
+  // if kine tree is available MC labels are used for rec points
+  // set opt equal to "SPD" or to "SDD" or to "SSD" do build
+  // rec points for individual subdetectors 
+  if (gAlice) {
+    delete AliRunLoader::Instance();
+    delete gAlice;
+    gAlice = NULL;
+  }
+
+  // Get geometry
+  AliGeomManager::LoadGeometry("geometry.root");
+
+  //Get Run loader and ITS loader - set geometry
+  AliRunLoader* rl = AliRunLoader::Open(filename.Data());
+
+  AliITSInitGeometry initgeom;
+  AliITSgeom *geom = initgeom.CreateAliITSgeom();
+  printf("Geometry name: %s \n",(initgeom.GetGeometryName()).Data());
+  AliITSLoader* loader = static_cast<AliITSLoader*>(rl->GetLoader("ITSLoader"));
+  if (!loader) {
+    Error("Init", "ITS loader not found");
+    return -1;
+  }
+  loader->SetITSgeom(geom);
+
+  // Set OCDB if needed
+  AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
+  if (!man->IsDefaultStorageSet()) {
+    printf("Setting a local default storage and run number 0\n");
+    man->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT/OCDB");
+    man->SetRun(0);
+  }
+  else {
+    printf("Using deafult storage \n");
+  }
+
+  AliRawReader *rawreader = NULL;
+  TString fileRaw(inputRawData);
+  if(!fileRaw.IsNull()){
+    if (fileRaw.EndsWith(".root")) {
+      cout<<"Raw data format - ROOT file \n"; 
+      rawreader = new AliRawReaderRoot(fileRaw); // root format
     }
-   if (gime->LoadRecPoints())
-    {
-      cerr<<"Load Rec Pints returned error !\n"; 
-      delete rl;
-      return 4;
+    else {
+      cout<<"Raw data format - DATE file \n";
+      rawreader = new AliRawReaderDate(fileRaw);  // DATE format
     }
-
-   TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",10000);
-
-   Float_t lp[5]; 
-   Int_t lab[6];
-   
-   Int_t iEvent;
-   for (iEvent = 0; iEvent< rl->GetNumberOfEvents() ; iEvent++) 
-    {
-
-     rl->GetEvent(iEvent);
-
-     TTree *cTree = gime->TreeC();
-     if (cTree == 0x0)  
-      {
-       gime->MakeTree("C");
-       cTree = gime->TreeC();
-      }
-   
-     cTree->Branch("Clusters",&clusters);
-     
-     TTree *pTree=gime->TreeR();
-     if (pTree == 0x0) 
-      {
-        cerr<<"Can not get TreeR !\n"; delete rl;return 5;
-      }
-     TBranch *branch = 0;
-     if (SlowOrFast=='f') {
-       branch = pTree->GetBranch("ITSRecPointsF");
-     }
-     else {
-       branch = pTree->GetBranch("ITSRecPoints");
-     }
-     if (!branch) 
-      { 
-       cerr<<"Can't get ITSRecPoints branch !\n"; 
-       delete rl;
-       return 6; 
-      }
-    
-     branch->SetAddress(&points);
-  
-     AliStack* stack = rl->Stack();
-     if (stack == 0x0)
-      {
-       cerr<<"AliITSFindClustersV2.C : Can not get stack"
-           << endl;
-       delete rl;
-       return 3;
-      }
-
-     TClonesArray &cl=*clusters;
-     Int_t nclusters=0;
-     Int_t nentr=(Int_t)branch->GetEntries();
-
-     cerr<<"Number of entries: "<<nentr<<endl;
-
-     for (Int_t i=0; i<nentr; i++) 
-      {
-       points->Clear();
-       clusters->Clear();
-       branch->GetEvent(i);
-       Int_t ncl=points->GetEntriesFast(); if (ncl==0){cTree->Fill();continue;}
-       Int_t lay,lad,det; geom->GetModuleId(i,lay,lad,det);
-       if ( (lay<0) || (lad<0) || (det<0))
-        {
-          ::Error("AliITSFindClustersV2.C","No such a module %d",i);
-          continue;
-        }
-       Float_t x,y,zshift; geom->GetTrans(lay,lad,det,x,y,zshift); 
-       Double_t rot[9];    geom->GetRotMatrix(lay,lad,det,rot);
-       Double_t yshift = x*rot[0] + y*rot[1];
-       Int_t ndet=(lad-1)*geom->GetNdetectors(lay) + (det-1);
-       nclusters+=ncl;
-
-       Float_t kmip=1; // ADC->mip normalization factor for the SDD and SSD 
-       if(lay==4 || lay==3){kmip=280.;};
-       if(lay==6 || lay==5){kmip=38.;};
-
-       for (Int_t j=0; j<ncl; j++) 
-        {
-          AliITSRecPoint *p=(AliITSRecPoint*)points->UncheckedAt(j);
-          //Float_t lp[5];
-          lp[0]=-p->GetX()-yshift; if (lay==1) lp[0]=-lp[0];
-          lp[1]=p->GetZ()+zshift;
-          lp[2]=p->GetSigmaX2();
-          lp[3]=p->GetSigmaZ2();
-          lp[4]=p->GetQ(); lp[4]/=kmip;
-          //Int_t lab[6]; 
-          lab[0]=p->GetLabel(0);lab[1]=p->GetLabel(1);lab[2]=p->GetLabel(2);
-          lab[3]=ndet;
-
-          Int_t label=lab[0];
-          if (label>=0) {
-             TParticle *part=(TParticle*)stack->Particle(label);
-             if (part == 0x0)
-              cerr<<"Can not get particle with label "<<label<<endl;
-             label=-3;
-             while (part->P() < 0.005) {
-                Int_t m=part->GetFirstMother();
-                if (m<0) {cerr<<"Primary momentum: "<<part->P()<<endl; break;}
-                label=m;
-                part=(TParticle*)gAlice->Particle(label);
-             }
-             if      (lab[1]<0) lab[1]=label;
-             else if (lab[2]<0) lab[2]=label;
-             else cerr<<"No empty labels !\n";
-         }
-
-          new(cl[j]) AliITSclusterV2(lab,lp);
-        }
-       cTree->Fill(); 
-//       clusters->Delete(); points->Delete();
-     }
-    gime->WriteRawClusters("OVERWRITE");
-    cerr<<"Number of clusters: "<<nclusters<<endl;
-    
-   }
-   
-   delete clusters;
-   delete points;
-   delete rl;
-   return 0;
-
+    //    if (!fEquipIdMap.IsNull() && fRawReader)fRawReader->LoadEquipmentIdsMap(fEquipIdMap);
+    Reconstruct(rl,rawreader,opt);
+  }
+  else {
+    cout<< "Starting from DIGITS \n";
+    Reconstruct(rl,opt);
+  }
+
+  return 0;
 }
 
+//________________________________________________________________________
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader,Option_t *opt){
+// reconstruct clusters starting from DIGITS
+// MC truth if available is used to label clusters according to the particles
+// originating them
+
+  AliITSLoader* loader = 
+                static_cast<AliITSLoader*>(runLoader->GetLoader("ITSLoader"));
+  if (!loader) {
+    Error("Reconstruct", "ITS loader not found");
+    return;
+  }
+  AliITSDetTypeRec* rec = new AliITSDetTypeRec();
+  rec->SetITSgeom(loader->GetITSgeom());
+  rec->SetDefaults();
+
+  runLoader->LoadKinematics();
+  TTree *trK=(TTree*)runLoader->TreeK();
+  if(trK){
+    cout<<"kine tree found - MC labels will be used in RP \n";
+    if(runLoader->LoadgAlice())gAlice = runLoader->GetAliRun();
+  }
+  else{
+    cout<<"kine tree not found - MC labels will not b used\n";
+  }
+
+  Int_t nEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
+  // loop on the events
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < nEvents; iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    cout<<">>>>>>>   Processing event number "<<iEvent+1<<endl;
+    loader->LoadRecPoints("update");
+    loader->CleanRecPoints();
+    loader->MakeRecPointsContainer();
+    loader->LoadDigits("read");
+    TTree *tR = loader->TreeR();
+    TTree *tD = loader->TreeD();
+    if(!tR){
+      cout<<"Tree R pointer not found - Abort \n";
+      break;
+    }
+    rec->SetTreeAddressD(tD);
+    rec->MakeBranch(tR,"R");
+    rec->SetTreeAddressR(tR);
+    rec->DigitsToRecPoints(tD,tR,0,opt,kTRUE);    
+    loader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
+    loader->UnloadRecPoints();
+    loader->UnloadDigits();
+    runLoader->UnloadKinematics();
+  }
 
+}
 
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader, AliRawReader *rawreader,Option_t *opt){
+// reconstruct clusters starting from raw data (root or DATE format)
+// MC truth if available is used to label clusters according to the particles
+// originating them
+
+  AliITSLoader* loader = static_cast<AliITSLoader*>(runLoader->GetLoader("ITSLoader"));
+  if (!loader) {
+    Error("Reconstruct", "ITS loader not found");
+    return;
+  }
+  AliITSDetTypeRec* rec = new AliITSDetTypeRec();
+  rec->SetITSgeom(loader->GetITSgeom());
+  rec->SetDefaults();
+  // direct clusterfinding starting from raw data is implemented only 
+  // in AliITSClusterFinderV2
+  rec->SetDefaultClusterFindersV2(kTRUE);
+
+  runLoader->LoadKinematics();
+  TTree *trK=(TTree*)runLoader->TreeK();
+  if(trK){
+    cout<<"kine tree found - MC labels will be used in RP \n";
+    if(runLoader->LoadgAlice())gAlice = runLoader->GetAliRun();
+  }
+  Int_t nEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
+  rawreader->RewindEvents();
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < nEvents; iEvent++) {
+    rawreader->NextEvent();
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    cout<<">>>>>>>   Processing event number: "<<iEvent<<endl;
+    loader->LoadRecPoints("update");
+    loader->CleanRecPoints();
+    loader->MakeRecPointsContainer();
+    TTree *tR = loader->TreeR();
+    if(!tR){
+      cout<<"Tree R pointer not found - Abort \n";
+      break;
+    }
+    rec->DigitsToRecPoints(rawreader,tR,opt);
+    rec->ResetRecPoints();
+    rec->ResetClusters();    
+    loader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
+    loader->UnloadRecPoints();
+    loader->UnloadDigits();
+    runLoader->UnloadKinematics();
+  }
 
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
+}