]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOS.cxx
Warnings fixed.
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOS.cxx
index 768de84dfc5a2b84c8aaf963c6a10870fb006f94..9059aa75abc8fbac40b8cd3d07d13e9d0ca9bee6 100644 (file)
 /* History of cvs commits:
  *
  * $Log$
- * Revision 1.96  2006/04/07 08:41:59  hristov
- * Follow AliAlignObj framework and remove AliPHOSAlignData (Yu.Kharlov)
+ * Revision 1.116  2007/10/10 09:05:10  schutz
+ * Changing name QualAss to QA
  *
- * Revision 1.95  2006/03/14 19:40:41  kharlov
- * Remove De-digitizing of raw data and digitizing the raw data fit
+ * Revision 1.115  2007/08/22 09:20:50  hristov
+ * Updated QA classes (Yves)
  *
- * Revision 1.94  2006/03/07 18:56:25  kharlov
- * CDB is passed via environment variable
+ * Revision 1.114  2007/08/07 14:12:03  kharlov
+ * Quality assurance added (Yves Schutz)
  *
- * Revision 1.93  2005/11/22 08:45:11  kharlov
- * Calibration is read from CDB if any (Boris Polichtchouk)
+ * Revision 1.113  2007/07/18 16:29:54  policheh
+ * Raw Sdigits energy converted to GeV.
  *
- * Revision 1.92  2005/11/03 13:09:19  hristov
- * Removing meaningless const declarations (linuxicc)
+ * Revision 1.112  2007/02/25 22:59:13  policheh
+ * Digits2Raw(): ALTRO buffer and mapping created per each DDL.
  *
- * Revision 1.91  2005/07/27 15:08:53  kharlov
- * Mixture ArCO2 is corrected
+ * Revision 1.111  2007/02/18 15:21:47  kharlov
+ * Corrections for memory leak in Digits2Raw due to AliAltroMapping
  *
- * Revision 1.90  2005/06/17 07:39:07  hristov
- * Removing GetDebug and SetDebug from AliRun and AliModule. Using AliLog for the messages
+ * Revision 1.110  2007/02/13 10:52:08  policheh
+ * Raw2SDigits() implemented
  *
- * Revision 1.89  2005/05/28 12:10:07  schutz
- * Copy constructor is corrected (by T.P.)
+ * Revision 1.109  2007/02/05 10:43:25  hristov
+ * Changes for correct initialization of Geant4 (Mihaela)
  *
+ * Revision 1.108  2007/02/01 10:34:47  hristov
+ * Removing warnings on Solaris x86
+ *
+ * Revision 1.107  2007/01/29 16:29:37  kharlov
+ * Digits2Raw(): special workaround for digits with time out of range
+ *
+ * Revision 1.106  2007/01/17 17:28:56  kharlov
+ * Extract ALTRO sample generation to a separate class AliPHOSPulseGenerator
+ *
+ * Revision 1.105  2007/01/12 21:44:29  kharlov
+ * Simulate and reconstruct two gains simulaneouslsy
  */
 
 //_________________________________________________________________________
@@ -67,26 +78,29 @@ class TFile;
 // --- AliRoot header files ---
 #include "AliMagF.h"
 #include "AliPHOS.h"
-#include "AliPHOSGetter.h"
+#include "AliPHOSLoader.h"
 #include "AliRun.h"
 #include "AliPHOSDigitizer.h"
 #include "AliPHOSSDigitizer.h"
 #include "AliPHOSDigit.h"
 #include "AliAltroBuffer.h"
+#include "AliAltroMapping.h"
+#include "AliCaloAltroMapping.h"
 #include "AliLog.h"
 #include "AliCDBManager.h"
 #include "AliCDBEntry.h"
 #include "AliCDBStorage.h"
 #include "AliPHOSCalibData.h"
+#include "AliPHOSPulseGenerator.h"
+#include "AliDAQ.h"
+#include "AliPHOSRawDecoder.h"
+#include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
+#include "AliPHOSQAChecker.h"
+#include "AliPHOSRecoParam.h"
+#include "AliPHOSSimParam.h"
 
 ClassImp(AliPHOS)
 
-Double_t AliPHOS::fgCapa        = 1.;        // 1pF 
-Int_t    AliPHOS::fgOrder       = 2 ;
-Double_t AliPHOS::fgTimeMax     = 2.56E-5 ;  // each sample is over 100 ns fTimeMax/fTimeBins
-Double_t AliPHOS::fgTimePeak    = 4.1E-6 ;   // 4 micro seconds
-Double_t AliPHOS::fgTimeTrigger = 100E-9 ;      // 100ns, just for a reference
-
 //____________________________________________________________________________
   AliPHOS:: AliPHOS() : AliDetector()
 {
@@ -99,12 +113,6 @@ Double_t AliPHOS::fgTimeTrigger = 100E-9 ;      // 100ns, just for a reference
 AliPHOS::AliPHOS(const char* name, const char* title): AliDetector(name, title)
 {
   //   ctor : title is used to identify the layout
-
-  fHighCharge        = 8.2 ;          // adjusted for a high gain range of 5.12 GeV (10 bits)
-  fHighGain          = 6.64 ; 
-  fHighLowGainFactor = 16. ;          // adjusted for a low gain range of 82 GeV (10 bits) 
-  fLowGainOffset     = GetGeometry()->GetNModules() + 1 ;   
-    // offset added to the module id to distinguish high and low gain data
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -112,20 +120,6 @@ AliPHOS::~AliPHOS()
 {  
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOS::Copy(TObject &obj)const
-{
-  // copy method to be used by the cpy ctor
-  TObject::Copy(obj);
-  
-  AliPHOS &phos = static_cast<AliPHOS &>(obj); 
-  
-  phos.fHighCharge        = fHighCharge ;
-  phos.fHighGain          = fHighGain ; 
-  phos.fHighLowGainFactor = fHighLowGainFactor ;  
-  phos.fLowGainOffset     = fLowGainOffset;   
-}
-
 //____________________________________________________________________________
 AliDigitizer* AliPHOS::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
 {
@@ -227,7 +221,8 @@ void AliPHOS::CreateMaterials()
   Float_t aG10[4] = { 12., 1., 16., 28.} ;
   Float_t zG10[4] = { 6., 1., 8., 14.} ;
   Float_t wG10[4] = { .259, .288, .248, .205} ;
-  Float_t dG10  = 1.7 ;
+  Float_t dG10  = 1.7 ; 
+
   
   AliMixture(12, "G10$", aG10, zG10, dG10, -4, wG10);
 
@@ -256,7 +251,8 @@ void AliPHOS::CreateMaterials()
   wArCO[1] = (1-arContent)*1;
   wArCO[2] = (1-arContent)*2;
   Float_t dArCO = arContent*dAr + (1-arContent)*dCO ;
-  AliMixture(16, "ArCO2$", aArCO, zArCO, dArCO,  -3, wArCO) ;
+  AliMixture(16, "ArCO2$", aArCO, zArCO, dArCO,  -3, wArCO) ; 
+
 
   // --- Stainless steel (let it be pure iron) ---
   AliMaterial(17, "Steel$", 55.845, 26, 7.87, 1.76, 0., 0, 0) ;
@@ -292,7 +288,6 @@ void AliPHOS::CreateMaterials()
   // DEFINITION OF THE TRACKING MEDIA
 
   // for PHOS: idtmed[699->798] equivalent to fIdtmed[0->100]
-  Int_t * idtmed = fIdtmed->GetArray() - 699 ; 
   Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ() ;
   Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max() ;
 
@@ -375,8 +370,16 @@ void AliPHOS::CreateMaterials()
   // Air                                                                            -> idtmed[798] 
   AliMedium(99, "Air          $", 99, 0,
             isxfld, sxmgmx, 10.0, 1.0, 0.1, 0.1, 10.0, 0, 0) ;
+}
 
+//_____________________________________________________________________________
+void AliPHOS::Init()
+{
+  //
+  // Initialises cuts for PHOS
+  //
   // --- Set decent energy thresholds for gamma and electron tracking
+  Int_t * idtmed = fIdtmed->GetArray() - 699 ; 
 
   // Tracking threshold for photons and electrons in the scintillator crystal 
   gMC->Gstpar(idtmed[699], "CUTGAM",0.5E-4) ; 
@@ -408,7 +411,6 @@ void AliPHOS::CreateMaterials()
   gMC->Gstpar(idtmed[715], "LOSS",2.) ;
   gMC->Gstpar(idtmed[715], "DRAY",0.) ;
   gMC->Gstpar(idtmed[715], "STRA",2.) ;
-
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -416,6 +418,10 @@ void AliPHOS::Digits2Raw()
 {
 // convert digits of the current event to raw data
   
+  if(AliPHOSSimParam::GetInstance()->IsEDigitizationOn()){
+    AliError("Energy digitization should be OFF if use Digits2Raw") ;
+  }
+
   AliPHOSLoader * loader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fLoader) ; 
 
   // get the digits
@@ -434,90 +440,145 @@ void AliPHOS::Digits2Raw()
     return;
   }
 
+  // get mapping from OCDB
+  const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
+  if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
+
   // some digitization constants
-  const Int_t    kDDLOffset = 0x600; // assigned to PHOS
-//   const Int_t    kThreshold = 1; // skip digits below this threshold // YVK
   const Float_t    kThreshold = 0.001; // skip digits below 1 MeV
   const Int_t      kAdcThreshold = 1;  // Lower ADC threshold to write to raw data
 
-  AliAltroBuffer* buffer = NULL;
   Int_t prevDDL = -1;
-  Int_t adcValuesLow[fkTimeBins];
-  Int_t adcValuesHigh[fkTimeBins];
+
+  // Create a shaper pulse object
+  AliPHOSPulseGenerator *pulse = new AliPHOSPulseGenerator();
+  
+  Int_t *adcValuesLow = new Int_t[pulse->GetRawFormatTimeBins()];
+  Int_t *adcValuesHigh= new Int_t[pulse->GetRawFormatTimeBins()];
+  
+  const Int_t maxDDL = 20;
+  AliAltroBuffer  *buffer[maxDDL];
+  AliAltroMapping *mapping[maxDDL];
+
+  for(Int_t jDDL=0; jDDL<maxDDL; jDDL++) {
+    buffer[jDDL]=0;
+    mapping[jDDL]=0;
+  }
+
+  //!!!!for debug!!!
+  Int_t modMax=-111;
+  Int_t colMax=-111;
+  Int_t rowMax=-111;
+  Float_t eMax=-333;
+  //!!!for debug!!!
 
   // loop over digits (assume ordered digits)
   for (Int_t iDigit = 0; iDigit < digits->GetEntries(); iDigit++) {
     AliPHOSDigit* digit = dynamic_cast<AliPHOSDigit *>(digits->At(iDigit)) ;
+
+    // Skip small energy below treshold
     if (digit->GetEnergy() < kThreshold) 
       continue;
+    // Skip CPV digits
+    if (digit->GetId() > geom->GetNModules() * geom->GetNCristalsInModule()) 
+      continue;
+
     Int_t relId[4];
     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relId);
     Int_t module = relId[0];
  
-   // Begin FIXME 
+    // Begin FIXME 
     if (relId[1] != 0) 
       continue;    // ignore digits from CPV
-   // End FIXME 
+    // End FIXME 
+
+    Int_t row = relId[2]-1;
+    Int_t col = relId[3]-1;
+
+    Int_t iRCU = -111;
+
+    //RCU0
+    if(0<=row&&row<32 && 0<=col&&col<28) iRCU=0;
+
+    //RCU1
+    if(0<=row&&row<32 && 28<=col&&col<56) iRCU=1;
+
+    //RCU2
+    if(32<=row&&row<64 && 0<=col&&col<28) iRCU=2;
+
+    //RCU3
+    if(32<=row&&row<64 && 28<=col&&col<56) iRCU=3;
+
 
-    // PHOS EMCA has 4 DDL per module. Splitting is done based on the row number
-    Int_t iDDL = 4 * (module - 1) + (4 * (relId[2] - 1)) / geom->GetNPhi();
+    // PHOS EMCA has 4 DDL per module. Splitting is based on the (row,column) numbers.
+    // PHOS internal convention: 1<module<5.
+    Int_t iDDL = 4 * (module - 1) + iRCU;
 
     // new DDL
     if (iDDL != prevDDL) {
-      // write real header and close previous file
-      if (buffer) {
-       buffer->Flush();
-       buffer->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
-       delete buffer;
+      if (buffer[iDDL] == 0) {
+       // open new file and write dummy header
+       TString fileName = AliDAQ::DdlFileName("PHOS",iDDL);
+
+       TString path = gSystem->Getenv("ALICE_ROOT");
+       path += "/PHOS/mapping/RCU";
+       path += iRCU;
+       path += ".data";
+
+       mapping[iDDL] = (AliAltroMapping*)maps->At(iRCU);
+       buffer[iDDL]  = new AliAltroBuffer(fileName.Data(),mapping[iDDL]);
+       buffer[iDDL]->WriteDataHeader(kTRUE, kFALSE);  //Dummy;
       }
-
-      // open new file and write dummy header
-      TString fileName("PHOS_") ;
-      fileName += (iDDL + kDDLOffset) ; 
-      fileName += ".ddl" ; 
-      buffer = new AliAltroBuffer(fileName.Data(), 1);
-      buffer->WriteDataHeader(kTRUE, kFALSE);  //Dummy;
-
       prevDDL = iDDL;
     }
 
-    // out of time range signal (?)
-    if (digit->GetTimeR() > GetRawFormatTimeMax() ) {
-      buffer->FillBuffer((Int_t)digit->GetEnergy());
-      buffer->FillBuffer(GetRawFormatTimeBins() );  // time bin
-      buffer->FillBuffer(3);          // bunch length      
-      buffer->WriteTrailer(3, relId[3], relId[2], module);  // trailer
+    AliDebug(2,Form("digit E=%.4f GeV, t=%g s, (mod,col,row)=(%d,%d,%d)\n",
+                   digit->GetEnergy(),digit->GetTimeR(),
+                   relId[0]-1,relId[3]-1,relId[2]-1));
+    // if a signal is out of time range, write only trailer
+    if (digit->GetTimeR() > pulse->GetRawFormatTimeMax()*0.5 ) {
+      AliDebug(2,"Signal is out of time range.\n");
+      buffer[iDDL]->FillBuffer(0);
+      buffer[iDDL]->FillBuffer(pulse->GetRawFormatTimeBins() );  // time bin
+      buffer[iDDL]->FillBuffer(3);                               // bunch length
+      buffer[iDDL]->WriteTrailer(3, relId[3]-1, relId[2]-1, 0);  // trailer
       
     // calculate the time response function
     } else {
       Double_t energy = 0 ;
-      Int_t   module = relId[0];
-      if ( digit->GetId() <= geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule()) {
+      module = relId[0];
+      if (digit->GetId() <= geom->GetNModules() * geom->GetNCristalsInModule()) {
        energy=digit->GetEnergy();
+       if(energy>eMax) {eMax=energy; modMax=module; colMax=col; rowMax=row;}
       }
       else {
-//     energy = digit->GetAmp()*digitizer->GetCPVchannel()+digitizer->GetCPVpedestal();
        energy = 0; // CPV raw data format is now know yet
-      }        
-      Bool_t lowgain = RawSampledResponse(digit->GetTimeR(), energy, adcValuesHigh, adcValuesLow) ; 
-      
-      if (lowgain) 
-       buffer->WriteChannel(relId[3], relId[2], module + fLowGainOffset, 
-                            GetRawFormatTimeBins(), adcValuesLow , kAdcThreshold);
-      else 
-       buffer->WriteChannel(relId[3], relId[2], module, 
-                            GetRawFormatTimeBins(), adcValuesHigh, kAdcThreshold);
-      
+      }
+      pulse->SetAmplitude(energy);
+      pulse->SetTZero(digit->GetTimeR());
+      pulse->MakeSamples();
+      pulse->GetSamples(adcValuesHigh, adcValuesLow) ; 
+      buffer[iDDL]->WriteChannel(relId[3]-1, relId[2]-1, 0, 
+                          pulse->GetRawFormatTimeBins(), adcValuesLow , kAdcThreshold);
+      buffer[iDDL]->WriteChannel(relId[3]-1, relId[2]-1, 1, 
+                          pulse->GetRawFormatTimeBins(), adcValuesHigh, kAdcThreshold);
     }
   }
   
   // write real header and close last file
-  if (buffer) {
-    buffer->Flush();
-    buffer->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
-    delete buffer;
+  for (Int_t iDDL=0; iDDL<maxDDL; iDDL++) {
+    if (buffer[iDDL]) {
+      buffer[iDDL]->Flush();
+      buffer[iDDL]->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
+      delete buffer[iDDL];
+      //if (mapping[iDDL]) delete mapping[iDDL];
+    }
   }
   
+  AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n",
+        modMax,colMax,rowMax,eMax));
+
+  delete pulse;
   loader->UnloadDigits();
 }
 
@@ -528,9 +589,11 @@ void AliPHOS::Hits2SDigits()
 
   AliPHOSSDigitizer phosDigitizer(fLoader->GetRunLoader()->GetFileName().Data()) ;
   phosDigitizer.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
   phosDigitizer.ExecuteTask("all") ; 
 }
 
+
 //____________________________________________________________________________
 AliLoader* AliPHOS::MakeLoader(const char* topfoldername)
 {
@@ -540,77 +603,6 @@ AliLoader* AliPHOS::MakeLoader(const char* topfoldername)
  return fLoader;
 }
 
-//__________________________________________________________________
-Double_t AliPHOS::RawResponseFunction(Double_t *x, Double_t *par) 
-{
-  // Shape of the electronics raw reponse:
-  // It is a semi-gaussian, 2nd order Gamma function of the general form
-  // v(t) = n**n * Q * A**n / C *(t/tp)**n * exp(-n * t/tp) with 
-  // tp : peaking time par[0]
-  // n  : order of the function
-  // C  : integrating capacitor in the preamplifier
-  // A  : open loop gain of the preamplifier
-  // Q  : the total APD charge to be measured Q = C * energy
-  
-  Double_t signal ;
-  Double_t xx = x[0] - ( fgTimeTrigger + par[3] ) ; 
-
-  if (xx < 0 || xx > fgTimeMax) 
-    signal = 0. ;  
-  else { 
-    Double_t fac = par[0] * TMath::Power(fgOrder, fgOrder) * TMath::Power(par[1], fgOrder) / fgCapa ; 
-    signal = fac * par[2] * TMath::Power(xx / fgTimePeak, fgOrder) * TMath::Exp(-fgOrder * (xx / fgTimePeak)) ; 
-  }
-  return signal ;  
-}
-
-//__________________________________________________________________
-Double_t AliPHOS::RawResponseFunctionMax(Double_t charge, Double_t gain) 
-{
-  return ( charge * TMath::Power(fgOrder, fgOrder) * TMath::Power(gain, fgOrder) 
-     / ( fgCapa * TMath::Exp(fgOrder) ) );  
-
-}
-
-//__________________________________________________________________
-Bool_t AliPHOS::RawSampledResponse(Double_t dtime, Double_t damp, Int_t * adcH, Int_t * adcL) const 
-{
-  // for a start time dtime and an amplitude damp given by digit, 
-  // calculates the raw sampled response AliPHOS::RawResponseFunction
-  // Input: dtime - signal start time
-  //        damp  - signal amplitude (energy)
-  // Output: adcH - array[fkTimeBins] of 10-bit samples for high-gain channel
-  //         adcL - array[fkTimeBins] of 10-bit samples for low-gain channel
-
-  const Int_t kRawSignalOverflow = 0x3FF ; 
-  Bool_t lowGain = kFALSE ; 
-
-  TF1 signalF("signal", RawResponseFunction, 0, GetRawFormatTimeMax(), 4);
-
-  for (Int_t iTime = 0; iTime < GetRawFormatTimeBins(); iTime++) {
-    signalF.SetParameter(0, GetRawFormatHighCharge() ) ; 
-    signalF.SetParameter(1, GetRawFormatHighGain() ) ; 
-    signalF.SetParameter(2, damp) ; 
-    signalF.SetParameter(3, dtime) ; 
-    Double_t time = iTime * GetRawFormatTimeMax() / GetRawFormatTimeBins() ;
-    Double_t signal = signalF.Eval(time) ;     
-    if ( static_cast<Int_t>(signal+0.5) > kRawSignalOverflow ){  // larger than 10 bits 
-      signal = kRawSignalOverflow ;
-      lowGain = kTRUE ; 
-    }
-    adcH[iTime] =  static_cast<Int_t>(signal + 0.5) ;
-
-    signalF.SetParameter(0, GetRawFormatLowCharge() ) ;     
-    signalF.SetParameter(1, GetRawFormatLowGain() ) ; 
-    signal = signalF.Eval(time) ;  
-    if ( static_cast<Int_t>(signal+0.5) > kRawSignalOverflow)  // larger than 10 bits 
-      signal = kRawSignalOverflow ;
-    adcL[iTime] = static_cast<Int_t>(0.5 + signal ) ; 
-
-  }
-  return lowGain ; 
-}
-
 //____________________________________________________________________________
 void AliPHOS::SetTreeAddress()
 { 
@@ -631,3 +623,36 @@ void AliPHOS::SetTreeAddress()
   }
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+Bool_t AliPHOS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
+{
+
+  AliPHOSLoader * loader = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fLoader) ;
+
+  TTree * tree = 0 ;
+  tree = loader->TreeS() ;
+  if ( !tree ) {
+    loader->MakeTree("S");
+    tree = loader->TreeS() ;
+  }
+
+  TClonesArray * sdigits = loader->SDigits() ;
+  if(!sdigits) { 
+    loader->MakeSDigitsArray();
+    sdigits = loader->SDigits();
+  }
+  sdigits->Clear();
+
+  AliPHOSRawDecoder dc(rawReader);
+  AliPHOSRawDigiProducer pr;
+  pr.MakeDigits(sdigits,&dc);
+
+  Int_t bufferSize = 32000 ;
+  // TBranch * sdigitsBranch = tree->Branch("PHOS",&sdigits,bufferSize);
+  tree->Branch("PHOS",&sdigits,bufferSize);
+  tree->Fill();
+
+  fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
+  return kTRUE;
+    
+}