]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSPIDv1.cxx
Updated PID with pi0 identification
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSPIDv1.cxx
index e1f9c4adcf3517b046248ffd808016327c1a02e3..af794083bfe1510feb240f3cbc7fc8ac19669c6d 100644 (file)
 //_________________________________________________________________________
 // Implementation version v1 of the PHOS particle identifier 
 // Particle identification based on the 
-//     - CPV information, 
-//     - Preshower information (in MIXT or GPS2 geometries)
-//     - shower width.
+//     - RCPV: distance from CPV recpoint to EMCA recpoint.
+//     - TOF 
+//     - PCA: Principal Components Analysis..
+// The identified particle has an identification number corresponding 
+// to a 9 bits number:
+//     -Bit 0 to 2: bit set if RCPV > CpvEmcDistance (each bit corresponds
+//      to a different efficiency-purity point of the photon identification) 
+//     -Bit 3 to 5: bit set if TOF  < TimeGate (each bit corresponds
+//      to a different efficiency-purity point of the photon identification) 
+//     -Bit 6 to 9: bit set if Principal Components are 
+//      inside an ellipse defined by the parameters a, b, c, x0 and y0.
+//      (each bit corresponds to a different efficiency-purity point of the 
+//      photon identification)
+//      The PCA (Principal components analysis) needs a file that contains
+//      a previous analysis of the correlations between the particles. This 
+//      file is $ALICE_ROOT/PHOS/PCA8pa15_0.5-100.root. Analysis done for 
+//      energies between 0.5 and 100 GeV.
+//      A calibrated energy is calculated. The energy of the reconstructed
+//      cluster is corrected with the formula A + B * E  + C * E^2, whose 
+//      parameters where obtained through the study of the reconstructed 
+//      energy distribution of monoenergetic photons. 
 //
-// CPV or Preshower clusters should be closer in PHOS plane than fCpvEmcDistance (in cm).
-// This parameter can be set by method SetCpvtoEmcDistanceCut(Float_t cut)  
-//
-// One can set desirable ID method by the function SetIdentificationMethod(option).
-// Presently the following options can be used together or separately :
-//     - "disp": use dispersion cut on shower width 
-//               (width can be set by method SetDispersionCut(Float_t cut)
-//     - "ell" : use cut on the axis of the ellipse, drawn around shower 
-//       (this cut can be changed by SetShowerProfileCut(char* formula), 
-//        where formula - any function of two variables f(lambda[0],lambda[1]).
-//        Shower is considered as EM if f() > 0 )
-// One can visualize current cuts calling method PlotDispersionCuts().    
+//      All the parameters (RCPV(2 rows-3 columns),TOF(1r-3c),PCA(5r-4c) 
+//      and calibration(1r-3c))are stored in a file called 
+//      $ALICE_ROOT/PHOS/Parameters.dat. Each time that AliPHOSPIDv1 is 
+//      initialized, this parameters are copied to a Matrix (9,4), a 
+//      TMatrixD object.  
 //
 // use case:
-//  root [0] AliPHOSPIDv1 * p1 = new AliPHOSPIDv1("galice.root")
-//  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
-//  root [1] p1->SetIdentificationMethod("disp ellipse")
-//  root [2] p1->ExecuteTask()
-//  root [3] AliPHOSPIDv1 * p2 = new AliPHOSPIDv1("galice1.root","ts1")
+//  root [0] AliPHOSPIDv1 * p = new AliPHOSPIDv1("galice1.root")
 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
-//                // reading headers from file galice1.root and TrackSegments 
-//                // with title "ts1"
-//  root [4] p2->SetRecParticlesBranch("rp1")
-//                // set file name for the branch RecParticles
-//  root [5] p2->ExecuteTask("deb all time")
-//                // available options
-//                // "deb" - prints # of reconstructed particles
-//                // "deb all" -  prints # and list of RecParticles
-//                // "time" - prints benchmarking results
+//          // reading headers from file galice1.root and create  RecParticles 
+            // TrackSegments and RecPoints are used 
+//          // set file name for the branch RecParticles
+//  root [1] p->ExecuteTask("deb all time")
+//          // available options
+//          // "deb" - prints # of reconstructed particles
+//          // "deb all" -  prints # and list of RecParticles
+//          // "time" - prints benchmarking results
 //                  
-//*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Gines Martinez (SUBATECH) & 
-//            Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
-//            Completely redesined by Dmitri Peressounko, March 2001
+//  root [2] AliPHOSPIDv1 * p2 = new AliPHOSPIDv1("galice1.root","v1",kTRUE)
+//  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
+//                //Split mode.  
+//  root [3] p2->ExecuteTask()
+//
+
 
+//*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Gines Martinez (SUBATECH) & 
+//            Gustavo Conesa April 2002
+//            PCA redesigned by Gustavo Conesa October 2002:
+//            The way of using the PCA has changed. Instead of 2
+//            files with the PCA, each one with different energy ranges 
+//            of application, we use the wide one (0.5-100 GeV), and instead
+//            of fixing 3 ellipses for different ranges of energy, it has been
+//            studied the dependency of the ellipses parameters with the 
+//            energy, and they are implemented in the code as a funtion 
+//            of the energy. 
+//
+//
+//
 // --- ROOT system ---
 #include "TROOT.h"
 #include "TTree.h"
 #include "TFolder.h"
 #include "TSystem.h"
 #include "TBenchmark.h"
+#include "TMatrixD.h"
+#include "TPrincipal.h"
+#include "TSystem.h"
+
 // --- Standard library ---
 
-#include <iostream.h>
-#include <iomanip.h>
+#include <Riostream.h>
 
 // --- AliRoot header files ---
 
@@ -90,89 +115,556 @@ ClassImp( AliPHOSPIDv1)
 AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1():AliPHOSPID()
 { 
   // default ctor
-  fFormula           = 0 ;
-  fDispersion        = 0. ; 
-  fCpvEmcDistance    = 0 ; 
-  fTimeGate          = 2.e-9 ;
-  fHeaderFileName    = "" ; 
-  fTrackSegmentsTitle= "" ; 
-  fRecPointsTitle    = "" ; 
-  fRecParticlesTitle = "" ; 
-  fIDOptions         = "dis time" ; 
-  fRecParticlesInRun = 0 ;
-  fEmcRecPoints = 0;
-  fCpvRecPoints = 0;
-  fTrackSegments = 0;
-  fRecParticles = 0;
-  fClusterizer = 0;
-  fTSMaker = 0;
+  InitParameters() ; 
+  fDefaultInit = kTRUE ; 
+
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1(const char * headerFile,const char * name) : AliPHOSPID(headerFile, name)
+AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1(const char * headerFile,const char * name, const Bool_t toSplit)
+:AliPHOSPID(headerFile, name,toSplit)
 { 
   //ctor with the indication on where to look for the track segments
-
-  fFormula        = new TFormula("LambdaCuts","(x>1)*(x<2.5)*(y>0)*(y<x)") ;   
-  fDispersion     = 2.0 ; 
-  fCpvEmcDistance = 3.0 ;
-  fTimeGate          = 2.e-9 ;
  
-  fHeaderFileName     = GetTitle() ; 
-  fTrackSegmentsTitle = GetName() ; 
-  fRecPointsTitle     = GetName() ; 
-  fRecParticlesTitle  = GetName() ; 
-  fIDOptions          = "dis time" ;
-    
-  TString tempo(GetName()) ; 
-  tempo.Append(":") ;
-  tempo.Append(Version()) ; 
-  SetName(tempo) ; 
-  fRecParticlesInRun = 0 ; 
+  InitParameters() ; 
 
   Init() ;
+  fDefaultInit = kFALSE ; 
 
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 AliPHOSPIDv1::~AliPHOSPIDv1()
 { 
-  if(fTrackSegments) fTrackSegments->Delete() ; 
-  if(fEmcRecPoints) fEmcRecPoints->Delete() ; 
-  if(fCpvRecPoints) fCpvRecPoints->Delete() ;
-  if(fRecParticles) fRecParticles->Delete() ;
+  // dtor
+  // fDefaultInit = kTRUE if PID created by default ctor (to get just the parameters)
+
+  delete [] fX ;    // Principal input 
+  delete [] fP ;    // Principal components
+  delete [] fPPi0 ; // Pi0 Principal components
+
+  if (!fDefaultInit) {  
+//    AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+    // remove the task from the folder list
+//     gime->RemoveTask("P",GetName()) ;
+//     TString name(GetName()) ; 
+//     name.ReplaceAll("pid", "clu") ; 
+//     gime->RemoveTask("C",name) ;
+    
+//     // remove the data from the folder list
+//     name = GetName() ; 
+//     name.Remove(name.Index(":")) ; 
+//     gime->RemoveObjects("RE", name) ; // EMCARecPoints
+//     gime->RemoveObjects("RC", name) ; // CPVRecPoints
+//     gime->RemoveObjects("T", name) ;  // TrackSegments
+//     gime->RemoveObjects("P", name) ;  // RecParticles
+    
+//     // Delete gAlice
+//     gime->CloseFile() ; 
+    
+    fSplitFile = 0 ; 
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+const TString AliPHOSPIDv1::BranchName() const 
+{  
+  TString branchName(GetName() ) ;
+  branchName.Remove(branchName.Index(Version())-1) ;
+  return branchName ;
+}
+//____________________________________________________________________________
+void AliPHOSPIDv1::Init()
+{
+  // Make all memory allocations that are not possible in default constructor
+  // Add the PID task to the list of PHOS tasks
+
+  if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
+    SetTitle("galice.root") ;
+
+  TString branchname(GetName()) ;
+  branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;    
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(),branchname.Data(),fToSplit ) ; 
+
+  //  gime->SetRecParticlesTitle(BranchName()) ;
+  if ( gime == 0 ) {
+    Error("Init", "Could not obtain the Getter object !" ) ;  
+    return ;
+  } 
+
+  fSplitFile = 0 ;
+  if(fToSplit){
+    //First - extract full path if necessary
+    TString fileName(GetTitle()) ;
+    Ssiz_t islash = fileName.Last('/') ;
+    if(islash<fileName.Length())
+      fileName.Remove(islash+1,fileName.Length()) ;
+    else
+      fileName="" ;
+    fileName+="PHOS.RecData." ;
+    if((strcmp(branchname.Data(),"Default")!=0)&&(strcmp(branchname.Data(),"")!=0)){
+      fileName+=branchname.Data() ;
+      fileName+="." ;
+    }
+    fileName+="root" ;
+    fSplitFile = static_cast<TFile*>(gROOT->GetFile(fileName.Data()));   
+    if(!fSplitFile)
+      fSplitFile =  TFile::Open(fileName.Data(),"update") ;
+  }
+  
+  gime->PostPID(this) ;
+  // create a folder on the white board //YSAlice/WhiteBoard/RecParticles/PHOS/recparticlesName
+  gime->PostRecParticles(branchname) ; 
+  
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+void AliPHOSPIDv1::InitParameters()
+{
+//   fFrom               = "" ;
+//   fHeaderFileName     = GetTitle() ; 
+//   TString name(GetName()) ; 
+//   if (name.IsNull()) 
+//     name = "Default" ;
+//   fTrackSegmentsTitle = name ; 
+//   fRecPointsTitle     = name ; 
+//   fRecParticlesTitle  = name ;
+//   name.Append(":") ;
+//   name.Append(Version()) ; 
+//   SetName(name) ; 
+  fRecParticlesInRun = 0 ; 
+  fNEvent            = 0 ;            
+  //  fClusterizer       = 0 ;      
+  //  fTSMaker           = 0 ;        
+  fRecParticlesInRun = 0 ;
+  TString pidName( GetName()) ;
+  if (pidName.IsNull() ) 
+    pidName = "Default" ; 
+  pidName.Append(":") ; 
+  pidName.Append(Version()) ; 
+  SetName(pidName) ;
+  fPi0Analysis = kFALSE ;
+  SetParameters() ; // fill the parameters matrix from parameters file
+}
 
 //____________________________________________________________________________
-Float_t  AliPHOSPIDv1::GetDistance(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv, Option_t *  Axis)const
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetCpvtoEmcDistanceCut(const Float_t e, const TString Axis) const
 {
-  // Calculates the distance between the EMC RecPoint and the PPSD RecPoint
+  // Get CpvtoEmcDistance Cut depending on the cluster energy, axis and 
+  // Purity-Efficiency point 
+
+  Int_t i = -1;
+  if      (Axis.Contains("X")) i = 1;
+  else if (Axis.Contains("Z")) i = 2;
+  else
+    Error("GetCpvtoEmcDistanceCut"," Invalid axis option ");
+   
+  Float_t a = (*fParameters)(i,0) ;
+  Float_t b = (*fParameters)(i,1) ;
+  Float_t c = (*fParameters)(i,2) ;
+
+  Float_t sig = a + TMath::Exp(b-c*e);
+  return sig;
+}
+//____________________________________________________________________________
+
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetTimeGate(const Int_t Eff_Pur) const
+{
+  // Get TimeGate parameter depending on Purity-Efficiency point 
  
+   if(Eff_Pur>2 || Eff_Pur<0)
+    Error("GetTimeGate","Invalid Efficiency-Purity choice %d",Eff_Pur);
+    return (*fParameters)(3,Eff_Pur) ; 
+
+}
+//_____________________________________________________________________________
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetDistance(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv, Option_t *  Axis)const
+{
+  // Calculates the distance between the EMC RecPoint and the PPSD RecPoint
+  
   const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ; 
   TVector3 vecEmc ;
   TVector3 vecCpv ;
-  
-  emc->GetLocalPosition(vecEmc) ;
-  cpv->GetLocalPosition(vecCpv) ; 
-  if(emc->GetPHOSMod() == cpv->GetPHOSMod()){ 
-    
-    // Correct to difference in CPV and EMC position due to different distance to center.
-    // we assume, that particle moves from center
-    Float_t dCPV = geom->GetIPtoOuterCoverDistance();
-    Float_t dEMC = geom->GetIPtoCrystalSurface() ;
-    dEMC         = dEMC / dCPV ;
-    vecCpv = dEMC * vecCpv  - vecEmc ; 
-    if (Axis == "X") return vecCpv.X();
-    if (Axis == "Y") return vecCpv.Y();
-    if (Axis == "Z") return vecCpv.Z();
-    if (Axis == "R") return vecCpv.Mag();
+  if(cpv){
+    emc->GetLocalPosition(vecEmc) ;
+    cpv->GetLocalPosition(vecCpv) ; 
+    if(emc->GetPHOSMod() == cpv->GetPHOSMod()){      
+      // Correct to difference in CPV and EMC position due to different distance to center.
+      // we assume, that particle moves from center
+      Float_t dCPV = geom->GetIPtoOuterCoverDistance();
+      Float_t dEMC = geom->GetIPtoCrystalSurface() ;
+      dEMC         = dEMC / dCPV ;
+      vecCpv = dEMC * vecCpv  - vecEmc ; 
+      if (Axis == "X") return vecCpv.X();
+      if (Axis == "Y") return vecCpv.Y();
+      if (Axis == "Z") return vecCpv.Z();
+      if (Axis == "R") return vecCpv.Mag();
   } 
+    
+    return 100000000 ;
+  }
   return 100000000 ;
 }
+//____________________________________________________________________________
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetCPVBit(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv,const Int_t EffPur, const Float_t e) const
+{
+  if(EffPur>2 || EffPur<0)
+    Error("GetCPVBit","Invalid Efficiency-Purity choice %d",EffPur);
+  
+  Float_t sigX = GetCpvtoEmcDistanceCut(e,"X");
+  Float_t sigZ = GetCpvtoEmcDistanceCut(e,"Z");
+  
+  Float_t deltaX = TMath::Abs(GetDistance(emc, cpv,  "X"));
+  Float_t deltaZ = TMath::Abs(GetDistance(emc, cpv,  "Z"));
+       
+  if((deltaX>sigX*(EffPur+1))|(deltaZ>sigZ*(EffPur+1)))
+    return 1;//Neutral
+  else
+    return 0;//Charged
+  
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetCalibratedEnergy(const Float_t e) const
+{
+//      It calibrates Energy depending on the recpoint energy.
+//      The energy of the reconstructed cluster is corrected with 
+//      the formula A + B* E  + C* E^2, whose parameters where obtained 
+//      through the study of the reconstructed energy distribution of 
+//      monoenergetic photons.
+  Double_t p[]={0.,0.,0.};
+  Int_t i;
+  for(i=0;i<3;i++) p[i]= (*fParameters)(0,i);
+  Double_t  enerec = p[0] +  p[1]* e+ p[2] * e * e;
+  return enerec ;
+
+}
+//____________________________________________________________________________
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetPrincipalBit(const Double_t* P,const Int_t eff_pur, const Float_t E)const
+{
+  //Is the particle inside de PCA ellipse?
+
+  Int_t    prinbit  = 0 ;
+  Double_t A        = GetEllipseParameter("a", E); 
+  Double_t B        = GetEllipseParameter("b", E);
+  Double_t C        = GetEllipseParameter("c", E);
+  Double_t X_center = GetEllipseParameter("x0", E); 
+  Double_t Y_center = GetEllipseParameter("y0", E);
+  
+  Double_t R = TMath::Power((P[0] - X_center)/A,2) + 
+      TMath::Power((P[1] - Y_center)/B,2) +
+      C*(P[0] -  X_center)*(P[1] - Y_center)/(A*B) ;
+  //3 different ellipses defined
+  if((eff_pur==2)&&(R <1./2.)) prinbit= 1;
+  if((eff_pur==1)&&(R <2.   )) prinbit= 1;
+  if((eff_pur==0)&&(R <9./2.)) prinbit= 1;
+
+  if(R<0)
+    Error("GetPrincipalBit", "Negative square? R=%f \n",R) ;
+
+  return prinbit;
+
+}
+//____________________________________________________________________________
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetPrincipalPi0Bit(const Double_t* P,const Int_t eff_pur, const Float_t E)const
+{
+  //Is the particle inside de Pi0 PCA ellipse?
+
+  Int_t    prinbit  = 0 ;
+  Double_t A        = GetEllipseParameterPi0("a", E); 
+  Double_t B        = GetEllipseParameterPi0("b", E);
+  Double_t C        = GetEllipseParameterPi0("c", E);
+  Double_t X_center = GetEllipseParameterPi0("x0", E); 
+  Double_t Y_center = GetEllipseParameterPi0("y0", E);
+  
+  Double_t R = TMath::Power((P[0] - X_center)/A,2) + 
+      TMath::Power((P[1] - Y_center)/B,2) +
+      C*(P[0] -  X_center)*(P[1] - Y_center)/(A*B) ;
+  //3 different ellipses defined
+  if((eff_pur==2)&&(R <1./2.)) prinbit= 1;
+  if((eff_pur==1)&&(R <2.   )) prinbit= 1;
+  if((eff_pur==0)&&(R <9./2.)) prinbit= 1;
+
+  if(R<0)
+    Error("GetPrincipalPi0Bit", "Negative square?") ;
+
+  return prinbit;
+
+}
+//_____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetCpvtoEmcDistanceCutParameters(Float_t e, Int_t Eff_Pur, TString Axis,Float_t cut) 
+{
+  // Set the parameters to calculate Cpvto EmcDistanceCut depending on the cluster energy and 
+  // Purity-Efficiency point 
+
+  if(Eff_Pur>2 || Eff_Pur<0)
+     Error("SetCpvtoEmcDistanceCutParameters","Invalid Efficiency-Purity choice %d",Eff_Pur);
+
+  Int_t i = -1;
+  if     (Axis.Contains("X")) i = 1;
+  else if(Axis.Contains("Z")) i = 2;
+  else
+    Error("SetCpvtoEmcDistanceCutParameters"," Invalid axis option");
+  
+  (*fParameters)(i,Eff_Pur) = cut ;
+}
+//_____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetTimeGate(Int_t Eff_Pur, Float_t gate) 
+{
+  // Set the parameter TimeGate depending on the cluster energy and 
+  // Purity-Efficiency point 
+  if(Eff_Pur>2 || Eff_Pur<0)
+    Error("SetTimeGate","Invalid Efficiency-Purity choice %d",Eff_Pur);
+  
+  (*fParameters)(3,Eff_Pur)= gate ; 
+} 
+//_____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameters() 
+{
+  // PCA : To do the Principal Components Analysis it is necessary 
+  // the Principal file, which is opened here
+  fX         = new double[7]; // Data for the PCA 
+  fP         = new double[7]; // Eigenvalues of the PCA
+  fPPi0      = new double[7]; // Eigenvalues of the Pi0 PCA
+
+  // Read photon principals from the photon file
+  
+  fFileName     = "$ALICE_ROOT/PHOS/PCA8pa15_0.5-100.root" ; 
+  TFile f( fFileName.Data(), "read" ) ;
+  fPrincipal = dynamic_cast<TPrincipal*> (f.Get("principal")) ; 
+  f.Close() ; 
+
+  // Read pi0 principals from the pi0 file
+
+  fFileNamePi0  = "$ALICE_ROOT/PHOS/PCA_pi0_40-120.root" ;
+  TFile fPi0( fFileNamePi0.Data(), "read" ) ;
+  fPrincipalPi0 = dynamic_cast<TPrincipal*> (fPi0.Get("principal")) ; 
+  fPi0.Close() ;
+
+  // Open parameters file and initialization of the Parameters matrix. 
+  // In the File Parameters.dat are all the parameters. These are introduced 
+  // in a matrix of 9x4  
+  // 
+  // All the parameters defined in this file are, in order of row: 
+  // -CpvtoEmcDistanceCut (2 row (x and z) and 3 columns, each one depending 
+  // on the parameter of the funtion that sets the cut in x or z.   
+  // -TimeGate, 1 row and 3 columns (3 efficiency-purty cuts) 
+  // -PCA, parameters of the functions that 
+  // calculate the ellipse parameters, x0,y0,a, b, c. These 5 parameters 
+  // (5 rows) depend on 4 parameters (columns). 
+  // -Finally there is a row with the energy calibration parameters, 
+  // 3 parameters. 
+
+  fFileNamePar = gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PHOS/Parameters.YVK.dat");
+  fParameters = new TMatrixD(14,4) ;
+  const Int_t maxLeng=255;
+  char string[maxLeng];
+
+  // Open a text file with PID parameters
+  FILE *fd = fopen(fFileNamePar.Data(),"r");
+  if (!fd)
+    Fatal("SetParameter","File %s with a PID parameters cannot be opened\n",
+         fFileNamePar.Data());
+
+  Int_t i=0;
+  // Read parameter file line-by-line and skip empty line and comments
+  while (fgets(string,maxLeng,fd) != NULL) {
+    if (string[0] == '\n' ) continue;
+    if (string[0] == '!'  ) continue;
+    sscanf(string, "%lf %lf %lf %lf",
+          &(*fParameters)(i,0), &(*fParameters)(i,1), 
+          &(*fParameters)(i,2), &(*fParameters)(i,3));
+    i++;
+  }
+  fclose(fd);
+}
+
+
+//________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetEllipseParameter(TString Param, Int_t i, Double_t par) 
+{  
+  // Set the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
+  // parameter "Param".
+  
+  Int_t p= -1;
+  if     (Param.Contains("a")) p=4; 
+  else if(Param.Contains("b")) p=5; 
+  else if(Param.Contains("c")) p=6; 
+  else if(Param.Contains("x0"))p=7; 
+  else if(Param.Contains("y0"))p=8;
+  if((i>4)||(i<0))
+    Error("SetEllipseParameter", "No parameter with index %d", i) ; 
+  else if(p==-1)
+     Error("SetEllipseParameter", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
+  else
+    (*fParameters)(p,i) = par ;
+} 
+//________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetEllipseParameterPi0(TString Param, Int_t i, Double_t par) 
+{  
+  // Set the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
+  // parameter "Param".
+  if(!fPi0Analysis) Error("SetPi0EllipseParameter", "Pi 0 Analysis is off") ; 
+  Int_t p= -1;
+  if     (Param.Contains("a")) p=9; 
+  else if(Param.Contains("b")) p=10; 
+  else if(Param.Contains("c")) p=11; 
+  else if(Param.Contains("x0"))p=12; 
+  else if(Param.Contains("y0"))p=13;
+  if((i>4)||(i<0))
+    Error("SetPi0EllipseParameter", "No parameter with index %d", i) ; 
+  else if(p==-1)
+     Error("SetPi0EllipseParameter", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
+  else
+    (*fParameters)(p,i) = par ;
+} 
+//________________________________________________________________________
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterToCalculateEllipse(const TString Param, const Int_t i) const
+{ 
+  // Get the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
+  // parameter "Param".
+
+  Int_t p= -1;
+  Double_t par = -1;
+
+  if     (Param.Contains("a")) p=4; 
+  else if(Param.Contains("b")) p=5; 
+  else if(Param.Contains("c")) p=6; 
+  else if(Param.Contains("x0"))p=7; 
+  else if(Param.Contains("y0"))p=8;
+
+  if((i>4)||(i<0))
+    Error("GetParameterToCalculateEllipse", "No parameter with index", i) ; 
+  else if(p==-1)
+    Error("GetParameterToCalculateEllipse", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
+  else
+    par = (*fParameters)(p,i) ;
+  
+  return par;
+
+} 
+//____________________________________________________________________________
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterToCalculatePi0Ellipse(const TString Param, const Int_t i) const
+{ 
+  // Get the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
+  // parameter "Param".
+
+  if(!fPi0Analysis) Error("GetParameterToCalculatePi0Ellipse", "Pi 0 Analysis is off") ;
+
+  Int_t p= -1;
+  Double_t par = -1;
+
+  if(Param.Contains("a")) p=9; 
+  if(Param.Contains("b")) p=10; 
+  if(Param.Contains("c")) p=11; 
+  if(Param.Contains("x0"))p=12; 
+  if(Param.Contains("y0"))p=13;
+
+  if((i>4)||(i<0))
+    Error("GetParameterToCalculatePi0Ellipse", "No parameter with index", i) ; 
+  else if(p==-1)
+    Error("GetParameterToCalculatePi0Ellipse", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
+  else
+    par = (*fParameters)(p,i) ;
+  
+  return par;
+
+} 
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetCalibrationParameter(Int_t i,Double_t param) 
+{
+  (*fParameters)(0,i) = param ;
+}
+//____________________________________________________________________________
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetCalibrationParameter(const Int_t i) const 
+{
+  Float_t param = (*fParameters)(0,i);
+  return param;
+}
+//____________________________________________________________________________
+// const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameter(const TString Param,Float_t E) const 
+// {
+//   // Calculates the parameter Param of the ellipse
+  
+//   Double_t p[4]={0.,0.,0.,0.};
+//   Double_t value = 0.0;
+//   Int_t i;
+
+//   if(Param.Contains("a")){
+//     for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(4,i);
+//     if(E>70.)E=70.;
+//   }
+  
+//   else if(Param.Contains("b")){
+//     for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(5,i);
+//     if(E>70.)E=70.;
+//   }
+  
+//   else if(Param.Contains("c"))
+//     for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(6,i);
+  
+//   else if(Param.Contains("x0")){
+//     for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(7,i);
+//     if(E<1.)E=1.1;
+//   }
+//   else if(Param.Contains("y0"))
+//     for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(8,i);
+  
+//   value = p[0]/TMath::Sqrt(E)+p[1]*E+p[2]*E*E+p[3];
+//   return value;
+// }
 
 //____________________________________________________________________________
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameter(const TString Param,Float_t E) const 
+{
+  // Calculates the parameter Param of the pi0 ellipse
+  
+  Double_t p[3]  = {0.,0.,0.};
+  Double_t value = 0.0;
+  Int_t    i;
+
+  if(Param.Contains("a"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(4,i);
+  else if(Param.Contains("b"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(5,i);
+  else if(Param.Contains("c"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(6,i);
+  else if(Param.Contains("x0"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(7,i);
+  else if(Param.Contains("y0"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(8,i);
+  
+  value = p[0] + p[1]*E + p[2]*E*E;
+  return value;
+}
+//____________________________________________________________________________
+const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameterPi0(const TString Param,Float_t E) const 
+{
+  // Calculates the parameter Param of the pi0 ellipse
+  
+  Double_t p[3]  = {0.,0.,0.};
+  Double_t value = 0.0;
+  Int_t    i;
+
+  if(Param.Contains("a"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(9,i);
+  else if(Param.Contains("b"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(10,i);
+  else if(Param.Contains("c"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(11,i);
+  else if(Param.Contains("x0"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(12,i);
+  else if(Param.Contains("y0"))
+    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(13,i);
+  
+  value = p[0] + p[1]*E + p[2]*E*E;
+  return value;
+}
+//____________________________________________________________________________
+
 void  AliPHOSPIDv1::Exec(Option_t * option) 
 {
   //Steering method
@@ -188,108 +680,61 @@ void  AliPHOSPIDv1::Exec(Option_t * option)
     return ; 
   }
 
-  gAlice->GetEvent(0) ;
-  //check, if the branch with name of this" already exits?
-  TObjArray * lob = (TObjArray*)gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
-  TIter next(lob) ; 
-  TBranch * branch = 0 ;  
-  Bool_t phospidfound = kFALSE, pidfound = kFALSE ; 
-  
-  TString taskName(GetName()) ; 
-  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
 
-  while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phospidfound || !pidfound) ) {
-    if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSPID")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) 
-      phospidfound = kTRUE ;
-    
-    else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSPID")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) 
-      pidfound = kTRUE ; 
-  }
-
-  if ( phospidfound || pidfound ) {
-    cerr << "WARNING: AliPHOSPIDv1::Exec -> RecParticles and/or PIDtMaker branch with name " 
-        << taskName.Data() << " already exits" << endl ;
-    return ; 
-  }       
-  
-  Int_t nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+  if(gime->BranchExists("RecParticles") )
+    return ;
+  Int_t nevents = gime->MaxEvent() ;  
   Int_t ievent ;
-  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
-  
+
   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
     gime->Event(ievent,"R") ;
-    
-    MakeRecParticles() ;
-    
-    WriteRecParticles(ievent);
-    
-    if(strstr(option,"deb"))
-      PrintRecParticles(option) ;
+    if(gime->TrackSegments() && //Skip events, where no track segments made
+       gime->TrackSegments()->GetEntriesFast()) {
+      MakeRecParticles() ;
+      WriteRecParticles(ievent);
+      if(strstr(option,"deb"))
+        PrintRecParticles(option) ;
+      //increment the total number of rec particles per run 
+      fRecParticlesInRun+=gime->RecParticles(BranchName())->GetEntriesFast() ; 
+    }
   }
   
   if(strstr(option,"tim")){
     gBenchmark->Stop("PHOSPID");
-    cout << "AliPHOSPID:" << endl ;
-    cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID") << " seconds for PID " 
-        <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID")/nevents << " seconds per event " << endl ;
-    cout << endl ;
-  }
-  
-}
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSPIDv1::Init()
-{
-  // Make all memory allocations that are not possible in default constructor
-  // Add the PID task to the list of PHOS tasks
-  
-  if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
-    SetTitle("galice.root") ;
-  
-  TString taskName(GetName()) ; 
-  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
-  
-  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(), taskName.Data()) ; 
-  if ( gime == 0 ) {
-    cerr << "ERROR: AliPHOSPIDv1::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ; 
-    return ;
+    Info("Exec", "took %f seconds for PID %f seconds per event", 
+        gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID"),  
+        gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID")/nevents) ;
   } 
-   
-  gime->PostPID(this) ;
-  // create a folder on the white board //YSAlice/WhiteBoard/RecParticles/PHOS/recparticlesName
-  gime->PostRecParticles(taskName.Data() ) ; 
-  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
 
   // Makes a RecParticle out of a TrackSegment
-  TString taskName(GetName()) ; 
-  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
-
+  
   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
-  TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints(taskName) ; 
-  TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints(taskName) ; 
-  TClonesArray * trackSegments = gime->TrackSegments(taskName) ; 
-  TClonesArray * recParticles  = gime->RecParticles(taskName) ; 
+  TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ; 
+  TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ; 
+  TClonesArray * trackSegments = gime->TrackSegments() ; 
+  if ( !emcRecPoints || !cpvRecPoints || !trackSegments ) {
+    Fatal("MakeRecParticles", "RecPoints or TrackSegments not found !") ;  
+  }
+  TClonesArray * recParticles  = gime->RecParticles() ; 
   recParticles->Clear();
-  
+
   TIter next(trackSegments) ; 
   AliPHOSTrackSegment * ts ; 
   Int_t index = 0 ; 
   AliPHOSRecParticle * rp ; 
-  
-  Bool_t ellips = fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase ) ;
-  Bool_t disp   = fIDOptions.Contains("dis",TString::kIgnoreCase ) ;
-  Bool_t time   = fIDOptions.Contains("tim",TString::kIgnoreCase ) ;
-  
   while ( (ts = (AliPHOSTrackSegment *)next()) ) {
     
     new( (*recParticles)[index] ) AliPHOSRecParticle() ;
     rp = (AliPHOSRecParticle *)recParticles->At(index) ; 
-    rp->SetTraskSegment(index) ;
+    rp->SetTrackSegment(index) ;
     rp->SetIndexInList(index) ;
-    
+       
     AliPHOSEmcRecPoint * emc = 0 ;
     if(ts->GetEmcIndex()>=0)
       emc = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(ts->GetEmcIndex()) ;
@@ -298,164 +743,169 @@ void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
     if(ts->GetCpvIndex()>=0)
       cpv = (AliPHOSRecPoint *)   cpvRecPoints->At(ts->GetCpvIndex()) ;
     
-    //set momentum and energy first
-    Float_t    e = emc->GetEnergy() ;
-    TVector3 dir = GetMomentumDirection(emc,cpv) ; 
-    dir.SetMag(e) ;
+    // Now set type (reconstructed) of the particle
 
-    rp->SetMomentum(dir.X(),dir.Y(),dir.Z(),e) ;
-    rp->SetCalcMass(0);
+    // Choose the cluster energy range
+    
+    if (!emc) {
+      Fatal("MakeRecParticles", "-> emc(%d) = %d", ts->GetEmcIndex(), emc ) ;
+    }
 
-    //now set type (reconstructed) of the particle    
-    Int_t showerprofile = 0;  // 0 narrow and 1 wide
+    Float_t    e = emc->GetEnergy() ;   
+    
+    Float_t  lambda[2] ;
+    emc->GetElipsAxis(lambda) ;
     
-    if(ellips){
-      Float_t lambda[2] ;
-      emc->GetElipsAxis(lambda) ;
-      if(fFormula->Eval(lambda[0],lambda[1]) <= 0 )
-       showerprofile = 1 ;  // not narrow
+    if((lambda[0]>0.01) && (lambda[1]>0.01)){
+      // Looking PCA. Define and calculate the data (X),
+      // introduce in the function X2P that gives the components (P).  
+
+      Float_t  Spher = 0. ;
+      Float_t  Emaxdtotal = 0. ; 
+      
+      if((lambda[0]+lambda[1])!=0) 
+       Spher=fabs(lambda[0]-lambda[1])/(lambda[0]+lambda[1]); 
+      
+      Emaxdtotal=emc->GetMaximalEnergy()/emc->GetEnergy(); 
+      
+      fX[0] = lambda[0] ;  
+      fX[1] = lambda[1] ; 
+      fX[2] = emc->GetDispersion() ; 
+      fX[3] = Spher ; 
+      fX[4] = emc->GetMultiplicity() ;  
+      fX[5] = Emaxdtotal ;  
+      fX[6] = emc->GetCoreEnergy() ;  
+      
+      fPrincipal->X2P(fX,fP);
+      if(fPi0Analysis)
+       fPrincipalPi0->X2P(fX,fPPi0);
+
+    }
+    else{
+      fP[0]=-100.0;  //We do not accept clusters with 
+      fP[1]=-100.0;  //one cell as a photon-like
+      if(fPi0Analysis){
+       fPPi0[0]=-100.0;
+       fPPi0[1]=-100.0;
+      }
     }
     
-    if(disp)
-      if(emc->GetDispersion() > fDispersion )
-       showerprofile = 1 ;  // not narrow
+    Float_t time =emc->GetTime() ;
+    
+    // Loop of Efficiency-Purity (the 3 points of purity or efficiency 
+    // are taken into account to set the particle identification)
+    for(Int_t eff_pur = 0; eff_pur < 3 ; eff_pur++){
+      
+      // Looking at the CPV detector. If RCPV greater than CpvEmcDistance, 
+      // 1st,2nd or 3rd bit (depending on the efficiency-purity point )
+      // is set to 1
+      if(GetCPVBit(emc, cpv, eff_pur,e) == 1 )  
+       rp->SetPIDBit(eff_pur) ;
+      
+      // Looking the TOF. If TOF smaller than gate,  4th, 5th or 6th 
+      // bit (depending on the efficiency-purity point )is set to 1             
+      if(time< (*fParameters)(2,eff_pur)) 
+       rp->SetPIDBit(eff_pur+3) ;                  
+      
+      //If we are inside the ellipse, 7th, 8th or 9th 
+      // bit (depending on the efficiency-purity point )is set to 1 
+      if(GetPrincipalBit(fP,eff_pur,e) == 1) 
+       rp->SetPIDBit(eff_pur+6) ;
+
+      //Pi0 analysis
+      //If we are inside the ellipse, 10th, 11th or 12th 
+      // bit (depending on the efficiency-purity point )is set to 1 
+      if(fPi0Analysis){
+       if(GetPrincipalPi0Bit(fPPi0,eff_pur,e) == 1) 
+         rp->SetPIDBit(eff_pur+9) ;
+      }
+    }
     
-    Int_t slow = 0 ;
-    if(time)
-      if(emc->GetTime() > fTimeGate )
-       slow = 0 ; 
-        
-    // Looking at the CPV detector
-    Int_t cpvdetector= 0 ;  //1 hit and 0 no hit     
-    if(cpv)
-      if(GetDistance(emc, cpv,  "R") < fCpvEmcDistance) 
-       cpvdetector = 1 ;  
     
-    Int_t type = showerprofile + 2 * slow  + 4 * cpvdetector ;
-    rp->SetType(type) ; 
+    //Set momentum, energy and other parameters 
+    Float_t  encal = GetCalibratedEnergy(e);
+    TVector3 dir   = GetMomentumDirection(emc,cpv) ; 
+    dir.SetMag(encal) ;
+    rp->SetMomentum(dir.X(),dir.Y(),dir.Z(),encal) ;
+    rp->SetCalcMass(0);
+    rp->Name(); //If photon sets the particle pdg name to gamma
+    rp->SetProductionVertex(0,0,0,0);
+    rp->SetFirstMother(-1);
+    rp->SetLastMother(-1);
+    rp->SetFirstDaughter(-1);
+    rp->SetLastDaughter(-1);
+    rp->SetPolarisation(0,0,0);
     index++ ; 
   }
   
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1:: Print(Option_t * option) const
+void  AliPHOSPIDv1::Print()
 {
   // Print the parameters used for the particle type identification
-    cout <<  "=============== AliPHOSPID1 ================" << endl ;
-    cout <<  "Making PID "<< endl ;
-    cout <<  "    Headers file:               " << fHeaderFileName.Data() << endl ;
-    cout <<  "    RecPoints branch title:     " << fRecPointsTitle.Data() << endl ;
-    cout <<  "    TrackSegments Branch title: " << fTrackSegmentsTitle.Data() << endl ;
-    cout <<  "    RecParticles Branch title   " << fRecParticlesTitle.Data() << endl;
-    cout <<  "with parameters: " << endl ;
-    cout <<  "    Maximal EMC - CPV  distance (cm) " << fCpvEmcDistance << endl ;
-    if(fIDOptions.Contains("dis",TString::kIgnoreCase ))
-      cout <<  "                    dispersion cut " << fDispersion << endl ;
-    if(fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase )){
-      cout << "             Eliptic cuts function: " << endl ;
-      cout << fFormula->GetTitle() << endl ;
-    }
-    if(fIDOptions.Contains("tim",TString::kIgnoreCase ))
-      cout << "             Time Gate uzed: " << fTimeGate <<  endl ;
-    cout <<  "============================================" << endl ;
-}
 
-//____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetShowerProfileCut(char * formula)
-{
-  //set shape of the cut on the axis of ellipce, drown around shouer
-  //shower considered "narrow" if Formula(lambda[0],lambda[1]) > 0.
-  if(fFormula) 
-    delete fFormula; 
-  fFormula = new TFormula("Lambda Cut",formula) ;
+  TString message ; 
+    message  = "\n=============== AliPHOSPID1 ================\n" ;
+    message += "Making PID\n";
+    message += "    Pricipal analysis file from 0.5 to 100 %s\n" ; 
+    message += "    Name of parameters file     %s\n" ;
+    message += "    Matrix of Parameters: 14x4\n" ;
+    message += "        Energy Calibration  1x3 [3 parametres to calibrate energy: A + B* E + C * E^2]\n" ;
+    message += "        RCPV 2x3 rows x and z, columns function cut parameters\n" ;
+    message += "        TOF  1x3 [High Eff-Low Pur,Medium Eff-Pur, Low Eff-High Pur]\n" ;
+    message += "        PCA  5x4 [5 ellipse parametres and 4 parametres to calculate them: A/Sqrt(E) + B* E + C * E^2 + D]\n" ;
+    message += "    Pi0 PCA  5x3 [5 ellipse parametres and 3 parametres to calculate them: A + B* E + C * E^2]\n" ;
+    Info("Print", message.Data(), fFileName.Data(), fFileNamePar.Data() ) ; 
+    fParameters->Print() ;
 }
+
 //____________________________________________________________________________
 void  AliPHOSPIDv1::WriteRecParticles(Int_t event)
 {
  
   AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
-  TString taskName(GetName()) ; 
-  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
-  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles(taskName) ; 
-  recParticles->Expand(recParticles->GetEntriesFast() ) ;
 
-  //Make branch in TreeR for RecParticles 
-  char * filename = 0;
-  if(gSystem->Getenv("CONFIG_SPLIT_FILE")!=0){   //generating file name
-    filename = new char[strlen(gAlice->GetBaseFile())+20] ;
-    sprintf(filename,"%s/PHOS.Reco.root",gAlice->GetBaseFile()) ; 
+  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles() ; 
+  recParticles->Expand(recParticles->GetEntriesFast() ) ;
+  TTree * treeR ;
+
+  if(fToSplit){
+    if(!fSplitFile)
+      return ;
+    fSplitFile->cd() ;
+    char name[10] ;
+    sprintf(name,"%s%d", "TreeR",event) ;
+    treeR = dynamic_cast<TTree*>(fSplitFile->Get(name)); 
+  }
+  else{
+    treeR = gAlice->TreeR();
   }
   
-  TDirectory *cwd = gDirectory;
+  if(!treeR){
+    gAlice->MakeTree("R", fSplitFile);
+    treeR = gAlice->TreeR() ;
+  }
   
   //First rp
   Int_t bufferSize = 32000 ;    
-  TBranch * rpBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSRP",&recParticles,bufferSize);
-  rpBranch->SetTitle(fRecParticlesTitle);
-  if (filename) {
-    rpBranch->SetFile(filename);
-    TIter next( rpBranch->GetListOfBranches());
-    TBranch * sb ;
-    while ((sb=(TBranch*)next())) {
-      sb->SetFile(filename);
-    }   
-    cwd->cd();
-  }
+  TBranch * rpBranch = treeR->Branch("PHOSRP",&recParticles,bufferSize);
+  rpBranch->SetTitle(BranchName());
+
   
   //second, pid
   Int_t splitlevel = 0 ; 
   AliPHOSPIDv1 * pid = this ;
-  TBranch * pidBranch = gAlice->TreeR()->Branch("AliPHOSPID","AliPHOSPIDv1",&pid,bufferSize,splitlevel);
-  pidBranch->SetTitle(fRecParticlesTitle.Data());
-  if (filename) {
-    pidBranch->SetFile(filename);
-    TIter next( pidBranch->GetListOfBranches());
-    TBranch * sb ;
-    while ((sb=(TBranch*)next())) {
-      sb->SetFile(filename);
-    }   
-    cwd->cd();
-  }    
+  TBranch * pidBranch = treeR->Branch("AliPHOSPID","AliPHOSPIDv1",&pid,bufferSize,splitlevel);
+  pidBranch->SetTitle(BranchName());
   
   rpBranch->Fill() ;
-  pidBranch->Fill() ;
+  pidBranch->Fill() ; 
   
-  gAlice->TreeR()->Write(0,kOverwrite) ;  
-  
-}
-
-//____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::PlotDispersionCuts()const
-{
-  // produces a plot of the dispersion cut
-  TCanvas*  lambdas = new TCanvas("lambdas","Cuts on the ellipse axis",200,10,700,500);
-  if(fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase ) ){
-    TF2 * ell = new TF2("Elliptic Cuts",fFormula->GetName(),0,3,0,3) ;
-    ell->SetMinimum(0.0000001) ;
-    ell->SetMaximum(0.001) ;
-    ell->SetLineStyle(1) ;
-    ell->SetLineWidth(2) ;
-    ell->Draw() ;
+  treeR->AutoSave() ; //Write(0,kOverwrite) ;  
+  if(gAlice->TreeR()!=treeR){
+    treeR->Delete();
   }
-  
-  if( fIDOptions.Contains("dis",TString::kIgnoreCase ) ){
-    TF2 * dsp = new TF2("dispersion","(y<x)*(x*x+y*y < [0]*[0])",0,3,0,3) ;
-    dsp->SetParameter(0,fDispersion) ;
-    dsp->SetMinimum(0.0000001) ;
-    dsp->SetMaximum(0.001) ;
-    dsp->SetLineStyle(1) ;
-    dsp->SetLineColor(2) ;
-    dsp->SetLineWidth(2) ;
-    dsp->SetNpx(200) ;
-    dsp->SetNpy(200) ;
-    if(fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase ) )
-      dsp->Draw("same") ;
-    else
-      dsp->Draw() ;
-  }
-  lambdas->Update();
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -473,34 +923,16 @@ TVector3 AliPHOSPIDv1::GetMomentumDirection(AliPHOSEmcRecPoint * emc, AliPHOSRec
   TMatrix  dummy ;
   
   emc->GetGlobalPosition(emcglobalpos, dummy) ;
-  
-  // The following commented code becomes valid once the PPSD provides 
-  // a reasonable position resolution, at least as good as EMC ! 
-  //   TVector3 ppsdlglobalpos ;
-  //   TVector3 ppsduglobalpos ;
-  //   if( fPpsdLowRecPoint ){ // certainly a photon that has concerted
-  //     fPpsdLowRecPoint->GetGlobalPosition(ppsdlglobalpos, mdummy) ; 
-  //     dir = emcglobalpos -  ppsdlglobalpos ; 
-  //     if( fPpsdUpRecPoint ){ // not looks like a charged       
-  //        fPpsdUpRecPoint->GetGlobalPosition(ppsduglobalpos, mdummy) ; 
-  //        dir = ( dir +  emcglobalpos -  ppsduglobalpos ) * 0.5 ; 
-  //      }
-  //   }
-  //   else { // looks like a neutral
-  //    dir = emcglobalpos ;  
-  //  }
-  
+
   dir = emcglobalpos ;  
   dir.SetZ( -dir.Z() ) ;   // why ?  
-  dir.SetMag(1.) ;
 
   //account correction to the position of IP
   Float_t xo,yo,zo ; //Coordinates of the origin
   gAlice->Generator()->GetOrigin(xo,yo,zo) ;
   TVector3 origin(xo,yo,zo);
   dir = dir - origin ;
-
+  dir.SetMag(1.) ;
   return dir ;  
 }
 //____________________________________________________________________________
@@ -510,71 +942,30 @@ void AliPHOSPIDv1::PrintRecParticles(Option_t * option)
 
   AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
 
-  TString taskName(GetName()) ; 
-  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
-  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles(taskName) ; 
-  
-  cout << "AliPHOSPIDv1: event "<<gAlice->GetEvNumber()  << endl ;
-  cout << "       found " << recParticles->GetEntriesFast() << " RecParticles " << endl ;
+  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles(BranchName()) ; 
+
+  TString message ; 
+  message  = "\nevent " ;
+  message += gAlice->GetEvNumber() ; 
+  message += "       found " ; 
+  message += recParticles->GetEntriesFast(); 
+  message += " RecParticles\n" ; 
 
-  fRecParticlesInRun += recParticles->GetEntriesFast() ; 
-  
   if(strstr(option,"all")) {  // printing found TS
-    
-    cout << "  PARTICLE "   
-        << "  Index    "  << endl ;
-      //        << "  X        "     
-      //        << "  Y        " 
-      //        << "  Z        "    
-      //        << " # of primaries "          
-      //        << " Primaries list "    <<  endl;      
+    message += "\n  PARTICLE         Index    \n" ; 
     
     Int_t index ;
     for (index = 0 ; index < recParticles->GetEntries() ; index++) {
       AliPHOSRecParticle * rp = (AliPHOSRecParticle * ) recParticles->At(index) ;       
-      
-      Text_t particle[11];
-      switch(rp->GetType()) {
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST:
-       strcpy( particle, "NEUTRAL EM FAST");
-       break;
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHAFAST:
-       strcpy(particle, "NEUTRAL HA FAST");
-       break;
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMSLOW:
-       strcpy(particle, "NEUTRAL EM SLOW");
-       break ;
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHASLOW: 
-       strcpy(particle, "NEUTRAL HA SLOW");
-       break ;
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDEMFAST:
-       strcpy(particle, "CHARGED EM FAST") ;
-       break ;
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDHAFAST:
-       strcpy(particle, "CHARGED HA FAST") ;
-       break ; 
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDEMSLOW:
-       strcpy(particle, "CHARGEDEMSLOW") ;
-       break ;
-      case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDHASLOW:
-       strcpy(particle, "CHARGED HA SLOW") ;
-       break ; 
-      }
-      
-      //    Int_t * primaries; 
-      //    Int_t nprimaries;
-      //    primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
-      
-      cout << setw(10) << particle << "  "
-          << setw(5) <<  rp->GetIndexInList() << " "  ;
-       //         << setw(4) <<  nprimaries << "  ";
-       //      for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
-       //      cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
-      cout << endl;     
+      message += "\n" ;
+      message += rp->Name().Data() ;  
+      message += " " ;
+      message += rp->GetIndexInList() ;  
+      message += " " ;
+      message += rp->GetType()  ;
     }
-    cout << "-------------------------------------------" << endl ;
   }
-  
+  Info("Print", message.Data() ) ; 
 }