]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSReconstructor.cxx
Updated IFC material distribution
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSReconstructor.cxx
index d799773288c0a4ee6523622b5190e2641769a4af..32120efb00c57acd58c9c0dd46b479b2821e83c0 100644 (file)
@@ -22,6 +22,8 @@
 // derived from STEER/AliReconstructor. 
 // 
 // --- ROOT system ---
+#include "TGeoManager.h"
+#include "TGeoMatrix.h"
 
 // --- Standard library ---
 
@@ -37,6 +39,7 @@
 #include "AliPHOSPIDv1.h"
 #include "AliPHOSTracker.h"
 #include "AliRawReader.h"
+#include "AliPHOSCalibData.h"
 #include "AliCDBEntry.h"
 #include "AliCDBManager.h"
 #include "AliPHOSTrigger.h"
 #include "AliPHOSTrackSegment.h"
 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
 #include "AliPHOSRecParticle.h"
-#include "AliPHOSRawDecoder.h"
-#include "AliPHOSRawDecoderv1.h"
-#include "AliPHOSRawDecoderv2.h"
+#include "AliPHOSRawFitterv0.h"
+#include "AliPHOSRawFitterv1.h"
+#include "AliPHOSRawFitterv2.h"
+#include "AliPHOSRawFitterv3.h"
 #include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
 
@@ -56,6 +60,8 @@ ClassImp(AliPHOSReconstructor)
 Bool_t AliPHOSReconstructor::fgDebug = kFALSE ; 
 TClonesArray*     AliPHOSReconstructor::fgDigitsArray = 0;   // Array of PHOS digits
 TObjArray*        AliPHOSReconstructor::fgEMCRecPoints = 0;   // Array of EMC rec.points
+AliPHOSCalibData * AliPHOSReconstructor::fgCalibData  = 0 ;
+
 
 //____________________________________________________________________________
 AliPHOSReconstructor::AliPHOSReconstructor() :
@@ -68,6 +74,12 @@ AliPHOSReconstructor::AliPHOSReconstructor() :
   fPID         = new AliPHOSPIDv1              (fGeom);
   fgDigitsArray = new TClonesArray("AliPHOSDigit",100);
   fgEMCRecPoints= new TObjArray(100) ;
+  if (!fgCalibData)
+    fgCalibData = new AliPHOSCalibData(-1); //use AliCDBManager's run number
+
+  AliInfo(Form("PHOS bad channel map contains %d bad channel(s).\n",
+               fgCalibData->GetNumOfEmcBadChannels()));
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -116,6 +128,8 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   else 
     fTSM->Clusters2TrackSegments("") ;
   
+  fPID->SetEnergyCorrectionOn(GetRecoParam()->GetEMCEnergyCorrectionOn());
+  
   fPID->SetInput(clustersTree, fTSM->GetTrackSegments()) ; 
   fPID->SetESD(esd) ; 
   if ( Debug() ) 
@@ -126,9 +140,6 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   TClonesArray *recParticles  = fPID->GetRecParticles();
   Int_t nOfRecParticles = recParticles->GetEntriesFast();
   
-  esd->SetNumberOfPHOSClusters(nOfRecParticles) ; 
-  esd->SetFirstPHOSCluster(esd->GetNumberOfCaloClusters()) ;
-  
   AliDebug(2,Form("%d rec. particles, option %s",nOfRecParticles,GetOption()));
   
   // Read digits array
@@ -223,10 +234,10 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   // Add to CaloCells only EMC digits with non-zero energy 
   for (Int_t idig = 0 ; idig < nDigits ; idig++) {
     const AliPHOSDigit * dig = (const AliPHOSDigit*)fgDigitsArray->At(idig);
-    if(dig->GetId() <= knEMC && dig->GetEnergy() > 0 ){
-      //printf("i %d; id %d; amp %f; time %e\n",
-      //idignew,dig->GetId(),dig->GetEnergy(), dig->GetTime());
-      phsCells.SetCell(idignew,dig->GetId(), dig->GetEnergy(), dig->GetTime());   
+    if(dig->GetId() <= knEMC && 
+       Calibrate(dig->GetEnergy(),dig->GetId()) > GetRecoParam()->GetEMCMinE() ){
+      phsCells.SetCell(idignew,dig->GetId(), Calibrate(dig->GetEnergy(),dig->GetId()),
+                                             CalibrateT(dig->GetTime(),dig->GetId()));   
       idignew++;
     }
   }
@@ -266,7 +277,7 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
       AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit *>(fgDigitsArray->At(digitsList[iCell]));
       absIdList[iCell] = (UShort_t)(digit->GetId());
       if (digit->GetEnergy() > 0)
-       fracList[iCell] = rpElist[iCell]/digit->GetEnergy();
+       fracList[iCell] = rpElist[iCell]/(Calibrate(digit->GetEnergy(),digit->GetId()));
       else
        fracList[iCell] = 0;
     }
@@ -291,8 +302,9 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     ec->SetM20(emcRP->GetM2z()) ;               //second moment M2z
     ec->SetNExMax(emcRP->GetNExMax());          //number of local maxima
     ec->SetEmcCpvDistance(ts->GetCpvDistance("r")); //Only radius, what about separate x,z????
+    ec->SetTrackDistance(ts->GetCpvDistance("x"),ts->GetCpvDistance("z")); 
     ec->SetClusterChi2(-1);                     //not yet implemented
-    ec->SetTOF(emcRP->GetTime()); //Time of flight
+    ec->SetTOF(emcRP->GetTime());               //Time of flight - already calibrated in EMCRecPoint
 
     //Cells contributing to clusters
     ec->SetNCells(cellMult);
@@ -305,15 +317,27 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     //Array of MC indeces
     TArrayI arrayPrim(primMult,primList);
     ec->AddLabels(arrayPrim);
-
-    //Array of tracks uncomment when available in future
-    //TArrayS arrayTrackMatched(1);// Only one track, temporal solution.
-    //arrayTrackMatched[0]= (Short_t)(matchedTrack[iClust]);
-    //ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
     
-    // add the track to the esd object
-
-    esd->AddCaloCluster(ec);
+    //Matched ESD track
+    TArrayI arrayTrackMatched(1);
+    arrayTrackMatched[0]= ts->GetTrackIndex();
+    ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
+    
+    Int_t index = esd->AddCaloCluster(ec);
+
+    //Set pointer to this cluster in ESD track
+    Int_t nt=esd->GetNumberOfTracks();
+    for (Int_t itr=0; itr<nt; itr++) {
+      AliESDtrack *esdTrack=esd->GetTrack(itr);
+      if(!esdTrack->IsPHOS())
+        continue ;
+      if(esdTrack->GetPHOScluster()==-recpart){ //we store negative cluster number
+        esdTrack->SetPHOScluster(index) ;
+//no garatie that only one track matched this cluster
+//      break ;
+      }
+    }
     delete ec;   
     delete [] fracList;
     delete [] absIdList;
@@ -321,6 +345,10 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   fgDigitsArray ->Delete();
   fgEMCRecPoints->Delete();
   recParticles  ->Delete();
+
+  //Store PHOS misalignment matrixes
+  FillMisalMatrixes(esd) ;
+
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -336,62 +364,142 @@ void  AliPHOSReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digits
   // Converts raw data to
   // PHOS digits
   // Works on a single-event basis
-
   rawReader->Reset() ; 
 
-  AliPHOSRawDecoder * dc ;
+  AliPHOSRawFitterv0 * fitter ;
 
   const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
 
-  AliAltroMapping *mapping[4];
-  for(Int_t i = 0; i < 4; i++) {
+  AliAltroMapping *mapping[20];
+  for(Int_t i = 0; i < 20; i++) {
     mapping[i] = (AliAltroMapping*)maps->At(i);
   }
 
-  if      (strcmp(GetRecoParam()->EMCDecoderVersion(),"v1")==0) 
-    dc=new AliPHOSRawDecoderv1(rawReader,mapping);
-  else if (strcmp(GetRecoParam()->EMCDecoderVersion(),"v2")==0) 
-    dc=new AliPHOSRawDecoderv2(rawReader,mapping);
+  if      (strcmp(GetRecoParam()->EMCFitterVersion(),"v1")==0) 
+    fitter=new AliPHOSRawFitterv1();
+  else if (strcmp(GetRecoParam()->EMCFitterVersion(),"v2")==0) 
+    fitter=new AliPHOSRawFitterv2();
+  else if (strcmp(GetRecoParam()->EMCFitterVersion(),"v3")==0) 
+    fitter=new AliPHOSRawFitterv3();
   else
-    dc=new AliPHOSRawDecoder(rawReader,mapping);
+    fitter=new AliPHOSRawFitterv0();
+
+  fitter->SubtractPedestals(GetRecoParam()->EMCSubtractPedestals());
+  fitter->SetAmpOffset     (GetRecoParam()->GetGlobalAltroOffset());
+  fitter->SetAmpThreshold  (GetRecoParam()->GetGlobalAltroThreshold());
 
-  dc->SubtractPedestals(GetRecoParam()->EMCSubtractPedestals());
-  
   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",1);
   digits->SetName("DIGITS");
   Int_t bufsize = 32000;
   digitsTree->Branch("PHOS", &digits, bufsize);
 
-  AliPHOSRawDigiProducer pr(GetRecoParam());
-  pr.MakeDigits(digits,dc);
+  AliPHOSRawDigiProducer rdp(rawReader,mapping);
 
-  delete dc ;
+  rdp.SetEmcMinAmp(GetRecoParam()->GetEMCRawDigitThreshold()); // in ADC
+  rdp.SetCpvMinAmp(GetRecoParam()->GetCPVMinE());
+  rdp.SetSampleQualityCut(GetRecoParam()->GetEMCSampleQualityCut());
+  rdp.MakeDigits(digits,fitter);
 
-  //!!!!for debug!!!
-/*
-  Int_t modMax=-111;
-  Int_t colMax=-111;
-  Int_t rowMax=-111;
-  Float_t eMax=-333;
-  //!!!for debug!!!
+  delete fitter ;
 
-  Int_t relId[4];
-  for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
-    AliPHOSDigit* digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(iDigit);
-    if(digit->GetEnergy()>eMax) {
-      fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(),relId);
-      eMax=digit->GetEnergy();
-      modMax=relId[0];
-      rowMax=relId[2];
-      colMax=relId[3];
+  if (AliLog::GetGlobalDebugLevel() == 1) {
+    Int_t modMax=-111;
+    Int_t colMax=-111;
+    Int_t rowMax=-111;
+    Float_t eMax=-333;
+    //!!!for debug!!!
+    
+    Int_t relId[4];
+    for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
+      AliPHOSDigit* digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(iDigit);
+      if(digit->GetEnergy()>eMax) {
+       fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(),relId);
+       eMax=digit->GetEnergy();
+       modMax=relId[0];
+       rowMax=relId[2];
+       colMax=relId[3];
+      }
     }
+    
+    AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n\n",
+                   modMax,colMax,rowMax,eMax));
   }
 
-  AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n\n",
-                 modMax,colMax,rowMax,eMax));
-*/
   digitsTree->Fill();
   digits->Delete();
   delete digits;
 }
+//==================================================================================
+Float_t AliPHOSReconstructor::Calibrate(Float_t amp, Int_t absId)const{
+  // Calibrate EMC digit, i.e. multiply its Amp by a factor read from CDB
+
+  const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
+
+  //Determine rel.position of the cell absolute ID
+  Int_t relId[4];
+  geom->AbsToRelNumbering(absId,relId);
+  Int_t module=relId[0];
+  Int_t row   =relId[2];
+  Int_t column=relId[3];
+  if(relId[1]){ //CPV
+    Float_t calibration = fgCalibData->GetADCchannelCpv(module,column,row);
+    return amp*calibration ;
+  }
+  else{ //EMC
+    Float_t calibration = fgCalibData->GetADCchannelEmc(module,column,row);
+    return amp*calibration ;
+  }
+}
+//==================================================================================
+Float_t AliPHOSReconstructor::CalibrateT(Float_t time, Int_t absId)const{
+  // Calibrate EMC digit, i.e. multiply its Amp by a factor read from CDB
+
+  const AliPHOSGeometry *geom = AliPHOSGeometry::GetInstance() ;
+
+  //Determine rel.position of the cell absolute ID
+  Int_t relId[4];
+  geom->AbsToRelNumbering(absId,relId);
+  Int_t module=relId[0];
+  Int_t row   =relId[2];
+  Int_t column=relId[3];
+  if(relId[1]){ //CPV
+    return 0. ;
+  }
+  else{ //EMC
+    time += fgCalibData->GetTimeShiftEmc(module,column,row);
+    return time ;
+  }
+}
+//==================================================================================
+void AliPHOSReconstructor::FillMisalMatrixes(AliESDEvent* esd)const{
+  //Store PHOS matrixes in ESD Header
+
+  //Check, if matrixes was already stored
+  for(Int_t mod=0 ;mod<5; mod++){
+    if(esd->GetPHOSMatrix(mod)!=0)
+      return ;
+  }
+
+  //Create and store matrixes
+  if(!gGeoManager){
+    AliError("Can not store misal. matrixes: no gGeoManager! \n") ;
+    return ;
+  }
+  //Note, that owner of copied marixes will be header
+  char path[255] ;
+  TGeoHMatrix * m ;
+  for(Int_t mod=0; mod<5; mod++){
+    sprintf(path,"/ALIC_1/PHOS_%d",mod+1) ; //In Geometry modules numbered 1,2,.,5
+    if (gGeoManager->cd(path)){
+      m = gGeoManager->GetCurrentMatrix() ;
+      esd->SetPHOSMatrix(new TGeoHMatrix(*m),mod) ;
+    }
+    else{
+      esd->SetPHOSMatrix(NULL,mod) ;
+    }
+  }
+
+}
+
+