]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSReconstructor.cxx
Updated histogram limits (PHOS energy)
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSReconstructor.cxx
index 667b408dab0bb50b8cbbdc304164d25cd8ca9137..e601566558fafa0b6ced82acae68cbcaecb461db 100644 (file)
 #include "AliPHOSPIDv1.h"
 #include "AliPHOSTracker.h"
 #include "AliRawReader.h"
+#include "AliCDBEntry.h"
+#include "AliCDBManager.h"
 #include "AliPHOSTrigger.h"
 #include "AliPHOSGeometry.h"
-#include "AliPHOSRecoParam.h"
-#include "AliPHOSRecoParamEmc.h"
-#include "AliPHOSRecoParamCpv.h"
 #include "AliPHOSDigit.h"
 #include "AliPHOSTrackSegment.h"
 #include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
 #include "AliPHOSRecParticle.h"
 #include "AliPHOSRawDecoder.h"
 #include "AliPHOSRawDecoderv1.h"
+#include "AliPHOSRawDecoderv2.h"
 #include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
 #include "AliPHOSPulseGenerator.h"
 
 ClassImp(AliPHOSReconstructor)
 
 Bool_t AliPHOSReconstructor::fgDebug = kFALSE ; 
-AliPHOSRecoParam* AliPHOSReconstructor::fgkRecoParamEmc =0;  // EMC rec. parameters
-AliPHOSRecoParam* AliPHOSReconstructor::fgkRecoParamCpv =0;  // CPV rec. parameters
+TClonesArray*     AliPHOSReconstructor::fgDigitsArray = 0;   // Array of PHOS digits
+TObjArray*        AliPHOSReconstructor::fgEMCRecPoints = 0;   // Array of EMC rec.points
 
 //____________________________________________________________________________
 AliPHOSReconstructor::AliPHOSReconstructor() :
-  fGeom(NULL)
+  fGeom(NULL),fClusterizer(NULL),fTSM(NULL),fPID(NULL)
 {
   // ctor
-
-  if (!fgkRecoParamEmc) {
-    AliWarning("The Reconstruction parameters for EMC nonitialized - Used default one");
-    fgkRecoParamEmc = AliPHOSRecoParamEmc::GetEmcDefaultParameters();
-  }
-
-  if (!fgkRecoParamCpv) {
-    AliWarning("The Reconstruction parameters for CPV nonitialized - Used default one");
-    fgkRecoParamCpv = AliPHOSRecoParamCpv::GetCpvDefaultParameters();
-  }
-
-  fGeom = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
+  fGeom        = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
+  fClusterizer = new AliPHOSClusterizerv1      (fGeom);
+  fTSM         = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1(fGeom);
+  fPID         = new AliPHOSPIDv1              (fGeom);
+  fgDigitsArray = new TClonesArray("AliPHOSDigit",100);
+  fgEMCRecPoints= new TObjArray(100) ;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -81,6 +75,11 @@ AliPHOSReconstructor::AliPHOSReconstructor() :
 {
   // dtor
   delete fGeom;
+  delete fClusterizer;
+  delete fTSM;
+  delete fPID;
+  delete fgDigitsArray;
+  delete fgEMCRecPoints;
 } 
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -91,13 +90,13 @@ void AliPHOSReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree) c
   // segment maker needs access to the AliESDEvent object to retrieve the tracks reconstructed by 
   // the global tracking.
 
-  AliPHOSClusterizerv1 clu(fGeom);
-  clu.SetInput(digitsTree);
-  clu.SetOutput(clustersTree);
+  fClusterizer->InitParameters();
+  fClusterizer->SetInput(digitsTree);
+  fClusterizer->SetOutput(clustersTree);
   if ( Debug() ) 
-    clu.Digits2Clusters("deb all") ; 
+    fClusterizer->Digits2Clusters("deb all") ; 
   else 
-    clu.Digits2Clusters("") ;
+    fClusterizer->Digits2Clusters("") ;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -108,31 +107,24 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   // then it creates AliESDtracks out of them and
   // write tracks to the ESD
 
-  AliPHOSTrackSegmentMaker *tsm = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1(fGeom);
-  AliPHOSPID               *pid = new AliPHOSPIDv1              (fGeom);
 
   // do current event; the loop over events is done by AliReconstruction::Run()
-  tsm->SetESD(esd) ; 
-  tsm->SetInput(clustersTree);
+  fTSM->SetESD(esd) ; 
+  fTSM->SetInput(clustersTree);
   if ( Debug() ) 
-    tsm->Clusters2TrackSegments("deb all") ;
+    fTSM->Clusters2TrackSegments("deb all") ;
   else 
-    tsm->Clusters2TrackSegments("") ;
+    fTSM->Clusters2TrackSegments("") ;
   
-  pid->SetInput(clustersTree, tsm->GetTrackSegments()) ; 
-  pid->SetESD(esd) ; 
+  fPID->SetInput(clustersTree, fTSM->GetTrackSegments()) ; 
+  fPID->SetESD(esd) ; 
   if ( Debug() ) 
-    pid->TrackSegments2RecParticles("deb all") ;
+    fPID->TrackSegments2RecParticles("deb all") ;
   else 
-    pid->TrackSegments2RecParticles("") ;
-
+    fPID->TrackSegments2RecParticles("") ;
 
-  // This function creates AliESDtracks from AliPHOSRecParticles
-  //         and
-  // writes them to the ESD
-
-  TClonesArray *recParticles  = pid->GetRecParticles();
-  Int_t nOfRecParticles = recParticles->GetEntries();
+  TClonesArray *recParticles  = fPID->GetRecParticles();
+  Int_t nOfRecParticles = recParticles->GetEntriesFast();
   
   esd->SetNumberOfPHOSClusters(nOfRecParticles) ; 
   esd->SetFirstPHOSCluster(esd->GetNumberOfCaloClusters()) ;
@@ -146,8 +138,7 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     AliError("can't get the branch with the PHOS digits !");
     return;
   }
-  TClonesArray *digitsArray    = new TClonesArray("AliPHOSDigit",100);
-  branch->SetAddress(&digitsArray);
+  branch->SetAddress(&fgDigitsArray);
   branch->GetEntry(0);
 
   // Get the clusters array
@@ -158,15 +149,15 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     return;
   }
 
-  TObjArray *emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
-  emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
+  emcbranch->SetAddress(&fgEMCRecPoints);
   emcbranch->GetEntry(0);
 
   //#########Calculate trigger and set trigger info###########
 
   AliPHOSTrigger tr ;
   //   tr.SetPatchSize(1);//create 4x4 patches
-  tr.Trigger();
+  tr.SetSimulation(kFALSE);
+  tr.Trigger(fgDigitsArray);
   
   Float_t maxAmp2x2  = tr.Get2x2MaxAmplitude();
   Float_t maxAmpnxn  = tr.GetnxnMaxAmplitude();
@@ -185,9 +176,10 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   AliDebug(2, Form("Trigger 4x4 max amp %f , out amp %f, SM %d, iphi %d, ieta %d",
                   maxAmpnxn, ampOutOfPatchnxn, iSMnxn,iCrystalPhinxn, iCrystalEtanxn));
 
-  Int_t iRelId2x2 []= {iSM2x2+1,0,iCrystalPhi2x2,iCrystalEta2x2};// PHOS modules in order to calculate AbsId need to be 1-5 not 0-4 as returns trigger.
+  // Attention! PHOS modules in order to calculate AbsId need to be 1-5 not 0-4 as returns trigger.
+  Int_t iRelId2x2 []= {iSM2x2+1,0,iCrystalPhi2x2,iCrystalEta2x2};
   Int_t iAbsId2x2 =-1;
-  Int_t iRelIdnxn []= {iSMnxn+1,0,iCrystalPhinxn,iCrystalEtanxn};// PHOS modules in order to calculate AbsId need to be 1-5 not 0-4 as returns trigger.
+  Int_t iRelIdnxn []= {iSMnxn+1,0,iCrystalPhinxn,iCrystalEtanxn};
   Int_t iAbsIdnxn =-1;
   TVector3    pos2x2(-1,-1,-1);
   TVector3    posnxn(-1,-1,-1);
@@ -219,7 +211,7 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   //############# Fill CaloCells ###########
   //########################################
 
-  Int_t nDigits = digitsArray->GetEntries();
+  Int_t nDigits = fgDigitsArray->GetEntries();
   Int_t idignew = 0 ;
   AliDebug(1,Form("%d digits",nDigits));
 
@@ -230,10 +222,10 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
 
   // Add to CaloCells only EMC digits with non-zero energy 
   for (Int_t idig = 0 ; idig < nDigits ; idig++) {
-    const AliPHOSDigit * dig = (const AliPHOSDigit*)digitsArray->At(idig);
-    if(dig->GetId() <= knEMC && dig->GetEnergy() > 0 ){
-      // printf("i %d; id %d; amp %f; time %f\n",
-      // idignew,dig->GetId(),dig->GetEnergy(), dig->GetTime());
+    const AliPHOSDigit * dig = (const AliPHOSDigit*)fgDigitsArray->At(idig);
+    if(dig->GetId() <= knEMC && dig->GetEnergy() > GetRecoParam()->GetEMCMinE() ){
+      //printf("i %d; id %d; amp %f; time %e\n",
+      //idignew,dig->GetId(),dig->GetEnergy(), dig->GetTime());
       phsCells.SetCell(idignew,dig->GetId(), dig->GetEnergy(), dig->GetTime());   
       idignew++;
     }
@@ -250,10 +242,10 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     if (Debug()) 
       rp->Print();
     // Get track segment and EMC rec.point associated with this rec.particle
-    AliPHOSTrackSegment *ts    = static_cast<AliPHOSTrackSegment *>(tsm->GetTrackSegments()
+    AliPHOSTrackSegment *ts    = static_cast<AliPHOSTrackSegment *>(fTSM->GetTrackSegments()
                                                                    ->At(rp->GetPHOSTSIndex()));
 
-    AliPHOSEmcRecPoint  *emcRP = static_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>(emcRecPoints->At(ts->GetEmcIndex()));
+    AliPHOSEmcRecPoint  *emcRP = static_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>(fgEMCRecPoints->At(ts->GetEmcIndex()));
     AliESDCaloCluster   *ec    = new AliESDCaloCluster() ; 
     
     Float_t xyz[3];
@@ -271,7 +263,7 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     Double_t *fracList   = new Double_t[cellMult];
 
     for (Int_t iCell=0; iCell<cellMult; iCell++) {
-      AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit *>(digitsArray->At(digitsList[iCell]));
+      AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit *>(fgDigitsArray->At(digitsList[iCell]));
       absIdList[iCell] = (UShort_t)(digit->GetId());
       if (digit->GetEnergy() > 0)
        fracList[iCell] = rpElist[iCell]/digit->GetEnergy();
@@ -283,10 +275,16 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     Int_t  primMult  = 0;
     Int_t *primList =  emcRP->GetPrimaries(primMult);
 
+    Float_t energy;
+    if (GetRecoParam()->EMCEcore2ESD())
+      energy = emcRP->GetCoreEnergy();
+    else
+      energy = rp->Energy();
+
     // fills the ESDCaloCluster
     ec->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kPHOSCluster);
     ec->SetPosition(xyz);                       //rec.point position in MARS
-    ec->SetE(rp->Energy());                     //total particle energy
+    ec->SetE(energy);                           //total or core particle energy
     ec->SetClusterDisp(emcRP->GetDispersion()); //cluster dispersion
     ec->SetPid(rp->GetPID()) ;                  //array of particle identification
     ec->SetM02(emcRP->GetM2x()) ;               //second moment M2x
@@ -294,8 +292,8 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     ec->SetNExMax(emcRP->GetNExMax());          //number of local maxima
     ec->SetEmcCpvDistance(ts->GetCpvDistance("r")); //Only radius, what about separate x,z????
     ec->SetClusterChi2(-1);                     //not yet implemented
-    ec->SetM11(-1) ;                            //not yet implemented
+    ec->SetTOF(emcRP->GetTime()); //Time of flight
+
     //Cells contributing to clusters
     ec->SetNCells(cellMult);
     ec->SetCellsAbsId(absIdList);
@@ -307,23 +305,20 @@ void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     //Array of MC indeces
     TArrayI arrayPrim(primMult,primList);
     ec->AddLabels(arrayPrim);
-
-    //Array of tracks uncomment when available in future
-    //TArrayS arrayTrackMatched(1);// Only one track, temporal solution.
-    //arrayTrackMatched[0]= (Short_t)(matchedTrack[iClust]);
-    //ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
     
-    // add the track to the esd object
-
+    //Matched ESD track
+    TArrayI arrayTrackMatched(1);
+    arrayTrackMatched[0]= ts->GetTrackIndex();
+    ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
+    
     esd->AddCaloCluster(ec);
     delete ec;   
+    delete [] fracList;
+    delete [] absIdList;
   }
-  digitsArray ->Delete();
-  delete digitsArray;
-  emcRecPoints->Delete();
-  delete emcRecPoints;
-  delete tsm;
-  delete pid;
+  fgDigitsArray ->Delete();
+  fgEMCRecPoints->Delete();
+  recParticles  ->Delete();
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -339,12 +334,11 @@ void  AliPHOSReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digits
   // Converts raw data to
   // PHOS digits
   // Works on a single-event basis
-
   rawReader->Reset() ; 
 
   AliPHOSRawDecoder * dc ;
 
-  const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParamEmc::GetMappings();
+  const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParam::GetMappings();
   if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
 
   AliAltroMapping *mapping[4];
@@ -352,58 +346,27 @@ void  AliPHOSReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digits
     mapping[i] = (AliAltroMapping*)maps->At(i);
   }
 
-  if(strcmp(fgkRecoParamEmc->DecoderVersion(),"v1")==0) 
+  if      (strcmp(GetRecoParam()->EMCDecoderVersion(),"v1")==0) 
     dc=new AliPHOSRawDecoderv1(rawReader,mapping);
+  else if (strcmp(GetRecoParam()->EMCDecoderVersion(),"v2")==0) 
+    dc=new AliPHOSRawDecoderv2(rawReader,mapping);
   else
     dc=new AliPHOSRawDecoder(rawReader,mapping);
 
-  TString option = GetOption();
-  if (option.Contains("OldRCUFormat"))
-    dc->SetOldRCUFormat(kTRUE);
-  else
-    dc->SetOldRCUFormat(kFALSE);
-  
-  dc->SubtractPedestals(fgkRecoParamEmc->SubtractPedestals());
+  dc->SubtractPedestals(GetRecoParam()->EMCSubtractPedestals());
   
   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",1);
   digits->SetName("DIGITS");
   Int_t bufsize = 32000;
   digitsTree->Branch("PHOS", &digits, bufsize);
 
-  AliPHOSRawDigiProducer pr;
+  AliPHOSRawDigiProducer pr(GetRecoParam());
   pr.MakeDigits(digits,dc);
 
   delete dc ;
 
-  //ADC counts -> GeV
-  if(strcmp(fgkRecoParamEmc->DecoderVersion(),"v1")==0){ //"Energy" calculated as fit
-    for(Int_t i=0; i<digits->GetEntries(); i++) {
-      AliPHOSDigit* digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(i);
-      digit->SetEnergy(digit->GetEnergy()*0.005); //We assume here 5 MeV/ADC channel
-      digit->SetTime(digit->GetTime()*1.e-7) ;    //Here we assume sample step==100 ns TO BE FIXED!!!!!!!!!!!!!
-    }
-  }
-  else{ //Digits energy calculated as maximal energy
-    for(Int_t i=0; i<digits->GetEntries(); i++) {
-      AliPHOSDigit* digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(i);
-      digit->SetEnergy(digit->GetEnergy()/AliPHOSPulseGenerator::GeV2ADC());
-    }
-  }
-  
-  // Clean up digits below the noise threshold
-  // Assuming the digit noise to be 4 MeV, we suppress digits within
-  // 3-sigma of the noise.
-  // This parameter should be passed via AliPHOSRecoParamEmc later
-
-  const Double_t emcDigitThreshold = 0.012;
-  for(Int_t i=0; i<digits->GetEntries(); i++) {
-    AliPHOSDigit* digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(i);
-    if(digit->GetEnergy() < emcDigitThreshold)
-      digits->RemoveAt(i) ;
-  }
-  digits->Compress() ;  
-
   //!!!!for debug!!!
+/*
   Int_t modMax=-111;
   Int_t colMax=-111;
   Int_t rowMax=-111;
@@ -424,7 +387,7 @@ void  AliPHOSReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digits
 
   AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n\n",
                  modMax,colMax,rowMax,eMax));
-
+*/
   digitsTree->Fill();
   digits->Delete();
   delete digits;