]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PWGJE/EMCALJetTasks/AliJetResponseMaker.cxx
Using detector quality flag (taken from ALICE logbook) to decide whether to rpodcue...
[u/mrichter/AliRoot.git] / PWGJE / EMCALJetTasks / AliJetResponseMaker.cxx
index fe1f2df5697cc631df6e80526df4b096eb0422e7..b8731048df988fe2dc7cac64baeec3d584b56f62 100644 (file)
 #include "AliLog.h"
 #include "AliRhoParameter.h"
 #include "AliNamedArrayI.h"
+#include "AliJetContainer.h"
+#include "AliParticleContainer.h"
+#include "AliClusterContainer.h"
 
 ClassImp(AliJetResponseMaker)
 
 //________________________________________________________________________
 AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker() : 
   AliAnalysisTaskEmcalJet("AliJetResponseMaker", kTRUE),
-  fTracks2Name(""),
-  fCalo2Name(""),
-  fJets2Name(""),
-  fRho2Name(""),
-  fJet2Radius(0.4),
-  fJet2AreaCut(-1),
-  fPtBiasJet2Track(0),
-  fPtBiasJet2Clus(0),
-  fJet2MinEta(-999),
-  fJet2MaxEta(-999),
-  fJet2MinPhi(-999),
-  fJet2MaxPhi(-999),
-  fMaxClusterPt2(1000),
-  fMaxTrackPt2(1000),
-  fAreCollections1MC(kFALSE),  
-  fAreCollections2MC(kTRUE),
   fMatching(kNoMatching),
   fMatchingPar1(0),
   fMatchingPar2(0),
@@ -50,22 +37,12 @@ AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker() :
   fDeltaEtaDeltaPhiAxis(0),
   fNEFAxis(0),
   fZAxis(0),
-  fDoJet2Histogram(0),
-  fTracks2(0),
-  fCaloClusters2(0),
-  fJets2(0),
-  fRho2(0),
-  fRho2Val(0),
-  fTracks2Map(0),
-  fHistLeadingJets1PtArea(0),
-  fHistLeadingJets1CorrPtArea(0),
-  fHistLeadingJets2PtArea(0),
-  fHistLeadingJets2CorrPtArea(0),
-  fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance(0),
-  fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance(0),
+  fIsJet1Rho(kFALSE),
+  fIsJet2Rho(kFALSE),
+  fHistRejectionReason1(0),
+  fHistRejectionReason2(0),
   fHistJets1(0),
   fHistJets2(0),
-  fHistJets2Acceptance(0),
   fHistMatching(0),
   fHistJets1PhiEta(0),
   fHistJets1PtArea(0),
@@ -76,9 +53,6 @@ AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker() :
   fHistJets2PhiEta(0),
   fHistJets2PtArea(0),
   fHistJets2CorrPtArea(0),
-  fHistJets2PhiEtaAcceptance(0),
-  fHistJets2PtAreaAcceptance(0),
-  fHistJets2CorrPtAreaAcceptance(0),
   fHistJets2NEFvsPt(0),
   fHistJets2CEFvsCEFPt(0),
   fHistJets2ZvsPt(0),
@@ -134,22 +108,6 @@ AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker() :
 //________________________________________________________________________
 AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker(const char *name) : 
   AliAnalysisTaskEmcalJet(name, kTRUE),
-  fTracks2Name("MCParticles"),
-  fCalo2Name(""),
-  fJets2Name("MCJets"),
-  fRho2Name(""),
-  fJet2Radius(0.4),
-  fJet2AreaCut(-1),
-  fPtBiasJet2Track(0),
-  fPtBiasJet2Clus(0),
-  fJet2MinEta(-999),
-  fJet2MaxEta(-999),
-  fJet2MinPhi(-999),
-  fJet2MaxPhi(-999),
-  fMaxClusterPt2(1000),
-  fMaxTrackPt2(1000),
-  fAreCollections1MC(kFALSE),  
-  fAreCollections2MC(kTRUE),
   fMatching(kNoMatching),
   fMatchingPar1(0),
   fMatchingPar2(0),
@@ -160,22 +118,12 @@ AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker(const char *name) :
   fDeltaEtaDeltaPhiAxis(0),
   fNEFAxis(0),
   fZAxis(0),
-  fDoJet2Histogram(0),
-  fTracks2(0),
-  fCaloClusters2(0),
-  fJets2(0),
-  fRho2(0),
-  fRho2Val(0),
-  fTracks2Map(0),
-  fHistLeadingJets1PtArea(0),
-  fHistLeadingJets1CorrPtArea(0),
-  fHistLeadingJets2PtArea(0),
-  fHistLeadingJets2CorrPtArea(0),
-  fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance(0),
-  fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance(0),
+  fIsJet1Rho(kFALSE),
+  fIsJet2Rho(kFALSE),
+  fHistRejectionReason1(0),
+  fHistRejectionReason2(0),
   fHistJets1(0),
   fHistJets2(0),
-  fHistJets2Acceptance(0),
   fHistMatching(0),
   fHistJets1PhiEta(0),
   fHistJets1PtArea(0),
@@ -186,9 +134,6 @@ AliJetResponseMaker::AliJetResponseMaker(const char *name) :
   fHistJets2PhiEta(0),
   fHistJets2PtArea(0),
   fHistJets2CorrPtArea(0),
-  fHistJets2PhiEtaAcceptance(0),
-  fHistJets2PtAreaAcceptance(0),
-  fHistJets2CorrPtAreaAcceptance(0),
   fHistJets2NEFvsPt(0),
   fHistJets2CEFvsCEFPt(0),
   fHistJets2ZvsPt(0),
@@ -264,7 +209,7 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTH2()
   fHistJets1PtArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
   fOutput->Add(fHistJets1PtArea);
  
-  if (!fRhoName.IsNull()) {
+  if (fIsJet1Rho) {
     fHistJets1CorrPtArea = new TH2F("fHistJets1CorrPtArea", "fHistJets1CorrPtArea", 
                                    fNbins/2, 0, 1.5, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
     fHistJets1CorrPtArea->GetXaxis()->SetTitle("area");
@@ -304,7 +249,7 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTH2()
   fHistJets2PtArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
   fOutput->Add(fHistJets2PtArea);
 
-  if (!fRho2Name.IsNull()) {
+  if (fIsJet2Rho) {
     fHistJets2CorrPtArea = new TH2F("fHistJets2CorrPtArea", "fHistJets2CorrPtArea", 
                                    fNbins/2, 0, 1.5, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
     fHistJets2CorrPtArea->GetXaxis()->SetTitle("area");
@@ -313,27 +258,6 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTH2()
     fOutput->Add(fHistJets2CorrPtArea);
   }
 
-  fHistJets2PhiEtaAcceptance = new TH2F("fHistJets2PhiEtaAcceptance", "fHistJets2PhiEtaAcceptance", 40, -1, 1, 40, 0, TMath::Pi()*2);
-  fHistJets2PhiEtaAcceptance->GetXaxis()->SetTitle("#eta");
-  fHistJets2PhiEtaAcceptance->GetYaxis()->SetTitle("#phi");
-  fOutput->Add(fHistJets2PhiEtaAcceptance);
-
-  fHistJets2PtAreaAcceptance = new TH2F("fHistJets2PtAreaAcceptance", "fHistJets2PtAreaAcceptance", 
-                                       fNbins/2, 0, 1.5, fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt);
-  fHistJets2PtAreaAcceptance->GetXaxis()->SetTitle("area");
-  fHistJets2PtAreaAcceptance->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2} (GeV/c)");
-  fHistJets2PtAreaAcceptance->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-  fOutput->Add(fHistJets2PtAreaAcceptance);
-
-  if (!fRho2Name.IsNull()) {
-    fHistJets2CorrPtAreaAcceptance = new TH2F("fHistJets2CorrPtAreaAcceptance", "fHistJets2CorrPtAreaAcceptance", 
-                                             fNbins/2, 0, 1.5, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
-    fHistJets2CorrPtAreaAcceptance->GetXaxis()->SetTitle("area");
-    fHistJets2CorrPtAreaAcceptance->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2}^{corr} (GeV/c)");
-    fHistJets2CorrPtAreaAcceptance->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-    fOutput->Add(fHistJets2CorrPtAreaAcceptance);
-  }
-
   fHistJets2ZvsPt = new TH2F("fHistJets2ZvsPt", "fHistJets2ZvsPt", 120, 0, 1.2, fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt);
   fHistJets2ZvsPt->GetXaxis()->SetTitle("Z");
   fHistJets2ZvsPt->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2} (GeV/c)");
@@ -490,8 +414,8 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTH2()
   fHistJet1PtvsJet2Pt->GetZaxis()->SetTitle("counts");
   fOutput->Add(fHistJet1PtvsJet2Pt);
 
-  if (!fRhoName.IsNull() || !fRho2Name.IsNull()) {
-    if (fRhoName.IsNull()
+  if (fIsJet1Rho || fIsJet2Rho) {
+    if (!fIsJet1Rho
       fHistDeltaCorrPtvsJet1CorrPt = new TH2F("fHistDeltaCorrPtvsJet1CorrPt", "fHistDeltaCorrPtvsJet1CorrPt", 
                                              fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
     else
@@ -503,7 +427,7 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTH2()
     fHistDeltaCorrPtvsJet1CorrPt->GetZaxis()->SetTitle("counts");
     fOutput->Add(fHistDeltaCorrPtvsJet1CorrPt);
 
-    if (fRho2Name.IsNull()
+    if (!fIsJet2Rho
       fHistDeltaCorrPtvsJet2CorrPt = new TH2F("fHistDeltaCorrPtvsJet2CorrPt", "fHistDeltaCorrPtvsJet2CorrPt", 
                                              fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);                                         
     else
@@ -571,10 +495,10 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTH2()
     fHistDeltaCorrPtvsDeltaArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
     fOutput->Add(fHistDeltaCorrPtvsDeltaArea);
     
-    if (fRhoName.IsNull()
+    if (!fIsJet1Rho
       fHistJet1CorrPtvsJet2CorrPt = new TH2F("fHistJet1CorrPtvsJet2CorrPt", "fHistJet1CorrPtvsJet2CorrPt", 
                                             fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
-    else if (fRho2Name.IsNull()
+    else if (!fIsJet2Rho
       fHistJet1CorrPtvsJet2CorrPt = new TH2F("fHistJet1CorrPtvsJet2CorrPt", "fHistJet1CorrPtvsJet2CorrPt", 
                                             2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt, fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt);
     else
@@ -672,10 +596,10 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTHnSparse()
 {
   // Allocate THnSparse histograms.
 
-  TString title[20]= {""};
-  Int_t nbins[20]  = {0};
-  Double_t min[20] = {0.};
-  Double_t max[20] = {0.};
+  TString title[25]= {""};
+  Int_t nbins[25]  = {0};
+  Double_t min[25] = {0.};
+  Double_t max[25] = {0.};
   Int_t dim = 0;
 
   title[dim] = "#phi";
@@ -702,21 +626,31 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTHnSparse()
   max[dim] = 1.5;
   dim++;
 
-  title[dim] = "NEF";
-  nbins[dim] = fNbins/4;
-  min[dim] = 0;
-  max[dim] = 1.2;
-  dim++;
+  if (fNEFAxis) {
+    title[dim] = "NEF";
+    nbins[dim] = fNbins/4;
+    min[dim] = 0;
+    max[dim] = 1.2;
+    dim++;
+  }
 
-  title[dim] = "Z";
-  nbins[dim] = fNbins/4;
+  if (fZAxis) {
+    title[dim] = "Z";
+    nbins[dim] = fNbins/4;
+    min[dim] = 0;
+    max[dim] = 1.2;
+    dim++;
+  }
+
+  title[dim] = "p_{T,particle}^{leading} (GeV/c)";
+  nbins[dim] = 120;
   min[dim] = 0;
-  max[dim] = 1.2;
+  max[dim] = 120;
   dim++;
 
   Int_t dim1 = dim, dim2 = dim;
 
-  if (!fRhoName.IsNull()) {
+  if (fIsJet1Rho) {
     title[dim1] = "p_{T}^{corr}";
     nbins[dim1] = fNbins*2;
     min[dim1] = -250;
@@ -737,7 +671,7 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTHnSparse()
     fHistJets1->GetAxis(i)->SetTitle(title[i]);
   fOutput->Add(fHistJets1);
 
-  if (!fRho2Name.IsNull()) {
+  if (fIsJet2Rho) {
     title[dim2] = "p_{T}^{corr}";
     nbins[dim2] = fNbins*2;
     min[dim2] = -250;
@@ -745,17 +679,10 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTHnSparse()
     dim2++;
   }
 
-  if (fDoJet2Histogram) {
-    fHistJets2 = new THnSparseD("fHistJets2","fHistJets2",dim2,nbins,min,max);
-    for (Int_t i = 0; i < dim2; i++) 
-      fHistJets2->GetAxis(i)->SetTitle(title[i]);
-    fOutput->Add(fHistJets2);
-  }
-
-  fHistJets2Acceptance = new THnSparseD("fHistJets2Acceptance","fHistJets2Acceptance",dim2,nbins,min,max);
+  fHistJets2 = new THnSparseD("fHistJets2","fHistJets2",dim2,nbins,min,max);
   for (Int_t i = 0; i < dim2; i++) 
-    fHistJets2Acceptance->GetAxis(i)->SetTitle(title[i]);
-  fOutput->Add(fHistJets2Acceptance);
+    fHistJets2->GetAxis(i)->SetTitle(title[i]);
+  fOutput->Add(fHistJets2);
   
   // Matching
 
@@ -803,6 +730,18 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTHnSparse()
   max[dim] = 1.2;
   dim++;
 
+  title[dim] = "p_{T,particle,1}^{leading} (GeV/c)";
+  nbins[dim] = 120;
+  min[dim] = 0;
+  max[dim] = 120;
+  dim++;
+
+  title[dim] = "p_{T,particle,2}^{leading} (GeV/c)";
+  nbins[dim] = 120;
+  min[dim] = 0;
+  max[dim] = 120;
+  dim++;
+
   if (fDeltaPtAxis) {
     title[dim] = "#deltaA_{jet}";
     nbins[dim] = fNbins/2;
@@ -816,21 +755,21 @@ void AliJetResponseMaker::AllocateTHnSparse()
     max[dim] = 250;
     dim++;
   }
-  if (!fRhoName.IsNull()) {
+  if (fIsJet1Rho) {
     title[dim] = "p_{T,1}^{corr}";
     nbins[dim] = fNbins*2;
     min[dim] = -250;
     max[dim] = 250;
     dim++;
   }
-  if (!fRho2Name.IsNull()) {
+  if (fIsJet2Rho) {
     title[dim] = "p_{T,2}^{corr}";
     nbins[dim] = fNbins*2;
     min[dim] = -250;
     max[dim] = 250;
     dim++;
   }
-  if (fDeltaPtAxis && (!fRhoName.IsNull() || !fRho2Name.IsNull())) {
+  if (fDeltaPtAxis && (fIsJet1Rho || fIsJet2Rho)) {
     title[dim] = "#deltap_{T}^{corr}";
     nbins[dim] = fNbins*2;
     min[dim] = -250;
@@ -909,52 +848,29 @@ void AliJetResponseMaker::UserCreateOutputObjects()
 
   AliAnalysisTaskEmcalJet::UserCreateOutputObjects();
 
-  // Jets 1 histograms
-  fHistLeadingJets1PtArea = new TH2F("fHistLeadingJets1PtArea", "fHistLeadingJets1PtArea", 
-                                    fNbins/2, 0, 1, fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt);
-  fHistLeadingJets1PtArea->GetXaxis()->SetTitle("area");
-  fHistLeadingJets1PtArea->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,1} (GeV/c)");
-  fHistLeadingJets1PtArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-  fOutput->Add(fHistLeadingJets1PtArea);
-
-  if (!fRhoName.IsNull()) {
-    fHistLeadingJets1CorrPtArea = new TH2F("fHistLeadingJets1CorrPtArea", "fHistLeadingJets1CorrPtArea", 
-                                          fNbins/2, 0, 1, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
-    fHistLeadingJets1CorrPtArea->GetXaxis()->SetTitle("area");
-    fHistLeadingJets1CorrPtArea->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,1}^{corr} (GeV/c)");
-    fHistLeadingJets1CorrPtArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-    fOutput->Add(fHistLeadingJets1CorrPtArea);
-  }
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
 
-  fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance = new TH2F("fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance", "fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance", 
-                                              fNbins/2, 1, 2, fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt);
-  fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance->GetXaxis()->SetTitle("area");
-  fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2} (GeV/c)");
-  fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-  fOutput->Add(fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance);
-
-  fHistLeadingJets2PtArea = new TH2F("fHistLeadingJets2PtArea", "fHistLeadingJets2PtArea", 
-                                    fNbins/2, 0, 1, fNbins, fMinBinPt, fMaxBinPt);
-  fHistLeadingJets2PtArea->GetXaxis()->SetTitle("area");
-  fHistLeadingJets2PtArea->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2} (GeV/c)");
-  fHistLeadingJets2PtArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-  fOutput->Add(fHistLeadingJets2PtArea);
-
-  if (!fRho2Name.IsNull()) {
-    fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance = new TH2F("fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance", "fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance", 
-                                                    fNbins/2, 0, 1, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
-    fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance->GetXaxis()->SetTitle("area");
-    fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2}^{corr} (GeV/c)");
-    fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-    fOutput->Add(fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance);
-
-    fHistLeadingJets2CorrPtArea = new TH2F("fHistLeadingJets2CorrPtArea", "fHistLeadingJets2CorrPtArea", 
-                                          fNbins/2, 0, 1, 2*fNbins, -fMaxBinPt, fMaxBinPt);
-    fHistLeadingJets2CorrPtArea->GetXaxis()->SetTitle("area");
-    fHistLeadingJets2CorrPtArea->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,2}^{corr} (GeV/c)");
-    fHistLeadingJets2CorrPtArea->GetZaxis()->SetTitle("counts");
-    fOutput->Add(fHistLeadingJets2CorrPtArea);
-  }
+  if (!jets1 || !jets2) return;
+
+  if (jets1->GetRhoName().IsNull()) fIsJet1Rho = kFALSE;
+  else fIsJet1Rho = kTRUE;
+  if (jets2->GetRhoName().IsNull()) fIsJet2Rho = kFALSE;
+  else fIsJet2Rho = kTRUE;
+
+  fHistRejectionReason1 = new TH2F("fHistRejectionReason1", "fHistRejectionReason1", 32, 0, 32, 100, 0, 250);
+  fHistRejectionReason1->GetXaxis()->SetTitle("Rejection reason");
+  fHistRejectionReason1->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,jet} (GeV/c)");
+  fHistRejectionReason1->GetZaxis()->SetTitle("counts");
+  SetRejectionReasonLabels(fHistRejectionReason1->GetXaxis());
+  fOutput->Add(fHistRejectionReason1);
+
+  fHistRejectionReason2 = new TH2F("fHistRejectionReason2", "fHistRejectionReason2", 32, 0, 32, 100, 0, 250);
+  fHistRejectionReason2->GetXaxis()->SetTitle("Rejection reason");
+  fHistRejectionReason2->GetYaxis()->SetTitle("p_{T,jet} (GeV/c)");
+  fHistRejectionReason2->GetZaxis()->SetTitle("counts");
+  SetRejectionReasonLabels(fHistRejectionReason2->GetXaxis());
+  fOutput->Add(fHistRejectionReason2);
 
   if (fHistoType==0)
     AllocateTH2();
@@ -965,7 +881,7 @@ void AliJetResponseMaker::UserCreateOutputObjects()
 }
 
 //________________________________________________________________________
-void AliJetResponseMaker::FillJetHisto(Double_t Phi, Double_t Eta, Double_t Pt, Double_t A, Double_t NEF, Double_t Z, Double_t CorrPt, Double_t MCPt, Int_t Set)
+void AliJetResponseMaker::FillJetHisto(Double_t Phi, Double_t Eta, Double_t Pt, Double_t A, Double_t NEF, Double_t LeadingPt, Double_t CorrPt, Double_t MCPt, Int_t Set)
 {
   if (fHistoType==1) {
     THnSparse *histo = 0;
@@ -973,8 +889,6 @@ void AliJetResponseMaker::FillJetHisto(Double_t Phi, Double_t Eta, Double_t Pt,
       histo = fHistJets1;
     else if (Set==2)
       histo = fHistJets2;
-    else if (Set==3)
-      histo = fHistJets2Acceptance;
 
     if (!histo)
       return;
@@ -994,11 +908,13 @@ void AliJetResponseMaker::FillJetHisto(Double_t Phi, Double_t Eta, Double_t Pt,
       else if (title=="NEF")
        contents[i] = NEF;
       else if (title=="Z")
-       contents[i] = Z;
+       contents[i] = LeadingPt/Pt;
       else if (title=="p_{T}^{corr}")
        contents[i] = CorrPt;
       else if (title=="p_{T}^{MC}")
        contents[i] = MCPt;
+      else if (title=="p_{T,particle}^{leading} (GeV/c)")
+       contents[i] = LeadingPt;
       else 
        AliWarning(Form("Unable to fill dimension %s!",title.Data()));
     }
@@ -1009,26 +925,20 @@ void AliJetResponseMaker::FillJetHisto(Double_t Phi, Double_t Eta, Double_t Pt,
     if (Set == 1) {
       fHistJets1PtArea->Fill(A, Pt);
       fHistJets1PhiEta->Fill(Eta, Phi);
-      fHistJets1ZvsPt->Fill(Z, Pt);
+      fHistJets1ZvsPt->Fill(LeadingPt/Pt, Pt);
       fHistJets1NEFvsPt->Fill(NEF, Pt);
       fHistJets1CEFvsCEFPt->Fill(1-NEF, (1-NEF)*Pt);
-      if (!fRhoName.IsNull())
+      if (fIsJet1Rho)
        fHistJets1CorrPtArea->Fill(A, CorrPt);
     }
     else if (Set == 2) {
       fHistJets2PtArea->Fill(A, Pt);
       fHistJets2PhiEta->Fill(Eta, Phi);
-      if (!fRho2Name.IsNull())
-       fHistJets2CorrPtArea->Fill(A, CorrPt);
-    }
-    else if (Set == 3) {
-      fHistJets2PtAreaAcceptance->Fill(A, Pt);
-      fHistJets2PhiEtaAcceptance->Fill(Eta, Phi);
-      fHistJets2ZvsPt->Fill(Z, Pt);
+      fHistJets2ZvsPt->Fill(LeadingPt/Pt, Pt);
       fHistJets2NEFvsPt->Fill(NEF, Pt);
       fHistJets2CEFvsCEFPt->Fill(1-NEF, (1-NEF)*Pt);
-      if (!fRho2Name.IsNull())
-       fHistJets2CorrPtAreaAcceptance->Fill(A, CorrPt);
+      if (fIsJet2Rho)
+       fHistJets2CorrPtArea->Fill(A, CorrPt);
     }
   }
 }
@@ -1036,7 +946,7 @@ void AliJetResponseMaker::FillJetHisto(Double_t Phi, Double_t Eta, Double_t Pt,
 //________________________________________________________________________
 void AliJetResponseMaker::FillMatchingHistos(Double_t Pt1, Double_t Pt2, Double_t Eta1, Double_t Eta2, Double_t Phi1, Double_t Phi2, 
                                             Double_t A1, Double_t A2, Double_t d, Double_t CE1, Double_t CE2, Double_t CorrPt1, Double_t CorrPt2, 
-                                            Double_t MCPt1, Double_t NEF1, Double_t NEF2, Double_t Z1, Double_t Z2)
+                                            Double_t MCPt1, Double_t NEF1, Double_t NEF2, Double_t LeadingPt1, Double_t LeadingPt2)
 {
   if (fHistoType==1) {
     Double_t contents[20]={0};
@@ -1080,9 +990,13 @@ void AliJetResponseMaker::FillMatchingHistos(Double_t Pt1, Double_t Pt2, Double_
       else if (title=="NEF_{2}")
        contents[i] = NEF2;
       else if (title=="Z_{1}")
-       contents[i] = Z1;
+       contents[i] = LeadingPt1/Pt1;
       else if (title=="Z_{2}")
-       contents[i] = Z2;
+       contents[i] = LeadingPt2/Pt2;
+      else if (title=="p_{T,particle,1}^{leading} (GeV/c)")
+       contents[i] = LeadingPt1;
+      else if (title=="p_{T,particle,2}^{leading} (GeV/c)")
+       contents[i] = LeadingPt2;
       else 
        AliWarning(Form("Unable to fill dimension %s!",title.Data()));
     }
@@ -1123,7 +1037,7 @@ void AliJetResponseMaker::FillMatchingHistos(Double_t Pt1, Double_t Pt2, Double_
 
     fHistJet1PtvsJet2Pt->Fill(Pt1, Pt2);
 
-    if (!fRhoName.IsNull() || !fRho2Name.IsNull()) {
+    if (fIsJet1Rho || fIsJet2Rho) {
       Double_t dcorrpt = CorrPt1 - CorrPt2;
       fHistDeltaCorrPtvsJet1CorrPt->Fill(CorrPt1, dcorrpt);
       fHistDeltaCorrPtvsJet2CorrPt->Fill(CorrPt2, dcorrpt);
@@ -1155,129 +1069,20 @@ void AliJetResponseMaker::FillMatchingHistos(Double_t Pt1, Double_t Pt2, Double_
   }
 }
 
-//________________________________________________________________________
-Bool_t AliJetResponseMaker::AcceptJet(AliEmcalJet *jet) const
-{   
-  // Return true if jet is accepted.
-
-  if (jet->Pt() < fJetPtCut)
-    return kFALSE;
-  if (jet->Area() < fJetAreaCut)
-    return kFALSE;
-  if (jet->MCPt() < fMinJetMCPt)
-    return kFALSE;
-
-  return kTRUE;
-}
-
-//________________________________________________________________________
-Bool_t AliJetResponseMaker::AcceptBiasJet2(AliEmcalJet *jet) const
-{ 
-  // Accept jet with a bias.
-
-  if (fLeadingHadronType == 0) {
-    if (jet->MaxTrackPt() < fPtBiasJet2Track) return kFALSE;
-  }
-  else if (fLeadingHadronType == 1) {
-    if (jet->MaxClusterPt() < fPtBiasJet2Clus) return kFALSE;
-  }
-  else {
-    if (jet->MaxTrackPt() < fPtBiasJet2Track && jet->MaxClusterPt() < fPtBiasJet2Clus) return kFALSE;
-  }
-
-  return kTRUE;
-}
-
 //________________________________________________________________________
 void AliJetResponseMaker::ExecOnce()
 {
   // Execute once.
 
-  if (!fJets2Name.IsNull() && !fJets2) {
-    fJets2 = dynamic_cast<TClonesArray*>(InputEvent()->FindListObject(fJets2Name));
-    if (!fJets2) {
-      AliError(Form("%s: Could not retrieve jets2 %s!", GetName(), fJets2Name.Data()));
-      return;
-    }
-    else if (!fJets2->GetClass()->GetBaseClass("AliEmcalJet")) {
-      AliError(Form("%s: Collection %s does not contain AliEmcalJet objects!", GetName(), fJets2Name.Data())); 
-      fJets2 = 0;
-      return;
-    }
-  }
-
-  if (!fTracks2Name.IsNull() && !fTracks2) {
-    fTracks2 = dynamic_cast<TClonesArray*>(InputEvent()->FindListObject(fTracks2Name));
-    if (!fTracks2) {
-      AliError(Form("%s: Could not retrieve tracks2 %s!", GetName(), fTracks2Name.Data())); 
-      return;
-    }
-    else {
-      TClass *cl = fTracks2->GetClass();
-      if (!cl->GetBaseClass("AliVParticle") && !cl->GetBaseClass("AliEmcalParticle")) {
-       AliError(Form("%s: Collection %s does not contain AliVParticle nor AliEmcalParticle objects!", GetName(), fTracks2Name.Data())); 
-       fTracks2 = 0;
-       return;
-      }
-    }
-
-    if (fAreCollections2MC) {
-      fTracks2Map = dynamic_cast<AliNamedArrayI*>(InputEvent()->FindListObject(fTracks2Name + "_Map"));
-      // this is needed to map the MC labels with the indexes of the MC particle collection
-      // if teh map is not given, the MC labels are assumed to be consistent with the indexes (which is not the case if AliEmcalMCTrackSelector is used)
-      if (!fTracks2Map) {
-       AliWarning(Form("%s: Could not retrieve map for tracks2 %s! Will assume MC labels consistent with indexes...", GetName(), fTracks2Name.Data())); 
-       fTracks2Map = new AliNamedArrayI("tracksMap",9999);
-       for (Int_t i = 0; i < 9999; i++) {
-         fTracks2Map->AddAt(i,i);
-       }
-      }
-    }
-  }
+  AliAnalysisTaskEmcalJet::ExecOnce();
 
-  if (!fCalo2Name.IsNull() && !fCaloClusters2) {
-    fCaloClusters2 =  dynamic_cast<TClonesArray*>(InputEvent()->FindListObject(fCalo2Name));
-    if (!fCaloClusters2) {
-      AliError(Form("%s: Could not retrieve clusters %s!", GetName(), fCalo2Name.Data())); 
-      return;
-    } else {
-      TClass *cl = fCaloClusters2->GetClass();
-      if (!cl->GetBaseClass("AliVCluster") && !cl->GetBaseClass("AliEmcalParticle")) {
-       AliError(Form("%s: Collection %s does not contain AliVCluster nor AliEmcalParticle objects!", GetName(), fCalo2Name.Data())); 
-       fCaloClusters2 = 0;
-       return;
-      }
-    }
-  }
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
 
-  if (!fRho2Name.IsNull() && !fRho2) {
-    fRho2 = dynamic_cast<AliRhoParameter*>(InputEvent()->FindListObject(fRho2Name));
-    if (!fRho2) {
-      AliError(Form("%s: Could not retrieve rho %s!", GetName(), fRho2Name.Data()));
-      fInitialized = kFALSE;
-      return;
-    }
-  }
+  if (!jets1 || !jets1->GetArray() || !jets2 || !jets2->GetArray()) return;
 
-  if (fPercAreaCut >= 0) {
-    if (fJet2AreaCut >= 0)
-      AliInfo(Form("%s: jet 2 area cut will be calculated as a percentage of the average area, given value will be overwritten", GetName()));
-    fJet2AreaCut = fPercAreaCut * fJet2Radius * fJet2Radius * TMath::Pi();
-  }
-  if (fJet2AreaCut < 0)
-    fJet2AreaCut = 0;
-
-  if (fJet2MinEta == -999)
-    fJet2MinEta = fJetMinEta - fJetRadius;
-  if (fJet2MaxEta == -999)
-    fJet2MaxEta = fJetMaxEta + fJetRadius;
-  if (fJet2MinPhi == -999)
-    fJet2MinPhi = fJetMinPhi - fJetRadius;
-  if (fJet2MaxPhi == -999)
-    fJet2MaxPhi = fJetMaxPhi + fJetRadius;
-
-  if (fMatching == kMCLabel && (!fAreCollections2MC || fAreCollections1MC)) {
-    if (fAreCollections2MC == fAreCollections1MC) {
+  if (fMatching == kMCLabel && (!jets2->GetIsParticleLevel() || jets1->GetIsParticleLevel())) {
+    if (jets1->GetIsParticleLevel() == jets2->GetIsParticleLevel()) {
       AliWarning("Changing matching type from MC label to same collection...");
       fMatching = kSameCollections;
     }
@@ -1286,8 +1091,8 @@ void AliJetResponseMaker::ExecOnce()
       fMatching = kGeometrical;
     }
   }
-  else if (fMatching == kSameCollections && fAreCollections2MC != fAreCollections1MC) {
-    if (fAreCollections2MC && !fAreCollections1MC) {
+  else if (fMatching == kSameCollections && jets1->GetIsParticleLevel() != jets2->GetIsParticleLevel()) {
+    if (jets2->GetIsParticleLevel() && !jets1->GetIsParticleLevel()) {
       AliWarning("Changing matching type from same collection to MC label...");
       fMatching = kMCLabel;
     }
@@ -1296,22 +1101,6 @@ void AliJetResponseMaker::ExecOnce()
       fMatching = kGeometrical;
     }
   }
-
-  AliAnalysisTaskEmcalJet::ExecOnce();
-}
-
-//________________________________________________________________________
-Bool_t AliJetResponseMaker::RetrieveEventObjects()
-{
-  // Retrieve event objects.
-
-  if (!AliAnalysisTaskEmcalJet::RetrieveEventObjects())
-    return kFALSE;
-
-  if (fRho2)
-    fRho2Val = fRho2->GetVal();
-
-  return kTRUE;
 }
 
 //________________________________________________________________________
@@ -1328,123 +1117,61 @@ Bool_t AliJetResponseMaker::Run()
 //________________________________________________________________________
 Bool_t AliJetResponseMaker::DoJetMatching()
 {
-  DoJetLoop(kFALSE);
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
 
-  const Int_t nJets = fJets->GetEntriesFast();
+  if (!jets1 || !jets1->GetArray() || !jets2 || !jets2->GetArray()) return kFALSE;
 
-  for (Int_t i = 0; i < nJets; i++) {
+  DoJetLoop();
 
-    AliEmcalJet* jet1 = static_cast<AliEmcalJet*>(fJets->At(i));
+  AliEmcalJet* jet1 = 0;
 
-    if (!jet1) {
-      AliError(Form("Could not receive jet %d", i));
-      continue;
-    }  
+  jets1->ResetCurrentID();
+  while ((jet1 = jets1->GetNextJet())) {
 
-    if (!AcceptJet(jet1))
-      continue;
+    AliEmcalJet *jet2 = jet1->ClosestJet();
 
-    if (jet1->Eta() < fJetMinEta || jet1->Eta() > fJetMaxEta || jet1->Phi() < fJetMinPhi || jet1->Phi() > fJetMaxPhi)
-      continue;
+    if (!jet2) continue;
+    if (jet2->ClosestJet() != jet1) continue;
+    if (jet1->ClosestJetDistance() > fMatchingPar1 || jet2->ClosestJetDistance() > fMatchingPar2) continue;
 
-    if (jet1->ClosestJet() && jet1->ClosestJet()->ClosestJet() == jet1 && 
-       jet1->ClosestJetDistance() < fMatchingPar1 && jet1->ClosestJet()->ClosestJetDistance() < fMatchingPar2) {    // Matched jet found
-      jet1->SetMatchedToClosest(fMatching);
-      jet1->ClosestJet()->SetMatchedToClosest(fMatching);
-      AliDebug(2,Form("Found matching: jet1 pt = %f, eta = %f, phi = %f, jet2 pt = %f, eta = %f, phi = %f", 
-                     jet1->Pt(), jet1->Eta(), jet1->Phi(), 
-                     jet1->MatchedJet()->Pt(), jet1->MatchedJet()->Eta(), jet1->MatchedJet()->Phi()));
-    }
+    // Matched jet found
+    jet1->SetMatchedToClosest(fMatching);
+    jet2->SetMatchedToClosest(fMatching);
+    AliDebug(2,Form("Found matching: jet1 pt = %f, eta = %f, phi = %f, jet2 pt = %f, eta = %f, phi = %f", 
+                   jet1->Pt(), jet1->Eta(), jet1->Phi(), 
+                   jet2->Pt(), jet2->Eta(), jet2->Phi()));
   }
 
   return kTRUE;
 }
 
 //________________________________________________________________________
-void AliJetResponseMaker::DoJetLoop(Bool_t order)
+void AliJetResponseMaker::DoJetLoop()
 {
   // Do the jet loop.
 
-  TClonesArray *jets1 = 0;
-  TClonesArray *jets2 = 0;
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
 
-  if (order) {
-    jets1 = fJets2;
-    jets2 = fJets;
-  }
-  else {
-    jets1 = fJets;
-    jets2 = fJets2;
-  }
+  if (!jets1 || !jets1->GetArray() || !jets2 || !jets2->GetArray()) return;
 
-  Int_t nJets1 = jets1->GetEntriesFast();
-  Int_t nJets2 = jets2->GetEntriesFast();
+  AliEmcalJet* jet1 = 0;
+  AliEmcalJet* jet2 = 0;
 
-  for (Int_t j = 0; j < nJets2; j++) {
-      
-    AliEmcalJet* jet2 = static_cast<AliEmcalJet*>(jets2->At(j));
-      
-    if (!jet2) {
-      AliError(Form("Could not receive jet %d", j));
-      continue;
-    }
-
-    jet2->ResetMatching();
-
-
-    if (!AcceptJet(jet2))
-      continue;
-
-    if (jet2->Eta() < fJet2MinEta || jet2->Eta() > fJet2MaxEta || jet2->Phi() < fJet2MinPhi || jet2->Phi() > fJet2MaxPhi)
-      continue;
-  }
+  jets2->ResetCurrentID();
+  while ((jet2 = jets2->GetNextJet())) jet2->ResetMatching();
     
-  for (Int_t i = 0; i < nJets1; i++) {
-
-    AliEmcalJet* jet1 = static_cast<AliEmcalJet*>(jets1->At(i));
-
-    if (!jet1) {
-      AliError(Form("Could not receive jet %d", i));
-      continue;
-    }
-
+  jets1->ResetCurrentID();
+  while ((jet1 = jets1->GetNextJet())) {
     jet1->ResetMatching();
+    
+    if (jet1->MCPt() < fMinJetMCPt) continue;
 
-    if (!AcceptJet(jet1))
-      continue;
-
-    if (order) {
-     if (jet1->Eta() < fJet2MinEta || jet1->Eta() > fJet2MaxEta || jet1->Phi() < fJet2MinPhi || jet1->Phi() > fJet2MaxPhi)
-       continue;
-    }
-    else {
-      if (jet1->Eta() < fJetMinEta || jet1->Eta() > fJetMaxEta || jet1->Phi() < fJetMinPhi || jet1->Phi() > fJetMaxPhi)
-       continue;
-    }
-
-    for (Int_t j = 0; j < nJets2; j++) {
-      
-      AliEmcalJet* jet2 = static_cast<AliEmcalJet*>(jets2->At(j));
-      
-      if (!jet2) {
-       AliError(Form("Could not receive jet %d", j));
-       continue;
-      }
-      if (!AcceptJet(jet2))
-       continue;
-
-      if (order) {
-       if (jet2->Eta() < fJetMinEta || jet2->Eta() > fJetMaxEta || jet2->Phi() < fJetMinPhi || jet2->Phi() > fJetMaxPhi)
-         continue;
-      }
-      else {
-       if (jet2->Eta() < fJet2MinEta || jet2->Eta() > fJet2MaxEta || jet2->Phi() < fJet2MinPhi || jet2->Phi() > fJet2MaxPhi)
-         continue;
-      }
-
+    jets2->ResetCurrentID();
+    while ((jet2 = jets2->GetNextJet())) {
       SetMatchingLevel(jet1, jet2, fMatching);
     } // jet2 loop
-
   } // jet1 loop
 }
 
@@ -1459,52 +1186,69 @@ void AliJetResponseMaker::GetGeometricalMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, AliEmca
 //________________________________________________________________________
 void AliJetResponseMaker::GetMCLabelMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, AliEmcalJet *jet2, Double_t &d1, Double_t &d2) const
 { 
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
+
+  if (!jets1 || !jets1->GetArray() || !jets2 || !jets2->GetArray()) return;
+
+  AliParticleContainer *tracks1   = jets1->GetParticleContainer();
+  AliClusterContainer  *clusters1 = jets1->GetClusterContainer();
+  AliParticleContainer *tracks2   = jets2->GetParticleContainer();
+
   // d1 and d2 represent the matching level: 0 = maximum level of matching, 1 = the two jets are completely unrelated
   d1 = jet1->Pt();
   d2 = jet2->Pt();
   Double_t totalPt1 = d1; // the total pt of the reconstructed jet will be cleaned from the background
 
-  for (Int_t iTrack2 = 0; iTrack2 < jet2->GetNumberOfTracks(); iTrack2++) {
-    Bool_t track2Found = kFALSE;
-    Int_t index2 = jet2->TrackAt(iTrack2);
+  // remove completely tracks that are not MC particles (label == 0)
+  if (tracks1 && tracks1->GetArray()) {
     for (Int_t iTrack = 0; iTrack < jet1->GetNumberOfTracks(); iTrack++) {
-      AliVParticle *track = jet1->TrackAt(iTrack,fTracks);
+      AliVParticle *track = jet1->TrackAt(iTrack,tracks1->GetArray());
       if (!track) {
        AliWarning(Form("Could not find track %d!", iTrack));
        continue;
       }
+
       Int_t MClabel = TMath::Abs(track->GetLabel());
-      if (MClabel > fMCLabelShift)
-       MClabel -= fMCLabelShift;
-      Int_t index = -1;
-         
-      if (MClabel == 0) {// this is not a MC particle; remove it completely
-       AliDebug(3,Form("Track %d (pT = %f) is not a MC particle (MClabel = %d)!",iTrack,track->Pt(),MClabel));
-       totalPt1 -= track->Pt();
-       d1 -= track->Pt();
+      MClabel -= fMCLabelShift;
+      if (MClabel != 0) continue;
+
+      // this is not a MC particle; remove it completely
+      AliDebug(3,Form("Track %d (pT = %f) is not a MC particle (MClabel = %d)!",iTrack,track->Pt(),MClabel));
+      totalPt1 -= track->Pt();
+      d1 -= track->Pt();
+    }
+  }
+
+  // remove completely clusters that are not MC particles (label == 0)
+  if (fUseCellsToMatch && fCaloCells) { 
+    for (Int_t iClus = 0; iClus < jet1->GetNumberOfClusters(); iClus++) {
+      AliVCluster *clus = jet1->ClusterAt(iClus,clusters1->GetArray());
+      if (!clus) {
+       AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", iClus));
        continue;
       }
-      else if (MClabel < fTracks2Map->GetSize()) {
-       index = fTracks2Map->At(MClabel);
-      }
+      TLorentzVector part;
+      clus->GetMomentum(part, const_cast<Double_t*>(fVertex));
          
-      if (index < 0) {
-       AliDebug(2,Form("Track %d (pT = %f) does not have an associated MC particle (MClabel = %d)!",iTrack,track->Pt(),MClabel));
-       continue;
-      }
+      for (Int_t iCell = 0; iCell < clus->GetNCells(); iCell++) {
+       Int_t cellId = clus->GetCellAbsId(iCell);
+       Double_t cellFrac = clus->GetCellAmplitudeFraction(iCell);
 
-      if (index2 == index) { // found common particle
-       track2Found = kTRUE;
-       d1 -= track->Pt();
-       AliVParticle *MCpart = static_cast<AliVParticle*>(fTracks2->At(index2));
-       AliDebug(3,Form("Track %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f) is associated with the MC particle %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f)!",
-                       iTrack,track->Pt(),track->Eta(),track->Phi(),MClabel,MCpart->Pt(),MCpart->Eta(),MCpart->Phi()));
-       d2 -= MCpart->Pt();
-       break;
+       Int_t MClabel = TMath::Abs(fCaloCells->GetCellMCLabel(cellId));
+       MClabel -= fMCLabelShift;
+       if (MClabel != 0) continue;
+
+       // this is not a MC particle; remove it completely
+       AliDebug(3,Form("Cell %d (frac = %f) is not a MC particle (MClabel = %d)!",iCell,cellFrac,MClabel));
+       totalPt1 -= part.Pt() * cellFrac;
+       d1 -= part.Pt() * cellFrac;
       }
     }
+  }
+  else {
     for (Int_t iClus = 0; iClus < jet1->GetNumberOfClusters(); iClus++) {
-      AliVCluster *clus = jet1->ClusterAt(iClus,fCaloClusters);
+      AliVCluster *clus = jet1->ClusterAt(iClus,clusters1->GetArray());
       if (!clus) {
        AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", iClus));
        continue;
@@ -1512,75 +1256,132 @@ void AliJetResponseMaker::GetMCLabelMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, AliEmcalJet
       TLorentzVector part;
       clus->GetMomentum(part, const_cast<Double_t*>(fVertex));
          
-      if (fUseCellsToMatch && fCaloCells) { // if the cell colection is available, look for cells with a matched MC particle
+      Int_t MClabel = TMath::Abs(clus->GetLabel());
+      MClabel -= fMCLabelShift;
+      if (MClabel != 0) continue;
+
+      // this is not a MC particle; remove it completely
+      AliDebug(3,Form("Cluster %d (pT = %f) is not a MC particle (MClabel = %d)!",iClus,part.Pt(),MClabel));
+      totalPt1 -= part.Pt();
+      d1 -= part.Pt();
+    }
+  }
+
+  for (Int_t iTrack2 = 0; iTrack2 < jet2->GetNumberOfTracks(); iTrack2++) {
+    Bool_t track2Found = kFALSE;
+    Int_t index2 = jet2->TrackAt(iTrack2);
+
+    // now look for common particles in the track array
+    for (Int_t iTrack = 0; iTrack < jet1->GetNumberOfTracks(); iTrack++) {
+      AliVParticle *track = jet1->TrackAt(iTrack,tracks1->GetArray());
+      if (!track) {
+       AliWarning(Form("Could not find track %d!", iTrack));
+       continue;
+      }
+      Int_t MClabel = TMath::Abs(track->GetLabel());
+      MClabel -= fMCLabelShift;          
+      if (MClabel <= 0) continue;
+
+      Int_t index = -1;
+      index = tracks2->GetIndexFromLabel(MClabel);
+      if (index < 0) {
+       AliDebug(2,Form("Track %d (pT = %f) does not have an associated MC particle (MClabel = %d)!",iTrack,track->Pt(),MClabel));
+       continue;
+      }
+       
+      if (index2 != index) continue;
+      
+      // found common particle
+      d1 -= track->Pt();
+
+      if (!track2Found) {
+       AliVParticle *MCpart = tracks2->GetParticle(index2);
+       AliDebug(3,Form("Track %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f) is associated with the MC particle %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f)!",
+                       iTrack,track->Pt(),track->Eta(),track->Phi(),MClabel,MCpart->Pt(),MCpart->Eta(),MCpart->Phi()));
+       d2 -= MCpart->Pt();
+      }
+
+      track2Found = kTRUE;
+    }
+
+    // now look for common particles in the cluster array
+    if (fUseCellsToMatch && fCaloCells) { // if the cell colection is available, look for cells with a matched MC particle
+      for (Int_t iClus = 0; iClus < jet1->GetNumberOfClusters(); iClus++) {
+       AliVCluster *clus = jet1->ClusterAt(iClus,fCaloClusters);
+       if (!clus) {
+         AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", iClus));
+         continue;
+       }
+       TLorentzVector part;
+       clus->GetMomentum(part, const_cast<Double_t*>(fVertex));
+      
        for (Int_t iCell = 0; iCell < clus->GetNCells(); iCell++) {
          Int_t cellId = clus->GetCellAbsId(iCell);
          Double_t cellFrac = clus->GetCellAmplitudeFraction(iCell);
-
+       
          Int_t MClabel = TMath::Abs(fCaloCells->GetCellMCLabel(cellId));
-         if (MClabel > fMCLabelShift)
-           MClabel -= fMCLabelShift;
-         Int_t index = -1;
+         MClabel -= fMCLabelShift;
+         if (MClabel <= 0) continue;
          
-         if (MClabel == 0) {// this is not a MC particle; remove it completely
-           AliDebug(3,Form("Cell %d (frac = %f) is not a MC particle (MClabel = %d)!",iCell,cellFrac,MClabel));
-           totalPt1 -= part.Pt() * cellFrac;
-           d1 -= part.Pt() * cellFrac;
-           continue;
-         }
-         else if (MClabel < fTracks2Map->GetSize()) {
-           index = fTracks2Map->At(MClabel);
-         }
-
-         if (index < 0) {
+         Int_t index1 = -1;
+         index1 = tracks2->GetIndexFromLabel(MClabel);
+         if (index1 < 0) {
            AliDebug(3,Form("Cell %d (frac = %f) does not have an associated MC particle (MClabel = %d)!",iCell,cellFrac,MClabel));
            continue;
          }
-         if (index2 == index) { // found common particle
-           d1 -= part.Pt() * cellFrac;
-               
-           if (!track2Found) {// only if it is not already found among charged tracks (charged particles are most likely already found)
-             AliVParticle *MCpart = static_cast<AliVParticle*>(fTracks2->At(index2));
-             AliDebug(3,Form("Cell %d belonging to cluster %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f) is associated with the MC particle %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f)!",
-                             iCell,iClus,part.Pt(),part.Eta(),part.Phi(),MClabel,MCpart->Pt(),MCpart->Eta(),MCpart->Phi()));             
-             d2 -= MCpart->Pt() * cellFrac;
-           }
-           break;
+       
+         if (index2 != index1) continue;
+         
+         // found common particle
+         d1 -= part.Pt() * cellFrac;
+       
+         if (!track2Found) { // only if it is not already found among charged tracks (charged particles are most likely already found)
+           AliVParticle *MCpart = tracks2->GetParticle(index2);
+           AliDebug(3,Form("Cell %d belonging to cluster %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f) is associated with the MC particle %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f)!",
+                           iCell,iClus,part.Pt(),part.Eta(),part.Phi(),MClabel,MCpart->Pt(),MCpart->Eta(),MCpart->Phi()));               
+           d2 -= MCpart->Pt() * cellFrac;
          }
+
+         track2Found = kTRUE;
        }
       }
-      else { //otherwise look for the first contributor to the cluster, and if matched to a MC label remove it
-       Int_t MClabel = TMath::Abs(clus->GetLabel());
-       if (MClabel > fMCLabelShift)
-         MClabel -= fMCLabelShift;
-       Int_t index = -1;
-           
-       if (MClabel == 0) {// this is not a MC particle; remove it completely
-         AliDebug(3,Form("Cluster %d (pT = %f) is not a MC particle (MClabel = %d)!",iClus,part.Pt(),MClabel));
-         totalPt1 -= part.Pt();
-         d1 -= part.Pt();
+    }
+    else { //otherwise look for the first contributor to the cluster, and if matched to a MC label remove it
+      for (Int_t iClus = 0; iClus < jet1->GetNumberOfClusters(); iClus++) {
+       AliVCluster *clus = jet1->ClusterAt(iClus,fCaloClusters);
+       if (!clus) {
+         AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", iClus));
          continue;
        }
-       else if (MClabel < fTracks2Map->GetSize()) {
-         index = fTracks2Map->At(MClabel);
-       }
-        
+       TLorentzVector part;
+       clus->GetMomentum(part, const_cast<Double_t*>(fVertex));
+      
+       Int_t MClabel = TMath::Abs(clus->GetLabel());
+       MClabel -= fMCLabelShift;           
+       if (MClabel <= 0) continue;
+
+       Int_t index = -1;
+       index = tracks2->GetIndexFromLabel(MClabel);
+      
        if (index < 0) {
          AliDebug(3,Form("Cluster %d (pT = %f) does not have an associated MC particle (MClabel = %d)!",iClus,part.Pt(),MClabel));
          continue;
        }
-       if (index2 == index) { // found common particle
-         d1 -= part.Pt();
-
-         if (!track2Found) {// only if it is not already found among charged tracks (charged particles are most likely already found)
-           AliVParticle *MCpart = static_cast<AliVParticle*>(fTracks2->At(index2));
-           AliDebug(3,Form("Cluster %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f) is associated with the MC particle %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f)!",
-                           iClus,part.Pt(),part.Eta(),part.Phi(),MClabel,MCpart->Pt(),MCpart->Eta(),MCpart->Phi()));
-               
-           d2 -= MCpart->Pt();
-         }
-         break;
+
+       if (index2 != index) continue;
+      
+       // found common particle
+       d1 -= part.Pt();
+      
+       if (!track2Found) { // only if it is not already found among charged tracks (charged particles are most likely already found)
+         AliVParticle *MCpart = tracks2->GetParticle(index2);
+         AliDebug(3,Form("Cluster %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f) is associated with the MC particle %d (pT = %f, eta = %f, phi = %f)!",
+                         iClus,part.Pt(),part.Eta(),part.Phi(),MClabel,MCpart->Pt(),MCpart->Eta(),MCpart->Phi()));
+         
+         d2 -= MCpart->Pt();
        }
+
+       track2Found = kTRUE;
       }
     }
   }
@@ -1605,29 +1406,39 @@ void AliJetResponseMaker::GetMCLabelMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, AliEmcalJet
 //________________________________________________________________________
 void AliJetResponseMaker::GetSameCollectionsMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, AliEmcalJet *jet2, Double_t &d1, Double_t &d2) const
 { 
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
+
+  if (!jets1 || !jets1->GetArray() || !jets2 || !jets2->GetArray()) return;
+
+  AliParticleContainer *tracks1   = jets1->GetParticleContainer();
+  AliClusterContainer  *clusters1 = jets1->GetClusterContainer();
+  AliParticleContainer *tracks2   = jets2->GetParticleContainer();
+  AliClusterContainer  *clusters2 = jets2->GetClusterContainer();
+
   // d1 and d2 represent the matching level: 0 = maximum level of matching, 1 = the two jets are completely unrelated
   d1 = jet1->Pt();
   d2 = jet2->Pt();
 
-  if (fTracks && fTracks2) {
+  if (tracks1 && tracks2) {
 
     for (Int_t iTrack2 = 0; iTrack2 < jet2->GetNumberOfTracks(); iTrack2++) {
       Int_t index2 = jet2->TrackAt(iTrack2);
-      for (Int_t iTrack = 0; iTrack < jet1->GetNumberOfTracks(); iTrack++) {
-       Int_t index = jet1->TrackAt(iTrack);
-       if (index2 == index) { // found common particle
-         AliVParticle *part = static_cast<AliVParticle*>(fTracks->At(index));
-         if (!part) {
-           AliWarning(Form("Could not find track %d!", index));
+      for (Int_t iTrack1 = 0; iTrack1 < jet1->GetNumberOfTracks(); iTrack1++) {
+       Int_t index1 = jet1->TrackAt(iTrack1);
+       if (index2 == index1) { // found common particle
+         AliVParticle *part1 = tracks1->GetParticle(index1);
+         if (!part1) {
+           AliWarning(Form("Could not find track %d!", index1));
            continue;
          }
-         AliVParticle *part2 = static_cast<AliVParticle*>(fTracks2->At(index2));
+         AliVParticle *part2 = tracks2->GetParticle(index2);
          if (!part2) {
            AliWarning(Form("Could not find track %d!", index2));
            continue;
          }
 
-         d1 -= part->Pt();
+         d1 -= part1->Pt();
          d2 -= part2->Pt();
          break;
        }
@@ -1636,7 +1447,7 @@ void AliJetResponseMaker::GetSameCollectionsMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, Ali
 
   }
 
-  if (fCaloClusters && fCaloClusters2) {
+  if (clusters1 && clusters2) {
 
     if (fUseCellsToMatch) {
       const Int_t nClus1 = jet1->GetNumberOfClusters();
@@ -1648,7 +1459,7 @@ void AliJetResponseMaker::GetSameCollectionsMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, Ali
       Double_t ptClus1[nClus1];
       for (Int_t iClus1 = 0; iClus1 < nClus1; iClus1++) {
        Int_t index1 = jet1->ClusterAt(iClus1);
-       AliVCluster *clus1 =  static_cast<AliVCluster*>(fCaloClusters->At(index1));
+       AliVCluster *clus1 = clusters1->GetCluster(index1);
        if (!clus1) {
          AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", index1));
          ncells1[iClus1] = 0;
@@ -1676,7 +1487,7 @@ void AliJetResponseMaker::GetSameCollectionsMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, Ali
       Int_t sortedIndexes2[maxNcells2];
       for (Int_t iClus2 = 0; iClus2 < nClus2; iClus2++) {
        Int_t index2 = jet2->ClusterAt(iClus2);
-       AliVCluster *clus2 =  static_cast<AliVCluster*>(fCaloClusters2->At(index2));
+       AliVCluster *clus2 =  clusters2->GetCluster(index2);
        if (!clus2) {
          AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", index2));
          continue;
@@ -1719,24 +1530,24 @@ void AliJetResponseMaker::GetSameCollectionsMatchingLevel(AliEmcalJet *jet1, Ali
     else {
       for (Int_t iClus2 = 0; iClus2 < jet2->GetNumberOfClusters(); iClus2++) {
        Int_t index2 = jet2->ClusterAt(iClus2);
-       for (Int_t iClus = 0; iClus < jet1->GetNumberOfClusters(); iClus++) {
-         Int_t index = jet1->ClusterAt(iClus);
-         if (index2 == index) { // found common particle
-           AliVCluster *clus =  static_cast<AliVCluster*>(fCaloClusters->At(index));
-           if (!clus) {
-             AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", index));
+       for (Int_t iClus1 = 0; iClus1 < jet1->GetNumberOfClusters(); iClus1++) {
+         Int_t index1 = jet1->ClusterAt(iClus1);
+         if (index2 == index1) { // found common particle
+           AliVCluster *clus1 = clusters1->GetCluster(index1);
+           if (!clus1) {
+             AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", index1));
              continue;
            }
-           AliVCluster *clus2 =  static_cast<AliVCluster*>(fCaloClusters2->At(index2));
+           AliVCluster *clus2 =  clusters2->GetCluster(index2);
            if (!clus2) {
              AliWarning(Form("Could not find cluster %d!", index2));
              continue;
            }
-           TLorentzVector part, part2;
-           clus->GetMomentum(part, const_cast<Double_t*>(fVertex));
+           TLorentzVector part1, part2;
+           clus1->GetMomentum(part1, const_cast<Double_t*>(fVertex));
            clus2->GetMomentum(part2, const_cast<Double_t*>(fVertex));
            
-           d1 -= part.Pt();
+           d1 -= part1.Pt();
            d2 -= part2.Pt();
            break;
          }
@@ -1811,123 +1622,74 @@ Bool_t AliJetResponseMaker::FillHistograms()
 {
   // Fill histograms.
 
-  static Int_t indexes[9999] = {-1};
+  AliJetContainer *jets1 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(0));
+  AliJetContainer *jets2 = static_cast<AliJetContainer*>(fJetCollArray.At(1));
 
-  const Int_t nJets2 = GetSortedArray(indexes, fJets2, fRho2Val);
+  if (!jets1 || !jets1->GetArray() || !jets2 || !jets2->GetArray()) return kFALSE;
 
-  Int_t naccJets2 = 0;
-  Int_t naccJets2Acceptance = 0;
-
-  for (Int_t i = 0; i < nJets2; i++) {
-    AliDebug(2,Form("Processing jet (2) %d", indexes[i]));
+  AliEmcalJet* jet1 = 0;  
+  AliEmcalJet* jet2 = 0;
+  
+  jets2->ResetCurrentID();
+  while ((jet2 = jets2->GetNextJet())) {
 
-    AliEmcalJet* jet2 = static_cast<AliEmcalJet*>(fJets2->At(indexes[i]));
+    AliDebug(2,Form("Processing jet (2) %d", jets2->GetCurrentID()));
 
-    if (!jet2) {
-      AliError(Form("Could not receive jet2 %d", i));
-      continue;
-    }
+    if (jet2->Pt() < jets2->GetJetPtCut()) continue;
 
-    // Jet 2 cuts
-    if (!AcceptJet(jet2))
-      continue;
-    if (!AcceptBiasJet2(jet2))
-      continue;
-    if (jet2->Eta() < fJet2MinEta || jet2->Eta() > fJet2MaxEta || jet2->Phi() < fJet2MinPhi || jet2->Phi() > fJet2MaxPhi)
-      continue;
-    if (jet2->MaxTrackPt() > fMaxTrackPt2 || jet2->MaxClusterPt() > fMaxClusterPt2)
-      continue;
+    Double_t ptLeading2 = jets2->GetLeadingHadronPt(jet2);
+    Double_t corrpt2 = jet2->Pt() - jets2->GetRhoVal() * jet2->Area();
 
-    if (naccJets2 < fNLeadingJets) {
-      fHistLeadingJets2PtArea->Fill(jet2->Area(), jet2->Pt());
-      if (!fRho2Name.IsNull())
-       fHistLeadingJets2CorrPtArea->Fill(jet2->Area(), jet2->Pt() - fRho2Val * jet2->Area());
-    }
+    if (jets2->AcceptJet(jet2))
+      FillJetHisto(jet2->Phi(), jet2->Eta(), jet2->Pt(), jet2->Area(), jet2->NEF(), ptLeading2, 
+                  corrpt2, jet2->MCPt(), 2);
+    else
+      fHistRejectionReason2->Fill(jets2->GetRejectionReasonBitPosition(), jet2->Pt());
 
-    if (fDoJet2Histogram)
-      FillJetHisto(jet2->Phi(), jet2->Eta(), jet2->Pt(), jet2->Area(), jet2->NEF(), jet2->MaxPartPt()/jet2->Pt(), jet2->Pt() - fRho2Val * jet2->Area(), jet2->MCPt(), 2);
+    jet1 = jet2->MatchedJet();
 
-    naccJets2++;
+    if (!jet1) continue;
+    if (!jets1->AcceptJet(jet1)) continue;
+    if (jet1->MCPt() < fMinJetMCPt) continue;
 
-    // Verify also jet cuts 1 on jet 2
-    if (AcceptBiasJet(jet2) &&
-       (jet2->Eta() > fJetMinEta && jet2->Eta() < fJetMaxEta && jet2->Phi() > fJetMinPhi && jet2->Phi() < fJetMaxPhi)) {
-      
-      if (naccJets2Acceptance < fNLeadingJets) {
-       fHistLeadingJets2PtAreaAcceptance->Fill(jet2->Area(), jet2->Pt());
-       if (!fRho2Name.IsNull()) 
-         fHistLeadingJets2CorrPtAreaAcceptance->Fill(jet2->Area(), jet2->Pt() - fRho2Val * jet2->Area());
-      }
+    Double_t d=-1, ce1=-1, ce2=-1;
+    if (jet2->GetMatchingType() == kGeometrical) {
+      if (jets2->GetIsParticleLevel() && !jets1->GetIsParticleLevel()) // the other way around is not supported
+       GetMCLabelMatchingLevel(jet1, jet2, ce1, ce2);
+      else if (jets1->GetIsParticleLevel() == jets2->GetIsParticleLevel())
+       GetSameCollectionsMatchingLevel(jet1, jet2, ce1, ce2);
       
-      FillJetHisto(jet2->Phi(), jet2->Eta(), jet2->Pt(), jet2->Area(), jet2->NEF(), jet2->MaxPartPt()/jet2->Pt(), jet2->Pt() - fRho2Val * jet2->Area(), jet2->MCPt(), 3);
-      naccJets2Acceptance++;
+      d = jet2->ClosestJetDistance();
     }
+    else if (jet2->GetMatchingType() == kMCLabel || jet2->GetMatchingType() == kSameCollections) {
+      GetGeometricalMatchingLevel(jet1, jet2, d);
 
-    if (jet2->MatchedJet()) {
-
-      if (AcceptJet(jet2->MatchedJet()) &&
-         jet2->MatchedJet()->Eta() > fJetMinEta && jet2->MatchedJet()->Eta() < fJetMaxEta &&
-         jet2->MatchedJet()->Phi() > fJetMinPhi && jet2->MatchedJet()->Phi() < fJetMaxPhi &&
-         AcceptBiasJet(jet2->MatchedJet()) &&
-         jet2->MatchedJet()->MaxTrackPt() < fMaxTrackPt && jet2->MatchedJet()->MaxClusterPt() < fMaxClusterPt) {
-
-       Double_t d=-1, ce1=-1, ce2=-1;
-       if (jet2->GetMatchingType() == kGeometrical) {
-         if (fAreCollections2MC && !fAreCollections1MC) // the other way around is not supported
-           GetMCLabelMatchingLevel(jet2->MatchedJet(), jet2, ce1, ce2);
-         else if (fAreCollections1MC == fAreCollections2MC)
-           GetSameCollectionsMatchingLevel(jet2->MatchedJet(), jet2, ce1, ce2);
-
-         d = jet2->ClosestJetDistance();
-       }
-       else if (jet2->GetMatchingType() == kMCLabel || jet2->GetMatchingType() == kSameCollections) {
-         GetGeometricalMatchingLevel(jet2->MatchedJet(), jet2, d);
-
-         ce1 = jet2->MatchedJet()->ClosestJetDistance();
-         ce2 = jet2->ClosestJetDistance();
-       }
-
-       Double_t corrpt1 = jet2->MatchedJet()->Pt() - fRhoVal * jet2->MatchedJet()->Area();
-       Double_t corrpt2 = jet2->Pt() - fRho2Val * jet2->Area();
-
-       FillMatchingHistos(jet2->MatchedJet()->Pt(), jet2->Pt(), jet2->MatchedJet()->Eta(), jet2->Eta(), jet2->MatchedJet()->Phi(), jet2->Phi(), 
-                          jet2->MatchedJet()->Area(), jet2->Area(), d, ce1, ce2, corrpt1, corrpt2, jet2->MatchedJet()->MCPt(), 
-                          jet2->MatchedJet()->NEF(), jet2->NEF(), jet2->MatchedJet()->MaxPartPt()/jet2->MatchedJet()->Pt(), jet2->MaxPartPt()/jet2->Pt());
-      }
+      ce1 = jet1->ClosestJetDistance();
+      ce2 = jet2->ClosestJetDistance();
     }
-  }
-
-  const Int_t nJets1 = GetSortedArray(indexes, fJets, fRhoVal);
-
-  Int_t naccJets1 = 0;
 
-  for (Int_t i = 0; i < nJets1; i++) {
-    AliDebug(2,Form("Processing jet (1) %d", indexes[i]));
-    AliEmcalJet* jet1 = static_cast<AliEmcalJet*>(fJets->At(indexes[i]));
+    Double_t ptLeading1 = jets1->GetLeadingHadronPt(jet1);
+    Double_t corrpt1 = jet1->Pt() - jets1->GetRhoVal() * jet1->Area();
 
-    if (!jet1) {
-      AliError(Form("Could not receive jet %d", i));
-      continue;
-    }  
+    FillMatchingHistos(jet1->Pt(), jet2->Pt(), jet1->Eta(), jet2->Eta(), jet1->Phi(), jet2->Phi(), 
+                      jet1->Area(), jet2->Area(), d, ce1, ce2, corrpt1, corrpt2, jet1->MCPt(), 
+                      jet1->NEF(), jet2->NEF(), ptLeading1, ptLeading2);
+  }
 
-    if (!AcceptJet(jet1))
-      continue;
-    if (!AcceptBiasJet(jet1))
-      continue;
-    if (jet1->MaxTrackPt() > fMaxTrackPt || jet1->MaxClusterPt() > fMaxClusterPt)
+  jets1->ResetCurrentID();
+  while ((jet1 = jets1->GetNextJet())) {
+    if (!jets1->AcceptJet(jet1)) {
+      fHistRejectionReason1->Fill(jets1->GetRejectionReasonBitPosition(), jet1->Pt());
       continue;
-    if (jet1->Eta() < fJetMinEta || jet1->Eta() > fJetMaxEta || jet1->Phi() < fJetMinPhi || jet1->Phi() > fJetMaxPhi)
-      continue;
-
-    if (naccJets1 < fNLeadingJets){
-      fHistLeadingJets1PtArea->Fill(jet1->Area(), jet1->Pt());
-      if (!fRhoName.IsNull())
-       fHistLeadingJets1CorrPtArea->Fill(jet1->Area(), jet1->Pt() - fRhoVal * jet1->Area());
     }
+    if (jet1->MCPt() < fMinJetMCPt) continue;
+    AliDebug(2,Form("Processing jet (1) %d", jets1->GetCurrentID()));
 
-    FillJetHisto(jet1->Phi(), jet1->Eta(), jet1->Pt(), jet1->Area(), jet1->NEF(), jet1->MaxPartPt()/jet1->Pt(), jet1->Pt() - fRhoVal * jet1->Area(), jet1->MCPt(), 1);
-    naccJets1++;
-  }
+    Double_t ptLeading1 = jets1->GetLeadingHadronPt(jet1);
+    Double_t corrpt1 = jet1->Pt() - jets1->GetRhoVal() * jet1->Area();
 
+    FillJetHisto(jet1->Phi(), jet1->Eta(), jet1->Pt(), jet1->Area(), jet1->NEF(), ptLeading1, 
+                corrpt1, jet1->MCPt(), 1);
+  }
   return kTRUE;
 }