]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - RALICE/AliSignal.cxx
Removed dependence on AliTPC.
[u/mrichter/AliRoot.git] / RALICE / AliSignal.cxx
index baedd5a412e7f42411f83c03db64989c691a63a8..a74153cbaf931b537fabea37b7496cbd239bbf70 100644 (file)
 //
 // AliSignal q;    // In the example below a signal contains the
 //                 // following data : timing, ADC and dE/dx
-// q.SetName("TOF hit");
+// q.SetNameTitle("Hybrid","Test for multiple signal data");
 // q.SetPosition(pos,"car");
 // q.SetPositionErrors(err,"car");
 // signal=82.5; // e.g. signal time in ns
 // error=2.01;
 // offset=0.003;
+// q.SetSlotName("TOF");
 // q.SetSignal(signal,1);
 // q.SetSignalError(error,1);
 // q.SetOffset(offset,1);
 // signal=268.1; // e.g. ADC value of signal
 // error=3.75;
 // gain=120.78;
-// q.SetSignal(signal,2);
-// q.SetSignalError(error,2);
-// q.SetGain(gain,2);
+// // Addressing via name specification instead of index 
+// q.SetSlotName("ADC");
+// q.SetSignal(signal,"ADC");
+// q.SetSignalError(error,"ADC");
+// q.SetGain(gain,"ADC");
 // signal=23.7; // e.g. corresponding dE/dx value
 // error=0.48;
 // offset=0.2;
 // gain=150;
+// q.SetSlotName("dE/dx");
 // q.SetSignal(signal,3);
 // q.SetSignalError(error,3);
 // q.SetOffset(offset,3);
 // q.SetGain(gain,3);
 //
+// Float_t dedx=q.GetSignal("dE/dx");
+//
 //--- Author: Nick van Eijndhoven 23-jan-1999 UU-SAP Utrecht
 //- Modified: NvE $Date$ UU-SAP Utrecht
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
 #include "AliSignal.h"
+#include "AliTrack.h"
 #include "Riostream.h"
  
 ClassImp(AliSignal) // Class implementation to enable ROOT I/O
  
-AliSignal::AliSignal() : TObject(),AliPosition(),AliAttrib()
+AliSignal::AliSignal() : TNamed(),AliPosition(),AliAttrib()
 {
 // Creation of an AliSignal object and initialisation of parameters.
 // Several signal values (with errors) can be stored in different slots.
@@ -99,7 +106,8 @@ AliSignal::AliSignal() : TObject(),AliPosition(),AliAttrib()
  fSignals=0;
  fDsignals=0;
  fWaveforms=0;
- fName="Unspecified";
+ fLinks=0;
+ fDevice=0;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 AliSignal::~AliSignal()
@@ -120,15 +128,23 @@ AliSignal::~AliSignal()
   delete fWaveforms;
   fWaveforms=0;
  }
+ if (fLinks)
+ {
+  delete fLinks;
+  fLinks=0;
+ }
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-AliSignal::AliSignal(AliSignal& s) : TObject(s),AliPosition(s),AliAttrib(s)
+AliSignal::AliSignal(const AliSignal& s) : TNamed(s),AliPosition(s),AliAttrib(s)
 {
 // Copy constructor
  fSignals=0;
  fDsignals=0;
- fName=s.fName;
  fWaveforms=0;
+ fLinks=0;
+
+ // Don't copy the owning device pointer for the copy
+ fDevice=0;
 
  Int_t n=s.GetNvalues();
  Double_t val;
@@ -151,6 +167,19 @@ AliSignal::AliSignal(AliSignal& s) : TObject(s),AliPosition(s),AliAttrib(s)
   TH1F* hist=s.GetWaveform(k);
   if (hist) SetWaveform(hist,k); 
  }
+
+ TArrayI slotarr;
+ TArrayI posarr;
+ TObject* dum=0;
+ n=s.GetIndices(dum,slotarr,posarr);
+ Int_t slot,pos;
+ for (Int_t idx=0; idx<n; idx++)
+ {
+  slot=slotarr.At(idx);
+  pos=posarr.At(idx);
+  TObject* obj=s.GetLink(slot,pos);
+  if (obj) SetLink(obj,slot,pos); 
+ }
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::Reset(Int_t mode)
@@ -165,6 +194,11 @@ void AliSignal::Reset(Int_t mode)
 //
 // The default when invoking Reset() corresponds to mode=0.
 //
+// Note : In all cases the storage of the various links will be reset.
+//        The UniqueID, name and title will NOT be reset.
+//        In case the user wants to reset these attributes, this has to
+//        be done explicitly via the SET facilities. 
+//
 // The usage of mode=0 allows to re-use the allocated memory for new
 // signal (and error) values. This behaviour is preferable (i.e. faster)
 // in case the various signals always contain the same number of values
@@ -174,7 +208,8 @@ void AliSignal::Reset(Int_t mode)
 // signals have a variable number of values.
 //
 // For more specific actions see ResetPosition(), ResetSignals(),
-// DeleteSignals(), ResetGain(), ResetOffset() and DeleteCalibrations().
+// DeleteSignals(), ResetGain(), ResetOffset(), ResetLink(), ResetWaveform(),
+// DeleteWaveform() and DeleteCalibrations().
 //
 
  if (mode<0 || mode>1)
@@ -194,6 +229,9 @@ void AliSignal::Reset(Int_t mode)
   DeleteSignals();
   DeleteCalibrations();
  }
+
+ if (fLinks) fLinks->Reset();
+ fDevice=0;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::ResetSignals(Int_t mode)
@@ -268,17 +306,9 @@ void AliSignal::DeleteSignals(Int_t mode)
  DeleteWaveform(0);
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-void AliSignal::ResetPosition()
-{
-// Reset the position and corresponding errors to 0.
- Double_t r[3]={0,0,0};
- SetPosition(r,"sph");
- SetErrors(r,"car");
-}
-///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,Int_t j)
 {
-// Store value in the j-th (default j=1) signal slot.
+// Store signal value for the j-th (default j=1) slot.
 // Note : The first signal slot is at j=1.
 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
 // slots for signal values, the number of reserved slots for the
@@ -300,9 +330,23 @@ void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,Int_t j)
  fSignals->AddAt(float(sig),j-1);
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::SetSignal(Double_t sig,TString name)
+{
+// Store signal value for the name-specified slot.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) SetSignal(sig,j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,Int_t j)
 {
-// Add value to the j-th (default j=1) signal slot.
+// Add value to the signal of the j-th (default j=1) slot.
 // Note : The first signal slot is at j=1.
 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
 // slots for signal values, the number of reserved slots for the
@@ -325,9 +369,23 @@ void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,Int_t j)
  fSignals->AddAt(sum,j-1);
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-Float_t AliSignal::GetSignal(Int_t j,Int_t mode)
+void AliSignal::AddSignal(Double_t sig,TString name)
 {
-// Provide value of the j-th (default j=1) signal slot.
+// Add value to the signal of the name-specified slot.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) AddSignal(sig,j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Float_t AliSignal::GetSignal(Int_t j,Int_t mode) const
+{
+// Provide signal value of the j-th (default j=1) slot.
 // Note : The first signal slot is at j=1.
 // In case no signal is present or the argument j is invalid, 0 is returned.
 // The parameter "mode" allows for automatic gain etc... correction of the signal.
@@ -379,9 +437,40 @@ Float_t AliSignal::GetSignal(Int_t j,Int_t mode)
  return sig;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Float_t AliSignal::GetSignal(TString name,Int_t mode) const
+{
+// Provide signal value of the name-specified slot.
+// In case no signal is present, 0 is returned.
+// The parameter "mode" allows for automatic gain etc... correction of the signal.
+//
+// mode = 0 : Just the j-th signal is returned.
+//        1 : The j-th signal is corrected for the gain, offset, dead flag etc...
+//            In case the gain value was not set, gain=1 will be assumed.
+//            In case the gain value was 0, a signal value of 0 is returned.
+//            In case the offset value was not set, offset=0 will be assumed.
+//            In case the j-th slot was marked dead, 0 is returned.
+//
+// The corrected signal (sigc) is determined as follows :
+//
+//              sigc=(signal/gain)-offset 
+//
+// The default is mode=0.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ Float_t val=0;
+ if (j>0) val=GetSignal(j,mode);
+ return val;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,Int_t j)
 {
-// Store error for the j-th (default j=1) signal slot.
+// Store error on the signal for the j-th (default j=1) slot.
 // Note : The first signal slot is at j=1.
 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
 // slots for signal error values, the number of reserved slots for the
@@ -403,9 +492,23 @@ void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,Int_t j)
  fDsignals->AddAt(float(dsig),j-1);
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-Float_t AliSignal::GetSignalError(Int_t j)
+void AliSignal::SetSignalError(Double_t dsig,TString name)
+{
+// Store error on the signal for the name-specified slot.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) SetSignalError(dsig,j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Float_t AliSignal::GetSignalError(Int_t j) const
 {
-// Provide error of the j-th (default j=1) signal slot.
+// Provide error on the signal of the j-th (default j=1) slot.
 // Note : The first signal slot is at j=1.
 // In case no signal is present or the argument j is invalid, 0 is returned.
  Float_t err=0;
@@ -423,64 +526,247 @@ Float_t AliSignal::GetSignalError(Int_t j)
  return err;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-void AliSignal::Data(TString f,Int_t j)
+Float_t AliSignal::GetSignalError(TString name) const
+{
+// Provide error on the signal of the name-specified slot.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ Float_t val=0;
+ if (j>0) val=GetSignalError(j);
+ return val;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::Data(TString f) const
+{
+// Provide all signal information within the coordinate frame f.
+
+ const char* name=GetName();
+ const char* title=GetTitle();
+
+ cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
+ if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
+ if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
+ cout << endl;
+ cout << "   Position";
+ Ali3Vector::Data(f);
+ if (fDevice)
+ {
+  const char* devname=fDevice->GetName();
+  const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
+  cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
+  if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
+  if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
+  cout << endl;
+ }
+
+ // Provide an overview of the stored waveforms
+ ListWaveform(-1);
+
+ // Provide an overview of all the data and attribute slots
+ List(-1);
+} 
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::List(Int_t j) const
 {
-// Provide signal information for the j-th slot within the coordinate frame f.
+// Provide signal information for the j-th slot.
 // The first slot is at j=1.
 // In case j=0 (default) the data of all slots will be listed.
+// In case j=-1 the data of all slots will be listed, but the header
+// information will be suppressed.
 
- if (j<0
+ if (j<-1
  {
-  cout << " *AliSignal::Data* Invalid argument j = " << j << endl;
+  cout << " *AliSignal::List* Invalid argument j = " << j << endl;
   return;
  }
 
- cout << " *AliSignal::Data* Signal of kind : " << fName.Data() << endl;
- cout << " Position";
- Ali3Vector::Data(f);
+ if (j != -1)
+ {
+  const char* name=GetName();
+  const char* title=GetTitle();
+
+  cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
+  if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
+  if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
+  cout << endl;
+  if (fDevice)
+  {
+   const char* devname=fDevice->GetName();
+   const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
+   cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
+   if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
+   if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
+   cout << endl;
+  }
+ }
 
  Int_t nvalues=GetNvalues();
  Int_t nerrors=GetNerrors();
+ Int_t nlinkslots=0;
+ if (fLinks) nlinkslots=fLinks->GetMaxColumn();
  Int_t n=nvalues;
  if (nerrors>n) n=nerrors;
+ if (nlinkslots>n) n=nlinkslots;
+
+ TObject* obj=0;
+ Int_t nrefs=0;
+ TArrayI posarr;
+ Int_t pos;
 
- if (j==0)
+ if (j<=0)
  {
   for (Int_t i=1; i<=n; i++)
   {
-   cout << "   Signal";
-   if (i<=nvalues) cout << " value : " << GetSignal(i);
+   cout << "   Slot : " << i;
+   if (i<=nvalues) cout << " Signal value : " << GetSignal(i);
    if (i<=nerrors) cout << " error : " << GetSignalError(i);
-   AliAttrib::Data(i);
+   AliAttrib::List(i);
    cout << endl;
+   obj=0;
+   nrefs=GetIndices(obj,i,posarr);
+   for (Int_t k=0; k<nrefs; k++)
+   {
+    pos=posarr.At(k);
+    obj=GetLink(i,pos);
+    if (obj)
+    {
+     cout << "    Link at position " << pos << " to : " << obj->ClassName();
+     if (obj->InheritsFrom("TNamed"))
+     {
+      const char* lname=obj->GetName();
+      const char* ltitle=obj->GetTitle();
+      if (strlen(lname))  cout << " Name : " << lname;
+      if (strlen(ltitle)) cout << " Title : " << ltitle;
+     }
+     cout << endl;
+    }
+   }
   }
  }
  else
  {
   if (j<=n)
   {
-   cout << "   Signal";
-   if (j<=nvalues) cout << " value : " << GetSignal(j);
+   cout << "   Slot : " << j;
+   if (j<=nvalues) cout << " Signal value : " << GetSignal(j);
    if (j<=nerrors) cout << " error : " << GetSignalError(j);
-   AliAttrib::Data(j);
+   AliAttrib::List(j);
    cout << endl;
+   obj=0;
+   nrefs=GetIndices(obj,j,posarr);
+   for (Int_t kj=0; kj<nrefs; kj++)
+   {
+    pos=posarr.At(kj);
+    obj=GetLink(j,pos);
+    if (obj)
+    {
+     cout << "    Link at position " << pos << " to : " << obj->ClassName();
+     if (obj->InheritsFrom("TNamed"))
+     {
+      const char* lnamej=obj->GetName();
+      const char* ltitlej=obj->GetTitle();
+      if (strlen(lnamej))  cout << " Name : " << lnamej;
+      if (strlen(ltitlej)) cout << " Title : " << ltitlej;
+     }
+     cout << endl;
+    }
+   }
   }
  }
 } 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-void AliSignal::SetName(TString name)
+void AliSignal::List(TString name) const
 {
-// Set the name tag to indicate the kind of signal.
- fName=name;
+// Provide signal information for the name-specified slot.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) List(j);
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-TString AliSignal::GetName()
+void AliSignal::ListWaveform(Int_t j) const
 {
-// Provide the name tag indicating the kind of signal.
- return fName;
+// Provide information for the j-th waveform.
+// The first waveform is at j=1.
+// In case j=0 (default) the info of all waveforms will be listed.
+// In case j=-1 the info of all waveforms will be listed, but the header
+// information will be suppressed.
+
+ if (j<-1) 
+ {
+  cout << " *AliSignal::ListWaveform* Invalid argument j = " << j << endl;
+  return;
+ }
+
+ if (j != -1)
+ {
+  const char* name=GetName();
+  const char* title=GetTitle();
+
+  cout << " *" << ClassName() << "::Data* Id :" << GetUniqueID();
+  if (strlen(name))  cout << " Name : " << name;
+  if (strlen(title)) cout << " Title : " << title;
+  cout << endl;
+  if (fDevice)
+  {
+   const char* devname=fDevice->GetName();
+   const char* devtitle=fDevice->GetTitle();
+   cout << "   Owned by device : " << fDevice->ClassName();
+   if (strlen(devname))  cout << " Name : " << devname;
+   if (strlen(devtitle)) cout << " Title : " << devtitle;
+   cout << endl;
+  }
+ }
+
+ Int_t n=GetNwaveforms();
+ TObject* obj=0;
+
+ if (j<=0)
+ {
+  for (Int_t i=1; i<=n; i++)
+  {
+   obj=GetWaveform(i);
+   if (obj)
+   {
+    const char* wfname=obj->GetName();
+    const char* wftitle=obj->GetTitle();
+    cout << "    Waveform " << i << " : " << obj->ClassName();
+    if (strlen(wfname))  cout << " Name : " << wfname;
+    if (strlen(wftitle)) cout << " Title : " << wftitle;
+    cout << endl;
+   }
+  }
+ }
+ else
+ {
+  if (j<=n)
+  {
+   obj=GetWaveform(j);
+   if (obj)
+   {
+    const char* wfnamej=obj->GetName();
+    const char* wftitlej=obj->GetTitle();
+    cout << "    Waveform " << j << " : " << obj->ClassName();
+    if (strlen(wfnamej))  cout << " Name : " << wfnamej;
+    if (strlen(wftitlej)) cout << " Title : " << wftitlej;
+    cout << endl;
+   }
+  }
+ }
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-Int_t AliSignal::GetNvalues()
+Int_t AliSignal::GetNvalues() const
 {
 // Provide the number of values for this signal.
  Int_t n=0;
@@ -488,7 +774,7 @@ Int_t AliSignal::GetNvalues()
  return n;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-Int_t AliSignal::GetNerrors()
+Int_t AliSignal::GetNerrors() const
 {
 // Provide the number specified errors on the values for this signal.
  Int_t n=0;
@@ -496,15 +782,26 @@ Int_t AliSignal::GetNerrors()
  return n;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-Int_t AliSignal::GetNwaveforms()
+Int_t AliSignal::GetNwaveforms() const
 {
-// Provide the number specified waveforms for this signal.
- Int_t n=0;
- if (fWaveforms) n=fWaveforms->GetSize();
- return n;
+// Provide the number of specified waveforms for this signal.
+// Actually the return value is the highest index of the stored waveforms.
+// This allows an index dependent meaning of waveform info (e.g. waveforms
+// with various gain values).
+// So, when all waveforms are stored in consequetive positions (e.g. 1,2,3),
+// this memberfunction returns 3, being both the highest filled position
+// and the actual number of waveforms.
+// In case only waveforms are stored at positions 1,2,5,7 this memberfunction
+// returns a value 7 whereas only 4 actual waveforms are present.
+// This implies that when looping over the various waveform slots, one
+// always has to check whether the returned pointer value is non-zero
+// (which is a good practice anyhow).
+ Int_t n=-1;
+ if (fWaveforms) n=fWaveforms->GetLast();
+ return (n+1);
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-TH1F* AliSignal::GetWaveform(Int_t j)
+TH1F* AliSignal::GetWaveform(Int_t j) const
 {
 // Provide pointer to the j-th waveform histogram.
  TH1F* waveform=0;
@@ -512,16 +809,52 @@ TH1F* AliSignal::GetWaveform(Int_t j)
  return waveform;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+TH1F* AliSignal::GetWaveform(TString name) const
+{
+// Provide pointer to the waveform histogram with the specified name.
+// In case no match is found, zero is returned.
+ Int_t n=GetNwaveforms();
+ TString str;
+ for (Int_t i=1; i<=n; i++)
+ {
+  TH1F* waveform=GetWaveform(i);
+  if (waveform)
+  {
+   str=waveform->GetName();
+   if (str == name) return waveform;
+  }
+ }
+ return 0; // No match found
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetWaveformIndex(TString name) const
+{
+// Provide index to the waveform histogram with the specified name.
+// In case no match is found, zero is returned.
+ Int_t n=GetNwaveforms();
+ TString str;
+ for (Int_t i=1; i<=n; i++)
+ {
+  TH1F* waveform=GetWaveform(i);
+  if (waveform)
+  {
+   str=waveform->GetName();
+   if (str == name) return i;
+  }
+ }
+ return 0; // No match found
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::SetWaveform(TH1F* waveform,Int_t j)
 {
-// Set the 1D waveform histogram corresponding to the j-th signal value.
+// Set the 1D waveform histogram for the j-th waveform.
 //
 // Notes :
-//  The waveform of the first signal value is at j=1.
+//  The first waveform position at j=1.
 //  j=1 is the default value.
 //
 // In case the value of the index j exceeds the maximum number of reserved
-// slots for the waveforms, the number of reserved slots for the waveforms
+// positions for the waveforms, the number of reserved positions for the waveforms
 // is increased automatically.
 //
 // In case the histo pointer argument has the same value as the current waveform
@@ -535,6 +868,8 @@ void AliSignal::SetWaveform(TH1F* waveform,Int_t j)
 // copy of the input histogram is created which becomes the current waveform
 // histogram.
 
+ if (j<1) return;
+
  if (!fWaveforms)
  {
   fWaveforms=new TObjArray(j);
@@ -562,10 +897,10 @@ void AliSignal::SetWaveform(TH1F* waveform,Int_t j)
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::ResetWaveform(Int_t j)
 {
-// Reset the waveform of the j-th (default j=1) signal value.
+// Reset the histogram of the j-th (default j=1) waveform.
 // This memberfunction invokes TH1F::Reset() for the corresponding waveform(s).
 // To actually delete the histograms from memory, use DeleteWaveform().
-// Notes : The first signal value is at j=1.
+// Notes : The first position is at j=1.
 //         j=0 ==> All waveforms will be reset.
  
  if (!fWaveforms) return;
@@ -595,10 +930,17 @@ void AliSignal::ResetWaveform(Int_t j)
  }
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::ResetWaveform(TString name)
+{
+// Reset the waveform with the specified name.
+ Int_t j=GetWaveformIndex(name);
+ if (j>0) ResetWaveform(j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 void AliSignal::DeleteWaveform(Int_t j)
 {
-// Delete the waveform of the j-th (default j=1) signal value.
-// Notes : The first signal value is at j=1.
+// Delete the histogram of the j-th (default j=1) waveform.
+// Notes : The first position is at j=1.
 //         j=0 ==> All waveforms will be deleted.
  
  if (!fWaveforms) return;
@@ -629,17 +971,513 @@ void AliSignal::DeleteWaveform(Int_t j)
  }
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-AliSignal* AliSignal::MakeCopy(AliSignal& s)
+void AliSignal::DeleteWaveform(TString name)
+{
+// Delete the waveform with the specified name.
+ Int_t j=GetWaveformIndex(name);
+ if (j>0) DeleteWaveform(j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetNlinks(TObject* obj,Int_t j) const
+{
+// Provide the number of links to the specified object for the j-th slot.
+// If j=0 (default) all slots will be scanned for the specified object.
+// If obj=0 (default) all encountered objects for the specified slot will be counted.
+// So, invokation of the default GetNlinks() will return the total number of
+// all references to all sorts of stored objects.
+ if (j<0)
+ {
+  cout << " *AliSignal::GetNlinks* Index j = " << j << " invalid." << endl;
+  return 0;
+ }
+
+ Int_t n=0;
+ if (!j)
+ {
+  if (fLinks) n=fLinks->GetNrefs(obj);
+ }
+ else
+ {
+  TArrayI posarr;
+  n=GetIndices(obj,j,posarr);
+ }
+ return n;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetNlinks(TObject* obj,TString name) const
+{
+// Provide the number of links to the specified object for the name-spec. slot.
+// If obj=0 all encountered objects for the specified slot will be counted.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ Int_t n=0;
+ if (j>0) n=GetNlinks(obj,j);
+ return n;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+TObject* AliSignal::GetLink(Int_t j,Int_t k) const
+{
+// Provide pointer of the object linked to the j-th slot at position k.
+
+ TObject* obj=0;
+ // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+ if (fLinks) obj=fLinks->GetObject(k,j);
+ return obj;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+TObject* AliSignal::GetLink(TString name,Int_t k) const
+{
+// Provide pointer of the object linked to the name-spec. slot at position k.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ TObject* obj=0;
+ if (j>0) obj=GetLink(j,k);
+ return obj;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::SetLink(TObject* obj,Int_t j,Int_t k)
+{
+// Introduce a link (=pointer) to an object for the j-th slot at position k.
+// Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
+// that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
+// by the AliSignal object.
+//
+// Notes :
+//  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
+//  j=1 and k=1 are the default values.
+//
+// If needed, the storage area for the links is increased automatically.
+//
+// In case the pointer argument is zero, indeed a value of zero will be
+// stored at the specified position (k) for the specified slot (j).
+//
+// In principle any object derived from TObject can be referred to by this
+// mechanism.
+// However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
+// to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
+// is related (see AliTrack::AddSignal).
+// Therefore, in case the input argument "obj" points to an AliTrack (or derived)
+// object, the current signal is automatically related to this AliTrack
+// (or derived) object.
+// 
+// Please also have a look at the docs of the memberfunction ResetLink()
+// to prevent the situation of stored pointers to non-existent object. 
+
+ if (!fLinks && obj) fLinks=new AliObjMatrix();
+
+ if (!fLinks) return;
+
+ // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+ fLinks->EnterObject(k,j,obj);
+ if (obj) 
+ {
+  if (obj->InheritsFrom("AliTrack"))
+  {
+   AliTrack* t=(AliTrack*)obj;
+   t->AddSignal(*this);
+  }
+ }
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::SetLink(TObject* obj,TString name,Int_t k)
 {
-// Make a deep copy of the input object and provide the pointer to the copy.
+// Introduce a link (=pointer) to an object for the name-spec. slot at position k.
+// Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
+// that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
+// by the AliSignal object.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) SetLink(obj,j,k);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::AddLink(TObject* obj,Int_t j)
+{
+// Introduce a link (=pointer) to an object for the j-th slot at the first
+// free position.
+// Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
+// that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
+// by the AliSignal object.
+//
+// Notes :
+//  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
+//  j=1 is the default value.
+//
+// If needed, the storage area for the links is increased automatically.
+//
+// In case the pointer argument is zero, no link will be added.
+//
+// In principle any object derived from TObject can be referred to by this
+// mechanism.
+// However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
+// to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
+// is related (see AliTrack::AddSignal).
+// Therefore, in case the input argument "obj" points to an AliTrack (or derived)
+// object, the current signal is automatically related to this AliTrack
+// (or derived) object.
+// 
+// Please also have a look at the docs of the memberfunction ResetLink()
+// to prevent the situation of stored pointers to non-existent object. 
+
+ if (!obj || j<=0) return;
+
+ if (!fLinks) fLinks=new AliObjMatrix();
+
+ TObject* dum=0;
+ Int_t n=GetNlinks(dum,j);
+ Int_t pos=1;
+ for (Int_t k=1; k<=n; k++)
+ {
+  dum=GetLink(j,k);
+  if (!dum) break;
+  pos++;
+ }
+
+ SetLink(obj,j,pos);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::AddLink(TObject* obj,TString name)
+{
+// Introduce a link (=pointer) to an object for the name-spec slot at the first
+// free position.
+// Only the pointer values are stored for (backward) reference, meaning
+// that the objects of which the pointers are stored are NOT owned
+// by the AliSignal object.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) AddLink(obj,j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::ResetLink(Int_t j,Int_t k)
+{
+// Reset the link of the j-th slot at position k.
+//
+// Notes :
+//  The first slot is at j=1 and the first position is at k=1.
+//  j=1 and k=1 are the default values.
+//
+//  This memberfunction is intended to reset only 1 specified link location.
+//  For extended functionality, please refer to the memberfuction ResetLinks().
+//
+// In general the user should take care of properly clearing the corresponding
+// pointer here when the referred object is deleted.
+// However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
+// to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
+// is related (see AliTrack::AddSignal).
+// As such, the AliTrack destructor already takes care of clearing the corresponding
+// links from the various AliSignal slots for all the AliSignal objects that were
+// related to that AliTrack. 
+// So, in case the link introduced via SetLink() is the pointer of an AliTrack object,
+// the user doesn't have to worry about clearing the corresponding AliTrack link from
+// the AliSignal object when the corresponding AliTrack object is deleted.
+ // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+ if (fLinks) fLinks->RemoveObject(k,j);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::ResetLink(TString name,Int_t k)
+{
+// Reset the link of the name-specified slot at position k.
+//
+// This memberfunction is intended to reset only 1 specified link location.
+// For extended functionality, please refer to the memberfuction ResetLinks().
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) ResetLink(j,k);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::ResetLinks(TObject* obj,Int_t j,Int_t k)
+{
+// Reset single or multiple link(s) according to user specified selections.
+//
+// A link is only reset if the stored reference matches the argument "obj".
+// In case obj=0 no check on the matching of the stored reference is performed
+// and the stored link is always reset in accordance with the other
+// selection criteria.
+//
+// In case the slot argument "j" is specified, only the links from that
+// specified slot will be deleted.
+// In case j=0 (default) no checking on the slot index is performed.
+//
+// In case the position argument "k" is specified, only the links from that
+// specified position will be deleted.
+// In case k=0 (default) no checking on the position index is performed.
+//
+// So, invokation of ResetLinks(obj) will remove all references to the
+// object "obj" from the total AliSignal, whereas ResetLinks(obj,j)
+// will remove all references to the object "obj" only from slot "j".
+//
+// Notes :
+// -------
+// The first slot is indicated as j=1, whereas the first position is at k=1.
+//
+// Invokation of ResetLinks(0,row,col) is equivalent to invoking the
+// memberfunction ResetLink(row,col).
+// Invoking the latter directly is slightly faster.
+//
+// Invokation of ResetLinks(0) will reset all stored references in this AliSignal.
+//
+// In general the user should take care of properly clearing the corresponding
+// pointer here when the referred object is deleted.
+// However, this "linking back" facility was introduced to enable AliSignal slots
+// to refer directly to the various AliTracks to which the AliSignal object itself
+// is related (see AliTrack::AddSignal).
+// As such, the AliTrack destructor already takes care of clearing the corresponding
+// links from the various AliSignal slots for all the AliSignal objects that were
+// related to that AliTrack. 
+// So, in case the link introduced via SetLink() is the pointer of an AliTrack object,
+// the user doesn't have to worry about clearing the corresponding AliTrack link from
+// the AliSignal object when the corresponding AliTrack object is deleted.
+ if (!fLinks) return;
+
+ if (!obj && !j && !k)
+ {
+  fLinks->Reset();
+ }
+ else
+ {
+  // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+  fLinks->RemoveObjects(obj,k,j);
+ }
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::ResetLinks(TObject* obj,TString name,Int_t k)
+{
+// Reset single or multiple link(s) according to user specified selections.
+//
+// A link is only reset if the stored reference matches the argument "obj".
+// In case obj=0 no check on the matching of the stored reference is performed
+// and the stored link is always reset in accordance with the other
+// selection criteria.
+//
+// In case the position argument "k" is specified, only the links from that
+// specified position will be deleted.
+// In case k=0 (default) no checking on the position index is performed.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ if (j>0) ResetLinks(obj,j,k);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TArrayI& js,TArrayI& ks) const
+{
+// Provide the slot and position indices of all the storage locations
+// of the specified object.
+// The slot (j) and pos. (k) indices are returned in the two separate TArrayI arrays
+// from which the (j,k) pairs can be obtained from the corresponding
+// array indices like (j,k)=(js.At(i),ks.At(i)).
+// The integer return argument represents the number of (j,k) pairs which
+// were encountered for the specified object.
+//
+// If obj=0 no object selection is performed and all (j,k) indices
+// of the stored references for all objects are returned.
+//
+// Notes :
+// -------
+// As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
+// 
+// This memberfunction always resets the two TArrayI arrays at the start.
+//
+// This memberfunction can only be used to obtain the (j,k) indices
+// of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
+// This means that in case the user has entered a TObjArray as object
+// (to increase the dimension of the resulting structure), the (j,k)
+// indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
+// actual objects contained in that TObjArray structure.
+//
+ Int_t nrefs=0;
+ js.Reset();
+ ks.Reset();
+ // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+ if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,ks,js);
+ return nrefs;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,Int_t j,TArrayI& ks) const
+{
+// Provide the position indices of all the storage locations of the
+// specified object in the j-th slot of this AliSignal.
+// The position indices are returned in the TArrayI array.
+// The integer return argument represents the number of storage locations which
+// were encountered for the specified object in the j-th slot.
+//
+// If obj=0 no object selection is performed and all position indices
+// of the stored references for all objects of the j-th slot are returned.
+//
+// If j=0 all slots will be scanned and all position indices matching the
+// object selection are returned.
+// Note that in this case multiple appearances of the same position index
+// will only be recorded once in the returned TArrayI array.
+//
+// Notes :
+// -------
+// As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
+// 
+// This memberfunction always resets the TArrayI array at the start.
+//
+// This memberfunction can only be used to obtain the position indices
+// of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
+// This means that in case the user has entered a TObjArray as object
+// (to increase the dimension of the resulting structure), the position
+// indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
+// actual objects contained in that TObjArray structure.
+//
+ Int_t nrefs=0;
+ ks.Reset();
+ // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+ if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,ks,j);
+ return nrefs;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TString name,TArrayI& ks) const
+{
+// Provide the position indices of all the storage locations of the
+// specified object in the name-specified slot of this AliSignal.
+// The position indices are returned in the TArrayI array.
+// The integer return argument represents the number of storage locations which
+// were encountered for the specified object in the j-th slot.
+//
+// If obj=0 no object selection is performed and all position indices
+// of the stored references for all objects of the j-th slot are returned.
+//
+// This procedure involves a slot-index search based on the specified name
+// at each invokation. This may become slow in case many slots have been
+// defined and/or when this procedure is invoked many times.
+// In such cases it is preferable to use indexed addressing in the user code
+// either directly or via a few invokations of GetSlotIndex().
+
+ Int_t j=GetSlotIndex(name);
+ Int_t n=0;
+ if (j>0) n=GetIndices(obj,j,ks);
+ return n;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetIndices(TObject* obj,TArrayI& js,Int_t k) const
+{
+// Provide the slot indices of all the storage locations of the
+// specified object for the k-th position in this AliSignal.
+// The slot indices are returned in the TArrayI array.
+// The integer return argument represents the number of storage locations which
+// were encountered for the specified object in the k-th position.
+//
+// If obj=0 no object selection is performed and all slot indices
+// of the stored references for all objects in the k-th position are returned.
+//
+// If k=0 all positions will be scanned and all slot indices matching the
+// object selection are returned.
+// Note that in this case multiple appearances of the same slot index
+// will only be recorded once in the returned TArrayI array.
+//
+// Notes :
+// -------
+// As usual the convention is that slot and position numbering starts at 1.
+// 
+// This memberfunction always resets the TArrayI array at the start.
+//
+// This memberfunction can only be used to obtain the slot indices
+// of the object as stored via the SetLink() or AddLink() memberfunction.
+// This means that in case the user has entered a TObjArray as object
+// (to increase the dimension of the resulting structure), the slot
+// indices of that TObjArray are obtained and NOT the indices of the
+// actual objects contained in that TObjArray structure.
+//
+ Int_t nrefs=0;
+ js.Reset();
+ // Note : In the internal storage matrix slots=columns positions=rows 
+ if (fLinks) nrefs=fLinks->GetIndices(obj,k,js);
+ return nrefs;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::SetSwapMode(Int_t swap)
+{
+// Set swapmode flag for the internal link storage.
+// In case for the stored links the maximum slot number differs considerably
+// from the maximum position number, it might be more efficient
+// (w.r.t. memory usage and/or output file size) to internally store the
+// link reference matrix with the rows and colums swapped.
+// This swapping is only related with the internal storage and as such
+// is completely hidden for the user.
+// At invokation of this memberfunction the default argument is swap=1.
+//
+// Note : The swap mode can only be set as long as no links are
+//        stored in the AliSignal (i.e. a new instance of AliSignal
+//        or after invokation of the Reset() or ResetLinks() function).
+ if (!fLinks) fLinks=new AliObjMatrix();
+ fLinks->SetSwapMode(swap);
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+Int_t AliSignal::GetSwapMode() const
+{
+// Provide swapmode flag of the link storage.
+ Int_t swap=0; 
+ if (fLinks) swap=fLinks->GetSwapMode();
+ return swap;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+void AliSignal::SetDevice(TObject* dev)
+{
+// Store the pointer to the device which owns this AliSignal object.
+// This memberfunction is meant for internal use in AliDevice.
+ fDevice=dev;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+AliDevice* AliSignal::GetDevice() const
+{
+// Provide the pointer to the device which owns this AliSignal object.
+ return (AliDevice*)fDevice;
+}
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+TObject* AliSignal::Clone(const char* name) const
+{
+// Make a deep copy of the current object and provide the pointer to the copy.
 // This memberfunction enables automatic creation of new objects of the
-// correct type depending on the argument type, a feature which may be very useful
+// correct type depending on the object type, a feature which may be very useful
 // for containers when adding objects in case the container owns the objects.
 // This feature allows e.g. AliTrack to store either AliSignal objects or
 // objects derived from AliSignal via the AddSignal memberfunction, provided
-// these derived classes also have a proper MakeCopy memberfunction. 
+// these derived classes also have a proper Clone memberfunction. 
 
- AliSignal* sig=new AliSignal(s);
+ AliSignal* sig=new AliSignal(*this);
+ if (name)
+ {
+  if (strlen(name)) sig->SetName(name);
+ }
  return sig;
 }
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////