]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
Changes towards speeding up the code. Thanks to Marian Ivanov.
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 714888a5ce9bb6d6422e3460f2c0ba32404b0000..a840e735f7b1255352a86c175588d033fddd9fea 100644 (file)
 
 /*
 $Log$
+Revision 1.52  2002/02/18 09:26:09  kowal2
+Removed compiler warning
+
+Revision 1.51  2002/01/21 17:13:21  kowal2
+New track hits using root containers. Setting active sectors added.
+
+Revision 1.50  2001/12/06 14:16:19  kowal2
+meaningfull printouts
+
+Revision 1.49  2001/11/30 11:55:37  hristov
+Noise table created in Hits2SDigits (M.Ivanov)
+
+Revision 1.48  2001/11/24 16:10:21  kowal2
+Faster algorithms.
+
+Revision 1.47  2001/11/19 10:25:34  kowal2
+Nearest integer instead of integer when converting to ADC counts
+
+Revision 1.46  2001/11/07 06:47:12  kowal2
+Removed printouts
+
+Revision 1.45  2001/11/03 13:33:48  kowal2
+Updated algorithms in Hits2SDigits, SDigits2Digits,
+Hits2ExactClusters.
+Added method Merge
+
+Revision 1.44  2001/08/30 09:28:48  hristov
+TTree names are explicitly set via SetName(name) and then Write() is called
+
+Revision 1.43  2001/07/28 12:02:54  hristov
+Branch split level set to 99
+
+Revision 1.42  2001/07/28 11:38:52  hristov
+Loop variable declared once
+
+Revision 1.41  2001/07/28 10:53:50  hristov
+Digitisation done according to the general scheme (M.Ivanov)
+
+Revision 1.40  2001/07/27 13:03:14  hristov
+Default Branch split level set to 99
+
+Revision 1.39  2001/07/26 09:09:34  kowal2
+Hits2Reco method added
+
+Revision 1.38  2001/07/20 14:32:43  kowal2
+Processing of many events possible now
+
+Revision 1.37  2001/06/12 07:17:18  kowal2
+Hits2SDigits method implemented (summable digits)
+
+Revision 1.36  2001/05/16 14:57:25  alibrary
+New files for folders and Stack
+
+Revision 1.35  2001/05/08 16:02:22  kowal2
+Updated material specifications
+
+Revision 1.34  2001/05/08 15:00:15  hristov
+Corrections for tracking in arbitrary magnenetic field. Changes towards a concept of global Alice track. Back propagation of reconstructed tracks (Yu.Belikov)
+
+Revision 1.33  2001/04/03 12:40:43  kowal2
+Removed printouts
+
+Revision 1.32  2001/03/12 17:47:36  hristov
+Changes needed on Sun with CC 5.0
+
+Revision 1.31  2001/03/12 08:21:50  kowal2
+Corrected C++ bug in the material definitions
+
+Revision 1.30  2001/03/01 17:34:47  kowal2
+Correction due to the accuracy problem
+
+Revision 1.29  2001/02/28 16:34:40  kowal2
+Protection against nonphysical values of the avalanche size,
+10**6 is the maximum
+
 Revision 1.28  2001/01/26 19:57:19  hristov
 Major upgrade of AliRoot code
 
@@ -109,7 +184,9 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include <TObjectTable.h>
 #include "TParticle.h"
 #include "AliTPC.h"
-#include <TFile.h>       
+#include <TFile.h>  
+#include <TROOT.h>
+#include <TSystem.h>     
 #include "AliRun.h"
 #include <iostream.h>
 #include <stdlib.h>
@@ -124,6 +201,7 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include "AliDigits.h"
 #include "AliSimDigits.h"
 #include "AliTPCTrackHits.h"
+#include "AliTPCTrackHitsV2.h"
 #include "AliPoints.h"
 #include "AliArrayBranch.h"
 
@@ -145,6 +223,31 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 
 ClassImp(AliTPC) 
 
+//_____________________________________________________________________________
+// helper class for fast matrix and vector manipulation - no range checking
+// origin - Marian Ivanov
+
+class AliTPCFastMatrix : public TMatrix {
+public :
+  AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb);
+  inline Float_t & UncheckedAt(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
+  inline Float_t   UncheckedAtFast(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
+};
+
+AliTPCFastMatrix::AliTPCFastMatrix(Int_t row_lwb, Int_t row_upb, Int_t col_lwb, Int_t col_upb):
+  TMatrix(row_lwb, row_upb,col_lwb,col_upb)
+   {
+   };
+//_____________________________________________________________________________
+class AliTPCFastVector : public TVector {
+public :
+  AliTPCFastVector(Int_t size);
+  inline Float_t & UncheckedAt(Int_t index) const  {return  fElements[index];} //fast acces  
+};
+
+AliTPCFastVector::AliTPCFastVector(Int_t size):TVector(size){
+};
+
 //_____________________________________________________________________________
 AliTPC::AliTPC()
 {
@@ -155,13 +258,16 @@ AliTPC::AliTPC()
   fHits     = 0;
   fDigits   = 0;
   fNsectors = 0;
-  //MI changes
   fDigitsArray = 0;
   fClustersArray = 0;
-  fTPCParam=0;
-  fTrackHits = 0;  
-  fHitType = 2;  
-  fTPCParam = 0; 
+  fDefaults = 0;
+  fTrackHits = 0; 
+  fTrackHitsOld = 0;   
+  fHitType = 4; //default CONTAINERS - based on ROOT structure 
+  fTPCParam = 0;    
+  fNoiseTable = 0;
+  fActiveSectors =0;
+
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -175,17 +281,25 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //
   // Initialise arrays of hits and digits 
   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
-  gAlice->AddHitList(fHits);
-  //MI change  
+  gAlice->AddHitList(fHits); 
   fDigitsArray = 0;
   fClustersArray= 0;
+  fDefaults = 0;
   //
-  fTrackHits = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  fTrackHits = new AliTPCTrackHitsV2;  
   fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
   fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);  
-  fTrackHits->SetMaxDistance(100); 
+  fTrackHits->SetMaxDistance(100);
 
-  fHitType = 2;
+  fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
+  fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);  
+  fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100); 
+
+  fNoiseTable =0;
+
+  fHitType = 4;
+  fActiveSectors = 0;
   //
   // Initialise counters
   fNsectors = 0;
@@ -200,8 +314,9 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //  Set TPC parameters
   //
 
-  if (!strcmp(title,"Default")) {  
-     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+
+  if (!strcmp(title,"Default")) {       
+    fTPCParam = new AliTPCParamSR;
   } else {
     cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
     fTPCParam=0;
@@ -221,6 +336,9 @@ AliTPC::~AliTPC()
   delete fDigits;
   delete fTPCParam;
   delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
+  delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
+  if (fNoiseTable) delete [] fNoiseTable;
+
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -235,7 +353,7 @@ void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
     TClonesArray &lhits = *fHits;
     new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
   }
-  if (fHitType&2)
+  if (fHitType>1)
    AddHit2(track,vol,hits);
 }
  
@@ -338,7 +456,8 @@ void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a track finder.
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCtracker::Clusters2Tracks(fTPCParam,of);
+  AliTPCtracker tracker(fTPCParam);
+  tracker.Clusters2Tracks(gFile,of);
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -589,7 +708,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   
   AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
 
-  // G10 60% SiO2 + 40% epoxy, I use A and Z for SiO2
+  // SiO2 - used later for the glass fiber
 
   amat[0]=28.086;
   amat[1]=15.9994;
@@ -600,13 +719,8 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   wmat[0]=1.;
   wmat[1]=2.;
 
-  density = 1.7;
-
-  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
 
-  AliMaterial(39,"G10",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
+  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz (rho=2.2)
 
   // Al
 
@@ -620,7 +734,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   // Si
 
   amat[0] = 28.086;
-  zmat[0] = 14.,
+  zmat[0] = 14.;
 
   density = 2.33;
 
@@ -672,6 +786,58 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
+  // Epoxy - C14 H20 O3
+
+  
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
+
+  wmat[0]=14.;
+  wmat[1]=20.;
+  wmat[2]=3.;
+
+  density=1.25;
+
+  AliMixture(45,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
+
+  // Carbon
+
+  amat[0]=12.011;
+  zmat[0]=6.;
+  density= 2.265;
+
+  AliMaterial(46,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+
+  // get epoxy
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[45],namate,amat[1],zmat[1],rho,X0,absl,buf,nbuf);
+
+  // Carbon fiber
+
+  wmat[0]=0.644; // by weight!
+  wmat[1]=0.356;
+
+  density=0.5*(1.25+2.265);
+
+  AliMixture(47,"Cfiber",amat,zmat,density,2,wmat);
+
+  // get SiO2
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
+
+  wmat[0]=0.725; // by weight!
+  wmat[1]=0.275;
+
+  density=1.7;
+
+  AliMixture(39,"G10",amat,zmat,density,2,wmat);
+
 
 
   //----------------------------------------------------------
@@ -697,22 +863,115 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
   AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
   AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(14,"Epoxy",45,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(15,"Cfiber",47,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
     
 }
 
+void AliTPC::GenerNoise(Int_t tablesize)
+{
+  //
+  //Generate table with noise
+  //
+  if (fTPCParam==0) {
+    // error message
+    fNoiseDepth=0;
+    return;
+  }
+  if (fNoiseTable)  delete[] fNoiseTable;
+  fNoiseTable = new Float_t[tablesize];
+  fNoiseDepth = tablesize; 
+  fCurrentNoise =0; //!index of the noise in  the noise table 
+  
+  Float_t norm = fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac();
+  for (Int_t i=0;i<tablesize;i++) fNoiseTable[i]= gRandom->Gaus(0,norm);      
+}
+
+Float_t AliTPC::GetNoise()
+{
+  // get noise from table
+  //  if ((fCurrentNoise%10)==0) 
+  //  fCurrentNoise= gRandom->Rndm()*fNoiseDepth;
+  if (fCurrentNoise>=fNoiseDepth) fCurrentNoise=0;
+  return fNoiseTable[fCurrentNoise++];
+  //gRandom->Gaus(0, fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
+}
+
+
+Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec)
+{
+  //
+  // check if the sector is active
+  if (!fActiveSectors) return kTRUE;
+  else return fActiveSectors[sec]; 
+}
 
-void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of)
+void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
+{
+  // activate interesting sectors
+  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
+  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
+  for (Int_t i=0;i<n;i++) 
+    if ((sectors[i]>=0) && sectors[i]<fTPCParam->GetNSector())  fActiveSectors[sectors[i]]=kTRUE;
+    
+}
+
+void    AliTPC::SetActiveSectors()
+{
+  //
+  // activate sectors which were hitted by tracks 
+  //loop over tracks
+  if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
+  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
+  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
+  TBranch * branch=0;
+  if (fHitType>1) branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC2");
+  else branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC");
+  Stat_t ntracks = gAlice->TreeH()->GetEntries();
+  // loop over all hits
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
+    ResetHits();
+    //
+    if (fTrackHits && fHitType&4) {
+      TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+      TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+      br1->GetEvent(track);
+      br2->GetEvent(track);
+      Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
+      for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++)
+       fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
+    }
+    
+    //
+    if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+      TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+      br->GetEvent(track);
+      AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+       fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
+      } 
+    }    
+  }
+  
+}  
+
+
+
+
+void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of, Int_t eventnumber)
 {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a simple cluster finder.
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of);
+  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of,eventnumber);
 }
 
 extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
 extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
+void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of, Int_t eventn)
 {
   //--------------------------------------------------------
   // TPC simple cluster generator from hits
@@ -751,10 +1010,7 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
      return;
   }
 
-   if(fTPCParam == 0){
-     printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
-     return;
-   }
+  //if(fDefaults == 0) SetDefaults();
 
   Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
   //
@@ -776,6 +1032,10 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
   //Switch to the output file
   of->cd();
 
+  char   cname[100];
+
+  sprintf(cname,"TreeC_TPC_%d",eventn);
+
   fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
   AliTPCClustersArray carray;
   carray.Setup(fTPCParam);
@@ -806,17 +1066,11 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
       tH->GetEvent(track);
       //
       //  Get number of the TPC hits
-      //
-      // nhits=fHits->GetEntriesFast();
-      //
-     
+      //     
        tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
 
       // Loop over hits
       //
-       //   for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-       //tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-
        while(tpcHit){
  
         if (tpcHit->fQ == 0.) {
@@ -825,9 +1079,6 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
         }
        sector=tpcHit->fSector; // sector number
 
-
-       //      if(sector != isec) continue; //terminate iteration
-
        if(sector != isec){
         tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
         continue; 
@@ -904,7 +1155,7 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
   } // end of loop over sectors  
 
   cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
-
+  carray.GetTree()->SetName(cname);
   carray.GetTree()->Write();
 
   savedir->cd(); //switch back to the input file
@@ -929,11 +1180,11 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   //
   TParticle *particle; // pointer to a given particle
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  Int_t sector,nhits;
+  //  Int_t sector,nhits;
   Int_t ipart;
   const Int_t kcmaxhits=30000;
-  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
-  TVector & xxx = *xxxx;
+  AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
+  AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
   Int_t maxhits = kcmaxhits;
   //construct array for each padrow
   for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
@@ -946,29 +1197,41 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   TTree *tH = gAlice->TreeH();
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
   Int_t npart = gAlice->GetNtrack();
-    
+  //MI change
+  TBranch * branch=0;
+  if (fHitType>1) branch = tH->GetBranch("TPC2");
+  else branch = tH->GetBranch("TPC");
+
   //------------------------------------------------------------
   // Loop over tracks
   //------------------------------------------------------------
-  
-  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
+
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){ 
+    Bool_t isInSector=kTRUE;
     ResetHits();
-    tH->GetEvent(track);
+     isInSector = TrackInVolume(isec,track);
+    if (!isInSector) continue;
+    //MI change
+    branch->GetEntry(track); // get next track
     //
     //  Get number of the TPC hits and a pointer
     //  to the particles
-    //
-    nhits=fHits->GetEntriesFast();
-    //
     // Loop over hits
     //
     Int_t currentIndex=0;
     Int_t lastrow=-1;  //last writen row
-    for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-      tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-      if (tpcHit==0) continue;
-      sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      if(sector != isec) continue; 
+
+    //M.I. changes
+
+    tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
+    while(tpcHit){
+      
+      Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
+      if(sector != isec){
+       tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
+       continue; 
+      }
+
       ipart=tpcHit->Track();
       if (ipart<npart) particle=gAlice->Particle(ipart);
       
@@ -977,7 +1240,7 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
       Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
       Int_t    index[3]={1,isec,0};
       Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;    
-      if (currentrow<0) continue;
+      if (currentrow<0) {tpcHit = (AliTPChit*)NextHit(); continue;}
       if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
       if (currentrow==lastrow){
        if ( currentIndex>=maxhits){
@@ -1041,22 +1304,24 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
          Float_t bz=detbz/det; //z angle
          sumy/=Float_t(currentIndex);
          sumz/=Float_t(currentIndex);
-         AliComplexCluster cl;
-         cl.fX=z;
-         cl.fY=y;
-         cl.fQ=sumq;
-         cl.fSigmaX2=bz;
-         cl.fSigmaY2=by;
-         cl.fTracks[0]=ipart;
-         
+
          AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(isec,lastrow));
-         if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
+         if (row!=0) {
+           AliComplexCluster* cl = new((AliComplexCluster*)row->Append()) AliComplexCluster ;
+           //    AliComplexCluster cl;
+           cl->fX=z;
+           cl->fY=y;
+           cl->fQ=sumq;
+           cl->fSigmaX2=bz;
+           cl->fSigmaY2=by;
+           cl->fTracks[0]=ipart;
+         }
          currentIndex=0;
          lastrow=currentrow;
        } //end of calculating cluster for given row
        
        
-       
+      tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
     } // end of loop over hits
   }   // end of loop over tracks 
   //write padrows to tree 
@@ -1067,82 +1332,406 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   xxxx->Delete();
  
 }
-//___________________________________________
-void AliTPC::SDigits2Digits()
+
+
+
+//__
+void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)  
+{
+  //create digits from summable digits
+  GenerNoise(500000); //create teble with noise
+  char  sname[100];
+  char  dname[100];
+  sprintf(sname,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+
+  //conect tree with sSDigits
+  TTree *t = (TTree *)gDirectory->Get(sname); 
+  AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
+  t->GetBranch("Segment")->SetAddress(&dummy);
+  Stat_t nentries = t->GetEntries();
+
+  // set zero suppression
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(2);
+
+  // get zero suppression
+
+  Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
+
+  //make tree with digits 
+  
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  
+  AliTPCParam * par =fTPCParam;
+
+  //Loop over segments of the TPC
+
+  for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
+    t->GetEvent(n);
+    Int_t sec, row;
+    if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
+      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
+      continue;
+    }
+    if (!IsSectorActive(sec)) continue;
+    AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
+    Int_t nrows = digrow->GetNRows();
+    Int_t ncols = digrow->GetNCols();
+
+    digrow->ExpandBuffer();
+    digarr.ExpandBuffer();
+    digrow->ExpandTrackBuffer();
+    digarr.ExpandTrackBuffer();
+
+    
+    Short_t * pamp0 = digarr.GetDigits();
+    Int_t   * ptracks0 = digarr.GetTracks();
+    Short_t * pamp1 = digrow->GetDigits();
+    Int_t   * ptracks1 = digrow->GetTracks();
+    Int_t  nelems =nrows*ncols;
+    Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat();
+    //use internal structure of the AliDigits - for speed reason
+    //if you cahnge implementation
+    //of the Alidigits - it must be rewriten -
+    for (Int_t i= 0; i<nelems; i++){
+      //      Float_t q = *pamp0;
+      //q/=16.;  //conversion faktor
+      //Float_t noise= GetNoise(); 
+      //q+=noise;      
+      //q= TMath::Nint(q);
+      Float_t q = TMath::Nint(Float_t(*pamp0)/16.+GetNoise());
+      if (q>zerosup){
+       if (q>saturation) q=saturation;      
+       *pamp1=(Short_t)q;
+       //if (ptracks0[0]==0)
+       //  ptracks1[0]=1;
+       //else
+       ptracks1[0]=ptracks0[0];        
+       ptracks1[nelems]=ptracks0[nelems];
+       ptracks1[2*nelems]=ptracks0[2*nelems];
+      }
+      pamp0++;
+      pamp1++;
+      ptracks0++;
+      ptracks1++;       
+    }
+
+    arr->StoreRow(sec,row);
+    arr->ClearRow(sec,row);   
+    // cerr<<sec<<"\t"<<row<<"\n";   
+  }  
+
+    
+  //write results
+
+  
+  arr->GetTree()->SetName(dname);  
+  arr->GetTree()->Write();  
+  delete arr;
+}
+//_________________________________________
+void AliTPC::Merge(TTree * intree, Int_t *mask, Int_t nin, Int_t outid)
+{
+  
+  //intree - pointer to array of trees with s digits
+  //mask   - mask for each 
+  //nin    - number of inputs
+  //outid  - event  number of the output event
+
+  //create digits from summable digits 
+  //conect tree with sSDigits
+
+    
+  AliSimDigits ** digarr = new AliSimDigits*[nin];
+  for (Int_t i1=0;i1<nin; i1++){
+    digarr[i1]=0;
+    intree[i1].GetBranch("Segment")->SetAddress(&digarr[i1]);
+  }
+  Stat_t nentries = intree[0].GetEntries();
+  
+  //make tree with digits   
+  char  dname[100];
+  sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),outid);
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fDigitsFile);  
+
+  // set zero suppression
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(2);
+
+  // get zero suppression
+
+  Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
+
+
+  AliTPCParam * par =fTPCParam;
+
+  //Loop over segments of the TPC
+  for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
+    
+    for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
+      //connect proper digits
+      intree[i].GetEvent(n);      
+      digarr[i]->ExpandBuffer();
+      digarr[i]->ExpandTrackBuffer();
+    }      
+    Int_t sec, row;
+    if (!par->AdjustSectorRow(digarr[0]->GetID(),sec,row)) {
+      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr[0]->GetID()<<endl;
+      continue;
+    }
+
+    AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
+    Int_t nrows = digrow->GetNRows();
+    Int_t ncols = digrow->GetNCols();
+
+    digrow->ExpandBuffer();
+    digrow->ExpandTrackBuffer();
+   
+    for (Int_t rows=0;rows<nrows; rows++){
+      for (Int_t col=0;col<ncols; col++){
+        Float_t q=0;
+        Int_t label[1000]; // i hope no more than 300 events merged
+        Int_t labptr = 0;
+        // looop over digits
+        for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
+          q  += digarr[i]->GetDigitFast(rows,col);
+          for (Int_t tr=0;tr<3;tr++) {
+            Int_t lab = digarr[i]->GetTrackIDFast(rows,col,tr);
+            if ( lab > 1) {
+              label[labptr]=lab+mask[i]-2;
+              labptr++;
+            }
+          }
+        }
+        //add noise
+        q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()*16); 
+        
+        q/=16;  //conversion faktor
+        q=(Short_t)q;
+
+        if (q> zerosup){
+
+          if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();
+          digrow->SetDigitFast((Short_t)q,rows,col);  
+          for (Int_t tr=0;tr<3;tr++){
+            if (tr<labptr)
+              ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(label[tr],rows,col,tr);
+            else
+              ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(-1,rows,col,tr);
+          }
+        }
+      } 
+     }         
+      arr->StoreRow(sec,row);
+
+      arr->ClearRow(sec,row);   
+  }  
+  
+  delete digarr;
+  arr->GetTree()->SetName(dname); 
+  arr->GetTree()->Write(); 
+  delete arr;  
+  
+}
+
+/*_________________________________________
+void AliTPC::SDigits2Digits(Int_t eventnumber)
 {
+
+
+  cerr<<"Digitizing TPC...\n";
+
+  Hits2Digits(eventnumber);
+   
+    
+  //write results
+
+  //  char treeName[100];
+
+  //  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  //  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName);  
+}
+*/
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::SetDefaults(){
+
+   
+   cerr<<"Setting default parameters...\n";
+
+  // Set response functions
+
   AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
   AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
   AliTPCPRF2D    * prfouter   = new AliTPCPRF2D;
   AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
-
-  TDirectory *cwd = gDirectory;
   rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
   rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
   rf->Update();
+  
+  TDirectory *savedir=gDirectory;
   TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
   if (!f->IsOpen()) { 
-     cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n";
+    cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n" ;
      exit(3);
   }
   prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
   prfouter->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
   f->Close();
-  cwd->cd();
-  
+  savedir->cd();
+
   param->SetInnerPRF(prfinner);
   param->SetOuterPRF(prfouter); 
   param->SetTimeRF(rf);
 
+  // set fTPCParam
+
   SetParam(param);
 
-  cerr<<"Digitizing TPC...\n";
+
+  fDefaults = 1;
+
+}
+//__________________________________________________________________  
+void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)  
+{ 
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors for a single event
+ //----------------------------------------------------
+
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
+  GenerNoise(500000); //create teble with noise
 
   //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
-  arr->Setup(param);
-  SetParam(param);
+  arr->Setup(fTPCParam);
   arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  fDigitsSwitch=0; // standard digits
+
+  cerr<<"Digitizing TPC -- normal digits...\n";
+
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
+
+  // write results
+
+  char treeName[100];
 
+  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName);  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->Write();  
+
+
+}
+
+
+
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)  
+{ 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
+
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors for a single event
+ //----------------------------------------------------
+
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+  GenerNoise(500000); //create table with noise
+  //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fDigitsFile);
   SetDigitsArray(arr);
 
-  Hits2Digits();
-   
-  // Hits2DigitsSector(1);         
-  // Hits2DigitsSector(2);             
-  // Hits2DigitsSector(3);             
-  // Hits2DigitsSector(1+18);             
-  // Hits2DigitsSector(2+18);             
-  // Hits2DigitsSector(3+18);             
-
-  // Hits2DigitsSector(36+1);             
-  // Hits2DigitsSector(36+2);             
-  // Hits2DigitsSector(36+3);             
-  // Hits2DigitsSector(36+1+18);             
-  // Hits2DigitsSector(36+2+18);             
-  // Hits2DigitsSector(36+3+18); 
-     
-  //write results
+  cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
+
+  fDigitsSwitch=1; // summable digits
+  
+    // set zero suppression to "0"
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(0);
+
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
+
+
+  // write results
 
   char treeName[100];
-  sprintf(treeName,"TreeD_%s",param->GetTitle());
-  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName,TObject::kOverwrite);
+
+  sprintf(treeName,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
+  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(); 
+
 }
 
-//__________________________________________________________________  
-void AliTPC::Hits2Digits()  
+
+
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2SDigits()  
 { 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
+
  //----------------------------------------------------
- // Loop over all sectors
+ // Loop over all sectors for a single event
  //----------------------------------------------------
+  //MI change - for pp run
+  Int_t eventnumber = gAlice->GetEvNumber();
 
-  if(fTPCParam == 0){
-    printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
-    return;
-  } 
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+  GenerNoise(500000); //create table with noise
+
+  //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  SetDigitsArray(arr);
 
- for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) Hits2DigitsSector(isec);
+  cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
+
+  //  fDigitsSwitch=1; // summable digits  -for the moment direct
+
+  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
+
+
+  // write results
+  char treeName[100];
+
+  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
+  
+  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
+  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(); 
 
 }
 
@@ -1162,6 +1751,10 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
   //  Get the access to the track hits
   //-------------------------------------------------------
 
+  // check if the parameters are set - important if one calls this method
+  // directly, not from the Hits2Digits
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
 
   TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
@@ -1174,7 +1767,7 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
     TObjArray **row;
     
-      printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
+    //printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
 
       Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
 
@@ -1184,7 +1777,7 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
       //--------------------------------------------------------
       //   Digitize this sector, row by row
-      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of TVectors,
+      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of AliTPCFastVectors,
       //   each one containing electrons accepted on this
       //   row, assigned into tracks
       //--------------------------------------------------------
@@ -1202,9 +1795,8 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
        fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
        Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
-       printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);
-       
+       if (gDebug > 10) printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
+       
         fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
 
    
@@ -1248,10 +1840,11 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //  Integrated signal for this row
   //  and a single track signal
   //    
-  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
-  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
+
+  AliTPCFastMatrix *m1 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
+  AliTPCFastMatrix *m2 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
   //
-  TMatrix &total  = *m1;
+  AliTPCFastMatrix &total  = *m1;
 
   //  Array of pointers to the label-signal list
 
@@ -1283,26 +1876,35 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   Int_t tracks[3];
 
   AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
-  for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
-    for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
-
-      Float_t q = total(ip,it);
-
-      Int_t gi =it*nofPads+ip; // global index
+  Int_t gi=-1;
+  Float_t fzerosup = zerosup+0.5;
+  for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
+    Float_t *pq = &(total.UncheckedAt(0,it));
+    for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
+      gi++;
+      Float_t q=*pq;      
+      pq++;
+      if(fDigitsSwitch == 0){
+       q+=GetNoise();
+        if(q <=fzerosup) continue; // do not fill zeros
+        q = TMath::Nint(q);
+        if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
 
-      q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
-
-      q = (Int_t)q;
+      }
 
-      if(q <=zerosup) continue; // do not fill zeros
-      if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
+      else {
+       if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
+       if(q>2000.) q=2000.;
+       q *= 16.;
+       q = TMath::Nint(q);
+      }
 
       //
       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
       //    
 
       for(Int_t j1=0;j1<3;j1++){
-        tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -1;
+       tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -2;
       }
 
 //Begin_Html
@@ -1341,8 +1943,8 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 
 //_____________________________________________________________________________
 
-Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
-                          Int_t *indexRange)
+Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, 
+             AliTPCFastMatrix *m1, AliTPCFastMatrix *m2,Int_t *indexRange)
 {
 
   //---------------------------------------------------------------
@@ -1356,10 +1958,10 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   // Modified: Marian Ivanov 
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  TVector *tv;
-  tv = (TVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
-  TVector &v = *tv;
+  AliTPCFastVector *tv;
+
+  tv = (AliTPCFastVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
+  AliTPCFastVector &v = *tv;
   
   Float_t label = v(0);
   Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3])-1)/2;
@@ -1370,10 +1972,8 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   indexRange[2]=9999; //min time
   indexRange[3]=-1; // max time
 
-  //  Float_t IneffFactor = 0.5; // inefficiency in the gain close to the edge, as above
-
-  TMatrix &signal = *m1;
-  TMatrix &total = *m2;
+  AliTPCFastMatrix &signal = *m1;
+  AliTPCFastMatrix &total = *m2;
   //
   //  Loop over all electrons
   //
@@ -1382,22 +1982,28 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
     Float_t aval =  v(idx+4);
     Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac(); 
     Float_t xyz[3]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3)};
-    Int_t n = fTPCParam->CalcResponse(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
-    
-    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){
-       Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(i);        
+    Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
+
+    Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(0);  
+    Float_t *weight = & (fTPCParam->GetResWeight(0));
+
+    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){       
        Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
-       if ( ( pad<(fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]))) && (pad>0)) {
+
+         if (pad>=0){
         Int_t time=index[2];    
-        Float_t weight = fTPCParam->GetResWeight(i); //we normalise response to ADC channel
-        weight *= eltoadcfac;
+         Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
         
-        if (m1!=0) signal(pad,time)+=weight; 
-        total(pad,time)+=weight;
-        indexRange[0]=TMath::Min(indexRange[0],pad);
-        indexRange[1]=TMath::Max(indexRange[1],pad);
-        indexRange[2]=TMath::Min(indexRange[2],time);
-        indexRange[3]=TMath::Max(indexRange[3],time); 
+        if (m1!=0) signal.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
+         total.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
+        if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
+        if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
+        if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
+        if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
+
+        index+=3;
+        weight++;      
+
        }        
     }
   } // end of loop over electrons
@@ -1406,8 +2012,8 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
-                     Float_t **pList)
+void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
+                     Int_t *indexRange, Float_t **pList)
 {
   //----------------------------------------------------------------------
   //  Updates the list of tracks contributing to digits for a given row
@@ -1417,7 +2023,7 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  TMatrix &signal = *m;
+  AliTPCFastMatrix &signal = *m;
 
   // lop over nonzero digits
 
@@ -1519,18 +2125,19 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit    
   //MI change
   TBranch * branch=0;
-  if (fHitType&2) branch = TH->GetBranch("TPC2");
+  if (fHitType>1) branch = TH->GetBranch("TPC2");
   else branch = TH->GetBranch("TPC");
 
  
   //----------------------------------------------
   // Create TObjArray-s, one for each row,
-  // each TObjArray will store the TVectors
-  // of electrons, one TVector per each track.
+  // each TObjArray will store the AliTPCFastVectors
+  // of electrons, one AliTPCFastVectors per each track.
   //---------------------------------------------- 
     
   Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
-  TVector **tracks = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
+  AliTPCFastVector **tracks = new AliTPCFastVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
+
   for(i=0; i<nrows; i++){
     row[i] = new TObjArray;
     nofElectrons[i]=0;
@@ -1549,16 +2156,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
     Bool_t isInSector=kTRUE;
     ResetHits();
-
-    if (fHitType&2) {
-      isInSector=kFALSE;
-      TBranch * br = TH->GetBranch("fTrackHitsInfo");
-      br->GetEvent(track);
-      AliObjectArray * ar = fTrackHits->fTrackHitsInfo;
-      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
-       if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==isec) isInSector=kTRUE;
-      }
-    }
+    isInSector = TrackInVolume(isec,track);
     if (!isInSector) continue;
     //MI change
     branch->GetEntry(track); // get next track
@@ -1575,7 +2173,6 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     while(tpcHit){
       
       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      //      if(sector != isec) continue; 
       if(sector != isec){
        tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
        continue; 
@@ -1591,19 +2188,19 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
           for(i=0;i<nrows;i++){
              if(previousTrack != -1){
               if(nofElectrons[i]>0){
-                TVector &v = *tracks[i];
+                 AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
                 v(0) = previousTrack;
                  tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
                 row[i]->Add(tracks[i]);                     
               }
                else{
-                 delete tracks[i]; // delete empty TVector
+                 delete tracks[i]; // delete empty AliTPCFastVector
                  tracks[i]=0;
               }
             }
 
              nofElectrons[i]=0;
-             tracks[i] = new TVector(481); // TVectors for the next fTrack
+             tracks[i] = new AliTPCFastVector(481); // AliTPCFastVectors for the next fTrack
 
           } // end of loop over rows
               
@@ -1637,8 +2234,8 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
          //
          // protection for the nonphysical avalanche size (10**6 maximum)
          //  
-         xyz[3]= (Float_t) 
-           (-gasgain*TMath::Log(gRandom->Rndm()*(1.-1.93e-22)+1.928e-22));  
+          Double_t rn=TMath::Max(gRandom->Rndm(0),1.93e-22);
+         xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
          index[0]=1;
          
          TransportElectron(xyz,index); //MI change -august       
@@ -1660,13 +2257,11 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
            }
          }
          
-         TVector &v = *tracks[rowNumber];
+          AliTPCFastVector &v = *tracks[rowNumber];
          Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
-
-         v(idx)=  xyz[0];   // X - pad row coordinate
-         v(idx+1)=xyz[1];   // Y - pad coordinate (along the pad-row)
-          v(idx+2)=xyz[2];   // Z - time bin coordinate
-         v(idx+3)=xyz[3];   // avalanche size  
+         Real_t * position = &(((AliTPCFastVector&)v).UncheckedAt(idx)); //make code faster
+         memcpy(position,xyz,4*sizeof(Float_t));
        } // end of loop over electrons
 
         tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
@@ -1680,7 +2275,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
 
      for(i=0;i<nrows;i++){
        if(nofElectrons[i]>0){
-          TVector &v = *tracks[i];
+          AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
          v(0) = previousTrack;
           tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
          row[i]->Add(tracks[i]);  
@@ -1706,18 +2301,20 @@ void AliTPC::Init()
   //
   Int_t i;
   //
-  printf("\n");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf(" TPC_INIT ");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf("\n");
-  //
-  for(i=0;i<80;i++) printf("*");
-  printf("\n");
+  if(fDebug) {
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf(" TPC_INIT ");
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    //
+    for(i=0;i<80;i++) printf("*");
+    printf("\n");
+  }
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, char *file)
+void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, const char *file)
 {
   //
   // Create Tree branches for the TPC.
@@ -1728,14 +2325,14 @@ void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, char *file)
 
   AliDetector::MakeBranch(option,file);
 
-  char *d = strstr(option,"D");
+  const char *d = strstr(option,"D");
 
   if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
-    gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
-                             branchname, &fDigits, buffersize, file) ;
+      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
+                       branchname, &fDigits, buffersize, file);
   }    
 
-  if (fHitType&2) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
+  if (fHitType>1) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -1938,44 +2535,81 @@ AliHit(shunt,track)
  
 
 //________________________________________________________________________
-// Additional code because of the AliTPCTrackHits
+// Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
 
-void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,char *file)
+void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char *file)
 {
   //
   // Create a new branch in the current Root Tree
   // The branch of fHits is automatically split
   // MI change 14.09.2000
-  if (fHitType&2==0) return;
+  if (fHitType<2) return;
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
   //
   // Get the pointer to the header
-  char *cH = strstr(option,"H");
-  //
-  if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH) {    
-    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHits, 
-                                                  gAlice->TreeH(),fBufferSize,1);
+  const char *cH = strstr(option,"H");
+  //
+  if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&4) {    
+    //    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
+    //                                            gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
+    //TBranch * branch = 
+    gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
+                                                  fBufferSize,99);
+
+    // gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+    if (GetDebug()>1) 
+      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
+    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
+    if (GetDebug())
+      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
+    Publish(folder,&fTrackHits,branchname);
+    if (file) {
+        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
+        TDirectory *wd = gDirectory;
+        b->SetFile(file);
+        TIter next( b->GetListOfBranches());
+        while ((b=(TBranch*)next())) {
+         b->SetFile(file);
+        }
+        wd->cd(); 
+        if (GetDebug()>1) 
+             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
+    }
+  }    
+
+  if (fTrackHitsOld   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&2) {    
+    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
+                                                  gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
+    //TBranch * branch = gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
+    //                                                    fBufferSize,99);
+
     gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
-    printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
+    if (GetDebug()>1) 
+      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
+    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
+    if (GetDebug())
+      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
+    Publish(folder,&fTrackHitsOld,branchname);
     if (file) {
         TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
         TDirectory *wd = gDirectory;
         b->SetFile(file);
         TIter next( b->GetListOfBranches());
         while ((b=(TBranch*)next())) {
-           b->SetFile(file);
+         b->SetFile(file);
         }
         wd->cd(); 
-           cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
+        if (GetDebug()>1) 
+             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
     }
   }    
 }
 
 void AliTPC::SetTreeAddress()
 {
-  if (fHitType&1) AliDetector::SetTreeAddress();
-  if (fHitType&2) SetTreeAddress2();
+  if (fHitType<=1) AliDetector::SetTreeAddress();
+  if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
 }
 
 void AliTPC::SetTreeAddress2()
@@ -1989,15 +2623,21 @@ void AliTPC::SetTreeAddress2()
   //
   // Branch address for hit tree
   TTree *treeH = gAlice->TreeH();
-  if (treeH) {
+  if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
     branch = treeH->GetBranch(branchname);
     if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHits);
   }
+  if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
+    branch = treeH->GetBranch(branchname);
+    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
+  }
+
 }
 
 void AliTPC::FinishPrimary()
 {
-  if (fTrackHits) fTrackHits->FlushHitStack();  
+  if (fTrackHits &&fHitType&4)      fTrackHits->FlushHitStack();  
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();  
 }
 
 
@@ -2017,32 +2657,39 @@ void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   //AliTPChit *hit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(fNhits-1);
   //if (hit->fTrack!=rtrack)
   //  cout<<"bad track number\n";
-  if (fTrackHits) 
+  if (fTrackHits && fHitType&4
     fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
                             hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+  if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
+    fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
+                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+  
 }
 
 void AliTPC::ResetHits()
 {
   if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
-  if (fHitType&2) ResetHits2();
+  if (fHitType>1) ResetHits2();
 }
 
 void AliTPC::ResetHits2()
 {
   //
   //reset hits
-  if (fTrackHits) fTrackHits->Clear();
+  if (fTrackHits && fHitType&4) fTrackHits->Clear();
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
+
 }   
 
 AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
 {
-  if (fHitType&2) return FirstHit2(track);
+  if (fHitType>1) return FirstHit2(track);
   return AliDetector::FirstHit(track);
 }
 AliHit* AliTPC::NextHit()
 {
-  if (fHitType&2) return NextHit2();
+  if (fHitType>1) return NextHit2();
+  
   return AliDetector::NextHit();
 }
 
@@ -2060,10 +2707,15 @@ AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
     gAlice->TreeH()->GetEvent(track);
   }
   //
-  if (fTrackHits) {
+  if (fTrackHits && fHitType&4) {
     fTrackHits->First();
     return fTrackHits->GetHit();
   }
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    fTrackHitsOld->First();
+    return fTrackHitsOld->GetHit();
+  }
+
   else return 0;
 }
 
@@ -2072,6 +2724,11 @@ AliHit* AliTPC::NextHit2()
   //
   //Return the next hit for the current track
 
+
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    fTrackHitsOld->Next();
+    return fTrackHitsOld->GetHit();
+  }
   if (fTrackHits) {
     fTrackHits->Next();
     return fTrackHits->GetHit();
@@ -2098,14 +2755,64 @@ void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
 void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
 {
   if (!fTrackHits) return;
-  AliObjectArray * arr = fTrackHits->fTrackHitsInfo;
-  for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
-    AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
-    info->fTrackID = map[info->fTrackID];
-  }
   
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
+    AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+    for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
+      AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
+    TClonesArray * arr = fTrackHits->GetArray();;
+    for (Int_t i=0;i<arr->GetEntriesFast();i++){
+      AliTrackHitsParamV2 * info = (AliTrackHitsParamV2 *)(arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
 }
 
+Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
+{
+  //return bool information - is track in given volume
+  //load only part of the track information 
+  //return true if current track is in volume
+  //
+  //  return kTRUE;
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+    br->GetEvent(track);
+    AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+    for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+      if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
+    } 
+  }
+
+  if (fTrackHits && fHitType&4) {
+    TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+    TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+    br2->GetEvent(track);
+    br1->GetEvent(track);    
+    Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
+    Int_t nvolumes = fTrackHits->GetNVolumes();
+    if (!volumes && nvolumes>0) {
+      printf("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes);
+      return kFALSE;
+    }
+    for (Int_t j=0;j<nvolumes; j++)
+      if (volumes[j]==id) return kTRUE;    
+  }
+
+  if (fHitType&1) {
+    TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fSector");
+    br->GetEvent(track);
+    for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
+      if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
+    } 
+  }
+  return kFALSE;  
+
+}
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
@@ -2113,9 +2820,12 @@ void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
   //
   // Store x, y, z of all hits in memory
   //
-  if (fTrackHits == 0) return;
+  if (fTrackHits == 0 && fTrackHitsOld==0) return;
   //
-  Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  Int_t nhits =0;
+  if (fHitType&4) nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  if (fHitType&2) nhits = fTrackHitsOld->GetEntriesFast();
+  
   if (nhits == 0) return;
   Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
@@ -2138,9 +2848,7 @@ void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
   // Loop over all the hits and store their position
   //
   ahit = FirstHit2(-1);
-  //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
   while (ahit){
-    //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
     trk=ahit->GetTrack();
     if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
       //
@@ -2161,6 +2869,9 @@ void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
     ntrk[trk]++;
     ahit = NextHit2();
   }
+
+
+
   //
   for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
     if(ntrk[trk]) {
@@ -2279,8 +2990,8 @@ void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * arr)
   Int_t ipart;
   
   const Int_t kcmaxhits=30000;
-  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
-  TVector & xxx = *xxxx;
+  AliTPCFastVector * xxxx = new AliTPCFastVector(kcmaxhits*4);
+  AliTPCFastVector & xxx = *xxxx;
   Int_t maxhits = kcmaxhits;
       
   //
@@ -2380,7 +3091,48 @@ void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * arr)
                
   } // end of loop over hits
   xxxx->Delete();
+
+}
+//_______________________________________________________________________________
+void AliTPC::Digits2Reco(Int_t firstevent,Int_t lastevent)
+{
+  // produces rec points from digits and writes them on the root file
+  // AliTPCclusters.root
+
+  TDirectory *cwd = gDirectory;
+
+
+  AliTPCParam *dig=(AliTPCParam *)gDirectory->Get("75x40_100x60");
+  SetParam(dig);
+  cout<<"AliTPC::Digits2Reco: TPC parameteres have been set"<<endl; 
+  TFile *out;
+  if(!gSystem->Getenv("CONFIG_FILE")){
+    out=TFile::Open("AliTPCclusters.root","recreate");
+  }
+  else {
+    const char *tmp1;
+    const char *tmp2;
+    char tmp3[80];
+    tmp1=gSystem->Getenv("CONFIG_FILE_PREFIX");
+    tmp2=gSystem->Getenv("CONFIG_OUTDIR");
+    sprintf(tmp3,"%s%s/AliTPCclusters.root",tmp1,tmp2);
+    out=TFile::Open(tmp3,"recreate");
+  }
+
+  TStopwatch timer;
+  cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points begins"<<endl;
+  timer.Start();
+  cwd->cd();
+  for(Int_t iev=firstevent;iev<lastevent+1;iev++){
+
+    printf("Processing event %d\n",iev);
+    Digits2Clusters(out,iev);
+  }
+  cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points ended"<<endl;
+  timer.Stop();
+  timer.Print();
+  out->Close();
+  cwd->cd(); 
 
 
 }