]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
Makefile added to PDF8
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 67f385972d87dc4fec7ed7d6623964b00f8bb84a..db43fe993ff74b2f5927b9a4595e59a40f0ccee9 100644 (file)
 
 /*
 $Log$
+Revision 1.19.2.4  2000/06/26 07:39:42  kowal2
+Changes to obey the coding rules
+
+Revision 1.19.2.3  2000/06/25 08:38:41  kowal2
+Splitted from AliTPCtracking
+
+Revision 1.19.2.2  2000/06/16 12:59:28  kowal2
+Changed parameter settings
+
+Revision 1.19.2.1  2000/06/09 07:15:07  kowal2
+
+Defaults loaded automatically (hard-wired)
+Optional parameters can be set via macro called in the constructor
+
+Revision 1.19  2000/04/18 19:00:59  fca
+Small bug fixes to TPC files
+
+Revision 1.18  2000/04/17 09:37:33  kowal2
+removed obsolete AliTPCDigitsDisplay.C
+
 Revision 1.17.2.2  2000/04/10 08:15:12  kowal2
 
 New, experimental data structure from M. Ivanov
@@ -55,6 +75,8 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 //                                                                          //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
+//
+
 #include <TMath.h>
 #include <TRandom.h>
 #include <TVector.h>
@@ -65,13 +87,14 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include <TObjectTable.h>
 #include "TParticle.h"
 #include "AliTPC.h"
+#include <TFile.h>       
 #include "AliRun.h"
 #include <iostream.h>
 #include <fstream.h>
 #include "AliMC.h"
 
 
-#include "AliTPCParam.h"
+#include "AliTPCParamSR.h"
 #include "AliTPCPRF2D.h"
 #include "AliTPCRF1D.h"
 #include "AliDigits.h"
@@ -83,7 +106,11 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 #include "AliTPCClustersRow.h"
 #include "AliTPCClustersArray.h"
 
+#include "AliTPCcluster.h"
+#include "AliTPCclusterer.h"
+#include "AliTPCtracker.h"
 
+#include <TInterpreter.h>
 
 ClassImp(AliTPC) 
 
@@ -94,17 +121,13 @@ AliTPC::AliTPC()
   // Default constructor
   //
   fIshunt   = 0;
-  fClusters = 0;
   fHits     = 0;
   fDigits   = 0;
-  fTracks   = 0;
   fNsectors = 0;
-  fNtracks  = 0;
-  fNclusters= 0;
   //MI changes
   fDigitsArray = 0;
   fClustersArray = 0;
-  fTPCParam = 0;
+  fTPCParam=0;
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -118,23 +141,31 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //
   // Initialise arrays of hits and digits 
   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
+  gAlice->AddHitList(fHits);
   //MI change  
   fDigitsArray = 0;
   fClustersArray= 0;
-  fTPCParam = 0;
   //
   // Initialise counters
-  fClusters = 0;
-  fTracks   = 0;
   fNsectors = 0;
-  fNtracks  = 0;
-  fNclusters= 0;
 
   //
   fIshunt     =  0;
   //
   // Initialise color attributes
   SetMarkerColor(kYellow);
+
+  //
+  //  Set TPC parameters
+  //
+
+  if (!strcmp(title,"Default")) {  
+     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+  } else {
+    cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
+    fTPCParam=0;
+  }
+
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -143,39 +174,13 @@ AliTPC::~AliTPC()
   //
   // TPC destructor
   //
+
   fIshunt   = 0;
   delete fHits;
   delete fDigits;
-  delete fClusters;
-  delete fTracks;
-  if (fDigitsArray!=0) delete fDigitsArray;
-  if (fClustersArray!=0) delete fClustersArray;
-
-  if (fTPCParam) delete fTPCParam;
+  delete fTPCParam;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddCluster(Float_t *hits, Int_t *tracks)
-{
-  //
-  // Add a simulated cluster to the list
-  //
-  if(!fClusters) fClusters=new TClonesArray("AliTPCcluster",10000);
-  TClonesArray &lclusters = *fClusters;
-  new(lclusters[fNclusters++]) AliTPCcluster(hits,tracks);
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddCluster(const AliTPCcluster &c)
-{
-  //
-  // Add a simulated cluster copy to the list
-  //
-  if(!fClusters) fClusters=new TClonesArray("AliTPCcluster",900000);
-  TClonesArray &lclusters = *fClusters;
-  new(lclusters[fNclusters++]) AliTPCcluster(c);
-}
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
 {
@@ -186,27 +191,6 @@ void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
 }
  
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddTrack(Float_t *hits)
-{
-  //
-  // Add a track to the list of tracks
-  //
-  TClonesArray &ltracks = *fTracks;
-  new(ltracks[fNtracks++]) AliTPCtrack(hits);
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::AddTrack(const AliTPCtrack& t)
-{
-  //
-  // Add a track copy to the list of tracks
-  //
-  if(!fTracks) fTracks=new TClonesArray("AliTPCtrack",10000);
-  TClonesArray &ltracks = *fTracks;
-  new(ltracks[fNtracks++]) AliTPCtrack(t);
-}
-
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::BuildGeometry()
 {
@@ -214,7 +198,7 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
   //
   // Build TPC ROOT TNode geometry for the event display
   //
-  TNode *Node, *Top;
+  TNode *nNode, *nTop;
   TTUBS *tubs;
   Int_t i;
   const int kColorTPC=19;
@@ -223,23 +207,23 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
   const Double_t kRaddeg=180./TMath::Pi();
 
 
-  Float_t InnerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
-  Float_t OuterOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
+  Float_t innerOpenAngle = fTPCParam->GetInnerAngle();
+  Float_t outerOpenAngle = fTPCParam->GetOuterAngle();
 
-  Float_t InnerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
-  Float_t OuterAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
+  Float_t innerAngleShift = fTPCParam->GetInnerAngleShift();
+  Float_t outerAngleShift = fTPCParam->GetOuterAngleShift();
 
   Int_t nLo = fTPCParam->GetNInnerSector()/2;
   Int_t nHi = fTPCParam->GetNOuterSector()/2;  
 
-  const Double_t loAng = (Double_t)TMath::Nint(InnerOpenAngle*kRaddeg);
-  const Double_t hiAng = (Double_t)TMath::Nint(OuterOpenAngle*kRaddeg);
-  const Double_t loAngSh = (Double_t)TMath::Nint(InnerAngleShift*kRaddeg);
-  const Double_t hiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(OuterAngleShift*kRaddeg);  
+  const Double_t kloAng = (Double_t)TMath::Nint(innerOpenAngle*kRaddeg);
+  const Double_t khiAng = (Double_t)TMath::Nint(outerOpenAngle*kRaddeg);
+  const Double_t kloAngSh = (Double_t)TMath::Nint(innerAngleShift*kRaddeg);
+  const Double_t khiAngSh = (Double_t)TMath::Nint(outerAngleShift*kRaddeg);  
 
 
-  const Double_t loCorr = 1/TMath::Cos(0.5*loAng*kDegrad);
-  const Double_t hiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*hiAng*kDegrad);
+  const Double_t kloCorr = 1/TMath::Cos(0.5*kloAng*kDegrad);
+  const Double_t khiCorr = 1/TMath::Cos(0.5*khiAng*kDegrad);
 
   Double_t rl,ru;
   
@@ -248,7 +232,7 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
   // Get ALICE top node
   //
 
-  Top=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
+  nTop=gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
 
   //  inner sectors
 
@@ -262,13 +246,13 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
     sprintf(title,"TPC low sector %3d",i);
     title[24]='\0';
     
-    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*loCorr,ru*loCorr,250.,
-                     loAng*(i-0.5)+loAngSh,loAng*(i+0.5)+loAngSh);
+    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*kloCorr,ru*kloCorr,250.,
+                     kloAng*(i-0.5)+kloAngSh,kloAng*(i+0.5)+kloAngSh);
     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
-    Top->cd();
-    Node = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
-    Node->SetLineColor(kColorTPC);
-    fNodes->Add(Node);
+    nTop->cd();
+    nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
+    nNode->SetLineColor(kColorTPC);
+    fNodes->Add(nNode);
   }
 
   // Outer sectors
@@ -281,19 +265,16 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
     name[4]='\0';
     sprintf(title,"TPC upper sector %d",i);
     title[24]='\0';
-    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*hiCorr,ru*hiCorr,250,
-                     hiAng*(i-0.5)+hiAngSh,hiAng*(i+0.5)+hiAngSh);
+    tubs = new TTUBS(name,title,"void",rl*khiCorr,ru*khiCorr,250,
+                     khiAng*(i-0.5)+khiAngSh,khiAng*(i+0.5)+khiAngSh);
     tubs->SetNumberOfDivisions(1);
-    Top->cd();
-    Node = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
-    Node->SetLineColor(kColorTPC);
-    fNodes->Add(Node);
+    nTop->cd();
+    nNode = new TNode(name,title,name,0,0,0,"");
+    nNode->SetLineColor(kColorTPC);
+    fNodes->Add(nNode);
   }
 
-
-}  
-  
-  
+}    
 
 //_____________________________________________________________________________
 Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
@@ -305,385 +286,62 @@ Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
   return 9999;
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-static Double_t SigmaY2(Double_t r, Double_t tgl, Double_t pt)
-{
-  //
-  // Parametrised error of the cluster reconstruction (pad direction)   
-  //
-  pt=TMath::Abs(pt)*1000.;
-  Double_t x=r/pt;
-  tgl=TMath::Abs(tgl);
-  Double_t s=a_rphi - b_rphi*r*tgl + c_rphi*x*x + d_rphi*x;
-  if (s<0.4e-3) s=0.4e-3;
-  s*=1.3; //Iouri Belikov
-  return s;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-static Double_t SigmaZ2(Double_t r, Double_t tgl) 
-{
-  //
-  // Parametrised error of the cluster reconstruction (drift direction)
-  //
-  tgl=TMath::Abs(tgl);
-  Double_t s=a_z - b_z*r*tgl + c_z*tgl*tgl;
-  if (s<0.4e-3) s=0.4e-3;
-  s*=1.3; //Iouri Belikov
-  return s;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-inline Double_t f1(Double_t x1,Double_t y1,
-                   Double_t x2,Double_t y2,
-                   Double_t x3,Double_t y3) 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Initial approximation of the track curvature
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
-  Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
-                  (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
-  Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
-                  (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
-
-  Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
-
-  return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr); 
-}
-
-
-//_____________________________________________________________________________
-inline Double_t f2(Double_t x1,Double_t y1,
-                   Double_t x2,Double_t y2,
-                   Double_t x3,Double_t y3) 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
-  Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
-                  (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
-  Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
-                  (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
-
-  Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
-  
-  return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-inline Double_t f3(Double_t x1,Double_t y1, 
-                   Double_t x2,Double_t y2,
-                   Double_t z1,Double_t z2) 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-static Int_t FindProlongation(AliTPCtrack& t, const AliTPCSector *sec,
-                           Int_t s, Int_t rf=0) 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function tries to find a track prolongation.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  const Int_t ROWS_TO_SKIP=(t<10) ? 10 : Int_t(0.5*sec->GetNRows());
-  const Float_t MAX_CHI2=12.;
-  Int_t try_again=ROWS_TO_SKIP;
-  Double_t alpha=sec->GetAlpha();
-  Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/alpha+0.5);
-
-  for (Int_t nr=sec->GetRowNumber(t.GetX())-1; nr>=rf; nr--) {
-    Double_t x=sec->GetX(nr), ymax=sec->GetMaxY(nr);
-    if (!t.PropagateTo(x)) return 0;
-
-    AliTPCcluster *cl=0;
-    Double_t max_chi2=MAX_CHI2;
-    const AliTPCRow& row=sec[s][nr];
-    Double_t sy2=SigmaY2(t.GetX(),t.GetTgl(),t.GetPt());
-    Double_t sz2=SigmaZ2(t.GetX(),t.GetTgl());
-    Double_t road=5.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2), y=t.GetY(), z=t.GetZ();
-
-    if (road>30) {
-      if (t>4) cerr<<t<<" FindProlongation warning: Too broad road !\n"; 
-      return 0;
-    }
-
-    if (row) {
-      for (Int_t i=row.Find(y-road); i<row; i++) {
-       AliTPCcluster* c=(AliTPCcluster*)(row[i]);
-       if (c->fY > y+road) break;
-       if (c->IsUsed()) continue;
-       if ((c->fZ - z)*(c->fZ - z) > 25.*(t.GetSigmaZ2() + sz2)) continue;
-       Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c);
-       if (chi2 > max_chi2) continue;
-       max_chi2=chi2;
-       cl=c;       
-      }
-    }
-    if (cl) {
-      t.Update(cl,max_chi2);
-      cl->fdEdX=sec->GetPadPitchWidth()*TMath::Sqrt((1+t.GetTgl()*t.GetTgl())/
-               (1-(t.GetC()*x-t.GetEta())*(t.GetC()*x-t.GetEta())));
-      try_again=ROWS_TO_SKIP;
-    } else {
-      if (try_again==0) break;
-      if (y > ymax) {
-         s = (s+1) % ns;
-         if (!t.Rotate(alpha)) return 0;
-      } else if (y <-ymax) {
-         s = (s-1+ns) % ns;
-         if (!t.Rotate(-alpha)) return 0;
-      }
-      try_again--;
-    }
-  }
-
-  return 1;
-
-}
-
-
-//_____________________________________________________________________________
-static void MakeSeeds(TObjArray& seeds,const AliTPCSector *sec, Int_t max_sec,
-Int_t i1, Int_t i2)
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function creates track seeds.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  TMatrix C(5,5); TVector x(5);
-  Double_t alpha=sec->GetAlpha(), shift=sec->GetAlphaShift();
-  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
-  for (Int_t ns=0; ns<max_sec; ns++) {
-    Int_t nl=sec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
-    Int_t nm=sec[ns][i2];
-    Int_t nu=sec[(ns+1)%max_sec][i2];
-    const AliTPCRow& r1=sec[ns][i1];
-    for (Int_t is=0; is < r1; is++) {
-      Double_t x1=sec->GetX(i1), y1=r1[is]->fY, z1=r1[is]->fZ;
-      for (Int_t js=0; js < nl+nm+nu; js++) {
-       const AliTPCcluster *cl;
-       Int_t ks;
-        Double_t x2=sec->GetX(i2), y2, z2, tmp;
-
-       if (js<nl) {
-         ks=(ns-1+max_sec)%max_sec;
-         const AliTPCRow& r2=sec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
-         cl=r2[js];
-          y2=cl->fY; z2=cl->fZ;
-          tmp= x2*cs+y2*sn;
-          y2 =-x2*sn+y2*cs; x2=tmp;
-       } else 
-         if (js<nl+nm) {
-           ks=ns;
-           const AliTPCRow& r2=sec[ns][i2];
-           cl=r2[js-nl];
-            y2=cl->fY; z2=cl->fZ;
-         } else {
-           ks=(ns+1)%max_sec;
-           const AliTPCRow& r2=sec[(ns+1)%max_sec][i2];
-           cl=r2[js-nl-nm];
-            y2=cl->fY; z2=cl->fZ;
-            tmp=x2*cs-y2*sn;
-            y2 =x2*sn+y2*cs; x2=tmp;
-         }
-
-        Double_t zz=z1 - z1/x1*(x1-x2); 
-        if (TMath::Abs(zz-z2)>5) continue;
-
-        Double_t d=(x2-x1)*(0.-y2)-(0.-x2)*(y2-y1);
-        if (d==0.) {cerr<<"MakeSeeds warning: Straight seed !\n"; continue;}
-
-        Double_t x3=0., y3=0.;//gRandom->Gaus(0.,TMath::Sqrt(cl->fSigmaY2));
-
-       x(0)=y1;
-       x(1)=z1;
-       x(2)=f1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
-       x(3)=f2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
-       x(4)=f3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
-       
-       if (TMath::Abs(x(2)*x1-x(3)) >= 0.999) continue;
-       
-       if (TMath::Abs(x(4)) > 1.2) continue;
-
-       Double_t a=asin(x(3));
-       Double_t zv=z1 - x(4)/x(2)*(a+asin(x(2)*x1-x(3)));
-       if (TMath::Abs(zv)>10.) continue; 
-
-       TMatrix X(6,6); X=0.; 
-       X(0,0)=r1[is]->fSigmaY2; X(1,1)=r1[is]->fSigmaZ2;
-       X(2,2)=cl->fSigmaY2;     X(3,3)=cl->fSigmaZ2;
-       X(4,4)=cl->fSigmaY2;     X(5,5)=cl->fSigmaZ2;
-       //X(4,4)=3./12.; X(5,5)=3./12.;
-       TMatrix F(5,6); F.UnitMatrix();
-       Double_t sy=sqrt(X(0,0)), sz=sqrt(X(1,1));
-       F(2,0)=(f1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x(2))/sy;
-       F(2,2)=(f1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x(2))/sy;
-       F(2,4)=(f1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x(2))/sy;
-       F(3,0)=(f2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x(3))/sy;
-       F(3,2)=(f2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x(3))/sy;
-       F(3,4)=(f2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x(3))/sy;
-       F(4,0)=(f3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x(4))/sy;
-       F(4,1)=(f3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x(4))/sz;
-       F(4,2)=(f3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x(4))/sy;
-       F(4,3)=(f3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x(4))/sz;
-       F(4,4)=0;
-       F(3,3)=0;
-       
-       TMatrix t(F,TMatrix::kMult,X);
-       C.Mult(t,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-
-       AliTPCtrack *track=new AliTPCtrack(r1[is], x, C, x1, ns*alpha+shift);
-        Int_t rc=FindProlongation(*track,sec,ns,i2);
-        if (rc<0 || *track<(i1-i2)/2) delete track;
-        else seeds.AddLast(track); 
-      }
-    }
-  }
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCParam *AliTPCSector::param;
-void AliTPC::Clusters2Tracks()
-{
+void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a track finder.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
   //-----------------------------------------------------------------
-  if (!fClusters) return;
-
-  AliTPCParam *p=fTPCParam;
-  AliTPCSector::SetParam(p);
-
-  const Int_t nis=p->GetNInnerSector()/2;
-  AliTPCSSector *ssec=new AliTPCSSector[nis];         
-  Int_t nrow_low=ssec->GetNRows();     
-
-  const Int_t nos=p->GetNOuterSector()/2;
-  AliTPCLSector *lsec=new AliTPCLSector[nos];
-  Int_t nrow_up=lsec->GetNRows();
-
-  Int_t ncl=fClusters->GetEntriesFast();
-  while (ncl--) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)fClusters->UncheckedAt(ncl);
-    Int_t sec=c->fSector, row=c->fPadRow;
-
-    if (sec<nis*2) {
-      ssec[sec%nis][row].InsertCluster(c);
-    } else {
-      sec -= nis*2;
-      lsec[sec%nos][row].InsertCluster(c);
-    }
-  }
-  
-  TObjArray seeds(20000);
-
-  Int_t nrows=nrow_low+nrow_up;
-  Int_t gap=Int_t(0.125*nrows), shift=Int_t(0.5*gap);
-  MakeSeeds(seeds, lsec, nos, nrow_up-1, nrow_up-1-gap);
-  MakeSeeds(seeds, lsec, nos, nrow_up-1-shift, nrow_up-1-shift-gap);
-    
-  seeds.Sort();
-
-  Int_t found=0;
-  Int_t nseed=seeds.GetEntriesFast();
-
-  for (Int_t s=0; s<nseed; s++) {
-    AliTPCtrack *pt=(AliTPCtrack*)seeds.UncheckedAt(s), &t=*pt;
-    Double_t alpha=t.GetAlpha();
-    if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
-    if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
-    Int_t ns=Int_t(alpha/lsec->GetAlpha())%nos;
-
-    if (!FindProlongation(t,lsec,ns)) continue;
-
-    alpha=t.GetAlpha() + 0.5*ssec->GetAlpha() - ssec->GetAlphaShift();
-    if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
-    if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
-    ns=Int_t(alpha/ssec->GetAlpha())%nis; //index of the inner sector needed
-
-    alpha=ns*ssec->GetAlpha() - t.GetAlpha();
-    if (!t.Rotate(alpha)) continue;
-    
-    if (!FindProlongation(t,ssec,ns)) continue;
-    
-    if (t >= Int_t(0.4*nrows)) {
-       AddTrack(t);
-       t.UseClusters();
-       cerr<<found++<<'\r';
-    }
-    delete pt; 
-  }  
-
-  delete[] ssec;
-  delete[] lsec;
-
+  AliTPCtracker::Clusters2Tracks(fTPCParam,of);
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::CreateMaterials()
 {
   //-----------------------------------------------
-  // Create Materials for for TPC
+  // Create Materials for for TPC simulations
   //-----------------------------------------------
 
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  Int_t ISXFLD=gAlice->Field()->Integ();
-  Float_t SXMGMX=gAlice->Field()->Max();
+  Int_t iSXFLD=gAlice->Field()->Integ();
+  Float_t sXMGMX=gAlice->Field()->Max();
 
   Float_t amat[5]; // atomic numbers
   Float_t zmat[5]; // z
   Float_t wmat[5]; // proportions
 
   Float_t density;
+  Float_t apure[2];
 
-  //  ********************* Gases *******************
 
-  //--------------------------------------------------------------
+  //***************** Gases *************************
+  
+  //-------------------------------------------------
   // pure gases
-  //--------------------------------------------------------------
+  //-------------------------------------------------
 
-  // Ne
+  // Neon
 
 
-  Float_t a_ne = 20.18;
-  Float_t z_ne = 10.;
-  
+  amat[0]= 20.18;
+  zmat[0]= 10.;  
   density = 0.0009;
+  apure[0]=amat[0];
 
-  AliMaterial(20,"Ne",a_ne,z_ne,density,999.,999.);
+  AliMaterial(20,"Ne",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  // Ar
+  // Argon
 
-  Float_t a_ar = 39.948;
-  Float_t z_ar = 18.;
+  amat[0]= 39.948;
+  zmat[0]= 18.;  
+  density = 0.001782;  
 
-  density = 0.001782;
-  AliMaterial(21,"Ar",a_ar,z_ar,density,999.,999.);
+  apure[1]=amat[0];
 
-  Float_t a_pure[2];
-  
-  a_pure[0] = a_ne;
-  a_pure[1] = a_ar;
-  
+  AliMaterial(21,"Ar",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
   //--------------------------------------------------------------
   // gases - compounds
@@ -691,7 +349,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   Float_t amol[3];
 
-  //  CO2
+  // CO2
 
   amat[0]=12.011;
   amat[1]=15.9994;
@@ -707,7 +365,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   amol[0] = amat[0]*wmat[0]+amat[1]*wmat[1];
 
   AliMixture(10,"CO2",amat,zmat,density,-2,wmat);
-
+  
   // CF4
 
   amat[0]=12.011;
@@ -725,6 +383,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   AliMixture(11,"CF4",amat,zmat,density,-2,wmat); 
 
+
   // CH4
 
   amat[0]=12.011;
@@ -745,15 +404,14 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   //----------------------------------------------------------------
   // gases - mixtures, ID >= 20 pure gases, <= 10 ID < 20 -compounds
   //----------------------------------------------------------------
-  char namate[21];
+
+  char namate[21]; 
   density = 0.;
   Float_t am=0;
   Int_t nc;
-
-  Float_t a,z,rho,absl,X0,buf[1];
+  Float_t rho,absl,X0,buf[1];
   Int_t nbuf;
+  Float_t a,z;
 
   for(nc = 0;nc<fNoComp;nc++)
     {
@@ -767,7 +425,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
  
-      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? a_pure[nnc] : amol[nnc]); 
+      am += fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? apure[nnc] : amol[nnc]); 
       density += fMixtProp[nc]*rho;  // density of the mixture
       
     }
@@ -779,41 +437,92 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
       Int_t nnc = (fMixtComp[nc]>=20) ? fMixtComp[nc]%20 : fMixtComp[nc]%10;
 
-      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? a_pure[nnc] : amol[nnc])/am;
+      wmat[nc] = fMixtProp[nc]*((fMixtComp[nc]>=20) ? 
+                 apure[nnc] : amol[nnc])/am;
+
+    } 
+
+  // Drift gases 1 - nonsensitive, 2 - sensitive
 
-    }  
-  
   AliMixture(31,"Drift gas 1",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
   AliMixture(32,"Drift gas 2",amat,zmat,density,fNoComp,wmat);
-  AliMixture(33,"Drift gas 3",amat,zmat,density,fNoComp,wmat); 
 
-  AliMedium(2, "Drift gas 1", 31, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-  AliMedium(3, "Drift gas 2", 32, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-  AliMedium(4, "Drift gas 3", 33, 1, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
 
-  // Air 
+  // Air
+
+  amat[0] = 14.61;
+  zmat[0] = 7.3;
+  density = 0.001205;
 
-  AliMaterial(24, "Air", 14.61, 7.3, .001205, 30420., 67500.);
+  AliMaterial(24,"Air",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
 
-  AliMedium(24, "Air", 24, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .1, .1);
 
   //----------------------------------------------------------------------
   //               solid materials
   //----------------------------------------------------------------------
 
-  // Al
 
-  AliMaterial(30, "Al", 26.98, 13., 2.7, 8.9, 37.2);
+  // Kevlar C14H22O2N2
 
-  AliMedium(0, "Al",30, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .1,   .1);
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+  amat[3] = 14.006;
 
-  // Si
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+  zmat[3] = 7.;
+
+  wmat[0] = 14.;
+  wmat[1] = 22.;
+  wmat[2] = 2.;
+  wmat[3] = 2.;
+
+  density = 1.45;
 
-  AliMaterial(31, "Si", 28.086, 14.,2.33, 9.36, 999.);
+  AliMixture(34,"Kevlar",amat,zmat,density,-4,wmat);  
 
-  AliMedium(7, "Al",31, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .1,   .1);
+  // NOMEX
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+  amat[3] = 14.006;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+  zmat[3] = 7.;
+
+  wmat[0] = 14.;
+  wmat[1] = 22.;
+  wmat[2] = 2.;
+  wmat[3] = 2.;
+
+  density = 0.03;
+
+  
+  AliMixture(35,"NOMEX",amat,zmat,density,-4,wmat);
+
+  // Makrolon C16H18O3
+
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 15.999;
+
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 8.;
+
+  wmat[0] = 16.;
+  wmat[1] = 18.;
+  wmat[2] = 3.;
   
+  density = 1.2;
 
+  AliMixture(36,"Makrolon",amat,zmat,density,-3,wmat);
+  
   // Mylar C5H4O2
 
   amat[0]=12.011;
@@ -830,23 +539,9 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   density = 1.39;
   
-  AliMixture(32, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat);
-
-  AliMedium(5, "Mylar",32, 0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
-
-
+  AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
 
-
-  // Carbon (normal)
-
-  AliMaterial(33,"C normal",12.011,6.,2.265,18.8,999.);
-
-  AliMedium(6,"C normal",33,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
-
-  // G10 for inner and outr field cage
-  // G10 is 60% SiO2 + 40% epoxy, right now I use A and Z for SiO2
-
-  Float_t rhoFactor;
+  // G10 60% SiO2 + 40% epoxy, I use A and Z for SiO2
 
   amat[0]=28.086;
   amat[1]=15.9994;
@@ -858,275 +553,118 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   wmat[1]=2.;
 
   density = 1.7;
-  
 
-  AliMixture(34,"G10 aux.",amat,zmat,density,-2,wmat);
+  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
 
+  AliMaterial(39,"G10",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[34],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
+  // Al
 
-  Float_t thickX0 = 0.0052; // field cage in X0 units
-  
-  Float_t thick = 2.; // in cm
+  amat[0] = 26.98;
+  zmat[0] = 13.;
 
-  X0=19.4; // G10 
+  density = 2.7;
 
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  AliMaterial(40,"Al",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  AliMaterial(35,"G10-fc",a,z,density,999.,999.);
+  // Si
 
-  AliMedium(8,"G10-fc",35,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  amat[0] = 28.086;
+  zmat[0] = 14.,
 
-  thickX0 = 0.0027; // inner vessel (eta <0.9)
-  thick=0.5;
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  density = 2.33;
 
-  AliMaterial(36,"G10-iv",a,z,density,999.,999.);  
+  AliMaterial(41,"Si",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  AliMedium(9,"G10-iv",36,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  // Cu
 
-  //  Carbon fibre  
-  
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[33],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
+  amat[0] = 63.546;
+  zmat[0] = 29.;
 
-  thickX0 = 0.0133; // outer vessel
-  thick=3.0;
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  density = 8.96;
 
+  AliMaterial(42,"Cu",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
 
-  AliMaterial(37,"C-ov",a,z,density,999.,999.);
+  // Tedlar C2H3F
 
-  AliMedium(10,"C-ov",37,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);  
+  amat[0] = 12.011;
+  amat[1] = 1.;
+  amat[2] = 18.998;
 
-  thickX0=0.015; // inner vessel (cone, eta > 0.9)
-  thick=1.5;
-  rhoFactor = X0*thickX0/thick;
-  density = rho*rhoFactor;
+  zmat[0] = 6.;
+  zmat[1] = 1.;
+  zmat[2] = 9.;
 
-  AliMaterial(38,"C-ivc",a,z,density,999.,999.);
+  wmat[0] = 2.;
+  wmat[1] = 3.; 
+  wmat[2] = 1.;
 
-  AliMedium(11,"C-ivc",38,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., .1, .1, .001, .01);
+  density = 1.71;
 
-  //
+  AliMixture(43, "Tedlar",amat,zmat,density,-3,wmat);  
 
-  AliMedium(12,"CO2",10,0, ISXFLD, SXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001);
-    
-}
 
-//_____________________________________________________________________________
-struct Bin {
-   UShort_t q;
-   UInt_t mask;
-   Bin();
-};
-Bin::Bin() {q=0; mask=0xFFFFFFFE;}
-
-struct Peak {
-   Int_t k;
-   UInt_t mask;
-};
-inline Bool_t IsMaximum(Int_t k, Int_t max, const Bin *bins) {
-  UShort_t q=bins[k].q;
-  if (q==1023) return kFALSE;
-  if (bins[k-max].q > q) return kFALSE;
-  if (bins[k-1  ].q > q) return kFALSE; 
-  if (bins[k+max].q > q) return kFALSE; 
-  if (bins[k+1  ].q > q) return kFALSE; 
-  if (bins[k-max-1].q > q) return kFALSE;
-  if (bins[k+max-1].q > q) return kFALSE; 
-  if (bins[k+max+1].q > q) return kFALSE; 
-  if (bins[k-max+1].q > q) return kFALSE;
-  return kTRUE; 
-}
-static void FindPeaks(Int_t k, Int_t max, Bin *bins, Peak *peaks, Int_t& n) {
-//if (n>=31) return;
-  if (n<31)
-  if (IsMaximum(k,max,bins)) {
-    peaks[n].k=k; peaks[n].mask=(2<<n);
-    n++;
-  }
-  bins[k].mask=0;
-  if (bins[k-max].mask&1) FindPeaks(k-max,max,bins,peaks,n);
-  if (bins[k-1  ].mask&1) FindPeaks(k-1  ,max,bins,peaks,n);
-  if (bins[k+max].mask&1) FindPeaks(k+max,max,bins,peaks,n);
-  if (bins[k+1  ].mask&1) FindPeaks(k+1  ,max,bins,peaks,n);
-}
+  // Plexiglas  C5H8O2
+
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
 
-static void MarkPeak(Int_t k, Int_t max, Bin *bins, UInt_t m) {
-  UShort_t q=bins[k].q;
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
 
-  bins[k].mask |= m; 
+  wmat[0]=5.;
+  wmat[1]=8.;
+  wmat[2]=2.;
 
-  if (bins[k-max].q <= q)
-     if ((bins[k-max].mask&m) == 0) MarkPeak(k-max,max,bins,m);
-  if (bins[k-1  ].q <= q)
-     if ((bins[k-1  ].mask&m) == 0) MarkPeak(k-1  ,max,bins,m);
-  if (bins[k+max].q <= q)
-     if ((bins[k+max].mask&m) == 0) MarkPeak(k+max,max,bins,m);
-  if (bins[k+1  ].q <= q)
-     if ((bins[k+1  ].mask&m) == 0) MarkPeak(k+1  ,max,bins,m);
-}
+  density=1.18;
+
+  AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
-static void MakeCluster(Int_t k,Int_t max,Bin *bins,UInt_t m,AliTPCcluster &c){
-  Float_t q=(Float_t)bins[k].q;
-  Int_t i=k/max, j=k-i*max;
-  c.fY += i*q;
-  c.fZ += j*q;
-  c.fSigmaY2 += i*i*q;
-  c.fSigmaZ2 += j*j*q;
-  c.fQ += q;
 
-  bins[k].mask = 0xFFFFFFFE;
+
+  //----------------------------------------------------------
+  // tracking media for gases
+  //----------------------------------------------------------
+
+  AliMedium(0, "Air", 24, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .01, .1);
+  AliMedium(1, "Drift gas 1", 31, 0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(2, "Drift gas 2", 32, 1, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1,.001, .001);
+  AliMedium(3,"CO2",10,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999.,.1, .001, .001); 
+
+  //-----------------------------------------------------------  
+  // tracking media for solids
+  //-----------------------------------------------------------
   
-  if (bins[k-max].mask == m) MakeCluster(k-max,max,bins,m,c);
-  if (bins[k-1  ].mask == m) MakeCluster(k-1  ,max,bins,m,c);
-  if (bins[k+max].mask == m) MakeCluster(k+max,max,bins,m,c);
-  if (bins[k+1  ].mask == m) MakeCluster(k+1  ,max,bins,m,c);
+  AliMedium(4,"Al",40,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(5,"Kevlar",34,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(6,"Nomex",35,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(7,"Makrolon",36,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(8,"Mylar",37,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(9,"Tedlar",43,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(10,"Cu",42,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+    
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Digits2Clusters()
+
+void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of)
 {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a simple cluster finder.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCParam *par = fTPCParam;
-  const Int_t MAXZ=par->GetMaxTBin()+2;
-
-  TTree *t = (TTree *)gDirectory->Get("TreeD_75x40_100x60");
-  AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
-  t->GetBranch("Segment")->SetAddress(&dummy);
-  Stat_t sectors_by_rows = t->GetEntries();
-  for (Int_t n=0; n<sectors_by_rows; n++) {
-    t->GetEvent(n);
-    Int_t sec, row;
-    if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
-       cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
-       continue;
-    }
-
-    Float_t rx=par->GetPadRowRadii(sec,row);
-
-    Int_t npads, sign;
-    {
-       Int_t nis=par->GetNInnerSector(), nos=par->GetNOuterSector();
-       if (sec < nis) {
-          npads = par->GetNPadsLow(row);
-          sign = (sec < nis/2) ? 1 : -1;
-       } else {
-          npads = par->GetNPadsUp(row);
-          sign = ((sec-nis) < nos/2) ? 1 : -1;
-       }
-    }
-
-    const Int_t MAXBIN=MAXZ*(npads+2);
-    Bin *bins=new Bin[MAXBIN];
-
-    digarr.First();
-    do {
-       Short_t dig=digarr.CurrentDigit();
-       if (dig<=par->GetZeroSup()) continue;
-       Int_t j=digarr.CurrentRow()+1, i=digarr.CurrentColumn()+1;
-       bins[i*MAXZ+j].q=dig;
-       bins[i*MAXZ+j].mask=1;
-    } while (digarr.Next());
-
-    Int_t ncl=0;
-    for (Int_t i=0; i<MAXBIN; i++) {
-      if ((bins[i].mask&1) == 0) continue;
-      Peak peaks[32]; Int_t npeaks=0;
-      FindPeaks(i, MAXZ, bins, peaks, npeaks);
-
-      if (npeaks>30) continue;
-
-      Int_t k,l;
-      for (k=0; k<npeaks-1; k++){//mark adjacent peaks
-        if (peaks[k].k < 0) continue; //this peak is already removed
-        for (l=k+1; l<npeaks; l++) {
-           if (peaks[l].k < 0) continue; //this peak is already removed
-           Int_t ki=peaks[k].k/MAXZ, kj=peaks[k].k - ki*MAXZ;
-           Int_t li=peaks[l].k/MAXZ, lj=peaks[l].k - li*MAXZ;
-           Int_t di=TMath::Abs(ki - li);
-           Int_t dj=TMath::Abs(kj - lj);
-           if (di>1 || dj>1) continue;
-           if (bins[peaks[k].k].q > bins[peaks[l].k].q) {
-              peaks[l].mask=peaks[k].mask;
-              peaks[l].k*=-1;
-           } else {
-              peaks[k].mask=peaks[l].mask;
-              peaks[k].k*=-1;
-              break;
-           } 
-        }
-      }
-
-      for (k=0; k<npeaks; k++) {
-        MarkPeak(TMath::Abs(peaks[k].k), MAXZ, bins, peaks[k].mask);
-      }
-        
-      for (k=0; k<npeaks; k++) {
-         if (peaks[k].k < 0) continue; //removed peak
-         AliTPCcluster c;
-         MakeCluster(peaks[k].k, MAXZ, bins, peaks[k].mask, c);
-         if (c.fQ < 5) continue; //noise cluster
-         c.fY /= c.fQ;
-         c.fZ /= c.fQ;
-
-         Double_t s2 = c.fSigmaY2/c.fQ - c.fY*c.fY;
-         c.fSigmaY2 = s2 + 1./12.;
-         c.fSigmaY2 *= par->GetPadPitchWidth(sec)*par->GetPadPitchWidth(sec);
-         if (s2 != 0.) {
-            c.fSigmaY2 *= 0.064*1.3*1.3;
-            if (sec<par->GetNInnerSector()) c.fSigmaY2 *= 1.44*1.44;
-         }
-
-         s2 = c.fSigmaZ2/c.fQ - c.fZ*c.fZ;
-         c.fSigmaZ2 = s2 + 1./12.;
-         c.fSigmaZ2 *= par->GetZWidth()*par->GetZWidth();
-         if (s2 != 0.) {
-            c.fSigmaZ2 *= 0.10*1.3*1.3;
-            if (sec<par->GetNInnerSector()) c.fSigmaZ2 *= 1.33*1.33;
-         }
-
-         c.fY = (c.fY - 0.5 - 0.5*npads)*par->GetPadPitchWidth(sec);
-         c.fZ = par->GetZWidth()*(c.fZ-1); 
-         c.fZ -= 3.*par->GetZSigma(); // PASA delay 
-         c.fZ = sign*(z_end - c.fZ);
-
-         if (rx<230./250.*TMath::Abs(c.fZ)) continue;
-
-         c.fSector=sec;
-         c.fPadRow=row;
-         Int_t ki=peaks[k].k/MAXZ, kj=peaks[k].k - ki*MAXZ;
-         c.fTracks[0]=digarr.GetTrackID(kj-1,ki-1,0);
-         c.fTracks[1]=digarr.GetTrackID(kj-1,ki-1,1);
-         c.fTracks[2]=digarr.GetTrackID(kj-1,ki-1,2);
-
-         c.fQ=bins[peaks[k].k].q;
-
-         if (ki==1 || ki==npads || kj==1 || kj==MAXZ-2) {
-           c.fSigmaY2 *= 25.;
-           c.fSigmaZ2 *= 4.;
-         }
-
-         AddCluster(c); ncl++;
-      }
-    }
-
-    cerr<<"sector, row, compressed digits, clusters: "
-    <<sec<<' '<<row<<' '<<digarr.GetSize()<<' '<<ncl<<"                  \r";
-        
-    delete[] bins;  
-  }
+  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of);
 }
 
+extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
+extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2Clusters()
+void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
 {
   //--------------------------------------------------------
   // TPC simple cluster generator from hits
@@ -1137,17 +675,44 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
+  // Adopted to Marian's cluster data structure by I.Belikov, CERN,
+  // Jouri.Belikov@cern.ch
+  //----------------------------------------------------------------
+  
+  /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+  //
+  //---------------------------------------------------------------------
+  //   ALICE TPC Cluster Parameters
+  //--------------------------------------------------------------------
+       
+  
+
+  // Cluster width in rphi
+  const Float_t kACrphi=0.18322;
+  const Float_t kBCrphi=0.59551e-3;
+  const Float_t kCCrphi=0.60952e-1;
+  // Cluster width in z
+  const Float_t kACz=0.19081;
+  const Float_t kBCz=0.55938e-3;
+  const Float_t kCCz=0.30428;
+
+  TDirectory *savedir=gDirectory; 
+
+  if (!of->IsOpen()) {
+     cerr<<"AliTPC::Hits2Clusters(): output file not open !\n";
+     return;
+  }
 
    if(fTPCParam == 0){
      printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
      return;
    }
 
-  Float_t sigma_rphi,sigma_z,cl_rphi,cl_z;
+  Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
   //
   TParticle *particle; // pointer to a given particle
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  TClonesArray *Particles; //pointer to the particle list
+  TClonesArray *particles; //pointer to the particle list
   Int_t sector,nhits;
   Int_t ipart;
   Float_t xyz[5];
@@ -1158,8 +723,20 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
   //  Get the access to the tracks 
   //---------------------------------------------------------------
   
-  TTree *TH = gAlice->TreeH();
-  Stat_t ntracks = TH->GetEntries();
+  TTree *tH = gAlice->TreeH();
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+  particles=gAlice->Particles();
+
+  //Switch to the output file
+  of->cd();
+
+  fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
+  AliTPCClustersArray carray;
+  carray.Setup(fTPCParam);
+  carray.SetClusterType("AliTPCcluster");
+  carray.MakeTree();
+
+  Int_t nclusters=0; //cluster counter
   
   //------------------------------------------------------------
   // Loop over all sectors (72 sectors for 20 deg
@@ -1180,13 +757,11 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
     
     for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
       ResetHits();
-      TH->GetEvent(track);
+      tH->GetEvent(track);
       //
-      //  Get number of the TPC hits and a pointer
-      //  to the particles
+      //  Get number of the TPC hits
       //
       nhits=fHits->GetEntriesFast();
-      Particles=gAlice->Particles();
       //
       // Loop over hits
       //
@@ -1196,7 +771,7 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
        sector=tpcHit->fSector; // sector number
        if(sector != isec) continue; //terminate iteration
        ipart=tpcHit->fTrack;
-       particle=(TParticle*)Particles->UncheckedAt(ipart);
+       particle=(TParticle*)particles->UncheckedAt(ipart);
        pl=particle->Pz();
        pt=particle->Pt();
        if(pt < 1.e-9) pt=1.e-9;
@@ -1204,23 +779,23 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
        tanth = TMath::Abs(tanth);
        rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->fX*tpcHit->fX + tpcHit->fY*tpcHit->fY);
        ratio=0.001*rpad/pt; // pt must be in MeV/c - historical reason
-       
+
        //   space-point resolutions
        
-       sigma_rphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
-       sigma_z   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
+       sigmaRphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
+       sigmaZ   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
        
        //   cluster widths
        
-       cl_rphi=ac_rphi-bc_rphi*rpad*tanth+cc_rphi*ratio*ratio;
-       cl_z=ac_z-bc_z*rpad*tanth+cc_z*tanth*tanth;
+       clRphi=kACrphi-kBCrphi*rpad*tanth+kCCrphi*ratio*ratio;
+       clZ=kACz-kBCz*rpad*tanth+kCCz*tanth*tanth;
        
        // temporary protection
        
-       if(sigma_rphi < 0.) sigma_rphi=0.4e-3;
-       if(sigma_z < 0.) sigma_z=0.4e-3;
-       if(cl_rphi < 0.) cl_rphi=2.5e-3;
-       if(cl_z < 0.) cl_z=2.5e-5;
+       if(sigmaRphi < 0.) sigmaRphi=0.4e-3;
+       if(sigmaZ < 0.) sigmaZ=0.4e-3;
+       if(clRphi < 0.) clRphi=2.5e-3;
+       if(clZ < 0.) clZ=2.5e-5;
        
        //
        
@@ -1228,21 +803,46 @@ void AliTPC::Hits2Clusters()
        // smearing --> rotate to the 1 (13) or to the 25 (49) sector,
        // then the inaccuracy in a X-Y plane is only along Y (pad row)!
        //
-       //Float_t xprim= tpcHit->fX*cph + tpcHit->fY*sph;
+        Float_t xprim= tpcHit->fX*cph + tpcHit->fY*sph;
        Float_t yprim=-tpcHit->fX*sph + tpcHit->fY*cph;
-       xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigma_rphi));   // y
-       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->fZ,TMath::Sqrt(sigma_z)); // z 
+       xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigmaRphi));   // y
+          Float_t alpha=(isec < fTPCParam->GetNInnerSector()) ?
+         fTPCParam->GetInnerAngle() : fTPCParam->GetOuterAngle();
+          Float_t ymax=xprim*TMath::Tan(0.5*alpha);
+          if (TMath::Abs(xyz[0])>ymax) xyz[0]=yprim; 
+       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->fZ,TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
+          if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->fZ; 
        xyz[2]=tpcHit->fQ;                                     // q
-       xyz[3]=sigma_rphi;                                     // fSigmaY2
-       xyz[4]=sigma_z;                                        // fSigmaZ2
-       
-        Int_t tracks[5]={tpcHit->fTrack, -1, -1, sector, tpcHit->fPadRow};
-       AddCluster(xyz,tracks);
-       
+       xyz[3]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
+       xyz[4]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
+
+        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(sector,tpcHit->fPadRow);
+        if (!clrow) clrow=carray.CreateRow(sector,tpcHit->fPadRow);    
+
+        Int_t tracks[3]={tpcHit->fTrack, -1, -1};
+       AliTPCcluster cluster(xyz,tracks);
+
+        clrow->InsertCluster(&cluster); nclusters++;
+
       } // end of loop over hits
-    }   // end of loop over tracks     
-    
+
+    }   // end of loop over tracks
+
+    Int_t nrows=fTPCParam->GetNRow(isec);
+    for (Int_t irow=0; irow<nrows; irow++) {
+        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(isec,irow);
+        if (!clrow) continue;
+        carray.StoreRow(isec,irow);
+        carray.ClearRow(isec,irow);
+    }
+
   } // end of loop over sectors  
+
+  cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
+
+  carray.GetTree()->Write();
+
+  savedir->cd(); //switch back to the input file
   
 } // end of function
 
@@ -1264,13 +864,13 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   //
   TParticle *particle; // pointer to a given particle
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  TClonesArray *Particles; //pointer to the particle list
+  TClonesArray *particles; //pointer to the particle list
   Int_t sector,nhits;
   Int_t ipart;
-  const Int_t cmaxhits=30000;
-  TVector * xxxx = new TVector(cmaxhits*4);
+  const Int_t kcmaxhits=30000;
+  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
   TVector & xxx = *xxxx;
-  Int_t maxhits = cmaxhits;
+  Int_t maxhits = kcmaxhits;
   //construct array for each padrow
   for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
     fClustersArray->CreateRow(isec,i);
@@ -1279,10 +879,10 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   //  Get the access to the tracks 
   //---------------------------------------------------------------
   
-  TTree *TH = gAlice->TreeH();
-  Stat_t ntracks = TH->GetEntries();
-  Particles=gAlice->Particles();
-  Int_t npart = Particles->GetEntriesFast();
+  TTree *tH = gAlice->TreeH();
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+  particles=gAlice->Particles();
+  Int_t npart = particles->GetEntriesFast();
     
   //------------------------------------------------------------
   // Loop over tracks
@@ -1290,7 +890,7 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   
   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
     ResetHits();
-    TH->GetEvent(track);
+    tH->GetEvent(track);
     //
     //  Get number of the TPC hits and a pointer
     //  to the particles
@@ -1307,7 +907,7 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
       sector=tpcHit->fSector; // sector number
       if(sector != isec) continue; 
       ipart=tpcHit->fTrack;
-      if (ipart<npart) particle=(TParticle*)Particles->UncheckedAt(ipart);
+      if (ipart<npart) particle=(TParticle*)particles->UncheckedAt(ipart);
       
       //find row number
 
@@ -1318,7 +918,7 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
       if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
       if (currentrow==lastrow){
        if ( currentIndex>=maxhits){
-         maxhits+=cmaxhits;
+         maxhits+=kcmaxhits;
          xxx.ResizeTo(4*maxhits);
        }     
        xxx(currentIndex*4)=x[0];
@@ -1358,7 +958,7 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
            sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;   
            sumq+=xxx(index*4+3);
          }
-         Float_t CentralPad = (fTPCParam->GetNPads(isec,lastrow)-1)/2;
+         Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(isec,lastrow)-1)/2;
          Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
            sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
          
@@ -1372,7 +972,7 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
          Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
            sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
          
-         Float_t y=detay/det+CentralPad;
+         Float_t y=detay/det+centralPad;
          Float_t z=detaz/det;  
          Float_t by=detby/det; //y angle
          Float_t bz=detbz/det; //z angle
@@ -1438,8 +1038,8 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
   //-------------------------------------------------------
 
 
-  TTree *TH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
-  Stat_t ntracks = TH->GetEntries();
+  TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
+  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
 
   if( ntracks > 0){
 
@@ -1455,7 +1055,7 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
       row= new TObjArray* [nrows];
     
-      MakeSector(isec,nrows,TH,ntracks,row);
+      MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
 
       //--------------------------------------------------------
       //   Digitize this sector, row by row
@@ -1476,7 +1076,7 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
        fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
-       Int_t ndig = dig->GetSize(); 
+       Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
  
        printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);
        
@@ -1515,26 +1115,26 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   fCurrentIndex[1]= isec;
   
 
-  Int_t n_of_pads = fTPCParam->GetNPads(isec,irow);
-  Int_t n_of_tbins = fTPCParam->GetMaxTBin();
-  Int_t IndexRange[4];
+  Int_t nofPads = fTPCParam->GetNPads(isec,irow);
+  Int_t nofTbins = fTPCParam->GetMaxTBin();
+  Int_t indexRange[4];
   //
   //  Integrated signal for this row
   //  and a single track signal
   //    
-  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,n_of_pads,0,n_of_tbins); // integrated
-  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,n_of_pads,0,n_of_tbins); // single
+  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
+  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
   //
-  TMatrix &Total  = *m1;
+  TMatrix &total  = *m1;
 
   //  Array of pointers to the label-signal list
 
-  Int_t NofDigits = n_of_pads*n_of_tbins; // number of digits for this row
-  Float_t  **pList = new Float_t* [NofDigits]; 
+  Int_t nofDigits = nofPads*nofTbins; // number of digits for this row
+  Float_t  **pList = new Float_t* [nofDigits]; 
 
   Int_t lp;
   Int_t i1;   
-  for(lp=0;lp<NofDigits;lp++)pList[lp]=0; // set all pointers to NULL
+  for(lp=0;lp<nofDigits;lp++)pList[lp]=0; // set all pointers to NULL
   //
   //calculate signal 
   //
@@ -1547,29 +1147,29 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
       fCurrentIndex[3]=irow;
       if (row==irow){
        m2->Zero();  // clear single track signal matrix
-       Float_t TrackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,IndexRange); 
-       GetList(TrackLabel,n_of_pads,m2,IndexRange,pList);
+       Float_t trackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,indexRange); 
+       GetList(trackLabel,nofPads,m2,indexRange,pList);
       }
-      else   GetSignal(rows[row],i1,0,m1,IndexRange);
+      else   GetSignal(rows[row],i1,0,m1,indexRange);
     }
   }
          
   Int_t tracks[3];
 
   AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
-  for(Int_t ip=0;ip<n_of_pads;ip++){
-    for(Int_t it=0;it<n_of_tbins;it++){
+  for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
+    for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
 
-      Float_t q = Total(ip,it);
+      Float_t q = total(ip,it);
 
-      Int_t gi =it*n_of_pads+ip; // global index
+      Int_t gi =it*nofPads+ip; // global index
 
       q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
 
       q = (Int_t)q;
 
       if(q <=zerosup) continue; // do not fill zeros
-      if(q > adc_sat) q = adc_sat;  // saturation
+      if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
 
       //
       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
@@ -1601,7 +1201,7 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //  This row has been digitized, delete nonused stuff
   //
 
-  for(lp=0;lp<NofDigits;lp++){
+  for(lp=0;lp<nofDigits;lp++){
     if(pList[lp]) delete [] pList[lp];
   }
   
@@ -1616,7 +1216,7 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 //_____________________________________________________________________________
 
 Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
-                          Int_t *IndexRange)
+                          Int_t *indexRange)
 {
 
   //---------------------------------------------------------------
@@ -1636,13 +1236,13 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   TVector &v = *tv;
   
   Float_t label = v(0);
-  Int_t CentralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3])-1)/2;
+  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3])-1)/2;
 
   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
-  IndexRange[0]=9999; // min pad
-  IndexRange[1]=-1; // max pad
-  IndexRange[2]=9999; //min time
-  IndexRange[3]=-1; // max time
+  indexRange[0]=9999; // min pad
+  indexRange[1]=-1; // max pad
+  indexRange[2]=9999; //min time
+  indexRange[3]=-1; // max time
 
   //  Float_t IneffFactor = 0.5; // inefficiency in the gain close to the edge, as above
 
@@ -1660,7 +1260,7 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
     
     if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){
        Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(i);        
-       Int_t pad=index[1]+CentralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
+       Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
        if ( ( pad<(fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]))) && (pad>0)) {
         Int_t time=index[2];    
         Float_t weight = fTPCParam->GetResWeight(i); //we normalise response to ADC channel
@@ -1668,10 +1268,10 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
         
         if (m1!=0) signal(pad,time)+=weight; 
         total(pad,time)+=weight;
-        IndexRange[0]=TMath::Min(IndexRange[0],pad);
-        IndexRange[1]=TMath::Max(IndexRange[1],pad);
-        IndexRange[2]=TMath::Min(IndexRange[2],time);
-        IndexRange[3]=TMath::Max(IndexRange[3],time); 
+        indexRange[0]=TMath::Min(indexRange[0],pad);
+        indexRange[1]=TMath::Max(indexRange[1],pad);
+        indexRange[2]=TMath::Min(indexRange[2],time);
+        indexRange[3]=TMath::Max(indexRange[3],time); 
        }        
     }
   } // end of loop over electrons
@@ -1680,7 +1280,7 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
+void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
                      Float_t **pList)
 {
   //----------------------------------------------------------------------
@@ -1695,8 +1295,8 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
 
   // lop over nonzero digits
 
-  for(Int_t it=IndexRange[2];it<IndexRange[3]+1;it++){
-    for(Int_t ip=IndexRange[0];ip<IndexRange[1]+1;ip++){
+  for(Int_t it=indexRange[2];it<indexRange[3]+1;it++){
+    for(Int_t ip=indexRange[0];ip<indexRange[1]+1;ip++){
 
 
         // accept only the contribution larger than 500 electrons (1/2 s_noise)
@@ -1704,36 +1304,36 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
         if(signal(ip,it)<0.5) continue; 
 
 
-        Int_t GlobalIndex = it*np+ip; // GlobalIndex starts from 0!
+        Int_t globalIndex = it*np+ip; // globalIndex starts from 0!
         
-        if(!pList[GlobalIndex]){
+        if(!pList[globalIndex]){
         
           // 
          // Create new list (6 elements - 3 signals and 3 labels),
          //
 
-          pList[GlobalIndex] = new Float_t [6];
+          pList[globalIndex] = new Float_t [6];
 
          // set list to -1 
 
-          *pList[GlobalIndex] = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+1) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+2) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+3) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+4) = -1.;
-          *(pList[GlobalIndex]+5) = -1.;
+          *pList[globalIndex] = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+1) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+2) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+3) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+4) = -1.;
+          *(pList[globalIndex]+5) = -1.;
 
 
-          *pList[GlobalIndex] = label;
-          *(pList[GlobalIndex]+3) = signal(ip,it);
+          *pList[globalIndex] = label;
+          *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
         }
         else{
 
          // check the signal magnitude
 
-          Float_t highest = *(pList[GlobalIndex]+3);
-          Float_t middle = *(pList[GlobalIndex]+4);
-          Float_t lowest = *(pList[GlobalIndex]+5);
+          Float_t highest = *(pList[globalIndex]+3);
+          Float_t middle = *(pList[globalIndex]+4);
+          Float_t lowest = *(pList[globalIndex]+5);
 
          //
          //  compare the new signal with already existing list
@@ -1744,24 +1344,24 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *IndexRange,
          //
 
           if (signal(ip,it)>highest){
-            *(pList[GlobalIndex]+5) = middle;
-            *(pList[GlobalIndex]+4) = highest;
-            *(pList[GlobalIndex]+3) = signal(ip,it);
+            *(pList[globalIndex]+5) = middle;
+            *(pList[globalIndex]+4) = highest;
+            *(pList[globalIndex]+3) = signal(ip,it);
 
-            *(pList[GlobalIndex]+2) = *(pList[GlobalIndex]+1);
-            *(pList[GlobalIndex]+1) = *pList[GlobalIndex];
-            *pList[GlobalIndex] = label;
+            *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
+            *(pList[globalIndex]+1) = *pList[globalIndex];
+            *pList[globalIndex] = label;
          }
           else if (signal(ip,it)>middle){
-            *(pList[GlobalIndex]+5) = middle;
-            *(pList[GlobalIndex]+4) = signal(ip,it);
+            *(pList[globalIndex]+5) = middle;
+            *(pList[globalIndex]+4) = signal(ip,it);
 
-            *(pList[GlobalIndex]+2) = *(pList[GlobalIndex]+1);
-            *(pList[GlobalIndex]+1) = label;
+            *(pList[globalIndex]+2) = *(pList[globalIndex]+1);
+            *(pList[globalIndex]+1) = label;
          }
           else{
-            *(pList[GlobalIndex]+5) = signal(ip,it);
-            *(pList[GlobalIndex]+2) = label;
+            *(pList[globalIndex]+5) = signal(ip,it);
+            *(pList[globalIndex]+2) = label;
          }
         }
 
@@ -1798,11 +1398,15 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   // of electrons, one TVector per each track.
   //---------------------------------------------- 
     
+  Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
+  TVector **tracks = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
   for(i=0; i<nrows; i++){
     row[i] = new TObjArray;
+    nofElectrons[i]=0;
+    tracks[i]=0;
   }
-  Int_t *n_of_electrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
-  TVector **tracks = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
+
 
   //--------------------------------------------------------------------
   //  Loop over tracks, the "track" contains the full history
@@ -1838,10 +1442,10 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
               
           for(i=0;i<nrows;i++){
              if(previousTrack != -1){
-              if(n_of_electrons[i]>0){
+              if(nofElectrons[i]>0){
                 TVector &v = *tracks[i];
                 v(0) = previousTrack;
-                 tracks[i]->ResizeTo(4*n_of_electrons[i]+1); // shrink if necessary
+                 tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
                 row[i]->Add(tracks[i]);                     
               }
                else{
@@ -1850,7 +1454,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
               }
             }
 
-             n_of_electrons[i]=0;
+             nofElectrons[i]=0;
              tracks[i] = new TVector(481); // TVectors for the next fTrack
 
           } // end of loop over rows
@@ -1858,7 +1462,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
            previousTrack=currentTrack; // update track label 
        }
           
-       Int_t QI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
+       Int_t qI = (Int_t) (tpcHit->fQ); // energy loss (number of electrons)
 
        //---------------------------------------------------
        //  Calculate the electron attachment probability
@@ -1868,7 +1472,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
         Float_t time = 1.e6*(fTPCParam->GetZLength()-TMath::Abs(tpcHit->fZ))
                                                         /fTPCParam->GetDriftV(); 
        // in microseconds!     
-       Float_t AttProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
+       Float_t attProb = fTPCParam->GetAttCoef()*
          fTPCParam->GetOxyCont()*time; //  fraction! 
    
        //-----------------------------------------------
@@ -1876,9 +1480,9 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
        //-----------------------------------------------
        Int_t index[3];
        index[1]=isec;
-        for(Int_t nel=0;nel<QI;nel++){
+        for(Int_t nel=0;nel<qI;nel++){
           // skip if electron lost due to the attachment
-          if((gRandom->Rndm(0)) < AttProb) continue; // electron lost!
+          if((gRandom->Rndm(0)) < attProb) continue; // electron lost!
          xyz[0]=tpcHit->fX;
          xyz[1]=tpcHit->fY;
          xyz[2]=tpcHit->fZ;      
@@ -1886,26 +1490,26 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
          index[0]=1;
          
          TransportElectron(xyz,index); //MI change -august       
-         Int_t row_number;
+         Int_t rowNumber;
          fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); //MI change august
-         row_number = index[2];
+         rowNumber = index[2];
          //transform position to local digit coordinates
          //relative to nearest pad row 
-         if ((row_number<0)||row_number>=fTPCParam->GetNRow(isec)) continue;     
-         n_of_electrons[row_number]++;   
+         if ((rowNumber<0)||rowNumber>=fTPCParam->GetNRow(isec)) continue;       
+         nofElectrons[rowNumber]++;      
          //----------------------------------
          // Expand vector if necessary
          //----------------------------------
-         if(n_of_electrons[row_number]>120){
-           Int_t range = tracks[row_number]->GetNrows();
-           if((n_of_electrons[row_number])>(range-1)/4){
+         if(nofElectrons[rowNumber]>120){
+           Int_t range = tracks[rowNumber]->GetNrows();
+           if((nofElectrons[rowNumber])>(range-1)/4){
         
-             tracks[row_number]->ResizeTo(range+400); // Add 100 electrons
+             tracks[rowNumber]->ResizeTo(range+400); // Add 100 electrons
            }
          }
          
-         TVector &v = *tracks[row_number];
-         Int_t idx = 4*n_of_electrons[row_number]-3;
+         TVector &v = *tracks[rowNumber];
+         Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
 
          v(idx)=  xyz[0];   // X - pad row coordinate
          v(idx+1)=xyz[1];   // Y - pad coordinate (along the pad-row)
@@ -1921,10 +1525,10 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     //
 
      for(i=0;i<nrows;i++){
-       if(n_of_electrons[i]>0){
+       if(nofElectrons[i]>0){
           TVector &v = *tracks[i];
          v(0) = previousTrack;
-          tracks[i]->ResizeTo(4*n_of_electrons[i]+1); // shrink if necessary
+          tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
          row[i]->Add(tracks[i]);  
        }
        else{
@@ -1934,7 +1538,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
       }  
 
           delete [] tracks;
-          delete [] n_of_electrons;
+          delete [] nofElectrons;
  
 
 } // end of MakeSector
@@ -1970,19 +1574,12 @@ void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
 
   AliDetector::MakeBranch(option);
 
-  char *D = strstr(option,"D");
+  char *d = strstr(option,"D");
 
-  if (fDigits   && gAlice->TreeD() && D) {
+  if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
     gAlice->TreeD()->Branch(branchname,&fDigits, buffersize);
     printf("Making Branch %s for digits\n",branchname);
   }    
-
-  char *R = strstr(option,"R");
-
-  if (fClusters && gAlice->TreeR() && R) {
-    gAlice->TreeR()->Branch(branchname,&fClusters, buffersize);
-    printf("Making Branch %s for Clusters\n",branchname);
-  }    
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -1990,12 +1587,9 @@ void AliTPC::ResetDigits()
 {
   //
   // Reset number of digits and the digits array for this detector
-  // reset clusters
   //
   fNdigits   = 0;
   if (fDigits)   fDigits->Clear();
-  fNclusters = 0;
-  if (fClusters) fClusters->Clear();
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2088,8 +1682,10 @@ void AliTPC::SetSens(Int_t sens)
   fSens = sens;
 }
  
-void AliTPC::SetSide(Float_t side)
+void AliTPC::SetSide(Float_t side=0.)
 {
+  // choice of the TPC side
+
   fSide = side;
  
 }
@@ -2098,6 +1694,8 @@ void AliTPC::SetGasMixt(Int_t nc,Int_t c1,Int_t c2,Int_t c3,Float_t p1,
                            Float_t p2,Float_t p3)
 {
 
+  // gax mixture definition
+
  fNoComp = nc;
  
  fMixtComp[0]=c1;
@@ -2129,11 +1727,11 @@ void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
   Float_t driftl=xyz[2];
   if(driftl<0.01) driftl=0.01;
   driftl=TMath::Sqrt(driftl);
-  Float_t sig_t = driftl*(fTPCParam->GetDiffT());
-  Float_t sig_l = driftl*(fTPCParam->GetDiffL());
-  xyz[0]=gRandom->Gaus(xyz[0],sig_t);
-  xyz[1]=gRandom->Gaus(xyz[1],sig_t);
-  xyz[2]=gRandom->Gaus(xyz[2],sig_l);
+  Float_t sigT = driftl*(fTPCParam->GetDiffT());
+  Float_t sigL = driftl*(fTPCParam->GetDiffL());
+  xyz[0]=gRandom->Gaus(xyz[0],sigT);
+  xyz[1]=gRandom->Gaus(xyz[1],sigT);
+  xyz[2]=gRandom->Gaus(xyz[2],sigL);
 
   // ExB
   
@@ -2157,75 +1755,13 @@ void AliTPC::Streamer(TBuffer &R__b)
       AliDetector::Streamer(R__b);
       if (R__v < 2) return;
       R__b >> fNsectors;
-      R__b >> fNclusters;
-      R__b >> fNtracks;
-
    } else {
       R__b.WriteVersion(AliTPC::IsA());
       AliDetector::Streamer(R__b);
       R__b << fNsectors;
-      R__b << fNclusters;
-      R__b << fNtracks;
    }
 }
   
-ClassImp(AliTPCcluster)
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCcluster::AliTPCcluster(Float_t *hits, Int_t *lab)
-{
-  //
-  // Creates a simulated cluster for the TPC
-  //
-  fTracks[0]  = lab[0];
-  fTracks[1]  = lab[1];
-  fTracks[2]  = lab[2];
-  fSector     = lab[3];
-  fPadRow     = lab[4];
-  fY          = hits[0];
-  fZ          = hits[1];
-  fQ          = hits[2];
-  fSigmaY2    = hits[3];
-  fSigmaZ2    = hits[4];
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCcluster::GetXYZ(Float_t *x, const AliTPCParam *par) const 
-{
-  //
-  // Transformation from local to global coordinate system
-  //
-  x[0]=par->GetPadRowRadii(fSector,fPadRow);
-  x[1]=fY;
-  x[2]=fZ;
-  Float_t cs, sn, tmp;
-  par->AdjustCosSin(fSector,cs,sn);
-  tmp = x[0]*cs-x[1]*sn;
-  x[1]= x[0]*sn+x[1]*cs; x[0]=tmp;
-}
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPCcluster::Compare(TObject * o)
-{
-  //
-  // compare two clusters according y coordinata
-  //
-  AliTPCcluster *cl= (AliTPCcluster *)o;
-  if (fY<cl->fY) return -1;
-  if (fY==cl->fY) return 0;
-  return 1;  
-}
-
-Bool_t AliTPCcluster::IsSortable() const
-{
-  //
-  //make AliTPCcluster sortabale
-  //
-  return kTRUE; 
-}
-
-
-
 ClassImp(AliTPCdigit)
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2260,421 +1796,4 @@ AliHit(shunt,track)
   fQ          = hits[3];
 }
  
-ClassImp(AliTPCtrack)
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCtrack::AliTPCtrack(Float_t *hits)
-{
-  //
-  // Default creator for a TPC reconstructed track object
-  //
-  fX=hits[0]; // This is dummy code !
-}
-//_________________________________________________________________________
-
-AliTPCtrack::AliTPCtrack(const AliTPCcluster *c,const TVector& xx,
-                        const TMatrix& CC, Double_t xref, Double_t alpha):
-  x(xx),C(CC),fClusters(200)
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This is the main track constructor.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  fX=xref;
-  fAlpha=alpha;
-  fChi2=0.;
-  fClusters.AddLast((AliTPCcluster*)(c));
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCtrack::AliTPCtrack(const AliTPCtrack& t) : x(t.x), C(t.C),
-  fClusters(t.fClusters.GetEntriesFast()) 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This is a track copy constructor.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  fX=t.fX;
-  fChi2=t.fChi2;
-  fAlpha=t.fAlpha;
-  Int_t n=t.fClusters.GetEntriesFast();
-  for (Int_t i=0; i<n; i++) fClusters.AddLast(t.fClusters.UncheckedAt(i));
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPCtrack::Compare(TObject *o) {
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function compares tracks according to the uncertainty of their
-  // position in Y.
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCtrack *t=(AliTPCtrack*)o;
-  Double_t co=t->GetSigmaY2();
-  Double_t c =GetSigmaY2();
-  if (c>co) return 1;
-  else if (c<co) return -1;
-  return 0;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPCtrack::PropagateTo(Double_t xk,Double_t x0,Double_t rho,Double_t pm)
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function propagates a track to a reference plane x=xk.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  if (TMath::Abs(x(2)*xk - x(3)) >= 0.999) {
-    if (*this>4) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Propagation failed !\n";
-    return 0;
-  }
-
-  Double_t x1=fX, x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1, y1=x(0), z1=x(1);
-  Double_t c1=x(2)*x1 - x(3), r1=sqrt(1.- c1*c1);
-  Double_t c2=x(2)*x2 - x(3), r2=sqrt(1.- c2*c2);
-  
-  x(0) += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
-  x(1) += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*x(4);
-
-  TMatrix F(5,5); F.UnitMatrix();
-  Double_t rr=r1+r2, cc=c1+c2, xx=x1+x2;
-  F(0,2)= dx*(rr*xx + cc*(c1*x1/r1+c2*x2/r2))/(rr*rr);
-  F(0,3)=-dx*(2*rr + cc*(c1/r1 + c2/r2))/(rr*rr);
-  Double_t cr=c1*r2+c2*r1;
-  F(1,2)= dx*x(4)*(cr*xx-cc*(r1*x2-c2*c1*x1/r1+r2*x1-c1*c2*x2/r2))/(cr*cr);
-  F(1,3)=-dx*x(4)*(2*cr + cc*(c2*c1/r1-r1 + c1*c2/r2-r2))/(cr*cr);
-  F(1,4)= dx*cc/cr; 
-  TMatrix tmp(F,TMatrix::kMult,C);
-  C.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-
-  fX=x2;
-
-  //Multiple scattering******************
-  Double_t ey=x(2)*fX - x(3);
-  Double_t ex=sqrt(1-ey*ey);
-  Double_t ez=x(4);
-  TMatrix Q(5,5); Q=0.;
-  Q(2,2)=ez*ez+ey*ey;   Q(2,3)=-ex*ey;       Q(2,4)=-ex*ez;
-  Q(3,2)=Q(2,3);        Q(3,3)= ez*ez+ex*ex; Q(3,4)=-ey*ez;
-  Q(4,2)=Q(2,4);        Q(4,3)= Q(3,4);      Q(4,4)=1.;
-  
-  F=0;
-  F(2,2)=-x(2)*ex;          F(2,3)=-x(2)*ey;
-  F(3,2)=-ex*(x(2)*fX-ey);  F(3,3)=-(1.+ x(2)*fX*ey - ey*ey);
-  F(4,2)=-ez*ex;            F(4,3)=-ez*ey;           F(4,4)=1.;
-  
-  tmp.Mult(F,Q);
-  Q.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-  
-  Double_t p2=GetPt()*GetPt()*(1.+x(4)*x(4));
-  Double_t beta2=p2/(p2 + pm*pm);
-  Double_t d=sqrt((x1-fX)*(x1-fX)+(y1-x(0))*(y1-x(0))+(z1-x(1))*(z1-x(1)));
-  Double_t theta2=14.1*14.1/(beta2*p2*1e6)*d/x0*rho;
-  Q*=theta2;
-  C+=Q;
-
-  //Energy losses************************
-  Double_t dE=0.153e-3/beta2*(log(5940*beta2/(1-beta2)) - beta2)*d*rho;
-  if (x1 < x2) dE=-dE;
-  x(2)*=(1.- sqrt(p2+pm*pm)/p2*dE);
-  //x(3)*=(1.- sqrt(p2+pm*pm)/p2*dE);
-
-  return 1;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::PropagateToVertex(Double_t x0,Double_t rho,Double_t pm) 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function propagates tracks to the "vertex".
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Double_t c=x(2)*fX - x(3);
-  Double_t tgf=-x(3)/(x(2)*x(0) + sqrt(1-c*c));
-  Double_t snf=tgf/sqrt(1.+ tgf*tgf);
-  Double_t xv=(x(3)+snf)/x(2);
-  PropagateTo(xv,x0,rho,pm);
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::Update(const AliTPCcluster *c, Double_t chisq)
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function associates a clusters with this track.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  TMatrix H(2,5); H.UnitMatrix();
-  TMatrix Ht(TMatrix::kTransposed,H);
-  TVector m(2);   m(0)=c->fY; m(1)=c->fZ; 
-  TMatrix V(2,2); V(0,0)=c->fSigmaY2; V(0,1)=0.; V(1,0)=0.; V(1,1)=c->fSigmaZ2;
-
-  TMatrix tmp(H,TMatrix::kMult,C);
-  TMatrix R(tmp,TMatrix::kMult,Ht); R+=V;
-  
-  Double_t det=(Double_t)R(0,0)*R(1,1) - (Double_t)R(0,1)*R(1,0);
-  R(0,1)=R(0,0); R(0,0)=R(1,1); R(1,1)=R(0,1); 
-  R(1,0)*=-1; R(0,1)=R(1,0);
-  R*=1./det;
-  
-  //R.Invert();
-  
-  TMatrix K(C,TMatrix::kMult,Ht); K*=R;
-  
-  TVector savex=x;
-  x*=H; x-=m;
-
-  x*=-1; x*=K; x+=savex;
-  if (TMath::Abs(x(2)*fX-x(3)) >= 0.999) {
-    if (*this>4) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Filtering failed !\n";
-    x=savex;
-    return;
-  }
-  
-  TMatrix saveC=C;
-  C.Mult(K,tmp); C-=saveC; C*=-1;
-
-  fClusters.AddLast((AliTPCcluster*)c);
-  fChi2 += chisq;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPCtrack::Rotate(Double_t alpha)
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function rotates this track.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  fAlpha += alpha;
-  
-  Double_t x1=fX, y1=x(0);
-  Double_t ca=cos(alpha), sa=sin(alpha);
-  Double_t r1=x(2)*fX - x(3);
-  
-  fX = x1*ca + y1*sa;
-  x(0)=-x1*sa + y1*ca;
-  x(3)=x(3)*ca + (x(2)*y1 + sqrt(1.- r1*r1))*sa;
-  
-  Double_t r2=x(2)*fX - x(3);
-  if (TMath::Abs(r2) >= 0.999) {
-    if (*this>4) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Rotation failed !\n";
-    return 0;
-  }
-  
-  Double_t y0=x(0) + sqrt(1.- r2*r2)/x(2);
-  if ((x(0)-y0)*x(2) >= 0.) {
-    if (*this>4) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Rotation failed !!!\n";
-    return 0;
-  }
-  
-  TMatrix F(5,5); F.UnitMatrix();
-  F(0,0)=ca;
-  F(3,0)=x(2)*sa; 
-  F(3,2)=(y1 - r1*x1/sqrt(1.- r1*r1))*sa; 
-  F(3,3)= ca + sa*r1/sqrt(1.- r1*r1);
-  TMatrix tmp(F,TMatrix::kMult,C); 
-  // Double_t dy2=C(0,0);
-  C.Mult(tmp,TMatrix(TMatrix::kTransposed,F));
-  // C(0,0)+=dy2*sa*sa*r1*r1/(1.- r1*r1);
-  // C(1,1)+=dy2*sa*sa*x(4)*x(4)/(1.- r1*r1);
-  
-  return 1;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::UseClusters() const 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function marks clusters associated with this track.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Int_t num_of_clusters=fClusters.GetEntriesFast();
-  for (Int_t i=0; i<num_of_clusters; i++) {
-    //if (i<=14) continue;
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)fClusters.UncheckedAt(i);
-    c->Use();   
-  }
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Double_t AliTPCtrack::GetPredictedChi2(const AliTPCcluster *c) const 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function calculates a predicted chi2 increment.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  TMatrix H(2,5); H.UnitMatrix();
-  TVector m(2);   m(0)=c->fY; m(1)=c->fZ; 
-  TMatrix V(2,2); V(0,0)=c->fSigmaY2; V(0,1)=0.; V(1,0)=0.; V(1,1)=c->fSigmaZ2;
-  TVector res=x;  res*=H; res-=m; //res*=-1; 
-  TMatrix tmp(H,TMatrix::kMult,C);
-  TMatrix R(tmp,TMatrix::kMult,TMatrix(TMatrix::kTransposed,H)); R+=V;
-  
-  Double_t det=(Double_t)R(0,0)*R(1,1) - (Double_t)R(0,1)*R(1,0);
-  if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
-    if (*this>4) cerr<<*this<<" AliTPCtrack warning: Singular matrix !\n";
-    return 1e10;
-  }
-  R(0,1)=R(0,0); R(0,0)=R(1,1); R(1,1)=R(0,1); 
-  R(1,0)*=-1; R(0,1)=R(1,0);
-  R*=1./det;
-  
-  //R.Invert();
-  
-  TVector r=res;
-  res*=R;
-  return r*res;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-struct S { Int_t lab; Int_t max; };
-Int_t AliTPCtrack::GetLabel(Int_t nrows) const 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function returns the track label. If label<0, this track is fake.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Int_t num_of_clusters=fClusters.GetEntriesFast();
-  S *s=new S[num_of_clusters];
-  Int_t i;
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) s[i].lab=s[i].max=0;
-  
-  Int_t lab=123456789;
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)fClusters.UncheckedAt(i);
-    lab=TMath::Abs(c->fTracks[0]);
-    Int_t j;
-    for (j=0; j<num_of_clusters; j++)
-      if (s[j].lab==lab || s[j].max==0) break;
-    s[j].lab=lab;
-    s[j].max++;
-  }
-  
-  Int_t max=0;
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) 
-    if (s[i].max>max) {max=s[i].max; lab=s[i].lab;}
-    
-  delete[] s;
-  
-  for (i=0; i<num_of_clusters; i++) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)fClusters.UncheckedAt(i);
-    if (TMath::Abs(c->fTracks[1]) == lab ||
-        TMath::Abs(c->fTracks[2]) == lab ) max++;
-  }
-  
-  if (1.-Float_t(max)/num_of_clusters > 0.10) return -lab;
-  
-  Int_t tail=Int_t(0.08*nrows);
-  if (num_of_clusters < tail) return lab;
-  
-  max=0;
-  for (i=1; i<=tail; i++) {
-    AliTPCcluster *c=(AliTPCcluster*)fClusters.UncheckedAt(num_of_clusters-i);
-    if (lab == TMath::Abs(c->fTracks[0]) ||
-        lab == TMath::Abs(c->fTracks[1]) ||
-        lab == TMath::Abs(c->fTracks[2])) max++;
-  }
-  if (max < Int_t(0.5*tail)) return -lab;
-  
-  return lab;
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPCtrack::GetPxPyPz(Double_t& px, Double_t& py, Double_t& pz) const 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This function returns reconstructed track momentum in the global system.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Double_t pt=TMath::Abs(GetPt()); // GeV/c
-  Double_t r=x(2)*fX-x(3);
-  Double_t y0=x(0) + sqrt(1.- r*r)/x(2);
-  px=-pt*(x(0)-y0)*x(2);    //cos(phi);
-  py=-pt*(x(3)-fX*x(2));   //sin(phi);
-  pz=pt*x(4);
-  Double_t tmp=px*TMath::Cos(fAlpha) - py*TMath::Sin(fAlpha);
-  py=px*TMath::Sin(fAlpha) + py*TMath::Cos(fAlpha);
-  px=tmp;  
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-Double_t AliTPCtrack::GetdEdX(Double_t low, Double_t up) const {
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------
-  Int_t ncl=fClusters.GetEntriesFast();
-  Int_t n=0;
-  Double_t *q=new Double_t[ncl];
-  Int_t i;
-  for (i=1; i<ncl; i++) { //Shall I think of this "i=1" ? (I.Belikov)
-     AliTPCcluster *cl=(AliTPCcluster*)(fClusters.UncheckedAt(i));
-     q[n++]=TMath::Abs(cl->fQ)/cl->fdEdX;
-     if (cl->fSector<36) q[n-1]*=1.1;
-  }
-
-  //stupid sorting
-  Int_t swap;
-  do {
-    swap=0;
-    for (i=0; i<n-1; i++) {
-      if (q[i]<=q[i+1]) continue;
-      Double_t tmp=q[i]; q[i]=q[i+1]; q[i+1]=tmp;
-      swap++;
-    }
-  } while (swap);
-
-  Int_t nl=Int_t(low*n), nu=Int_t(up *n);
-  Double_t dedx=0.;
-  for (i=nl; i<=nu; i++) dedx += q[i];
-  dedx /= (nu-nl+1);
-  return dedx;
-}
-
-//_________________________________________________________________________
-//
-// Classes for internal tracking use
-//_________________________________________________________________________
-void AliTPCRow::InsertCluster(const AliTPCcluster* c) {
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Insert a cluster into this pad row in accordence with its y-coordinate
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  if (num_of_clusters==MAX_CLUSTER_PER_ROW) {
-    cerr<<"AliTPCRow::InsertCluster(): Too many clusters !\n"; return;
-  }
-  if (num_of_clusters==0) {clusters[num_of_clusters++]=c; return;}
-  Int_t i=Find(c->fY);
-  memmove(clusters+i+1 ,clusters+i,(num_of_clusters-i)*sizeof(AliTPCcluster*));
-  clusters[i]=c; num_of_clusters++;
-}
-//___________________________________________________________________
-
-Int_t AliTPCRow::Find(Double_t y) const {
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Return the index of the nearest cluster 
-  //
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  if (y <= clusters[0]->fY) return 0;
-  if (y > clusters[num_of_clusters-1]->fY) return num_of_clusters;
-  Int_t b=0, e=num_of_clusters-1, m=(b+e)/2;
-  for (; b<e; m=(b+e)/2) {
-    if (y > clusters[m]->fY) b=m+1;
-    else e=m; 
-  }
-  return m;
-}
-//________________________________________________________________________