]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPCCalibCE.cxx
Fix in documentation
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCCalibCE.cxx
index d0b12023d49f168070eac02f8ced979037ea70ca..febf42af3f03b55a02180b48ed671132f96cb1cb 100644 (file)
@@ -311,18 +311,23 @@ AliTPCCalibCE::AliTPCCalibCE() :
     fLastSector(-1),
     fOldRCUformat(kTRUE),
     fROC(AliTPCROC::Instance()),
+    fMapping(NULL),
     fParam(new AliTPCParam),
     fPedestalTPC(0x0),
     fPadNoiseTPC(0x0),
     fPedestalROC(0x0),
     fPadNoiseROC(0x0),
     fCalRocArrayT0(72),
+    fCalRocArrayT0Err(72),
     fCalRocArrayQ(72),
     fCalRocArrayRMS(72),
     fCalRocArrayOutliers(72),
     fHistoQArray(72),
     fHistoT0Array(72),
     fHistoRMSArray(72),
+    fMeanT0rms(0),
+    fMeanQrms(0),
+    fMeanRMSrms(0),
     fHistoTmean(72),
     fParamArrayEventPol1(72),
     fParamArrayEventPol2(72),
@@ -377,18 +382,23 @@ AliTPCCalibCE::AliTPCCalibCE(const AliTPCCalibCE &sig) :
     fLastSector(-1),
     fOldRCUformat(kTRUE),
     fROC(AliTPCROC::Instance()),
+    fMapping(NULL),
     fParam(new AliTPCParam),
     fPedestalTPC(0x0),
     fPadNoiseTPC(0x0),
     fPedestalROC(0x0),
     fPadNoiseROC(0x0),
     fCalRocArrayT0(72),
+    fCalRocArrayT0Err(72),
     fCalRocArrayQ(72),
     fCalRocArrayRMS(72),
     fCalRocArrayOutliers(72),
     fHistoQArray(72),
     fHistoT0Array(72),
     fHistoRMSArray(72),
+    fMeanT0rms(sig.fMeanT0rms),
+    fMeanQrms(sig.fMeanQrms),
+    fMeanRMSrms(sig.fMeanRMSrms),
     fHistoTmean(72),
     fParamArrayEventPol1(72),
     fParamArrayEventPol2(72),
@@ -521,6 +531,7 @@ AliTPCCalibCE::~AliTPCCalibCE()
     //
 
     fCalRocArrayT0.Delete();
+    fCalRocArrayT0Err.Delete();
     fCalRocArrayQ.Delete();
     fCalRocArrayRMS.Delete();
     fCalRocArrayOutliers.Delete();
@@ -543,7 +554,7 @@ AliTPCCalibCE::~AliTPCCalibCE()
 
     if ( fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
 //    if ( fHTime0 ) delete fHTime0;
-    delete fROC;
+//    delete fROC;
     delete fParam;
 }
 //_____________________________________________________________________
@@ -558,6 +569,10 @@ Int_t AliTPCCalibCE::Update(const Int_t icsector,
     // no extra analysis necessary. Assumes knowledge of the signal shape!
     // assumes that it is looped over consecutive time bins of one pad
     //
+
+  if (icRow<0) return 0;
+  if (icPad<0) return 0;
+  if (icTimeBin<0) return 0;
     if ( (icTimeBin>fLastTimeBin) || (icTimeBin<fFirstTimeBin)   ) return 0;
 
     Int_t iChannel  = fROC->GetRowIndexes(icsector)[icRow]+icPad; //  global pad position in sector
@@ -755,7 +770,7 @@ void AliTPCCalibCE::FindLocalMaxima(TVectorF &maxima)
     //
     // Find local maxima on the pad signal and Histogram them
     //
-    Float_t ceThreshold = 5.*fPadNoise;  // threshold for the signal
+  Float_t ceThreshold = 5.*TMath::Max(fPadNoise,Float_t(1.));  // threshold for the signal
     Int_t   count       = 0;
     Int_t   tminus      = 2;
     Int_t   tplus       = 3;
@@ -782,8 +797,6 @@ void AliTPCCalibCE::ProcessPad()
     FindLocalMaxima(maxima);
     if ( (fNevents == 0) || (fOldRunNumber!=fRunNumber) ) return;  // return because we don't have Time0 info for the CE yet
 
-
-
     TVectorD param(3);
     Float_t  qSum;
     FindCESignal(param, qSum, maxima);
@@ -845,11 +858,17 @@ void AliTPCCalibCE::EndEvent()
        time0Side[1]/=time0SideCount[1];
     // end find time0 offset
 
+    Int_t nSecMeanT=0;
     //loop over all ROCs, fill CE Time histogram corrected for the mean Time0 of each ROC
     for ( Int_t iSec = 0; iSec<72; ++iSec ){
       //find median and then calculate the mean around it
        TH1S *hMeanT    = GetHistoTmean(iSec); //histogram with local maxima position information
        if ( !hMeanT ) continue;
+        //continue if not enough data is filled in the meanT histogram. This is the case if we do not have a laser event.
+        if ( hMeanT->GetEntries() < fROC->GetNChannels(iSec)*2/3 ){
+          hMeanT->Reset();
+          continue;
+        }
 
        Double_t entries = hMeanT->GetEntries();
        Double_t sum     = 0;
@@ -857,7 +876,7 @@ void AliTPCCalibCE::EndEvent()
         Int_t ibin=0;
        for ( ibin=0; ibin<hMeanT->GetNbinsX(); ++ibin){
            sum+=arr[ibin];
-            if ( sum>=(entries/2) ) break;
+            if ( sum>=(entries/2.) ) break;
        }
        Int_t delta = 4;
         Int_t firstBin = fFirstTimeBin+ibin-delta;
@@ -873,8 +892,9 @@ void AliTPCCalibCE::EndEvent()
             vMeanTime->ResizeTo(vSize+100);
 
        vMeanTime->GetMatrixArray()[fNevents]=median;
+        nSecMeanT++;
       // end find median
-
+        
        TVectorF *vTimes = GetPadTimesEvent(iSec);
        if ( !vTimes ) continue;                     //continue if no time information for this sector is available
 
@@ -968,7 +988,6 @@ void AliTPCCalibCE::EndEvent()
            }
            //-----------------------------  Debug end  ------------------------------
        }// end channel loop
-       hMeanT->Reset();
 
        TVectorD paramPol1(3);
        TVectorD paramPol2(6);
@@ -989,7 +1008,6 @@ void AliTPCCalibCE::EndEvent()
            GetParamArrayPol1(iSec,kTRUE)->AddAtAndExpand(new TVectorD(paramPol1), fNevents);
            GetParamArrayPol2(iSec,kTRUE)->AddAtAndExpand(new TVectorD(paramPol2), fNevents);
        }
-//     printf("events: %d -- size: %d\n",fNevents,GetParamArrayPol1(iSec)->GetSize());
 
        //-------------------------------  Debug start  ------------------------------
        if ( fDebugLevel>0 ){
@@ -1015,8 +1033,12 @@ void AliTPCCalibCE::EndEvent()
                "\n";
        }
        //-------------------------------  Debug end  ------------------------------
+        hMeanT->Reset();
     }// end sector loop
-
+    //return if no sector has a valid mean time
+    if ( nSecMeanT == 0 ) return;
+    
+    
 //    fTMeanArrayEvent.AddAtAndExpand(new TVectorF(vMeanTime),fNevents);
 //    fQMeanArrayEvent.AddAtAndExpand(new TVectorF(vMeanQ),fNevents);
     if ( fVEventTime.GetNrows() < fNevents+1 ) {
@@ -1045,11 +1067,11 @@ Bool_t AliTPCCalibCE::ProcessEventFast(AliTPCRawStreamFast *rawStreamFast)
          Int_t isector  = rawStreamFast->GetSector();                       //  current sector
          Int_t iRow     = rawStreamFast->GetRow();                          //  current row
          Int_t iPad     = rawStreamFast->GetPad();                          //  current pad
-         Int_t startTbin = (Int_t)rawStreamFast->GetStartTimeBin();
-          Int_t endTbin = (Int_t)rawStreamFast->GetEndTimeBin();
 
          while ( rawStreamFast->NextBunch() ){
-             for (Int_t iTimeBin = startTbin; iTimeBin < endTbin; iTimeBin++){
+            Int_t startTbin = (Int_t)rawStreamFast->GetStartTimeBin();
+            Int_t endTbin = (Int_t)rawStreamFast->GetEndTimeBin();
+            for (Int_t iTimeBin = startTbin; iTimeBin < endTbin; iTimeBin++){
                  Float_t signal=(Float_t)rawStreamFast->GetSignals()[iTimeBin-startTbin];
                  Update(isector,iRow,iPad,iTimeBin+1,signal);
                  withInput = kTRUE;
@@ -1078,7 +1100,7 @@ Bool_t AliTPCCalibCE::ProcessEventFast(AliRawReader *rawReader)
   }
   fEventId = *rawReader->GetEventId();
 
-  AliTPCRawStreamFast *rawStreamFast = new AliTPCRawStreamFast(rawReader);
+  AliTPCRawStreamFast *rawStreamFast = new AliTPCRawStreamFast(rawReader, (AliAltroMapping**)fMapping);
   Bool_t res=ProcessEventFast(rawStreamFast);
   delete rawStreamFast;
   return res;
@@ -1124,7 +1146,7 @@ Bool_t AliTPCCalibCE::ProcessEvent(AliRawReader *rawReader)
   //
 
 
-    AliTPCRawStream rawStream(rawReader);
+  AliTPCRawStream rawStream(rawReader,(AliAltroMapping**)fMapping);
     AliRawEventHeaderBase* eventHeader = (AliRawEventHeaderBase*)rawReader->GetEventHeader();
     if (eventHeader){
        fTimeStamp   = eventHeader->Get("Timestamp");
@@ -1222,7 +1244,7 @@ TH1S* AliTPCCalibCE::GetHisto(Int_t sector, TObjArray *arr,
     sprintf(name,"hCalib%s%.2d",type,sector);
     sprintf(title,"%s calibration histogram sector %.2d",type,sector);
 
-    // new histogram with calib information. One value for each pad!
+    // new histogram with calib information. One value for each pad!
     TH1S* hist = new TH1S(name,title,
                          fLastTimeBin-fFirstTimeBin,fFirstTimeBin,fLastTimeBin);
     hist->SetDirectory(0);
@@ -1338,13 +1360,23 @@ AliTPCCalROC* AliTPCCalibCE::GetCalRoc(Int_t sector, TObjArray* arr, Bool_t forc
 AliTPCCalROC* AliTPCCalibCE::GetCalRocT0(Int_t sector, Bool_t force)
 {
     //
-    // return pointer to Carge ROC Calibration
+    // return pointer to Time 0 ROC Calibration
     // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
     //
     TObjArray *arr = &fCalRocArrayT0;
     return GetCalRoc(sector, arr, force);
 }
 //_____________________________________________________________________
+AliTPCCalROC* AliTPCCalibCE::GetCalRocT0Err(Int_t sector, Bool_t force)
+{
+    //
+    // return pointer to the error of Time 0 ROC Calibration
+    // if force is true create a new histogram if it doesn't exist allready
+    //
+    TObjArray *arr = &fCalRocArrayT0Err;
+    return GetCalRoc(sector, arr, force);
+}
+//_____________________________________________________________________
 AliTPCCalROC* AliTPCCalibCE::GetCalRocQ(Int_t sector, Bool_t force)
 {
     //
@@ -1522,8 +1554,8 @@ void AliTPCCalibCE::Merge(AliTPCCalibCE *ce)
             arrPol2->Expand(fNevents+nCEevents);
        }
        if ( vMeanTimeCE && vMeanQCE ){
-           vMeanTime = GetTMeanEvents(iSec);
-           vMeanQCE  = GetQMeanEvents(iSec);
+           vMeanTime = GetTMeanEvents(iSec,kTRUE);
+           vMeanQ    = GetQMeanEvents(iSec,kTRUE);
            vMeanTime->ResizeTo(fNevents+nCEevents);
            vMeanQ->ResizeTo(fNevents+nCEevents);
        }
@@ -1648,14 +1680,20 @@ void AliTPCCalibCE::Analyse()
     TVectorD paramRMS(3);
     TMatrixD dummy(3,3);
 
+    Float_t channelCounter=0;
+    fMeanT0rms=0;
+    fMeanQrms=0;
+    fMeanRMSrms=0;
+
     for (Int_t iSec=0; iSec<72; ++iSec){
        TH2S *hT0 = GetHistoT0(iSec);
         if (!hT0 ) continue;
 
-       AliTPCCalROC *rocQ   = GetCalRocQ  (iSec,kTRUE);
-       AliTPCCalROC *rocT0  = GetCalRocT0 (iSec,kTRUE);
-       AliTPCCalROC *rocRMS = GetCalRocRMS(iSec,kTRUE);
-        AliTPCCalROC *rocOut = GetCalRocOutliers(iSec,kTRUE);
+       AliTPCCalROC *rocQ     = GetCalRocQ  (iSec,kTRUE);
+       AliTPCCalROC *rocT0    = GetCalRocT0 (iSec,kTRUE);
+       AliTPCCalROC *rocT0Err = GetCalRocT0Err (iSec,kTRUE);
+       AliTPCCalROC *rocRMS   = GetCalRocRMS(iSec,kTRUE);
+        AliTPCCalROC *rocOut   = GetCalRocOutliers(iSec,kTRUE);
 
        TH2S *hQ   = GetHistoQ(iSec);
        TH2S *hRMS = GetHistoRMS(iSec);
@@ -1678,18 +1716,22 @@ void AliTPCCalibCE::Analyse()
            Float_t cogTime0 = -1000;
            Float_t cogQ     = -1000;
            Float_t cogRMS   = -1000;
-            Float_t cogOut   = 0;
+           Float_t cogOut   = 0;
+            Float_t rms      = 0;
+            Float_t rmsT0    = 0;
 
 
            Int_t offsetQ = (fNbinsQ+2)*(iChannel+1)+1;
            Int_t offsetT0 = (fNbinsT0+2)*(iChannel+1)+1;
            Int_t offsetRMS = (fNbinsRMS+2)*(iChannel+1)+1;
 
-           cogQ     = AliMathBase::GetCOG(arrayhQ+offsetQ,fNbinsQ,fXminQ,fXmaxQ);
-           cogTime0 = AliMathBase::GetCOG(arrayhT0+offsetT0,fNbinsT0,fXminT0,fXmaxT0);
-            cogRMS   = AliMathBase::GetCOG(arrayhRMS+offsetRMS,fNbinsRMS,fXminRMS,fXmaxRMS);
-
-
+           cogQ     = AliMathBase::GetCOG(arrayhQ+offsetQ,fNbinsQ,fXminQ,fXmaxQ,&rms);
+            fMeanQrms+=rms;
+           cogTime0 = AliMathBase::GetCOG(arrayhT0+offsetT0,fNbinsT0,fXminT0,fXmaxT0,&rmsT0);
+            fMeanT0rms+=rmsT0;
+            cogRMS   = AliMathBase::GetCOG(arrayhRMS+offsetRMS,fNbinsRMS,fXminRMS,fXmaxRMS,&rms);
+            fMeanRMSrms+=rms;
+            channelCounter++;
 
            /*
              //outlier specifications
@@ -1702,6 +1744,7 @@ void AliTPCCalibCE::Analyse()
 */
                    rocQ->SetValue(iChannel, cogQ*cogQ);
            rocT0->SetValue(iChannel, cogTime0);
+           rocT0Err->SetValue(iChannel, rmsT0);
            rocRMS->SetValue(iChannel, cogRMS);
            rocOut->SetValue(iChannel, cogOut);
 
@@ -1735,6 +1778,11 @@ void AliTPCCalibCE::Analyse()
        }
 
     }
+    if ( channelCounter>0 ){
+       fMeanT0rms/=channelCounter;
+       fMeanQrms/=channelCounter;
+       fMeanRMSrms/=channelCounter;
+    }
     if ( fDebugStreamer ) fDebugStreamer->GetFile()->Write();
 //    delete fDebugStreamer;
 //    fDebugStreamer = 0x0;