]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRD.cxx
Cleaned-up version of AliTRDCalibra
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRD.cxx
index 6402c7333e741fef0b09289900c2c78506e5ce9d..81fab43b8b5a3b5283530b6430686ef893afe55b 100644 (file)
 #include "AliConst.h"
 #include "AliDigit.h"
 #include "AliLoader.h"
+#include "AliLog.h"
+#include "AliMC.h"
 #include "AliMagF.h"
 #include "AliRun.h"
+#include "AliTrackReference.h"
+
 #include "AliTRD.h"
 #include "AliTRDdigit.h"
 #include "AliTRDdigitizer.h"
 #include "AliTRDdigitsManager.h"
-#include "AliTRDgeometryFull.h"
-#include "AliTRDgeometryHole.h"
+#include "AliTRDgeometry.h"
 #include "AliTRDhit.h"
 #include "AliTRDpoints.h"
 #include "AliTRDrawData.h"
-#include "AliTrackReference.h"
-#include "AliMC.h"
+#include "AliTRDSimParam.h"
+#include "AliTRDRecParam.h"
+#include "AliTRDCommonParam.h"
+#include "AliTRDcalibDB.h"
 
 ClassImp(AliTRD)
  
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRD::AliTRD()
+  :AliDetector()
+  ,fGeometry(0)
+  ,fGasDensity(0)
+  ,fFoilDensity(0)
+  ,fDrawTR(0)
+  ,fDisplayType(0)
 {
   //
   // Default constructor
   //
-
-  fIshunt        = 0;
-  fGasMix        = 0;
-  fHits          = 0;
-  fDigits        = 0;
-
-  fGeometry      = 0;
-
-  fGasDensity    = 0;
-  fFoilDensity   = 0;
-
-  fDrawTR        = 0;
-  fDisplayType   = 0;
  
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRD::AliTRD(const char *name, const char *title)
-       : AliDetector(name,title)
+  :AliDetector(name,title)
+  ,fGeometry(0)
+  ,fGasDensity(0)
+  ,fFoilDensity(0)
+  ,fDrawTR(0)
+  ,fDisplayType(0)
 {
   //
   // Standard constructor for the TRD
   //
 
-  // Check that FRAME is there otherwise we have no place where to
-  // put TRD
-  AliModule* frame = gAlice->GetModule("FRAME");
+  // Check that FRAME is there otherwise we have no place where to put TRD
+  AliModule *frame = gAlice->GetModule("FRAME");
   if (!frame) {
-    Error("Ctor","TRD needs FRAME to be present\n");
+    AliError("TRD needs FRAME to be present\n");
     exit(1);
   } 
 
   // Define the TRD geometry
   if ((frame->IsVersion() == 0) ||
       (frame->IsVersion() == 1)) {
-    fGeometry = new AliTRDgeometryFull();
+    fGeometry = new AliTRDgeometry();
   }
   else {
-    Error("Ctor","Could not find valid FRAME version\n");
+    AliError("Could not find valid FRAME version\n");
     exit(1);
   }
 
   // Save the geometry
-  TDirectorysaveDir = gDirectory;
+  TDirectory *saveDir = gDirectory;
   gAlice->GetRunLoader()->CdGAFile();
   fGeometry->Write("TRDgeometry");
   saveDir->cd();
 
   // Allocate the hit array
-  fHits           = new TClonesArray("AliTRDhit"     ,405);
+  fHits = new TClonesArray("AliTRDhit",405);
   gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 
-  // Allocate the digits array
-  fDigits         = 0;
-
-  fIshunt        = 0;
-  fGasMix        = 1;
-
-  fGasDensity    = 0;
-  fFoilDensity   = 0;
-
-  fDrawTR        = 0;
-  fDisplayType   = 0;
-
   SetMarkerColor(kWhite);   
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-AliTRD::AliTRD(const AliTRD &trd):AliDetector(trd)
+AliTRD::AliTRD(const AliTRD &trd)
+  :AliDetector(trd)
+  ,fGeometry(trd.fGeometry)
+  ,fGasDensity(trd.fGasDensity)
+  ,fFoilDensity(trd.fFoilDensity)
+  ,fDrawTR(trd.fDrawTR)
+  ,fDisplayType(trd.fDisplayType)
 {
   //
   // Copy constructor
   //
 
-  ((AliTRD &) trd).Copy(*this);
-
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -148,15 +142,14 @@ AliTRD::~AliTRD()
   // TRD destructor
   //
 
-  fIshunt = 0;
-
   if (fGeometry) {
     delete fGeometry;
-    fGeometry  = 0;
+    fGeometry = 0;
   }
+
   if (fHits) {
     delete fHits;
-    fHits      = 0;
+    fHits     = 0;
   }
 
 }
@@ -167,18 +160,23 @@ void AliTRD::Hits2Digits()
   //
   // Create digits
   //
+
   AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");
-  digitizer.SetDebug(GetDebug());
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitizer",AliDebugLevel());
   
   // Initialization
   digitizer.InitDetector();
     
-  if (!fLoader->TreeH()) fLoader->LoadHits("read");
+  if (!fLoader->TreeH()) {
+    fLoader->LoadHits("read");
+  }
   fLoader->LoadDigits("recreate");
-  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  AliRunLoader *runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
 
   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
-    digitizer.Open(runLoader->GetFileName().Data(), iEvent);
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    digitizer.Open(runLoader,iEvent);
     digitizer.MakeDigits();
     digitizer.WriteDigits();
   }
@@ -198,17 +196,21 @@ void AliTRD::Hits2SDigits()
   AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");
   // For the summable digits
   digitizer.SetSDigits(kTRUE);
-  digitizer.SetDebug(GetDebug());
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitizer",AliDebugLevel());
 
   // Initialization
   digitizer.InitDetector();
     
-  if (!fLoader->TreeH()) fLoader->LoadHits("read");
+  if (!fLoader->TreeH()) {
+    fLoader->LoadHits("read");
+  }
   fLoader->LoadSDigits("recreate");
-  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  AliRunLoader *runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
 
   for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
-    digitizer.Open(runLoader->GetFileName().Data(), iEvent);
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    digitizer.Open(runLoader,iEvent);
     digitizer.MakeDigits();
     digitizer.WriteDigits();
   }
@@ -219,7 +221,7 @@ void AliTRD::Hits2SDigits()
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-AliDigitizer* AliTRD::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
+AliDigitizer *AliTRD::CreateDigitizer(AliRunDigitizer *manager) const
 {
   //
   // Creates a new digitizer object
@@ -236,9 +238,9 @@ void AliTRD::SDigits2Digits()
   // Create final digits from summable digits
   //
 
-   // Create the TRD digitizer
+  // Create the TRD digitizer
   AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");  
-  digitizer.SetDebug(GetDebug());
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitizer",AliDebugLevel());
 
   // Set the parameter
   digitizer.SetEvent(gAlice->GetEvNumber());
@@ -249,17 +251,19 @@ void AliTRD::SDigits2Digits()
   // Read the s-digits via digits manager
   AliTRDdigitsManager sdigitsManager;
  
-  sdigitsManager.SetDebug(GetDebug());
+  AliLog::SetClassDebugLevel("TRDdigitisManager",AliDebugLevel());
   sdigitsManager.SetSDigits(kTRUE);
   sdigitsManager.CreateArrays();
   
-  if (!fLoader->TreeS()) 
-    if (fLoader->LoadSDigits("read"))
-     {
-       Error("SDigits2Digits","Error while reading SDigits for event %d",gAlice->GetEvNumber());
-       return;
-     }
-  if (!fLoader->TreeS()) return;
+  if (!fLoader->TreeS()) { 
+    if (fLoader->LoadSDigits("read")) {
+      return;
+    }
+  }
+  if (!fLoader->TreeS()) {
+    AliError(Form("Error while reading SDigits for event %d",gAlice->GetEvNumber()));
+    return;
+  }
   
   sdigitsManager.ReadDigits(fLoader->TreeS());
 
@@ -270,7 +274,9 @@ void AliTRD::SDigits2Digits()
   digitizer.SDigits2Digits();
 
   // Store the digits
-  if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
+  if (!fLoader->TreeD()) {
+    fLoader->MakeTree("D");
+  }
   if (digitizer.MakeBranch(fLoader->TreeD())){
     digitizer.WriteDigits();
   }
@@ -281,20 +287,19 @@ void AliTRD::SDigits2Digits()
 void AliTRD::Digits2Raw() 
 {
   //
-  // convert digits of the current event to raw data
+  // Convert digits of the current event to raw data
   //
 
   fLoader->LoadDigits();
-  TTreedigits = fLoader->TreeD();
+  TTree *digits = fLoader->TreeD();
   if (!digits) {
-    Error("Digits2Raw", "no digits tree");
+    AliError("No digits tree");
     return;
   }
 
   AliTRDrawData rawWriter;
-//  rawWriter.SetDebug(2);
   if (!rawWriter.Digits2Raw(digits)) {
-    Error("AliTRD::Digits2Raw","The raw writer could not load the digits tree");
+    AliError("The raw writer could not load the digits tree");
   }
 
   fLoader->UnloadDigits();
@@ -311,12 +316,14 @@ void AliTRD::AddHit(Int_t track, Int_t det, Float_t *hits, Int_t q
 
   TClonesArray &lhits = *fHits;
   AliTRDhit *hit = new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt,track,det,hits,q);
+
   if (inDrift) {
     hit->SetDrift();
   }
   else {
     hit->SetAmplification();
   }
+
   if (q < 0) {
     hit->SetTRphoton();
   }
@@ -333,8 +340,10 @@ void AliTRD::BuildGeometry()
   TNode *node, *top;
   TPGON *pgon;
 
-  Float_t rmin, rmax;
-  Float_t zmax1, zmax2;
+  Float_t rmin;
+  Float_t rmax;
+  Float_t zmax1;
+  Float_t zmax2;
 
   Int_t   iPlan;
  
@@ -394,10 +403,10 @@ void AliTRD::BuildGeometry()
     }
 
     thickness += AliTRDgeometry::DrThick();
-    rmin  = AliTRDgeometry::Rmin() + thickness;
-    rmax  = rmin + AliTRDgeometry::AmThick();
-    zmax2 = AliTRDgeometry::Zmax2() + slope * thickness;
-    zmax1 = zmax2 + slope * AliTRDgeometry::AmThick();
+    rmin       = AliTRDgeometry::Rmin() + thickness;
+    rmax       = rmin + AliTRDgeometry::AmThick();
+    zmax2      = AliTRDgeometry::Zmax2() + slope * thickness;
+    zmax1      = zmax2 + slope * AliTRDgeometry::AmThick();
 
     for (iPlan = 0; iPlan < AliTRDgeometry::Nplan(); iPlan++) {
 
@@ -431,15 +440,12 @@ void AliTRD::Copy(TObject &trd) const
   // Copy function
   //
 
-  ((AliTRD &) trd).fGasMix      = fGasMix;
   ((AliTRD &) trd).fGeometry    = fGeometry;       
   ((AliTRD &) trd).fGasDensity  = fGasDensity;
   ((AliTRD &) trd).fFoilDensity = fFoilDensity;
   ((AliTRD &) trd).fDrawTR      = fDrawTR;
   ((AliTRD &) trd).fDisplayType = fDisplayType;
 
-  //AliDetector::Copy(trd);
-
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -450,10 +456,9 @@ void AliTRD::CreateGeometry()
   //
 
   // Check that FRAME is there otherwise we have no place where to put the TRD
-  AliModuleframe = gAlice->GetModule("FRAME");
+  AliModule *frame = gAlice->GetModule("FRAME");
   if (!frame) {
-    printf(" The TRD needs the FRAME to be defined first\n");
-    return;
+    AliFatal("The TRD needs the FRAME to be defined first");
   }
 
   fGeometry->CreateGeometry(fIdtmed->GetArray() - 1299);
@@ -465,138 +470,104 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
 {
   //
   // Create the materials for the TRD
-  // Origin Y.Foka
   //
 
   Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ();
   Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max();
   
   // For polyethilene (CH2) 
-  Float_t ape[2] = { 12., 1. };
-  Float_t zpe[2] = {  6., 1. };
-  Float_t wpe[2] = {  1., 2. };
-  Float_t dpe    = 0.95;
+  Float_t ape[2]    = { 12.011 ,  1.0079 };
+  Float_t zpe[2]    = {  6.0   ,  1.0    };
+  Float_t wpe[2]    = {  1.0   ,  2.0    };
+  Float_t dpe       = 0.95;
 
   // For mylar (C5H4O2) 
-  Float_t amy[3] = { 12., 1., 16. };
-  Float_t zmy[3] = {  6., 1.,  8. };
-  Float_t wmy[3] = {  5., 4.,  2. };
-  Float_t dmy    = 1.39;
+  Float_t amy[3]    = { 12.011 ,  1.0079, 15.9994 };
+  Float_t zmy[3]    = {  6.0   ,  1.0   ,  8.0    };
+  Float_t wmy[3]    = {  5.0   ,  4.0   ,  2.0    };
+  Float_t dmy       = 1.39;
 
   // For CO2 
-  Float_t aco[2] = { 12., 16. };
-  Float_t zco[2] = {  6.,  8. };
-  Float_t wco[2] = {  1.,  2. };
-  Float_t dco    = 0.001977;
+  Float_t aco[2]    = { 12.011 , 15.9994 };
+  Float_t zco[2]    = {  6.0   ,  8.0    };
+  Float_t wco[2]    = {  1.0   ,  2.0    };
+  Float_t dco       = 0.00186;
 
   // For water
-  Float_t awa[2] = {  1., 16. };
-  Float_t zwa[2] = {  1.,  8. };
-  Float_t wwa[2] = {  2.,  1. };
-  Float_t dwa    = 1.0;
+  Float_t awa[2]    = {  1.0079, 15.9994 };
+  Float_t zwa[2]    = {  1.0   ,  8.0    };
+  Float_t wwa[2]    = {  2.0   ,  1.0    };
+  Float_t dwa       = 1.0;
 
   // For isobutane (C4H10)
-  Float_t ais[2] = { 12.,  1. };
-  Float_t zis[2] = {  6.,  1. };
-  Float_t wis[2] = {  4., 10. };
-  Float_t dis    = 0.00267;
+  Float_t ais[2]    = { 12.011 ,  1.0079 };
+  Float_t zis[2]    = {  6.0   ,  1.0    };
+  Float_t wis[2]    = {  4.0   , 10.0    };
+  Float_t dis       = 0.00267;
 
   // For plexiglas (C5H8O2)
-  Float_t apg[3] = { 12.011 ,  1.0    , 15.9994 };
-  Float_t zpg[3] = {  6.0   ,  1.0    ,  8.0    };
-  Float_t wpg[3] = {  5.0   ,  8.0    ,  2.0    };
-  Float_t dpg    = 1.18; 
+  Float_t apg[3]    = { 12.011 ,  1.0079, 15.9994 };
+  Float_t zpg[3]    = {  6.0   ,  1.0   ,  8.0    };
+  Float_t wpg[3]    = {  5.0   ,  8.0   ,  2.0    };
+  Float_t dpg       = 1.18; 
   
   // For epoxy (C18H19O3)
-  Float_t aEpoxy[3] = { 15.9994 ,  1.00794 , 12.0107 }; 
-  Float_t zEpoxy[3] = {  8.0    ,  1.0     ,  6.0    }; 
-  Float_t wEpoxy[3] = {  3.0    , 19.0     , 18.0    }; 
+  Float_t aEpoxy[3] = { 15.9994,  1.0079, 12.011  }; 
+  Float_t zEpoxy[3] = {  8.0   ,  1.0   ,  6.0    }; 
+  Float_t wEpoxy[3] = {  3.0   , 19.0   , 18.0    }; 
   Float_t dEpoxy    = 1.8 ; 
 
   // For air  
-  Float_t aAir[4]   = { 12.0      , 14.0      , 16.0      , 36.0     };
-  Float_t zAir[4]   = {  6.0      ,  7.0      ,  8.0      , 18.0     };
-  Float_t wAir[4]   = {  0.000124 ,  0.755267 ,  0.231781 ,  0.012827};
+  Float_t aAir[4]   = { 12.011   , 14.0     , 15.9994  , 36.0      };
+  Float_t zAir[4]   = {  6.0     ,  7.0     ,  8.0     , 18.0      };
+  Float_t wAir[4]   = {  0.000124,  0.755267,  0.231781,  0.012827 };
   Float_t dAir      = 1.20479E-3;
 
   // For G10
-  Float_t aG10[4]   = {  1.0         , 12.011       , 15.9994      , 28.086       };
-  Float_t zG10[4]   = {  1.0         ,  6.0         ,  8.0         , 14.0         };
-  //PH  Float_t wG10[4]   = {  0.148648649 ,  0.104054054 ,  0.483499056 ,  0.241666667 };
-  Float_t wG10[4]={0.15201,0.10641,0.49444,0.24714};
+  Float_t aG10[4]   = {  1.0079  , 12.011   , 15.9994  , 28.086    };
+  Float_t zG10[4]   = {  1.0     ,  6.0     ,  8.0     , 14.0      };
+  Float_t wG10[4]   = {  0.15201 ,  0.10641 ,  0.49444 ,  0.24714  };
   Float_t dG10      = 1.7;
 
   // For Xe/CO2-gas-mixture 
-  Float_t aXeCO2[3] = { 39.948, 12.0107, 15.9994 };
-  Float_t zXeCO2[3] = { 18.0,    6.0,     8.0    };
-  Float_t wXeCO2[3] = {  0.85,   0.0375,  0.1125 };
+  Float_t aXeCO2[3] = { 131.29   ,  12.0107 ,  15.9994  };
+  Float_t zXeCO2[3] = {  54.0    ,   6.0    ,   8.0     };
+  Float_t wXeCO2[3] = {   8.5    ,   1.5    ,   3.0     }; 
   // Xe-content of the Xe/CO2-mixture (85% / 15%) 
-  Float_t fxc    = .85;
-  // Xe-content of the Xe/Isobutane-mixture (97% / 3%) 
-  Float_t fxi    = .97;
-  Float_t dxe    = .005858;
+  Float_t fxc       = 0.85;
+  Float_t dxe       = 0.00549;
+  Float_t dgm       = fxc * dxe + (1.0 - fxc) * dco;
   
   // General tracking parameter
-  Float_t tmaxfd = -10.;
-  Float_t stemax = -1e10;
-  Float_t deemax = -0.1;
-  Float_t epsil  =  1e-4;
-  Float_t stmin  = -0.001;
-  
-  Float_t absl, radl, d, buf[1];
-  Float_t agm[2], zgm[2], wgm[2];
-  Float_t dgm1, dgm2;
-  Int_t   nbuf;
+  Float_t tmaxfd    = -10.0;
+  Float_t stemax    = -1.0e10;
+  Float_t deemax    = -0.1;
+  Float_t epsil     =  1.0e-4;
+  Float_t stmin     = -0.001;
   
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   //     Define Materials 
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
   AliMaterial( 1, "Al"   ,  26.98, 13.0, 2.7     ,     8.9 ,    37.2);
-  //AliMaterial( 2, "Air"  ,  14.61,  7.3, 0.001205, 30420.0 , 67500.0);
-  AliMaterial( 4, "Xe"   , 131.29, 54.0, dxe     ,  1447.59,     0.0);
+  AliMaterial( 4, "Xe"   , 131.29, 54.0, dxe     ,  1546.16,     0.0);
   AliMaterial( 5, "Cu"   ,  63.54, 29.0, 8.96    ,     1.43,    14.8);
   AliMaterial( 6, "C"    ,  12.01,  6.0, 2.265   ,    18.8 ,    74.4);
-  //AliMaterial(12, "G10"  ,  20.00, 10.0, 1.7     ,    19.4 ,   999.0);
   AliMaterial(15, "Sn"   , 118.71, 50.0, 7.31    ,     1.21,    14.8);
   AliMaterial(16, "Si"   ,  28.09, 14.0, 2.33    ,     9.36,    37.2);
-  //AliMaterial(17, "Epoxy",  17.75,  8.9, 1.8     ,    21.82,   999.0);
 
   // Mixtures 
-  AliMixture(2, "Air"         ,  aAir,  zAir,  dAir,  4,   wAir);
-  AliMixture(3, "Polyethilene",   ape,   zpe,   dpe, -2,    wpe);
-  AliMixture(7, "Mylar",          amy,   zmy,   dmy, -3,    wmy);
-  AliMixture(8, "CO2",            aco,   zco,   dco, -2,    wco);
-  AliMixture(9, "Isobutane",      ais,   zis,   dis, -2,    wis);
-  AliMixture(12,"G10",           aG10,  zG10,  dG10,  4,   wG10);
-  AliMixture(13,"Water",          awa,   zwa,   dwa, -2,    wwa);
-  AliMixture(14,"Plexiglas",      apg,   zpg,   dpg, -3,    wpg);
-  AliMixture(17,"Epoxy",       aEpoxy,zEpoxy,dEpoxy, -3, wEpoxy);
-
-  // Gas mixtures
-  Char_t namate[21]="";
-  // Xe/CO2-mixture
-  // Get properties of Xe 
-  //gMC->Gfmate((*fIdmate)[4], namate, agm[0], zgm[0], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Get properties of CO2 
-  //gMC->Gfmate((*fIdmate)[8], namate, agm[1], zgm[1], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Create gas mixture 
-  wgm[0] = fxc;
-  wgm[1] = 1. - fxc;
-  dgm1   = wgm[0] * dxe + wgm[1] * dco;
-  AliMixture(10, "Gas mixture 1", aXeCO2, zXeCO2, dgm1,  3, wXeCO2);
-
-  // Xe/Isobutane-mixture
-  // Get properties of Xe 
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[4], namate, agm[0], zgm[0], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Get properties of Isobutane
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[9], namate, agm[1], zgm[1], d, radl, absl, buf, nbuf);
-  // Create gas mixture 
-  wgm[0] = fxi;
-  wgm[1] = 1. - fxi;
-  dgm2   = wgm[0] * dxe + wgm[1] * dis;
-  AliMixture(11, "Gas mixture 2", agm, zgm, dgm2,  2, wgm);
+  AliMixture(2, "Air"         , aAir,   zAir,   dAir,    4, wAir  );
+  AliMixture(3, "Polyethilene", ape,    zpe,    dpe,    -2, wpe   );
+  AliMixture(7, "Mylar",        amy,    zmy,    dmy,    -3, wmy   );
+  AliMixture(8, "CO2",          aco,    zco,    dco,    -2, wco   );
+  AliMixture(9, "Isobutane",    ais,    zis,    dis,    -2, wis   );
+  AliMixture(10,"Gas mixture",  aXeCO2, zXeCO2, dgm,    -3, wXeCO2);
+  AliMixture(12,"G10",          aG10,   zG10,   dG10,    4, wG10  );
+  AliMixture(13,"Water",        awa,    zwa,    dwa,    -2, wwa   );
+  AliMixture(14,"Plexiglas",    apg,    zpg,    dpg,    -3, wpg   );
+  AliMixture(17,"Epoxy",        aEpoxy, zEpoxy, dEpoxy, -3, wEpoxy);
+
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   //     Tracking Media Parameters 
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
@@ -617,7 +588,7 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   AliMedium(5, "Padplane",   5, 1, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Fee + cables 
-  AliMedium(6, "Readout",    1, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(6, "Readout",    5, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // C frame 
   AliMedium(7, "C Frame",    6, 0, isxfld, sxmgmx
@@ -625,16 +596,9 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   // Mylar foils 
   AliMedium(8, "Mylar",      7, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  if (fGasMix == 1) {
-    // Gas-mixture (Xe/CO2) 
-    AliMedium(9, "Gas-mix",   10, 1, isxfld, sxmgmx
-                  , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  }
-  else {
-    // Gas-mixture (Xe/Isobutane) 
-    AliMedium(9, "Gas-mix",   11, 1, isxfld, sxmgmx
-                  , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
-  }
+  // Gas-mixture (Xe/CO2) 
+  AliMedium(9, "Gas-mix",   10, 1, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Nomex-honeycomb (use carbon for the time being) 
   AliMedium(10, "Nomex",      6, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
@@ -684,17 +648,18 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   AliMedium(25, "Serv-Cu" ,   5, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
 
+  // Special tracking options for charged particles for XeCO2
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"DRAY",1.0);
+  gMC->Gstpar((* fIdtmed)[9],"STRA",1.0); 
+
   // Save the density values for the TRD absorbtion
   fFoilDensity = dmy;
-  if (fGasMix == 1)
-    fGasDensity = dgm1;
-  else
-    fGasDensity = dgm2;
+  fGasDensity  = dgm;
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::DrawModule()
+void AliTRD::DrawModule() const
 {
   //
   // Draw a shaded view of the Transition Radiation Detector version 0
@@ -728,17 +693,7 @@ void AliTRD::DrawModule()
     gMC->Gsatt("BTR2","SEEN", 0);
     gMC->Gsatt("BTR3","SEEN", 0);
     gMC->Gsatt("UTR1","SEEN", 0);
-    if (fGeometry->GetPHOShole())
-      gMC->Gsatt("UTR2","SEEN", 0);
-    if (fGeometry->GetRICHhole())
-      gMC->Gsatt("UTR3","SEEN", 0);
   }
-//   gMC->Gsatt("UCII","SEEN", 0);
-//   gMC->Gsatt("UCIM","SEEN", 0);
-//   gMC->Gsatt("UCIO","SEEN", 0);
-//   gMC->Gsatt("UL02","SEEN", 1);
-//   gMC->Gsatt("UL05","SEEN", 1);
-//   gMC->Gsatt("UL06","SEEN", 1);
   
   gMC->Gdopt("hide", "on");
   gMC->Gdopt("shad", "on");
@@ -758,6 +713,7 @@ Int_t AliTRD::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
   //
   // Distance between the mouse and the TRD detector on the screen
   // Dummy routine
+  //
   
   return 9999;
 
@@ -770,34 +726,12 @@ void AliTRD::Init()
   // Initialize the TRD detector after the geometry has been created
   //
 
-  Int_t i;
+  AliDebug(1,"++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++");
 
-  if (fDebug) {
-    printf("\n%s: ",ClassName());
-    for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
-    printf(" TRD_INIT ");
-    for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
-    printf("\n");
-  }
-
-  if (fGeometry->IsVersion() == 1) {
-    printf("%s: Full geometry version initialized\n",ClassName());
-    if (fGeometry->GetPHOShole())
-      printf("%s: Leave space in front of PHOS free\n",ClassName());
-    if (fGeometry->GetRICHhole())
-      printf("%s: Leave space in front of RICH free\n",ClassName());
-  }
-  else {
-    printf("%s: Not a valid geometry\n",ClassName());
+  if (fGeometry->IsVersion() != 1) {
+    AliError("Not a valid geometry");
   }
   
-  if (fGasMix == 1) {
-    printf("%s: Gas Mixture: 85%% Xe + 15%% CO2\n",ClassName());
-  }
-  else {
-    printf("%s: Gas Mixture: 97%% Xe + 3%% Isobutane\n",ClassName());
-  }
-
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -808,18 +742,19 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t )
   // Hit originating from TR photons are given a different color
   //
 
-  //if (!fDrawTR) {
-  //  AliDetector::LoadPoints(track);
-  //  return;
-  //}
-
-  if (fHits == 0) return;
+  if (fHits == 0) {
+    return;
+  }
 
-  Int_t nhits = fHits->GetEntriesFast();
-  if (nhits == 0) return;
+  Int_t nhits  = fHits->GetEntriesFast();
+  if (nhits == 0) {
+    return;
+  }
 
   Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
-  if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
+  if (fPoints == 0) {
+    fPoints = new TObjArray(tracks);
+  }
 
   AliTRDhit *ahit;
   
@@ -871,7 +806,8 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t )
 
     }
     // TR photon hits
-    else if ((ahit->GetCharge() < 0) && (fDrawTR)) {
+    else if ((ahit->GetCharge() < 0) && 
+             (fDrawTR)) {
 
       trk = ahit->GetTrack();
       if (ntrkT[trk] == limiT[trk]) {
@@ -938,7 +874,7 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t )
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::MakeBranch(Option_toption)
+void AliTRD::MakeBranch(Option_t *option)
 {
   //
   // Create Tree branches for the TRD digits.
@@ -948,13 +884,15 @@ void AliTRD::MakeBranch(Option_t* option)
   Char_t branchname[15];
   sprintf(branchname,"%s",GetName());
 
-  const char *cD = strstr(option,"D");
+  const Char_t *cD = strstr(option,"D");
 
   AliDetector::MakeBranch(option);
 
-  if (fDigits && gAlice->TreeD() && cD) {
+  if (fDigits         && 
+      gAlice->TreeD() && 
+      cD) {
     MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(),branchname,&fDigits,buffersize,0);
-  }    
+  }
 
 }
 
@@ -966,7 +904,10 @@ void AliTRD::ResetDigits()
   //
 
   fNdigits = 0;
-  if (fDigits) fDigits->Clear();
+
+  if (fDigits) {
+    fDigits->Clear();
+  }
 
 }
 
@@ -977,53 +918,14 @@ void AliTRD::SetTreeAddress()
   // Set the branch addresses for the trees.
   //
 
-  if ( fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
+  if (fLoader->TreeH() && 
+      (fHits == 0x0)) {
     fHits = new TClonesArray("AliTRDhit",405);
   }
   AliDetector::SetTreeAddress();
 
 }
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::SetGasMix(Int_t imix)
-{
-  //
-  // Defines the gas mixture (imix=0:  Xe/Isobutane imix=1: Xe/CO2)
-  //
-  
-  if ((imix < 0) || (imix > 1)) {
-    printf("Wrong input value: %d\n",imix);
-    printf("Use standard setting\n");
-    fGasMix = 1;
-    return;
-  }
-
-  fGasMix = imix;
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::SetPHOShole()
-{
-  //
-  // Selects a geometry with a hole in front of the PHOS
-  //
-
-  fGeometry->SetPHOShole();
-
-}
-
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::SetRICHhole()
-{
-  //
-  // Selects a geometry with a hole in front of the RICH
-  //
-
-  fGeometry->SetRICHhole();
-
-}
-
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRD &AliTRD::operator=(const AliTRD &trd)
 {
@@ -1032,6 +934,7 @@ AliTRD &AliTRD::operator=(const AliTRD &trd)
   //
 
   if (this != &trd) ((AliTRD &) trd).Copy(*this);
+
   return *this;
 
 }