]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRD.cxx
Particle history saved
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRD.cxx
index ab1425de59de55c9cf6bc530da02b834121a71e2..d2df1b33a30ea75b8a8c73a5bb03c76e6a28ef4a 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/*
-$Log$
-
-Revision 1.17.2.6  2000/10/15 23:29:08  cblume
-Introduced more detailed geometry for the display
-
-Revision 1.17.2.5  2000/10/06 16:49:46  cblume
-Made Getters const
-
-Revision 1.17.2.4  2000/10/04 16:34:57  cblume
-Replace include files by forward declarations
-
-Revision 1.17.2.3  2000/09/22 14:45:17  cblume
-Included changes for the tracking
-
-Revision 1.17.2.2  2000/09/18 13:25:13  cblume
-Included LoadPoints() method to display the TR photons
-
-Revision 1.22  2000/10/02 21:28:19  fca
-Removal of useless dependecies via forward declarations
-
-Revision 1.21  2000/06/09 11:10:07  cblume
-Compiler warnings and coding conventions, next round
-
-Revision 1.20  2000/06/08 18:32:57  cblume
-Make code compliant to coding conventions
-
-Revision 1.19  2000/06/07 16:25:37  cblume
-Try to remove compiler warnings on Sun and HP
-
-Revision 1.18  2000/05/08 16:17:27  cblume
-Merge TRD-develop
-
-Revision 1.21  2000/06/09 11:10:07  cblume
-Compiler warnings and coding conventions, next round
-
-Revision 1.20  2000/06/08 18:32:57  cblume
-Make code compliant to coding conventions
-
-Revision 1.19  2000/06/07 16:25:37  cblume
-Try to remove compiler warnings on Sun and HP
-
-Revision 1.18  2000/05/08 16:17:27  cblume
-Merge TRD-develop
-
-Revision 1.17.2.1  2000/05/08 14:28:59  cblume
-Introduced SetPHOShole() and SetRICHhole(). AliTRDrecPoint container is now a TObjArray
-
-Revision 1.17  2000/02/28 19:10:26  cblume
-Include the new TRD classes
-
-Revision 1.16.2.2  2000/02/28 17:53:24  cblume
-Introduce TRD geometry classes
-
-Revision 1.16.2.1  2000/02/28 17:04:19  cblume
-Include functions and data members for AliTRDrecPoint
-
-Revision 1.16  2000/01/19 17:17:35  fca
-Introducing a list of lists of hits -- more hits allowed for detector now
-
-Revision 1.15  1999/11/02 17:04:25  fca
-Small syntax change for HP compiler
-
-Revision 1.14  1999/11/02 16:57:02  fca
-Avoid non ansi warnings on HP compilers
-
-Revision 1.13  1999/11/02 16:35:56  fca
-New version of TRD introduced
-
-Revision 1.12  1999/11/01 20:41:51  fca
-Added protections against using the wrong version of FRAME
-
-Revision 1.11  1999/09/29 09:24:34  fca
-Introduction of the Copyright and cvs Log
-
-*/
+/* $Id$ */
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
@@ -99,28 +24,35 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
 #include <stdlib.h>
+#include <Riostream.h>
 
+#include <TFile.h>
+#include <TGeometry.h>
+#include <TLorentzVector.h>
 #include <TMath.h>
 #include <TNode.h>
-#include <TGeometry.h>
-#include <TTree.h>                                                              
 #include <TPGON.h> 
-
-#include "AliRun.h"
+#include <TParticle.h>
+#include <TROOT.h>
+#include <TTree.h>
+#include <TVirtualMC.h>
 #include "AliConst.h"
 #include "AliDigit.h"
+#include "AliLoader.h"
 #include "AliMagF.h"
-#include "AliMC.h"                                                              
+#include "AliRun.h"
 #include "AliTRD.h"
-#include "AliTRDhit.h"
-#include "AliTRDpoints.h"
 #include "AliTRDdigit.h"
 #include "AliTRDdigitizer.h"
-#include "AliTRDclusterizer.h"
-#include "AliTRDgeometryHole.h"
+#include "AliTRDdigitsManager.h"
 #include "AliTRDgeometryFull.h"
-#include "AliTRDrecPoint.h"
+#include "AliTRDgeometryHole.h"
+#include "AliTRDhit.h"
+#include "AliTRDpoints.h"
+#include "AliTRDtrackHits.h"  
+#include "AliTrackReference.h"
+#include "AliMC.h"
 
 ClassImp(AliTRD)
  
@@ -131,21 +63,21 @@ AliTRD::AliTRD()
   // Default constructor
   //
 
-  fIshunt      = 0;
-  fGasMix      = 0;
-  fHits        = 0;
-  fDigits      = 0;
+  fIshunt        = 0;
+  fGasMix        = 0;
+  fHits          = 0;
+  fDigits        = 0;
 
-  fRecPoints   = 0;
-  fNRecPoints  = 0;
+  fGeometry      = 0;
 
-  fGeometry    = 0;
+  fGasDensity    = 0;
+  fFoilDensity   = 0;
 
-  fGasDensity  = 0;
-  fFoilDensity = 0;
-
-  fDrawTR      = 0;
-  fDisplayType = 0; 
+  fDrawTR        = 0;
+  fDisplayType   = 0;
+  fTrackHits     = 0; 
+  fHitType       = 0; 
 
 }
  
@@ -165,13 +97,9 @@ AliTRD::AliTRD(const char *name, const char *title)
     exit(1);
   } 
 
-  // Define the TRD geometry according to the FRAME geometry
-  if      (frame->IsVersion() == 0) {
-    // Geometry with hole
-    fGeometry = new AliTRDgeometryHole();
-  }
-  else if (frame->IsVersion() == 1) {
-    // Geometry without hole
+  // Define the TRD geometry
+  if ((frame->IsVersion() == 0) ||
+      (frame->IsVersion() == 1)) {
     fGeometry = new AliTRDgeometryFull();
   }
   else {
@@ -179,32 +107,37 @@ AliTRD::AliTRD(const char *name, const char *title)
     exit(1);
   }
 
+  // Save the geometry
+  TDirectory* saveDir = gDirectory;
+  gAlice->GetRunLoader()->CdGAFile();
+  fGeometry->Write("TRDgeometry");
+  saveDir->cd();
+
   // Allocate the hit array
-  fHits        = new TClonesArray("AliTRDhit"     ,405);
-  gAlice->AddHitList(fHits);
+  fHits           = new TClonesArray("AliTRDhit"     ,405);
+  gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
 
   // Allocate the digits array
-  fDigits      = 0;
+  fDigits         = 0;
 
-  // Allocate the rec point array
-  fRecPoints   = new TObjArray(400);
-  fNRecPoints  = 0;
-   
-  fIshunt      = 0;
-  fGasMix      = 0;
+  fIshunt        = 0;
+  fGasMix        = 1;
 
-  fGasDensity  = 0;
-  fFoilDensity = 0;
+  fGasDensity    = 0;
+  fFoilDensity   = 0;
 
-  fDrawTR      = 0;
-  fDisplayType = 0;
+  fDrawTR        = 0;
+  fDisplayType   = 0;
+
+  fTrackHits     = 0;
+  fHitType       = 2;
 
   SetMarkerColor(kWhite);   
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-AliTRD::AliTRD(const AliTRD &trd)
+AliTRD::AliTRD(const AliTRD &trd):AliDetector(trd)
 {
   //
   // Copy constructor
@@ -223,57 +156,153 @@ AliTRD::~AliTRD()
 
   fIshunt = 0;
 
-  delete fGeometry;
-  delete fHits;
-  delete fRecPoints;
+  if (fGeometry) {
+    delete fGeometry;
+    fGeometry  = 0;
+  }
+  if (fHits) {
+    delete fHits;
+    fHits      = 0;
+  }
+//  if (fRecPoints) {
+//    delete fRecPoints;
+//    fRecPoints = 0;
+//  }
+  if (fTrackHits) {
+    delete fTrackHits;
+    fTrackHits = 0;
+  }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::AddRecPoint(Float_t *pos, Int_t *digits, Int_t det, Float_t amp
-                       , Int_t *tracks)
+void AliTRD::Hits2Digits()
 {
   //
-  // Add a reconstructed point for the TRD
+  // Create digits
   //
-
-  AliTRDrecPoint *recPoint = new AliTRDrecPoint();
-  TVector3        posVec(pos[0],pos[1],pos[2]);
-  recPoint->SetLocalPosition(posVec);
-  recPoint->SetDetector(det);
-  recPoint->SetEnergy(amp);
-  for (Int_t iDigit = 0; iDigit < 3; iDigit++) {
-    recPoint->AddDigit(digits[iDigit]);
+  AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");
+  digitizer.SetDebug(GetDebug());
+  
+  // Initialization
+  digitizer.InitDetector();
+    
+  if (!fLoader->TreeH()) fLoader->LoadHits("read");
+  fLoader->LoadDigits("recreate");
+  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    digitizer.Open(runLoader->GetFileName().Data(), iEvent);
+    digitizer.MakeDigits();
+    digitizer.WriteDigits();
   }
 
-  recPoint->AddTrackIndex(tracks);
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadDigits();
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::Hits2SDigits()
+{
+  //
+  // Create summable digits
+  //
+  AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");
+  // For the summable digits
+  digitizer.SetSDigits(kTRUE);
+  digitizer.SetDebug(GetDebug());
+
+  // Initialization
+  digitizer.InitDetector();
+    
+  if (!fLoader->TreeH()) fLoader->LoadHits("read");
+  fLoader->LoadSDigits("recreate");
+  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    digitizer.Open(runLoader->GetFileName().Data(), iEvent);
+    digitizer.MakeDigits();
+    digitizer.WriteDigits();
+  }
 
-  recPoint->SetTrackingYZ(0.,0.);  // variance values set inside
-  fRecPoints->Add(recPoint);
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadSDigits();
+  }
 
+//_____________________________________________________________________________
+AliDigitizer* AliTRD::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
+{
+  return new AliTRDdigitizer(manager);
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::AddDigit(Int_t *digits, Int_t *amp)
+void AliTRD::SDigits2Digits()
 {
   //
-  // Add a digit for the TRD
+  // Create final digits from summable digits
   //
 
-  TClonesArray &ldigits = *fDigits;
-  new(ldigits[fNdigits++]) AliTRDdigit(kFALSE,digits,amp);
+   // Create the TRD digitizer
+  AliTRDdigitizer digitizer("TRDdigitizer","TRD digitizer class");  
+  digitizer.SetDebug(GetDebug());
+
+  // Set the parameter
+  digitizer.SetEvent(gAlice->GetEvNumber());
+
+  // Initialization
+  digitizer.InitDetector();
+
+  // Read the s-digits via digits manager
+  AliTRDdigitsManager sdigitsManager;
+  sdigitsManager.SetDebug(GetDebug());
+  sdigitsManager.SetSDigits(kTRUE);
+  sdigitsManager.CreateArrays();
+  
+  if (!fLoader->TreeS()) 
+    if (fLoader->LoadSDigits("read"))
+     {
+       Error("SDigits2Digits","Error while reading SDigits for event %d",gAlice->GetEvNumber());
+       return;
+     }
+  if (!fLoader->TreeS()) return;
+  
+  sdigitsManager.ReadDigits(fLoader->TreeS());
+
+  // Add the s-digits to the input list 
+  digitizer.AddSDigitsManager(&sdigitsManager);
+
+  // Convert the s-digits to normal digits
+  digitizer.SDigits2Digits();
+
+  // Store the digits
+  if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
+  if (digitizer.MakeBranch(fLoader->TreeD())){
+    digitizer.WriteDigits();
+  }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::AddHit(Int_t track, Int_t det, Float_t *hits, Int_t q)
+void AliTRD::AddHit(Int_t track, Int_t det, Float_t *hits, Int_t q
+                  , Bool_t inDrift)
 {
   //
   // Add a hit for the TRD
+  // 
+  // The data structure is set according to fHitType:
+  //   bit0: standard TClonesArray
+  //   bit1: compressed trackHits structure
   //
 
-  TClonesArray &lhits = *fHits;
-  new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt,track,det,hits,q);
+  if (fHitType & 1) {
+    TClonesArray &lhits = *fHits;
+    new(lhits[fNhits++]) AliTRDhit(fIshunt,track,det,hits,q);
+  }
+
+  if (fHitType > 1) {
+    AddHit2(track,det,hits,q,inDrift);
+  }
 
 }
 
@@ -289,15 +318,15 @@ void AliTRD::BuildGeometry()
 
   Float_t rmin, rmax;
   Float_t zmax1, zmax2;
+
+  Int_t   iPlan;
  
   const Int_t kColorTRD = 46;
   
   // Find the top node alice
   top = gAlice->GetGeometry()->GetNode("alice");
   
-  switch (fDisplayType) {
-
-  case 0:
+  if      (fDisplayType == 0) {
 
     pgon = new TPGON("S_TRD","TRD","void",0,360,AliTRDgeometry::Nsect(),4);
     rmin = AliTRDgeometry::Rmin();
@@ -311,22 +340,24 @@ void AliTRD::BuildGeometry()
     node->SetLineColor(kColorTRD);
     fNodes->Add(node);
 
-    break;
+  }
+  else if (fDisplayType == 1) {
 
-  case 1:
+    Char_t name[7];
 
     Float_t slope = (AliTRDgeometry::Zmax1() - AliTRDgeometry::Zmax2())
                   / (AliTRDgeometry::Rmax()  - AliTRDgeometry::Rmin());
 
-    rmin  = AliTRDgeometry::Rmin() + AliTRDgeometry::RaThick();
-    rmax  = rmin + AliTRDgeometry::DrThick();
-    zmax2 = AliTRDgeometry::Zmax2() + slope * AliTRDgeometry::RaThick();
+    rmin  = AliTRDgeometry::Rmin() + AliTRDgeometry::CraHght();
+    rmax  = rmin                   + AliTRDgeometry::CdrHght();
+
+    Float_t thickness = rmin - AliTRDgeometry::Rmin();
+    zmax2 = AliTRDgeometry::Zmax2() + slope * thickness;
     zmax1 = zmax2 + slope * AliTRDgeometry::DrThick();
-    Char_t name[7];
 
-    for (Int_t iPlan = 0; iPlan < AliTRDgeometry::Nplan(); iPlan++) {
+    for (iPlan = 0; iPlan < AliTRDgeometry::Nplan(); iPlan++) {
 
-      sprintf(name,"S_TRD%d",iPlan);
+      sprintf(name,"S_TR1%d",iPlan);
       pgon  = new TPGON(name,"TRD","void",0,360,AliTRDgeometry::Nsect(),4);
       pgon->DefineSection(0,-zmax1,rmax,rmax);
       pgon->DefineSection(1,-zmax2,rmin,rmax);
@@ -345,9 +376,34 @@ void AliTRD::BuildGeometry()
 
     }
 
-    break;
+    thickness += AliTRDgeometry::DrThick();
+    rmin  = AliTRDgeometry::Rmin() + thickness;
+    rmax  = rmin + AliTRDgeometry::AmThick();
+    zmax2 = AliTRDgeometry::Zmax2() + slope * thickness;
+    zmax1 = zmax2 + slope * AliTRDgeometry::AmThick();
+
+    for (iPlan = 0; iPlan < AliTRDgeometry::Nplan(); iPlan++) {
+
+      sprintf(name,"S_TR2%d",iPlan);
+      pgon  = new TPGON(name,"TRD","void",0,360,AliTRDgeometry::Nsect(),4);
+      pgon->DefineSection(0,-zmax1,rmax,rmax);
+      pgon->DefineSection(1,-zmax2,rmin,rmax);
+      pgon->DefineSection(2, zmax2,rmin,rmax);
+      pgon->DefineSection(3, zmax1,rmax,rmax);
+      top->cd();
+      node = new TNode("TRD","TRD",name,0,0,0,"");
+      node->SetLineColor(kColorTRD);
+      fNodes->Add(node);
+
+      Float_t height = AliTRDgeometry::Cheight() + AliTRDgeometry::Cspace(); 
+      rmin  = rmin  + height;
+      rmax  = rmax  + height;
+      zmax1 = zmax1 + slope * height;
+      zmax2 = zmax2 + slope * height;
+
+    }
 
-  };
+  }
 
 }
  
@@ -360,12 +416,11 @@ void AliTRD::Copy(TObject &trd)
 
   ((AliTRD &) trd).fGasMix      = fGasMix;
   ((AliTRD &) trd).fGeometry    = fGeometry;       
-  ((AliTRD &) trd).fRecPoints   = fRecPoints;
-  ((AliTRD &) trd).fNRecPoints  = fNRecPoints;
   ((AliTRD &) trd).fGasDensity  = fGasDensity;
   ((AliTRD &) trd).fFoilDensity = fFoilDensity;
   ((AliTRD &) trd).fDrawTR      = fDrawTR;
   ((AliTRD &) trd).fDisplayType = fDisplayType;
+  ((AliTRD &) trd).fHitType     = fHitType;
 
   //AliDetector::Copy(trd);
 
@@ -430,9 +485,15 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   Float_t wis[2] = {  4., 10. };
   Float_t dis    = 0.00267;
 
+  // For plexiglas (C5H8O2)
+  Float_t apg[3] = { 12.011 ,  1.0    , 15.9994 };
+  Float_t zpg[3] = {  6.0   ,  1.0    ,  8.0    };
+  Float_t wpg[3] = {  5.0   ,  8.0    ,  2.0    };
+  Float_t dpg    = 1.18; 
+
   // For Xe/CO2-gas-mixture 
-  // Xe-content of the Xe/CO2-mixture (90% / 10%) 
-  Float_t fxc    = .90;
+  // Xe-content of the Xe/CO2-mixture (85% / 15%) 
+  Float_t fxc    = .85;
   // Xe-content of the Xe/Isobutane-mixture (97% / 3%) 
   Float_t fxi    = .97;
   Float_t dxe    = .005858;
@@ -453,22 +514,26 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   //     Define Materials 
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
-  AliMaterial( 1, "Al $",  26.98, 13.0, 2.7     ,     8.9 ,    37.2);
-  AliMaterial( 2, "Air$",  14.61,  7.3, 0.001205, 30420.0 , 67500.0);
-  AliMaterial( 4, "Xe $", 131.29, 54.0, dxe     ,  1447.59,     0.0);
-  AliMaterial( 5, "Cu $",  63.54, 29.0, 8.96    ,     1.43,    14.8);
-  AliMaterial( 6, "C  $",  12.01,  6.0, 2.265   ,    18.8 ,    74.4);
-  AliMaterial(12, "G10$",  20.00, 10.0, 1.7     ,    19.4 ,   999.0);
+  AliMaterial( 1, "Al"   ,  26.98, 13.0, 2.7     ,     8.9 ,    37.2);
+  AliMaterial( 2, "Air"  ,  14.61,  7.3, 0.001205, 30420.0 , 67500.0);
+  AliMaterial( 4, "Xe"   , 131.29, 54.0, dxe     ,  1447.59,     0.0);
+  AliMaterial( 5, "Cu"   ,  63.54, 29.0, 8.96    ,     1.43,    14.8);
+  AliMaterial( 6, "C"    ,  12.01,  6.0, 2.265   ,    18.8 ,    74.4);
+  AliMaterial(12, "G10"  ,  20.00, 10.0, 1.7     ,    19.4 ,   999.0);
+  AliMaterial(15, "Sn"   , 118.71, 50.0, 7.31    ,     1.21,    14.8);
+  AliMaterial(16, "Si"   ,  28.09, 14.0, 2.33    ,     9.36,    37.2);
+  AliMaterial(17, "Epoxy",  17.75,  8.9, 1.8     ,    21.82,   999.0);
 
   // Mixtures 
-  AliMixture(3, "Polyethilene$",   ape, zpe, dpe, -2, wpe);
-  AliMixture(7, "Mylar$",          amy, zmy, dmy, -3, wmy);
-  AliMixture(8, "CO2$",            aco, zco, dco, -2, wco);
-  AliMixture(9, "Isobutane$",      ais, zis, dis, -2, wis);
-  AliMixture(13,"Water$",          awa, zwa, dwa, -2, wwa);
+  AliMixture(3, "Polyethilene",   ape, zpe, dpe, -2, wpe);
+  AliMixture(7, "Mylar",          amy, zmy, dmy, -3, wmy);
+  AliMixture(8, "CO2",            aco, zco, dco, -2, wco);
+  AliMixture(9, "Isobutane",      ais, zis, dis, -2, wis);
+  AliMixture(13,"Water",          awa, zwa, dwa, -2, wwa);
+  AliMixture(14,"Plexiglas",      apg, zpg, dpg, -3, wpg);
 
   // Gas mixtures
-  Char_t namate[21];
+  Char_t namate[21]="";
   // Xe/CO2-mixture
   // Get properties of Xe 
   gMC->Gfmate((*fIdmate)[4], namate, agm[0], zgm[0], d, radl, absl, buf, nbuf);
@@ -478,7 +543,7 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   wgm[0] = fxc;
   wgm[1] = 1. - fxc;
   dgm1   = wgm[0] * dxe + wgm[1] * dco;
-  AliMixture(10, "Gas mixture 1$", agm, zgm, dgm1,  2, wgm);
+  AliMixture(10, "Gas mixture 1", agm, zgm, dgm1,  2, wgm);
   // Xe/Isobutane-mixture
   // Get properties of Xe 
   gMC->Gfmate((*fIdmate)[4], namate, agm[0], zgm[0], d, radl, absl, buf, nbuf);
@@ -488,60 +553,93 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
   wgm[0] = fxi;
   wgm[1] = 1. - fxi;
   dgm2   = wgm[0] * dxe + wgm[1] * dis;
-  AliMixture(11, "Gas mixture 2$", agm, zgm, dgm2,  2, wgm);
+  AliMixture(11, "Gas mixture 2", agm, zgm, dgm2,  2, wgm);
  
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   //     Tracking Media Parameters 
   //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
   // Al Frame 
-  AliMedium(1, "Al Frame$",   1, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(1, "Al Frame",   1, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Air 
-  AliMedium(2, "Air$",        2, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(2, "Air",        2, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Polyethilene 
-  AliMedium(3, "Radiator$",   3, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(3, "Radiator",   3, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Xe 
-  AliMedium(4, "Xe$",         4, 1, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(4, "Xe",         4, 1, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Cu pads 
-  AliMedium(5, "Padplane$",   5, 1, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(5, "Padplane",   5, 1, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Fee + cables 
-  AliMedium(6, "Readout$",    1, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(6, "Readout",    1, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // C frame 
-  AliMedium(7, "C Frame$",    6, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(7, "C Frame",    6, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Mylar foils 
-  AliMedium(8, "Mylar$",      7, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(8, "Mylar",      7, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   if (fGasMix == 1) {
     // Gas-mixture (Xe/CO2) 
-    AliMedium(9, "Gas-mix$",   10, 1, isxfld, sxmgmx
+    AliMedium(9, "Gas-mix",   10, 1, isxfld, sxmgmx
                   , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   }
   else {
     // Gas-mixture (Xe/Isobutane) 
-    AliMedium(9, "Gas-mix$",   11, 1, isxfld, sxmgmx
+    AliMedium(9, "Gas-mix",   11, 1, isxfld, sxmgmx
                   , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   }
   // Nomex-honeycomb (use carbon for the time being) 
-  AliMedium(10, "Nomex$",      6, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(10, "Nomex",      6, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Kapton foils (use Mylar for the time being) 
-  AliMedium(11, "Kapton$",     7, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(11, "Kapton",     7, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Gas-filling of the radiator 
-  AliMedium(12, "CO2$",        8, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(12, "CO2",        8, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // G10-plates
-  AliMedium(13, "G10-plates$",12, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(13, "G10-plates",12, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
   // Cooling water
-  AliMedium(14, "Water$",     13, 0, isxfld, sxmgmx
+  AliMedium(14, "Water",     13, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Rohacell (plexiglas) for the radiator
+  AliMedium(15, "Rohacell",  14, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Al layer in MCMs
+  AliMedium(16, "MCM-Al"  ,   1, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Sn layer in MCMs
+  AliMedium(17, "MCM-Sn"  ,  15, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Cu layer in MCMs
+  AliMedium(18, "MCM-Cu"  ,   5, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // G10 layer in MCMs
+  AliMedium(19, "MCM-G10" ,  12, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Si in readout chips
+  AliMedium(20, "Chip-Si" ,  16, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Epoxy in readout chips
+  AliMedium(21, "Chip-Ep" ,  17, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // PE in connectors
+  AliMedium(22, "Conn-PE" ,   3, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Cu in connectors
+  AliMedium(23, "Chip-Cu" ,   5, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Al of cooling pipes
+  AliMedium(24, "Cooling" ,   1, 0, isxfld, sxmgmx
+                , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
+  // Cu in services
+  AliMedium(25, "Serv-Cu" ,   5, 0, isxfld, sxmgmx
                 , tmaxfd, stemax, deemax, epsil, stmin);
 
   // Save the density values for the TRD absorbtion
@@ -554,7 +652,7 @@ void AliTRD::CreateMaterials()
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::DrawModule()
+void AliTRD::DrawModule() const
 {
   //
   // Draw a shaded view of the Transition Radiation Detector version 0
@@ -575,9 +673,9 @@ void AliTRD::DrawModule()
     gMC->Gsatt("BTR1","SEEN", 0);
     gMC->Gsatt("BTR2","SEEN", 0);
     gMC->Gsatt("BTR3","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD1","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD2","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD3","SEEN", 0);
+    gMC->Gsatt("UTR1","SEEN", 0);
+    gMC->Gsatt("UTR2","SEEN", 0);
+    gMC->Gsatt("UTR3","SEEN", 0);
   }
   else {
     gMC->Gsatt("B071","SEEN", 0);
@@ -587,18 +685,18 @@ void AliTRD::DrawModule()
     gMC->Gsatt("BTR1","SEEN", 0);
     gMC->Gsatt("BTR2","SEEN", 0);
     gMC->Gsatt("BTR3","SEEN", 0);
-    gMC->Gsatt("TRD1","SEEN", 0);
+    gMC->Gsatt("UTR1","SEEN", 0);
     if (fGeometry->GetPHOShole())
-      gMC->Gsatt("TRD2","SEEN", 0);
+      gMC->Gsatt("UTR2","SEEN", 0);
     if (fGeometry->GetRICHhole())
-      gMC->Gsatt("TRD3","SEEN", 0);
-  }
-  gMC->Gsatt("UCII","SEEN", 0);
-  gMC->Gsatt("UCIM","SEEN", 0);
-  gMC->Gsatt("UCIO","SEEN", 0);
-  gMC->Gsatt("UL02","SEEN", 1);
-  gMC->Gsatt("UL05","SEEN", 1);
-  gMC->Gsatt("UL06","SEEN", 1);
+      gMC->Gsatt("UTR3","SEEN", 0);
+  }
+//   gMC->Gsatt("UCII","SEEN", 0);
+//   gMC->Gsatt("UCIM","SEEN", 0);
+//   gMC->Gsatt("UCIO","SEEN", 0);
+//   gMC->Gsatt("UL02","SEEN", 1);
+//   gMC->Gsatt("UL05","SEEN", 1);
+//   gMC->Gsatt("UL06","SEEN", 1);
   
   gMC->Gdopt("hide", "on");
   gMC->Gdopt("shad", "on");
@@ -613,7 +711,7 @@ void AliTRD::DrawModule()
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTRD::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
+Int_t AliTRD::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t ) const
 {
   //
   // Distance between the mouse and the TRD detector on the screen
@@ -632,51 +730,59 @@ void AliTRD::Init()
 
   Int_t i;
 
-  printf("\n");
-  for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
-  printf(" TRD_INIT ");
-  for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
-  printf("\n");
-  printf("\n");
-
-  if      (fGeometry->IsVersion() == 0) {
-    printf("          Geometry for spaceframe with holes initialized.\n\n");
+  if (fDebug) {
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
+    printf(" TRD_INIT ");
+    for (i = 0; i < 35; i++) printf("*");
+    printf("\n");
   }
-  else if (fGeometry->IsVersion() == 1) {
-    printf("          Geometry for spaceframe without holes initialized.\n");
+
+  if (fGeometry->IsVersion() == 1) {
+    printf("%s: Full geometry version initialized\n",ClassName());
     if (fGeometry->GetPHOShole())
-      printf("          Leave space in front of PHOS free.\n");
+      printf("%s: Leave space in front of PHOS free\n",ClassName());
     if (fGeometry->GetRICHhole())
-      printf("          Leave space in front of RICH free.\n");
-    printf("\n");
+      printf("%s: Leave space in front of RICH free\n",ClassName());
+  }
+  else {
+    printf("%s: Not a valid geometry\n",ClassName());
+  }
+  
+  if (fGasMix == 1) {
+    printf("%s: Gas Mixture: 85%% Xe + 15%% CO2\n",ClassName());
+  }
+  else {
+    printf("%s: Gas Mixture: 97%% Xe + 3%% Isobutane\n",ClassName());
   }
-
-  if (fGasMix == 1)
-    printf("          Gas Mixture: 90%% Xe + 10%% CO2\n\n");
-  else
-    printf("          Gas Mixture: 97%% Xe + 3%% Isobutane\n\n");
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::LoadPoints(Int_t track)
+void AliTRD::LoadPoints(Int_t )
 {
   //
   // Store x, y, z of all hits in memory.
   // Hit originating from TR photons are given a different color
   //
 
-  if (!fDrawTR) {
-    AliDetector::LoadPoints(track);
-    return;
-  }
+  //if (!fDrawTR) {
+  //  AliDetector::LoadPoints(track);
+  //  return;
+  //}
 
-  if (fHits == 0) return;
+  if ((fHits == 0) && (fTrackHits == 0)) return;
 
-  Int_t nhits  = fHits->GetEntriesFast();
+  Int_t nhits;
+  if (fHitType < 2) {
+    nhits = fHits->GetEntriesFast();
+  }
+  else {
+    nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  } 
   if (nhits == 0) return;
 
-  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
 
   AliTRDhit *ahit;
@@ -696,15 +802,14 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t track)
     limiT[i] = 0;
   }
   
-  AliTRDpoints  *points = 0;
-  Float_t       *fp     = 0;
-  Int_t          trk;
-  Int_t          chunk  = nhits / 4 + 1;
+  AliTRDpoints *points = 0;
+  Float_t      *fp     = 0;
+  Int_t         trk;
+  Int_t         chunk  = nhits / 4 + 1;
 
   // Loop over all the hits and store their position
-  for (Int_t hit = 0; hit < nhits; hit++) {
-
-    ahit = (AliTRDhit *) fHits->UncheckedAt(hit);
+  ahit = (AliTRDhit *) FirstHit(-1);
+  while (ahit) {
 
     // dEdx hits
     if (ahit->GetCharge() >= 0) {
@@ -730,7 +835,7 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t track)
 
     }
     // TR photon hits
-    else {
+    else if ((ahit->GetCharge() < 0) && (fDrawTR)) {
 
       trk = ahit->GetTrack();
       if (ntrkT[trk] == limiT[trk]) {
@@ -753,6 +858,8 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t track)
 
     }
 
+    ahit = (AliTRDhit *) NextHit();
+
   }
 
   for (trk = 0; trk < tracks; ++trk) {
@@ -798,36 +905,36 @@ void AliTRD::LoadPoints(Int_t track)
 void AliTRD::MakeBranch(Option_t* option)
 {
   //
-  // Create Tree branches for the TRD digits and cluster.
+  // Create Tree branches for the TRD digits.
   //
 
-  //Int_t  buffersize = 4000;
-  //Char_t branchname[15];
+  Int_t  buffersize = 4000;
+  Char_t branchname[15];
+  sprintf(branchname,"%s",GetName());
+
+  const char *cD = strstr(option,"D");
 
   AliDetector::MakeBranch(option);
 
-  //Char_t *r = strstr(option,"R");
-  //sprintf(branchname,"%srecPoints",GetName());
-  //if (fRecPoints && gAlice->TreeR() && r) {
-  //  gAlice->TreeR()->Branch(branchname,fRecPoints->IsA()->GetName()
-  //                         ,&fRecPoints,buffersize,0);
-  //  printf("* AliTRD::MakeBranch * Making Branch %s for points in TreeR\n",branchname);
-  //}
+  if (fDigits && gAlice->TreeD() && cD) {
+    MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(),branchname,&fDigits,buffersize,0);
+  }    
+
+  if (fHitType > 1) {
+    MakeBranch2(option,0); 
+  }
 
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRD::ResetRecPoints()
+void AliTRD::ResetDigits()
 {
   //
-  // Reset number of reconstructed points and the point array
+  // Reset number of digits and the digits array for this detector
   //
 
-  if(fRecPoints) {
-    fNRecPoints = 0;
-    Int_t nentr = fRecPoints->GetEntriesFast();
-    for(Int_t i = 0; i < nentr; i++) delete fRecPoints->RemoveAt(i);
-  }
+  fNdigits = 0;
+  if (fDigits) fDigits->Clear();
 
 }
 
@@ -838,21 +945,11 @@ void AliTRD::SetTreeAddress()
   // Set the branch addresses for the trees.
   //
 
-  Char_t branchname[15];
-
+  if ( fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0))  fHits = new TClonesArray("AliTRDhit",405);
   AliDetector::SetTreeAddress();
 
-  TBranch *branch;
-  TTree   *treeR = gAlice->TreeR();
-
-  if (treeR) {
-    sprintf(branchname,"%srecPoints",GetName());
-    if (fRecPoints) {
-      branch = treeR->GetBranch(branchname);
-      if (branch) {
-        branch->SetAddress(&fRecPoints);
-      }
-    }
+  if (fHitType > 0) {
+    SetTreeAddress2();    
   }
 
 }
@@ -867,7 +964,7 @@ void AliTRD::SetGasMix(Int_t imix)
   if ((imix < 0) || (imix > 1)) {
     printf("Wrong input value: %d\n",imix);
     printf("Use standard setting\n");
-    fGasMix = 0;
+    fGasMix = 1;
     return;
   }
 
@@ -907,4 +1004,549 @@ AliTRD &AliTRD::operator=(const AliTRD &trd)
   if (this != &trd) ((AliTRD &) trd).Copy(*this);
   return *this;
 
+} 
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::FinishPrimary()
+{
+  //
+  // Store the hits in the containers after all primaries are finished
+  //
+
+  if (fTrackHits) { 
+    fTrackHits->FlushHitStack();
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
+{
+  //
+  // Remap the track IDs
+  //
+
+  if (!fTrackHits) {
+    return;
+  }
+
+  if (fTrackHits) {
+    TClonesArray *arr = fTrackHits->GetArray();;
+    for (Int_t i = 0; i < arr->GetEntriesFast(); i++){
+      AliTrackHitsParamV2 *info = (AliTrackHitsParamV2 *) (arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::ResetHits()
+{
+  //
+  // Reset the hits
+  //
+
+  AliDetector::ResetHits();
+  if (fTrackHits) {
+    fTrackHits->Clear();
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliHit* AliTRD::FirstHit(Int_t track)
+{
+  //
+  // Return the first hit of a track
+  //
+
+  if (fHitType > 1) {
+    return FirstHit2(track);
+  }
+
+  return AliDetector::FirstHit(track);
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliHit* AliTRD::NextHit()
+{
+  //
+  // Returns the next hit of a track
+  //
+
+  if (fHitType > 1) {
+    return NextHit2();
+  }
+
+  return AliDetector::NextHit();
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliHit* AliTRD::FirstHit2(Int_t track) 
+{
+  //
+  // Initializes the hit iterator.
+  // Returns the address of the first hit of a track.
+  // If <track> >= 0 the track is read from disk,
+  // while if <track> < 0 the first hit of the current
+  // track is returned.
+  //
+
+  if (track >= 0) {
+    gAlice->ResetHits();
+    TreeH()->GetEvent(track);
+  }
+  
+  if (fTrackHits) {
+    fTrackHits->First();
+    return (AliHit*) fTrackHits->GetHit();
+  }
+  else {
+    return 0;
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliHit* AliTRD::NextHit2()
+{
+  //
+  // Returns the next hit of the current track
+  //
+
+  if (fTrackHits) {
+    fTrackHits->Next();
+    return (AliHit *) fTrackHits->GetHit();
+  }
+  else {
+    return 0;
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::MakeBranch2(Option_t *option, const char* )
+{
+  //
+  // Create a new branch in the current Root tree.
+  // The branch of fHits is automatically split.
+  //
+
+  if (fHitType < 2) {
+    return;
+  }
+
+  char branchname[10];
+  sprintf(branchname,"%s2",GetName());
+
+  // Get the pointer to the header
+  const char *cH = strstr(option,"H");
+  if (!fTrackHits) {
+    fTrackHits = new AliTRDtrackHits();
+   }
+
+
+  if (fTrackHits && TreeH() && cH) 
+   {
+    TreeH()->Branch(branchname,"AliTRDtrackHits",&fTrackHits,fBufferSize,99);
+    Info("MakeBranch2","Making Branch %s for trackhits",branchname);
+   }
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::SetTreeAddress2()
+{
+  //
+  // Set the branch address for the trackHits tree
+  //
+  if (GetDebug())  Info("SetTreeAddress2","");
+
+  TBranch *branch;
+  char branchname[20];
+  sprintf(branchname,"%s2",GetName());
+  
+  // Branch address for hit tree
+  TTree *treeH = TreeH();
+  if ((treeH) && (fHitType > 0)) {
+    branch = treeH->GetBranch(branchname);
+    if (branch) 
+     {
+       branch->SetAddress(&fTrackHits);
+       if (GetDebug())
+         Info("SetTreeAddress2","Success.");
+     }
+    else
+     {
+       if (GetDebug())
+         Info("SetTreeAddress2","Can NOT get the branch %s",branchname);
+     }
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRD::AddHit2(Int_t track, Int_t det, Float_t *hits, Int_t q
+                   , Bool_t inDrift)
+{
+  //
+  // Add a hit to the list
+  //
+
+  Int_t rtrack;
+
+  if (fIshunt) {
+    Int_t primary = gAlice->GetMCApp()->GetPrimary(track);
+    gAlice->GetMCApp()->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
+    rtrack = primary;
+  } 
+  else {
+    rtrack = track;
+    gAlice->GetMCApp()->FlagTrack(track);
+  }
+
+  if ((fTrackHits) && (fHitType > 0)) {
+    fTrackHits->AddHitTRD(det,rtrack,hits[0],hits[1],hits[2],q,inDrift);
+  }
+
 }
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+