]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRDclusterizer.h
Added protection against wrongly formed cloning list
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDclusterizer.h
index edef8461f8f5a79cb63afd101be1b943329bcffc..c583ea0edd68b1fa0ea09821cdb2a305cc053b74 100644 (file)
 
 #include <TNamed.h>
 
+#include "AliTRDrawStream.h"
+#include "AliTRDgeometry.h"
+
 class TFile;
 class TTree;
-class TObjArray;
+class TClonesArray;
 
 class AliRunLoader;
 class AliRawReader;
 
 class AliTRD;
 class AliTRDcluster;
-class AliTRDdataArrayS;
-class AliTRDdataArrayDigits;
-class AliTRDdataArrayF;
+
+class AliTRDarrayADC;
+class AliTRDarraySignal;
 class AliTRDdigitsManager;
 class AliTRDSignalIndex;
 class AliTRDtransform;
 class AliTRDCalROC;
 class AliTRDReconstructor;
+class AliTRDCalSingleChamberStatus;
+class AliTRDrecoParam;
+class AliTRDCalOnlineGainTableROC;
+
 class AliTRDclusterizer : public TNamed 
 {
-public:
-  AliTRDclusterizer(AliTRDReconstructor *rec = 0x0);
-  AliTRDclusterizer(const Text_t* name, const Text_t* title, AliTRDReconstructor *rec = 0x0);
+
+ public:
+
+  // steering flags
+  // bits from 0-13 are reserved by ROOT (see TObject.h)
+  enum{
+    kTrOwner = BIT(14)  //  toggle online tracklets ownership
+    ,kClOwner= BIT(15)  //  toggle cluster ownership
+    ,kLabels = BIT(16)  //  toggle MC labels for clusters
+    ,kSkipTrafo = BIT(17)  //  skip the coordinate transformation of clusters?
+    ,kLUT    = BIT(18)  //  using look up table for cluster's r-phi position
+    ,kGAUS   = BIT(19)  //  using gauss approx. for cluster's r-phi position
+    ,knewDM  = BIT(20)  //  was the digitsmanger created by raw2clusters?
+    ,kTracksOwner = BIT(21) //  toggle GTU track ownership
+  };
+
+  struct MaxStruct
+  {
+    Int_t       row;           // row of the current cluster candidate
+    Int_t       col;           // col of the current cluster candidate
+    Int_t       time;          // time -"-
+    Short_t     signals[3];    // signals of the maximum pad and it's twon neigbours
+    UChar_t     padStatus;     // padStatus of the current cluster candidate
+    Bool_t      fivePad;       // is this cluster candidate part of a 5 pad cluster (two overlaping clusters)?
+  MaxStruct():row(-1),col(0),time(0),padStatus(0),fivePad(kFALSE)
+      {memset(signals, 0, 3*sizeof(Short_t));}
+    MaxStruct &operator=(const MaxStruct &a)
+    {memcpy(this, &a, sizeof(MaxStruct)); return *this;}
+  };
+  
+  AliTRDclusterizer(const AliTRDReconstructor *const rec = 0x0);
+  AliTRDclusterizer(const Text_t* name, const Text_t* title, const AliTRDReconstructor *const rec = 0x0);
   AliTRDclusterizer(const AliTRDclusterizer &c);
   virtual         ~AliTRDclusterizer();
   AliTRDclusterizer &operator=(const AliTRDclusterizer &c);
 
-  virtual void     Copy(TObject &c) const;
+  void     Copy(TObject &c) const;
 
-  virtual Bool_t   Open(const Char_t *name, Int_t nEvent = 0);
-  virtual Bool_t   OpenInput(Int_t nEvent = 0);
-  virtual Bool_t   OpenOutput();
-  virtual Bool_t   OpenOutput(TTree *clusterTree);
+  Bool_t   Open(const Char_t *name, Int_t nEvent = 0);
+  Bool_t   OpenInput(Int_t nEvent = 0);
+  Bool_t   OpenOutput();
+  Bool_t   OpenOutput(TTree *const clusterTree);
 
-  virtual Bool_t   ReadDigits();
-  virtual Bool_t   ReadDigits(AliRawReader *rawReader);
-  virtual Bool_t   ReadDigits(TTree *digitsTree);
+  Bool_t   ReadDigits();
+  Bool_t   ReadDigits(AliRawReader *rawReader);
+  Bool_t   ReadDigits(TTree *digitsTree);
 
-  virtual Bool_t   WriteClusters(Int_t det);
-          void     ResetRecPoints();
-  TObjArray       *RecPoints();
-          Bool_t   WriteTracklets(Int_t det);
+  Bool_t   ReadTracklets();
+  Bool_t   ReadTracks();
 
-  virtual Bool_t   Raw2Clusters(AliRawReader *rawReader);
-  virtual Bool_t   Raw2ClustersChamber(AliRawReader *rawReader);
+  Bool_t   WriteClusters(Int_t det);
+  void     ResetRecPoints();
+  virtual TClonesArray    *RecPoints();
+  virtual TClonesArray    *TrackletsArray(const TString &trkltype = "");
+  virtual TClonesArray    *TracksArray();
 
-  virtual Bool_t   MakeClusters();
-  virtual Bool_t   MakeClusters(Int_t det);
+  Bool_t   Raw2Clusters(AliRawReader *rawReader);
+  Bool_t   Raw2ClustersChamber(AliRawReader *rawReader);
 
-  virtual Bool_t   AddLabels(Int_t idet, Int_t firstClusterROC, Int_t nClusterROC);
-  virtual Bool_t   SetAddLabels(Bool_t kset) { fAddLabels = kset; 
-            return fAddLabels;  } // should we assign labels to clusters
-  virtual void     SetRawVersion(Int_t iver) { fRawVersion = iver; } // set the expected raw data version
+  Bool_t   MakeClusters();
+  Bool_t   MakeClusters(Int_t det);
+
+  Bool_t   AddLabels();
+  Bool_t   SetUseLabels(const Bool_t kset) { SetBit(kLabels, kset); return TestBit(kLabels);  } // should we assign labels to clusters
+  void     SetRawVersion(const Int_t iver) { fRawVersion = iver; } // set the expected raw data version
   void             SetReconstructor(const AliTRDReconstructor *rec) {fReconstructor = rec;}
-  static UChar_t GetStatus(Short_t &signal);
+  static UChar_t   GetStatus(Short_t &signal);
+  Int_t            GetAddedClusters() const {return fNoOfClusters;}
+  Int_t            GetNTimeBins() const {return fTimeTotal;}
+
+  Bool_t           IsClustersOwner() const {return TestBit(kClOwner);}
+  virtual void     SetClustersOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kClOwner, own); if(!own) {fRecPoints = 0x0; fNoOfClusters=0;} }
+  void             SetTrackletsOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kTrOwner, own); if(!own) {fTracklets = 0x0; } }
+  void             SetTracksOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kTracksOwner, own); if(!own) {fTracks = 0x0; } }
+  void             SetSkipTransform(Bool_t b=kTRUE) {SetBit(kSkipTrafo, b); }
+
+  UInt_t   GetTriggerFlags(const Int_t sector) const { return fTrgFlags[sector]; }
 
 protected:
-  void     DeConvExp(Double_t *source, Double_t *target
-              , Int_t nTimeTotal, Int_t nexp);
-  void     TailCancelation(AliTRDdataArrayDigits *digitsIn
-              , AliTRDdataArrayF *digitsOut 
-              , AliTRDSignalIndex *indexesIn
-              , AliTRDSignalIndex *indexesOut
-              , Int_t nTimeTotal
-              , Float_t ADCthreshold
-              , AliTRDCalROC *calGainFactorROC
-              , Float_t calGainFactorDetValue);
-  virtual Double_t Unfold(Double_t eps, Int_t layer, Double_t *padSignal);
-  Double_t GetCOG(Double_t signal[5]) const; 
-  void     FillLUT();
-  Double_t LUTposition(Int_t ilayer, Double_t ampL, Double_t ampC, Double_t ampR) const;
-  virtual void     ResetHelperIndexes(AliTRDSignalIndex *indexesIn);
+
+  void             ApplyTCTM(Short_t *const arr, const Int_t nTime, const Int_t nexp);
+  void             DeConvExp (Short_t *const arr, const Int_t nTime, const Int_t nexp);
+  void             ConvExp(Short_t *const arr, const Int_t nTime);
+  void             TailCancelation(const AliTRDrecoParam* const recoParam);
+
+  Float_t          Unfold(Double_t eps, Int_t layer, const Double_t *const padSignal) const;
+  
+  void             SetPadStatus(const UChar_t status, UChar_t &encoding) const;
+  UChar_t          GetPadStatus(UChar_t encoding) const;
+  Int_t            GetCorruption(UChar_t encoding) const;
+
+  Bool_t           IsMaximum(const MaxStruct &Max, UChar_t &padStatus, Short_t *const Signals);       //for const correctness reasons not const parameters are given separately
+  Bool_t           FivePadCluster(MaxStruct &ThisMax, MaxStruct &NeighbourMax);
+  void             CreateCluster(const MaxStruct &Max); 
+
+  virtual void     AddClusterToArray(AliTRDcluster* cluster);
+
+private:
+  inline void      CalcAdditionalInfo(const MaxStruct &Max, Short_t *const signals, Int_t &nPadCount);
 
 protected:
-  const AliTRDReconstructor *fReconstructor;       //! reconstructor
+  const AliTRDReconstructor *fReconstructor; //! reconstructor
   AliRunLoader        *fRunLoader;           //! Run Loader
   TTree               *fClusterTree;         //! Tree with the cluster
-  TObjArray           *fRecPoints;           //! Array of clusters
+  TClonesArray        *fRecPoints;           //! Array of clusters
+  TClonesArray        *fTracklets;           //! Array of online tracklets
+  TClonesArray        *fTracks;              //! Array of GTU tracks
 
-  TTree               *fTrackletTree;         //! Tree for tracklets
+  TTree               *fTrackletTree;        //! Tree for tracklets
 
   AliTRDdigitsManager *fDigitsManager;       //! TRD digits manager
 
-  UInt_t              **fTrackletContainer;    //! tracklet container
+  UInt_t              **fTrackletContainer;  //! tracklet container
+                                            // legacy code to avoid breakint AliHLTTRDClusterizer
+                                            // but it's useless
 
-  Bool_t               fAddLabels;           //  Should clusters have MC labels?
   Int_t                fRawVersion;          //  Expected raw version of the data - default is 2
 
-  AliTRDSignalIndex   *fIndexesOut;          //! Helper indexes for clusterization
-  AliTRDSignalIndex   *fIndexesMaxima;       //! Helper indexes for clusterization
-
   AliTRDtransform     *fTransform;           //! Transforms the reconstructed space points
 
-  Int_t                fLUTbin;              //  Number of bins of the LUT
-  Double_t            *fLUT;                 //! The lookup table
-
-  ClassDef(AliTRDclusterizer,6)              //  TRD clusterfinder
+  AliTRDarrayADC      *fDigits;               // Array holding the digits
+  AliTRDSignalIndex   *fIndexes;              // Array holding the indexes to the digits
+  Short_t              fMaxThresh;            // Threshold value for the maximum
+  Short_t              fMaxThreshTest;        // Threshold value for the maximum to test agains
+  Short_t              fSigThresh;            // Threshold value for the digit signal
+  Float_t              fMinMaxCutSigma;       // Threshold value for the maximum (cut noise)
+  Float_t              fMinLeftRightCutSigma; // Threshold value for the sum pad (cut noise)
+  Int_t                fLayer;                // Current layer of the detector
+  Int_t                fDet;                  // Current detecor
+  UShort_t             fVolid;                // Volume ID
+  Int_t                fColMax;               // Number of Colums in one detector
+  Int_t                fTimeTotal;            // Number of time bins
+  AliTRDCalROC        *fCalGainFactorROC;     // Calibration object with pad wise values for the gain factors
+  Float_t              fCalGainFactorDetValue;// Calibration value for chamber wise noise
+  AliTRDCalROC        *fCalNoiseROC;          // Calibration object with pad wise values for the noise
+  Float_t              fCalNoiseDetValue;     // Calibration value for chamber wise noise
+  AliTRDCalSingleChamberStatus *fCalPadStatusROC; // Calibration object with the pad status
+  AliTRDCalOnlineGainTableROC *fCalOnGainROC; // Calibration table of online gain factors
+  Int_t                fClusterROC;           // The index to the first cluster of a given ROC
+  Int_t                firstClusterROC;       // The number of cluster in a given ROC
+  Int_t                fNoOfClusters;         // Number of Clusters already processed and still owned by the clusterizer
+  Int_t                fBaseline;             // Baseline of the ADC values
+  AliTRDrawStream     *fRawStream;            // Raw data streamer
+  UInt_t               fTrgFlags[AliTRDgeometry::kNsector]; // trigger flags
+
+  ClassDef(AliTRDclusterizer,6)               //  TRD clusterfinder
 
 };