]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRDclusterizer.h
Added protection against wrongly formed cloning list
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDclusterizer.h
index f805d3c582cc56d6d986e766a0e62a618c8612cc..c583ea0edd68b1fa0ea09821cdb2a305cc053b74 100644 (file)
@@ -13,6 +13,9 @@
 
 #include <TNamed.h>
 
+#include "AliTRDrawStream.h"
+#include "AliTRDgeometry.h"
+
 class TFile;
 class TTree;
 class TClonesArray;
@@ -31,6 +34,8 @@ class AliTRDtransform;
 class AliTRDCalROC;
 class AliTRDReconstructor;
 class AliTRDCalSingleChamberStatus;
+class AliTRDrecoParam;
+class AliTRDCalOnlineGainTableROC;
 
 class AliTRDclusterizer : public TNamed 
 {
@@ -38,28 +43,30 @@ class AliTRDclusterizer : public TNamed
  public:
 
   // steering flags
+  // bits from 0-13 are reserved by ROOT (see TObject.h)
   enum{
-    kTrOwner= BIT(13)  //  toggle online tracklets ownership
-   ,kClOwner= BIT(14)  //  toggle cluster ownership
-   ,kLabels = BIT(15)  //  toggle MC labels for clusters
-   ,kHLT    = BIT(16)  //  HLT mode
-   ,kLUT    = BIT(17)  //  using look up table for cluster's r-phi position
-   ,kGAUS   = BIT(18)  //  using gauss approx. for cluster's r-phi position
+    kTrOwner = BIT(14)  //  toggle online tracklets ownership
+    ,kClOwner= BIT(15)  //  toggle cluster ownership
+    ,kLabels = BIT(16)  //  toggle MC labels for clusters
+    ,kSkipTrafo = BIT(17)  //  skip the coordinate transformation of clusters?
+    ,kLUT    = BIT(18)  //  using look up table for cluster's r-phi position
+    ,kGAUS   = BIT(19)  //  using gauss approx. for cluster's r-phi position
+    ,knewDM  = BIT(20)  //  was the digitsmanger created by raw2clusters?
+    ,kTracksOwner = BIT(21) //  toggle GTU track ownership
   };
 
   struct MaxStruct
   {
-    Int_t       Row;
-    Int_t       Col;
-    Int_t       Time;
-    UChar_t     padStatus;
-    Short_t     Signals[3];
-    Bool_t      FivePad;
-  MaxStruct():Row(-1),Col(0),Time(0),padStatus(0),FivePad(kFALSE)
-      {memset(Signals, 0, 3*sizeof(Short_t));}
+    Int_t       row;           // row of the current cluster candidate
+    Int_t       col;           // col of the current cluster candidate
+    Int_t       time;          // time -"-
+    Short_t     signals[3];    // signals of the maximum pad and it's twon neigbours
+    UChar_t     padStatus;     // padStatus of the current cluster candidate
+    Bool_t      fivePad;       // is this cluster candidate part of a 5 pad cluster (two overlaping clusters)?
+  MaxStruct():row(-1),col(0),time(0),padStatus(0),fivePad(kFALSE)
+      {memset(signals, 0, 3*sizeof(Short_t));}
     MaxStruct &operator=(const MaxStruct &a)
-    {Row=a.Row; Col=a.Col; Time=a.Time; padStatus=a.padStatus; FivePad=a.FivePad;
-     memcpy(Signals, a.Signals, 3*sizeof(Short_t)); return *this;}
+    {memcpy(this, &a, sizeof(MaxStruct)); return *this;}
   };
   
   AliTRDclusterizer(const AliTRDReconstructor *const rec = 0x0);
@@ -73,18 +80,20 @@ class AliTRDclusterizer : public TNamed
   Bool_t   Open(const Char_t *name, Int_t nEvent = 0);
   Bool_t   OpenInput(Int_t nEvent = 0);
   Bool_t   OpenOutput();
-  Bool_t   OpenOutput(TTree *clusterTree);
-  Bool_t   OpenTrackletOutput();
+  Bool_t   OpenOutput(TTree *const clusterTree);
 
   Bool_t   ReadDigits();
   Bool_t   ReadDigits(AliRawReader *rawReader);
   Bool_t   ReadDigits(TTree *digitsTree);
 
+  Bool_t   ReadTracklets();
+  Bool_t   ReadTracks();
+
   Bool_t   WriteClusters(Int_t det);
   void     ResetRecPoints();
   virtual TClonesArray    *RecPoints();
-  virtual TClonesArray    *TrackletsArray();
-  Bool_t   WriteTracklets(Int_t det);
+  virtual TClonesArray    *TrackletsArray(const TString &trkltype = "");
+  virtual TClonesArray    *TracksArray();
 
   Bool_t   Raw2Clusters(AliRawReader *rawReader);
   Bool_t   Raw2ClustersChamber(AliRawReader *rawReader);
@@ -97,42 +106,54 @@ class AliTRDclusterizer : public TNamed
   void     SetRawVersion(const Int_t iver) { fRawVersion = iver; } // set the expected raw data version
   void             SetReconstructor(const AliTRDReconstructor *rec) {fReconstructor = rec;}
   static UChar_t   GetStatus(Short_t &signal);
-  Int_t            GetAddedClusters() {return fNoOfClusters;}
+  Int_t            GetAddedClusters() const {return fNoOfClusters;}
+  Int_t            GetNTimeBins() const {return fTimeTotal;}
+
+  Bool_t           IsClustersOwner() const {return TestBit(kClOwner);}
+  virtual void     SetClustersOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kClOwner, own); if(!own) {fRecPoints = 0x0; fNoOfClusters=0;} }
+  void             SetTrackletsOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kTrOwner, own); if(!own) {fTracklets = 0x0; } }
+  void             SetTracksOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kTracksOwner, own); if(!own) {fTracks = 0x0; } }
+  void             SetSkipTransform(Bool_t b=kTRUE) {SetBit(kSkipTrafo, b); }
 
-  Bool_t   IsClustersOwner() const {return TestBit(kClOwner);}
-  virtual void     SetClustersOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kTrOwner, own); if(!own) {fRecPoints = 0x0; fNoOfClusters=0;} }
-  void     SetTrackletsOwner(Bool_t own=kTRUE) {SetBit(kTrOwner, own); if(!own) {fTracklets = 0x0; } }
+  UInt_t   GetTriggerFlags(const Int_t sector) const { return fTrgFlags[sector]; }
 
 protected:
 
-  void             DeConvExp (const Double_t *const source, Double_t *const target
-                            ,const Int_t nTimeTotal, const Int_t nexp);
-  void             TailCancelation();
+  void             ApplyTCTM(Short_t *const arr, const Int_t nTime, const Int_t nexp);
+  void             DeConvExp (Short_t *const arr, const Int_t nTime, const Int_t nexp);
+  void             ConvExp(Short_t *const arr, const Int_t nTime);
+  void             TailCancelation(const AliTRDrecoParam* const recoParam);
 
-  Float_t  Unfold(Double_t eps, Int_t layer, Double_t *padSignal) const;
+  Float_t          Unfold(Double_t eps, Int_t layer, const Double_t *const padSignal) const;
   
-  void             SetPadStatus(const UChar_t status, UChar_t &encoding);
+  void             SetPadStatus(const UChar_t status, UChar_t &encoding) const;
   UChar_t          GetPadStatus(UChar_t encoding) const;
   Int_t            GetCorruption(UChar_t encoding) const;
 
   Bool_t           IsMaximum(const MaxStruct &Max, UChar_t &padStatus, Short_t *const Signals);       //for const correctness reasons not const parameters are given separately
   Bool_t           FivePadCluster(MaxStruct &ThisMax, MaxStruct &NeighbourMax);
   void             CreateCluster(const MaxStruct &Max); 
+
+  virtual void     AddClusterToArray(AliTRDcluster* cluster);
+
+private:
   inline void      CalcAdditionalInfo(const MaxStruct &Max, Short_t *const signals, Int_t &nPadCount);
-  virtual void     AddClusterToArray(AliTRDcluster *cluster);
-  virtual void     AddTrackletsToArray();
 
+protected:
   const AliTRDReconstructor *fReconstructor; //! reconstructor
   AliRunLoader        *fRunLoader;           //! Run Loader
   TTree               *fClusterTree;         //! Tree with the cluster
   TClonesArray        *fRecPoints;           //! Array of clusters
   TClonesArray        *fTracklets;           //! Array of online tracklets
+  TClonesArray        *fTracks;              //! Array of GTU tracks
 
   TTree               *fTrackletTree;        //! Tree for tracklets
 
   AliTRDdigitsManager *fDigitsManager;       //! TRD digits manager
 
   UInt_t              **fTrackletContainer;  //! tracklet container
+                                            // legacy code to avoid breakint AliHLTTRDClusterizer
+                                            // but it's useless
 
   Int_t                fRawVersion;          //  Expected raw version of the data - default is 2
 
@@ -140,9 +161,9 @@ protected:
 
   AliTRDarrayADC      *fDigits;               // Array holding the digits
   AliTRDSignalIndex   *fIndexes;              // Array holding the indexes to the digits
-  Float_t              fADCthresh;            // ADC thresholds: There is no ADC threshold anymore, and simParam should not be used in clusterizer. KO
-  Float_t              fMaxThresh;            // Threshold value for the maximum
-  Float_t              fSigThresh;            // Threshold value for the digit signal
+  Short_t              fMaxThresh;            // Threshold value for the maximum
+  Short_t              fMaxThreshTest;        // Threshold value for the maximum to test agains
+  Short_t              fSigThresh;            // Threshold value for the digit signal
   Float_t              fMinMaxCutSigma;       // Threshold value for the maximum (cut noise)
   Float_t              fMinLeftRightCutSigma; // Threshold value for the sum pad (cut noise)
   Int_t                fLayer;                // Current layer of the detector
@@ -155,9 +176,13 @@ protected:
   AliTRDCalROC        *fCalNoiseROC;          // Calibration object with pad wise values for the noise
   Float_t              fCalNoiseDetValue;     // Calibration value for chamber wise noise
   AliTRDCalSingleChamberStatus *fCalPadStatusROC; // Calibration object with the pad status
+  AliTRDCalOnlineGainTableROC *fCalOnGainROC; // Calibration table of online gain factors
   Int_t                fClusterROC;           // The index to the first cluster of a given ROC
   Int_t                firstClusterROC;       // The number of cluster in a given ROC
   Int_t                fNoOfClusters;         // Number of Clusters already processed and still owned by the clusterizer
+  Int_t                fBaseline;             // Baseline of the ADC values
+  AliTRDrawStream     *fRawStream;            // Raw data streamer
+  UInt_t               fTrgFlags[AliTRDgeometry::kNsector]; // trigger flags
 
   ClassDef(AliTRDclusterizer,6)               //  TRD clusterfinder