]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRDdEdxReconUtils.cxx
TRD module
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDdEdxReconUtils.cxx
diff --git a/TRD/AliTRDdEdxReconUtils.cxx b/TRD/AliTRDdEdxReconUtils.cxx
deleted file mode 100644 (file)
index 075fa03..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,334 +0,0 @@
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-
-//
-// TRD dEdx recon utils
-// xx
-// xx
-// xx
-// xx
-//
-//  Xianguo Lu 
-//  lu@physi.uni-heidelberg.de
-//  Xianguo.Lu@cern.ch
-//  
-//
-
-#include "TF1.h"
-#include "TFile.h"
-#include "TH1D.h"
-#include "TH2D.h"
-#include "THnSparse.h"
-#include "TMath.h"
-#include "TMatrixD.h"
-#include "TMinuit.h"
-#include "TObjArray.h"
-#include "TRandom3.h"
-#include "TStopwatch.h"
-#include "TVectorD.h"
-
-#include "TTreeStream.h"
-
-#include "AliCDBId.h"
-#include "AliCDBMetaData.h"
-#include "AliCDBStorage.h"
-#include "AliESDEvent.h"
-#include "AliESDfriendTrack.h"
-#include "AliESDtrack.h"
-#include "AliTRDcalibDB.h"
-#include "AliTRDCalROC.h"
-#include "AliTRDtrackV1.h"
-
-#include "AliTRDdEdxBaseUtils.h"
-#include "AliTRDdEdxReconUtils.h"
-
-#define EPSILON 1e-8
-
-Int_t AliTRDdEdxReconUtils::ApplyCalib(const Int_t nc0, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const TObjArray *cobj)
-{
-  //
-  //apply calibration on arrayQ
-  //
-  if(!cobj){ printf("AliTRDdEdxReconUtils::ApplyCalib error gain array null!!\n"); exit(1);}
-
-  TVectorD tmpq(arrayQ->GetNrows());
-  TVectorD tmpx(arrayX->GetNrows());
-  Int_t ncls = 0;
-
-  const TVectorD * gain = (TVectorD*) cobj->At(0); 
-  for(Int_t ii=0; ii<nc0; ii++){
-    const Double_t dq = (*arrayQ)[ii];
-    const Int_t xx = (Int_t)(*arrayX)[ii];
-    const Double_t gg = (*gain)[xx];
-
-    if(gg<EPSILON){
-      continue;
-    }
-
-    tmpq[ncls] = dq*gg;
-    tmpx[ncls] = xx;
-    ncls++;
-  }
-
-  (*arrayQ)=tmpq;
-  (*arrayX)=tmpx;
-
-  return ncls;
-}
-
-Double_t AliTRDdEdxReconUtils::ToyCook(const Bool_t kinvq, Int_t &ncluster, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const TObjArray *cobj)
-{
-  //
-  //template for cookdedx
-  //
-  if(cobj){
-    if(arrayQ && arrayX){
-      ncluster = ApplyCalib(ncluster, arrayQ, arrayX, cobj);
-    }
-    else{
-      printf("AliTRDdEdxReconUtils::ToyCook arrayQ arrayX null, applycalib can not be applied!\n"); exit(1);
-    }
-  }
-
-  Double_t lowFrac =-999, highFrac = -999;
-  if(kinvq){
-    lowFrac = AliTRDdEdxBaseUtils::Q1Frac(); highFrac = 0.99;
-  }
-  else{
-    lowFrac = 0.01; highFrac = AliTRDdEdxBaseUtils::Q0Frac();
-  }
-
-  Double_t meanQ = AliTRDdEdxBaseUtils::TruncatedMean(ncluster, arrayQ->GetMatrixArray(), lowFrac, highFrac);
-  if(kinvq){
-    if(meanQ>EPSILON){
-      meanQ = 1/meanQ;
-    }
-  }
-
-  return meanQ;
-}
-
-Double_t AliTRDdEdxReconUtils::CombineddEdx(const Bool_t kinvq, Int_t &concls, TVectorD *coarrayQ, TVectorD *coarrayX, const Int_t tpcncls, const TVectorD *tpcarrayQ, const TVectorD *tpcarrayX, const Int_t trdncls, const TVectorD *trdarrayQ, const TVectorD *trdarrayX)
-{
-  //
-  //combine tpc and trd dedx
-  //
-
-  for(Int_t iq=0; iq<tpcncls; iq++){
-    (*coarrayQ)[iq]=(*tpcarrayQ)[iq];
-    if(tpcarrayX && trdarrayX && coarrayX){
-      (*coarrayX)[iq]=(*tpcarrayX)[iq];
-    }
-  }
-  for(Int_t iq=0; iq<trdncls; iq++){
-    (*coarrayQ)[tpcncls+iq]=(*trdarrayQ)[iq];
-    if(tpcarrayX && trdarrayX && coarrayX){
-      (*coarrayX)[tpcncls+iq]=159+(*trdarrayX)[iq];
-    }
-  }
-
-  concls=trdncls+tpcncls;
-
-  const Double_t coQ = ToyCook(kinvq, concls, coarrayQ, coarrayX);
-
-  return coQ;
-}
-
-Double_t AliTRDdEdxReconUtils::GetPadGain(const Int_t det, const Int_t icol, const Int_t irow)
-{
-  //
-  //get pad calibration
-  //
-  AliTRDcalibDB* calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
-  if (!calibration) {
-    printf("AliTRDdEdxReconUtils::GetPadCalib No AliTRDcalibDB instance available\n"); exit(1);
-  }
-  AliTRDCalROC * calGainFactorROC = calibration->GetGainFactorROC(det);
-  if(!calGainFactorROC){
-    printf("AliTRDdEdxReconUtils::GetPadCalib no calGainFactorROC!\n"); exit(1);
-  }
-
-  Double_t padgain = -999;
-  if( icol >= 0 && 
-      icol < calGainFactorROC->GetNcols() && 
-      irow >=0 && 
-      irow < calGainFactorROC->GetNrows()){
-    padgain = calGainFactorROC->GetValue(icol, irow);
-    if(padgain<EPSILON){
-      printf("AliTRDdEdxReconUtils::GetPadGain padgain 0! %f %f -- %d %d %d -- %d %d\n", padgain, EPSILON, det, icol, irow, calGainFactorROC->GetNcols(), calGainFactorROC->GetNrows()); exit(1);
-    }
-  }
-  else{
-    //printf("\nAliTRDdEdxReconUtils::GetPadGain warning!! indices out of range %d %d %d -- %d %d\n\n", det, icol, irow, calGainFactorROC->GetNcols(), calGainFactorROC->GetNrows() );  
-  }
-
-  return padgain;
-}
-
-Double_t AliTRDdEdxReconUtils::GetRNDClusterQ(AliTRDcluster *cl, const Double_t baseline)
-{
-  //
-  //get cluter q from GetRawQ, apply baseline and Kr pad-calibration
-  //
-
-  const Int_t det     = cl->GetDetector();
-  const Int_t pad3col = cl->GetPadCol();
-  const Int_t padrow  = cl->GetPadRow();
-
-  Double_t rndqsum = 0;
-  for(Int_t ii=0; ii<7; ii++){
-    if(cl->GetSignals()[ii] < EPSILON){//bad pad marked by electronics
-      continue;
-    }
-
-    const Int_t icol = pad3col+(ii-3);
-    const Double_t padgain = GetPadGain(det, icol, padrow);
-    if(padgain<0){//indices out of range, pad3col near boundary case
-      continue;
-    }
-
-    const Double_t rndsignal = (cl->GetSignals()[ii] - baseline )/(AliTRDdEdxBaseUtils::IsPadGainOn()? padgain : 1);
-
-    //sum it anyway even if signal below baseline, as long as the total is positive
-    rndqsum += rndsignal;
-  }
-
-  return rndqsum;
-}
-
-Double_t AliTRDdEdxReconUtils::GetClusterQ(const Bool_t kinvq, const AliTRDseedV1 * seed, const Int_t itb)
-{
-  //
-  //get cluster charge
-  //
-  Double_t dq = 0;
-  AliTRDcluster *cl = 0x0;
-      
-  const Double_t baseline = 10;
-
-  //GetRNDClusterQ(cl)>0 ensures that the total sum of q is above baseline*NsignalPhysical. 
-  cl = seed->GetClusters(itb);                    if(cl && GetRNDClusterQ(cl, baseline)>0 ) dq+= GetRNDClusterQ(cl, baseline);
-  cl = seed->GetClusters(itb+AliTRDseedV1::kNtb); if(cl && GetRNDClusterQ(cl, baseline)>0 ) dq+= GetRNDClusterQ(cl, baseline);
-
-  dq /= AliTRDdEdxBaseUtils::Getdldx(seed);
-  
-  dq /= AliTRDdEdxBaseUtils::QScale();
-      
-  if(kinvq){
-    if(dq>EPSILON){
-      dq = 1/dq;
-    }
-  }
-
-  return dq;
-}
-
-Int_t AliTRDdEdxReconUtils::GetArrayClusterQ(const Bool_t kinvq, TVectorD *arrayQ, TVectorD *arrayX, const AliTRDtrackV1 *trdtrack, Int_t timeBin0, Int_t timeBin1, Int_t tstep)
-{
-  //
-  //return nclustter
-  //(if kinvq, return 1/q array), size of array must be larger than 31*6
-  //
-  if(!arrayQ || arrayQ->GetNrows()< (AliTRDseedV1::kNtb*AliTRDtrackV1::kNplane)){
-    printf("AliTRDdEdxReconUtils::GetArrayClusterQ error arrayQ null or size too small! %d\n", arrayQ? arrayQ->GetNrows() : -999); exit(1);
-  }
-  if(!arrayX || arrayX->GetNrows()< (AliTRDseedV1::kNtb*AliTRDtrackV1::kNplane)){
-    printf("AliTRDdEdxReconUtils::GetArrayClusterQ error arrayX null or size too small! %d\n", arrayX? arrayX->GetNrows() : -999); exit(1);
-  }
-
-  const Int_t mintb = 0;
-  const Int_t maxtb = AliTRDseedV1::kNtb-1;
-  if(timeBin0<mintb) timeBin0=mintb;
-  if(timeBin1>maxtb) timeBin1=maxtb;
-  if(tstep<=0) tstep=1;
-
-  //============
-  Int_t tbN=0;
-  Double_t tbQ[200];
-  Int_t tbBin[200];
-    
-  for(Int_t ichamber=0; ichamber < AliTRDtrackV1::kNplane; ichamber++){
-    const AliTRDseedV1 * seed = trdtrack->GetTracklet(ichamber);
-    if(!seed)
-      continue;
-    
-    const Int_t det = seed->GetDetector();
-
-    for(Int_t itb=timeBin0; itb<=timeBin1; itb+=tstep){
-      const Double_t dq = GetClusterQ(kinvq, seed, itb);
-      if(dq<EPSILON)
-        continue;
-
-      const Int_t gtb = det * AliTRDseedV1::kNtb + itb;
-
-      tbQ[tbN]=dq;
-      tbBin[tbN]=gtb;
-      tbN++;
-    }
-  }
-
-  Int_t ncls = 0;
-  for(Int_t iq=0; iq<tbN; iq++){
-    if(tbQ[iq]<EPSILON)
-      continue;
-
-    (*arrayQ)[ncls] = tbQ[iq];
-    (*arrayX)[ncls] = tbBin[iq];
-
-    ncls++;
-  }
-
-  static Int_t kprint = 100;
-  if(kprint<0){
-    printf("\nAliTRDdEdxReconUtils::GetArrayClusterQ raw cluster-Q\n");
-    for(Int_t iq=0; iq<ncls; iq++){
-      const Int_t ichamber =  AliTRDdEdxBaseUtils::ToLayer((*arrayX)[iq]);
-      const AliTRDseedV1 * seed = trdtrack->GetTracklet(ichamber);
-      if(!seed){
-        printf("error seed null!!\n"); exit(1);
-      }
-      const Double_t rawq =  (*arrayQ)[iq] * 45. * AliTRDdEdxBaseUtils::Getdldx(seed);
-      printf("esdid=%d; chamber=%d; timebin=%d; rawq= %.3f; myq[%d]= %e;\n", trdtrack->GetESDid(), ichamber, AliTRDdEdxBaseUtils::ToTimeBin((*arrayX)[iq]), rawq, iq, (*arrayQ)[iq]);
-    }
-    printf("\n");
-  }
-  kprint++;
-
-  return ncls;
-}
-
-Int_t AliTRDdEdxReconUtils::UpdateArrayX(const Int_t ncls, TVectorD* arrayX)
-{
-  //
-  //arrayX det*Ntb+itb -> itb
-  //
-
-  TVectorD countChamber(6);
-  for(Int_t ii = 0; ii<ncls; ii++){
-    const Int_t xx = (Int_t)(*arrayX)[ii];
-    const Int_t idet = AliTRDdEdxBaseUtils::ToDetector(xx);
-    
-    const Double_t ich = AliTRDgeometry::GetLayer(idet);
-    const Double_t itb = AliTRDdEdxBaseUtils::ToTimeBin(xx);
-    (*arrayX)[ii] = ich*AliTRDseedV1::kNtb+itb;
-
-    countChamber[ich] = 1;
-  }
-
-  const Double_t nch = countChamber.Sum();
-  return (Int_t) nch;
-}
-
-