]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRDtracker.cxx
New version of TOF tracker which uses TOF clusters as an input (A. De Caro)
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDtracker.cxx
index c423db0ce85944cc3992e13af3937685b158724a..6e82a97621e1b0ba3c200ff9307582539112cb0d 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
                                                       
-/*
-$Log$
-Revision 1.8  2000/12/20 13:00:44  cblume
-Modifications for the HP-compiler
+/* $Id$ */
 
-Revision 1.7  2000/12/08 16:07:02  cblume
-Update of the tracking by Sergei
-
-Revision 1.6  2000/11/30 17:38:08  cblume
-Changes to get in line with new STEER and EVGEN
-
-Revision 1.5  2000/11/14 14:40:27  cblume
-Correction for the Sun compiler (kTRUE and kFALSE)
-
-Revision 1.4  2000/11/10 14:57:52  cblume
-Changes in the geometry constants for the DEC compiler
-
-Revision 1.3  2000/10/15 23:40:01  cblume
-Remove AliTRDconst
-
-Revision 1.2  2000/10/06 16:49:46  cblume
-Made Getters const
-
-Revision 1.1.2.2  2000/10/04 16:34:58  cblume
-Replace include files by forward declarations
-
-Revision 1.1.2.1  2000/09/22 14:47:52  cblume
-Add the tracking code
-
-*/   
-
-#include <iostream.h>
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+//                                                                           //
+//  The standard TRD tracker                                                 //
+//                                                                           //
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
+#include <Riostream.h>
 #include <TFile.h>
-#include <TROOT.h>
 #include <TBranch.h>
-#include <TTree.h>
+#include <TTree.h>  
+#include <TObjArray.h> 
 
-#include "AliRun.h"
-#include "AliTRD.h"
 #include "AliTRDgeometry.h"
-#include "AliTRDrecPoint.h" 
+#include "AliTRDparameter.h"
+#include "AliTRDpadPlane.h"
+#include "AliTRDgeometryDetail.h"
 #include "AliTRDcluster.h" 
 #include "AliTRDtrack.h"
-#include "AliTRDtrackingSector.h"
-#include "AliTRDtimeBin.h"
+#include "AliESD.h"
 
+#include "TTreeStream.h"
+#include "TGraph.h"
 #include "AliTRDtracker.h"
+//
 
 ClassImp(AliTRDtracker) 
 
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fSeedDepth          = 0.5; 
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fSeedStep           = 0.05;   
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fSeedGap            = 0.25;  
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSeedDepth          = 0.5; 
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSeedStep           = 0.10;   
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSeedGap            = 0.25;  
+
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedDeltaZ12    = 40.;  
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedDeltaZ      = 25.;  
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedC           = 0.0052; 
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedTan         = 1.2;  
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMaxSeedVertexZ     = 150.; 
+
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkSeedErrorSY        = 0.2;
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkSeedErrorSY3       = 2.5;
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkSeedErrorSZ        = 0.1;
+
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMinClustersInSeed  = 0.7;  
 
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedDeltaZ12    = 40.;  
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedDeltaZ      = 25.;  
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedC           = 0.0052; 
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedTan         = 1.2;  
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedVertexZ     = 150.; 
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMinClustersInTrack = 0.5;  
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkMinFractionOfFoundClusters = 0.8;  
 
-  const  Double_t    AliTRDtracker::fSeedErrorSY        = 0.2;
-  const  Double_t    AliTRDtracker::fSeedErrorSY3       = 2.5;
-  const  Double_t    AliTRDtracker::fSeedErrorSZ        = 0.1;
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkSkipDepth          = 0.3;
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkLabelFraction      = 0.8;  
+  const  Float_t     AliTRDtracker::fgkWideRoad           = 20.;
 
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMinClustersInSeed  = 0.7;  
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkMaxChi2            = 12.; 
 
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fMinClustersInTrack = 0.5;  
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fSkipDepth          = 0.05;
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fLabelFraction      = 0.5;  
-  const  Float_t     AliTRDtracker::fWideRoad           = 20.;
+//   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkOffset             = -0.012;
+//   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkOffsetX            = 0.35;
+//   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkCoef               = 0.00;
+//   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkMean               = 8.;
+//   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkDriftCorrection    = 1.07;
+//   const  Double_t    AliTRDtracker::fgkExB                = 0.072;
 
-  const  Double_t    AliTRDtracker::fMaxChi2            = 24.; 
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkOffset             = -0.015;
+const  Double_t    AliTRDtracker::fgkOffsetX            = 0.26;       // "time offset"  
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkCoef               = 0.0096;   // angular shift 
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkMean               = 0.;
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkDriftCorrection    = 1.04;   // drift coefficient correction
+  const  Double_t    AliTRDtracker::fgkExB                = 0.072;  // ExB angle - for error parameterization
+
+
+//     poscorrection =  fgkCoef*(GetLocalTimeBin() - fgkMean)+fgkOffset; 
+
+const Int_t AliTRDtracker::fgkFirstPlane = 5;
+const Int_t AliTRDtracker::fgkLastPlane = 17;
 
 //____________________________________________________________________
-AliTRDtracker::AliTRDtracker()
+AliTRDtracker::AliTRDtracker():AliTracker(),
+                              fGeom(0),
+                              fPar(0),
+                              fNclusters(0),
+                              fClusters(0),
+                              fNseeds(0),
+                              fSeeds(0),
+                              fNtracks(0),
+                              fTracks(0),
+                              fSY2corr(0),
+                              fSZ2corr(0),
+                              fTimeBinsPerPlane(0),
+                              fMaxGap(0),
+                              fVocal(kFALSE),
+                              fAddTRDseeds(kFALSE),
+                              fNoTilt(kFALSE)
 {
-  //
   // Default constructor
-  //   
 
-  fEvent     = 0;
-  fGeom      = NULL;
+  for(Int_t i=0;i<kTrackingSectors;i++) fTrSec[i]=0;
+  for(Int_t j=0;j<5;j++)
+    for(Int_t k=0;k<18;k++) fHoles[j][k]=kFALSE;
+  fDebugStreamer = 0;
+} 
+//____________________________________________________________________
+AliTRDtracker::AliTRDtracker(const TFile *geomfile):AliTracker()
+{
+  // 
+  //  Main constructor
+  //  
+
+  //Float_t fTzero = 0;
+   
+  fAddTRDseeds = kFALSE;
+  fGeom = NULL;
+  fNoTilt = kFALSE;
+  
+  TDirectory *savedir=gDirectory; 
+  TFile *in=(TFile*)geomfile;  
+  if (!in->IsOpen()) {
+    printf("AliTRDtracker::AliTRDtracker(): geometry file is not open!\n");
+    printf("    DETAIL TRD geometry and DEFAULT TRD parameter will be used\n");
+  }
+  else {
+    in->cd();  
+//    in->ls();
+    fGeom = (AliTRDgeometry*) in->Get("TRDgeometry");
+    fPar  = (AliTRDparameter*) in->Get("TRDparameter");
+//    fGeom->Dump();
+  }
 
-  fNclusters = 0;
-  fClusters  = NULL; 
-  fNseeds    = 0;
-  fSeeds     = NULL;
-  fNtracks   = 0;
-  fTracks    = NULL;
+  if(fGeom) {
+    //    fTzero = geo->GetT0();
+    //    printf("Found geometry version %d on file \n", fGeom->IsVersion());
+  }
+  else { 
+    printf("AliTRDtracker::AliTRDtracker(): can't find TRD geometry!\n");
+    //printf("The DETAIL TRD geometry will be used\n");
+    //fGeom = new AliTRDgeometryDetail();
+    fGeom = new AliTRDgeometryDetail();
+    fGeom->SetPHOShole();
+    fGeom->SetRICHhole();    
+  } 
 
-  fSY2corr = 0.025;
-}   
+  if (!fPar) {  
+    printf("AliTRDtracker::AliTRDtracker(): can't find TRD parameter!\n");
+    printf("The DEFAULT TRD parameter will be used\n");
+    fPar = new AliTRDparameter("Pica","Vyjebana");
+  }
+  fPar = new AliTRDparameter("Pica","Vyjebana");
+  fPar->Init();
+
+  savedir->cd();  
 
-//____________________________________________________________________
-AliTRDtracker::AliTRDtracker(const Text_t* name, const Text_t* title)
-                  :TNamed(name, title)
-{
-  fEvent     = 0;
-  fGeom      = NULL;
+
+  //  fGeom->SetT0(fTzero);
 
   fNclusters = 0;
   fClusters  = new TObjArray(2000); 
   fNseeds    = 0;
-  fSeeds     = new TObjArray(20000);
+  fSeeds     = new TObjArray(2000);
   fNtracks   = 0;
-  fTracks    = new TObjArray(10000);
+  fTracks    = new TObjArray(1000);
 
-  fSY2corr = 0.025;
-}   
+  for(Int_t geomS = 0; geomS < kTrackingSectors; geomS++) {
+    Int_t trS = CookSectorIndex(geomS);
+    fTrSec[trS] = new AliTRDtrackingSector(fGeom, geomS, fPar);
+    for (Int_t icham=0;icham<AliTRDgeometry::kNcham; icham++){
+      fHoles[icham][trS]=fGeom->IsHole(0,icham,geomS);
+    }
+  }
+  AliTRDpadPlane *padPlane = fPar->GetPadPlane(0,0);
+  Float_t tiltAngle = TMath::Abs(padPlane->GetTiltingAngle());
+  //  Float_t tiltAngle = TMath::Abs(fPar->GetTiltingAngle()); 
+  if(tiltAngle < 0.1) {
+    fNoTilt = kTRUE;
+  }
 
-//___________________________________________________________________
-AliTRDtracker::~AliTRDtracker()
-{
-  delete fClusters;
-  delete fTracks;
-  delete fSeeds;
-  delete fGeom;
-}   
+  fSY2corr = 0.2;
+  fSZ2corr = 120.;      
 
-//___________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::Clusters2Tracks(TH1F *hs, TH1F *hd)
-{
-  Int_t inner, outer;
-  Int_t fTotalNofTimeBins = fGeom->GetTimeMax() * AliTRDgeometry::Nplan();
-  Int_t nSteps = (Int_t) (fSeedDepth / fSeedStep);
-  Int_t gap = (Int_t) (fTotalNofTimeBins * fSeedGap);
-  Int_t step = (Int_t) (fTotalNofTimeBins * fSeedStep);
+  if(fNoTilt && (tiltAngle > 0.1)) fSY2corr = fSY2corr + tiltAngle * 0.05; 
 
 
-  //  nSteps = 1;
+  // calculate max gap on track
 
-  if (!fClusters) return; 
+  Double_t dxAmp = (Double_t) fGeom->CamHght();   // Amplification region
+  Double_t dxDrift = (Double_t) fGeom->CdrHght(); // Drift region
 
-  AliTRDtrackingSector fTrSec[AliTRDgeometry::kNsect];
-  SetUpSectors(fTrSec);
+  Double_t dx = fgkDriftCorrection*(Double_t) fPar->GetDriftVelocity()
+                         / fPar->GetSamplingFrequency();
 
-  // make a first turn looking for seed ends in the same (n,n) 
-  // and in the adjacent sectors (n,n+1)
+  Int_t tbAmp = fPar->GetTimeBefore();
+  Int_t maxAmp = (Int_t) ((dxAmp+0.000001)/dx);
+  if(kTRUE) maxAmp = 0;  // intentional until we change the parameter class 
+  Int_t tbDrift = fPar->GetTimeMax();
+  Int_t maxDrift = (Int_t) ((dxDrift+0.000001)/dx);
 
-  for(Int_t i=0; i<nSteps; i++) {
-    printf("step %d out of %d \n", i+1, nSteps);
-    outer=fTotalNofTimeBins-1-i*step; inner=outer-gap;
-    MakeSeeds(inner,outer, fTrSec, 1, hs, hd);
-    FindTracks(fTrSec, hs, hd);
-  } 
+  tbDrift = TMath::Min(tbDrift,maxDrift);
+  tbAmp = TMath::Min(tbAmp,maxAmp);
 
-  // make a second turn looking for seed ends in next-to-adjacent 
-  // sectors (n,n+2)
+  fTimeBinsPerPlane = tbAmp + tbDrift;
+  fMaxGap = (Int_t) (fTimeBinsPerPlane * fGeom->Nplan() * fgkSkipDepth);
 
-  for(Int_t i=0; i<nSteps; i++) {
-    printf("step %d out of %d \n", i+1, nSteps);
-    outer=fTotalNofTimeBins-1-i*step; inner=outer-gap;
-    MakeSeeds(inner, outer, fTrSec, 2, hs, hd);
-    FindTracks(fTrSec,hs,hd);
-  } 
+  fVocal = kFALSE;
+  
+  fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TRDdebug.root");
 
-}          
+  savedir->cd();
+}   
 
-//_____________________________________________________________________
-Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaY2(Double_t r, Double_t tgl, Double_t pt)
+//___________________________________________________________________
+AliTRDtracker::~AliTRDtracker()
 {
-  // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Y 
+  //
+  // Destructor of AliTRDtracker 
+  //
 
-  Double_t s = 0.08 * 0.08;    
-  return s;
-}
+  if (fClusters) {
+    fClusters->Delete();
+    delete fClusters;
+  }
+  if (fTracks) {
+    fTracks->Delete();
+    delete fTracks;
+  }
+  if (fSeeds) {
+    fSeeds->Delete();
+    delete fSeeds;
+  }
+  delete fGeom;  
+  delete fPar;  
+
+  for(Int_t geomS = 0; geomS < kTrackingSectors; geomS++) {
+    delete fTrSec[geomS];
+  }
+  if (fDebugStreamer) {    
+    //fDebugStreamer->Close();
+    delete fDebugStreamer;
+  }
+}   
 
 //_____________________________________________________________________
-Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaZ2(Double_t r, Double_t tgl)
-{
-  // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Z 
 
-  Double_t s = 6 * 6 /12.;  
-  return s;
-}                  
+Bool_t AliTRDtracker::AdjustSector(AliTRDtrack *track) {
+  //
+  // Rotates the track when necessary
+  //
+
+  Double_t alpha = AliTRDgeometry::GetAlpha(); 
+  Double_t y = track->GetY();
+  Double_t ymax = track->GetX()*TMath::Tan(0.5*alpha);
+
+  //Int_t ns = AliTRDgeometry::kNsect;
+  //Int_t s=Int_t(track->GetAlpha()/alpha)%ns; 
+
+  if (y > ymax) {
+    //s = (s+1) % ns;
+    if (!track->Rotate(alpha)) return kFALSE;
+  } else if (y <-ymax) {
+    //s = (s-1+ns) % ns;                           
+    if (!track->Rotate(-alpha)) return kFALSE;   
+  } 
+
+  return kTRUE;
+}
 
 //_____________________________________________________________________
-Double_t f1trd(Double_t x1,Double_t y1,
-              Double_t x2,Double_t y2,
-              Double_t x3,Double_t y3)
+inline Double_t f1trd(Double_t x1,Double_t y1,
+                      Double_t x2,Double_t y2,
+                      Double_t x3,Double_t y3)
 {
+  //
   // Initial approximation of the track curvature
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
-
+  //
   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
@@ -210,12 +295,14 @@ Double_t f1trd(Double_t x1,Double_t y1,
 }          
 
 //_____________________________________________________________________
-Double_t f2trd(Double_t x1,Double_t y1,
-              Double_t x2,Double_t y2,
-              Double_t x3,Double_t y3)
+inline Double_t f2trd(Double_t x1,Double_t y1,
+                      Double_t x2,Double_t y2,
+                      Double_t x3,Double_t y3)
 {
-  // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
+  //
+  // Initial approximation of the track curvature times X coordinate
+  // of the center of curvature
+  //
 
   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
@@ -229,660 +316,2846 @@ Double_t f2trd(Double_t x1,Double_t y1,
 }          
 
 //_____________________________________________________________________
-Double_t f3trd(Double_t x1,Double_t y1,
-              Double_t x2,Double_t y2,
-              Double_t z1,Double_t z2)
+inline Double_t f3trd(Double_t x1,Double_t y1,
+                      Double_t x2,Double_t y2,
+                      Double_t z1,Double_t z2)
 {
+  //
   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
-  // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
+  //
 
   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
 }            
 
 
-//___________________________________________________________________
-
-Int_t AliTRDtracker::FindProlongation(AliTRDtrack& t, AliTRDtrackingSector *sec,
-                            Int_t s, Int_t rf, Int_t matched_index, 
-                                     TH1F *hs, TH1F *hd)
-{
-  // Starting from current position on track=t this function tries 
-  // to extrapolate the track up to timeBin=rf and to confirm prolongation
-  // if a close cluster is found. *sec is a pointer to allocated
-  // array of sectors, in which the initial sector has index=s. 
+AliTRDcluster * AliTRDtracker::GetCluster(AliTRDtrack * track, Int_t plane, Int_t timebin, UInt_t &index){
+  //
+  //try to find cluster in the backup list
+  //
+  AliTRDcluster * cl =0;
+  UInt_t *indexes = track->GetBackupIndexes();
+  for (UInt_t i=0;i<kMaxTimeBinIndex;i++){
+    if (indexes[i]==0) break;  
+    AliTRDcluster * cli = (AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(indexes[i]);
+    if (!cli) break;
+    if (cli->GetLocalTimeBin()!=timebin) continue;
+    Int_t iplane = fGeom->GetPlane(cli->GetDetector());
+    if (iplane==plane) {
+      cl = cli;
+      index = indexes[i];
+      break;
+    }
+  }
+  return cl;
+}
 
 
-  //  TH1F *hsame = hs;     
-  //  TH1F *hdiff = hd;   
+Int_t  AliTRDtracker::GetLastPlane(AliTRDtrack * track){
+  //
+  //return last updated plane
+  Int_t lastplane=0;
+  UInt_t *indexes = track->GetBackupIndexes();
+  for (UInt_t i=0;i<kMaxTimeBinIndex;i++){
+    AliTRDcluster * cli = (AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(indexes[i]);
+    if (!cli) break;
+    Int_t iplane = fGeom->GetPlane(cli->GetDetector());
+    if (iplane>lastplane) {
+      lastplane = iplane;
+    }
+  }
+  return lastplane;
+}
+//___________________________________________________________________
+Int_t AliTRDtracker::Clusters2Tracks(AliESD* event)
+{
+  //
+  // Finds tracks within the TRD. The ESD event is expected to contain seeds 
+  // at the outer part of the TRD. The seeds
+  // are found within the TRD if fAddTRDseeds is TRUE. 
+  // The tracks are propagated to the innermost time bin 
+  // of the TRD and the ESD event is updated
+  //
 
-  //  Bool_t good_match;
+  Int_t timeBins = fTrSec[0]->GetNumberOfTimeBins();
+  Float_t foundMin = fgkMinClustersInTrack * timeBins; 
+  Int_t nseed = 0;
+  Int_t found = 0;
+  Int_t innerTB = fTrSec[0]->GetInnerTimeBin();
+
+  Int_t n = event->GetNumberOfTracks();
+  for (Int_t i=0; i<n; i++) {
+    AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
+    ULong_t status=seed->GetStatus();
+    if ( (status & AliESDtrack::kTRDout ) == 0 ) continue;
+    if ( (status & AliESDtrack::kTRDin) != 0 ) continue;
+    nseed++;
+    
+    AliTRDtrack* seed2 = new AliTRDtrack(*seed);
+    //seed2->ResetCovariance(); 
+    AliTRDtrack *pt = new AliTRDtrack(*seed2,seed2->GetAlpha());
+    AliTRDtrack &t=*pt; 
+    FollowProlongation(t, innerTB); 
+    if (t.GetNumberOfClusters() >= foundMin) {
+      UseClusters(&t);
+      CookLabel(pt, 1-fgkLabelFraction);
+      //      t.CookdEdx();
+    }
+    found++;
+//    cout<<found<<'\r';     
 
-  const Int_t TIME_BINS_TO_SKIP=Int_t(fSkipDepth*sec->GetNtimeBins());
-  Int_t try_again=TIME_BINS_TO_SKIP;
+    if(PropagateToTPC(t)) {
+      seed->UpdateTrackParams(pt, AliESDtrack::kTRDin);
+    }  
+    delete seed2;
+    delete pt;
+  }     
 
-  Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
+  cout<<"Number of loaded seeds: "<<nseed<<endl;  
+  cout<<"Number of found tracks from loaded seeds: "<<found<<endl;
 
-  Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/alpha+0.5);
+  // after tracks from loaded seeds are found and the corresponding 
+  // clusters are used, look for additional seeds from TRD
 
-  Double_t x0, rho;
+  if(fAddTRDseeds) { 
+    // Find tracks for the seeds in the TRD
+    Int_t timeBins = fTrSec[0]->GetNumberOfTimeBins();
+  
+    Int_t nSteps = (Int_t) (fgkSeedDepth / fgkSeedStep);
+    Int_t gap = (Int_t) (timeBins * fgkSeedGap);
+    Int_t step = (Int_t) (timeBins * fgkSeedStep);
+  
+    // make a first turn with tight cut on initial curvature
+    for(Int_t turn = 1; turn <= 2; turn++) {
+      if(turn == 2) {
+        nSteps = (Int_t) (fgkSeedDepth / (3*fgkSeedStep));
+        step = (Int_t) (timeBins * (3*fgkSeedStep));
+      }
+      for(Int_t i=0; i<nSteps; i++) {
+        Int_t outer=timeBins-1-i*step; 
+        Int_t inner=outer-gap;
 
-  for (Int_t nr=sec->GetTimeBinNumber(t.GetX())-1; nr>=rf; nr--) {
+        nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
+      
+        MakeSeeds(inner, outer, turn);
+      
+        nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
+       //        printf("\n turn %d, step %d: number of seeds for TRD inward %d\n", 
+       //               turn, i, nseed); 
+              
+        for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {   
+          AliTRDtrack *pt=(AliTRDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i), &t=*pt; 
+          FollowProlongation(t,innerTB); 
+          if (t.GetNumberOfClusters() >= foundMin) {
+            UseClusters(&t);
+            CookLabel(pt, 1-fgkLabelFraction);
+            t.CookdEdx();
+           found++;
+//            cout<<found<<'\r';     
+            if(PropagateToTPC(t)) {
+             AliESDtrack track;
+             track.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTRDin);
+             event->AddTrack(&track);
+             //              track.SetTRDtrack(new AliTRDtrack(*pt));
+            }        
+          }
+          delete fSeeds->RemoveAt(i);
+          fNseeds--;
+        }
+      }
+    }
+  }
+  
+  cout<<"Total number of found tracks: "<<found<<endl;
+    
+  return 0;    
+}     
+     
+  
 
-    Double_t x=sec->GetX(nr);
-    Double_t ymax=x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+//_____________________________________________________________________________
+Int_t AliTRDtracker::PropagateBack(AliESD* event) {
+  //
+  // Gets seeds from ESD event. The seeds are AliTPCtrack's found and
+  // backpropagated by the TPC tracker. Each seed is first propagated 
+  // to the TRD, and then its prolongation is searched in the TRD.
+  // If sufficiently long continuation of the track is found in the TRD
+  // the track is updated, otherwise it's stored as originaly defined 
+  // by the TPC tracker.   
+  //  
+
+  Int_t found=0;  
+  Float_t foundMin = 20;
+  Int_t n = event->GetNumberOfTracks();
+  //
+  //Sort tracks
+  Float_t *quality =new Float_t[n];
+  Int_t *index   =new Int_t[n];
+  for (Int_t i=0; i<n; i++) {
+    AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
+    Double_t covariance[15];
+    seed->GetExternalCovariance(covariance);
+    quality[i] = covariance[0]+covariance[2];      
+  }
+  TMath::Sort(n,quality,index,kFALSE);
+  //
+  for (Int_t i=0; i<n; i++) {
+    //    AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
+    AliESDtrack* seed=event->GetTrack(index[i]);
+
+    ULong_t status=seed->GetStatus();
+    if ( (status & AliESDtrack::kTPCout ) == 0 ) continue;
+    if ( (status & AliESDtrack::kTRDout) != 0 ) continue;
+
+    Int_t lbl = seed->GetLabel();
+    AliTRDtrack *track = new AliTRDtrack(*seed);
+    track->SetSeedLabel(lbl);
+    seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDbackup); //make backup
+    fNseeds++;
+    Float_t p4     = track->GetC();
+    //
+    Int_t expectedClr = FollowBackProlongation(*track);
+    /*
+      // only debug purpose
+    if (track->GetNumberOfClusters()<expectedClr/3){
+      AliTRDtrack *track1 = new AliTRDtrack(*seed);
+      track1->SetSeedLabel(lbl);
+      FollowBackProlongation(*track1);
+      AliTRDtrack *track2= new AliTRDtrack(*seed);
+      track->SetSeedLabel(lbl);
+      FollowBackProlongation(*track2);      
+      delete track1;
+      delete track2;
+    }
+    */
+    if (TMath::Abs(track->GetC()-p4)/TMath::Abs(p4)<0.2 || TMath::Abs(track->GetPt())>0.8 ) {
+      // 
+      //make backup for back propagation 
+      //
+      Int_t foundClr = track->GetNumberOfClusters();
+      if (foundClr >= foundMin) {
+       track->CookdEdx(); 
+       CookLabel(track, 1-fgkLabelFraction);
+       if(track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()<4) {   // sign only gold tracks
+         if (seed->GetKinkIndex(0)==0&&TMath::Abs(track->GetPt())<1.5 ) UseClusters(track);
+       }
+       Bool_t isGold = kFALSE;
+       
+       if (track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()<5) {  //full gold track
+         // seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDbackup);
+          if (track->GetBackupTrack()) seed->UpdateTrackParams(track->GetBackupTrack(), AliESDtrack::kTRDbackup);
+         isGold = kTRUE;
+       }
+       if (!isGold && track->GetNCross()==0&&track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()<7){ //almost gold track
+         //      seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDbackup);
+         if (track->GetBackupTrack()) seed->UpdateTrackParams(track->GetBackupTrack(), AliESDtrack::kTRDbackup);
+         isGold = kTRUE;
+       }
+       if (!isGold && track->GetBackupTrack()){
+         if (track->GetBackupTrack()->GetNumberOfClusters()>foundMin&&
+             (track->GetBackupTrack()->GetChi2()/(track->GetBackupTrack()->GetNumberOfClusters()+1))<7){         
+           seed->UpdateTrackParams(track->GetBackupTrack(), AliESDtrack::kTRDbackup);
+           isGold = kTRUE;
+         }
+       }
+       if (track->StatusForTOF()>0 &&track->fNCross==0 && Float_t(track->fN)/Float_t(track->fNExpected)>0.4){
+         seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDbackup);
+       }
+      }
+    }
+    //
+    //Propagation to the TOF (I.Belikov)
+    
+    if (track->GetStop()==kFALSE){
+      
+      Double_t xtof=371.;
+      Double_t c2=track->GetC()*xtof - track->GetEta();
+      if (TMath::Abs(c2)>=0.99) {
+       delete track;
+       continue;
+      }
+      Double_t xTOF0 = 365. ;          
+      PropagateToOuterPlane(*track,xTOF0); 
+      //
+      //energy losses taken to the account - check one more time
+      c2=track->GetC()*xtof - track->GetEta();
+      if (TMath::Abs(c2)>=0.99) {
+       delete track;
+       continue;
+      }
 
-    rho = 0.00295; x0 = 11.09;  // TEC
-    if(sec->TECframe(nr,t.GetY(),t.GetZ())) { 
-      rho = 1.7; x0 = 33.0;     // G10 frame 
-    } 
-    if(TMath::Abs(x - t.GetX()) > 3) { 
-      rho = 0.0559; x0 = 55.6;  // radiator
+      //      
+      Double_t ymax=xtof*TMath::Tan(0.5*AliTRDgeometry::GetAlpha());
+      Double_t y=track->GetYat(xtof);
+      if (y > ymax) {
+       if (!track->Rotate(AliTRDgeometry::GetAlpha())) {
+         delete track;
+         continue;
+       }
+      } else if (y <-ymax) {
+       if (!track->Rotate(-AliTRDgeometry::GetAlpha())) {
+         delete track;
+         continue;
+       }
+      }
+      
+      if (track->PropagateTo(xtof)) {
+       seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
+        for (Int_t i=0;i<kNPlane;i++) {
+           seed->SetTRDsignals(track->GetPIDsignals(i),i);
+           seed->SetTRDTimBin(track->GetPIDTimBin(i),i);
+        }
+       //      seed->SetTRDtrack(new AliTRDtrack(*track));
+       if (track->GetNumberOfClusters()>foundMin) found++;
+      }
+    }else{
+      if (track->GetNumberOfClusters()>15&&track->GetNumberOfClusters()>0.5*expectedClr){
+       seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
+       //seed->SetStatus(AliESDtrack::kTRDStop);    
+        for (Int_t i=0;i<kNPlane;i++) {
+           seed->SetTRDsignals(track->GetPIDsignals(i),i);
+           seed->SetTRDTimBin(track->GetPIDTimBin(i),i);
+        }
+       //seed->SetTRDtrack(new AliTRDtrack(*track));
+       found++;
+      }
     }
-    if (!t.PropagateTo(x,x0,rho,0.139)) {
-      cerr<<"Can't propagate to x = "<<x<<endl;
-      return 0;
+    seed->SetTRDQuality(track->StatusForTOF());    
+    //
+    // Debug part of tracking
+    TTreeSRedirector& cstream = *fDebugStreamer;
+    Int_t eventNr = event->GetEventNumber();
+    if (track->GetBackupTrack()){
+      cstream<<"Tracks"<<
+       "EventNr="<<eventNr<<
+       "ESD.="<<seed<<
+       "trd.="<<track<<
+       "trdback.="<<track->GetBackupTrack()<<  
+       "\n";
+    }else{
+      cstream<<"Tracks"<<
+       "EventNr="<<eventNr<<
+       "ESD.="<<seed<<
+       "trd.="<<track<<
+       "trdback.="<<track<<
+       "\n";
     }
+    delete track;
+    //
+    //End of propagation to the TOF
+    //if (foundClr>foundMin)
+    //  seed->UpdateTrackParams(track, AliESDtrack::kTRDout);
+    
+
+  }
+  
+  cerr<<"Number of seeds: "<<fNseeds<<endl;  
+  cerr<<"Number of back propagated TRD tracks: "<<found<<endl;
 
-    AliTRDtimeBin& time_bin=sec[s][nr];
-    Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(t.GetX(),t.GetTgl(),t.GetPt());
-    Double_t sz2=ExpectedSigmaZ2(t.GetX(),t.GetTgl());
-    Double_t road=25.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2), y=t.GetY(), z=t.GetZ();
+  //  MakeSeedsMI(3,5); //new seeding
 
-    if (road>fWideRoad) {
-      if (t.GetNclusters() > 4) {
-       cerr<<t.GetNclusters()<<" FindProlongation: Road is too wide !\n";
-      }
-      return 0;
-    }       
 
-    AliTRDcluster *cl=0;
-    UInt_t index=0;
-    //    Int_t ncl = 0;
+  fSeeds->Clear(); fNseeds=0;
+  delete [] index;
+  delete [] quality;
+  
+  return 0;
 
-    Double_t max_chi2=fMaxChi2;
+}
 
-    if (time_bin) {
+//_____________________________________________________________________________
+Int_t AliTRDtracker::RefitInward(AliESD* event)
+{
+  //
+  // Refits tracks within the TRD. The ESD event is expected to contain seeds 
+  // at the outer part of the TRD. 
+  // The tracks are propagated to the innermost time bin 
+  // of the TRD and the ESD event is updated
+  // Origin: Thomas KUHR (Thomas.Kuhr@cern.ch)
+  //
 
-      for (Int_t i=time_bin.Find(y-road); i<time_bin; i++) {
-        AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(time_bin[i]);
+  Int_t timeBins = fTrSec[0]->GetNumberOfTimeBins();
+  Float_t foundMin = fgkMinClustersInTrack * timeBins; 
+  Int_t nseed = 0;
+  Int_t found = 0;
+  Int_t innerTB = fTrSec[0]->GetInnerTimeBin();
+  AliTRDtrack seed2;
+
+  Int_t n = event->GetNumberOfTracks();
+  for (Int_t i=0; i<n; i++) {
+    AliESDtrack* seed=event->GetTrack(i);
+    new(&seed2) AliTRDtrack(*seed);
+    if (seed2.GetX()<270){
+      seed->UpdateTrackParams(&seed2, AliESDtrack::kTRDbackup); // backup TPC track - only update
+      continue;
+    }
 
-       //      good_match = kFALSE;
-       //      if((c->GetTrackIndex(0) == matched_index) ||
-       //   (c->GetTrackIndex(1) == matched_index) ||
-       //   (c->GetTrackIndex(2) == matched_index)) good_match = kTRUE;
-       //        if(hsame) hsame->Fill(TMath::Abs(c->GetY()-y)/road);
-       //        if(hdiff) hdiff->Fill(road);
+    ULong_t status=seed->GetStatus();
+    if ( (status & AliESDtrack::kTRDout ) == 0 ) {
+      continue;
+    }
+    if ( (status & AliESDtrack::kTRDin) != 0 ) {
+      continue;
+    }
+    nseed++;    
+//     if (1/seed2.Get1Pt()>1.5&& seed2.GetX()>260.) {
+//       Double_t oldx = seed2.GetX();
+//       seed2.PropagateTo(500.);
+//       seed2.ResetCovariance(1.);
+//       seed2.PropagateTo(oldx);
+//     }
+//     else{
+//       seed2.ResetCovariance(5.); 
+//     }
+
+    AliTRDtrack *pt = new AliTRDtrack(seed2,seed2.GetAlpha());
+    UInt_t * indexes2 = seed2.GetIndexes();
+    for (Int_t i=0;i<kNPlane;i++) {
+      pt->SetPIDsignals(seed2.GetPIDsignals(i),i);
+      pt->SetPIDTimBin(seed2.GetPIDTimBin(i),i);
+    }
 
-        if (c->GetY() > y+road) break;
-        if (c->IsUsed() > 0) continue;
+    UInt_t * indexes3 = pt->GetBackupIndexes();
+    for (Int_t i=0;i<200;i++) {
+      if (indexes2[i]==0) break;
+      indexes3[i] = indexes2[i];
+    }          
+    //AliTRDtrack *pt = seed2;
+    AliTRDtrack &t=*pt; 
+    FollowProlongation(t, innerTB); 
+    if (t.GetNumberOfClusters() >= foundMin) {
+      //      UseClusters(&t);
+      //CookLabel(pt, 1-fgkLabelFraction);
+      t.CookdEdx();
+      CookdEdxTimBin(t);
+    }
+    found++;
+//    cout<<found<<'\r';     
+
+    if(PropagateToTPC(t)) {
+      seed->UpdateTrackParams(pt, AliESDtrack::kTRDrefit);
+      for (Int_t i=0;i<kNPlane;i++) {
+        seed->SetTRDsignals(pt->GetPIDsignals(i),i);
+        seed->SetTRDTimBin(pt->GetPIDTimBin(i),i);
+      }
+    }else{
+      //if not prolongation to TPC - propagate without update
+      AliTRDtrack* seed2 = new AliTRDtrack(*seed);
+      seed2->ResetCovariance(5.); 
+      AliTRDtrack *pt2 = new AliTRDtrack(*seed2,seed2->GetAlpha());
+      delete seed2;
+      if (PropagateToTPC(*pt2)) { 
+        pt2->CookdEdx(0.,1.);
+        CookdEdxTimBin(*pt2);
+       seed->UpdateTrackParams(pt2, AliESDtrack::kTRDrefit);
+        for (Int_t i=0;i<kNPlane;i++) {
+          seed->SetTRDsignals(pt2->GetPIDsignals(i),i);
+          seed->SetTRDTimBin(pt2->GetPIDTimBin(i),i);
+        }
+      }
+      delete pt2;
+    }  
+    delete pt;
+  }   
 
-       //      if(good_match) hsame->Fill(TMath::Abs(c->GetZ()-z));
-       //      else hdiff->Fill(TMath::Abs(c->GetZ()-z));
+  cout<<"Number of loaded seeds: "<<nseed<<endl;  
+  cout<<"Number of found tracks from loaded seeds: "<<found<<endl;
 
-       //      if(!good_match) continue;
+  return 0;
 
-       if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 3 * 12 * sz2) continue;
+}
 
-        Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c);
 
-       //      if((c->GetTrackIndex(0) == matched_index) ||
-       //         (c->GetTrackIndex(1) == matched_index) ||
-       //         (c->GetTrackIndex(2) == matched_index))
-       //        hdiff->Fill(chi2);
+//---------------------------------------------------------------------------
+Int_t AliTRDtracker::FollowProlongation(AliTRDtrack& t, Int_t rf)
+{
+  // Starting from current position on track=t this function tries
+  // to extrapolate the track up to timeBin=0 and to confirm prolongation
+  // if a close cluster is found. Returns the number of clusters
+  // expected to be found in sensitive layers
 
-       //      ncl++;
+  Float_t  wIndex, wTB, wChi2;
+  Float_t  wYrt, wYclosest, wYcorrect, wYwindow;
+  Float_t  wZrt, wZclosest, wZcorrect, wZwindow;
+  Float_t  wPx, wPy, wPz, wC;
+  Double_t px, py, pz;
+  Float_t  wSigmaC2, wSigmaTgl2, wSigmaY2, wSigmaZ2;
+  Int_t lastplane = GetLastPlane(&t);
 
-        if (chi2 > max_chi2) continue;
-        max_chi2=chi2;
-        cl=c;
-        index=time_bin.GetIndex(i);
-      }   
-      
-      if(!cl) {
+  Int_t trackIndex = t.GetLabel();  
 
-       for (Int_t i=time_bin.Find(y-road); i<time_bin; i++) {
-         AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(time_bin[i]);
+  Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);     
 
-         if (c->GetY() > y+road) break;
-         if (c->IsUsed() > 0) continue;          
-         if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 3.25 * 12 * sz2) continue;
-         
-         Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c);
-         
-         //      ncl++;
+  Int_t tryAgain=fMaxGap;
 
-         if (chi2 > max_chi2) continue;
-         max_chi2=chi2;
-         cl=c;
-         index=time_bin.GetIndex(i);
-       }   
-      }
-      
-    }
+  Double_t alpha=t.GetAlpha();
+  alpha = TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
 
-    if (cl) {
+  Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;  
+  Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax, z;
 
-      t.Update(cl,max_chi2,index);
+  Int_t expectedNumberOfClusters = 0;
+  Bool_t lookForCluster;
 
-      try_again=TIME_BINS_TO_SKIP;
-    } else {
-      if (try_again==0) break;
-      if (y > ymax) {
-       //      cerr<<"y > ymax: "<<y<<" > "<<ymax<<endl;
-         s = (s+1) % ns;
-         if (!t.Rotate(alpha)) {
-          cerr<<"Failed to rotate, alpha = "<<alpha<<endl;
-          return 0;
-        }
-      } else if (y <-ymax) {
-       //      cerr<<"y < -ymax: "<<y<<" < "<<-ymax<<endl;
-         s = (s-1+ns) % ns;
-         if (!t.Rotate(-alpha)) {
-          cerr<<"Failed to rotate, alpha = "<<alpha<<endl;
-          return 0;
-        }
-      }
-      if(!sec->TECframe(nr,y,z)) try_again--;
-    }
-  }
+  alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
 
-  return 1;
-}          
+  for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX()); nr>rf; nr--) { 
+
+    y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+
+    // first propagate to the inner surface of the current time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()-dx/2; y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    y = t.GetY();
+    ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+    if (y > ymax) {
+      s = (s+1) % ns;
+      if (!t.Rotate(alpha)) break;
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } else if (y <-ymax) {
+      s = (s-1+ns) % ns;                           
+      if (!t.Rotate(-alpha)) break;   
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } 
 
+    y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+
+    // now propagate to the middle plane of the next time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetX(); y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    y = t.GetY();
+    ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+    if (y > ymax) {
+      s = (s+1) % ns;
+      if (!t.Rotate(alpha)) break;
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } else if (y <-ymax) {
+      s = (s-1+ns) % ns;                           
+      if (!t.Rotate(-alpha)) break;   
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } 
 
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::GetEvent(const Char_t *hitfile, const Char_t *clusterfile)
-{
-  // Opens a ROOT-file with TRD-clusters and reads the cluster-tree in
+    if(lookForCluster) {
 
-  ReadClusters(fClusters, clusterfile);
+      expectedNumberOfClusters++;       
+      wIndex = (Float_t) t.GetLabel();
+      wTB = nr;
 
-  // get geometry from the file with hits
+      AliTRDpropagationLayer& timeBin=*(fTrSec[s]->GetLayer(nr-1));
 
-  TFile *fInputFile = (TFile*) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(hitfile);
-  if (!fInputFile) {
-    printf("AliTRDtracker::Open -- ");
-    printf("Open the ALIROOT-file %s.\n",hitfile);
-    fInputFile = new TFile(hitfile,"UPDATE");
-  }
-  else {
-    printf("AliTRDtracker::Open -- ");
-    printf("%s is already open.\n",hitfile);
-  }
+      Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(x,t.GetTgl(),t.GetPt());
+      Double_t sz2=ExpectedSigmaZ2(x,t.GetTgl());
 
-  // Get AliRun object from file or create it if not on file
+      Double_t road;
+      if((t.GetSigmaY2() + sy2) > 0) road=10.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2);
+      else return expectedNumberOfClusters;
+      
+      wYrt = (Float_t) y;
+      wZrt = (Float_t) z;
+      wYwindow = (Float_t) road;
+      t.GetPxPyPz(px,py,pz);
+      wPx = (Float_t) px;
+      wPy = (Float_t) py;
+      wPz = (Float_t) pz;
+      wC  = (Float_t) t.GetC();
+      wSigmaC2 = (Float_t) t.GetSigmaC2();
+      wSigmaTgl2    = (Float_t) t.GetSigmaTgl2();
+      wSigmaY2 = (Float_t) t.GetSigmaY2();
+      wSigmaZ2 = (Float_t) t.GetSigmaZ2();
+      wChi2 = -1;            
+      
 
-  gAlice = (AliRun*) fInputFile->Get("gAlice");
-  if (gAlice) {
-    printf("AliTRDtracker::GetEvent -- ");
-    printf("AliRun object found on file.\n");
-  }
-  else {
-    printf("AliTRDtracker::GetEvent -- ");
-    printf("Could not find AliRun object.\n");
+      AliTRDcluster *cl=0;
+      UInt_t index=0;
+
+      Double_t maxChi2=fgkMaxChi2;
+
+      wYclosest = 12345678;
+      wYcorrect = 12345678;
+      wZclosest = 12345678;
+      wZcorrect = 12345678;
+      wZwindow  = TMath::Sqrt(2.25 * 12 * sz2);   
+
+      // Find the closest correct cluster for debugging purposes
+      if (timeBin&&fVocal) {
+        Float_t minDY = 1000000;
+        for (Int_t i=0; i<timeBin; i++) {
+          AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
+          if((c->GetLabel(0) != trackIndex) &&
+             (c->GetLabel(1) != trackIndex) &&
+             (c->GetLabel(2) != trackIndex)) continue;
+          if(TMath::Abs(c->GetY() - y) > minDY) continue;
+          minDY = TMath::Abs(c->GetY() - y);
+          wYcorrect = c->GetY();
+          wZcorrect = c->GetZ();
+
+          Double_t h01 = GetTiltFactor(c);
+          wChi2 = t.GetPredictedChi2(c, h01);
+        }
+      }                    
+
+      // Now go for the real cluster search
+
+      if (timeBin) {
+       //
+       //find cluster in history
+       cl =0;
+       
+       AliTRDcluster * cl0 = timeBin[0];
+       if (!cl0) {
+         continue;
+       }
+       Int_t plane = fGeom->GetPlane(cl0->GetDetector());
+       if (plane>lastplane) continue;
+       Int_t timebin = cl0->GetLocalTimeBin();
+       AliTRDcluster * cl2= GetCluster(&t,plane, timebin,index);
+       if (cl2) {
+         cl =cl2;      
+         Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
+         maxChi2=t.GetPredictedChi2(cl,h01);
+       }
+       if ((!cl) && road>fgkWideRoad) {
+         //if (t.GetNumberOfClusters()>4)
+         //  cerr<<t.GetNumberOfClusters()
+         //    <<"FindProlongation warning: Too broad road !\n";
+         continue;
+       }             
+
+        if (cl) {
+         
+          wYclosest = cl->GetY();
+          wZclosest = cl->GetZ();
+          Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
+
+          if (cl->GetNPads()<5) 
+           t.SetSampledEdx(TMath::Abs(cl->GetQ()/dx)); 
+         Int_t det = cl->GetDetector();    
+         Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
+
+         if(!t.UpdateMI(cl,maxChi2,index,h01,plane)) {
+           //if(!t.Update(cl,maxChi2,index,h01)) {
+            //if(!tryAgain--) return 0;
+          }  
+          else tryAgain=fMaxGap;
+        }
+        else {
+          //if (tryAgain==0) break; 
+          tryAgain--;
+        }
+      }
+    }  
   }
+  return expectedNumberOfClusters;
+  
+  
+}                
 
-  /*  
-  // Import the Trees for the event nEvent in the file
-  Int_t nparticles = gAlice->GetEvent(fEvent);
-  cerr<<"nparticles = "<<nparticles<<endl;
+//___________________________________________________________________
 
-  if (nparticles <= 0) {
-    printf("AliTRDtracker::GetEvent -- ");
-    printf("No entries in the trees for event %d.\n",fEvent);
-  }
-  */  
+Int_t AliTRDtracker::FollowBackProlongation(AliTRDtrack& t)
+{
+  // Starting from current radial position of track <t> this function
+  // extrapolates the track up to outer timebin and in the sensitive
+  // layers confirms prolongation if a close cluster is found. 
+  // Returns the number of clusters expected to be found in sensitive layers
 
-  AliTRD *TRD = (AliTRD*) gAlice->GetDetector("TRD");
-  fGeom = TRD->GetGeometry();
+  Int_t tryAgain=fMaxGap;
 
-}     
+  Double_t alpha=t.GetAlpha();
+  TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
 
+  Int_t s;
+  
+  Int_t clusters[1000];
+  for (Int_t i=0;i<1000;i++) clusters[i]=-1;
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::SetUpSectors(AliTRDtrackingSector *sec)
-{
-  // Fills clusters into TRD tracking_sectors 
-  // Note that the numbering scheme for the TRD tracking_sectors 
-  // differs from that of TRD sectors
+  Int_t outerTB = fTrSec[0]->GetOuterTimeBin();
+  //Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax = 0, z;
+  Double_t radLength, rho, x, dx, y, z;
+  Bool_t lookForCluster;
 
-  for (Int_t i=0; i<AliTRDgeometry::Nsect(); i++) sec[i].SetUp();
+  Int_t expectedNumberOfClusters = 0;
+  x = t.GetX();
 
-  //  Sort clusters into AliTRDtimeBin's within AliTRDtrackSector's 
+  alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
 
-  cerr<<"SetUpSectors: sorting clusters"<<endl;
-              
-  Int_t ncl=fClusters->GetEntriesFast();
-  UInt_t index;
-  while (ncl--) {
-    printf("\r %d left  ",ncl); 
-    AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(ncl);
-    Int_t detector=c->GetDetector(), local_time_bin=c->GetLocalTimeBin();
-    Int_t sector=fGeom->GetSector(detector);
+  //  Int_t zone =0;
+  Int_t nr;
+  Float_t ratio0=0;
+  AliTRDtracklet tracklet;
+  //
+  for (nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX()); nr<outerTB+1; nr++) { 
+   
+    y = t.GetY(); 
+    z = t.GetZ();
+    // first propagate to the outer surface of the current time bin 
+
+    s = t.GetSector();
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()+dx/2; 
+    y = t.GetY(); 
+    z = t.GetZ();
+
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    //
+    // MI -fix untill correct material desription will be implemented
+    //
+    //Int_t nrotate = t.GetNRotate();
+    if (!AdjustSector(&t)) break;    
+    //
+    //
+    y = t.GetY();
+    z = t.GetZ();
+    s = t.GetSector();
+
+    // now propagate to the middle plane of the next time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+//     if (nrotate!=t.GetNRotate()){
+//       rho = 1000*2.7; radLength = 24.01;  //TEMPORARY - aluminium in between z - will be detected using GeoModeler in future versions
+//     }
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetX(); 
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    if (!AdjustSector(&t)) break;
+    s = t.GetSector();
+    //    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    
+    if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) break;
+
+    y = t.GetY();
+    z = t.GetZ();
+
+    if(lookForCluster) {
+      if (clusters[nr]==-1) {
+       Float_t  ncl   = FindClusters(s,nr,nr+30,&t,clusters,tracklet);
+       ratio0 = ncl/Float_t(fTimeBinsPerPlane);
+       Float_t  ratio1 = Float_t(t.fN+1)/Float_t(t.fNExpected+1.);     
+       if (tracklet.GetChi2()<18.&&ratio0>0.8 && ratio1>0.6 && ratio0+ratio1>1.5 && t.GetNCross()==0 && TMath::Abs(t.GetSnp())<0.85&&t.fN>20){
+         t.MakeBackupTrack();                            // make backup of the track until is gold
+       }
+//     if (ncl>4){
+//       t.PropagateTo(tracklet.GetX());
+//       t.UpdateMI(tracklet);
+//       nr = fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX())+1;
+//       continue;
+//     }
+      }
 
-    Int_t tracking_sector = AliTRDgeometry::kNsect - sector - 1;
+      expectedNumberOfClusters++;       
+      t.fNExpected++;
+      if (t.fX>345) t.fNExpectedLast++;
 
-    Int_t tb=sec[sector].GetTimeBin(detector,local_time_bin); 
-    index=ncl;
-    sec[tracking_sector][tb].InsertCluster(c,index);
+      AliTRDpropagationLayer& timeBin=*(fTrSec[s]->GetLayer(nr+1));
+      Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(t.GetX(),t.GetTgl(),t.GetPt());
+      if((t.GetSigmaY2() + sy2) < 0) {
+       printf("problem\n");
+       break;
+      }
+      Double_t road = 10.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2); 
+      
+      if (road>fgkWideRoad) {
+        return 0;
+      }      
 
-  }    
-  printf("\r\n");
-}
+      AliTRDcluster *cl=0;
+      UInt_t index=0;
+      Double_t maxChi2=fgkMaxChi2;
+      
+      // Now go for the real cluster search
 
+      if (timeBin) {
+       
+       if (clusters[nr+1]>0) {
+         index = clusters[nr+1];
+         cl    = (AliTRDcluster*)GetCluster(index);
+         Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
+          maxChi2=t.GetPredictedChi2(cl,h01);          
+       }
+       
+        if (cl) {
+         if (cl->GetNPads()<5) 
+           t.SetSampledEdx(TMath::Abs(cl->GetQ()/dx)); 
+          Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
+         Int_t det = cl->GetDetector();    
+         Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
+         if (t.fX>345){
+           t.fNLast++;
+           t.fChi2Last+=maxChi2;
+         }
+         if(!t.UpdateMI(cl,maxChi2,index,h01,plane)) {
+           if(!t.Update(cl,maxChi2,index,h01)) {
+             //if(!tryAgain--) return 0;
+           }
+          }  
+          else tryAgain=fMaxGap;
+         //
+         
+         if (cl->GetLocalTimeBin()==1&&t.fN>20 && float(t.fChi2)/float(t.fN)<5){
+           Float_t  ratio1 = Float_t(t.fN)/Float_t(t.fNExpected);      
+           if (tracklet.GetChi2()<18&&ratio0>0.8&&ratio1>0.6 &&ratio0+ratio1>1.5 && t.GetNCross()==0 && TMath::Abs(t.GetSnp())<0.85){
+             t.MakeBackupTrack();                            // make backup of the track until is gold
+           }
+         }
+         
+       }                       
+        else {
+         // if (tryAgain==0) break; 
+          //tryAgain--;                                                                               
+        }
+       
+       
+      }
+    }  
+  }
+  if (nr<outerTB) 
+    t.SetStop(kTRUE);
+  else
+    t.SetStop(kFALSE);
+  return expectedNumberOfClusters;
+  
+  
+}         
 
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::MakeSeeds(Int_t inner, Int_t outer, 
-                              AliTRDtrackingSector* fTrSec, Int_t turn,
-                             TH1F *hs, TH1F *hd)
+//---------------------------------------------------------------------------
+Int_t AliTRDtracker::Refit(AliTRDtrack& t, Int_t rf)
 {
-  // Creates track seeds using clusters in timeBins=i1,i2
+  // Starting from current position on track=t this function tries
+  // to extrapolate the track up to timeBin=0 and to reuse already
+  // assigned clusters. Returns the number of clusters
+  // expected to be found in sensitive layers
+  // get indices of assigned clusters for each layer
+  // Origin: Thomas KUHR (Thomas.Kuhr@cern.ch)
+
+  Int_t iCluster[90];
+  for (Int_t i = 0; i < 90; i++) iCluster[i] = 0;
+  for (Int_t i = 0; i < t.GetNumberOfClusters(); i++) {
+    Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
+    AliTRDcluster *cl=(AliTRDcluster*) GetCluster(index);
+    if (!cl) continue;
+    Int_t detector=cl->GetDetector();
+    Int_t localTimeBin=cl->GetLocalTimeBin();
+    Int_t sector=fGeom->GetSector(detector);
+    Int_t plane=fGeom->GetPlane(detector);
 
-  Int_t i2 = inner, i1 = outer; 
-  Int_t ti[3], to[3];
-  Int_t nprim = 85600/2;
+    Int_t trackingSector = CookSectorIndex(sector);
 
+    Int_t gtb = fTrSec[trackingSector]->CookTimeBinIndex(plane,localTimeBin);
+    if(gtb < 0) continue; 
+    Int_t layer = fTrSec[trackingSector]->GetLayerNumber(gtb);
+    iCluster[layer] = index;
+  }
+  t.ResetClusters();
 
-  TH1F *hsame = hs;
-  TH1F *hdiff = hd;   
-  Bool_t match = false;
-  Int_t matched_index;
+  Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);     
 
-  // find seeds
+  Double_t alpha=t.GetAlpha();
+  alpha = TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
 
-  Double_t x[5], c[15];
-  Int_t max_sec=AliTRDgeometry::kNsect;
+  Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;  
+  Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax, z;
 
-  Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
-  Double_t shift=AliTRDgeometry::GetAlpha()/2.;
-  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);  
-  Double_t cs2=cos(2.*alpha), sn2=sin(2.*alpha);  
+  Int_t expectedNumberOfClusters = 0;
+  Bool_t lookForCluster;
+
+  alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
+
+  for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(t.GetX()); nr>rf; nr--) { 
+
+    y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+
+    // first propagate to the inner surface of the current time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()-dx/2; y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    y = t.GetY();
+    ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+    if (y > ymax) {
+      s = (s+1) % ns;
+      if (!t.Rotate(alpha)) break;
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } else if (y <-ymax) {
+      s = (s-1+ns) % ns;                           
+      if (!t.Rotate(-alpha)) break;   
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } 
 
-  Double_t x1 =fTrSec[0].GetX(i1);
-  Double_t xx2=fTrSec[0].GetX(i2);  
+    y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+
+    // now propagate to the middle plane of the next time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetX(); y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    y = t.GetY();
+    ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+    if (y > ymax) {
+      s = (s+1) % ns;
+      if (!t.Rotate(alpha)) break;
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } else if (y <-ymax) {
+      s = (s-1+ns) % ns;                           
+      if (!t.Rotate(-alpha)) break;   
+      if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) break;
+    } 
 
+    if(lookForCluster) expectedNumberOfClusters++;       
 
-  printf("\n");
+    // use assigned cluster
+    if (!iCluster[nr-1]) continue;
+    AliTRDcluster *cl=(AliTRDcluster*)GetCluster(iCluster[nr-1]);
+    Double_t h01 = GetTiltFactor(cl);
+    Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(cl, h01);
+    if (cl->GetNPads()<5) t.SetSampledEdx(TMath::Abs(cl->GetQ()/dx)); 
 
-  if((turn != 1)&&(turn != 2)) {
-    printf("*** Error in MakeSeeds: unexpected turn = %d  \n", turn);
-    return;
+      //t.SetSampledEdx(cl->GetQ()/dx,t.GetNumberOfClusters()); 
+    t.Update(cl,chi2,iCluster[nr-1],h01);
   }
 
+  return expectedNumberOfClusters;
+}                
 
-  for (Int_t ns=0; ns<max_sec; ns++) {
+//___________________________________________________________________
 
-    printf("\n MakeSeeds: sector %d \n", ns); 
+Int_t AliTRDtracker::PropagateToOuterPlane(AliTRDtrack& t, Double_t xToGo)
+{
+  // Starting from current radial position of track <t> this function
+  // extrapolates the track up to radial position <xToGo>. 
+  // Returns 1 if track reaches the plane, and 0 otherwise 
 
-    Int_t nl2=fTrSec[(ns-2+max_sec)%max_sec][i2]; 
-    Int_t nl=fTrSec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
-    Int_t nm=fTrSec[ns][i2];
-    Int_t nu=fTrSec[(ns+1)%max_sec][i2];
-    Int_t nu2=fTrSec[(ns+2)%max_sec][i2]; 
+  Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);     
 
-    AliTRDtimeBin& r1=fTrSec[ns][i1];
+  Double_t alpha=t.GetAlpha();
 
-    for (Int_t is=0; is < r1; is++) {
-      Double_t y1=r1[is]->GetY(), z1=r1[is]->GetZ();
-      for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) to[ii] = r1[is]->GetTrackIndex(ii); 
+  if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
+  if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
 
-      for (Int_t js=0; js < nl2+nl+nm+nu+nu2; js++) {
-         
-       const AliTRDcluster *cl;
-       Double_t x2,   y2,   z2;
-       Double_t x3=0., y3=0.;  
-
-       if (js<nl2) {
-         if(turn != 2) continue;
-         AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns-2+max_sec)%max_sec][i2];
-         cl=r2[js];
-         y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
-         for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
-
-         x2= xx2*cs2+y2*sn2;
-         y2=-xx2*sn2+y2*cs2;
-       }        
-       else if (js<nl2+nl) {
-         if(turn != 1) continue;
-         AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
-         cl=r2[js-nl2];
-         y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
-         for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
-
-         x2= xx2*cs+y2*sn;
-         y2=-xx2*sn+y2*cs;
+  Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;  
 
-       }
-       else if (js<nl2+nl+nm) {
-         if(turn != 1) continue;
-         AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[ns][i2];
-         cl=r2[js-nl2-nl];
-         x2=xx2; y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
-         for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
-       }
-       else if (js<nl2+nl+nm+nu) {
-         if(turn != 1) continue;
-         AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns+1)%max_sec][i2];
-         cl=r2[js-nl2-nl-nm];
-         y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
-         for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
+  Bool_t lookForCluster;
+  Double_t radLength, rho, x, dx, y, ymax, z;
 
-         x2=xx2*cs-y2*sn;
-         y2=xx2*sn+y2*cs;
+  x = t.GetX();
 
-       }
-       else {
-         if(turn != 2) continue;
-         AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns+2)%max_sec][i2];
-         cl=r2[js-nl2-nl-nm-nu];
-         y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
-         for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
-         
-         x2=xx2*cs2-y2*sn2;
-         y2=xx2*sn2+y2*cs2;
-       }         
-       
+  alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
 
-       match = false;
-       matched_index = -1;
-       for (Int_t ii=0; ii<3; ii++) {
-         // cerr<<"ti["<<ii<<"] = "<<ti[ii]<<"; to["<<ii<<"] = "<<to[ii]<<endl;
-         if(ti[ii] < 0) continue;
-         if(ti[ii] >= nprim) continue;
-         for (Int_t kk=0; kk<3; kk++) {
-           if(to[kk] < 0) continue;
-           if(to[kk] >= nprim) continue;
-           if(ti[ii] == to[kk]) {
-             //cerr<<"ti["<<ii<<"] = "<<ti[ii]<<" = "<<to[kk]<<" = to["<<kk<<"]"<<endl;
-             matched_index = ti[ii];
-             match = true;
-           }
-         }
-       }                 
-       
-       if(TMath::Abs(z1-z2) > fMaxSeedDeltaZ12) continue;
+  Int_t plToGo = fTrSec[0]->GetLayerNumber(xToGo);
 
-        Double_t zz=z1 - z1/x1*(x1-x2);
+  for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(x); nr<plToGo; nr++) { 
 
-        if (TMath::Abs(zz-z2)>fMaxSeedDeltaZ) continue;   
+    y = t.GetY(); z = t.GetZ();
 
-        Double_t d=(x2-x1)*(0.-y2)-(0.-x2)*(y2-y1);
-        if (d==0.) {cerr<<"TRD MakeSeeds: Straight seed !\n"; continue;}
+    // first propagate to the outer surface of the current time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()+dx/2; y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+    y = t.GetY();
+    ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+    if (y > ymax) {
+      s = (s+1) % ns;
+      if (!t.Rotate(alpha)) return 0;
+    } else if (y <-ymax) {
+      s = (s-1+ns) % ns;                           
+      if (!t.Rotate(-alpha)) return 0;   
+    } 
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+
+    y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+
+    // now propagate to the middle plane of the next time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr+1)->GetX(); y = t.GetY(); z = t.GetZ();
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+    y = t.GetY();
+    ymax = x*TMath::Tan(0.5*alpha);
+    if (y > ymax) {
+      s = (s+1) % ns;
+      if (!t.Rotate(alpha)) return 0;
+    } else if (y <-ymax) {
+      s = (s-1+ns) % ns;                           
+      if (!t.Rotate(-alpha)) return 0;   
+    } 
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+  }
+  return 1;
+}         
 
-        x[0]=y1;
-        x[1]=z1;
-        x[2]=f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
+//___________________________________________________________________
+
+Int_t AliTRDtracker::PropagateToTPC(AliTRDtrack& t)
+{
+  // Starting from current radial position of track <t> this function
+  // extrapolates the track up to radial position of the outermost
+  // padrow of the TPC. 
+  // Returns 1 if track reaches the TPC, and 0 otherwise 
+
+  //Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/AliTRDgeometry::GetAlpha()+0.5);     
+
+  Double_t alpha=t.GetAlpha();
+  alpha = TVector2::Phi_0_2pi(alpha);
+
+  Int_t s=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;  
+
+  Bool_t lookForCluster;
+  Double_t radLength, rho, x, dx, y, /*ymax,*/ z;
+
+  x = t.GetX();
+
+  alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();  // note: change in meaning
+  Int_t plTPC = fTrSec[0]->GetLayerNumber(246.055);
+
+  for (Int_t nr=fTrSec[0]->GetLayerNumber(x); nr>plTPC; nr--) { 
+
+    y = t.GetY(); 
+    z = t.GetZ();
+
+    // first propagate to the outer surface of the current time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr)->GetX()-dx/2; 
+    
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+    AdjustSector(&t);
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+
+    y = t.GetY(); 
+    z = t.GetZ();
+
+    // now propagate to the middle plane of the next time bin 
+    fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetPropagationParameters(y,z,dx,rho,radLength,lookForCluster);
+    x = fTrSec[s]->GetLayer(nr-1)->GetX(); 
+    
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+    AdjustSector(&t);
+    if(!t.PropagateTo(x,radLength,rho)) return 0;
+  } 
+  return 1;
+}         
+
+//_____________________________________________________________________________
+Int_t AliTRDtracker::LoadClusters(TTree *cTree)
+{
+  // Fills clusters into TRD tracking_sectors 
+  // Note that the numbering scheme for the TRD tracking_sectors 
+  // differs from that of TRD sectors
+  cout<<"\n Read Sectors  clusters"<<endl;
+  if (ReadClusters(fClusters,cTree)) {
+     Error("LoadClusters","Problem with reading the clusters !");
+     return 1;
+  }
+  Int_t ncl=fClusters->GetEntriesFast();
+  fNclusters=ncl;
+  cout<<"\n LoadSectors: sorting "<<ncl<<" clusters"<<endl;
+              
+  UInt_t index;
+  for (Int_t ichamber=0;ichamber<5;ichamber++)
+    for (Int_t isector=0;isector<18;isector++){
+      fHoles[ichamber][isector]=kTRUE;
+    }
+
+
+  while (ncl--) {
+//    printf("\r %d left  ",ncl); 
+    AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(ncl);
+    Int_t detector=c->GetDetector();
+    Int_t localTimeBin=c->GetLocalTimeBin();
+    Int_t sector=fGeom->GetSector(detector);
+    Int_t plane=fGeom->GetPlane(detector);
+      
+    Int_t trackingSector = CookSectorIndex(sector);
+    if (c->GetLabel(0)>0){
+      Int_t chamber = fGeom->GetChamber(detector);
+      fHoles[chamber][trackingSector]=kFALSE;
+    }
+
+    Int_t gtb = fTrSec[trackingSector]->CookTimeBinIndex(plane,localTimeBin);
+    if(gtb < 0) continue; 
+    Int_t layer = fTrSec[trackingSector]->GetLayerNumber(gtb);
+
+    index=ncl;
+    fTrSec[trackingSector]->GetLayer(layer)->InsertCluster(c,index);
+  }    
+  //  printf("\r\n");
+  //
+  //
+  /*
+  for (Int_t isector=0;isector<18;isector++){
+    for (Int_t ichamber=0;ichamber<5;ichamber++)      
+      if (fHoles[ichamber][isector]!=fGeom->IsHole(0,ichamber,17-isector)) 
+       printf("Problem \t%d\t%d\t%d\t%d\n",isector,ichamber,fHoles[ichamber][isector],
+            fGeom->IsHole(0,ichamber,17-isector));
+  }
+  */
+  return 0;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDtracker::UnloadClusters() 
+{ 
+  //
+  // Clears the arrays of clusters and tracks. Resets sectors and timebins 
+  //
+
+  Int_t i, nentr;
+
+  nentr = fClusters->GetEntriesFast();
+  for (i = 0; i < nentr; i++) delete fClusters->RemoveAt(i);
+  fNclusters = 0;
 
-        if (TMath::Abs(x[2]) > fMaxSeedC) continue;
+  nentr = fSeeds->GetEntriesFast();
+  for (i = 0; i < nentr; i++) delete fSeeds->RemoveAt(i);
 
-        x[3]=f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
+  nentr = fTracks->GetEntriesFast();
+  for (i = 0; i < nentr; i++) delete fTracks->RemoveAt(i);
 
-        if (TMath::Abs(x[2]*x1-x[3]) >= 0.99999) continue;
+  Int_t nsec = AliTRDgeometry::kNsect;
 
-        x[4]=f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
+  for (i = 0; i < nsec; i++) {    
+    for(Int_t pl = 0; pl < fTrSec[i]->GetNumberOfLayers(); pl++) {
+      fTrSec[i]->GetLayer(pl)->Clear();
+    }
+  }
 
-        if (TMath::Abs(x[4]) > fMaxSeedTan) continue;
+}
 
-        Double_t a=asin(x[3]);
-        Double_t zv=z1 - x[4]/x[2]*(a+asin(x[2]*x1-x[3]));
+//__________________________________________________________________________
+void AliTRDtracker::MakeSeeds(Int_t inner, Int_t outer, Int_t turn)
+{
+  // Creates track seeds using clusters in timeBins=i1,i2
 
-        if (TMath::Abs(zv)>fMaxSeedVertexZ) continue;    
+  if(turn > 2) {
+    cerr<<"MakeSeeds: turn "<<turn<<" exceeds the limit of 2"<<endl;
+    return;
+  }
 
+  Double_t x[5], c[15];
+  Int_t maxSec=AliTRDgeometry::kNsect;
+  
+  Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
+  Double_t shift=AliTRDgeometry::GetAlpha()/2.;
+  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
+  Double_t cs2=cos(2.*alpha), sn2=sin(2.*alpha);
+    
+      
+  Int_t i2 = fTrSec[0]->GetLayerNumber(inner);
+  Int_t i1 = fTrSec[0]->GetLayerNumber(outer);
+      
+  Double_t x1 =fTrSec[0]->GetX(i1);
+  Double_t xx2=fTrSec[0]->GetX(i2);
+      
+  for (Int_t ns=0; ns<maxSec; ns++) {
+    
+    Int_t nl2 = *(fTrSec[(ns-2+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
+    Int_t nl=(*fTrSec[(ns-1+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
+    Int_t nm=(*fTrSec[ns]->GetLayer(i2));
+    Int_t nu=(*fTrSec[(ns+1)%maxSec]->GetLayer(i2));
+    Int_t nu2=(*fTrSec[(ns+2)%maxSec]->GetLayer(i2));
+    
+    AliTRDpropagationLayer& r1=*(fTrSec[ns]->GetLayer(i1));
+    
+    for (Int_t is=0; is < r1; is++) {
+      Double_t y1=r1[is]->GetY(), z1=r1[is]->GetZ();
+      
+      for (Int_t js=0; js < nl2+nl+nm+nu+nu2; js++) {
+        
+        const AliTRDcluster *cl;
+        Double_t x2,   y2,   z2;
+        Double_t x3=0., y3=0.;   
+        
+        if (js<nl2) {
+          if(turn != 2) continue;
+          AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns-2+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
+          cl=r2[js];
+          y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
+          
+          x2= xx2*cs2+y2*sn2;
+          y2=-xx2*sn2+y2*cs2;
+        }
+        else if (js<nl2+nl) {
+          if(turn != 1) continue;
+          AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns-1+maxSec)%maxSec]->GetLayer(i2));
+          cl=r2[js-nl2];
+          y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
+          
+          x2= xx2*cs+y2*sn;
+          y2=-xx2*sn+y2*cs;
+        }                                
+        else if (js<nl2+nl+nm) {
+          if(turn != 1) continue;
+          AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[ns]->GetLayer(i2));
+          cl=r2[js-nl2-nl];
+          x2=xx2; y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
+        }
+        else if (js<nl2+nl+nm+nu) {
+          if(turn != 1) continue;
+          AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns+1)%maxSec]->GetLayer(i2));
+          cl=r2[js-nl2-nl-nm];
+          y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
+          
+          x2=xx2*cs-y2*sn;
+          y2=xx2*sn+y2*cs;
+        }              
+        else {
+          if(turn != 2) continue;
+          AliTRDpropagationLayer& r2=*(fTrSec[(ns+2)%maxSec]->GetLayer(i2));
+          cl=r2[js-nl2-nl-nm-nu];
+          y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
+          
+          x2=xx2*cs2-y2*sn2;
+          y2=xx2*sn2+y2*cs2;
+        }
+        
+        if(TMath::Abs(z1-z2) > fgkMaxSeedDeltaZ12) continue;
+        
+        Double_t zz=z1 - z1/x1*(x1-x2);
+        
+        if (TMath::Abs(zz-z2)>fgkMaxSeedDeltaZ) continue;
+        
+        Double_t d=(x2-x1)*(0.-y2)-(0.-x2)*(y2-y1);
+        if (d==0.) {cerr<<"TRD MakeSeeds: Straight seed !\n"; continue;}
+        
+        x[0]=y1;
+        x[1]=z1;
+        x[4]=f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
+        
+        if (TMath::Abs(x[4]) > fgkMaxSeedC) continue;      
+        
+        x[2]=f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
+        
+        if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= 0.99999) continue;
+        
+        x[3]=f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
+        
+        if (TMath::Abs(x[3]) > fgkMaxSeedTan) continue;
+        
+        Double_t a=asin(x[2]);
+        Double_t zv=z1 - x[3]/x[4]*(a+asin(x[4]*x1-x[2]));
+        
+        if (TMath::Abs(zv)>fgkMaxSeedVertexZ) continue;
+        
         Double_t sy1=r1[is]->GetSigmaY2(), sz1=r1[is]->GetSigmaZ2();
         Double_t sy2=cl->GetSigmaY2(),     sz2=cl->GetSigmaZ2();
-        Double_t sy3=fSeedErrorSY3, sy=fSeedErrorSY, sz=fSeedErrorSZ;
-
-        Double_t f20=(f1trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
-        Double_t f22=(f1trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
-        Double_t f24=(f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
-        Double_t f30=(f2trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[3])/sy;
-        Double_t f32=(f2trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[3])/sy;
-        Double_t f34=(f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[3])/sy;
-        Double_t f40=(f3trd(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[4])/sy;
-        Double_t f41=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[4])/sz;
-        Double_t f42=(f3trd(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[4])/sy;
-        Double_t f43=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[4])/sz;
+        Double_t sy3=fgkSeedErrorSY3, sy=fgkSeedErrorSY, sz=fgkSeedErrorSZ;  
+
+        // Tilt changes
+        Double_t h01 = GetTiltFactor(r1[is]);
+       Double_t xuFactor = 100.;
+       if(fNoTilt) { 
+         h01 = 0;
+         xuFactor = 1;
+       }
 
+        sy1=sy1+sz1*h01*h01;
+        Double_t syz=sz1*(-h01);
+        // end of tilt changes
+        
+        Double_t f40=(f1trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
+        Double_t f42=(f1trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
+        Double_t f43=(f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
+        Double_t f20=(f2trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
+        Double_t f22=(f2trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
+        Double_t f23=(f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
+        Double_t f30=(f3trd(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
+        Double_t f31=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
+        Double_t f32=(f3trd(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
+        Double_t f34=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;    
+
+        
         c[0]=sy1;
-        c[1]=0.;       c[2]=sz1;
-        c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f24*sy3*f24;
-        c[6]=f30*sy1;  c[7]=0.;       c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22+f34*sy3*f24;
-                                      c[9]=f30*sy1*f30+f32*sy2*f32+f34*sy3*f34;
-        c[10]=f40*sy1; c[11]=f41*sz1; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22;
-        c[13]=f40*sy1*f30+f42*sy2*f32;
-        c[14]=f40*sy1*f40+f41*sz1*f41+f42*sy2*f42+f43*sz2*f43;   
-
+        //        c[1]=0.;       c[2]=sz1;
+        c[1]=syz;       c[2]=sz1*xuFactor;
+        c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
+        c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
+                       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
+        c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
+        c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
+        c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;      
+        
         UInt_t index=r1.GetIndex(is);
-       
-        AliTRDtrack *track=new AliTRDtrack(r1[is],index,x,c,x1,ns*alpha+shift); 
-
-        Int_t rc=FindProlongation(*track,fTrSec,ns,i2,matched_index,hsame,hdiff);
+        
+        AliTRDtrack *track=new AliTRDtrack(r1[is],index,x,c,x1,ns*alpha+shift);
+
+        Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);     
+        
+        if ((rc < 1) ||
+            (track->GetNumberOfClusters() < 
+             (outer-inner)*fgkMinClustersInSeed)) delete track;
+        else {
+          fSeeds->AddLast(track); fNseeds++;
+//          cerr<<"\r found seed "<<fNseeds;
+        }
+      }
+    }
+  }
+}            
+//__________________________________________________________________________
+void AliTRDtracker::MakeSeedsMI(Int_t /*inner*/, Int_t /*outer*/)
+{
+  //
+  // Creates  seeds using clusters between  position inner plane  and outer plane 
+  //
 
-       //      if (match) hsame->Fill((Float_t) track->GetNclusters());
-       //      else hdiff->Fill((Float_t) track->GetNclusters());  
-       //      delete track;
-       //      continue;
+  const Double_t maxtheta = 2;
+  const Double_t maxphi   = 1.5;
+  Int_t maxSec=AliTRDgeometry::kNsect;
 
-        if ((rc < 0) || 
-            (track->GetNclusters() < (i1-i2)*fMinClustersInSeed)) delete track;
-        else { 
-         fSeeds->AddLast(track); fNseeds++; 
-         printf("\r found seed %d  ", fNseeds);
+  //  
+  // find the maximal and minimal layer for the planes
+  // fucking "object oriented" geometry - find the time bin range for different planes
+  //
+  Int_t layers[6][2];
+  for (Int_t i=0;i<6;i++){layers[i][0]=10000; layers[i][1]=0;}
+
+  for (Int_t ns=0;ns<maxSec;ns++){
+    for (Int_t ilayer=0;ilayer<fTrSec[ns]->GetNumberOfLayers();ilayer++){
+      AliTRDpropagationLayer& layer=*(fTrSec[ns]->GetLayer(ilayer));
+      if (layer==0) continue;
+      Int_t det   = layer[0]->GetDetector();    
+      Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
+      if (ilayer<layers[plane][0]) layers[plane][0] = ilayer;
+      if (ilayer>layers[plane][1]) layers[plane][1] = ilayer;
+    }
+  }
+  //
+      
+  Int_t ilayer1 = layers[5][1];  // time bin in mplification region
+  Int_t ilayer2 = layers[3][1];  //
+  Int_t ilayerM = layers[4][1];  //
+  //    
+  Double_t x1 = fTrSec[0]->GetX(ilayer1);
+  Double_t x2 = fTrSec[0]->GetX(ilayer2);
+  Double_t xm = fTrSec[0]->GetX(ilayerM);
+  Double_t dist = x2-x1;
+  //  Int_t indexes1[20];
+  //Int_t indexes2[20];
+  AliTRDcluster *clusters1[15],*clusters2[15],*clustersM[15];
+  //
+  //      
+  for (Int_t ns=0; ns<maxSec; ns++) {
+    AliTRDpropagationLayer& layer1=*(fTrSec[ns]->GetLayer(ilayer1));  //select propagation layers
+    AliTRDpropagationLayer& layer2=*(fTrSec[ns]->GetLayer(ilayer2));
+    //  
+    for (Int_t icl1=0;icl1<layer1;icl1++){
+      AliTRDcluster *cl1 = layer1[icl1];
+      if (!cl1) continue;
+      Double_t y1 = cl1->GetY();
+      Double_t z1 = cl1->GetZ();
+      //
+      for (Int_t icl2=0;icl2<layer2;icl2++){
+       AliTRDcluster *cl2 = layer2[icl2];
+       if (!cl2) continue;
+       Double_t y2 = cl2->GetY();
+       Double_t z2 = cl2->GetZ();      
+       Double_t tanphi   = (y2-y1)/dist; 
+       Double_t tantheta = (z2-z1)/dist; 
+       if (TMath::Abs(tanphi)>maxphi) continue;
+       if (TMath::Abs(tantheta)>maxtheta) continue;
+       //
+       clusters1[0] = cl1;
+       clusters2[0] = cl2;
+       Double_t road =  0.5+TMath::Abs(tanphi)*1;
+       Int_t ncl=0;
+       Double_t sum1=0, sumx1=0,sum2x1=0,sumxy1=0, sumy1=0;
+       Double_t sum2=0, sumx2=0,sum2x2=0,sumxy2=0, sumy2=0;
+       //
+       for (Int_t dlayer=1;dlayer<15;dlayer++){
+         clusters1[dlayer]=0;
+         clusters2[dlayer]=0;
+         AliTRDpropagationLayer& layer1C=*(fTrSec[ns]->GetLayer(ilayer1-dlayer));  //select propagation layers
+         AliTRDpropagationLayer& layer2C=*(fTrSec[ns]->GetLayer(ilayer2-dlayer));  //
+         Double_t yy1 = y1+(tanphi)  *(layer1C.GetX()-x1);
+         Double_t zz1 = z1+(tantheta)*(layer1C.GetX()-x1);
+         Double_t yy2 = y1+(tanphi)  *(layer2C.GetX()-x1);
+         Double_t zz2 = z1+(tantheta)*(layer2C.GetX()-x1);
+         Int_t index1 = layer1C.FindNearestCluster(yy1,zz1,road);
+         Int_t index2 = layer2C.FindNearestCluster(yy2,zz2,road);
+         if (index1>=0) {
+           clusters1[dlayer]= (AliTRDcluster*)GetCluster(index1);
+           ncl++;
+           sum1++;
+           Double_t dx = layer1C.GetX()-x1;
+           sumx1 +=dx;
+           sum2x1+=dx*dx;
+           sumxy1+=dx*clusters1[dlayer]->GetY();       
+           sumy1 +=clusters1[dlayer]->GetY();
+         }
+         if (index2>=0) {
+           clusters2[dlayer]= (AliTRDcluster*)GetCluster(index2);
+           ncl++;
+           sum2++;
+           Double_t dx = layer2C.GetX()-x2;
+           sumx2 +=dx;
+           sum2x2+=dx*dx;
+           sumxy2+=dx*clusters2[dlayer]->GetY();
+           sumy2 +=clusters2[dlayer]->GetY();
+         }
+       }
+       if (sum1<10) continue;
+       if (sum2<10) continue;
+       //
+       Double_t det1   = sum1*sum2x1-sumx1*sumx1;
+       Double_t angle1 = (sum1*sumxy1-sumx1*sumy1)/det1;
+       Double_t pos1   = (sum2x1*sumy1-sumx1*sumxy1)/det1;  // at x1 
+       //
+       Double_t det2   = sum2*sum2x2-sumx2*sumx2;
+       Double_t angle2 = (sum2*sumxy2-sumx2*sumy2)/det2;
+       Double_t pos2   = (sum2x2*sumy2-sumx2*sumxy2)/det2;  // at x2
+       //
+       //
+
+       Double_t sumM=0, sumxM=0,sum2xM=0,sumxyM=0, sumyM=0;
+       //
+       for (Int_t dlayer=1;dlayer<15;dlayer++){
+         clustersM[dlayer]=0;
+         AliTRDpropagationLayer& layerM=*(fTrSec[ns]->GetLayer(ilayerM-dlayer));  //select propagation layers
+         Double_t yyM = y1+(tanphi)  *(layerM.GetX()-x1);
+         Double_t zzM = z1+(tantheta)*(layerM.GetX()-x1);
+         Int_t indexM = layerM.FindNearestCluster(yyM,zzM,road);
+         if (indexM>=0) {
+           clustersM[dlayer]= (AliTRDcluster*)GetCluster(indexM);
+           ncl++;
+           sumM++;
+           Double_t dx = layerM.GetX()-xm;
+           sumxM +=dx;
+           sum2xM+=dx*dx;
+           sumxyM+=dx*clustersM[dlayer]->GetY();       
+           sumyM +=clustersM[dlayer]->GetY();
+         }
+       }
+       Double_t detM   = sumM*sum2xM-sumxM*sumxM;
+       Double_t posM=0, angleM=0;
+       if (TMath::Abs(detM)>0.0000001){
+         angleM = (sumM*sumxyM-sumxM*sumyM)/detM;
+         posM   = (sum2xM*sumyM-sumxM*sumxyM)/detM;  // at xm
+       }
+       //
+
+       if (ncl>15){
+         TTreeSRedirector& cstream = *fDebugStreamer;
+         cstream<<"Seeds"<<
+           "Ncl="<<ncl<<
+           "SumM="<<sumM<<
+           "x1="<<x1<<
+           "x2="<<x2<<
+           "Cl1.="<<cl1<<
+           "Cl2.="<<cl2<<
+           "Phi="<<tanphi<<
+           "Theta="<<tantheta<<
+           "Pos1="<<pos1<<
+           "Pos2="<<pos2<<
+           "PosM="<<posM<<
+           "Angle1="<<angle1<<
+           "Angle2="<<angle2<<
+           "AngleM="<<angleM<<
+           "\n";
        }
       }
     }
   }
-
-  fSeeds->Sort();
-}          
+}            
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::ReadClusters(TObjArray *array, const Char_t *filename) 
+Int_t AliTRDtracker::ReadClusters(TObjArray *array, TTree *ClusterTree) const
 {
   //
   // Reads AliTRDclusters (option >= 0) or AliTRDrecPoints (option < 0) 
   // from the file. The names of the cluster tree and branches 
   // should match the ones used in AliTRDclusterizer::WriteClusters()
   //
-
-  TDirectory *savedir=gDirectory; 
-
-  TFile *file = TFile::Open(filename);
-  if (!file->IsOpen()) {printf("Can't open file %s !\n",filename); return;} 
-
-  TTree *ClusterTree = (TTree*)file->Get("ClusterTree");
-
-  TObjArray *ClusterArray = new TObjArray(400); 
-  ClusterTree->GetBranch("TRDcluster")->SetAddress(&ClusterArray); 
+  Int_t nsize = Int_t(ClusterTree->GetTotBytes()/(sizeof(AliTRDcluster))); 
+  TObjArray *clusterArray = new TObjArray(nsize+1000); 
+  
+  TBranch *branch=ClusterTree->GetBranch("TRDcluster");
+  if (!branch) {
+    Error("ReadClusters","Can't get the branch !");
+    return 1;
+  }
+  branch->SetAddress(&clusterArray); 
   
   Int_t nEntries = (Int_t) ClusterTree->GetEntries();
-  printf("found %d entries in %s.\n",nEntries,ClusterTree->GetName());
-
+  //  printf("found %d entries in %s.\n",nEntries,ClusterTree->GetName());
+  
   // Loop through all entries in the tree
-  Int_t nbytes;
+  Int_t nbytes = 0;
   AliTRDcluster *c = 0;
-
+  //  printf("\n");
   for (Int_t iEntry = 0; iEntry < nEntries; iEntry++) {    
     
     // Import the tree
     nbytes += ClusterTree->GetEvent(iEntry);  
-
+    
     // Get the number of points in the detector
-    Int_t nCluster = ClusterArray->GetEntriesFast();  
-    printf("Read %d clusters from entry %d \n", nCluster, iEntry);
-
+    Int_t nCluster = clusterArray->GetEntriesFast();  
+//    printf("\r Read %d clusters from entry %d", nCluster, iEntry);
+    
     // Loop through all TRD digits
     for (Int_t iCluster = 0; iCluster < nCluster; iCluster++) { 
-      c = (AliTRDcluster*)ClusterArray->UncheckedAt(iCluster);
-      AliTRDcluster *co = new AliTRDcluster(*c);
+      c = (AliTRDcluster*)clusterArray->UncheckedAt(iCluster);
+//       if (c->GetNPads()>3&&(iCluster%3>0)) {
+//     delete clusterArray->RemoveAt(iCluster);
+//     continue;
+//       }
+      //      AliTRDcluster *co = new AliTRDcluster(*c);  //remove unnecesary coping - + clusters are together in memory
+      AliTRDcluster *co = c;
       co->SetSigmaY2(c->GetSigmaY2() * fSY2corr);
+      Int_t ltb = co->GetLocalTimeBin();
+      if(ltb == 19) co->SetSigmaZ2(c->GetSigmaZ2());
+      else if(fNoTilt) co->SetSigmaZ2(c->GetSigmaZ2() * fSZ2corr);
       array->AddLast(co);
-      delete ClusterArray->RemoveAt(iCluster); 
+      //      delete clusterArray->RemoveAt(iCluster); 
+      clusterArray->RemoveAt(iCluster); 
     }
   }
+//   cout<<"Allocated"<<nsize<<"\tLoaded"<<array->GetEntriesFast()<<"\n";
 
-  file->Close();                   
-  delete ClusterArray;
-  savedir->cd(); 
-  
+  delete clusterArray;
+
+  return 0;
 }
 
-//___________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::FindTracks(AliTRDtrackingSector* fTrSec, TH1F *hs, TH1F *hd) 
+//__________________________________________________________________
+void AliTRDtracker::CookLabel(AliKalmanTrack* pt, Float_t wrong) const 
 {
   //
-  // Finds tracks in TRD
+  // This cooks a label. Mmmmh, smells good...
   //
 
-  TH1F *hsame = hs;
-  TH1F *hdiff = hd;   
+  Int_t label=123456789, index, i, j;
+  Int_t ncl=pt->GetNumberOfClusters();
+  const Int_t kRange = fTrSec[0]->GetOuterTimeBin()+1;
 
-  Int_t num_of_time_bins = fTrSec[0].GetNtimeBins(); 
-  Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
+  Bool_t labelAdded;
 
-  Int_t nSeedClusters;
-  for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
-    cerr<<"FindTracks: seed "<<i+1<<" out of "<<nseed<<endl;
+  //  Int_t s[kRange][2];
+  Int_t **s = new Int_t* [kRange];
+  for (i=0; i<kRange; i++) {
+    s[i] = new Int_t[2];
+  }
+  for (i=0; i<kRange; i++) {
+    s[i][0]=-1;
+    s[i][1]=0;
+  }
+
+  Int_t t0,t1,t2;
+  for (i=0; i<ncl; i++) {
+    index=pt->GetClusterIndex(i);
+    AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
+    t0=c->GetLabel(0);
+    t1=c->GetLabel(1);
+    t2=c->GetLabel(2);
+  }
+
+  for (i=0; i<ncl; i++) {
+    index=pt->GetClusterIndex(i);
+    AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
+    for (Int_t k=0; k<3; k++) { 
+      label=c->GetLabel(k);
+      labelAdded=kFALSE; j=0;
+      if (label >= 0) {
+        while ( (!labelAdded) && ( j < kRange ) ) {
+          if (s[j][0]==label || s[j][1]==0) {
+            s[j][0]=label; 
+            s[j][1]=s[j][1]+1; 
+            labelAdded=kTRUE;
+          }
+          j++;
+        }
+      }
+    }
+  }
 
-    AliTRDtrack& t=*((AliTRDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i));
+  Int_t max=0;
+  label = -123456789;
 
-    nSeedClusters = t.GetNclusters();
-    Double_t alpha=t.GetAlpha();
+  for (i=0; i<kRange; i++) {
+    if (s[i][1]>max) {
+      max=s[i][1]; label=s[i][0];
+    }
+  }
 
-    if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
-    if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
-    Int_t ns=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;
+  for (i=0; i<kRange; i++) {
+    delete []s[i];
+  }        
 
-    Int_t label = GetTrackLabel(t);
+  delete []s;
 
-    if (FindProlongation(t,fTrSec,ns,0,label,hsame,hdiff)) {
-      cerr<<"No of clusters in the track = "<<t.GetNclusters()<<endl; 
-      if (t.GetNclusters() >= Int_t(fMinClustersInTrack*num_of_time_bins)) {
-       Int_t label = GetTrackLabel(t);
-       t.SetLabel(label);
-       t.CookdEdx();
-       UseClusters(t);
+  if ((1.- Float_t(max)/ncl) > wrong) label=-label;   
 
-        AliTRDtrack *pt = new AliTRDtrack(t);
-        fTracks->AddLast(pt); fNtracks++;     
+  pt->SetLabel(label); 
 
-       cerr<<"found track "<<fNtracks<<endl;
-      }                         
-    }     
-    delete fSeeds->RemoveAt(i);  
-    fNseeds--;
-  }            
 }
 
+
 //__________________________________________________________________
-void AliTRDtracker::UseClusters(AliTRDtrack t) {
-  Int_t ncl=t.GetNclusters();
-  for (Int_t i=0; i<ncl; i++) {
-    Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
+void AliTRDtracker::UseClusters(const AliKalmanTrack* t, Int_t from) const 
+{
+  //
+  // Use clusters, but don't abuse them!
+  //
+
+  Int_t ncl=t->GetNumberOfClusters();
+  for (Int_t i=from; i<ncl; i++) {
+    Int_t index = t->GetClusterIndex(i);
     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
     c->Use();
   }
 }
 
-//__________________________________________________________________
-Int_t AliTRDtracker::GetTrackLabel(AliTRDtrack t) {
 
-  Int_t label=123456789, index, i, j;
-  Int_t ncl=t.GetNclusters();
-  const Int_t range = AliTRDgeometry::kNplan * fGeom->GetTimeMax();
-  Bool_t label_added;
+//_____________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaY2(Double_t , Double_t , Double_t ) const
+{
+  // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Y 
 
-  //  Int_t s[range][2];
-  Int_t **s = new Int_t* [range];
-  for (i=0; i<range; i++) {
-    s[i] = new Int_t[2];
+  Double_t s = 0.08 * 0.08;    
+  return s;
+}
+
+//_____________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaZ2(Double_t , Double_t ) const
+{
+  // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Z 
+
+  Double_t s = 9 * 9 /12.;  
+  return s;
+}                  
+
+//_____________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtracker::GetX(Int_t sector, Int_t plane, Int_t localTB) const 
+{
+  //
+  // Returns radial position which corresponds to time bin <localTB>
+  // in tracking sector <sector> and plane <plane>
+  //
+
+  Int_t index = fTrSec[sector]->CookTimeBinIndex(plane, localTB); 
+  Int_t pl = fTrSec[sector]->GetLayerNumber(index);
+  return fTrSec[sector]->GetLayer(pl)->GetX();
+
+}
+
+
+//_______________________________________________________
+AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::AliTRDpropagationLayer(Double_t x, 
+               Double_t dx, Double_t rho, Double_t radLength, Int_t tbIndex)
+{ 
+  //
+  // AliTRDpropagationLayer constructor
+  //
+
+  fN = 0; fX = x; fdX = dx; fRho = rho; fX0 = radLength;
+  fClusters = NULL; fIndex = NULL; fTimeBinIndex = tbIndex;
+
+
+  for(Int_t i=0; i < (Int_t) kZones; i++) {
+    fZc[i]=0; fZmax[i] = 0;
   }
-  for (i=0; i<range; i++) {
-    s[i][0]=-1;
-    s[i][1]=0;
+
+  fYmax = 0;
+
+  if(fTimeBinIndex >= 0) { 
+    fClusters = new AliTRDcluster*[kMaxClusterPerTimeBin];
+    fIndex = new UInt_t[kMaxClusterPerTimeBin];
   }
 
-  Int_t t0,t1,t2;
-  for (i=0; i<ncl; i++) {
-    index=t.GetClusterIndex(i);
-    AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
-    t0=c->GetTrackIndex(0);
-    t1=c->GetTrackIndex(1);
-    t2=c->GetTrackIndex(2);
+  for (Int_t i=0;i<5;i++) fIsHole[i] = kFALSE;
+  fHole = kFALSE;
+  fHoleZc = 0;
+  fHoleZmax = 0;
+  fHoleYc = 0;
+  fHoleYmax = 0;
+  fHoleRho = 0;
+  fHoleX0 = 0;
+
+}
+
+//_______________________________________________________
+void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::SetHole(
+          Double_t Zmax, Double_t Ymax, Double_t rho, 
+          Double_t radLength, Double_t Yc, Double_t Zc) 
+{
+  //
+  // Sets hole in the layer 
+  //
+  fHole = kTRUE;
+  fHoleZc = Zc;
+  fHoleZmax = Zmax;
+  fHoleYc = Yc;
+  fHoleYmax = Ymax;
+  fHoleRho = rho;
+  fHoleX0 = radLength;
+}
+  
+
+//_______________________________________________________
+AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::AliTRDtrackingSector(AliTRDgeometry* geo, Int_t gs, AliTRDparameter* par)
+{
+  //
+  // AliTRDtrackingSector Constructor
+  //
+  AliTRDpadPlane *padPlane = 0;
+
+  fGeom = geo;
+  fPar = par;
+  fGeomSector = gs;
+  fTzeroShift = 0.13;
+  fN = 0;
+  //
+  // get holes description from geometry
+  Bool_t holes[AliTRDgeometry::kNcham];
+  //printf("sector\t%d\t",gs);
+  for (Int_t icham=0; icham<AliTRDgeometry::kNcham;icham++){
+    holes[icham] = fGeom->IsHole(0,icham,gs);
+    //printf("%d",holes[icham]);
+  } 
+  //printf("\n");
+  
+  for(UInt_t i=0; i < kMaxTimeBinIndex; i++) fTimeBinIndex[i] = -1;
+
+
+  AliTRDpropagationLayer* ppl;
+
+  Double_t x, xin, xout, dx, rho, radLength;
+  Int_t    steps;
+
+  // set time bins in the gas of the TPC
+
+  xin = 246.055; xout = 254.055; steps = 20; dx = (xout-xin)/steps;
+  rho = 0.9e-3;  radLength = 28.94;
+
+  for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+    x = xin + i*dx + dx/2;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+    InsertLayer(ppl);
   }
 
-  for (i=0; i<ncl; i++) {
-    index=t.GetClusterIndex(i);
-    AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
-    for (Int_t k=0; k<3; k++) { 
-      label=c->GetTrackIndex(k);
-      label_added=kFALSE; j=0;
-      if (label >= 0) {
-       while ( (!label_added) && ( j < range ) ) {
-         if (s[j][0]==label || s[j][1]==0) {
-           s[j][0]=label; 
-           s[j][1]=s[j][1]+1; 
-           label_added=kTRUE;
-         }
-         j++;
-       }
-      }
+  // set time bins in the outer field cage vessel
+
+  dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 0.02; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 2.; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45*0.02; radLength = 41.28; // Nomex
+  steps = 5; dx = (xout - xin)/steps;
+  for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+    x = xin + i*dx + dx/2;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+    InsertLayer(ppl);
+  }
+
+  dx = 0.02; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+
+  // set time bins in CO2
+
+  xin = xout; xout = 275.0; 
+  steps = 50; dx = (xout - xin)/steps;
+  rho = 1.977e-3;  radLength = 36.2;
+  
+  for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+    x = xin + i*dx + dx/2;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+    InsertLayer(ppl);
+  }
+
+  // set time bins in the outer containment vessel
+
+  dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 2.7; radLength = 24.01; // Al
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 0.06; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 3.; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45*0.02; radLength = 41.28; // Nomex
+  steps = 10; dx = (xout - xin)/steps;
+  for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+    x = xin + i*dx + dx/2;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+    InsertLayer(ppl);
+  }
+
+  dx = 0.06; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.45; radLength = 44.86; // prepreg
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 1.71; radLength = 44.77; // Tedlar
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+  
+  dx = 50e-4; xin = xout; xout = xin + dx; rho = 2.7; radLength = 24.01; // Al
+  ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+  InsertLayer(ppl);
+
+  Double_t xtrd = (Double_t) fGeom->Rmin();  
+
+  // add layers between TPC and TRD (Air temporarily)
+  xin = xout; xout = xtrd;
+  steps = 50; dx = (xout - xin)/steps;
+  rho = 1.2e-3;  radLength = 36.66;
+  
+  for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+    x = xin + i*dx + dx/2;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+    InsertLayer(ppl);
+  }
+
+
+  //  Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
+
+  // add layers for each of the planes
+
+  Double_t dxRo = (Double_t) fGeom->CroHght();    // Rohacell 
+  Double_t dxSpace = (Double_t) fGeom->Cspace();  // Spacing between planes
+  Double_t dxAmp = (Double_t) fGeom->CamHght();   // Amplification region
+  Double_t dxDrift = (Double_t) fGeom->CdrHght(); // Drift region  
+  Double_t dxRad = (Double_t) fGeom->CraHght();   // Radiator
+  Double_t dxTEC = dxRad + dxDrift + dxAmp + dxRo; 
+  Double_t dxPlane = dxTEC + dxSpace; 
+
+  Int_t tb, tbIndex;
+  const Int_t  kNchambers = AliTRDgeometry::Ncham();
+  Double_t  ymax = 0;
+  //, holeYmax = 0;
+  Double_t ymaxsensitive=0;
+  Double_t *zc = new Double_t[kNchambers];
+  Double_t *zmax = new Double_t[kNchambers];
+  Double_t *zmaxsensitive = new Double_t[kNchambers];  
+  //  Double_t  holeZmax = 1000.;   // the whole sector is missing
+
+  for(Int_t plane = 0; plane < AliTRDgeometry::Nplan(); plane++) {
+    //
+    // Radiator 
+    xin = xtrd + plane * dxPlane; xout = xin + dxRad;
+    steps = 12; dx = (xout - xin)/steps; rho = 0.074; radLength = 40.6; 
+    for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+      x = xin + i*dx + dx/2;
+      ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);      
+      InsertLayer(ppl);
+    }
+
+    ymax          = fGeom->GetChamberWidth(plane)/2.;
+    // Modidified for new pad plane class, 22.04.05 (C.B.)
+    // ymaxsensitive = (fPar->GetColPadSize(plane)*fPar->GetColMax(plane)-4)/2.;
+    padPlane = fPar->GetPadPlane(plane,0);
+    ymaxsensitive = (padPlane->GetColSize(1)*padPlane->GetNcols()-4)/2.;
+
+    //    ymaxsensitive = (fPar->GetColPadSize(plane)*fPar->GetColMax(plane)-4)/2.;
+    
+    for(Int_t ch = 0; ch < kNchambers; ch++) {
+      zmax[ch] = fGeom->GetChamberLength(plane,ch)/2;
+      //
+      // Modidified for new pad plane class, 22.04.05 (C.B.)
+      //Float_t pad = fPar->GetRowPadSize(plane,ch,0);
+      Float_t pad = padPlane->GetRowSize(1);
+      //Float_t pad = fPar->GetRowPadSize(plane,ch,0);
+      Float_t row0 = fPar->GetRow0(plane,ch,0);
+      Int_t nPads = fPar->GetRowMax(plane,ch,0);
+      zmaxsensitive[ch] = Float_t(nPads)*pad/2.;      
+      //      zc[ch] = (pad * nPads)/2 + row0 - pad/2;
+      //      zc[ch] = (pad * nPads)/2 + row0;
+      zc[ch] = -(pad * nPads)/2 + row0;
+      //zc[ch] = row0+zmax[ch]-AliTRDgeometry::RpadW();
+
+    }
+
+    dx  = fgkDriftCorrection*fPar->GetDriftVelocity()
+        / fPar->GetSamplingFrequency();
+    rho = 0.00295 * 0.85; radLength = 11.0;  
+
+    Double_t x0 = (Double_t) fPar->GetTime0(plane);
+    Double_t xbottom = x0 - dxDrift;
+    Double_t xtop = x0 + dxAmp;
+    //
+    // Amplification region
+    steps = (Int_t) (dxAmp/dx);
+
+    for(tb = 0; tb < steps; tb++) {
+      x = x0 + tb * dx + dx/2+ fgkOffsetX;
+      tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, -tb-1);
+      ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
+      ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
+      ppl->SetZ(zc, zmax, zmaxsensitive);
+      ppl->SetHoles(holes);
+      InsertLayer(ppl);
+    }
+    tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, -steps);
+    x = (x + dx/2 + xtop)/2;
+    dx = 2*(xtop-x);
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
+    ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
+    ppl->SetZ(zc, zmax,zmaxsensitive);
+    ppl->SetHoles(holes);
+    InsertLayer(ppl);
+
+    // Drift region
+
+    dx = fgkDriftCorrection*fPar->GetDriftVelocity()
+       / fPar->GetSamplingFrequency();
+    steps = (Int_t) (dxDrift/dx);
+
+    for(tb = 0; tb < steps; tb++) {
+      x = x0 - tb * dx - dx/2 + fgkOffsetX;                      //temporary fix - fix it the parameters
+      tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, tb);
+
+      ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
+      ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
+      ppl->SetZ(zc, zmax, zmaxsensitive);
+      ppl->SetHoles(holes);
+      InsertLayer(ppl);
+    }
+    tbIndex = CookTimeBinIndex(plane, steps);
+    x = (x - dx/2 + xbottom)/2;
+    dx = 2*(x-xbottom);
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,tbIndex);
+    ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
+    ppl->SetZ(zc, zmax, zmaxsensitive);
+    ppl->SetHoles(holes);    
+    InsertLayer(ppl);
+
+    // Pad Plane
+    xin = xtop; dx = 0.025; xout = xin + dx; rho = 1.7; radLength = 33.0;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(xin+dx/2,dx,rho,radLength,-1);
+    ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
+    ppl->SetZ(zc, zmax,zmax);
+    ppl->SetHoles(holes);        
+    InsertLayer(ppl);
+
+    // Rohacell
+    xin = xout; xout = xtrd + (plane + 1) * dxPlane - dxSpace;
+    steps = 5; dx = (xout - xin)/steps; rho = 0.074; radLength = 40.6; 
+    for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+      x = xin + i*dx + dx/2;
+      ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+      ppl->SetYmax(ymax,ymaxsensitive);
+      ppl->SetZ(zc, zmax,zmax);
+      ppl->SetHoles(holes);
+      InsertLayer(ppl);
+    }
+
+    // Space between the chambers, air
+    xin = xout; xout = xtrd + (plane + 1) * dxPlane;
+    steps = 5; dx = (xout - xin)/steps; rho = 1.29e-3; radLength = 36.66; 
+    for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+      x = xin + i*dx + dx/2;
+      ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+      InsertLayer(ppl);
     }
+  }    
+
+  // Space between the TRD and RICH
+  Double_t xRICH = 500.;
+  xin = xout; xout = xRICH;
+  steps = 200; dx = (xout - xin)/steps; rho = 1.29e-3; radLength = 36.66; 
+  for(Int_t i=0; i<steps; i++) {
+    x = xin + i*dx + dx/2;
+    ppl = new AliTRDpropagationLayer(x,dx,rho,radLength,-1);
+    InsertLayer(ppl);
   }
 
-  Int_t max=0;
-  label = -123456789;
+  MapTimeBinLayers();
+  delete [] zc;
+  delete [] zmax;
+  delete [] zmaxsensitive;
 
-  for (i=0; i<range; i++) {
-    if (s[i][1]>max) {
-      max=s[i][1]; label=s[i][0];
+}
+
+//______________________________________________________
+
+Int_t  AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::CookTimeBinIndex(Int_t plane, Int_t localTB) const
+{
+  //
+  // depending on the digitization parameters calculates "global"
+  // time bin index for timebin <localTB> in plane <plane>
+  //
+
+  Double_t dxAmp = (Double_t) fGeom->CamHght();   // Amplification region
+  Double_t dxDrift = (Double_t) fGeom->CdrHght(); // Drift region  
+  
+  Double_t dx = fgkDriftCorrection*(Double_t) fPar->GetDriftVelocity()
+                         / fPar->GetSamplingFrequency();
+
+  Int_t tbAmp = fPar->GetTimeBefore();
+  Int_t maxAmp = (Int_t) ((dxAmp+0.000001)/dx);
+  if(kTRUE) maxAmp = 0;   // intentional until we change parameter class 
+  Int_t tbDrift = fPar->GetTimeMax();
+  Int_t maxDrift = (Int_t) ((dxDrift+0.000001)/dx);
+
+  Int_t tbPerPlane = TMath::Min(tbAmp,maxAmp) + TMath::Min(tbDrift,maxDrift);
+
+  Int_t gtb = (plane+1) * tbPerPlane - localTB - 1 - TMath::Min(tbAmp,maxAmp);
+
+  if((localTB < 0) && 
+     (TMath::Abs(localTB) > TMath::Min(tbAmp,maxAmp))) return -1;
+  if(localTB >= TMath::Min(tbDrift,maxDrift)) return -1;
+
+  return gtb;
+
+
+}
+
+//______________________________________________________
+
+void AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::MapTimeBinLayers() 
+{
+  //
+  // For all sensitive time bins sets corresponding layer index
+  // in the array fTimeBins 
+  //
+
+  Int_t index;
+
+  for(Int_t i = 0; i < fN; i++) {
+    index = fLayers[i]->GetTimeBinIndex();
+    
+    //    printf("gtb %d -> pl %d -> x %f \n", index, i, fLayers[i]->GetX());
+
+    if(index < 0) continue;
+    if(index >= (Int_t) kMaxTimeBinIndex) {
+      printf("*** AliTRDtracker::MapTimeBinLayers: \n");
+      printf("    index %d exceeds allowed maximum of %d!\n",
+             index, kMaxTimeBinIndex-1);
+      continue;
     }
+    fTimeBinIndex[index] = i;
+  }
+
+  Double_t x1, dx1, x2, dx2, gap;
+
+  for(Int_t i = 0; i < fN-1; i++) {
+    x1 = fLayers[i]->GetX();
+    dx1 = fLayers[i]->GetdX();
+    x2 = fLayers[i+1]->GetX();
+    dx2 = fLayers[i+1]->GetdX();
+    gap = (x2 - dx2/2) - (x1 + dx1/2);
+//     if(gap < -0.01) {
+//       printf("*** warning: layers %d and %d are overlayed:\n",i,i+1);
+//       printf("             %f + %f + %f > %f\n", x1, dx1/2, dx2/2, x2);
+//     }
+//     if(gap > 0.01) { 
+//       printf("*** warning: layers %d and %d have a large gap:\n",i,i+1);
+//       printf("             (%f - %f) - (%f + %f) = %f\n", 
+//              x2, dx2/2, x1, dx1, gap);
+//     }
   }
-  delete []s;
-  if(max > ncl*fLabelFraction) return label;
-  else return -1;
 }
+  
 
-//___________________________________________________________________
+//______________________________________________________
 
-Int_t AliTRDtracker::WriteTracks(const Char_t *filename) {
 
-  TDirectory *savedir=gDirectory;   
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetLayerNumber(Double_t x) const
+{
+  // 
+  // Returns the number of time bin which in radial position is closest to <x>
+  //
 
-  //TFile *out=TFile::Open(filename,"RECREATE");
-  TFile *out = (TFile*) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
-  if (!out) {
-    printf("AliTRDtracker::Open -- ");
-    printf("Open the ALIROOT-file %s.\n",filename);
-    out = new TFile(filename,"RECREATE");
+  if(x >= fLayers[fN-1]->GetX()) return fN-1; 
+  if(x <= fLayers[0]->GetX()) return 0; 
+
+  Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
+  for (; b<e; m=(b+e)/2) {
+    if (x > fLayers[m]->GetX()) b=m+1;
+    else e=m;
   }
-  else {
-    printf("AliTRDtracker::Open -- ");
-    printf("%s is already open.\n",filename);
+  if(TMath::Abs(x - fLayers[m]->GetX()) > 
+     TMath::Abs(x - fLayers[m+1]->GetX())) return m+1;
+  else return m;
+
+}
+
+//______________________________________________________
+
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetInnerTimeBin() const 
+{
+  // 
+  // Returns number of the innermost SENSITIVE propagation layer
+  //
+
+  return GetLayerNumber(0);
+}
+
+//______________________________________________________
+
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetOuterTimeBin() const 
+{
+  // 
+  // Returns number of the outermost SENSITIVE time bin
+  //
+
+  return GetLayerNumber(GetNumberOfTimeBins() - 1);
+}
+
+//______________________________________________________
+
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::GetNumberOfTimeBins() const 
+{
+  // 
+  // Returns number of SENSITIVE time bins
+  //
+
+  Int_t tb, layer;
+  for(tb = kMaxTimeBinIndex-1; tb >=0; tb--) {
+    layer = GetLayerNumber(tb);
+    if(layer>=0) break;
   }
+  return tb+1;
+}
 
-  TTree tracktree("TreeT","Tree with TRD tracks");
+//______________________________________________________
 
-  AliTRDtrack *iotrack=0;
-  tracktree.Branch("tracks","AliTRDtrack",&iotrack,32000,0);  
+void AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::InsertLayer(AliTRDpropagationLayer* pl)
+{ 
+  //
+  // Insert layer <pl> in fLayers array.
+  // Layers are sorted according to X coordinate.
 
-  Int_t ntracks=fTracks->GetEntriesFast();
+  if ( fN == ((Int_t) kMaxLayersPerSector)) {
+    printf("AliTRDtrackingSector::InsertLayer(): Too many layers !\n");
+    return;
+  }
+  if (fN==0) {fLayers[fN++] = pl; return;}
+  Int_t i=Find(pl->GetX());
 
-  for (Int_t i=0; i<ntracks; i++) {
-    AliTRDtrack *pt=(AliTRDtrack*)fTracks->UncheckedAt(i);
-    iotrack=pt;
-    tracktree.Fill(); 
-    cerr<<"WriteTracks: put track "<<i<<" in the tree"<<endl;
+  memmove(fLayers+i+1 ,fLayers+i,(fN-i)*sizeof(AliTRDpropagationLayer*));
+  fLayers[i]=pl; fN++;
+
+}              
+
+//______________________________________________________
+
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDtrackingSector::Find(Double_t x) const 
+{
+  //
+  // Returns index of the propagation layer nearest to X 
+  //
+
+  if (x <= fLayers[0]->GetX()) return 0;
+  if (x > fLayers[fN-1]->GetX()) return fN;
+  Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
+  for (; b<e; m=(b+e)/2) {
+    if (x > fLayers[m]->GetX()) b=m+1;
+    else e=m;
   }
+  return m;
+}             
 
-  tracktree.Write(); 
-  out->Close(); 
 
-  savedir->cd();  
 
-  cerr<<"WriteTracks: done"<<endl;
-  return 1;
+
+
+//______________________________________________________
+void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::SetZ(Double_t* center, Double_t *w, Double_t *wsensitive )
+{
+  //
+  // set centers and the width of sectors
+  for (Int_t icham=0;icham< AliTRDgeometry::kNcham;icham++){
+    fZc[icham] = center[icham];  
+    fZmax[icham] = w[icham];
+    fZmaxSensitive[icham] = wsensitive[icham];
+    //   printf("chamber\t%d\tzc\t%f\tzmax\t%f\tzsens\t%f\n",icham,fZc[icham],fZmax[icham],fZmaxSensitive[icham]);
+  }  
+}
+//______________________________________________________
+
+void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::SetHoles(Bool_t *holes)
+{
+  //
+  // set centers and the width of sectors
+  fHole = kFALSE;
+  for (Int_t icham=0;icham< AliTRDgeometry::kNcham;icham++){
+    fIsHole[icham] = holes[icham]; 
+    if (holes[icham]) fHole = kTRUE;
+  }  
+}
+
+
+
+Bool_t AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::GetPropagationParameters(
+        Double_t y, Double_t z, Double_t &dx, Double_t &rho, Double_t &radLength, 
+        Bool_t &lookForCluster) const
+{
+  //
+  // Returns radial step <dx>, density <rho>, rad. length <radLength>,
+  // and sensitivity <lookForCluster> in point <y,z>  
+  //
+
+  Double_t alpha =  AliTRDgeometry::GetAlpha(); 
+  Double_t ymax  =  fX*TMath::Tan(0.5*alpha);
+
+
+  dx  = fdX;
+  rho = fRho;
+  radLength  = fX0;
+  lookForCluster = kFALSE;
+  Bool_t cross =kFALSE;
+  //
+  //
+  if ( (ymax-TMath::Abs(y))<3.){   //cross material
+    rho*=40.;
+    radLength*=40.;
+    cross=kTRUE;
+  }
+  //
+  // check dead regions in sensitive volume 
+    //
+  Int_t zone=-1;
+  for(Int_t ch = 0; ch < (Int_t) kZones; ch++) {
+    if (TMath::Abs(z - fZc[ch]) > fZmax[ch]) continue;  //not in given zone
+    //
+    if  (TMath::Abs(z - fZc[ch]) < fZmaxSensitive[ch]){ 
+      if (fTimeBinIndex>=0) lookForCluster = !(fIsHole[zone]);
+      if(TMath::Abs(y) > fYmaxSensitive){  
+       lookForCluster = kFALSE;        
+      }
+      if (fIsHole[zone]) {
+       //if hole
+       rho = 1.29e-3;
+       radLength = 36.66;
+      }
+    }else{
+      cross = kTRUE; rho = 2.7; radLength = 24.01;  //aluminium in between
+    }        
+  }
+  //
+  if (fTimeBinIndex>=0) return cross;
+  //
+  //
+  // check hole
+  if (fHole==kFALSE) return cross;
+  //
+  for(Int_t ch = 0; ch < (Int_t) kZones; ch++) {
+    if  (TMath::Abs(z - fZc[ch]) < fZmax[ch]){ 
+      if (fIsHole[ch]) {
+       //if hole
+       rho = 1.29e-3;
+       radLength = 36.66;
+      }    
+    }
+  }
+  return cross;
+}
+
+Int_t  AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::GetZone( Double_t z) const
+{
+  //
+  //
+  if (fTimeBinIndex < 0) return -20;  //unknown 
+  Int_t zone=-10;   // dead zone
+  for(Int_t ch = 0; ch < (Int_t) kZones; ch++) {
+    if(TMath::Abs(z - fZc[ch]) < fZmax[ch]) 
+      zone = ch;
+  }
+  return zone;
+}
+
+
+//______________________________________________________
+
+void AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::InsertCluster(AliTRDcluster* c, 
+                                                          UInt_t index) {
+
+// Insert cluster in cluster array.
+// Clusters are sorted according to Y coordinate.  
+
+  if(fTimeBinIndex < 0) { 
+    printf("*** attempt to insert cluster into non-sensitive time bin!\n");
+    return;
+  }
+
+  if (fN== (Int_t) kMaxClusterPerTimeBin) {
+    printf("AliTRDpropagationLayer::InsertCluster(): Too many clusters !\n"); 
+    return;
+  }
+  if (fN==0) {fIndex[0]=index; fClusters[fN++]=c; return;}
+  Int_t i=Find(c->GetY());
+  memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTRDcluster*));
+  memmove(fIndex   +i+1 ,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t)); 
+  fIndex[i]=index; fClusters[i]=c; fN++;
+}  
+
+//______________________________________________________
+
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::Find(Double_t y) const {
+
+// Returns index of the cluster nearest in Y    
+
+  if (y <= fClusters[0]->GetY()) return 0;
+  if (y > fClusters[fN-1]->GetY()) return fN;
+  Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
+  for (; b<e; m=(b+e)/2) {
+    if (y > fClusters[m]->GetY()) b=m+1;
+    else e=m;
+  }
+  return m;
+}    
+
+Int_t AliTRDtracker::AliTRDpropagationLayer::FindNearestCluster(Double_t y, Double_t z, Double_t maxroad) const 
+{
+  //
+  // Returns index of the cluster nearest to the given y,z
+  //
+  Int_t index = -1;
+  Int_t maxn = fN;
+  Double_t mindist = maxroad;                  
+  Float_t padlength =-1;
+  //
+  for (Int_t i=Find(y-maxroad); i<maxn; i++) {
+    AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(fClusters[i]);
+    if (padlength<0){
+      padlength = TMath::Sqrt(c->GetSigmaZ2()*12); 
+    }
+    //
+    if (c->GetY() > y+maxroad) break;
+    if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > padlength*0.75) continue;      
+    if (TMath::Abs(c->GetY()-y)<mindist){
+      mindist = TMath::Abs(c->GetY()-y);
+      index = GetIndex(i);
+    }        
+  }                                            
+  return index;
+}             
+
+
+//---------------------------------------------------------
+
+Double_t AliTRDtracker::GetTiltFactor(const AliTRDcluster* c) {
+//
+//  Returns correction factor for tilted pads geometry 
+//
+  Int_t det = c->GetDetector();    
+  Int_t plane = fGeom->GetPlane(det);
+  AliTRDpadPlane *padPlane = fPar->GetPadPlane(plane,0);
+  Double_t h01 = TMath::Tan(-TMath::Pi() / 180.0 * padPlane->GetTiltingAngle());
+
+  if(fNoTilt) h01 = 0;
+  return h01;
 }
 
+
+void AliTRDtracker::CookdEdxTimBin(AliTRDtrack& TRDtrack)
+{
+  // *** ADDED TO GET MORE INFORMATION FOR TRD PID  ---- PS
+  // This is setting fdEdxPlane and fTimBinPlane
+  // Sums up the charge in each plane for track TRDtrack and also get the 
+  // Time bin for Max. Cluster
+  // Prashant Shukla (shukla@physi.uni-heidelberg.de)
+
+  //  const Int_t kNPlane = AliTRDgeometry::Nplan();
+  //  const Int_t kNPlane = 6;
+  Double_t  clscharge[kNPlane], maxclscharge[kNPlane];
+  Int_t  nCluster[kNPlane], timebin[kNPlane];
+
+  //Initialization of cluster charge per plane.  
+  for (Int_t iPlane = 0; iPlane < kNPlane; iPlane++) {
+    clscharge[iPlane] = 0.0;
+    nCluster[iPlane] = 0;
+    timebin[iPlane] = -1;
+    maxclscharge[iPlane] = 0.0;
+  }
+
+  // Loop through all clusters associated to track TRDtrack
+  Int_t nClus = TRDtrack.GetNumberOfClusters();  // from Kalmantrack
+  for (Int_t iClus = 0; iClus < nClus; iClus++) {
+    Double_t charge = TRDtrack.GetClusterdQdl(iClus);
+    Int_t index = TRDtrack.GetClusterIndex(iClus);
+    AliTRDcluster *TRDcluster = (AliTRDcluster *) GetCluster(index); 
+    if (!TRDcluster) continue;
+    Int_t tb = TRDcluster->GetLocalTimeBin();
+    if (!tb) continue;
+    Int_t detector = TRDcluster->GetDetector();
+    Int_t iPlane   = fGeom->GetPlane(detector);
+    clscharge[iPlane] = clscharge[iPlane]+charge;
+    if(charge > maxclscharge[iPlane]) {
+      maxclscharge[iPlane] = charge;
+      timebin[iPlane] = tb;
+    }
+    nCluster[iPlane]++;
+  } // end of loop over cluster
+
+  // Setting the fdEdxPlane and fTimBinPlane variabales 
+  Double_t Total_ch = 0;
+  for (Int_t iPlane = 0; iPlane < kNPlane; iPlane++) {
+    // Quality control of TRD track.
+    if (nCluster[iPlane]<= 5) {
+      clscharge[iPlane]=0.0;
+      timebin[iPlane]=-1;
+    }
+    if (nCluster[iPlane]) clscharge[iPlane] /= nCluster[iPlane];
+    TRDtrack.SetPIDsignals(clscharge[iPlane], iPlane);
+    TRDtrack.SetPIDTimBin(timebin[iPlane], iPlane);
+    Total_ch= Total_ch+clscharge[iPlane];
+  }
+  //  Int_t i;
+  //  Int_t nc=TRDtrack.GetNumberOfClusters(); 
+  //  Float_t dedx=0;
+  //  for (i=0; i<nc; i++) dedx += TRDtrack.GetClusterdQdl(i);
+  //  dedx /= nc;
+  //  for (Int_t iPlane = 0; iPlane < kNPlane; iPlane++) {
+  //    TRDtrack.SetPIDsignals(dedx, iPlane);
+  //    TRDtrack.SetPIDTimBin(timbin[iPlane], iPlane);
+  //  }
+
+} // end of function
+
+
+Int_t AliTRDtracker::FindClusters(Int_t sector, Int_t t0, Int_t t1, AliTRDtrack * track, Int_t *clusters,AliTRDtracklet&tracklet)
+{
+  //
+  //
+  //  try to find nearest clusters to the track in timebins from t0 to t1 
+  //  
+  //
+  //  
+  // correction coeficients   - depends on TRD parameters  - to be changed according it
+  //
+
+  Double_t x[100],yt[100],zt[100];
+  Double_t xmean=0;   //reference x
+  Double_t dz[10][100],dy[10][100];
+  Float_t zmean[100], nmean[100];
+  Int_t    clfound=0;
+  Int_t    indexes[10][100];    // indexes of the clusters in the road
+  AliTRDcluster *cl[10][100];   // pointers to the clusters in the road
+  Int_t    best[10][100];       // index of best matching cluster 
+  //
+  //
+  TClonesArray array0("AliTRDcluster",1);
+  TClonesArray array1("AliTRDcluster",1);
+  for (Int_t it=0;it<t1-t0; it++){
+    x[it]=0;
+    yt[it]=0;
+    zt[it]=0;
+    clusters[it+t0]=-2;
+    zmean[it]=0;
+    nmean[it]=0;
+    //
+    for (Int_t ih=0;ih<10;ih++){
+      indexes[ih][it]=-2;              //reset indexes1
+      cl[ih][it]=0;
+      dz[ih][it]=-100;
+      dy[ih][it]=-100;
+      best[ih][it]=0;
+    }
+  }  
+  //
+  Double_t x0 = track->GetX();
+  Double_t sigmaz = TMath::Sqrt(track->GetSigmaZ2());
+  Int_t nall=0;
+  Int_t nfound=0;
+  Double_t h01 =0;
+  Int_t plane =-1;
+  Float_t padlength=0;
+  AliTRDtrack track2(*track);
+  Float_t snpy = track->GetSnp();
+  Float_t tany = TMath::Sqrt(snpy*snpy/(1.-snpy*snpy)); 
+  if (snpy<0) tany*=-1;
+  //
+  Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(x0,track->GetTgl(),track->GetPt());
+  Double_t sz2=ExpectedSigmaZ2(x0,track->GetTgl());
+  Double_t road = 15.*sqrt(track->GetSigmaY2() + sy2);
+  if (road>6.) road=6.;
+
+  //
+  for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+    Double_t maxChi2[2]={fgkMaxChi2,fgkMaxChi2};      
+    AliTRDpropagationLayer& timeBin=*(fTrSec[sector]->GetLayer(it+t0));
+    if (timeBin==0) continue;  // no indexes1
+    Int_t maxn = timeBin;
+    x[it] = timeBin.GetX();
+    track2.PropagateTo(x[it]);
+    yt[it] = track2.GetY();
+    zt[it] = track2.GetZ();
+    
+    Double_t  y=yt[it],z=zt[it];
+    Double_t chi2 =1000000;
+    nall++;
+    //
+    // find 2 nearest cluster at given time bin
+    // 
+    // 
+    for (Int_t i=timeBin.Find(y-road); i<maxn; i++) {
+      AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(timeBin[i]);
+      h01 = GetTiltFactor(c);
+      if (plane<0){
+       Int_t det = c->GetDetector();    
+       plane = fGeom->GetPlane(det);
+       padlength = TMath::Sqrt(c->GetSigmaZ2()*12.);
+      }
+      //      if (c->GetLocalTimeBin()==0) continue;
+      if (c->GetY() > y+road) break;
+      if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 12. * sz2) continue;      
+
+      Double_t dist = TMath::Abs(c->GetZ()-z);
+      if (dist> (0.5*padlength+6.*sigmaz)) continue;   // 6 sigma boundary cut
+      Double_t cost = 0;
+      //
+      if (dist> (0.5*padlength-sigmaz)){   //  sigma boundary cost function
+       cost =  (dist-0.5*padlength)/(2.*sigmaz);
+       if (cost>-1) cost= (cost+1.)*(cost+1.);
+       else cost=0;
+      }      
+      //      Int_t label = TMath::Abs(track->GetLabel());
+      //      if (c->GetLabel(0)!=label && c->GetLabel(1)!=label&&c->GetLabel(2)!=label) continue;
+      chi2=track2.GetPredictedChi2(c,h01)+cost;
+      //
+      clfound++;      
+      if (chi2 > maxChi2[1]) continue;
+      
+      for (Int_t ih=2;ih<9; ih++){  //store the clusters in the road
+       if (cl[ih][it]==0){
+         cl[ih][it] = c;
+         indexes[ih][it] =timeBin.GetIndex(i);   // index - 9 - reserved for outliers
+         break;
+       }
+      }
+      //
+      if (chi2 <maxChi2[0]){
+       maxChi2[1]     = maxChi2[0];
+       maxChi2[0]     = chi2;
+       indexes[1][it] = indexes[0][it];
+       cl[1][it]      = cl[0][it];
+       indexes[0][it] = timeBin.GetIndex(i);
+       cl[0][it]      = c;
+       continue;
+      }
+      maxChi2[1]=chi2;
+      cl[1][it] = c;
+      indexes[1][it] =timeBin.GetIndex(i); 
+    }         
+    if (cl[0][it]){
+      nfound++;
+      xmean += x[it];
+    }
+  }
+  //
+  if (nfound<4) return 0;  
+  xmean /=Float_t(nfound);     // middle x
+  track2.PropagateTo(xmean);   // propagate track to the center
+  //
+  // choose one of the variants
+  //
+  Int_t changes[10];
+  Float_t sumz      = 0;
+  Float_t sum       = 0;
+  Double_t sumdy    = 0;
+  Double_t sumdy2   = 0;
+  Double_t sumx     = 0;
+  Double_t sumxy    = 0;
+  Double_t sumx2    = 0;
+  Double_t mpads    = 0;
+  //
+  Int_t   ngood[10];
+  Int_t   nbad[10];
+  //
+  Double_t meanz[10];
+  Double_t moffset[10];    // mean offset
+  Double_t mean[10];       // mean value
+  Double_t angle[10];      // angle
+  //
+  Double_t smoffset[10];   // sigma of mean offset
+  Double_t smean[10];      // sigma of mean value
+  Double_t sangle[10];     // sigma of angle
+  Double_t smeanangle[10]; // correlation
+  //
+  Double_t sigmas[10];     
+  Double_t tchi2s[10];      // chi2s for tracklet
+  //
+  // calculate zmean
+  //
+  for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+    if (!cl[0][it]) continue;
+    for (Int_t dt=-3;dt<=3;dt++){
+      if (it+dt<0) continue;
+      if (it+dt>t1) continue;
+      if (!cl[0][it+dt]) continue;
+      zmean[it]+=cl[0][it+dt]->GetZ();
+      nmean[it]+=1.;
+    }
+    zmean[it]/=nmean[it]; 
+  }
+  //
+  for (Int_t it=0; it<t1-t0;it++){
+    best[0][it]=0;
+    for (Int_t ih=0;ih<10;ih++){
+      dz[ih][it]=-100;
+      dy[ih][it]=-100;
+      if (!cl[ih][it]) continue;
+      Float_t poscor =  fgkCoef*(cl[ih][it]->GetLocalTimeBin() - fgkMean)+fgkOffset;      
+      dz[ih][it]  = cl[ih][it]->GetZ()- zt[it];                               // calculate distance from track  in z
+      dy[ih][it]  = cl[ih][it]->GetY()+ dz[ih][it]*h01 - poscor  -yt[it];     //                                in y
+    }
+    // minimize changes
+    if (!cl[0][it]) continue;
+    if (TMath::Abs(cl[0][it]->GetZ()-zmean[it])> padlength*0.8 &&cl[1][it])
+      if (TMath::Abs(cl[1][it]->GetZ()-zmean[it])< padlength*0.5){
+       best[0][it]=1;
+      }
+  }
+  //
+  // iterative choosing of "best path"
+  //
+  //
+  Int_t label = TMath::Abs(track->GetLabel());
+  Int_t bestiter=0;
+  //
+  for (Int_t iter=0;iter<9;iter++){
+    //
+    changes[iter]= 0;
+    sumz      = 0; sum=0; sumdy=0;sumdy2=0;sumx=0;sumx2=0;sumxy=0;mpads=0; ngood[iter]=0; nbad[iter]=0; 
+    // linear fit
+    for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+      if (!cl[best[iter][it]][it]) continue;
+      //calculates pad-row changes
+      Double_t zbefore= cl[best[iter][it]][it]->GetZ();
+      Double_t zafter = cl[best[iter][it]][it]->GetZ();
+      for (Int_t itd = it-1; itd>=0;itd--) {
+       if (cl[best[iter][itd]][itd]) {
+         zbefore= cl[best[iter][itd]][itd]->GetZ();
+         break;
+       }
+      }
+      for (Int_t itd = it+1; itd<t1-t0;itd++) {
+       if (cl[best[iter][itd]][itd]) {
+         zafter= cl[best[iter][itd]][itd]->GetZ();
+         break;
+       }
+      }
+      if (TMath::Abs(cl[best[iter][it]][it]->GetZ()-zbefore)>0.1&&TMath::Abs(cl[best[iter][it]][it]->GetZ()-zafter)>0.1) changes[iter]++;
+      //
+      Double_t dx = x[it]-xmean;  // distance to reference x
+      sumz += cl[best[iter][it]][it]->GetZ();      
+      sum++;
+      sumdy += dy[best[iter][it]][it];
+      sumdy2+= dy[best[iter][it]][it]*dy[best[iter][it]][it];
+      sumx  += dx;
+      sumx2 += dx*dx;
+      sumxy  += dx*dy[best[iter][it]][it];
+      mpads += cl[best[iter][it]][it]->GetNPads();
+      if (cl[best[iter][it]][it]->GetLabel(0)==label || cl[best[iter][it]][it]->GetLabel(1)==label||cl[best[iter][it]][it]->GetLabel(2)==label){
+       ngood[iter]++;
+      }
+      else{
+       nbad[iter]++;
+      }
+    }
+    //
+    // calculates line parameters
+    //
+    Double_t det  = sum*sumx2-sumx*sumx;
+    angle[iter]   = (sum*sumxy-sumx*sumdy)/det;
+    mean[iter]    = (sumx2*sumdy-sumx*sumxy)/det;
+    meanz[iter]   = sumz/sum;    
+    moffset[iter] = sumdy/sum;
+    mpads        /= sum;                         // mean number of pads
+    //
+    //
+    Double_t  sigma2 = 0;   // normalized residuals - for line fit
+    Double_t  sigma1 = 0;   // normalized residuals - constant fit
+    //
+    for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+      if (!cl[best[iter][it]][it]) continue;
+      Double_t dx = x[it]-xmean;
+      Double_t ytr = mean[iter]+angle[iter]*dx;
+      sigma2 += (dy[best[iter][it]][it]-ytr)*(dy[best[iter][it]][it]-ytr);
+      sigma1 +=  (dy[best[iter][it]][it]-moffset[iter])*(dy[best[iter][it]][it]-moffset[iter]);
+      sum++;
+    }
+    sigma2      /=(sum-2);                    // normalized residuals
+    sigma1      /=(sum-1);                    // normalized residuals
+    //
+    smean[iter]       = sigma2*(sumx2/det);   // estimated error2 of mean
+    sangle[iter]      = sigma2*(sum/det);     // estimated error2 of angle
+    smeanangle[iter]  = sigma2*(-sumx/det);   // correlation
+    //
+    //
+    sigmas[iter]  = TMath::Sqrt(sigma1);      //
+    smoffset[iter]= (sigma1/sum)+0.01*0.01;             // sigma of mean offset + unisochronity sigma 
+    //
+    // iterative choosing of "better path"
+    //
+    for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+      if (!cl[best[iter][it]][it]) continue;
+      //
+      Double_t sigmatr2 = smoffset[iter]+0.5*tany*tany;             //add unisochronity + angular effect contribution
+      Double_t sweight  = 1./sigmatr2+1./track->fCyy;
+      Double_t weighty  = (moffset[iter]/sigmatr2)/sweight;         // weighted mean
+      Double_t sigmacl  = TMath::Sqrt(sigma1*sigma1+track->fCyy);   //
+      Double_t mindist=100000; 
+      Int_t ihbest=0;
+      for (Int_t ih=0;ih<10;ih++){
+       if (!cl[ih][it]) break;
+       Double_t dist2 = (dy[ih][it]-weighty)/sigmacl;
+       dist2*=dist2;    //chi2 distance
+       if (dist2<mindist){
+         mindist = dist2;
+         ihbest =ih;
+       }
+      }
+      best[iter+1][it]=ihbest;
+    }
+    //
+    //  update best hypothesy if better chi2 according tracklet position and angle
+    //
+    Double_t sy2 = smean[iter]  + track->fCyy;
+    Double_t sa2 = sangle[iter] + track->fCee;
+    Double_t say = track->fCey;
+    //    Double_t chi20 = mean[bestiter]*mean[bestiter]/sy2+angle[bestiter]*angle[bestiter]/sa2;
+    // Double_t chi21 = mean[iter]*mean[iter]/sy2+angle[iter]*angle[iter]/sa2;
+
+    Double_t detchi    = sy2*sa2-say*say;
+    Double_t invers[3] = {sa2/detchi, sy2/detchi, -say/detchi};   //inverse value of covariance matrix  
+    
+    Double_t chi20 = mean[bestiter]*mean[bestiter]*invers[0]+angle[bestiter]*angle[bestiter]*invers[1]+
+      2.*mean[bestiter]*angle[bestiter]*invers[2];
+    Double_t chi21 = mean[iter]*mean[iter]*invers[0]+angle[iter]*angle[iter]*invers[1]+
+      2*mean[iter]*angle[iter]*invers[2];
+    tchi2s[iter] =chi21;
+    //
+    if (changes[iter]<=changes[bestiter] && chi21<chi20) {
+      bestiter =iter;      
+    }
+  }
+  //
+  //set clusters 
+  //
+  Double_t sigma2 = sigmas[0];   // choose as sigma  from 0 iteration
+  //if (tchi2s[bestiter]>25.) sigma2*=tchi2s[bestiter]/25.;
+  //if (tchi2s[bestiter]>25.) sigma2=1000.;  // dont'accept
+
+  Double_t expectederr = sigma2*sigma2+0.01*0.01;
+  if (mpads>3.5) expectederr  +=   (mpads-3.5)*0.04;
+  if (changes[bestiter]>1) expectederr+=   changes[bestiter]*0.01; 
+  expectederr+=(0.03*(tany-fgkExB)*(tany-fgkExB))*15;
+  //  if (tchi2s[bestiter]>18.) expectederr*= tchi2s[bestiter]/18.;
+  //expectederr+=10000;
+  for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+    if (!cl[best[bestiter][it]][it]) continue;
+    Float_t poscor =  fgkCoef*(cl[best[bestiter][it]][it]->GetLocalTimeBin() - fgkMean)+fgkOffset;          
+    cl[best[bestiter][it]][it]->SetSigmaY2(expectederr);  // set cluster error
+    if (!cl[best[bestiter][it]][it]->IsUsed()){
+      cl[best[bestiter][it]][it]->SetY( cl[best[bestiter][it]][it]->GetY()-poscor);  // ExB corrction correction    
+      cl[best[bestiter][it]][it]->Use();
+    }
+    clusters[it+t0] = indexes[best[bestiter][it]][it];    
+  } 
+  //
+  // set tracklet parameters
+  //
+  Double_t trackleterr2 = smoffset[bestiter]+0.01*0.01;
+  if (mpads>3.5) trackleterr2  +=   (mpads-3.5)*0.04;
+  trackleterr2+=   changes[bestiter]*0.01;
+  trackleterr2*=   TMath::Max(14.-nfound,1.);
+  trackleterr2+=   0.2*(tany-fgkExB)*(tany-fgkExB); 
+  //
+  tracklet.Set(xmean, track2.GetY()+moffset[bestiter], meanz[bestiter], track2.GetAlpha(), trackleterr2);  //set tracklet parameters
+  tracklet.SetTilt(h01);
+  tracklet.SetP0(mean[bestiter]);
+  tracklet.SetP1(angle[bestiter]);
+  tracklet.SetN(nfound);
+  tracklet.SetNCross(changes[bestiter]);
+  tracklet.SetPlane(plane);
+  tracklet.SetSigma2(expectederr);
+  tracklet.SetChi2(tchi2s[bestiter]);
+  track->fTracklets[plane] = tracklet;
+  track->fNWrong+=nbad[0];
+  //
+  // Debuging part
+  //
+  TTreeSRedirector& cstream = *fDebugStreamer;
+  AliTRDcluster dummy;
+  Double_t dy0[100];
+  Double_t dyb[100];  
+  for (Int_t it=0;it<t1-t0;it++){
+    dy0[it] = dy[0][it];
+    dyb[it] = dy[best[bestiter][it]][it];
+    if(cl[0][it]) {
+      new(array0[it]) AliTRDcluster(*cl[0][it]);
+    }
+    else{
+      new(array0[it]) AliTRDcluster(dummy);
+    }
+    if(cl[best[bestiter][it]][it]) {
+      new(array1[it]) AliTRDcluster(*cl[best[bestiter][it]][it]);
+    }
+    else{
+      new(array1[it]) AliTRDcluster(dummy);
+    }
+  }
+  TGraph graph0(t1-t0,x,dy0);
+  TGraph graph1(t1-t0,x,dyb);
+  TGraph graphy(t1-t0,x,yt);
+  TGraph graphz(t1-t0,x,zt);
+  //
+  //
+  cstream<<"tracklet"<<
+    "track.="<<track<<                                       // track parameters
+    "tany="<<tany<<                                          // tangent of the local track angle 
+    "xmean="<<xmean<<                                        // xmean - reference x of tracklet  
+    "tilt="<<h01<<                                           // tilt angle
+    "nall="<<nall<<                                          // number of foundable clusters 
+    "nfound="<<nfound<<                                      // number of found clusters
+    "clfound="<<clfound<<                                    // total number of found clusters in road 
+    "mpads="<<mpads<<                                        // mean number of pads per cluster
+    "plane="<<plane<<                                        // plane number 
+    "road="<<road<<                                          // the width of the used road
+    "graph0.="<<&graph0<<                                    // x - y = dy for closest cluster
+    "graph1.="<<&graph1<<                                    // x - y = dy for second closest cluster    
+    "graphy.="<<&graphy<<                                    // y position of the track
+    "graphz.="<<&graphz<<                                    // z position of the track
+    "fCl.="<<&array0<<                                       // closest cluster
+    "fCl2.="<<&array1<<                                      // second closest cluster
+    //
+    "bestiter="<<bestiter<<                                  // best iteration number 
+    "tracklet.="<<&tracklet<<                                // corrspond to the best iteration
+    "tchi20="<<tchi2s[0]<<                                   // chi2 of cluster in the 0 iteration
+    "tchi2b="<<tchi2s[bestiter]<<                            // chi2 of cluster in the best  iteration
+    "sigmas0="<<sigmas[0]<<                                  // residuals sigma 
+    "sigmasb="<<sigmas[bestiter]<<                           // residulas sigma
+    //
+    "ngood0="<<ngood[0]<<                                    // number of good clusters in 0 iteration
+    "nbad0="<<nbad[0]<<                                      // number of bad clusters in 0 iteration
+    "ngoodb="<<ngood[bestiter]<<                             //                        in  best iteration    
+    "nbadb="<<nbad[bestiter]<<                               //                        in  best iteration
+    //
+    "changes0="<<changes[0]<<                                // changes of pardrows in iteration number 0 
+    "changesb="<<changes[bestiter]<<                         // changes of pardrows in best iteration
+    //
+    "moffset0="<<moffset[0]<<                                // offset fixing angle in iter=0
+    "smoffset0="<<smoffset[0]<<                              // sigma of offset fixing angle in iter=0
+    "moffsetb="<<moffset[bestiter]<<                         // offset fixing angle in iter=best
+    "smoffsetb="<<smoffset[bestiter]<<                       // sigma of offset fixing angle in iter=best
+    //
+    "mean0="<<mean[0]<<                                      // mean dy in iter=0;
+    "smean0="<<smean[0]<<                                    // sigma of mean dy in iter=0
+    "meanb="<<mean[bestiter]<<                               // mean dy in iter=best
+    "smeanb="<<smean[bestiter]<<                             // sigma of mean dy in iter=best
+    //
+    "angle0="<<angle[0]<<                                    // angle deviation in the iteration number 0 
+    "sangle0="<<sangle[0]<<                                  // sigma of angular deviation in iteration number 0
+    "angleb="<<angle[bestiter]<<                             // angle deviation in the best iteration   
+    "sangleb="<<sangle[bestiter]<<                           // sigma of angle deviation in the best iteration   
+    //
+    "expectederr="<<expectederr<<                            // expected error of cluster position
+    "\n";
+  //
+  //
+  return nfound;
+}
+
+