Do not set the matrices load status at the InitParameters

Coverity fix

Fix coverity defects

coverity

increase size of calo cluster array

Protection against run==0 runnumbers

AliTRDCalibTask.cxx .h (running on a test task over all triggers)
AliTRDCalibraFit.cxx .h (one constant per run in case of too few stats for vdrift and gain only)
AliTRDPreprocessorOffline.cxx .h  (status implementation and case for one constant per run)

updated Bayesian PID

Selection of absolute leading for triggering, MC histograms added, possibility of different pt trigger bins, general clean-up and cosmetics

o add histograms for TPC + TOF
o Prepare for EMCAL

Add online gain tables (Annika)

coverity fix

Fix bug in mu calculation (Plamen)

esdFriend selection modified by Markus Koeler

Remove print

adding TPC cosntrained tracks back in for comparison

added new cuts (Iter1>70

Clusters removed during transformation of recpoints into caloclusters, null pointer added instead, now corrected. In case of just unfold and recalibration requested, calibrate cells

Isolate only leading particles, and some cosmetics

Added theDeleteImage method allowing destruction of TCanvas** (see https://savannah.cern.ch/bugs/?84565)

Propagating scalers to ESD.  (Plamen)

Added methods for mu calculation (Plamen)

changed methods of AOD track

fix for NUA

Possilibity to change the binning and range of time histogras

Change default name of geometry to Complete, add debugging print

extra bit for TPC and Global constrained flagging

Do not use fESDpid if it does not exist

Fix for memory leak.

HMPID performance task and centrality task added to the train

b field dependence

Task AliHMPIDPerformanceTask (L. Molnar) for basic performance studies added

change in dphi distance formula

mistyping fixed

Additions in the balance function code, including shuffling

Fix in PID application for LambdaC (Rossella)

Fixing broken code with temporary fix.

-- changes by Weilin
1. track selection using tof information
2. activate TPC-ITS matching component

M    TPC/AliPerformanceTPC.cxx
M    TPC/macros/AddTaskPerformanceTPCdEdxQA.C
M    TPC/AliTPCPerformanceSummary.cxx
M    TPC/AliPerformanceObject.cxx
M    TPC/AliPerformanceDEdx.cxx
M    TPC/AliTPCPerformanceSummary.h
M    TPC/AliPerformanceObject.h
M    TPC/AliPerformanceMatch.cxx
M    TPC/AliPerformanceTask.cxx
M    TPC/AliPerformanceMatch.h

Clone finctionality removed

updated systematics for D* analysis in pp @ 2.76TeV + typo fixed in the 7 TeV D* systematics (Alessandro)

Main updates: PID and centrality

Added diagnostics

Added diagnostics

bug fix

Selection on weak processes for secondary particles added

Added a value for computin absolute resolution instead of relative one

-- new trigger mask implemented
M    dNdPt/AlidNdPt.h
M    dNdPt/AlidNdPt.cxx

-- new trigger mask implemented
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysisPbPb.cxx
M    dNdPt/AlidNdPtAnalysis.cxx

indented function MakeAnalysisFillHistograms

Coverity fixed

Fix for #68917: Improper usage of TClonesArrays in ITS -- 2

-- new class to store track tree
A    PWG0/dNdPt/AlidNdPtTrackDumpTask.h
A    PWG0/dNdPt/AlidNdPtTrackDumpTask.cxx
M    PWG0/PWG0depLinkDef.h
M    PWG0/CMakelibPWG0dep.pkg

-- add possibility to project THnSparses
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPt.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPt.cxx
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtTask.cxx
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtTask.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtCutAnalysisPbPb.h
M    PWG0/dNdPt/AlidNdPtCutAnalysisPbPb.cxx

Fix Coverity report

cast histogram content to int to avoid compilation warning

Allow to do cluster-track matching with TPC only tracks or Global tracks - Rongrong

Coverity fixes. (Mario Sitta)

Fixed a memory leak in AliCTPTimeParams

Add getter for the channel status in map

add protections against null cluter pointers

Driver macro for calculating Et em corrections

Helper classes for Et em corrections from Marcelo

Task from Marcelo for calculating Et em corrections

Definition of labels for SDigits from Raw Data. They will be used for embedding purposes (Ruben)

o updates (Pietro)

bugfix in pointer check, including necessary libraries in the macro, introducing the mode switches as arguments

error in AliHMPIDCluster.h fixed

access optimization, cluster association improved

adding functionality to indicate regions of spacepoints, residual calculation; more options for Draw method

Fix compilation warnings

Fix compilation warnings

Introduction of decalibration in the simulations with anchor runs and raw:// OCDB.

bug fix from A. Hansen - requesting proper mother particle ID

Warning fixed

Sharing diagnostics

New config file for filtering Pb peripheral events

using base class HLTSpacePointContainer as function argument type

Fix for compiler warning

Added protection in AliHMPIDReconHTA.cxx and setter methods for charge values in AliHMPIDCluster class (D. Di Bari)

Electronc noise switched-on in simulation. Default number of sigma for threshold calculation set to 4. Sigma values for each channel retrieved from OCDB. New setter and getter methods of threshold value and number of sigmas added in AliHMPIDParam

protection against null cluster pointer

Updates from Deepa

1. New function AliEMCALRecoUtils::GetRecoUtils() to get the pointer to AliEMCALRecoUtils.
2. Fixed the bug in removing clusters with hot channels from the cluster list.
3. Implemented hot channels for LHC11a/pass2 and LHC11c

coverty fix

More detailed geometry of ITS upgrade (cf. rev. 50841 (M. Sitta)

allowing also to measure sum pt

pad coordinate with respect to middle of the pad (0.5 shift); disable handling of transformed clusters (gives wrong coodinates anyhow)

fixing env var in par file creation (after directory relocation)

adding column for counting of pile up to stat histogram (Antonio O)

In alignment classes:
- Added the possibility to run the alignment in two steps
  * First step is to calculate the derivatives. The derivatives are stored in an AOD. It's fully parallelizable.
  * Second step reads back the derivatives from the AOD and performs the minimization.
  * The behaviour is handle in the AliMUONAlignmentTask setting the appropiate flags with the methods
    muonAlign->SetReadRecords();
    muonAlign->SetDoAlignment();
    muonAlign->SetWriteRecords();
- Improve running of alignment taks on the grid
- Correct handling of different OCDB used for input and output alignments
(Hugo, Javier)

In rootlogon.C:
Updated includes from STEER (now in subdirectories).

changed binning

fabs --> TMath::Abs (Marta V)

Add PairPt Cut

Extension of unfolding procedures (Marco vL, Marta V)
- new regularisations: a powerlaw with fixed power (5) and general powerlaw (linearity on a log-log scale)
- general powerlaw takes into account the efficiencies (if provided)
- interactive unfolder use

Fix compilation errors

Fixing wrong usage of bits

corrected initialization of ITS chi2's

dded ITS chi2 on all 3 steps of tracking

changing the ranges for gain calibration
Aexander

Gain calibration added to the HWCF emulation

Phi star version of the radial distance cut

Add PID code