From Jennifer - get geo-manager via AliEveEventManager::AssertGeometry().

New feature (=event-by-event selection of injector pads for drift speed calcualation) in SDD DA for injector runs (F. Prino)

Adding new task to implement central filtering (AliAnalysisTaskFilterSteer).
Removing obsolete task (AliAnalysisTaskFilterSTEER).
Adding steering macro for AliAnalysisTaskFilterSteer.

- Implementing Central task for filtering the ESD friends:
    - keeping only 1% of the whole sample, randomly selected

- Adding the setting/getting of the "skip" bit (bit 23) for AliESDfriendTrack/AliESDfriend
  during the filtering
    - AliESDfriendTrack --> to allow to have the logical or between tracks from different tasks
      when adding a "dummy" friend track (when not selected by the filter)
    - AliESDfriend --> to be able to disentagle between ESDfriends added because
      selected, or added as "dummy" ones when not selected

- Corresponding changes in AliAnalysisTaskFilter/AliESDHandler and in the
  example filtering tasks

- Removal of AliAnalysisFilterSTEER:
  - the 1% selection is now done in AliAnalysisFilterSteer
  - the pt selection should be handled in separate detector-specific tasks

- macro for filling histograms for tracking diagnostics (TPCTrackHisto component)
  (shorter and legible version of the very long HLT-TPC reconstruction macro)

Fixes for warnings

Removed obsolete method

correct setting of EMCAL geometry, correct memory leak, correct problems with terminate execution

Fix for Savannah bug 66143

Warning fixes from Magali

Fix for bug number 66155

remove the check SetOwner before cleaning the TObjArray

remove setting of distance to bad channel in Omega analsys

Fixing conding violation rules. Add task macro that was forgotten last commit (Livio)

Fixing of coding violations
Marian

- first trigger version for ultra-peripheral collisions (Kyrre Skjerdal)
- added macro that runs the HLT reconstruction and processes the output through the trigger component
   (global trigger menu to be modified, so that the chain can be complete with the addition of the global trigger component)
- no arguments passed from OCDB entry yet

In MUONRecoCheck.C:
- Add protection against 0 when computing the average momentum per bin
- Correct the phi resolution for a possible +- 2*pi shift in its computation
(Philippe P.)

removing TPC analysis classes from end 2006

updated to new BG histo naming

updated multiplicity analysis for the INEL>0 case

Updated AliUnfolding class. The regularization schemas have changed taking into account bin
width and in a different way the error of the single bin.
Please CHECK the weights given to the regularization. They most likely need to be changed.

Added check of daughters clustermap in ITS

update for INEL>0 analysis

- fixing warnings

- moving initialisation of helper classes from the clusterizer constructor to DoInit
- adding detector name to constants class

Added to fieldmaps the parameterized integrals of field transv.components/bz
AliMagF::GetTPCRatInt(xyz,b) gives the integral of bx/bz, by/bz and
(bx/bz)^2+(by/bz)^2  from 0 to xyz[2].
The (old) integral of components /GetTPCInt(xyz,b)/ is brought to the same
convention (before was from z=+-250 to xyz[2])
The min/max Z and R allowed is 300 cm.
GetTPCRatIntCyl and GetTPCIntCyl provide similar integrals in cyl.frame.
Reparameterized

remove call to gstpar, now in galice.cuts

Code for the simulations at generator level, used for model comparison in the first papers.
Initial commit.

Partial fix for bug #66084: Remove gstpar calls and put parameters in galice.cuts -- EMCAL

LTM-volumeID mapping: update (A.Silenzi)

In MUONRecoCheck.C:
Added new control plots:
- X-Y slopes at first cluster and at vertex
- Eta at vertex
- Phi at vertex
- p*DCA
(Philippe P.)

Some more fix

Central electrode updated according to the drawings from Wolfgang Klempt

fCTTMmatrixBack index out of bounds: fixed (F.Reidt)

Update of DAs (PED & GAIN):
- Add messages giving faulty DDL (and FRT) in case of Token lost errors
- Pedestal forced to 4095 (or 4090) when statistics < 10 events (or
RMS < 0.5)

(Jean-Luc Charvet)

Fixing coding conventions

- EMCAL digit maker loads bad channel map from CDB
- Geometry initialisation in clusterizer moved from constructor to dedicated function

- stop clusterisation on no geometry

fixed warning

Bug in QA class corrected

Fix to suppress the warning

bugfix: checking correct data origin for ITS tracking form digits (Gaute)

compilation warnings about unused parameters corrected

correcting warnings: function parameters commented after becoming unused in previous commit

Medium cuts moved to galice.cuts

Major updates for millipede2 and related classes (Ruben)

Changed cuts (Ana)

Change to SSD geometry: addition of metallisation to the capacitors on the hybrids (M. van Leeuwen) Savannah bug 63965

Compute position and size of luminous region vs time (D. Caffarri)

Updating the trigger code for 2010 data. Should be ok now while the code is being incorporated in the reconstruction.

Coding convention fixes from Magali

Added possibility to invert the sign of the parametization

Fixes for report #65951: Request to change PHOS initialization in MC

Fix for bug #66094: Remove gstpar calls and put parameters in galice.cuts -- ZDC

doubles in the AliMillePedeRecord changed to double32, many changes in
MP2 related to treatment of constraints and low-statistics parameters

Removal of obsolete code

Major update of cuts classes; now they are used in AliAnalysisVertexingHF and stored as a list in AliAOD.VertexingHF.root; missing: D* cuts; possibility to get reco cuts from candidates with TRef

Added class AliFlowEvent, inherits from AliFlowEventSimple.

Solution for bug #66136: removed memory leaks in AliTOFtracker* classes

In alignment classes:
Fixing coding convention violations and compiler warnings.
(Javier)

The "static" was removed from the definition of some variables,
which was not working in the cocktail generator.
Bogdan Vulpescu

Changes for report #65872 Request for adding changes in AliESDpid for trunk. We added a method in AliESDpid for recalculating the TRD PID probabilities based on the 1D Likelihood method

Increment ClassDef number

Move the initialization of bad map to setting of bad channels, add the name of the task to the reader data members

Updated list of classes

In trigger QA:
- Do not store 44/34 ratio in case of scalare events.
- Set pave text color of histogram for QA shifter to red when no events where analyzed.
(Diego)

- restore calibration macro to previous status (reconstruction with grid connection is not running yet, more investigation is needed)

true dqdl distribution as function of drift length (requested by Alex W)

- changes due to deletion of files

- removing obsolote classes
- removing obsolete files

- set clustering thresholds from CDB entries

Header files added to compile the macro

Fixes for coding conventions violations

First implementation of the task to perform filtering on the ESD friend tracks:
- for randomly selected events + event 0 --> keep friend info for the tracks
- for the remaining events, keep friend info for tracks with pT > pT_cut

(M. Ivanov)

Protection against negative TPC signal

 Code to analyze the TPC calibration and to produce OCDB entries
Marian

Write AliHLTGlobalTriggerDecision with splitlevel -1, needed to get custom streamer called

Protection added.

Removing gstpar from PHOS

gMC->Gstpar is removed from the code. Medium cuts are read from galice.cuts.

Fix for bug #66122: Backward compatibility in AliMultiplicity

- using AliVertexerTracks initialization provided by Andrea
  - reading cuts from AliGRPRecoParam
  - do not require kITSrefit flag
  - using mode ITS
- publishing the AliESDVertex object
- updated the corresponding macro
  - extended chain with GlobalVertexerHisto and connected ROOTFileWriter
  - two parallel chains with GlobalVertexer and GlobalOfflineVertexer
  - new running mode to analyse ESDs directly, either esdTree or HLTesdTree

replacing 'new TFile' by 'TFile::Open' in order to support direct file access on the Grid

removing obsolete cout

From Kalliopi: Updated HLT histogram filling

- fill the number of cluster per track only for TPC or TPC+ITS tracks (0 entries rejected) (Hege Erdal)
- fill the eta histogram with a DCA cut (<5cm) for selecting primary tracks and a pt cut (>300MeV/c) to get rid of looping particles
- reject laser tracks in all histograms
- included histo with the status flag of every track

Adding the preprocessor for calibration

Added lines to separate TOF SMs, according to the DAM shifters request (F.Bellini)

initialization of magnetic field, setting the kITSrefit flag for the input tracks as a first attempt
more detailed studies underway
the component now also compiles with the v4-18-Release where the ESD parameter to the AliVertexerTracks was not const

In AliMUONReconstructor:
Putting back unloading mapping from ctor, but now only if the mapping objects
exist. (This removes the warning from AliCDBManager with new OCDB where the
old objects are removed and keeps the code working with old OCDBs where the old
objects are present.)

Reducing printouts.

protection for ProdVtxRange2D added

Added graphical reference to help DQM shifter. Updated sim TOF QA histograms. (F.Bellini)

In AliMUONReconstructor:
Removing unloading mapping from ctor (the old mapping is not in OCDB anymore)

Updating LinkDef's as well

Added graphical reference to help DQM shifter. Updated sim TOF QA histograms. (F.Bellini)

Add Gamma conversions removal

Add Eta cut

Add dEdx monitoring class.

Add dEdx monitoring. Add accepted multiplicity monitoring