Analysis code updated

Updated treatment of TOF PID in QA task (Francesco+Pietro)

Analysis files for kaon spectra analysis from kinks from Martha

Updating angular resolution calculation and correction factor as a function of chamber occupancy and particle specie

fix track time cut decission

Some bug fixes when not data is available for QA histos

Make macro compilable

- Fix problem with EventSpecie when running online in DQM. The problem prevented a plot to be shown to DQM shifter during Calibration events.
- Do not check for algorithm errors in events where readout errors are found.
- Account for global trigger masks in both simulation and QA: if all of the global inputs for a regional board are masked, fully mask the corresponding boards. CAVEAT: the local boards are not masked in case some of the inputs are still transmitted to the global board.
(Diego)

Forgot initialization of new histograms

comment out code retrieving vertex BC since not filled yet for AODs

Add possibility to cut tracks on DCA

Reading QA thresholds from external file II

Setting thresholds for QA from external config file

Minor changes in macros to check SDD calibration

deleted files 'AliAnalysisMuMu.cxx AliAnalysisMuMu.h AliAnalysisMuMuFromAOD.cxx AliAnalysisMuMuFromAOD.h AliAnalysisMuMuFromESD.cxx AliAnalysisMuMuFromESD.h AliAnalysisMuMu.cxx AliAnalysisMuMu.h'

Changed scripts for new TrainSetup

Changed scripts for new TrainSetup

Added a README file

Removed old runTrain and replaced it with what used to be runTrain2

Moved Forward specific trains to PWGLF/FORWARD/analysis2/trains

Moved Forward specific trains to PWGLF/FORWARD/analysis2/trains

Removed obsolete TrainSetup stuff

Various minor fixes

Various minor fixes

protection in case of invalid or empty selection (Marian)

Added Set/GetBC as a virtual method of AliVVertex.
Added filtering of the primary vertex BCID from ESD to AOD

#97485: cmake fails for DAs in trunk + some cleanup

r3 projection change

forgot init new data member histogram in ctor

remove remnant printout

ChargedParticles: Add histograms for DCA and TOF
Photon: Add eta-phi histogram for out of BC=0 clusters
Isolation: Add histogram to check tracks in cone and out of BC=0 tracks in cone
Correlation: Add histograms to check tracks out of BC=0
AddTask: Update recent developments

add switch for timing cuts, apply BC=0 cut on tracks in reader, change TH*I  to TH*F and add BC histogram in maker

Fixes for reco

o bug fixes for 11h gain scenarios (Mikolaj)
o better treatment of eta maps for the 'tuned on data' setting (Benjamin)
o load default splines for pPb MC
J. Wiechula

Adding an additional loop wrapping the opening the alien file and writing to it. This is to check that the file
which was successfully closed and written into can also be re-opened. This check was suggested by Andreas to
spot the very unfortunate and rare case described above, happening in case of a network glitch while closing
the file.

adding some drawing macros for balance functions

adding charge independent correlation output (for comparison with other correlation analyses)

Adding QA histograms

o updates TOF PID (Pietro)
  - fix cut above 5sigma proton
  - start time distributions also for AOD case

Updates

Fix for MC in AddTask for Sigma* pp analysis (M.Venaruzzo)

o small fix

adding possibility for per trigger normalization (Jan Fiete Style)

adding possibility for per trigger normalization (Jan Fiete Style)

current AOD macros

updated

Updated macros for lego train (mavala)

o remove obsolete lines
o add macro to create a pdf report from the PIDqa output
o add loggin of splines and TPC Response setting

Upper cut in track p for PID in D* cut class (Alessandro)

Fix in the projection of histograms in 2 deltaphi bins

cosmetics from Rosi

Bugfix for https://savannah.cern.ch/bugs/?97755

Pointers to MC labels were wrong for the merged clusters.
Now complete MC labels are stored in the cluster array instead of pointers.

Adding the statistical information for the number of clusters variable
+
Addign standard comments to trend variables

added higher harmonics

including input file tag to get the correct normalization in mc productions

update from Constantin

changes from fzhou

Formula for flattening corrected

reconstruction updates

weighting of trigger particle

Temporarily change the number of charge injection points to
~1.5*path_in_sensor/min_pitch and set the threshold to 200 electrons
(to avoid fragmented digits/clusters)

Adding NPart distribution for DPMJET (Chiara)

Cut on minimal distance to bad channel added

Core Dispersion calculation added (instead of Disp2)

Bug fix

update from Constantin

Fixing some memory issues

Possibility to use Raa-beauty as energy loss hypothesis

Add centrality classes

Possibility to vary the boundaries of the fiducial volume

changes from fzhou

small change in event selection, enabling MC events

-update

fix compilation warning

Updates for tracker

Next version of train config

per event weighting

Changed task to update Trigger settings

Add TOF-track related histograms

Add histogram counting events with tracks or EMCal clusters in different bunch crossings

Redo the tracker/trigger matching like in the reconstruction, which allows to move up and down the matching chi2 cut. Add the possibility to change the magnetic field map before refitting. Add the possibility to remove (i.e. give bad resolution to) mono-cathod clusters in stations 3, 4 & 5 before refitting. Add the possibility to simply tag the tracks that do not pass the tracking/matching cuts anymore instead of removing them. (Philippe Pillot)

Minor fixes for style (mvala)

Updated macros for lego_train (mvala)

Fix - disabled event plane information in pp analysis

Modifications in Lc->V0+P analysis (Levente):

*** ConfigVertexingHF... -s are updated with:
- vHF->SetV0TypeForCascadeVertex(AliRDHFCuts::kAllV0s); //Note that all V)s are enabled
- cutsArrayLctoV0 extended from [9] to [10] last number controls the V0s, but currently set to all V0s

*** AliRDHFCutsLctoV0 updated with
- new data member: fV0Type
- and corresponding getter

*** AliAnalysisVertexingHF
- check consistency of AliAnalysisVertexingHF and analysis task(s) settings
- V0 filtering fro cascade vertex reconstruction

*** AliRDHFCuts - contains the steering of the V0s:
enum EV0sel  {kAllV0s = 0, kOnlyOfflineV0s = 1, kOnlyOnTheFlyV0s = 2};

Add histogram with fraction of energy in cluster with large time cells

remove AOD time array trick for old AODs, apply time cut on cells before clusterizing

move time cut from calibration method to the place during the clusterization where cells are selected after calibration

ante updates

updated AMANDA simulation time: missing timestamps

mirror also to SEs where storing failed

Placeholders to have uniform SNV access patterns

#33758: pA Production with DPMJET+Fragment

#98823: Updtate QA task for HMPID

Kinematics TLorentsVector added to AliMuonForwardTrack

Fix in TRDslices transfer of AOD->ESD constructor

update of MuMu analysis task and new helper classes (in particular AliAnalysisTriggerScalers to inspect OCDB scalers). Laurent

Update for the systematics

Missing check for NULL pointer corrected.
Jens Wiechula <Jens.Wiechula@cern.ch>

bug fix: Ambiguous Abs() operator