adding the HLT offline QA skeleton

In AliMUONTrackReconstructorK:
Bug fix: always compress array of tracks after track removal
(Philippe P.)

No kinematics when the reconstruction is from RAW

Corrected bug in cluster selection with PID

Updated fix for bug #50143: corrected calcualtion of the number of bins with entries in the fit region. Loglikelihood fit since the number of entries is small

avoid warning for the default HLT simulation
- changed default output data type of BlockFilter component from
  'Void' to 'Any'
- bugfix in AliHLTComponent: handle component output type
  kAliHLTAnyDataType correctly

Updated list of classes

Modifications of the activation scheme for module agents and
the printout at component library loading

In order to activate only the agents of the library being loaded,
a check for library name and module id is applied. Works for
component libraries with agents following the naming scheme
libAliHLT<MOD>.so

Info messages have been adjusted to the needs in order to reduce
output. The full message is now only printed if the library
contains detailed build information from the HLT build system.

Revert commit 32313: back to 20 simulated events

Corrected protection

correct error parameterization for pad row cross

added function MakeSlice + fixed projection

Patch - reflection in case of GEANT4
(Andrei Gheata)

reset cluster's used flag (Markus)

Renaming AliHLTReconstructorBase to AliHLTPluginBase to reflect the
more common role. The change is backward campatible in order to run
macros of older AliRoot versions.

Adding the AliHLTPluginBase to AliHLTSimulation in order to support
definition of HLT chains within the same macro.

Incorporating chain definition into sim-hlt-tpc.C macro and deleting
separate conf-tpc-esd.C macro. Removing command line initialization
for magnetic field -> rely on OCDB object.

List of Changes:
AliTRDTrigger:
- new class as interface to CTP

AliTRD:
- create trigger detector
- add loader for GTU tracks

MCM Sim:
- separated tracklet calculation and writing
- added getters for raw and filtered data

GTU Sim:
- changed AliInfo -> AliDebug where appropriate

Don't propagate track outside of the TPC acceptance
(Marian)

Restored compilation

PID selection based on simple lambda cut, returns photon or pi0 ID instead of neutral hadron

Possibility to set the vertex smearing in AliITSVertexerFast via AliITSRecoParam, useful for debug purposes on MC simulations (F. Prino)

1) Added protection in correlation analysis classes, input AOD must be of the type AliAODPWG4ParticleCorrelation
2)AliAnaParticleHadronCorrelation: In case with correlation with pi0, pi0 found and stored in AOD. Configuration and Train macros updated accordingly.
3)AliAnaParticleJetLeadingConeCorrelation: Many bugs related to phi definition in TLorentzVectors corrected, added histograms with xi calculation for leading particles.

Add the eta and phi direction of the leading particle.

set eventespie for ESD and Recpoints data maker

correction naming of QA data object

add un-use functionality to clusters
modify z error parametrization for pad row cross tracklets

Corrected coding violations

cables and girders, modular geometry easy to turn off

Removing obsolete header file

Fix product method

In rootlogon.C
Adding ${ALICE_ROOT}/include in the include path
as it is needed in UpdateCDBCTPConfig.C macro.

Strict checking of external packages names.

coding conventions

Fix for insertion of #User comment when some package contains the name "User"

fix a gap in the output container population.

update post processing of momentum histograms (TPC, layer and species
wise)

Reverting change in r 29876 which caused seg faults under certain circumstances, aplying the appropriate correction to avoid the gcc warning
Matthias

esd->Get Vertex changed to esd->GetVertexTracks (A. Dainese)

Temporary protections, to be investigated in more details by the detector experts

Fix coding convention violations (Domenico, Mariella)

We should not delete what we do not own...

set the bits correctly

Preparing for GRID analysis by inserting energy distributions based on the production

Preparing for GRID analysis by inserting a background correction based on the production

debug output deleted

Adding a line referencing the macro(s) used to update the RecoParam in OCDB/MUON/Calib/RecoParam

Update related to rev 32327

Introducing a new OCDB object, MUON/Calib/KillMap, which allows to selectively
kill some tracker channels, based on initial analysis of the data.
(Laurent)

Number of TOF alignable volumes: correction. Old 1593 (strips). New 1611 (strips and SMs)

Number of TOF alignable volumes: correction. Old 1593 (strips). New 1611 (strips and SMs)

Warning message suppression in EquipmentId2VolumeId method: inserted control on crates, TRMs and TDCs connected to the TOF sensitive elements (pads)

Make sure that the histogram has at least 3 bins with entries in the fit region

add protection in case no recoparam

- move makeResults.C macro to "macros" directory
- improve file merging for large files
- adapt to the new storage scheme

add protection in case no recoparam

Vertex histogram binning in QA ESD changed to avoid small dips

Add option to use LCMS

Example macro to run ( not only) AliMCTrackinTestTask

(Marian)

Adding test for AliExternalTrackParam::Update
(Marian Ivanov)

QADataMaker gets the event specie fro AliDetectorRecoParam

QADataMaker gets the event specie fro AliDetectorRecoParam

Reduced QA output (Yves)

Updates needed for full jet reconstruction (charged + emcal) [Magali Estienne]

Fix in the histogram for the mathing efficiency in TOF (thanks to Chiara and Annalisa).

Updated alignment object

A fix in the initialization of iclusters array that generated a compilation warning (and also looked like a bug).

Pointer to AliAnalysisVertexingHF made persistent (needed to run with plugin)

Update production train (use AliEn plugin, added 4 prong, added like-sign 3 prong (Renu)

Removing unnecessary info lines

Removing unnecessary warning lines

New MUON Tracking DA splitted in two programs:
MUONTRKPEDda for pedestal runs and MUONTRKGAINda for calibration runs.
(Jean-Luc, Alberto)

Temporary bug fix (M. Siciliano)

Very important & added.

Added titles to the histogram axes

Retrenchment of TOF printout during (s)digitization steps

Save in-medium pathlength for Q-Pythia

Possibility to save values of integrals I0, I1

Store in-medium pathlength in case of run with quenching.

various updates in the resolution performance/calibration tasks

improve verbosity (suggested by Federico)

move reconstruction setup parameters to debug level 1 (asked by
Federico)

The new background correction task for the FMD. It can loop over galice input files and produces mergeable output. Work in progress.

moving information concerning loading of alignment objects per detector from AliInfo to AliDebug level 5

Move geometry message from normal execution to debug

Correction from Andrei

This is an upgrade to the FMD analysis which includes better sharing correction, collection of hits from the simulation (of present) and preparations for the ocde to run in AliEn. An analysis task to calculate the background in AliEn will be submitted shortly.

At the moment the pseudorapidity is calculated instead of being taken from the ESDs. I need to understand the differences I observe between these two before changing this.

In case no geometry pointer, a geometry has to be created in ConstructGeonmetry()

Be less verbose

Updated list of files

Adding new classes to be used in new MUON Tracking DA
splitted in two programs:
MUONTRKPEDda for pedestal runs and MUONTRKGAINda for calibration runs.
(Jean-Luc, Alberto)

minor

added uniform flow fluctuations

Revert changes from rev. 30849

Retuning of vertexer parameters for fPileupAlgo=1. Added trigger and magnetic field information to macro DoVerticesSPD.C (F.Prino)

Interface to AliMillePede2 for ITS alignment + related classes (R. Shaoyan)

Adding run types for ZDC.

compilation warnings corrected

Fixing a warning that was a bug

adding missing include

fix warning found by Federico...

Fixing the compilation warning