EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 Created one histogram for QA shifter;
  22 The idea:average counts for all the towers should be flat
  23 Change all existing histograms as experts
  24  --By Yaxian Mao
  25
  26 */
  27
  28 // --- ROOT system ---
  29 #include <TClonesArray.h>
  30 #include <TFile.h>
  31 #include <TH1F.h>
  32 #include <TH1I.h>
  33 #include <TH2F.h>
  34 #include <TProfile.h>
  35
  36 // --- Standard library ---
  37
  38
  39 // --- AliRoot header files ---
  40 #include "AliESDCaloCluster.h"
  41 #include "AliESDCaloCells.h"
  42 #include "AliESDEvent.h"
  43 #include "AliLog.h"
  44 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  45 #include "AliQAChecker.h"
  46 #include "AliEMCALDigit.h"
  47 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  48 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  49 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  50 #include "AliEMCALRecParam.h"
  51 #include "AliRawReader.h"
  52 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  53 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  54 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
  55
  56 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  57 #include "AliCaloFitResults.h"
  58 #include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
  59 #include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
  60 #include "AliCaloRawAnalyzerLMS.h"
  61 #include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
  62 #include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
  63
  64 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  65
  66 //____________________________________________________________________________
  67 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(fitAlgorithm fitAlgo) :
  68   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  69   fFittingAlgorithm(0),
  70   fRawAnalyzer(0),
  71   fRawAnalyzerTRU(0),
  72   fSuperModules(4), // FIXME!!! number of SuperModules; 4 for 2009; update default to 12 for later runs..
  73   fFirstPedestalSample(0),
  74   fLastPedestalSample(3),
  75   fFirstPedestalSampleTRU(0),
  76   fLastPedestalSampleTRU(3),
  77   fMinSignalLG(0),
  78   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  79   fMinSignalHG(0),
  80   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  81   fMinSignalTRU(0),
  82   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  83   fMinSignalLGLEDMon(0),
  84   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  85   fMinSignalHGLEDMon(0),
  86   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax)
  87 {
  88   // ctor
  89   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
  90   fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
  91   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
  92   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
  93 }
  94
  95 //____________________________________________________________________________
  96 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
  97   AliQADataMakerRec(),
  98   fFittingAlgorithm(0),
  99   fRawAnalyzer(0),
 100   fRawAnalyzerTRU(0),
 101   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()),
 102   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()),
 103   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),
 104   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()),
 105   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),
 106   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
 107   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
 108   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
 109   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
 110   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
 111   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
 112   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
 113   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
 114   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
 115   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon())
 116 {
 117   //copy ctor
 118   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
 119   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
 120   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
 121   fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
 122   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 123   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 124 }
 125
 126 //__________________________________________________________________
 127 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
 128 {
 129   // Equal operator.
 130   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
 131   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
 132   return *this;
 133 }
 134
 135 //____________________________________________________________________________
 136 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
 137 {
 138   //Detector specific actions at end of cycle
 139
 140 //  if(fCycleCounter)
 141 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
 142
 143   // do the QA checking
 144   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
 145 }
 146
 147 //____________________________________________________________________________
 148 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
 149 {
 150   //Create histograms to controll ESD
 151   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 152   const Bool_t image    = kTRUE ;
 153
 154   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ;
 155   h1->Sumw2() ;
 156   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
 157
 158   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
 159   h2->Sumw2() ;
 160   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 161
 162   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ;
 163   h3->Sumw2() ;
 164   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 165
 166   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 167   h4->Sumw2() ;
 168   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 169
 170 }
 171
 172 //____________________________________________________________________________
 173 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 174 {
 175   // create Digits histograms in Digits subdir
 176   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 177   const Bool_t image    = kTRUE ;
 178
 179   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 180   h0->Sumw2() ;
 181   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 182   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 183   h1->Sumw2() ;
 184   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 185 }
 186
 187 //____________________________________________________________________________
 188 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 189 {
 190   // create Reconstructed Points histograms in RecPoints subdir
 191   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 192   const Bool_t image    = kTRUE ;
 193
 194   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 195   h0->Sumw2();
 196   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 197
 198   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 199   h1->Sumw2();
 200   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 201
 202   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 203   h2->Sumw2();
 204   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 205
 206 }
 207
 208 //____________________________________________________________________________
 209 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 210 {
 211   // create Raws histograms in Raws subdir
 212    const Bool_t expert   = kTRUE ;
 213    const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 214    const Bool_t image    = kTRUE ;
 215
 216   int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 217   int nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 218
 219   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 220   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 221                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 222   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, image, !saveCorr) ;
 223   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 224                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 225   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, image, !saveCorr) ;
 226
 227   // where did max sample occur? (bins are towers)
 228   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 229                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 230   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, image, !saveCorr) ;
 231   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 232                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 233   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, image, !saveCorr) ;
 234
 235   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 236   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 237                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 238   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, image, !saveCorr) ;
 239   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 240                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 241   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, image, !saveCorr) ;
 242
 243   // total counter: channels per event
 244   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 245   h6->Sumw2() ;
 246   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, image, !saveCorr) ;
 247   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 248   h7->Sumw2() ;
 249   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, image, !saveCorr) ;
 250
 251   // pedestal (bins are towers)
 252   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 253                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 254   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, image, !saveCorr) ;
 255   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 256                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 257   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, image, !saveCorr) ;
 258
 259  //number of events per tower, for shifter fast check
 260   TH1I * h12 = new TH1I("hTowerHG", "High Gains on the Tower;Tower", nTot,0, nTot) ;
 261   h12->Sumw2() ;
 262   Add2RawsList(h12, kTowerHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 263   TH1I * h13 = new TH1I("hTowerLG", "Low Gains on the Tower;Tower", nTot,0, nTot) ;
 264   h13->Sumw2() ;
 265   Add2RawsList(h13, kTowerLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 266
 267   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 268   int nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 269
 270   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 271   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 272                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 273   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, image, !saveCorr) ;
 274
 275   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
 276   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]",
 277                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 278   Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, expert, image, !saveCorr) ;
 279
 280   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 281   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 282                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 283   Add2RawsList(hT2, kSigTRU, expert, image, !saveCorr) ;
 284
 285   // total counter: channels per event
 286   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 287   hT3->Sumw2() ;
 288   Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, expert, image, !saveCorr) ;
 289
 290   // pedestal (bins are TRU channels)
 291   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]",
 292                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 293   Add2RawsList(hT4, kPedTRU, expert, image, !saveCorr) ;
 294
 295   // and also LED Mon..
 296   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 297   int nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 298
 299   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 300   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 301                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 302   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 303   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 304                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 305   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 306
 307   // where did max sample occur? (bins are strips)
 308   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 309                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 310   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 311   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 312                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 313   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 314
 315   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 316   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 317                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 318   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 319   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 320                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 321   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 322
 323   // total counter: channels per event
 324   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 325   hL6->Sumw2() ;
 326   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 327   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 328   hL7->Sumw2() ;
 329   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 330
 331   // pedestal (bins are strips)
 332   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 333                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 334   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 335   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 336                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 337   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
 338
 339 }
 340
 341 //____________________________________________________________________________
 342 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 343 {
 344   // make QA data from ESDs
 345
 346   Int_t nTot = 0 ;
 347   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 348     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 349     if( clu->IsEMCAL() ) {
 350       GetESDsData(kESDCaloClusE)->Fill(clu->E()) ;
 351       nTot++ ;
 352     }
 353   }
 354   GetESDsData(kESDCaloClusM)->Fill(nTot) ;
 355
 356   //fill calo cells
 357   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 358   GetESDsData(kESDCaloCellM)->Fill(cells->GetNumberOfCells()) ;
 359
 360   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 361     GetESDsData(kESDCaloCellA)->Fill(cells->GetAmplitude(index)) ;
 362   }
 363
 364 }
 365
 366 //____________________________________________________________________________
 367 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 368 {
 369   //Fill prepared histograms with Raw digit properties
 370
 371   // setup
 372   rawReader->Reset() ;
 373   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 374   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's
 375
 376   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
 377   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) {
 378     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
 379   }
 380
 381   fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed(true); // TMP - should use stream->IsZeroSuppressed(), or altro cfg registers later
 382
 383   int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 384   int nRows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 385   int nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 386   int n2x2PerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 387
 388   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 389   int nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 390   int nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 391   int nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 392   int nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 393   int nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 394
 395   // start loop over input stream
 396   int iSM = 0;
 397   while (in.NextDDL()) {
 398     iSM = in.GetModule(); // SuperModule
 399     if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
 400
 401       int iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
 402
 403       while (in.NextChannel()) {
 404
 405         int nsamples = 0;
 406         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist;
 407         while (in.NextBunch()) {
 408           nsamples += in.GetBunchLength();
 409           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
 410         }
 411
 412         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
 413           Float_t time = 0;
 414           Float_t amp = 0;
 415           // indices for pedestal calc.
 416           int firstPedSample = 0;
 417           int lastPedSample = 0;
 418
 419           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling
 420             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 421             amp = fitResults.GetAmp();
 422             time = fitResults.GetTof();
 423             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
 424             lastPedSample = fLastPedestalSample;
 425           }
 426           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
 427             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 428             amp = fitResults.GetAmp();
 429             time = fitResults.GetTof();
 430             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
 431             lastPedSample = fLastPedestalSampleTRU;
 432           }
 433
 434           // pedestal samples
 435           int nPed = 0;
 436           UShort_t *pedSamples = 0;
 437
 438           // select earliest bunch
 439           unsigned int bunchIndex = 0;
 440           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
 441           if (bunchlist.size() > 0) {
 442             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
 443               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
 444                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
 445                 bunchIndex = ui;
 446               }
 447             }
 448           }
 449
 450           // check bunch for entries in the pedestal sample range
 451           int bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength();
 452           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
 453           int timebin = 0;
 454           for (int i = 0; i<bunchLength; i++) {
 455             timebin = startBin--;
 456             if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
 457               pedSamples[nPed] = sig[i];
 458               nPed++;
 459             }
 460           } // i
 461
 462           // fill histograms
 463           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 464             int towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 465
 466             if ( in.IsLowGain() ) {
 467               nTotalSMLG[iSM]++;
 468               GetRawsData(kTowerLG)->Fill(towerId);
 469               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) {
 470                 GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, amp);
 471                 GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, time);
 472               }
 473               if (nPed > 0) {
 474                 for (int i=0; i<nPed; i++) {
 475                   GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
 476                 }
 477               }
 478             } // gain==0
 479             else if ( in.IsHighGain() ) {
 480               nTotalSMHG[iSM]++;
 481               GetRawsData(kTowerHG)->Fill(towerId);
 482               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) {
 483                 GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, amp);
 484                 GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, time);
 485               }
 486               if (nPed > 0) {
 487                 for (int i=0; i<nPed; i++) {
 488                   GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
 489                 }
 490               }
 491             } // gain==1
 492           } // low or high gain
 493           // TRU
 494           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
 495             // for TRU data, the mapping class holds the TRU internal 2x2 number (0..95) in the Column var..
 496             int iTRU = iRCU; //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1
 497             if (iRCU>0 && in.GetBranch()>0) iTRU=2; // TRU2 is from branch B on RCU1
 498             int iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU
 499               + in.GetColumn();
 500
 501             nTotalSMTRU[iSM]++;
 502             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) {
 503               GetRawsData(kSigTRU)->Fill(iTRU2x2Id, amp);
 504               GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(iTRU2x2Id, time);
 505             }
 506             if (nPed > 0) {
 507               for (int i=0; i<nPed; i++) {
 508                 GetRawsData(kPedTRU)->Fill(iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
 509               }
 510             }
 511           }
 512           // LED Mon
 513           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 514             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 515             // and the Strip number in the Column..
 516             int gain = in.GetRow();
 517             int stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 518
 519             if ( gain == 0 ) {
 520               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++;
 521               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) {
 522                 GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
 523                 GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, time);
 524               }
 525               if (nPed > 0) {
 526                 for (int i=0; i<nPed; i++) {
 527                   GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
 528                 }
 529               }
 530             } // gain==0
 531             else if ( gain == 1 ) {
 532               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++;
 533               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) {
 534                 GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
 535                 GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, time);
 536               }
 537               if (nPed > 0) {
 538                 for (int i=0; i<nPed; i++) {
 539                   GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
 540                 }
 541               }
 542             } // low or high gain
 543           } // LEDMon
 544
 545         } // SM index OK
 546
 547       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
 548     }// end while over channel
 549
 550   }//end while over DDL's, of input stream
 551
 552   // let's also fill the SM and event counter histograms
 553   int nTotalHG = 0;
 554   int nTotalLG = 0;
 555   int nTotalTRU = 0;
 556   int nTotalHGLEDMon = 0;
 557   int nTotalLGLEDMon = 0;
 558   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 559     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 560     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 561     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 562     nTotalLG += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 563     nTotalHG += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 564     GetRawsData(kNsmodLG)->Fill(iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 565     GetRawsData(kNsmodHG)->Fill(iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 566     GetRawsData(kNsmodTRU)->Fill(iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 567     GetRawsData(kNsmodLGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 568     GetRawsData(kNsmodHGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 569   }
 570
 571   GetRawsData(kNtotLG)->Fill(nTotalLG);
 572   GetRawsData(kNtotHG)->Fill(nTotalHG);
 573   GetRawsData(kNtotTRU)->Fill(nTotalTRU);
 574   GetRawsData(kNtotLGLEDMon)->Fill(nTotalLGLEDMon);
 575   GetRawsData(kNtotHGLEDMon)->Fill(nTotalHGLEDMon);
 576
 577   SetEventSpecie(saveSpecie) ;
 578   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 579   rawReader->Reset() ;
 580
 581   return;
 582 }
 583
 584 //____________________________________________________________________________
 585 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 586 {
 587   // makes data from Digits
 588
 589   GetDigitsData(1)->Fill(fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 590   TIter next(fDigitsArray) ;
 591   AliEMCALDigit * digit ;
 592   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 593     GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmp()) ;
 594   }
 595
 596 }
 597
 598 //____________________________________________________________________________
 599 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 600 {
 601   // makes data from Digit Tree
 602   if (fDigitsArray)
 603     fDigitsArray->Clear() ;
 604   else
 605     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 606
 607   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 608   if ( ! branch ) {
 609     AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found") ;
 610   } else {
 611     branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 612     branch->GetEntry(0) ;
 613     MakeDigits() ;
 614   }
 615
 616 }
 617
 618 //____________________________________________________________________________
 619 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 620 {
 621   // makes data from RecPoints
 622   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 623   if (!emcbranch) {
 624     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 625     return;
 626   }
 627
 628   TObjArray * emcrecpoints = new TObjArray(100) ;
 629   emcbranch->SetAddress(&emcrecpoints);
 630   emcbranch->GetEntry(0);
 631
 632   GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcrecpoints->GetEntriesFast()) ;
 633   TIter next(emcrecpoints) ;
 634   AliEMCALRecPoint * rp ;
 635   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 636     GetRecPointsData(kRecPE)->Fill( rp->GetEnergy()) ;
 637     GetRecPointsData(kRecPDigM)->Fill(rp->GetMultiplicity());
 638   }
 639   emcrecpoints->Delete();
 640   delete emcrecpoints;
 641
 642 }
 643
 644 //____________________________________________________________________________
 645 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 646 {
 647   //Detector specific actions at start of cycle
 648
 649 }
 650
 651 //____________________________________________________________________________
 652 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)
 653 {
 654   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
 655   //printf("**** Set Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
 656
 657   if(fitAlgo == fFittingAlgorithm && fRawAnalyzer) {
 658     //Do nothing, this same algorithm already set before.
 659     //printf("**** Algorithm already set before, number %d, %s ****\n",fitAlgo, fRawAnalyzer->GetName());
 660     return;
 661   }
 662   //Initialize the requested algorithm
 663   if(fitAlgo != fFittingAlgorithm || !fRawAnalyzer) {
 664     //printf("**** Init Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
 665
 666     fFittingAlgorithm = fitAlgo;
 667     if (fRawAnalyzer) delete fRawAnalyzer;  // delete prev. analyzer if existed.
 668
 669     if (fitAlgo == kFastFit) {
 670       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerFastFit();
 671     }
 672     else if (fitAlgo == kNeuralNet) {
 673       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerNN();
 674     }
 675     else if (fitAlgo == kLMS) {
 676       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
 677     }
 678     else if (fitAlgo == kPeakFinder) {
 679       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerPeakFinder();
 680     }
 681     else if (fitAlgo == kCrude) {
 682       fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerCrude();
 683     }
 684     else {
 685       AliWarning("EMCAL QA invalid fit algorithm choice") ;
 686     }
 687
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