PHOS/AliPHOSDigitizer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //*-- Author :  Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  20 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  21 // This TTask performs digitization of Summable digits (in the PHOS case it is just
  22 // the sum of contributions from all primary particles into a given cell).
  23 // In addition it performs mixing of summable digits from different events.
  24 // The name of the TTask is also the title of the branch that will contain
  25 // the created SDigits
  26 // The title of the TTAsk is the name of the file that contains the hits from
  27 // which the SDigits are created
  28 //
  29 // For each event two branches are created in TreeD:
  30 //   "PHOS" - list of digits
  31 //   "AliPHOSDigitizer" - AliPHOSDigitizer with all parameters used in digitization
  32 //
  33 // Note, that one can set a title for new digits branch, and repeat digitization with
  34 // another set of parameters.
  35 //
  36 // Use case:
  37 // root[0] AliPHOSDigitizer * d = new AliPHOSDigitizer() ;
  38 // root[1] d->ExecuteTask()
  39 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  40 //                       //Digitizes SDigitis in all events found in file galice.root
  41 //
  42 // root[2] AliPHOSDigitizer * d1 = new AliPHOSDigitizer("galice1.root") ;
  43 //                       // Will read sdigits from galice1.root
  44 // root[3] d1->MixWith("galice2.root")
  45 // Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  46 //                       // Reads another set of sdigits from galice2.root
  47 // root[3] d1->MixWith("galice3.root")
  48 //                       // Reads another set of sdigits from galice3.root
  49 // root[4] d->ExecuteTask("deb timing")
  50 //                       // Reads SDigits from files galice1.root, galice2.root ....
  51 //                       // mixes them and stores produced Digits in file galice1.root
  52 //                       // deb - prints number of produced digits
  53 //                       // deb all - prints list of produced digits
  54 //                       // timing  - prints time used for digitization
  55 //
  56
  57 // --- ROOT system ---
  58 #include "TFile.h"
  59 #include "TTree.h"
  60 #include "TSystem.h"
  61 #include "TROOT.h"
  62 #include "TFolder.h"
  63 #include "TObjString.h"
  64 #include "TGeometry.h"
  65 #include "TBenchmark.h"
  66
  67 // --- Standard library ---
  68 #include <iomanip.h>
  69
  70 // --- AliRoot header files ---
  71
  72 #include "AliRun.h"
  73 #include "AliHeader.h"
  74 #include "AliRunDigitizer.h"
  75 #include "AliPHOSDigit.h"
  76 #include "AliPHOS.h"
  77 #include "AliPHOSGetter.h"
  78 #include "AliPHOSDigitizer.h"
  79 #include "AliPHOSSDigitizer.h"
  80 #include "AliPHOSGeometry.h"
  81 #include "AliPHOSTick.h"
  82
  83 ClassImp(AliPHOSDigitizer)
  84
  85
  86 //____________________________________________________________________________
  87   AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer()
  88 {
  89   // ctor
  90
  91   fPinNoise           = 0.004 ;
  92   fEMCDigitThreshold  = 0.012 ;
  93   fCPVNoise           = 0.01;
  94   fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
  95   fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
  96   fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
  97   fDigitsInRun  = 0 ;
  98   fADCchanelEmc = 0.0015;        // width of one ADC channel in GeV
  99   fADCpedestalEmc = 0.005 ;      //
 100   fNADCemc = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in EMC ADC
 101
 102   fADCchanelCpv = 0.0012 ;          // width of one ADC channel in CPV 'popugais'
 103   fADCpedestalCpv = 0.012 ;         //
 104   fNADCcpv = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in CPV ADC
 105
 106   fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
 107   fManager = 0 ;                        // We work in the standalong mode
 108 }
 109
 110 //____________________________________________________________________________
 111 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(const char *headerFile,const char * name)
 112 {
 113   // ctor
 114   SetName(name) ;
 115   SetTitle(headerFile) ;
 116   fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
 117   Init() ;
 118
 119 }
 120
 121 //____________________________________________________________________________
 122 AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(AliRunDigitizer * ard):AliDigitizer(ard)
 123 {
 124   // ctor
 125   SetName("");     //Will call init in the digitizing
 126   SetTitle("aliroot") ;
 127 }
 128
 129 //____________________________________________________________________________
 130   AliPHOSDigitizer::~AliPHOSDigitizer()
 131 {
 132   // dtor
 133
 134
 135 }
 136
 137 //____________________________________________________________________________
 138 void AliPHOSDigitizer::Digitize(const Int_t event)
 139 {
 140
 141   // Makes the digitization of the collected summable digits.
 142   //  It first creates the array of all PHOS modules
 143   //  filled with noise (different for EMC, CPV and PPSD) and
 144   //  then adds contributions from SDigits.
 145   // This design avoids scanning over the list of digits to add
 146   // contribution to new SDigits only.
 147
 148   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 149   TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 150
 151   digits->Clear() ;
 152
 153   const AliPHOSGeometry *geom = gime->PHOSGeometry() ;
 154
 155   //Making digits with noise, first EMC
 156   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
 157
 158   Int_t nCPV ;
 159   Int_t absID ;
 160   TString name      =  geom->GetName() ;
 161
 162   nCPV = nEMC + geom->GetNumberOfCPVPadsZ()*geom->GetNumberOfCPVPadsPhi()*
 163     geom->GetNModules() ;
 164
 165   digits->Expand(nCPV) ;
 166
 167   // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
 168   const AliPHOSSDigitizer * sDigitizer = gime->SDigitizer(GetName());
 169   if ( !sDigitizer) {
 170     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::Digitize -> SDigitizer with name " << GetName() << " not found " << endl ;
 171     abort() ;
 172   }
 173
 174   // loop through the sdigits posted to the White Board and add them to the noise
 175   TCollection * folderslist = gime->SDigitsFolder()->GetListOfFolders() ;
 176   TIter next(folderslist) ;
 177   TFolder * folder = 0 ;
 178   TClonesArray * sdigits = 0 ;
 179   Int_t input = 0 ;
 180   TObjArray * sdigArray = new TObjArray(2) ;
 181   while ( (folder = (TFolder*)next()) )
 182     if ( (sdigits = (TClonesArray*)folder->FindObject(GetName()) ) ) {
 183       TString fileName(folder->GetName()) ;
 184       fileName.ReplaceAll("_","/") ;
 185       cout << "INFO: AliPHOSDigitizer::Digitize -> Adding SDigits "
 186            << GetName() << " from " << fileName << endl ;
 187       sdigArray->AddAt(sdigits, input) ;
 188       input++ ;
 189     }
 190
 191   //Find the first crystall with signal
 192   Int_t nextSig = 200000 ;
 193   Int_t i;
 194   for(i=0; i<input; i++){
 195     sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
 196     if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
 197       continue ;
 198     Int_t curNext = ((AliPHOSDigit *)sdigits->At(0))->GetId() ;
 199      if(curNext < nextSig)
 200        nextSig = curNext ;
 201   }
 202
 203   TArrayI index(input) ;
 204   index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
 205
 206   AliPHOSDigit * digit ;
 207   AliPHOSDigit * curSDigit ;
 208
 209   TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliPHOSTick",1000) ;
 210
 211   //Put Noise contribution
 212   for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
 213     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise) ;
 214     new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
 215     //look if we have to add signal?
 216     digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(absID-1) ;
 217
 218     if(absID==nextSig){
 219       //Add SDigits from all inputs
 220       ticks->Clear() ;
 221       Int_t contrib = 0 ;
 222       Float_t a = digit->GetAmp() ;
 223       Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
 224       //Mark the beginnign of the signal
 225       new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime(),0, b);
 226       //Mark the end of the ignal
 227       new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 228
 229       //loop over inputs
 230       for(i=0; i<input; i++){
 231         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 232           curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 233         else
 234           curSDigit = 0 ;
 235         //May be several digits will contribute from the same input
 236         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 237           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 238           Int_t primaryoffset ;
 239           if(fManager)
 240             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 241           else
 242             primaryoffset = 10000000*i ;
 243           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 244
 245           a = curSDigit->GetAmp() ;
 246           b = a /fTimeSignalLength ;
 247           new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime(),0, b);
 248           new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b);
 249
 250           *digit = *digit + *curSDigit ;  //add energies
 251
 252           index[i]++ ;
 253           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 254             curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 255           else
 256             curSDigit = 0 ;
 257         }
 258       }
 259
 260       //calculate and set time
 261       Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
 262       digit->SetTime(time) ;
 263
 264       //Find next signal module
 265       nextSig = 200000 ;
 266       for(i=0; i<input; i++){
 267         sdigits = ((TClonesArray *)sdigArray->At(i)) ;
 268         Int_t curNext = nextSig ;
 269         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
 270           curNext = ((AliPHOSDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
 271
 272         }
 273         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 274       }
 275     }
 276   }
 277
 278   ticks->Delete() ;
 279   delete ticks ;
 280
 281
 282   //Now CPV digits (different noise and no timing)
 283   for(absID = nEMC+1; absID <= nCPV; absID++){
 284     Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fCPVNoise) ;
 285     new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
 286     //look if we have to add signal?
 287     if(absID==nextSig){
 288       digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(absID-1) ;
 289       //Add SDigits from all inputs
 290       for(i=0; i<input; i++){
 291         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 292           curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 293         else
 294           curSDigit = 0 ;
 295
 296         //May be several digits will contribute from the same input
 297         while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){
 298           //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
 299           Int_t primaryoffset ;
 300           if(fManager)
 301             primaryoffset = fManager->GetMask(i) ;
 302           else
 303             primaryoffset = 10000000*i ;
 304           curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
 305
 306           //add energies
 307           *digit = *digit + *curSDigit ;
 308           index[i]++ ;
 309           if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
 310             curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;
 311           else
 312             curSDigit = 0 ;
 313         }
 314       }
 315
 316       //Find next signal module
 317       nextSig = 200000 ;
 318       for(i=0; i<input; i++){
 319         sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
 320         Int_t curNext = nextSig ;
 321         if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] )
 322           curNext = ((AliPHOSDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
 323         if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
 324       }
 325
 326     }
 327   }
 328   delete sdigArray ; //We should not delete its contents
 329
 330
 331
 332   //remove digits below thresholds
 333   for(i = 0; i < nEMC ; i++){
 334     digit = (AliPHOSDigit*) digits->At(i) ;
 335     if(sDigitizer->Calibrate( digit->GetAmp() ) < fEMCDigitThreshold)
 336       digits->RemoveAt(i) ;
 337     else
 338       digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
 339   }
 340
 341
 342   for(i = nEMC; i < nCPV ; i++)
 343     if(sDigitizer->Calibrate(((AliPHOSDigit*)digits->At(i))->GetAmp()) < fCPVDigitThreshold)
 344       digits->RemoveAt(i) ;
 345
 346   digits->Compress() ;
 347
 348   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
 349   digits->Expand(ndigits) ;
 350
 351   //Set indexes in list of digits and make true digitization of the energy
 352   for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) {
 353     AliPHOSDigit * digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(i) ;
 354     digit->SetIndexInList(i) ;
 355     Float_t energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
 356     digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy,digit->GetId()) ) ;
 357   }
 358
 359 }
 360 //____________________________________________________________________________
 361 Int_t AliPHOSDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t absId)
 362 {
 363   Int_t chanel ;
 364   if(absId <= fEmcCrystals){ //digitize as EMC
 365     chanel = (Int_t) TMath::Ceil((energy - fADCpedestalEmc)/fADCchanelEmc) ;
 366     if(chanel > fNADCemc ) chanel =  fNADCemc ;
 367   }
 368   else{ //Digitize as CPV
 369     chanel = (Int_t) TMath::Ceil((energy - fADCpedestalCpv)/fADCchanelCpv) ;
 370     if(chanel > fNADCcpv ) chanel =  fNADCcpv ;
 371   }
 372   return chanel ;
 373 }
 374 //____________________________________________________________________________
 375 void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option)
 376 {
 377   // Managing method
 378
 379   if(strcmp(GetName(), "") == 0 )
 380     Init() ;
 381
 382   if (strstr(option,"print")) {
 383     Print("");
 384     return ;
 385   }
 386
 387   if(strstr(option,"tim"))
 388     gBenchmark->Start("PHOSDigitizer");
 389
 390   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 391
 392   Int_t nevents ;
 393
 394   TTree * treeD ;
 395
 396   if(fManager){
 397     treeD = fManager->GetTreeD() ;
 398     nevents = 1 ;    // Will process only one event
 399   }
 400   else {
 401     gAlice->GetEvent(0) ;
 402     nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
 403     treeD=gAlice->TreeD() ;
 404   }
 405
 406
 407   //Check, if this branch already exits
 408   if (treeD) {
 409     TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
 410     TIter next(lob) ;
 411     TBranch * branch = 0 ;
 412     Bool_t phosfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ;
 413
 414     while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phosfound || !digitizerfound) ) {
 415       if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOS")==0) &&
 416            (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 417         phosfound = kTRUE ;
 418
 419       else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSDigitizer")==0) &&
 420                 (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) )
 421         digitizerfound = kTRUE ;
 422     }
 423
 424     if ( phosfound ) {
 425       cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digits branch with name " << GetName()
 426            << " already exits" << endl ;
 427       return ;
 428     }
 429     if ( digitizerfound ) {
 430       cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName()
 431            << " already exits" << endl ;
 432       return ;
 433     }
 434   }
 435
 436   Int_t ievent ;
 437
 438   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
 439
 440     if(fManager){
 441       Int_t input ;
 442       for(input = 0 ; input < fManager->GetNinputs(); input ++){
 443         TTree * treeS = fManager->GetInputTreeS(input) ;
 444         if(!treeS){
 445           cerr << "AliPHOSDigitizer -> No Input " << endl ;
 446           return ;
 447         }
 448         gime->ReadTreeS(treeS,input) ;
 449       }
 450     }
 451     else
 452       gime->Event(ievent,"S") ;
 453
 454     Digitize(ievent) ; //Add prepared SDigits to digits and add the noise
 455
 456     WriteDigits(ievent) ;
 457
 458     if(strstr(option,"deb"))
 459       PrintDigits(option);
 460
 461     //increment the total number of Digits per run
 462     fDigitsInRun += gime->Digits()->GetEntriesFast() ;
 463   }
 464
 465   if(strstr(option,"tim")){
 466     gBenchmark->Stop("PHOSDigitizer");
 467     cout << "AliPHOSDigitizer:" << endl ;
 468     cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSDigitizer") << " seconds for Digitizing "
 469          <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSDigitizer")/nevents << " seconds per event " << endl ;
 470     cout << endl ;
 471   }
 472
 473 }
 474
 475 //____________________________________________________________________________
 476 Float_t AliPHOSDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks)
 477 { //
 478   ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
 479   TIter it(ticks) ;
 480   AliPHOSTick * ctick = (AliPHOSTick *) it.Next() ;
 481   Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 482
 483   AliPHOSTick * t ;
 484   while((t=(AliPHOSTick*) it.Next())){
 485     if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
 486       *ctick+=*t ;
 487     else
 488       return time ;
 489
 490     time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;
 491   }
 492   return time ;
 493 }
 494 //____________________________________________________________________________
 495 Bool_t AliPHOSDigitizer::Init()
 496 {
 497   fPinNoise           = 0.004 ;
 498   fEMCDigitThreshold  = 0.012 ;
 499   fCPVNoise           = 0.01;
 500   fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
 501   fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
 502   fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
 503   fDigitsInRun  = 0 ;
 504   fADCchanelEmc = 0.0015;        // width of one ADC channel in GeV
 505   fADCpedestalEmc = 0.005 ;      //
 506   fNADCemc = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in EMC ADC
 507
 508   fADCchanelCpv = 0.0012 ;          // width of one ADC channel in CPV 'popugais'
 509   fADCpedestalCpv = 0.012 ;         //
 510   fNADCcpv = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in CPV ADC
 511
 512   fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
 513
 514   if(fManager)
 515     SetTitle("aliroot") ;
 516   else if (strcmp(GetTitle(),"")==0)
 517    SetTitle("galice.root") ;
 518
 519   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 520     SetName("Default") ;
 521
 522   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(), GetName()) ;
 523   if ( gime == 0 ) {
 524     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ;
 525     return kFALSE;
 526   }
 527
 528   const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
 529   fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
 530
 531   // Post Digits to the white board
 532   gime->PostDigits(GetName() ) ;
 533
 534   // Post Digitizer to the white board
 535   gime->PostDigitizer(this) ;
 536
 537   //Mark that we will use current header file
 538   if(!fManager){
 539     gime->PostSDigits(GetName(),GetTitle()) ;
 540     gime->PostSDigitizer(GetName(),GetTitle()) ;
 541   }
 542   return kTRUE ;
 543 }
 544
 545 //__________________________________________________________________
 546 void AliPHOSDigitizer::MixWith(const char* headerFile)
 547 {
 548   // Allows to produce digits by superimposing background and signal event.
 549   // It is assumed, that headers file with SIGNAL events is opened in
 550   // the constructor.
 551   // Sets the BACKGROUND event, with which the SIGNAL event is to be mixed
 552   // Thus we avoid writing (changing) huge and expensive
 553   // backgound files: all output will be writen into SIGNAL, i.e.
 554   // opened in constructor file.
 555   //
 556   // One can open as many files to mix with as one needs.
 557   // However only Sdigits with the same name (i.e. constructed with the same SDigitizer)
 558   // can be mixed.
 559
 560   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 561     Init() ;
 562
 563   if(fManager){
 564     cout << "Can not use this method under AliRunDigitizer " << endl ;
 565     return ;
 566   }
 567
 568   // check if the specified SDigits do not already exist on the White Board:
 569   // //Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits/headerFile/sdigitsname
 570
 571   TString path = "Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits" ;
 572   path += headerFile ;
 573   path += "/" ;
 574   path += GetName() ;
 575   if ( gROOT->FindObjectAny(path.Data()) ) {
 576     cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer::MixWith -> Entry already exists, do not add" << endl ;
 577     return;
 578   }
 579
 580   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 581   gime->PostSDigits(GetName(),headerFile) ;
 582
 583   // check if the requested file is already open or exist and if SDigits Branch exist
 584   TFile * file = (TFile*)gROOT->FindObject(headerFile);
 585   if ( !file ) {
 586     file = new TFile(headerFile, "READ") ;
 587     if (!file) {
 588       cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::MixWith -> File " << headerFile << " does not exist!" << endl ;
 589       return ;
 590     }
 591   }
 592
 593 }
 594
 595 //__________________________________________________________________
 596 void AliPHOSDigitizer::SetSplitFile(const TString splitFileName) const
 597 {
 598   // Diverts the Digits in a file separate from the hits file
 599
 600   // I guess it is not going to work if we do merging
 601   if (fManager) {
 602     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> Not yet available in case of merging activated " << endl ;
 603     return ;
 604   }
 605
 606   TDirectory * cwd = gDirectory ;
 607   TFile * splitFile = gAlice->InitTreeFile("D",splitFileName.Data());
 608   splitFile->cd() ;
 609   if ( !splitFile->Get("gAlice") )
 610     gAlice->Write();
 611
 612   TTree *treeE  = gAlice->TreeE();
 613   if (!treeE) {
 614     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> No TreeE found "<<endl;
 615     abort() ;
 616   }
 617
 618   // copy TreeE
 619   if ( !splitFile->Get("TreeE") ) {
 620     AliHeader *header = new AliHeader();
 621     treeE->SetBranchAddress("Header", &header);
 622     treeE->SetBranchStatus("*",1);
 623     TTree *treeENew =  treeE->CloneTree();
 624     treeENew->Write();
 625   }
 626
 627   // copy AliceGeom
 628   if ( !splitFile->Get("AliceGeom") ) {
 629     TGeometry *AliceGeom = static_cast<TGeometry*>(cwd->Get("AliceGeom"));
 630     if (!AliceGeom) {
 631       cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> AliceGeom was not found in the input file "<<endl;
 632       abort() ;
 633     }
 634     AliceGeom->Write();
 635   }
 636
 637   cwd->cd() ;
 638   gAlice->MakeTree("D",splitFile);
 639   cout << "INFO: AliPHOSDigitizer::SetSPlitMode -> Digits will be stored in " << splitFileName.Data() << endl ;
 640 }
 641
 642 //__________________________________________________________________
 643 void AliPHOSDigitizer::Print(Option_t* option)const {
 644   // Print Digitizer's parameters
 645   if( strcmp(GetName(), "") != 0 ){
 646
 647     cout << "------------------- "<< GetName() << " -------------" << endl ;
 648     cout << "Digitizing sDigits from file(s): " <<endl ;
 649
 650      TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits"))->GetListOfFolders() ;
 651     TIter next(folderslist) ;
 652     TFolder * folder = 0 ;
 653
 654     while ( (folder = (TFolder*)next()) ) {
 655       if ( folder->FindObject(GetName())  )
 656         cout << "Adding SDigits " << GetName() << " from " << folder->GetName() << endl ;
 657     }
 658     cout << endl ;
 659     cout << "Writing digits to " << GetTitle() << endl ;
 660
 661     cout << endl ;
 662     cout << "With following parameters: " << endl ;
 663     cout << "     Electronics noise in EMC (fPinNoise) = " << fPinNoise << endl ;
 664     cout << "  Threshold  in EMC  (fEMCDigitThreshold) = " << fEMCDigitThreshold  << endl ; ;
 665     cout << "                 Noise in CPV (fCPVNoise) = " << fCPVNoise << endl ;
 666     cout << "    Threshold in CPV (fCPVDigitThreshold) = " << fCPVDigitThreshold << endl ;
 667     cout << "---------------------------------------------------" << endl ;
 668   }
 669   else
 670     cout << "AliPHOSDigitizer not initialized " << endl ;
 671
 672 }
 673
 674 //__________________________________________________________________
 675 void AliPHOSDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
 676   // Print a table of digits
 677
 678   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 679   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 680
 681   cout << "AliPHOSDigitiser: event " << gAlice->GetEvNumber() << endl ;
 682   cout << "       Number of entries in Digits list " << digits->GetEntriesFast() << endl ;
 683   cout << endl ;
 684   if(strstr(option,"all")||strstr(option,"EMC")){
 685
 686     //loop over digits
 687     AliPHOSDigit * digit;
 688     cout << "EMC digits (with primaries): " << endl ;
 689     cout << "Digit Id     Amplitude   Index       Nprim  Primaries list " <<  endl;
 690     Int_t maxEmc = gime->PHOSGeometry()->GetNModules()*gime->PHOSGeometry()->GetNCristalsInModule() ;
 691     Int_t index ;
 692     for (index = 0 ; (index < digits->GetEntriesFast()) &&
 693          (((AliPHOSDigit * )  digits->At(index))->GetId() <= maxEmc) ; index++) {
 694       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
 695       if(digit->GetNprimary() == 0) continue;
 696       cout << setw(6)  <<  digit->GetId() << "   "  <<  setw(10)  <<  digit->GetAmp() <<   "    "
 697            << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "    "
 698            << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"    ";
 699
 700       Int_t iprimary;
 701       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
 702         cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << "    ";
 703       cout << endl;
 704     }
 705     cout << endl;
 706   }
 707
 708   if(strstr(option,"all")||strstr(option,"CPV")){
 709
 710     //loop over CPV digits
 711     AliPHOSDigit * digit;
 712     cout << "CPV digits: " << endl ;
 713     cout << "Digit Id     Amplitude   Index       Nprim  Primaries list " <<  endl;
 714     Int_t maxEmc = gime->PHOSGeometry()->GetNModules()*gime->PHOSGeometry()->GetNCristalsInModule() ;
 715     Int_t index ;
 716     for (index = 0 ; index < digits->GetEntriesFast(); index++) {
 717       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
 718       if(digit->GetId() > maxEmc){
 719         cout << setw(6)  <<  digit->GetId() << "   "  <<        setw(10)  <<  digit->GetAmp() <<   "    "
 720              << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "    "
 721              << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"    ";
 722
 723         Int_t iprimary;
 724         for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
 725           cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << "    ";
 726         cout << endl;
 727       }
 728     }
 729   }
 730
 731 }
 732
 733 //__________________________________________________________________
 734 void AliPHOSDigitizer::SetSDigitsBranch(const char* title)
 735 {
 736   // we set title (comment) of the SDigits branch in the first! header file
 737   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 738     Init() ;
 739
 740   AliPHOSGetter::GetInstance()->SDigits()->SetName(title) ;
 741
 742 }
 743 //__________________________________________________________________
 744 Float_t AliPHOSDigitizer::TimeOfNoise(void)
 745 {  // Calculates the time signal generated by noise
 746   //to be rewritten, now returns just big number
 747   return 1. ;
 748
 749 }
 750 //____________________________________________________________________________
 751 void AliPHOSDigitizer::Reset()
 752 {
 753   // sets current event number to the first simulated event
 754
 755   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
 756     Init() ;
 757
 758  //  Int_t inputs ;
 759 //   for(inputs = 0; inputs < fNinputs ;inputs++)
 760 //       fIevent->AddAt(-1, inputs ) ;
 761
 762 }
 763
 764 //____________________________________________________________________________
 765 void AliPHOSDigitizer::WriteDigits(Int_t event)
 766 {
 767
 768   // Makes TreeD in the output file.
 769   // Check if branch already exists:
 770   //   if yes, exit without writing: ROOT TTree does not support overwriting/updating of
 771   //      already existing branches.
 772   //   else creates branch with Digits, named "PHOS", title "...",
 773   //      and branch "AliPHOSDigitizer", with the same title to keep all the parameters
 774   //      and names of files, from which digits are made.
 775
 776   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
 777   const TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ;
 778  TTree * treeD ;
 779
 780
 781  if(fManager)
 782    treeD = fManager->GetTreeD() ;
 783  else {
 784    if (!gAlice->TreeD() )
 785      gAlice->MakeTree("D");
 786    treeD = gAlice->TreeD();
 787  }
 788
 789
 790   // -- create Digits branch
 791   Int_t bufferSize = 32000 ;
 792   TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("PHOS",&digits,bufferSize);
 793   digitsBranch->SetTitle(GetName());
 794
 795   // -- Create Digitizer branch
 796   Int_t splitlevel = 0 ;
 797   AliPHOSDigitizer * d = gime->Digitizer(GetName()) ;
 798   TBranch * digitizerBranch = treeD->Branch("AliPHOSDigitizer", "AliPHOSDigitizer", &d,bufferSize,splitlevel);
 799   digitizerBranch->SetTitle(GetName());
 800
 801   digitsBranch->Fill() ;
 802   treeD->AutoSave() ;
 803
 804 }