STEER/AliMC.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 // This class is extracted from the AliRun class
  19 // and contains all the MC-related functionality
  20 // The number of dependencies has to be reduced...
  21 // Author: F.Carminati
  22 //         Federico.Carminati@cern.ch
  23
  24 #include <TBrowser.h>
  25 #include <TStopwatch.h>
  26 #include <TSystem.h>
  27 #include <TVirtualMC.h>
  28
  29 #include "AliDetector.h"
  30 #include "AliGenerator.h"
  31 #include "AliHeader.h"
  32 #include "AliLego.h"
  33 #include "AliMC.h"
  34 #include "AliMCQA.h"
  35 #include "AliRun.h"
  36 #include "AliStack.h"
  37 #include "AliTrackReference.h"
  38
  39
  40 ClassImp(AliMC)
  41
  42 //_______________________________________________________________________
  43 AliMC::AliMC() :
  44   fGenerator(0),
  45   fEventEnergy(0),
  46   fSummEnergy(0),
  47   fSum2Energy(0),
  48   fTrRmax(1.e10),
  49   fTrZmax(1.e10),
  50   fDebug(0),
  51   fImedia(0),
  52   fTransParName("\0"),
  53   fMCQA(0),
  54   fHitLists(0),
  55   fTrackReferences(0)
  56
  57 {
  58   //default constructor
  59 }
  60
  61 //_______________________________________________________________________
  62 AliMC::AliMC(const char *name, const char *title) :
  63   TVirtualMCApplication(name, title),
  64   fGenerator(0),
  65   fEventEnergy(0),
  66   fSummEnergy(0),
  67   fSum2Energy(0),
  68   fTrRmax(1.e10),
  69   fTrZmax(1.e10),
  70   fDebug(0),
  71   fImedia(new TArrayI(1000)),
  72   fTransParName("\0"),
  73   fMCQA(0),
  74   fHitLists(new TList()),
  75   fTrackReferences(new TClonesArray("AliTrackReference", 100))
  76 {
  77   //constructor
  78   // Set transport parameters
  79   SetTransPar();
  80
  81   // Prepare the tracking medium lists
  82   for(Int_t i=0;i<1000;i++) (*fImedia)[i]=-99;
  83
  84 }
  85
  86 //_______________________________________________________________________
  87 AliMC::AliMC(const AliMC &mc) :
  88   TVirtualMCApplication(mc),
  89   fGenerator(0),
  90   fEventEnergy(0),
  91   fSummEnergy(0),
  92   fSum2Energy(0),
  93   fTrRmax(1.e10),
  94   fTrZmax(1.e10),
  95   fDebug(0),
  96   fImedia(0),
  97   fTransParName("\0"),
  98   fMCQA(0),
  99   fHitLists(0),
 100   fTrackReferences(0)
 101 {
 102   //
 103   // Copy constructor for AliRun
 104   //
 105   mc.Copy(*this);
 106 }
 107
 108 //_______________________________________________________________________
 109 AliMC::~AliMC()
 110 {
 111   //destructor
 112   delete fGenerator;
 113   delete fImedia;
 114   delete fMCQA;
 115   delete fHitLists;
 116   // Delete track references
 117   if (fTrackReferences) {
 118     fTrackReferences->Delete();
 119     delete fTrackReferences;
 120     fTrackReferences     = 0;
 121   }
 122
 123 }
 124
 125 //_______________________________________________________________________
 126 void AliMC::Copy(TObject &) const
 127 {
 128   //dummy Copy function
 129   Fatal("Copy","Not implemented!\n");
 130 }
 131
 132 //_______________________________________________________________________
 133 void  AliMC::ConstructGeometry()
 134 {
 135   //
 136   // Create modules, materials, geometry
 137   //
 138
 139     TStopwatch stw;
 140     TIter next(gAlice->Modules());
 141     AliModule *detector;
 142     if (GetDebug()) Info("ConstructGeometry","Geometry creation:");
 143     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 144       stw.Start();
 145       // Initialise detector materials and geometry
 146       detector->CreateMaterials();
 147       detector->CreateGeometry();
 148       printf("%10s R:%.2fs C:%.2fs\n",
 149              detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime());
 150     }
 151 }
 152
 153 //_______________________________________________________________________
 154 void  AliMC::InitGeometry()
 155 {
 156   //
 157   // Initialize detectors and display geometry
 158   //
 159
 160    printf("Initialisation:\n");
 161     TStopwatch stw;
 162     TIter next(gAlice->Modules());
 163     AliModule *detector;
 164     while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 165       stw.Start();
 166       // Initialise detector and display geometry
 167       detector->Init();
 168       detector->BuildGeometry();
 169       printf("%10s R:%.2fs C:%.2fs\n",
 170              detector->GetName(),stw.RealTime(),stw.CpuTime());
 171     }
 172
 173 }
 174
 175 //_______________________________________________________________________
 176 void  AliMC::GeneratePrimaries()
 177 {
 178   //
 179   // Generate primary particles and fill them in the stack.
 180   //
 181
 182   Generator()->Generate();
 183 }
 184
 185 //_______________________________________________________________________
 186 void AliMC::SetGenerator(AliGenerator *generator)
 187 {
 188   //
 189   // Load the event generator
 190   //
 191   if(!fGenerator) fGenerator = generator;
 192 }
 193
 194 //_______________________________________________________________________
 195 void AliMC::ResetGenerator(AliGenerator *generator)
 196 {
 197   //
 198   // Load the event generator
 199   //
 200   if(fGenerator)
 201     if(generator)
 202       Warning("ResetGenerator","Replacing generator %s with %s\n",
 203               fGenerator->GetName(),generator->GetName());
 204     else
 205       Warning("ResetGenerator","Replacing generator %s with NULL\n",
 206               fGenerator->GetName());
 207   fGenerator = generator;
 208 }
 209
 210 //_______________________________________________________________________
 211 void AliMC::FinishRun()
 212 {
 213   // Clean generator information
 214   if (GetDebug()) Info("FinishRun"," fGenerator->FinishRun()");
 215   fGenerator->FinishRun();
 216
 217   //Output energy summary tables
 218   if (GetDebug()) Info("FinishRun"," EnergySummary()");
 219   EnergySummary();
 220
 221 }
 222
 223 //_______________________________________________________________________
 224 void AliMC::BeginPrimary()
 225 {
 226   //
 227   // Called  at the beginning of each primary track
 228   //
 229
 230   // Reset Hits info
 231   ResetHits();
 232   ResetTrackReferences();
 233
 234 }
 235
 236 //_______________________________________________________________________
 237 void AliMC::PreTrack()
 238 {
 239   // Actions before the track's transport
 240      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 241      AliModule *module;
 242
 243      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 244        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 245          module->PreTrack();
 246
 247      fMCQA->PreTrack();
 248 }
 249
 250 //_______________________________________________________________________
 251 void AliMC::Stepping()
 252 {
 253   //
 254   // Called at every step during transport
 255   //
 256
 257   Int_t id = DetFromMate(gMC->GetMedium());
 258   if (id < 0) return;
 259
 260   //
 261   // --- If lego option, do it and leave
 262   if (gAlice->Lego())
 263     gAlice->Lego()->StepManager();
 264   else {
 265     Int_t copy;
 266     //Update energy deposition tables
 267     AddEnergyDeposit(gMC->CurrentVolID(copy),gMC->Edep());
 268     //
 269     // write tracke reference for track which is dissapearing - MI
 270     if (gMC->IsTrackDisappeared()) {
 271       if (gMC->Etot()>0.05) AddTrackReference(GetCurrentTrackNumber());
 272     }
 273
 274     //Call the appropriate stepping routine;
 275     AliModule *det = dynamic_cast<AliModule*>(gAlice->Modules()->At(id));
 276     if(det && det->StepManagerIsEnabled()) {
 277       fMCQA->StepManager(id);
 278       det->StepManager();
 279     }
 280   }
 281 }
 282
 283 //_______________________________________________________________________
 284 void AliMC::EnergySummary()
 285 {
 286   //
 287   // Print summary of deposited energy
 288   //
 289
 290   Int_t ndep=0;
 291   Float_t edtot=0;
 292   Float_t ed, ed2;
 293   Int_t kn, i, left, j, id;
 294   const Float_t kzero=0;
 295   Int_t ievent=gAlice->GetRunLoader()->GetHeader()->GetEvent()+1;
 296   //
 297   // Energy loss information
 298   if(ievent) {
 299     printf("***************** Energy Loss Information per event (GEV) *****************\n");
 300     for(kn=1;kn<fEventEnergy.GetSize();kn++) {
 301       ed=fSummEnergy[kn];
 302       if(ed>0) {
 303         fEventEnergy[ndep]=kn;
 304         if(ievent>1) {
 305           ed=ed/ievent;
 306           ed2=fSum2Energy[kn];
 307           ed2=ed2/ievent;
 308           ed2=100*TMath::Sqrt(TMath::Max(ed2-ed*ed,kzero))/ed;
 309         } else
 310           ed2=99;
 311         fSummEnergy[ndep]=ed;
 312         fSum2Energy[ndep]=TMath::Min(static_cast<Float_t>(99.),TMath::Max(ed2,kzero));
 313         edtot+=ed;
 314         ndep++;
 315       }
 316     }
 317     for(kn=0;kn<(ndep-1)/3+1;kn++) {
 318       left=ndep-kn*3;
 319       for(i=0;i<(3<left?3:left);i++) {
 320         j=kn*3+i;
 321         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 322         printf(" %s %10.3f +- %10.3f%%;",gMC->VolName(id),fSummEnergy[j],fSum2Energy[j]);
 323       }
 324       printf("\n");
 325     }
 326     //
 327     // Relative energy loss in different detectors
 328     printf("******************** Relative Energy Loss per event ********************\n");
 329     printf("Total energy loss per event %10.3f GeV\n",edtot);
 330     for(kn=0;kn<(ndep-1)/5+1;kn++) {
 331       left=ndep-kn*5;
 332       for(i=0;i<(5<left?5:left);i++) {
 333         j=kn*5+i;
 334         id=Int_t (fEventEnergy[j]+0.1);
 335         printf(" %s %10.3f%%;",gMC->VolName(id),100*fSummEnergy[j]/edtot);
 336       }
 337       printf("\n");
 338     }
 339     for(kn=0;kn<75;kn++) printf("*");
 340     printf("\n");
 341   }
 342   //
 343   // Reset the TArray's
 344   //  fEventEnergy.Set(0);
 345   //  fSummEnergy.Set(0);
 346   //  fSum2Energy.Set(0);
 347 }
 348
 349 //_____________________________________________________________________________
 350 void AliMC::BeginEvent()
 351 {
 352   //
 353   // Clean-up previous event
 354   // Energy scores
 355   if (GetDebug())
 356    {
 357      Info("BeginEvent",">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 358      Info("BeginEvent",">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 359      Info("BeginEvent",">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 360      Info("BeginEvent","          BEGINNING EVENT               ");
 361      Info("BeginEvent",">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 362      Info("BeginEvent",">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 363      Info("BeginEvent",">>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>");
 364    }
 365
 366     AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 367
 368   /*******************************/
 369   /*   Clean after eventual      */
 370   /*   previous event            */
 371   /*******************************/
 372
 373
 374   //Set the next event in Run Loader -> Cleans trees (TreeK and all trees in detectors),
 375   gAlice->SetEventNrInRun(gAlice->GetEventNrInRun()+1);
 376   runloader->SetEventNumber(gAlice->GetEventNrInRun());// sets new files, cleans the previous event stuff, if necessary, etc.,
 377   if (GetDebug()) Info("BeginEvent","EventNr is %d",gAlice->GetEventNrInRun());
 378
 379   fEventEnergy.Reset();
 380     // Clean detector information
 381
 382   if (runloader->Stack())
 383     runloader->Stack()->Reset();//clean stack -> tree is unloaded
 384   else
 385     runloader->MakeStack();//or make a new one
 386
 387   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 388    {
 389      if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  fRunLoader->MakeTree(K)");
 390      runloader->MakeTree("K");
 391    }
 392
 393   if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  gMC->SetStack(fRunLoader->Stack())");
 394   gMC->SetStack(gAlice->GetRunLoader()->Stack());//Was in InitMC - but was moved here
 395                                      //because we don't have guarantee that
 396                                      //stack pointer is not going to change from event to event
 397                          //since it bellobgs to header and is obtained via RunLoader
 398   //
 399   //  Reset all Detectors & kinematics & make/reset trees
 400   //
 401
 402   runloader->GetHeader()->Reset(gAlice->GetRunNumber(),gAlice->GetEvNumber(),
 403     gAlice->GetEventNrInRun());
 404 //  fRunLoader->WriteKinematics("OVERWRITE");  is there any reason to rewrite here since MakeTree does so
 405
 406   if(gAlice->Lego())
 407    {
 408     gAlice->Lego()->BeginEvent();
 409     return;
 410    }
 411
 412
 413   if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  ResetHits()");
 414   ResetHits();
 415
 416   if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  fRunLoader->MakeTree(H)");
 417   runloader->MakeTree("H");
 418
 419   if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  fRunLoader->MakeTrackRefsContainer()");
 420   runloader->MakeTrackRefsContainer();//for insurance
 421
 422
 423   //create new branches and SetAdresses
 424   TIter next(gAlice->Modules());
 425   AliModule *detector;
 426   while((detector = (AliModule*)next()))
 427    {
 428     if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  %s->MakeBranch(H)",detector->GetName());
 429     detector->MakeBranch("H");
 430     if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  %s->MakeBranchTR()",detector->GetName());
 431     detector->MakeBranchTR();
 432     if (GetDebug()) Info("BeginEvent","  %s->SetTreeAddress()",detector->GetName());
 433     detector->SetTreeAddress();
 434    }
 435   // make branch for AliRun track References
 436   TTree * treeTR = runloader->TreeTR();
 437   if (treeTR){
 438     // make branch for central track references
 439     if (!fTrackReferences) fTrackReferences = new TClonesArray("AliTrackReference",0);
 440     TBranch *branch;
 441     branch = treeTR->Branch("AliRun",&fTrackReferences);
 442     branch->SetAddress(&fTrackReferences);
 443   }
 444   //
 445 }
 446
 447 //_______________________________________________________________________
 448 void AliMC::ResetHits()
 449 {
 450   //
 451   //  Reset all Detectors hits
 452   //
 453   TIter next(gAlice->Modules());
 454   AliModule *detector;
 455   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 456      detector->ResetHits();
 457   }
 458 }
 459
 460 //_______________________________________________________________________
 461 void AliMC::PostTrack()
 462 {
 463   // Posts tracks for each module
 464      TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 465      AliModule *module;
 466
 467      for(Int_t i=0; i<=gAlice->GetNdets(); i++)
 468        if((module = dynamic_cast<AliModule*>(dets[i])))
 469          module->PostTrack();
 470 }
 471
 472 //_______________________________________________________________________
 473 void AliMC::FinishPrimary()
 474 {
 475   //
 476   // Called  at the end of each primary track
 477   //
 478   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 479   //  static Int_t count=0;
 480   //  const Int_t times=10;
 481   // This primary is finished, purify stack
 482   runloader->Stack()->PurifyKine();
 483
 484   TIter next(gAlice->Modules());
 485   AliModule *detector;
 486   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 487     detector->FinishPrimary();
 488     AliLoader* loader = detector->GetLoader();
 489     if(loader)
 490      {
 491        TTree* treeH = loader->TreeH();
 492        if (treeH) treeH->Fill(); //can be Lego run and treeH can not exist
 493      }
 494   }
 495
 496   // Write out track references if any
 497   if (runloader->TreeTR()) runloader->TreeTR()->Fill();
 498 }
 499
 500 //_______________________________________________________________________
 501 void AliMC::FinishEvent()
 502 {
 503   //
 504   // Called at the end of the event.
 505   //
 506
 507   //
 508   if(gAlice->Lego()) gAlice->Lego()->FinishEvent();
 509
 510   TIter next(gAlice->Modules());
 511   AliModule *detector;
 512   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
 513     detector->FinishEvent();
 514   }
 515
 516   //Update the energy deposit tables
 517   Int_t i;
 518   for(i=0;i<fEventEnergy.GetSize();i++)
 519    {
 520     fSummEnergy[i]+=fEventEnergy[i];
 521     fSum2Energy[i]+=fEventEnergy[i]*fEventEnergy[i];
 522    }
 523
 524   AliRunLoader *runloader=gAlice->GetRunLoader();
 525
 526   AliHeader* header = runloader->GetHeader();
 527   AliStack* stack = runloader->Stack();
 528   if ( (header == 0x0) || (stack == 0x0) )
 529    {//check if we got header and stack. If not cry and exit aliroot
 530     Fatal("AliRun","Can not get the stack or header from LOADER");
 531     return;//never reached
 532    }
 533   // Update Header information
 534   header->SetNprimary(stack->GetNprimary());
 535   header->SetNtrack(stack->GetNtrack());
 536
 537
 538   // Write out the kinematics
 539   stack->FinishEvent();
 540
 541   // Write out the event Header information
 542   TTree* treeE = runloader->TreeE();
 543   if (treeE)
 544    {
 545       header->SetStack(stack);
 546       treeE->Fill();
 547    }
 548   else
 549    {
 550     Error("FinishEvent","Can not get TreeE from RL");
 551    }
 552
 553   if(gAlice->Lego() == 0x0)
 554    {
 555      runloader->WriteKinematics("OVERWRITE");
 556      runloader->WriteTrackRefs("OVERWRITE");
 557      runloader->WriteHits("OVERWRITE");
 558    }
 559
 560   if (GetDebug())
 561    {
 562      Info("FinishEvent","<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 563      Info("FinishEvent","<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 564      Info("FinishEvent","<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 565      Info("FinishEvent","          FINISHING EVENT               ");
 566      Info("FinishEvent","<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 567      Info("FinishEvent","<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 568      Info("FinishEvent","<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<");
 569    }
 570 }
 571
 572 //_______________________________________________________________________
 573 void AliMC::Field(const Double_t* x, Double_t* b) const
 574 {
 575   // Calculates field "b" at point "x"
 576     gAlice->Field(x,b);
 577 }
 578
 579 //_______________________________________________________________________
 580 void AliMC::Init()
 581 {
 582   // MC initialization
 583
 584    //=================Create Materials and geometry
 585    gMC->Init();
 586    gMC->DefineParticles();  //Create standard MC particles
 587
 588    //Read the cuts for all materials
 589    ReadTransPar();
 590    //Build the special IMEDIA table
 591    MediaTable();
 592
 593    //Compute cross-sections
 594    gMC->BuildPhysics();
 595
 596    //Write Geometry object to current file.
 597    gAlice->GetRunLoader()->WriteGeometry();
 598
 599    //Initialise geometry deposition table
 600    fEventEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 601    fSummEnergy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 602    fSum2Energy.Set(gMC->NofVolumes()+1);
 603
 604    //
 605    fMCQA = new AliMCQA(gAlice->GetNdets());
 606
 607    // Register MC in configuration
 608    AliConfig::Instance()->Add(gMC);
 609
 610 }
 611
 612 //_______________________________________________________________________
 613 void AliMC::MediaTable()
 614 {
 615   //
 616   // Built media table to get from the media number to
 617   // the detector id
 618   //
 619
 620   Int_t kz, nz, idt, lz, i, k, ind;
 621   //  Int_t ibeg;
 622   TObjArray &dets = *gAlice->Detectors();
 623   AliModule *det;
 624   Int_t ndets=gAlice->GetNdets();
 625   //
 626   // For all detectors
 627   for (kz=0;kz<ndets;kz++) {
 628     // If detector is defined
 629     if((det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[kz]))) {
 630         TArrayI &idtmed = *(det->GetIdtmed());
 631         for(nz=0;nz<100;nz++) {
 632         // Find max and min material number
 633         if((idt=idtmed[nz])) {
 634           det->LoMedium() = det->LoMedium() < idt ? det->LoMedium() : idt;
 635           det->HiMedium() = det->HiMedium() > idt ? det->HiMedium() : idt;
 636         }
 637       }
 638       if(det->LoMedium() > det->HiMedium()) {
 639         det->LoMedium() = 0;
 640         det->HiMedium() = 0;
 641       } else {
 642         if(det->HiMedium() > fImedia->GetSize()) {
 643           Error("MediaTable","Increase fImedia from %d to %d",
 644                 fImedia->GetSize(),det->HiMedium());
 645           return;
 646         }
 647         // Tag all materials in rage as belonging to detector kz
 648         for(lz=det->LoMedium(); lz<= det->HiMedium(); lz++) {
 649           (*fImedia)[lz]=kz;
 650         }
 651       }
 652     }
 653   }
 654   //
 655   // Print summary table
 656   printf(" Traking media ranges:\n");
 657   for(i=0;i<(ndets-1)/6+1;i++) {
 658     for(k=0;k< (6<ndets-i*6?6:ndets-i*6);k++) {
 659       ind=i*6+k;
 660       det=dynamic_cast<AliModule*>(dets[ind]);
 661       if(det)
 662         printf(" %6s: %3d -> %3d;",det->GetName(),det->LoMedium(),
 663                det->HiMedium());
 664       else
 665         printf(" %6s: %3d -> %3d;","NULL",0,0);
 666     }
 667     printf("\n");
 668   }
 669 }
 670
 671 //_______________________________________________________________________
 672 void AliMC::ReadTransPar()
 673 {
 674   //
 675   // Read filename to set the transport parameters
 676   //
 677
 678
 679   const Int_t kncuts=10;
 680   const Int_t knflags=11;
 681   const Int_t knpars=kncuts+knflags;
 682   const char kpars[knpars][7] = {"CUTGAM" ,"CUTELE","CUTNEU","CUTHAD","CUTMUO",
 683                                "BCUTE","BCUTM","DCUTE","DCUTM","PPCUTM","ANNI",
 684                                "BREM","COMP","DCAY","DRAY","HADR","LOSS",
 685                                "MULS","PAIR","PHOT","RAYL"};
 686   char line[256];
 687   char detName[7];
 688   char* filtmp;
 689   Float_t cut[kncuts];
 690   Int_t flag[knflags];
 691   Int_t i, itmed, iret, ktmed, kz;
 692   FILE *lun;
 693   //
 694   // See whether the file is there
 695   filtmp=gSystem->ExpandPathName(fTransParName.Data());
 696   lun=fopen(filtmp,"r");
 697   delete [] filtmp;
 698   if(!lun) {
 699     Warning("ReadTransPar","File %s does not exist!\n",fTransParName.Data());
 700     return;
 701   }
 702   //
 703   if(fDebug) {
 704     printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 705     printf(" *%59s\n","*");
 706     printf(" *       Please check carefully what you are doing!%10s\n","*");
 707     printf(" *%59s\n","*");
 708   }
 709   //
 710   while(1) {
 711     // Initialise cuts and flags
 712     for(i=0;i<kncuts;i++) cut[i]=-99;
 713     for(i=0;i<knflags;i++) flag[i]=-99;
 714     itmed=0;
 715     for(i=0;i<256;i++) line[i]='\0';
 716     // Read up to the end of line excluded
 717     iret=fscanf(lun,"%[^\n]",line);
 718     if(iret<0) {
 719       //End of file
 720       fclose(lun);
 721       if(fDebug){
 722         printf(" *%59s\n","*");
 723         printf(" "); for(i=0;i<60;i++) printf("*"); printf("\n");
 724       }
 725       return;
 726     }
 727     // Read the end of line
 728     fscanf(lun,"%*c");
 729     if(!iret) continue;
 730     if(line[0]=='*') continue;
 731     // Read the numbers
 732     iret=sscanf(line,"%s %d %f %f %f %f %f %f %f %f %f %f %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d %d",
 733                 detName,&itmed,&cut[0],&cut[1],&cut[2],&cut[3],&cut[4],&cut[5],&cut[6],&cut[7],&cut[8],
 734                 &cut[9],&flag[0],&flag[1],&flag[2],&flag[3],&flag[4],&flag[5],&flag[6],&flag[7],
 735                 &flag[8],&flag[9],&flag[10]);
 736     if(!iret) continue;
 737     if(iret<0) {
 738       //reading error
 739       Warning("ReadTransPar","Error reading file %s\n",fTransParName.Data());
 740       continue;
 741     }
 742     // Check that the module exist
 743     AliModule *mod = gAlice->GetModule(detName);
 744     if(mod) {
 745       // Get the array of media numbers
 746       TArrayI &idtmed = *mod->GetIdtmed();
 747       // Check that the tracking medium code is valid
 748       if(0<=itmed && itmed < 100) {
 749         ktmed=idtmed[itmed];
 750         if(!ktmed) {
 751           Warning("ReadTransPar","Invalid tracking medium code %d for %s\n",itmed,mod->GetName());
 752           continue;
 753         }
 754         // Set energy thresholds
 755         for(kz=0;kz<kncuts;kz++) {
 756           if(cut[kz]>=0) {
 757             if(fDebug) printf(" *  %-6s set to %10.3E for tracking medium code %4d for %s\n",
 758                    kpars[kz],cut[kz],itmed,mod->GetName());
 759             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kz],cut[kz]);
 760           }
 761         }
 762         // Set transport mechanisms
 763         for(kz=0;kz<knflags;kz++) {
 764           if(flag[kz]>=0) {
 765             if(fDebug) printf(" *  %-6s set to %10d for tracking medium code %4d for %s\n",
 766                    kpars[kncuts+kz],flag[kz],itmed,mod->GetName());
 767             gMC->Gstpar(ktmed,kpars[kncuts+kz],Float_t(flag[kz]));
 768           }
 769         }
 770       } else {
 771         Warning("ReadTransPar","Invalid medium code %d *\n",itmed);
 772         continue;
 773       }
 774     } else {
 775       if(fDebug) printf("%s::ReadTransParModule: %s not present\n",ClassName(),detName);
 776       continue;
 777     }
 778   }
 779 }
 780
 781 //_______________________________________________________________________
 782 void AliMC::SetTransPar(const char *filename)
 783 {
 784   //
 785   // Sets the file name for transport parameters
 786   //
 787   fTransParName = filename;
 788 }
 789
 790 //_______________________________________________________________________
 791 void AliMC::Browse(TBrowser *b)
 792 {
 793   //
 794   // Called when the item "Run" is clicked on the left pane
 795   // of the Root browser.
 796   // It displays the Root Trees and all detectors.
 797   //
 798   //detectors are in folders anyway
 799   b->Add(fMCQA,"AliMCQA");
 800 }
 801
 802 //PH
 803 //_______________________________________________________________________
 804 void AliMC::AddHit(Int_t id, Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits) const
 805 {
 806   //
 807   //  Add a hit to detector id
 808   //
 809   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 810   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddHit(track,vol,hits);
 811 }
 812
 813 //_______________________________________________________________________
 814 void AliMC::AddDigit(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *digits) const
 815 {
 816   //
 817   // Add digit to detector id
 818   //
 819   TObjArray &dets = *gAlice->Modules();
 820   if(dets[id]) dynamic_cast<AliModule*>(dets[id])->AddDigit(tracks,digits);
 821 }
 822
 823 //_______________________________________________________________________
 824 Int_t AliMC::GetCurrentTrackNumber() const {
 825   //
 826   // Returns current track
 827   //
 828   return gAlice->GetRunLoader()->Stack()->GetCurrentTrackNumber();
 829 }
 830
 831 //_______________________________________________________________________
 832 void AliMC::DumpPart (Int_t i) const
 833 {
 834   //
 835   // Dumps particle i in the stack
 836   //
 837   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 838    if (runloader->Stack())
 839     runloader->Stack()->DumpPart(i);
 840 }
 841
 842 //_______________________________________________________________________
 843 void AliMC::DumpPStack () const
 844 {
 845   //
 846   // Dumps the particle stack
 847   //
 848   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 849    if (runloader->Stack())
 850     runloader->Stack()->DumpPStack();
 851 }
 852
 853 //_______________________________________________________________________
 854 Int_t AliMC::GetNtrack() const {
 855   //
 856   // Returns number of tracks in stack
 857   //
 858   Int_t ntracks = -1;
 859   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 860    if (runloader->Stack())
 861      ntracks = runloader->Stack()->GetNtrack();
 862    return ntracks;
 863 }
 864
 865 //_______________________________________________________________________
 866 Int_t AliMC::GetPrimary(Int_t track) const
 867 {
 868   //
 869   // return number of primary that has generated track
 870   //
 871   Int_t nprimary = -999;
 872   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 873   if (runloader->Stack())
 874     nprimary = runloader->Stack()->GetPrimary(track);
 875   return nprimary;
 876 }
 877
 878 //_______________________________________________________________________
 879 TParticle* AliMC::Particle(Int_t i) const
 880 {
 881   // Returns the i-th particle from the stack taking into account
 882   // the remaping done by PurifyKine
 883   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 884   if (runloader)
 885    if (runloader->Stack())
 886     return runloader->Stack()->Particle(i);
 887   return 0x0;
 888 }
 889
 890 //_______________________________________________________________________
 891 TObjArray* AliMC::Particles() const {
 892   //
 893   // Returns pointer to Particles array
 894   //
 895   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 896   if (runloader)
 897    if (runloader->Stack())
 898     return runloader->Stack()->Particles();
 899   return 0x0;
 900 }
 901
 902 //_______________________________________________________________________
 903 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg, Float_t *pmom,
 904                       Float_t *vpos, Float_t *polar, Float_t tof,
 905                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is)
 906 {
 907 // Delegate to stack
 908 //
 909   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 910   if (runloader)
 911     if (runloader->Stack())
 912       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, pmom, vpos, polar, tof,
 913                                     mech, ntr, weight, is);
 914 }
 915
 916 //_______________________________________________________________________
 917 void AliMC::PushTrack(Int_t done, Int_t parent, Int_t pdg,
 918                       Double_t px, Double_t py, Double_t pz, Double_t e,
 919                       Double_t vx, Double_t vy, Double_t vz, Double_t tof,
 920                       Double_t polx, Double_t poly, Double_t polz,
 921                       TMCProcess mech, Int_t &ntr, Float_t weight, Int_t is)
 922 {
 923   // Delegate to stack
 924   //
 925   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 926   if (runloader)
 927     if (runloader->Stack())
 928       runloader->Stack()->PushTrack(done, parent, pdg, px, py, pz, e, vx, vy, vz, tof,
 929                                     polx, poly, polz, mech, ntr, weight, is);
 930 }
 931
 932 //_______________________________________________________________________
 933 void AliMC::SetHighWaterMark(Int_t nt)
 934 {
 935     //
 936     // Set high water mark for last track in event
 937   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 938   if (runloader)
 939     if (runloader->Stack())
 940       runloader->Stack()->SetHighWaterMark(nt);
 941 }
 942
 943 //_______________________________________________________________________
 944 void AliMC::KeepTrack(Int_t track)
 945 {
 946   //
 947   // Delegate to stack
 948   //
 949   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 950   if (runloader)
 951     if (runloader->Stack())
 952       runloader->Stack()->KeepTrack(track);
 953 }
 954
 955 //_______________________________________________________________________
 956 void AliMC::FlagTrack(Int_t track)
 957 {
 958   // Delegate to stack
 959   //
 960   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 961   if (runloader)
 962     if (runloader->Stack())
 963       runloader->Stack()->FlagTrack(track);
 964 }
 965
 966 //_______________________________________________________________________
 967 void AliMC::SetCurrentTrack(Int_t track)
 968 {
 969   //
 970   // Set current track number
 971   //
 972   AliRunLoader * runloader = gAlice->GetRunLoader();
 973   if (runloader)
 974     if (runloader->Stack())
 975       runloader->Stack()->SetCurrentTrack(track);
 976 }
 977
 978 //_______________________________________________________________________
 979 void  AliMC::AddTrackReference(Int_t label){
 980   //
 981   // add a trackrefernce to the list
 982   if (!fTrackReferences) {
 983     cerr<<"Container trackrefernce not active\n";
 984     return;
 985   }
 986   Int_t nref = fTrackReferences->GetEntriesFast();
 987   TClonesArray &lref = *fTrackReferences;
 988   new(lref[nref]) AliTrackReference(label);
 989 }
 990
 991
 992
 993 //_______________________________________________________________________
 994 void AliMC::ResetTrackReferences()
 995 {
 996   //
 997   //  Reset all  references
 998   //
 999   if (fTrackReferences)   fTrackReferences->Clear();
1000
1001   TIter next(gAlice->Modules());
1002   AliModule *detector;
1003   while((detector = dynamic_cast<AliModule*>(next()))) {
1004      detector->ResetTrackReferences();
1005   }
1006 }
1007
1008 void AliMC::RemapTrackReferencesIDs(Int_t *map)
1009 {
1010   //
1011   // Remapping track reference
1012   // Called at finish primary
1013   //
1014   if (!fTrackReferences) return;
1015   for (Int_t i=0;i<fTrackReferences->GetEntries();i++){
1016     AliTrackReference * ref = dynamic_cast<AliTrackReference*>(fTrackReferences->UncheckedAt(i));
1017     if (ref) {
1018       Int_t newID = map[ref->GetTrack()];
1019       if (newID>=0) ref->SetTrack(newID);
1020       else {
1021         //ref->SetTrack(-1);
1022         ref->SetBit(kNotDeleted,kFALSE);
1023         fTrackReferences->RemoveAt(i);
1024       }
1025     }
1026   }
1027   fTrackReferences->Compress();
1028 }