]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALReconstructor.cxx
correct the way the clusterizer is initialized, depending on event type
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALReconstructor.cxx
index e4c41b88a46e6e47557cc79d724c3855433d4788..526a5680eaa46310f8ac80133408c635946e2215 100644 (file)
@@ -37,6 +37,8 @@
 #include "AliEMCALReconstructor.h"
 
 #include "AliCodeTimer.h"
+#include "AliCaloCalibPedestal.h"
+#include "AliEMCALCalibData.h"
 #include "AliESDEvent.h"
 #include "AliESDCaloCluster.h"
 #include "AliESDCaloCells.h"
@@ -45,6 +47,7 @@
 #include "AliEMCALRawUtils.h"
 #include "AliEMCALDigit.h"
 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
+#include "AliEMCALClusterizerNxN.h"
 #include "AliEMCALRecPoint.h"
 #include "AliEMCALPID.h"
 #include "AliEMCALTrigger.h"
 #include "AliCDBManager.h"
 #include "AliEMCALGeometry.h"
 #include "AliEMCAL.h"
-#include "AliEMCALHistoUtilities.h"
 #include "AliESDVZERO.h"
 #include "AliCDBManager.h"
 #include "AliRunLoader.h"
 #include "AliRun.h"
 #include "AliEMCALTriggerData.h"
 #include "AliEMCALTriggerElectronics.h"
-#include "AliVZEROLoader.h"
+#include "AliEMCALTriggerDCSConfigDB.h"
+#include "AliEMCALTriggerDCSConfig.h"
+#include "AliEMCALTriggerData.h"
+#include "AliEMCALTriggerRawDigit.h"
+#include "AliEMCALTriggerPatch.h"
+#include "AliEMCALTriggerTypes.h"
 
 ClassImp(AliEMCALReconstructor) 
 
-const AliEMCALRecParam* AliEMCALReconstructor::fgkRecParam = 0;  // EMCAL rec. parameters
-AliEMCALRawUtils* AliEMCALReconstructor::fgRawUtils = 0;   // EMCAL raw utilities class
-AliEMCALClusterizer* AliEMCALReconstructor::fgClusterizer = 0;   // EMCAL clusterizer class
-TClonesArray*     AliEMCALReconstructor::fgDigitsArr = 0;  // shoud read just once at event
+const AliEMCALRecParam*     AliEMCALReconstructor::fgkRecParam        = 0;   // EMCAL rec. parameters
+AliEMCALRawUtils*           AliEMCALReconstructor::fgRawUtils         = 0;   // EMCAL raw utilities class
+AliEMCALClusterizer*        AliEMCALReconstructor::fgClusterizer      = 0;   // EMCAL clusterizer class
+TClonesArray*               AliEMCALReconstructor::fgDigitsArr        = 0;   // list of digits, to be used multiple times
+TObjArray*                  AliEMCALReconstructor::fgClustersArr      = 0;   // list of clusters, to be used multiple times
 AliEMCALTriggerElectronics* AliEMCALReconstructor::fgTriggerProcessor = 0x0;
 //____________________________________________________________________________
 AliEMCALReconstructor::AliEMCALReconstructor() 
-  : fDebug(kFALSE), fList(0), fGeom(0),fCalibData(0),fPedestalData(0) 
+  : fDebug(kFALSE), fList(0), fGeom(0),fCalibData(0),fPedestalData(0),fTriggerData(0x0) 
 {
   // ctor
 
@@ -80,9 +88,12 @@ AliEMCALReconstructor::AliEMCALReconstructor()
   //To make sure we match with the geometry in a simulation file,
   //let's try to get it first.  If not, take the default geometry
   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
-  if (rl->GetAliRun() && rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL")) {
-    fGeom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
-  } else {
+  if (rl->GetAliRun()){
+    AliEMCAL * emcal = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"));
+    if(emcal) fGeom = emcal->GetGeometry();
+  }
+  
+  if(!fGeom) {
     AliInfo(Form("Using default geometry in reconstruction"));
     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
   }
@@ -101,40 +112,110 @@ AliEMCALReconstructor::AliEMCALReconstructor()
   //Get calibration parameters 
   if(!fPedestalData)
     {
-               AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*) 
-               AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Pedestals");
-               if (entry) fPedestalData =  (AliCaloCalibPedestal*) entry->GetObject();
+      AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*) 
+      AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Pedestals");
+      if (entry) fPedestalData =  (AliCaloCalibPedestal*) entry->GetObject();
     }
-       
-       if(!fPedestalData)
-               AliFatal("Dead map not found in CDB!");
-       
-       
-  //Init the clusterizer with geometry and calibration pointers, avoid doing it twice.
-  fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerv1(fGeom, fCalibData,fPedestalData); 
-       
+  
+  if(!fPedestalData)
+    AliFatal("Dead map not found in CDB!");
+       
   if(!fGeom) AliFatal(Form("Could not get geometry!"));
 
-  fgTriggerProcessor = new AliEMCALTriggerElectronics();
+  AliEMCALTriggerDCSConfigDB* dcsConfigDB = AliEMCALTriggerDCSConfigDB::Instance();
+
+  const AliEMCALTriggerDCSConfig* dcsConfig = dcsConfigDB->GetTriggerDCSConfig();
+
+  if (!dcsConfig) AliFatal("No Trigger DCS Configuration from OCDB!");
+  fgTriggerProcessor = new AliEMCALTriggerElectronics( dcsConfig );
+       
+  fTriggerData = new AliEMCALTriggerData();
+
+  //Init temporary list of digits
+  fgDigitsArr   = new TClonesArray("AliEMCALDigit",1000);
+  fgClustersArr = new TObjArray(1000);
+       
 } 
 
 //____________________________________________________________________________
 AliEMCALReconstructor::~AliEMCALReconstructor()
 {
   // dtor
-  delete fGeom;
-  delete fgRawUtils;
-  delete fgClusterizer;
-  delete fgTriggerProcessor;
 
+  if(fGeom)              delete fGeom;
+  
+  //No need to delete, recovered from OCDB
+  //if(fCalibData)         delete fCalibData;
+  //if(fPedestalData)      delete fPedestalData;
+  
+  if(fgDigitsArr){
+    fgDigitsArr->Clear("C");
+    delete fgDigitsArr; 
+  }
+  
+  if(fgClustersArr){
+    fgClustersArr->Clear();
+    delete fgClustersArr; 
+  }
+  
+  if(fgRawUtils)         delete fgRawUtils;
+  if(fgClusterizer)      delete fgClusterizer;
+  if(fgTriggerProcessor) delete fgTriggerProcessor;
+  
   AliCodeTimer::Instance()->Print();
 } 
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCALReconstructor::Init()
+// //____________________________________________________________________________
+// void AliEMCALReconstructor::Init()
+// {
+//   // Trigger hists - Oct 24, 2007
+//    fList = AliEMCALHistoUtilities::GetTriggersListOfHists(kTRUE);
+// }
+
+//____________________________________________________________________________                                  
+void AliEMCALReconstructor::InitClusterizer() const
 {
-  // Trigger hists - Oct 24, 2007
-  fList = AliEMCALHistoUtilities::GetTriggersListOfHists(kTRUE);
+  //Init the clusterizer with geometry and calibration pointers, avoid doing it twice.                          
+  Int_t clusterizerType = -1;
+  Int_t eventType = -1;
+  if(GetRecParam()) {
+    clusterizerType = GetRecParam()->GetClusterizerFlag();
+    eventType       = GetRecParam()->GetEventSpecie();
+  }
+  else{
+    AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
+    AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/RecoParam");
+    //Get The reco param for the default event specie                                                           
+    if (entry) {
+      AliEMCALRecParam *recParam  = (AliEMCALRecParam*)((TObjArray *) entry->GetObject())->At(0);
+      if(recParam) clusterizerType = recParam->GetClusterizerFlag(); 
+    }
+  }
+  
+  //Check if clusterizer previously set corresponds to what is needed for this event type                       
+  if(fgClusterizer){
+    if(eventType!=AliRecoParam::kCalib){
+      //printf("ReCreate clusterizer? Clusterizer set <%d>, Clusterizer in use <%s>\n",
+        //     clusterizerType, fgClusterizer->Version());
+      
+      if     (clusterizerType == AliEMCALRecParam::kClusterizerv1 && !strcmp(fgClusterizer->Version(),"clu-v1")) return;
+      
+      else if(clusterizerType == AliEMCALRecParam::kClusterizerNxN && !strcmp(fgClusterizer->Version(),"clu-NxN")) return;
+      
+      //Need to create new clusterizer, the one set previously is not the correct one     
+      delete fgClusterizer;
+    }
+    else return;
+  }
+
+  if (clusterizerType  == AliEMCALRecParam::kClusterizerv1)
+  {
+    fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerv1(fGeom, fCalibData,fPedestalData);
+  }
+  else
+  {
+    fgClusterizer = new AliEMCALClusterizerNxN(fGeom, fCalibData,fPedestalData);
+  }
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -149,59 +230,30 @@ void AliEMCALReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree)
   AliCodeTimerAuto("",0)
 
   ReadDigitsArrayFromTree(digitsTree);
+
+  InitClusterizer();
+  
   fgClusterizer->InitParameters();
   fgClusterizer->SetOutput(clustersTree);
-
-  AliEMCALTriggerData* trgData = new AliEMCALTriggerData();
-       
-  Int_t bufferSize = 32000;
-
-  if (TBranch* triggerBranch = clustersTree->GetBranch("EMTRG"))
-         triggerBranch->SetAddress(&trgData);
-  else
-         clustersTree->Branch("EMTRG","AliEMCALTriggerData",&trgData,bufferSize);
-
-  AliVZEROLoader* vzeroLoader = dynamic_cast<AliVZEROLoader*>(AliRunLoader::Instance()->GetDetectorLoader("VZERO"));
   
-  TTree* treeV0 = 0x0;
-       
-  if (vzeroLoader) 
-  {
-         vzeroLoader->LoadDigits("READ");
-      treeV0 = vzeroLoader->TreeD();
-  }
-
-  TClonesArray *trgDigits = new TClonesArray("AliEMCALRawDigit",1000);
-  TBranch *branchdig = digitsTree->GetBranch("EMTRG");
-  if (!branchdig) 
-  { 
-         AliError("Can't get the branch with the EMCAL trigger digits !");
-         return;
-  }
-
-  branchdig->SetAddress(&trgDigits);
-  branchdig->GetEntry(0);
+  //Skip clusterization of LED events
+  if (GetRecParam()->GetEventSpecie()!=AliRecoParam::kCalib){
+       
+               if(fgDigitsArr && fgDigitsArr->GetEntries()) {
 
-  fgTriggerProcessor->Digits2Trigger(trgDigits, treeV0, trgData);
-       
-  trgDigits->Delete();
-       
-  if(fgDigitsArr && fgDigitsArr->GetEntries()) {
-
-    fgClusterizer->SetInput(digitsTree);
+                 fgClusterizer->SetInput(digitsTree);
     
-    if(Debug())
-      fgClusterizer->Digits2Clusters("deb all") ;
-    else
-      fgClusterizer->Digits2Clusters("");
+                 if(Debug())
+                         fgClusterizer->Digits2Clusters("deb all") ;
+                 else
+                         fgClusterizer->Digits2Clusters("");
     
-    fgClusterizer->Clear();
-
-  }
+                 fgClusterizer->Clear();
 
+         }//digits array exists and has somethind
+  }//not a LED event
+       
   clustersTree->Fill();        
-
-  delete trgData;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -214,30 +266,42 @@ void AliEMCALReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digits
 
   rawReader->Reset() ; 
 
-  TClonesArray *digitsArr = new TClonesArray("AliEMCALDigit",200);
-  TClonesArray *digitsTrg = new TClonesArray("AliEMCALRawDigit", 200);
-
-  Int_t bufsize = 32000;
-  digitsTree->Branch("EMCAL", &digitsArr, bufsize);
-  digitsTree->Branch("EMTRG", &digitsTrg, bufsize);
-
-  //must be done here because, in constructor, option is not yet known
-  fgRawUtils->SetOption(GetOption());
+  fTriggerData->SetMode(1);    
 
-  fgRawUtils->SetRawFormatHighLowGainFactor(GetRecParam()->GetHighLowGainFactor());
-  fgRawUtils->SetRawFormatOrder(GetRecParam()->GetOrderParameter());
-  fgRawUtils->SetRawFormatTau(GetRecParam()->GetTau());
-  fgRawUtils->SetNoiseThreshold(GetRecParam()->GetNoiseThreshold());
-  fgRawUtils->SetNPedSamples(GetRecParam()->GetNPedSamples());
-  fgRawUtils->SetRemoveBadChannels(GetRecParam()->GetRemoveBadChannels());
-  fgRawUtils->SetFittingAlgorithm(GetRecParam()->GetFittingAlgorithm());
+  if(fgDigitsArr) fgDigitsArr->Clear("C");
 
-  fgRawUtils->Raw2Digits(rawReader,digitsArr,fPedestalData,digitsTrg);
+  TClonesArray *digitsTrg = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit", 32 * 96);
 
+  Int_t bufsize = 32000;
+  digitsTree->Branch("EMCAL", &fgDigitsArr, bufsize);
+  digitsTree->Branch("EMTRG", &digitsTrg, bufsize);
+       
+  //Skip calibration events do the rest
+  Bool_t doFit = kTRUE;
+  if ( !(GetRecParam()->FitLEDEvents()) && GetRecParam()->GetEventSpecie()==AliRecoParam::kCalib) doFit = kFALSE;
+  if (doFit){
+         //must be done here because, in constructor, option is not yet known
+         fgRawUtils->SetOption(GetOption());
+
+         fgRawUtils->SetRawFormatHighLowGainFactor(GetRecParam()->GetHighLowGainFactor());
+         fgRawUtils->SetRawFormatOrder(GetRecParam()->GetOrderParameter());
+         fgRawUtils->SetRawFormatTau(GetRecParam()->GetTau());
+         fgRawUtils->SetNoiseThreshold(GetRecParam()->GetNoiseThreshold());
+         fgRawUtils->SetNPedSamples(GetRecParam()->GetNPedSamples());
+         fgRawUtils->SetRemoveBadChannels(GetRecParam()->GetRemoveBadChannels());
+         fgRawUtils->SetFittingAlgorithm(GetRecParam()->GetFittingAlgorithm());
+         fgRawUtils->SetFALTROUsage(GetRecParam()->UseFALTRO());
+         fgRawUtils->SetTimeMin(GetRecParam()->GetTimeMin());
+         fgRawUtils->SetTimeMax(GetRecParam()->GetTimeMax());
+       
+         fgRawUtils->Raw2Digits(rawReader,fgDigitsArr,fPedestalData,digitsTrg,fTriggerData);
+  }//skip calibration event
+  else{
+       AliDebug(1," Calibration Event, skip!");
+  }
+       
   digitsTree->Fill();
-  digitsArr->Delete();
   digitsTrg->Delete();
-  delete digitsArr;
   delete digitsTrg;
 
 }
@@ -250,115 +314,116 @@ void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   // Called by AliReconstruct after Reconstruct() and global tracking and vertexing 
   // and V0 
   // Works on the current event
-  //  printf(" ## AliEMCALReconstructor::FillESD() is started ### \n ");
+  // printf(" ## AliEMCALReconstructor::FillESD() is started ### \n ");
   //return;
 
-  //######################################################
-  //#########Calculate trigger and set trigger info###########
-  //######################################################
-  AliEMCALTrigger tr;
-  //   tr.SetPatchSize(1);  // create 4x4 patches
-  tr.SetSimulation(kFALSE); // Reconstruction mode
-  tr.SetDigitsList(fgDigitsArr);
-  // Get VZERO total multiplicity for jet trigger simulation 
-  // The simulation of jey trigger will be incorrect if no VZERO data 
-  // at ESD
-  AliESDVZERO* vZero = esd->GetVZEROData();
-  if(vZero) {
-    tr.SetVZER0Multiplicity(vZero->GetMTotV0A() + vZero->GetMTotV0C());
-  }
-  //
-  tr.Trigger();
-
-  Float_t maxAmp2x2  = tr.Get2x2MaxAmplitude();
-  Float_t maxAmpnxn  = tr.GetnxnMaxAmplitude();
-  Float_t ampOutOfPatch2x2  = tr.Get2x2AmpOutOfPatch() ;
-  Float_t ampOutOfPatchnxn  = tr.GetnxnAmpOutOfPatch() ;
-
-  Int_t iSM2x2      = tr.Get2x2SuperModule();
-  Int_t iSMnxn      = tr.GetnxnSuperModule();
-  Int_t iModulePhi2x2 = tr.Get2x2ModulePhi();
-  Int_t iModulePhinxn = tr.GetnxnModulePhi();
-  Int_t iModuleEta2x2 = tr.Get2x2ModuleEta();
-  Int_t iModuleEtanxn = tr.GetnxnModuleEta();
-
-  AliDebug(2, Form("Trigger 2x2 max amp %f, out amp %f, SM %d, iphi %d ieta %d",  maxAmp2x2, ampOutOfPatch2x2, iSM2x2,iModulePhi2x2, iModuleEta2x2));
-  AliDebug(2, Form("Trigger 4x4 max amp %f , out amp %f, SM %d, iphi %d, ieta %d",  maxAmpnxn, ampOutOfPatchnxn, iSMnxn,iModulePhinxn, iModuleEtanxn));
-
-  TVector3    pos2x2(-1,-1,-1);
-  TVector3    posnxn(-1,-1,-1);
-
-  Int_t iAbsId2x2 = fGeom->GetAbsCellIdFromCellIndexes( iSM2x2, iModulePhi2x2, iModuleEta2x2) ; // should be changed to Module
-  Int_t iAbsIdnxn = fGeom->GetAbsCellIdFromCellIndexes( iSMnxn, iModulePhinxn, iModuleEtanxn) ;
-  fGeom->GetGlobal(iAbsId2x2, pos2x2);
-  fGeom->GetGlobal(iAbsIdnxn, posnxn);
-  //printf(" iAbsId2x2 %i iAbsIdnxn %i \n", iAbsId2x2, iAbsIdnxn);
+  //########################################
+  // Trigger
+  //########################################
+
+   Int_t v0M[2] = {0, 0};
+       
+   AliESDVZERO* esdV0 = esd->GetVZEROData();
+
+   if (esdV0) 
+   {
+         for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
+         {
+                 v0M[0] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0C(i);
+                 v0M[1] += (Int_t)esdV0->GetAdcV0A(i);
+         }
+   }
+   else
+   {
+         AliWarning("Cannot retrieve V0 ESD! Run w/ null V0 charges");
+   }
+
+   TClonesArray *trgDigits = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit",1000);
+       
+   TBranch *branchtrg = digitsTree->GetBranch("EMTRG");
+       
+   if (!branchtrg) 
+   { 
+         AliError("Can't get the branch with the EMCAL trigger digits!");
+         return;
+   }
+       
+   branchtrg->SetAddress(&trgDigits);
+   branchtrg->GetEntry(0);
   
-  TArrayF triggerPosition(6);
-  triggerPosition[0] = pos2x2(0) ;   
-  triggerPosition[1] = pos2x2(1) ;   
-  triggerPosition[2] = pos2x2(2) ;  
-  triggerPosition[3] = posnxn(0) ;   
-  triggerPosition[4] = posnxn(1) ;   
-  triggerPosition[5] = posnxn(2) ;
-  //printf(" triggerPosition ");
-  //for(int i=0; i<6; i++) printf(" %i %f : ", i, triggerPosition[i]);
-
-  TArrayF triggerAmplitudes(4);
-  triggerAmplitudes[0] = maxAmp2x2 ;   
-  triggerAmplitudes[1] = ampOutOfPatch2x2 ;    
-  triggerAmplitudes[2] = maxAmpnxn ;   
-  triggerAmplitudes[3] = ampOutOfPatchnxn ;   
-  //printf("\n triggerAmplitudes ");
-  //for(int i=0; i<4; i++) printf(" %i %f : ", i, triggerAmplitudes[i]);
-  //printf("\n");
-  //tr.Print("");
-  //
-  // Trigger jet staff
-  //
-  if(tr.GetNJetThreshold()>0) {
-    // Jet phi/eta
-    Int_t n0 = triggerPosition.GetSize();
-    const TH2F *hpatch = tr.GetJetMatrixE();
-    triggerPosition.Set(n0 + 2);
-    for(Int_t i=0; i<2; i++) triggerPosition[n0+i] = hpatch->GetMean(i+1);   
-    // Add jet ampitudes
-    n0 = triggerAmplitudes.GetSize();
-    triggerAmplitudes.Set(n0 + tr.GetNJetThreshold());
-    Double_t *ampJet = tr.GetL1JetThresholds();
-    for(Int_t i=0; i<tr.GetNJetThreshold(); i++){
-      triggerAmplitudes[n0 + i] = Float_t(ampJet[i]);
-    }
-  }
-  esd->AddEMCALTriggerPosition(triggerPosition);
-  esd->AddEMCALTriggerAmplitudes(triggerAmplitudes);
-  // Fill trigger hists
-  AliEMCALHistoUtilities::FillTriggersListOfHists(fList,&triggerPosition,&triggerAmplitudes);
+   // Note: fgTriggerProcessor reset done at the end of this method
+   fgTriggerProcessor->Digits2Trigger(trgDigits, v0M, fTriggerData);
+
+   // Fill ESD
+   AliESDCaloTrigger* trgESD = esd->GetCaloTrigger("EMCAL");
+  
+   if (trgESD)
+   {
+         trgESD->Allocate(trgDigits->GetEntriesFast());
+         
+         for (Int_t i = 0; i < trgDigits->GetEntriesFast(); i++)
+         {       
+                 AliEMCALTriggerRawDigit* rdig = (AliEMCALTriggerRawDigit*)trgDigits->At(i);
+                 
+                 Int_t px, py;
+                 if (fGeom->GetPositionInEMCALFromAbsFastORIndex(rdig->GetId(), px, py))
+                 {
+                         Int_t a = -1, t = -1, times[10]; 
+                         
+                         rdig->GetMaximum(a, t);
+                         rdig->GetL0Times(times);
+                                                 
+                         trgESD->Add(px, py, a, t, times, rdig->GetNL0Times(), rdig->GetL1TimeSum());
+                 }
+         }
+         
+         trgESD->SetL1Threshold(0, fTriggerData->GetL1GammaThreshold());
+         
+         trgESD->SetL1Threshold(1, fTriggerData->GetL1JetThreshold()  );
+
+         for (Int_t i = 0; i < kTriggerTypeEnd; i++)
+         {       
+                 for (Int_t j = 0; j < 2; j++)
+                 {
+                         TClonesArray* patches = fTriggerData->GetPatches((TriggerType_t)i, j);
+                         
+                         TIter NextPatch(patches);
+                         while (AliEMCALTriggerPatch* p = (AliEMCALTriggerPatch*)NextPatch())
+                         {
+                                 TVector2 pos; p->Position(pos);
+                                 trgESD->SetTriggerBits((Int_t) pos.X(), (Int_t) pos.Y(), i, j);
+                         }
+                 }
+         }
+   }
 
+   // Resetting
+   fTriggerData->Reset();
+  
   //########################################
   //##############Fill CaloCells###############
   //########################################
+  ReadDigitsArrayFromTree(digitsTree);
 
-  TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliEMCALDigit",1000);
-  TBranch *branchdig = digitsTree->GetBranch("EMCAL");
-  if (!branchdig) { 
-    AliError("can't get the branch with the EMCAL digits !");
-    return;
-  }
-  branchdig->SetAddress(&digits);
-  digitsTree->GetEvent(0);
-  Int_t nDigits = digits->GetEntries(), idignew = 0 ;
+//   TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliEMCALDigit",1000);
+//   TBranch *branchdig = digitsTree->GetBranch("EMCAL");
+//   if (!branchdig) { 
+//     AliError("can't get the branch with the EMCAL digits !");
+//     return;
+//   }
+//   branchdig->SetAddress(&digits);
+//   digitsTree->GetEvent(0);
+  Int_t nDigits = fgDigitsArr->GetEntries(), idignew = 0 ;
   AliDebug(1,Form("%d digits",nDigits));
 
   AliESDCaloCells &emcCells = *(esd->GetEMCALCells());
   emcCells.CreateContainer(nDigits);
-  emcCells.SetType(AliESDCaloCells::kEMCALCell);
+  emcCells.SetType(AliVCaloCells::kEMCALCell);
   Float_t energy = 0;
   for (Int_t idig = 0 ; idig < nDigits ; idig++) {
-    const AliEMCALDigit * dig = (const AliEMCALDigit*)digits->At(idig);
-    if(dig->GetAmp() > 0 ){
-         energy = (static_cast<AliEMCALClusterizerv1*> (fgClusterizer))->Calibrate(dig->GetAmp(),dig->GetId());
+    const AliEMCALDigit * dig = (const AliEMCALDigit*)fgDigitsArr->At(idig);
+    if(dig->GetAmplitude() > 0 ){
+         energy = fgClusterizer->Calibrate(dig->GetAmplitude(),dig->GetTime(),dig->GetId()); //TimeR or Time?
          if(energy > 0){ //Digits tagged as bad (dead, hot, not alive) are set to 0 in calibrate, remove them  
                  emcCells.SetCell(idignew,dig->GetId(),energy, dig->GetTime());   
                  idignew++;
@@ -371,15 +436,16 @@ void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   //------------------------------------------------------------
   //-----------------CLUSTERS-----------------------------
   //------------------------------------------------------------
-  TObjArray *clusters = new TObjArray(100);
+  clustersTree->SetBranchStatus("*",0); //disable all branches
+  clustersTree->SetBranchStatus("EMCALECARP",1); //Enable only the branch we need
+  if(fgClustersArr) fgClustersArr->Clear();
   TBranch *branch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
-  branch->SetAddress(&clusters);
-  clustersTree->GetEvent(0);
+  branch->SetAddress(&fgClustersArr);
+  branch->GetEntry(0);
+  //clustersTree->GetEvent(0);
 
-  Int_t nClusters = clusters->GetEntries(),  nClustersNew=0;
+  Int_t nClusters = fgClustersArr->GetEntries(),  nClustersNew=0;
   AliDebug(1,Form("%d clusters",nClusters));
-  esd->SetFirstEMCALCluster(esd->GetNumberOfCaloClusters()); // Put after Phos clusters 
-
 
   //######################################################
   //#######################TRACK MATCHING###############
@@ -403,10 +469,9 @@ void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
   //########################################
   //##############Fill CaloClusters#############
   //########################################
-  esd->SetNumberOfEMCALClusters(nClusters);
   for (Int_t iClust = 0 ; iClust < nClusters ; iClust++) {
-    const AliEMCALRecPoint * clust = (const AliEMCALRecPoint*)clusters->At(iClust);
-    //if(clust->GetClusterType()== AliESDCaloCluster::kEMCALClusterv1) nRP++; else nPC++;
+    const AliEMCALRecPoint * clust = (const AliEMCALRecPoint*)fgClustersArr->At(iClust);
+    //if(clust->GetClusterType()== AliVCluster::kEMCALClusterv1) nRP++; else nPC++;
     if (Debug()) clust->Print();
     // Get information from EMCAL reconstruction points
     Float_t xyz[3];
@@ -428,11 +493,11 @@ void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
     for (Int_t iCell=0; iCell<cellMult; iCell++) {
       if (amplFloat[iCell] > 0) {
       absIdList[newCellMult] = (UShort_t)(digitInts[iCell]);
-      //Uncomment when unfolding is done
-      //if(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell])>0)
-      //fracList[newCellMult] = amplFloat[iCell]/(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell])*calibration);//get cell calibration value 
-      //else
-      fracList[newCellMult] = 0; 
+      //Calculate Fraction
+      if(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell])>0 && GetRecParam()->GetUnfold())
+        fracList[newCellMult] = amplFloat[iCell]/(emcCells.GetCellAmplitude(digitInts[iCell]));//get cell calibration value 
+      else
+        fracList[newCellMult] = 0; 
       newCellMult++;
       }
     }
@@ -447,25 +512,25 @@ void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
       Int_t *parentList =  clust->GetParents(parentMult);
       // fills the ESDCaloCluster
       AliESDCaloCluster * ec = new AliESDCaloCluster() ;
-      ec->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kEMCALClusterv1);
+      ec->SetType(AliVCluster::kEMCALClusterv1);
       ec->SetPosition(xyz);
       ec->SetE(clust->GetEnergy());
                
-         //Distance to the nearest bad crystal
-         ec->SetDistanceToBadChannel(clust->GetDistanceToBadTower()); 
+      //Distance to the nearest bad crystal
+      ec->SetDistanceToBadChannel(clust->GetDistanceToBadTower()); 
 
       ec->SetNCells(newCellMult);
       //Change type of list from short to ushort
       UShort_t *newAbsIdList  = new UShort_t[newCellMult];
-      Double_t *newFracList  = new Double_t[newCellMult];
+      Double_t *newFracList   = new Double_t[newCellMult];
       for(Int_t i = 0; i < newCellMult ; i++) {
         newAbsIdList[i]=absIdList[i];
-        newFracList[i]=fracList[i];
+        newFracList[i] =fracList[i];
       }
       ec->SetCellsAbsId(newAbsIdList);
       ec->SetCellsAmplitudeFraction(newFracList);
-      ec->SetClusterDisp(clust->GetDispersion());
-      ec->SetClusterChi2(-1); //not yet implemented
+      ec->SetDispersion(clust->GetDispersion());
+      ec->SetChi2(-1); //not yet implemented
       ec->SetM02(elipAxis[0]*elipAxis[0]) ;
       ec->SetM20(elipAxis[1]*elipAxis[1]) ;
       ec->SetTOF(clust->GetTime()) ; //time-of-fligh
@@ -487,24 +552,15 @@ void AliEMCALReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree,
 
  delete [] matchedTrack;
 
- esd->SetNumberOfEMCALClusters(nClustersNew);
- //if(nClustersNew != nClusters)
- //printf(" ##### nClusters %i -> new %i ##### \n", nClusters, nClustersNew );
-
  //Fill ESDCaloCluster with PID weights
-  AliEMCALPID *pid = new AliEMCALPID;
-  //pid->SetPrintInfo(kTRUE);
-  pid->SetReconstructor(kTRUE);
-  pid->RunPID(esd);
-  delete pid;
-  
-  delete digits;
-  delete clusters;
-  
-  // printf(" ## AliEMCALReconstructor::FillESD() is ended : ncl %i -> %i ### \n ",nClusters, nClustersNew); 
-
-  //Store EMCAL misalignment matrixes
-  FillMisalMatrixes(esd) ;
+ AliEMCALPID *pid = new AliEMCALPID;
+ //pid->SetPrintInfo(kTRUE);
+ pid->SetReconstructor(kTRUE);
+ pid->RunPID(esd);
+ delete pid;
+    
+ //Store EMCAL misalignment matrixes
+ FillMisalMatrixes(esd) ;
 
 }
 
@@ -513,7 +569,7 @@ void AliEMCALReconstructor::FillMisalMatrixes(AliESDEvent* esd)const{
        //Store EMCAL matrixes in ESD Header
        
        //Check, if matrixes was already stored
-       for(Int_t sm = 0 ; sm < 12; sm++){
+       for(Int_t sm = 0 ; sm < fGeom->GetNumberOfSuperModules(); sm++){
                if(esd->GetEMCALMatrix(sm)!=0)
                        return ;
        }
@@ -524,15 +580,21 @@ void AliEMCALReconstructor::FillMisalMatrixes(AliESDEvent* esd)const{
                return ;
        }
        //Note, that owner of copied marixes will be header
-       char path[255] ;
+  const Int_t bufsize = 255;
+       char path[bufsize] ;
        TGeoHMatrix * m = 0x0;
-       for(Int_t sm = 0; sm < 12; sm++){
-               sprintf(path,"/ALIC_1/XEN1_1/SMOD_%d",sm+1) ; //In Geometry modules numbered 1,2,.,5
-               if(sm >= 10) sprintf(path,"/ALIC_1/XEN1_1/SM10_%d",sm-10+1) ;
+       for(Int_t sm = 0; sm < fGeom->GetNumberOfSuperModules(); sm++){
+               snprintf(path,bufsize,"/ALIC_1/XEN1_1/SMOD_%d",sm+1) ; //In Geometry modules numbered 1,2,.,5
+               if(sm >= 10) snprintf(path,bufsize,"/ALIC_1/XEN1_1/SM10_%d",sm-10+1) ;
                
                if (gGeoManager->CheckPath(path)){
+                       gGeoManager->cd(path);
                        m = gGeoManager->GetCurrentMatrix() ;
+//                     printf("================================================= \n");
+//                     printf("AliEMCALReconstructor::FixMisalMatrixes(), sm %d, \n",sm);
+//                     m->Print("");
                        esd->SetEMCALMatrix(new TGeoHMatrix(*m),sm) ;
+//                     printf("================================================= \n");
                }
                else{
                        esd->SetEMCALMatrix(NULL,sm) ;
@@ -548,8 +610,8 @@ void AliEMCALReconstructor::ReadDigitsArrayFromTree(TTree *digitsTree) const
   // See AliEMCALClusterizer::SetInput(TTree *digitsTree);
   if(fgDigitsArr) {
     // Clear previous digits 
-    fgDigitsArr->Delete();
-    delete fgDigitsArr;
+    fgDigitsArr->Clear("C");
+    //delete fgDigitsArr;
   }
   // Read the digits from the input tree
   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("EMCAL");