]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - FMD/AliFMDReconstructor.cxx
Update of the class ESDMuonFilter. New marcros for creating AOD with muon information...
[u/mrichter/AliRoot.git] / FMD / AliFMDReconstructor.cxx
index ea8e2cd4d3da80ca6663aaad5b9d7485cb9cebaa..bb1717fa1d9921e00cd7d247b2c735cc9a10b563 100644 (file)
 //
 //____________________________________________________________________
 
-#include <AliLog.h>                        // ALILOG_H
+// #include <AliLog.h>                        // ALILOG_H
 // #include <AliRun.h>                        // ALIRUN_H
-#include <AliRunLoader.h>                  // ALIRUNLOADER_H
-#include <AliHeader.h>                     // ALIHEADER_H
-#include <AliGenEventHeader.h>             // ALIGENEVENTHEADER_H
+#include "AliFMDDebug.h"
 #include "AliFMDGeometry.h"                // ALIFMDGEOMETRY_H
 #include "AliFMDParameters.h"              // ALIFMDPARAMETERS_H
 #include "AliFMDDigit.h"                   // ALIFMDDIGIT_H
 #include "AliFMDReconstructor.h"           // ALIFMDRECONSTRUCTOR_H
 #include "AliFMDRawReader.h"               // ALIFMDRAWREADER_H
 #include "AliFMDRecPoint.h"               // ALIFMDMULTNAIIVE_H
-#include "AliESD.h"                       // ALIESD_H
+#include "AliESDEvent.h"                  // ALIESDEVENT_H
+#include "AliESDVertex.h"                 // ALIESDVERTEX_H
 #include <AliESDFMD.h>                    // ALIESDFMD_H
+#include <TMath.h>
+#include <TH1.h>
+#include <TH2.h>
+#include <TFile.h>
 class AliRawReader;
 
 //____________________________________________________________________
@@ -61,9 +64,21 @@ AliFMDReconstructor::AliFMDReconstructor()
     fTreeR(0x0),
     fCurrentVertex(0),
     fESDObj(0x0),
-    fESD(0x0)
+    fNoiseFactor(0),
+    fAngleCorrect(kTRUE),
+    fVertexType(kNoVertex),
+    fESD(0x0),
+    fDiagnostics(kFALSE),
+    fDiagStep1(0), 
+    fDiagStep2(0),
+    fDiagStep3(0),
+    fDiagStep4(0),
+    fDiagAll(0)
 {
   // Make a new FMD reconstructor object - default CTOR.  
+  SetNoiseFactor();
+  SetAngleCorrect();
+  if (AliDebugLevel() > 0) fDiagnostics = kTRUE;
 }
   
 
@@ -75,7 +90,16 @@ AliFMDReconstructor::AliFMDReconstructor(const AliFMDReconstructor& other)
     fTreeR(other.fTreeR),
     fCurrentVertex(other.fCurrentVertex),
     fESDObj(other.fESDObj),
-    fESD(other.fESD)
+    fNoiseFactor(other.fNoiseFactor),
+    fAngleCorrect(other.fAngleCorrect),
+    fVertexType(other.fVertexType),
+    fESD(other.fESD),
+    fDiagnostics(other.fDiagnostics),
+    fDiagStep1(other.fDiagStep1), 
+    fDiagStep2(other.fDiagStep2),
+    fDiagStep3(other.fDiagStep3),
+    fDiagStep4(other.fDiagStep4),
+    fDiagAll(other.fDiagAll) 
 {
   // Copy constructor 
 }
@@ -86,12 +110,21 @@ AliFMDReconstructor&
 AliFMDReconstructor::operator=(const AliFMDReconstructor& other) 
 {
   // Assignment operator
-  fMult   = other.fMult;
-  fNMult = other.fNMult;
-  fTreeR = other.fTreeR;
+  fMult          = other.fMult;
+  fNMult         = other.fNMult;
+  fTreeR         = other.fTreeR;
   fCurrentVertex = other.fCurrentVertex;
-  fESDObj = other.fESDObj;
-  fESD = other.fESD;
+  fESDObj        = other.fESDObj;
+  fNoiseFactor   = other.fNoiseFactor;
+  fAngleCorrect  = other.fAngleCorrect;
+  fVertexType    = other.fVertexType;
+  fESD           = other.fESD;
+  fDiagnostics   = other.fDiagnostics;
+  fDiagStep1     = other.fDiagStep1;
+  fDiagStep2     = other.fDiagStep2;
+  fDiagStep3     = other.fDiagStep3;
+  fDiagStep4     = other.fDiagStep4;
+  fDiagAll       = other.fDiagAll;
   return *this;
 }
 
@@ -106,10 +139,10 @@ AliFMDReconstructor::~AliFMDReconstructor()
 
 //____________________________________________________________________
 void 
-AliFMDReconstructor::Init(AliRunLoader* runLoader
+AliFMDReconstructor::Init() 
 {
   // Initialize the reconstructor 
-  AliDebug(1, Form("Init called with runloader 0x%x", runLoader));
+
   // Initialize the geometry 
   AliFMDGeometry* geom = AliFMDGeometry::Instance();
   geom->Init();
@@ -126,33 +159,35 @@ AliFMDReconstructor::Init(AliRunLoader* runLoader)
   // Create ESD output object 
   fESDObj = new AliESDFMD;
   
-  // Check that we have a run loader
-  if (!runLoader) { 
-    Warning("Init", "No run loader");
-    return;
-  }
-
-  // Check if we can get the header tree 
-  AliHeader* header = runLoader->GetHeader();
-  if (!header) {
-    Warning("Init", "No header");
-    return;
-  }
-
-  // Check if we can get a simulation header 
-  AliGenEventHeader* eventHeader = header->GenEventHeader();
-  if (eventHeader) {
-    TArrayF vtx;
-    eventHeader->PrimaryVertex(vtx);
-    fCurrentVertex = vtx[2];
-    AliDebug(1, Form("Primary vertex Z coordinate for event # %d/%d is %f", 
-                    header->GetRun(), header->GetEvent(), fCurrentVertex));
-    Warning("Init", "no generator event header");
-  }
-  else {
-    Warning("Init", "No generator event header - "
-           "perhaps we get the vertex from ESD?");
-  }
+  // Check if we need diagnostics histograms 
+  if (!fDiagnostics) return;
+  AliInfo("Making diagnostics histograms");
+  fDiagStep1   = new TH2I("diagStep1", "Read ADC vs. Noise surpressed ADC",
+                       1024, -.5, 1023.5, 1024, -.5, 1023.5);
+  fDiagStep1->SetDirectory(0);
+  fDiagStep1->GetXaxis()->SetTitle("ADC (read)");
+  fDiagStep1->GetYaxis()->SetTitle(Form("ADC (noise surpressed %4.f)", 
+                                       fNoiseFactor));
+  fDiagStep2  = new TH2F("diagStep2",  "ADC vs Edep deduced",
+                       1024, -.5, 1023.5, 100, 0, 2);
+  fDiagStep2->SetDirectory(0);
+  fDiagStep2->GetXaxis()->SetTitle("ADC (noise surpressed)");
+  fDiagStep2->GetYaxis()->SetTitle("#Delta E [GeV]");
+  fDiagStep3  = new TH2F("diagStep3",  "Edep vs Edep path corrected",
+                       100, 0., 2., 100, 0., 2.);
+  fDiagStep3->SetDirectory(0);
+  fDiagStep3->GetXaxis()->SetTitle("#Delta E [GeV]");
+  fDiagStep3->GetYaxis()->SetTitle("#Delta E/#Delta x #times #delta x [GeV]");
+  fDiagStep4  = new TH2F("diagStep4",  "Edep vs Multiplicity deduced", 
+                       100, 0., 2., 100, -.1, 19.9);
+  fDiagStep4->SetDirectory(0);
+  fDiagStep4->GetXaxis()->SetTitle("#Delta E/#Delta x #times #delta x [GeV]");
+  fDiagStep4->GetYaxis()->SetTitle("Multiplicity");
+  fDiagAll    = new TH2F("diagAll",    "Read ADC vs Multiplicity deduced", 
+                        1024, -.5, 1023.5, 100, -.1, 19.9);
+  fDiagAll->SetDirectory(0);
+  fDiagAll->GetXaxis()->SetTitle("ADC (read)");
+  fDiagAll->GetYaxis()->SetTitle("Multiplicity");
 }
 
 //____________________________________________________________________
@@ -161,7 +196,7 @@ AliFMDReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* reader,
                                   TTree* digitsTree) const
 {
   // Convert Raw digits to AliFMDDigit's in a tree 
-  AliDebug(1, "Reading raw data into digits tree");
+  AliFMDDebug(2, ("Reading raw data into digits tree"));
   AliFMDRawReader rawRead(reader, digitsTree);
   // rawRead.SetSampleRate(fFMD->GetSampleRate());
   rawRead.Exec();
@@ -169,23 +204,58 @@ AliFMDReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* reader,
 
 //____________________________________________________________________
 void 
-AliFMDReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, 
-                                TTree* clusterTree) const 
+AliFMDReconstructor::GetVertex() const
 {
-  // Reconstruct event from digits in tree 
-  // Get the FMD branch holding the digits. 
-  // FIXME: The vertex may not be known yet, so we may have to move
-  // some of this to FillESD. 
-  AliDebug(1, "Reconstructing from digits in a tree");
-#if 1
+  // Return the vertex to use. 
+  // This is obtained from the ESD object. 
+  // If not found, a warning is issued.
+  fVertexType    = kNoVertex;
+  fCurrentVertex = 0;
   if (fESD) {
     const AliESDVertex* vertex = fESD->GetVertex();
     if (vertex) {
-      AliDebug(1, Form("Got vertex from ESD: %f", vertex->GetZv()));
+      AliFMDDebug(2, ("Got vertex from ESD: %f", vertex->GetZv()));
       fCurrentVertex = vertex->GetZv();
+      fVertexType    = kESDVertex;
+      return;
     }
   }
-#endif  
+  AliWarning("Didn't get any vertex from ESD or generator");
+}
+  
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliRawReader* /*reader*/, TTree*) const
+{
+  // Reconstruct directly from raw data (no intermediate output on
+  // digit tree or rec point tree).  
+  // Parameters: 
+  //   reader  Raw event reader 
+  //   ctree    Not used. 
+  AliError("Method is not used");
+#if 0
+  TClonesArray*   array = new TClonesArray("AliFMDDigit");
+  AliFMDRawReader rawRead(reader, 0);
+  rawRead.ReadAdcs(array);
+  ProcessDigits(array);
+  array->Delete();
+  delete array;
+#endif
+}
+
+//____________________________________________________________________
+void 
+AliFMDReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, 
+                                TTree* clusterTree) const 
+{
+  // Reconstruct event from digits in tree 
+  // Get the FMD branch holding the digits. 
+  // FIXME: The vertex may not be known yet, so we may have to move
+  // some of this to FillESD. 
+  AliFMDDebug(2, ("Reconstructing from digits in a tree"));
+  GetVertex();
+
   TBranch *digitBranch = digitsTree->GetBranch("FMD");
   if (!digitBranch) {
     Error("Exec", "No digit branch for the FMD found");
@@ -201,14 +271,14 @@ AliFMDReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree,
   fTreeR = clusterTree;
   fTreeR->Branch("FMD", &fMult);
   
-  AliDebug(5, "Getting entry 0 from digit branch");
+  AliFMDDebug(5, ("Getting entry 0 from digit branch"));
   digitBranch->GetEntry(0);
   
-  AliDebug(5, "Processing digits");
+  AliFMDDebug(5, ("Processing digits"));
   ProcessDigits(digits);
 
   Int_t written = clusterTree->Fill();
-  AliDebug(10, Form("Filled %d bytes into cluster tree", written));
+  AliFMDDebug(10, ("Filled %d bytes into cluster tree", written));
   digits->Delete();
   delete digits;
 }
@@ -222,13 +292,19 @@ AliFMDReconstructor::ProcessDigits(TClonesArray* digits) const
   // number of corrected ADC counts, and pass it on to the algorithms
   // used. 
   Int_t nDigits = digits->GetEntries();
-  AliDebug(1, Form("Got %d digits", nDigits));
+  AliFMDDebug(1, ("Got %d digits", nDigits));
+  fESDObj->SetNoiseFactor(fNoiseFactor);
+  fESDObj->SetAngleCorrected(fAngleCorrect);
   for (Int_t i = 0; i < nDigits; i++) {
     AliFMDDigit* digit = static_cast<AliFMDDigit*>(digits->At(i));
     AliFMDParameters* param  = AliFMDParameters::Instance();
     // Check that the strip is not marked as dead 
     if (param->IsDead(digit->Detector(), digit->Ring(), 
-                     digit->Sector(), digit->Strip())) continue;
+                     digit->Sector(), digit->Strip())) {
+      AliFMDDebug(10, ("FMD%d%c[%2d,%3d] is dead", digit->Detector(), 
+                       digit->Ring(), digit->Sector(), digit->Strip()));
+      continue;
+    }
 
     // digit->Print();
     // Get eta and phi 
@@ -244,26 +320,30 @@ AliFMDReconstructor::ProcessDigits(TClonesArray* digits) const
     // Make rough multiplicity 
     Double_t mult     = Energy2Multiplicity(digit, edep);
     
-    AliDebug(10, Form("FMD%d%c[%2d,%3d]: "
+    AliFMDDebug(10, ("FMD%d%c[%2d,%3d]: "
                      "ADC: %d, Counts: %d, Energy: %f, Mult: %f", 
                      digit->Detector(), digit->Ring(), digit->Sector(),
                      digit->Strip(), digit->Counts(), counts, edep, mult));
     
     // Create a `RecPoint' on the output branch. 
-    AliFMDRecPoint* m = 
-      new ((*fMult)[fNMult]) AliFMDRecPoint(digit->Detector(), 
-                                           digit->Ring(), 
-                                           digit->Sector(),
-                                           digit->Strip(),
-                                           eta, phi, 
-                                           edep, mult);
-    (void)m; // Suppress warnings about unused variables. 
-    fNMult++;
-
+    if (fMult) {
+      AliFMDRecPoint* m = 
+       new ((*fMult)[fNMult]) AliFMDRecPoint(digit->Detector(), 
+                                             digit->Ring(), 
+                                             digit->Sector(),
+                                             digit->Strip(),
+                                             eta, phi, 
+                                             edep, mult);
+      (void)m; // Suppress warnings about unused variables. 
+      fNMult++;
+    }
+    
     fESDObj->SetMultiplicity(digit->Detector(), digit->Ring(), 
                             digit->Sector(),  digit->Strip(), mult);
     fESDObj->SetEta(digit->Detector(), digit->Ring(), 
                    digit->Sector(),  digit->Strip(), eta);
+
+    if (fDiagAll) fDiagAll->Fill(digit->Counts(), mult);  
   }
 }
 
@@ -276,19 +356,25 @@ AliFMDReconstructor::SubtractPedestal(AliFMDDigit* digit) const
   // load this to subtract a pedestal that was given in a database or
   // something like that. 
 
-  Int_t             counts = 0;
   AliFMDParameters* param  = AliFMDParameters::Instance();
-  Float_t           pedM   = param->GetPedestal(digit->Detector(), 
+  Float_t           ped    = param->GetPedestal(digit->Detector(), 
                                                digit->Ring(), 
                                                digit->Sector(), 
                                                digit->Strip());
-  AliDebug(10, Form("Subtracting pedestal %f from signal %d", 
-                  pedM, digit->Counts()));
-  if (digit->Count3() > 0)      counts = digit->Count3();
-  else if (digit->Count2() > 0) counts = digit->Count2();
-  else                          counts = digit->Count1();
-  counts = TMath::Max(Int_t(counts - pedM), 0);
-  if (counts > 0) AliDebug(10, "Got a hit strip");
+  Float_t           noise  = param->GetPedestalWidth(digit->Detector(), 
+                                                    digit->Ring(), 
+                                                    digit->Sector(), 
+                                                    digit->Strip());
+  AliFMDDebug(15, ("Subtracting pedestal %f from signal %d", 
+                  ped, digit->Counts()));
+  // if (digit->Count3() > 0)      adc = digit->Count3();
+  // else if (digit->Count2() > 0) adc = digit->Count2();
+  // else                          adc = digit->Count1();
+  Int_t adc    = digit->Counts();
+  Int_t counts = TMath::Max(Int_t(adc - ped), 0);
+  if (counts < noise * fNoiseFactor) counts = 0;
+  if (counts > 0) AliFMDDebug(15, ("Got a hit strip"));
+  if (fDiagStep1) fDiagStep1->Fill(adc, counts);
   
   return  UShort_t(counts);
 }
@@ -296,7 +382,7 @@ AliFMDReconstructor::SubtractPedestal(AliFMDDigit* digit) const
 //____________________________________________________________________
 Float_t
 AliFMDReconstructor::Adc2Energy(AliFMDDigit* digit, 
-                               Float_t      /* eta */
+                               Float_t      eta
                                UShort_t     count) const
 {
   // Converts number of ADC counts to energy deposited. 
@@ -315,17 +401,26 @@ AliFMDReconstructor::Adc2Energy(AliFMDDigit* digit,
   //           ADC_channel_size    
   // 
   // is constant and the same for all strips.
-
-  // Double_t theta = 2 * TMath::ATan(TMath::Exp(-eta));
-  // Double_t edep  = TMath::Abs(TMath::Cos(theta)) * fGain * count;
+  if (count <= 0) return 0;
   AliFMDParameters* param = AliFMDParameters::Instance();
   Float_t           gain  = param->GetPulseGain(digit->Detector(), 
                                                digit->Ring(), 
                                                digit->Sector(), 
                                                digit->Strip());
-  Double_t          edep  = count * gain;
-  AliDebug(10, Form("Converting counts %d to energy via factor %f", 
+  AliFMDDebug(15, ("Converting counts %d to energy via factor %f", 
                    count, gain));
+
+  Double_t edep  = count * gain;
+  if (fDiagStep2) fDiagStep2->Fill(count, edep);  
+  if (fAngleCorrect) {
+    Double_t theta = 2 * TMath::ATan(TMath::Exp(-eta));
+    Double_t corr  = TMath::Abs(TMath::Cos(theta));
+    Double_t cedep = corr * edep;
+    AliFMDDebug(10, ("correcting for path %f * %f = %f (eta=%f, theta=%f)",
+                     edep, corr, cedep, eta, theta));
+    if (fDiagStep3) fDiagStep3->Fill(edep, cedep);  
+    edep = cedep;
+  }
   return edep;
 }
 
@@ -352,8 +447,9 @@ AliFMDReconstructor::Energy2Multiplicity(AliFMDDigit* /* digit */,
   Double_t          edepMIP = param->GetEdepMip();
   Float_t           mult    = edep / edepMIP;
   if (edep > 0) 
-    AliDebug(10, Form("Translating energy %f to multiplicity via "
+    AliFMDDebug(15, ("Translating energy %f to multiplicity via "
                     "divider %f->%f", edep, edepMIP, mult));
+  if (fDiagStep4) fDiagStep4->Fill(edep, mult);  
   return mult;
 }
 
@@ -384,74 +480,56 @@ AliFMDReconstructor::PhysicalCoordinates(AliFMDDigit* digit,
 void 
 AliFMDReconstructor::FillESD(TTree*  /* digitsTree */, 
                             TTree*  /* clusterTree */,
-                            AliESD* esd) const
+                            AliESDEvent* esd) const
 {
   // nothing to be done
   // FIXME: The vertex may not be known when Reconstruct is executed,
   // so we may have to move some of that member function here. 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with two trees and one ESD"));
+  AliFMDDebug(2, ("Calling FillESD with two trees and one ESD"));
   // fESDObj->Print();
 
   if (esd) { 
-    AliDebug(1, Form("Writing FMD data to ESD tree"));
+    AliFMDDebug(2, ("Writing FMD data to ESD tree"));
     esd->SetFMDData(fESDObj);
   }
-}
 
+  if (!fDiagnostics || !esd) return;
+  static bool first = true;
+  // This is most likely NOT the event number you'd like to use. It
+  // has nothing to do with the 'real' event number. 
+  // - That's OK.  We just use it for the name of the directory -
+  // nothing else.  Christian
+  Int_t evno = esd->GetEventNumberInFile(); 
+  AliFMDDebug(1, ("Writing diagnostics histograms to FMD.Diag.root/%03d",evno));
+  TFile f("FMD.Diag.root", (first ? "RECREATE" : "UPDATE"));
+  first = false;
+  f.cd(); 
+  TDirectory* d = f.mkdir(Form("%03d", evno), 
+                         Form("Diagnostics histograms for event # %d", evno));
+  d->cd();
+  if (fDiagStep1) fDiagStep1->Write();
+  if (fDiagStep2) fDiagStep2->Write();
+  if (fDiagStep3) fDiagStep3->Write();
+  if (fDiagStep4) fDiagStep4->Write();
+  if (fDiagAll)   fDiagAll->Write();
+  d->Write();
+  f.Write();
+  f.Close();
 
-//____________________________________________________________________
-void 
-AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliRawReader*,TTree*) const 
-{
-  // Cannot be used.  See member function with same name but with 2
-  // TTree arguments.   Make sure you do local reconstrucion 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with loader and tree"));
-  AliError("MayNotUse");
-}
-//____________________________________________________________________
-void 
-AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliRunLoader*) const 
-{
-  // Cannot be used.  See member function with same name but with 2
-  // TTree arguments.   Make sure you do local reconstrucion 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with loader"));
-  AliError("MayNotUse");
-}
-//____________________________________________________________________
-void 
-AliFMDReconstructor::Reconstruct(AliRunLoader*, AliRawReader*) const 
-{
-  // Cannot be used.  See member function with same name but with 2
-  // TTree arguments.   Make sure you do local reconstrucion 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with loader and raw reader"));
-  AliError("MayNotUse");
-}
-//____________________________________________________________________
-void 
-AliFMDReconstructor::FillESD(AliRawReader*,TTree*,AliESD*) const 
-{
-  // Cannot be used.  See member function with same name but with 2
-  // TTree arguments.   Make sure you do local reconstrucion 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with raw reader, tree, and ESD"));
-  AliError("MayNotUse");
-}
-//____________________________________________________________________
-void 
-AliFMDReconstructor::FillESD(AliRunLoader*,AliESD*) const
-{
-  // Cannot be used.  See member function with same name but with 2
-  // TTree arguments.   Make sure you do local reconstrucion 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with loader and ESD"));
-  AliError("MayNotUse");
+  if (fDiagStep1) fDiagStep1->Reset();
+  if (fDiagStep2) fDiagStep2->Reset();
+  if (fDiagStep3) fDiagStep3->Reset();
+  if (fDiagStep4) fDiagStep4->Reset();
+  if (fDiagAll)   fDiagAll->Reset();
 }
+
 //____________________________________________________________________
-void 
-AliFMDReconstructor::FillESD(AliRunLoader*,AliRawReader*,AliESD*) const 
+void
+AliFMDReconstructor::FillESD(AliRawReader*, TTree* clusterTree, 
+                            AliESDEvent* esd) const
 {
-  // Cannot be used.  See member function with same name but with 2
-  // TTree arguments.   Make sure you do local reconstrucion 
-  AliDebug(1, Form("Calling FillESD with loader, raw reader, and ESD"));
-  AliError("MayNotUse");
+  TTree* dummy = 0;
+  FillESD(dummy, clusterTree, esd);
 }
 
 //____________________________________________________________________