]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITSsimulationSSD.cxx
RC12, RC17 violation: suppression
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSsimulationSSD.cxx
index b26997bd9c4437b96efd5ddb79f82b504adc9501..e4293e2ed887065233ca0bf282094f9a4607e0f7 100644 (file)
  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
+
 /* $Id$ */
 
 #include <stdio.h>
 #include <stdlib.h>
-#include <iostream.h>
-#include <iomanip.h>
+#include <Riostream.h>
 #include <TObjArray.h>
 #include <TRandom.h>
-#include <TMath.h>
 
 #include "AliITSmodule.h"
 #include "AliITSMapA2.h"
 #include "AliITSpList.h"
-#include "AliITSresponseSSD.h"
+#include "AliITSCalibrationSSD.h"
 #include "AliITSsegmentationSSD.h"
-#include "AliITSdcsSSD.h"
+//#include "AliITSdcsSSD.h"
 #include "AliITS.h"
+#include "AliITShit.h"
+#include "AliITSdigitSSD.h"
 #include "AliRun.h"
 #include "AliITSgeom.h"
 #include "AliITSsimulationSSD.h"
+#include "AliITSTableSSD.h"
+#include <TF1.h>
+
 
-ClassImp(AliITSsimulationSSD);
+ClassImp(AliITSsimulationSSD)
+////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+//                                                                    //
+// Author: Enrico Fragiacomo                                          //
+//         enrico.fragiacomo@ts.infn.it                               //
+// Last revised: june 2008                                            // 
+//                                                                    //
+// AliITSsimulationSSD is the simulation of SSD.                     //
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-// Version: 0
-// Written by Enrico Fragiacomo
-// July 2000
-//
-// AliITSsimulationSSD is the simulation of SSDs.
 
 //----------------------------------------------------------------------
-AliITSsimulationSSD::AliITSsimulationSSD(){
+AliITSsimulationSSD::AliITSsimulationSSD():AliITSsimulation(),
+                                          //fDCS(0),
+fMapA2(0),
+fIonE(0.0),
+fDifConst(),
+fDriftVel(),
+fTimeResponse(NULL){
     //default Constructor
-
-    fDCS     = 0;
-    fDifConst[0] = fDifConst[1] = 0.0;
-    fDriftVel[0] = fDriftVel[1] = 0.0;
-    fMapA2   = 0;
+    //Inputs:
+    // none.
+    // Outputs:
+    // none.
+    // Return:
+    //  A default construction AliITSsimulationSSD class
 }
 //----------------------------------------------------------------------
-AliITSsimulationSSD::AliITSsimulationSSD(AliITSsegmentation *seg,
-                                         AliITSresponse *resp){
-    // Constructor
-
-    fDCS     = 0;
-    fDifConst[0] = fDifConst[1] = 0.0;
-    fDriftVel[0] = fDriftVel[1] = 0.0;
-    fMapA2   = 0;
-    Init((AliITSsegmentationSSD*)seg,(AliITSresponseSSD*)resp);
+AliITSsimulationSSD::AliITSsimulationSSD(AliITSDetTypeSim* dettyp):
+AliITSsimulation(dettyp),
+//fDCS(0),
+fMapA2(0),
+fIonE(0.0),
+fDifConst(),
+fDriftVel(),
+fTimeResponse(NULL){
+    // Constructor 
+    // Input:
+    //   AliITSDetTypeSim    Pointer to the SSD dettype to be used
+    // Outputs:
+    //   none.
+    // Return
+    //   A standard constructed AliITSsimulationSSD class
+
+  fTimeResponse = new TF1("ftimeresponse",".5*x*exp(1.-.5*x)");
+    Init();
 }
 //----------------------------------------------------------------------
-void AliITSsimulationSSD::Init(AliITSsegmentationSSD *seg,
-                              AliITSresponseSSD *resp){
-    // Constructor
-
-    fSegmentation    = seg;
-    fResponse        = resp;
-    Float_t noise[2] = {0.,0.};
-    fResponse->GetNoiseParam(noise[0],noise[1]); // retrieves noise parameters
-    fDCS             = new AliITSdcsSSD(seg,resp); 
-
-    SetDriftVelocity(); // use default values in .h file
-    SetIonizeE();       // use default values in .h file
-    SetDiffConst();     // use default values in .h file
-    fMapA2           = new AliITSMapA2(fSegmentation);
+void AliITSsimulationSSD::Init(){
+  // Inilizer, Inilizes all of the variable as needed in a standard place.
+  // Input:
+  //   AliITSsegmentationSSD *seg  Pointer to the SSD segmentation to be used
+  //   AliITSCalibrationSSD   *resp Pointer to the SSD responce class to be used
+  // Outputs:
+  //   none.
+  // Return
+  //   none.
+  AliITSsegmentationSSD* seg = (AliITSsegmentationSSD*)GetSegmentationModel(2);
+  
+  SetDriftVelocity(); // use default values in .h file
+  SetIonizeE();       // use default values in .h file
+  SetDiffConst();     // use default values in .h file
+  fpList           = new AliITSpList(2,GetNStrips());
+  fMapA2           = new AliITSMapA2(seg);
 }
 //______________________________________________________________________
 AliITSsimulationSSD& AliITSsimulationSSD::operator=(
-                                                const AliITSsimulationSSD &s){
-    // Operator =
-
-    if(this==&s) return *this;
-
-    this->fDCS         = new AliITSdcsSSD(*(s.fDCS));
-    this->fMapA2       = s.fMapA2;
-    this->fIonE        = s.fIonE;
-    this->fDifConst[0] = s.fDifConst[0];
-    this->fDifConst[1] = s.fDifConst[1];
-    this->fDriftVel[0] = s.fDriftVel[0];
-    this->fDriftVel[1] = s.fDriftVel[1];
-    return *this;
+                                         const AliITSsimulationSSD &s){
+  // Operator =
+
+  if(this==&s) return *this;
+
+  //  this->fDCS         = new AliITSdcsSSD(*(s.fDCS));
+  this->fMapA2       = s.fMapA2;
+  this->fIonE        = s.fIonE;
+  this->fDifConst[0] = s.fDifConst[0];
+  this->fDifConst[1] = s.fDifConst[1];
+  this->fDriftVel[0] = s.fDriftVel[0];
+  this->fDriftVel[1] = s.fDriftVel[1];
+  this->fTimeResponse = s.fTimeResponse;
+  return *this;
 }
+/*
 //______________________________________________________________________
-AliITSsimulationSSD::AliITSsimulationSSD(const AliITSsimulationSSD &source){
-    // copy constructor
+AliITSsimulation& AliITSsimulationSSD::operator=(
+                                         const AliITSsimulation &s){
+  // Operator =
 
-    *this = source;
+  if(this==&s) return *this;
+  Error("AliITSsimulationSSD","Not allowed to make a = with "
+       "AliITSsimulationSSD Using default creater instead");
+  
+  return *this;
+}
+*/
+//______________________________________________________________________
+AliITSsimulationSSD::AliITSsimulationSSD(const AliITSsimulationSSD &source):
+    AliITSsimulation(source),
+fMapA2(source.fMapA2),
+fIonE(source.fIonE),
+fDifConst(),
+fDriftVel(),
+fTimeResponse(source.fTimeResponse){
+  // copy constructor
+  fDifConst[0] = source.fDifConst[0];
+  fDifConst[1] = source.fDifConst[1];
+  fDriftVel[0] = source.fDriftVel[0];
+  fDriftVel[1] = source.fDriftVel[1];
 }
 //______________________________________________________________________
 AliITSsimulationSSD::~AliITSsimulationSSD() {
-    // destructor
-    delete fMapA2;
-    delete fDCS;
+  // destructor
+  delete fMapA2;
+  delete fTimeResponse;
+  //delete fDCS;
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITSsimulationSSD::DigitiseModule(AliITSmodule *mod,
-                                        Int_t dummy0,Int_t dummy1) {
-    // Digitizes hits for one SSD module
-    Int_t module     = mod->GetIndex();
-    AliITSpList *pList = new AliITSpList(2,GetNStrips());
-
-    HitsToAnalogDigits(mod,pList);
-    SDigitToDigit(module,pList);
-
-    delete pList;
+void AliITSsimulationSSD::InitSimulationModule(Int_t module,Int_t event){
+    // Creates maps to build the list of tracks for each sumable digit
+    // Inputs:
+    //   Int_t module    // Module number to be simulated
+    //   Int_t event     // Event number to be simulated
+    // Outputs:
+    //   none.
+    // Return
+    //    none.
+
+    SetModuleNumber(module);
+    SetEventNumber(event);
     fMapA2->ClearMap();
+    fpList->ClearMap();
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITSsimulationSSD::SDigitiseModule(AliITSmodule *mod,Int_t dummy0,
-                                         Int_t dummy1) {
-    // Produces Summable/Analog digits and writes them to the SDigit tree.
-    AliITSpList *pList = new AliITSpList(2,GetNStrips()); 
-
-    HitsToAnalogDigits(mod,pList);
+void AliITSsimulationSSD::FinishSDigitiseModule(){
+    // Does the Sdigits to Digits work
+    // Inputs:
+    //   none.
+    // Outputs:
+    //   none.
+    // Return:
+    //   none.
+
+  FillMapFrompList(fpList);  // need to check if needed here or not????
+  SDigitToDigit(fModule,fpList);
+  fpList->ClearMap();
+  fMapA2->ClearMap();
+}
+//______________________________________________________________________
+void AliITSsimulationSSD::DigitiseModule(AliITSmodule *mod,Int_t,Int_t) {
+  // Digitizes hits for one SSD module
+  SetModuleNumber(mod->GetIndex());
+  
+  HitsToAnalogDigits(mod,fpList);
+  SDigitToDigit(GetModuleNumber(),fpList);
+  
+  fpList->ClearMap();
+  fMapA2->ClearMap();
+}
+//______________________________________________________________________
+void AliITSsimulationSSD::SDigitiseModule(AliITSmodule *mod,Int_t,Int_t) {
+  // Produces Summable/Analog digits and writes them to the SDigit tree. 
 
-    WriteSDigits(pList);
+    HitsToAnalogDigits(mod,fpList);
 
-    delete pList;
+    WriteSDigits(fpList);
+    
+    fpList->ClearMap();
     fMapA2->ClearMap();
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::SDigitToDigit(Int_t module,AliITSpList *pList){
-    // Takes the pList and finishes the digitization.
-
-    FillMapFrompList(pList);
-
-    ApplyNoise(pList,module);
-    ApplyCoupling(pList,module);
-
-    ChargeToSignal(pList);
+  // Takes the pList and finishes the digitization.
+  
+  ApplyNoise(pList,module);
+  ApplyCoupling(pList,module);
+  ApplyDeadChannels(module);
+  
+  ChargeToSignal(module,pList);
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::HitsToAnalogDigits(AliITSmodule *mod,
-                                            AliITSpList *pList){
+                                             AliITSpList *pList){
     // Loops over all hits to produce Analog/floating point digits. This
     // is also the first task in producing standard digits.
-    Int_t indexRange[4] = {0,0,0,0};
-    static Bool_t first = kTRUE;
-    Int_t lasttrack     = -2;
-    Int_t idtrack       = -2;
-    Double_t x0=0.0, y0=0.0, z0=0.0;
-    Double_t x1=0.0, y1=0.0, z1=0.0;
-    Double_t de=0.0;
-    Int_t module = mod->GetIndex();
-
-    TObjArray *hits = mod->GetHits();
-    Int_t nhits     = hits->GetEntriesFast();
-    if (nhits<=0) return;
-
-    module = mod->GetIndex();
-    if ( mod->GetLayer() == 6 ) GetSegmentation()->SetLayer(6);
-    if ( mod->GetLayer() == 5 ) GetSegmentation()->SetLayer(5);
-
-    for(Int_t i=0; i<nhits; i++) {    
-       // LineSegmentL returns 0 if the hit is entering
-       // If hits is exiting returns positions of entering and exiting hits
-       // Returns also energy loss
-
-       if (mod->LineSegmentL(i, x0, x1, y0, y1, z0, z1, de, idtrack)) {
-           HitToDigit(module, x0, y0, z0, x1, y1, z1, de, indexRange, first);
-       
-           if (lasttrack != idtrack || i==(nhits-1)) {
-               GetList(idtrack,i,module,pList,indexRange);
-               first=kTRUE;
-           } // end if
-           lasttrack=idtrack;
-       } // end if
-    }  // end loop over hits
-    return;
+  Int_t lasttrack     = -2;
+  Int_t idtrack       = -2;
+  Double_t x0=0.0, y0=0.0, z0=0.0;
+  Double_t x1=0.0, y1=0.0, z1=0.0;
+  Double_t de=0.0;
+  Int_t module = mod->GetIndex();
+  Double_t tof = 0.;
+  
+  
+  AliITSsegmentationSSD* seg = (AliITSsegmentationSSD*)GetSegmentationModel(2);
+  
+  TObjArray *hits = mod->GetHits();
+  Int_t nhits     = hits->GetEntriesFast();
+  if (nhits<=0) return;
+  AliITSTableSSD * tav = new AliITSTableSSD(GetNStrips());
+  module = mod->GetIndex();
+  if ( mod->GetLayer() == 6 ) seg->SetLayer(6);
+  if ( mod->GetLayer() == 5 ) seg->SetLayer(5);
+  for(Int_t i=0; i<nhits; i++) {    
+    // LineSegmentL returns 0 if the hit is entering
+    // If hits is exiting returns positions of entering and exiting hits
+    // Returns also energy loss
+    if(GetDebug(4)){
+      cout << i << " ";
+      cout << mod->GetHit(i)->GetXL() << " "<<mod->GetHit(i)->GetYL();
+      cout << " " << mod->GetHit(i)->GetZL();
+      cout << endl;
+    } // end if
+    if (mod->LineSegmentL(i, x0, x1, y0, y1, z0, z1, de, idtrack)) {
+
+      // Scale down dE/dx according to the hit's TOF wrt to the trigger
+      // Necessary for pileup simulation
+      // EF - 21/04/09
+      tof = mod->GetHit(i)->GetTOF();
+      tof *= 1.E+6; // convert time in microsecond
+      if(tof<2.) de = de * fTimeResponse->Eval(-1.*tof+2.);
+      else de = 0.;
+      //
+
+      HitToDigit(module, x0, y0, z0, x1, y1, z1, de,tav);
+      if (lasttrack != idtrack || i==(nhits-1)) {
+       GetList(idtrack,i,module,pList,tav);
+      } // end if
+      lasttrack=idtrack;
+    } // end if
+  }  // end loop over hits
+  delete tav; tav=0;
+  return;
 }
 //----------------------------------------------------------------------
 void AliITSsimulationSSD::HitToDigit(Int_t module, Double_t x0, Double_t y0, 
-                                    Double_t z0, Double_t x1, Double_t y1, 
-                                    Double_t z1, Double_t de,
-                                    Int_t *indexRange, Bool_t first) {
-    // Turns hits in SSD module into one or more digits.
-
-    Float_t tang[2] = {0.0,0.0};
-    GetSegmentation()->Angles(tang[0], tang[1]);//stereo<<->tan(stereo)~=stereo
-    Double_t x, y, z;
-    Double_t dex=0.0, dey=0.0, dez=0.0;
-    Double_t pairs; // pair generation energy per step.
-    Double_t sigma[2] = {0.,0.};// standard deviation of the diffusion gaussian
-    Double_t tdrift[2] = {0.,0.}; // time of drift
-    Double_t w;
-    Double_t inf[2], sup[2], par0[2];                 
-
-    // Steps in the module are determined "manually" (i.e. No Geant)
-    // NumOfSteps divide path between entering and exiting hits in steps 
-    Int_t numOfSteps = NumOfSteps(x1, y1, z1, dex, dey, dez);
+                                     Double_t z0, Double_t x1, Double_t y1, 
+                                     Double_t z1, Double_t de,
+                                     AliITSTableSSD *tav) {
+  
+  // hit to digit conversion
   
-    // Enery loss is equally distributed among steps
-    de    = de/numOfSteps;
-    pairs = de/GetIonizeE(); // e-h pairs generated
-
-    for(Int_t j=0; j<numOfSteps; j++) {     // stepping
-       x = x0 + (j+0.5)*dex;
-       y = y0 + (j+0.5)*dey;
-       if ( y > (GetSegmentation()->Dy()/2+10)*1.0E-4 ) {
-           // check if particle is within the detector
-           Warning("HitToDigit","hit out of detector y0=%e,y=%e,dey=%e,j =%e",
-                   y0,y,dey,j);
-           return;
-       } // end if
-       z = z0 + (j+0.5)*dez;
-
-       // calculate drift time
-       // y is the minimum path
-       tdrift[0] = (y+(GetSegmentation()->Dy()*1.0E-4)/2)/GetDriftVelocity(0);
-       tdrift[1] = ((GetSegmentation()->Dy()*1.0E-4)/2-y)/GetDriftVelocity(1);
-
-       for(Int_t k=0; k<2; k++) {   // both sides    remember: 0=Pside 1=Nside
-
-           tang[k]=TMath::Tan(tang[k]);
-
-           // w is the coord. perpendicular to the strips
-           if(k==0) {
-               w = (x+(GetSegmentation()->Dx()*1.0E-4)/2) -
-                   (z+(GetSegmentation()->Dz()*1.0E-4)/2)*tang[k]; 
-           }else{
-               w = (x+(GetSegmentation()->Dx()*1.0E-4)/2) + 
-                   (z-(GetSegmentation()->Dz()*1.0E-4)/2)*tang[k];
-           } // end if
-           w /= (GetStripPitch()*1.0E-4); // w is converted in units of pitch
-
-           if((w<(-0.5)) || (w>(GetNStrips()-0.5))) {
-               // this check rejects hits in regions not covered by strips
-               // 0.5 takes into account boundaries 
-               return; // There are dead region on the SSD sensitive volume.
-               /*
-               if(k==0) Warning("HitToDigit",
-                                "no strip in this region of P side");
-               else Warning"HitToDigit","no strip in this region of N side");
-               return;
-               */
-           } // end if
-
-           // sigma is the standard deviation of the diffusion gaussian
-           if(tdrift[k]<0) return;
-           sigma[k] = TMath::Sqrt(2*GetDiffConst(k)*tdrift[k]);
-           sigma[k] /= (GetStripPitch()*1.0E-4);  //units of Pitch
-           if(sigma[k]==0.0) {         
-               Error("HitToDigit"," sigma[%d]=0",k);
-               exit(0);
-           } // end if
-
-           par0[k] = pairs;
-           // we integrate the diffusion gaussian from -3sigma to 3sigma 
-           inf[k] = w - 3*sigma[k]; // 3 sigma from the gaussian average  
-           sup[k] = w + 3*sigma[k]; // 3 sigma from the gaussian average
-                                    // IntegrateGaussian does the actual
-                                     // integration of diffusion gaussian
-           IntegrateGaussian(k, par0[k], w, sigma[k], inf[k], sup[k], 
-                             indexRange, first);
-       }  // end for loop over side (0=Pside, 1=Nside)      
-    } // end stepping
-    //delete seg;
+  AliITSsegmentationSSD* seg = (AliITSsegmentationSSD*)GetSegmentationModel(2);
+  // Turns hits in SSD module into one or more digits.
+  //Float_t tang[2] = {0.0,0.0};
+  //seg->Angles(tang[0], tang[1]);//stereo<<->tan(stereo)~=stereo
+  Double_t x, y, z;
+  Double_t dex=0.0, dey=0.0, dez=0.0; 
+  Double_t pairs; // pair generation energy per step.
+  Double_t sigma[2] = {0.,0.};// standard deviation of the diffusion gaussian
+  Double_t tdrift[2] = {0.,0.}; // time of drift
+  Double_t w;
+  Double_t inf[2], sup[2], par0[2];                 
+  
+  // Steps in the module are determined "manually" (i.e. No Geant)
+  // NumOfSteps divide path between entering and exiting hits in steps 
+  Int_t numOfSteps = NumOfSteps(x1, y1, z1, dex, dey, dez);
+  // Enery loss is equally distributed among steps
+  de    = de/numOfSteps;
+  pairs = de/GetIonizeE(); // e-h pairs generated
+
+  //-----------------------------------------------------
+  // stepping
+  //-----------------------------------------------------
+  for(Int_t j=0; j<numOfSteps; j++) {     // stepping
+
+    x = x0 + (j+0.5)*dex;
+    y = y0 + (j+0.5)*dey;
+    if ( y > (seg->Dy()/2+10)*1.0E-4 ) {
+      // check if particle is within the detector
+      Warning("HitToDigit",
+             "hit out of detector y0=%e,y=%e,dey=%e,j =%d module=%d,  exceed=%e",
+             y0,y,dey,j,module, y-(seg->Dy()/2+10)*1.0E-4);
+      return;
+    } // end if
+    z = z0 + (j+0.5)*dez;
+
+    if(GetDebug(4)) cout <<"HitToDigit "<<x<<" "<<y<<" "<<z<< " "
+                        <<dex<<" "<<dey<<" "<<dez<<endl;
+
+    if(seg->GetLayer()==6) {
+      y=-y; // Lay6 module has sensor up-side-down!!!
+    }
+    
+    // w is the coord. perpendicular to the strips
+    //    Float_t xp=x*1.e+4,zp=z*1.e+4; // microns    
+    Float_t xp=x,zp=z; 
+    seg->GetPadTxz(xp,zp);
+
+    Int_t k;
+    //---------------------------------------------------------
+    // Pside
+    //------------------------------------------------------------
+    k=0;
+    
+    // calculate drift time
+    // y is the minimum path
+    tdrift[0] = (y+(seg->Dy()*1.0E-4)/2)/GetDriftVelocity(0);
+    
+    w = xp; // P side strip number
+    
+    if((w<(-0.5)) || (w>(GetNStrips()-0.5))) {
+      // this check rejects hits in regions not covered by strips
+      // 0.5 takes into account boundaries 
+      if(GetDebug(4)) cout << "Dead SSD region, x,z="<<x<<","<<z<<endl;
+      return; // There are dead region on the SSD sensitive volume!!!
+    } // end if
+    
+      // sigma is the standard deviation of the diffusion gaussian
+    if(tdrift[k]<0) return;
+    
+    sigma[k] = TMath::Sqrt(2*GetDiffConst(k)*tdrift[k]);
+    sigma[k] /= (GetStripPitch()*1.0E-4);  //units of Pitch
+    
+    if(sigma[k]==0.0) {        
+      Error("HitToDigit"," sigma[%d]=0",k);
+      exit(0);
+    } // end if
+    
+    par0[k] = pairs;
+    // we integrate the diffusion gaussian from -3sigma to 3sigma 
+    inf[k] = w - 3*sigma[k]; // 3 sigma from the gaussian average  
+    sup[k] = w + 3*sigma[k]; // 3 sigma from the gaussian average
+    // IntegrateGaussian does the actual
+    // integration of diffusion gaussian
+    IntegrateGaussian(k, par0[k], w, sigma[k], inf[k], sup[k],tav);
+    
+    //------------------------------------------------------
+    // end Pside
+    //-------------------------------------------------------
+    
+    //------------------------------------------------------
+    // Nside
+    //-------------------------------------------------------
+    k=1;
+    tdrift[1] = ((seg->Dy()*1.0E-4)/2-y)/GetDriftVelocity(1);
+    
+    //tang[k]=TMath::Tan(tang[k]);
+    
+    w = zp; // N side strip number
+    
+    if((w<(-0.5)) || (w>(GetNStrips()-0.5))) {
+      // this check rejects hits in regions not covered by strips
+      // 0.5 takes into account boundaries 
+      if(GetDebug(4)) cout << "Dead SSD region, x,z="<<x<<","<<z<<endl;
+      return; // There are dead region on the SSD sensitive volume.
+    } // end if
+    
+      // sigma is the standard deviation of the diffusion gaussian
+    if(tdrift[k]<0) return;
+    
+    sigma[k] = TMath::Sqrt(2*GetDiffConst(k)*tdrift[k]);
+    sigma[k] /= (GetStripPitch()*1.0E-4);  //units of Pitch
+    
+    if(sigma[k]==0.0) {        
+      Error("HitToDigit"," sigma[%d]=0",k);
+      exit(0);
+    } // end if
+    
+    par0[k] = pairs;
+    // we integrate the diffusion gaussian from -3sigma to 3sigma 
+    inf[k] = w - 3*sigma[k]; // 3 sigma from the gaussian average  
+    sup[k] = w + 3*sigma[k]; // 3 sigma from the gaussian average
+    // IntegrateGaussian does the actual
+    // integration of diffusion gaussian
+    IntegrateGaussian(k, par0[k], w, sigma[k], inf[k], sup[k],tav);
+    
+    //-------------------------------------------------
+    // end Nside
+    //-------------------------------------------------
+    
+    
+  } // end stepping
 }
+
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::ApplyNoise(AliITSpList *pList,Int_t module){
-    // Apply Noise.
-    Int_t    k,ix;
-    Double_t signal,noise;
-    Double_t noiseP[2] = {0.,0.};
-    Float_t a,b;
-
-    fResponse->GetNoiseParam(a,b); // retrieves noise parameters
-    noiseP[0] = (Double_t) a; noiseP[1] = (Double_t) b;
-    for(k=0;k<2;k++){                    // both sides (0=Pside, 1=Nside)
-       for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){      // loop over strips
-           noise  = gRandom->Gaus(0,noiseP[k]);// get noise to signal
-           signal = noise + fMapA2->GetSignal(k,ix);//get signal from map
-           if(signal<0.) signal=0.0;           // in case noise is negative...
-           fMapA2->SetHit(k,ix,signal); // give back signal to map
-           if(signal>0.0) pList->AddNoise(k,ix,module,noise);
-       } // loop over strip 
-    } // loop over k (P or N side)
+  // Apply Noise.
+  Int_t ix;
+  Double_t signal,noise;
+  AliITSCalibrationSSD* res =(AliITSCalibrationSSD*)GetCalibrationModel(module);
+   
+  // Pside
+  for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){      // loop over strips
+    
+    // noise is gaussian
+    noise  = (Double_t) gRandom->Gaus(0,res->GetNoiseP(ix));
+    
+    // need to calibrate noise 
+    // NOTE. noise from the calibration database comes uncalibrated, 
+    // it needs to be calibrated in order to be added
+    // to the signal. It will be decalibrated later on together with the noise    
+    noise *= (Double_t) res->GetGainP(ix); 
+    
+    // noise comes in ADC channels from the calibration database
+    // It needs to be converted back to electronVolts
+    noise /= res->GetSSDDEvToADC(1.);
+    
+    // Finally, noise is added to the signal
+    signal = noise + fMapA2->GetSignal(0,ix);//get signal from map
+    fMapA2->SetHit(0,ix,signal); // give back signal to map
+    if(signal>0.0) pList->AddNoise(0,ix,module,noise);
+  } // loop over strip 
+  
+    // Nside
+  for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){      // loop over strips
+    noise  = (Double_t) gRandom->Gaus(0,res->GetNoiseN(ix));// give noise to signal
+    noise *= (Double_t) res->GetGainN(ix); 
+    noise /= res->GetSSDDEvToADC(1.);
+    signal = noise + fMapA2->GetSignal(1,ix);//get signal from map
+    fMapA2->SetHit(1,ix,signal); // give back signal to map
+    if(signal>0.0) pList->AddNoise(1,ix,module,noise);
+  } // loop over strip 
+  
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::ApplyCoupling(AliITSpList *pList,Int_t module) {
-    // Apply the effect of electronic coupling between channels
-    Int_t ix;
-    Double_t signalLeft=0, signalRight=0,signal=0;
-
-    for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){
-       // P side coupling
-       if(ix>0.)signalLeft = fMapA2->GetSignal(0,ix-1)*fDCS->GetCouplingPL();
-       else signalLeft = 0.0;
-       if(ix<(GetNStrips()-1)) signalRight = fMapA2->GetSignal(0,ix+1)*
-                                                        fDCS->GetCouplingPR();
-       else signalRight = 0.0;
-       signal = signalLeft + signalRight;
-       fMapA2->AddSignal(0,ix,signal);
-       if(signal>0.0) pList->AddNoise(0,ix,module,signal);
-
-       signalLeft = signalRight = signal = 0.0;
-       // N side coupling
-       if(ix>0.) signalLeft = fMapA2->GetSignal(1,ix-1)*fDCS->GetCouplingNL();
-       else signalLeft = 0.0;
-       if(ix<(GetNStrips()-1)) signalRight = fMapA2->GetSignal(1,ix+1)*
-                                                         fDCS->GetCouplingNR();
-       else signalRight = 0.0;
-       signal = signalLeft + signalRight;
-       fMapA2->AddSignal(1,ix,signal);
-       if(signal>0.0) pList->AddNoise(1,ix,module,signal);
-    } // loop over strips 
+  // Apply the effect of electronic coupling between channels
+  Int_t ix;
+  Double_t signal=0;
+  //AliITSCalibrationSSD* res =(AliITSCalibrationSSD*)GetCalibrationModel(module);
+  AliITSSimuParam* res = fDetType->GetSimuParam();
+    
+  Double_t *contrLeft  = new Double_t[GetNStrips()];
+  Double_t *contrRight = new Double_t[GetNStrips()];
+  
+  // P side coupling
+  for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){
+    if(ix>0) contrLeft[ix] = fMapA2->GetSignal(0,ix-1)*res->GetSSDCouplingPL();
+    else contrLeft[ix] = 0.0;
+    if(ix<(GetNStrips()-1)) contrRight[ix] = fMapA2->GetSignal(0,ix+1)*res->GetSSDCouplingPR();
+    else contrRight[ix] = 0.0;
+  } // loop over strips 
+  
+  for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){
+    signal = contrLeft[ix] + contrRight[ix] - res->GetSSDCouplingPL() * fMapA2->GetSignal(0,ix)
+      - res->GetSSDCouplingPR() * fMapA2->GetSignal(0,ix);
+    fMapA2->AddSignal(0,ix,signal);
+    if(signal>0.0) pList->AddNoise(0,ix,module,signal);
+  } // loop over strips 
+  
+  // N side coupling
+  for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){
+    if(ix>0) contrLeft[ix] = fMapA2->GetSignal(1,ix-1)*res->GetSSDCouplingNL();
+    else contrLeft[ix] = 0.0;
+    if(ix<(GetNStrips()-1)) contrRight[ix] = fMapA2->GetSignal(1,ix+1)*res->GetSSDCouplingNR();
+    else contrRight[ix] = 0.0;
+  } // loop over strips 
+  
+  for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++){
+    signal = contrLeft[ix] + contrRight[ix] - res->GetSSDCouplingNL() * fMapA2->GetSignal(0,ix)
+      - res->GetSSDCouplingNR() * fMapA2->GetSignal(0,ix);
+    fMapA2->AddSignal(1,ix,signal);
+    if(signal>0.0) pList->AddNoise(1,ix,module,signal);
+  } // loop over strips 
+  
+
+  delete [] contrLeft;
+  delete [] contrRight; 
 }
+
+//______________________________________________________________________
+void AliITSsimulationSSD::ApplyDeadChannels(Int_t module) {
+  // Kill dead channels setting gain to zero
+
+  AliITSCalibrationSSD* res = (AliITSCalibrationSSD*)GetCalibrationModel(module);
+
+  for(Int_t i=0;i<GetNStrips();i++){
+
+    if(res->IsPChannelBad(i)) res->SetGainP(i,0.0);
+    if(res->IsNChannelBad(i)) res->SetGainN(i,0.0);
+
+  } // loop over strips 
+
+}
+
 //______________________________________________________________________
 Float_t AliITSsimulationSSD::F(Float_t av, Float_t x, Float_t s) {
     // Computes the integral of a gaussian using Error Function
@@ -330,9 +523,9 @@ Float_t AliITSsimulationSSD::F(Float_t av, Float_t x, Float_t s) {
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::IntegrateGaussian(Int_t k,Double_t par, Double_t w,
-                                           Double_t sigma, 
-                                           Double_t inf, Double_t sup,
-                                           Int_t *indexRange, Bool_t first) {
+                                            Double_t sigma, 
+                                            Double_t inf, Double_t sup,
+                                            AliITSTableSSD *tav) {
     // integrate the diffusion gaussian
     // remind: inf and sup are w-3sigma and w+3sigma
     //         we could define them here instead of passing them
@@ -344,90 +537,71 @@ void AliITSsimulationSSD::IntegrateGaussian(Int_t k,Double_t par, Double_t w,
     // Watch that we only involve at least two strips
     // Numbers greater than 2 of strips in a cluster depend on
     //  geometry of the track and delta rays, not charge diffusion!   
-  
-    Double_t strip = TMath::Floor(w);         // clostest strip on the left
 
-    if ( TMath::Abs((strip - w)) < 0.5) { 
-       // gaussian mean is closer to strip on the left
-       a = inf;                         // integration starting point
-       if((strip+0.5)<=sup) {
-           // this means that the tail of the gaussian goes beyond
-           // the middle point between strips ---> part of the signal
-           // is given to the strip on the right
-           b = strip + 0.5;               // integration stopping point
-           dXCharge1 = F( w, b, sigma) - F(w, a, sigma);
-           dXCharge2 = F( w, sup, sigma) - F(w ,b, sigma); 
-       }else { 
-           // this means that all the charge is given to the strip on the left
-           b = sup;
-           dXCharge1 = 0.9973;   // gaussian integral at 3 sigmas
-           dXCharge2 = 0.0;
-       } // end if
-
-       dXCharge1 = par * dXCharge1;// normalize by mean of number of carriers
-       dXCharge2 = par * dXCharge2;
-
-       // for the time being, signal is the charge
-       // in ChargeToSignal signal is converted in ADC channel
-       fMapA2->AddSignal(k,(Int_t)strip,dXCharge1);
-       if(((Int_t) strip) < (GetNStrips()-1)) {
-           // strip doesn't have to be the last (remind: last=GetNStrips()-1)
-           // otherwise part of the charge is lost
-           fMapA2->AddSignal(k,((Int_t)strip+1),dXCharge2);
-       } // end if
-    
-       if(dXCharge1 > 1.) {
-           if (first) {
-               indexRange[k*2+0] = indexRange[k*2+1]=(Int_t) strip;
-               first=kFALSE;
-           } // end if first
-
-           indexRange[k*2+0]=TMath::Min(indexRange[k*2+0],(Int_t) strip);
-           indexRange[k*2+1]=TMath::Max(indexRange[k*2+1],(Int_t) strip);
-       }      // dXCharge > 1 e-
+    Double_t strip = TMath::Floor(w);         // closest strip on the left
 
+    if ( TMath::Abs((strip - w)) < 0.5) { 
+        // gaussian mean is closer to strip on the left
+        a = inf;                         // integration starting point
+        if((strip+0.5)<=sup) {
+            // this means that the tail of the gaussian goes beyond
+            // the middle point between strips ---> part of the signal
+            // is given to the strip on the right
+            b = strip + 0.5;               // integration stopping point
+            dXCharge1 = F( w, b, sigma) - F(w, a, sigma);
+            dXCharge2 = F( w, sup, sigma) - F(w ,b, sigma); 
+        }else { 
+            // this means that all the charge is given to the strip on the left
+            b = sup;
+            dXCharge1 = 0.9973;   // gaussian integral at 3 sigmas
+            dXCharge2 = 0.0;
+        } // end if
+        dXCharge1 = par * dXCharge1;// normalize by mean of number of carriers
+        dXCharge2 = par * dXCharge2;
+
+        // for the time being, signal is the charge
+        // in ChargeToSignal signal is converted in ADC channel
+        fMapA2->AddSignal(k,(Int_t)strip,dXCharge1);
+        tav->Add(k,(Int_t)strip);
+        if(((Int_t) strip) < (GetNStrips()-1)) {
+            // strip doesn't have to be the last (remind: last=GetNStrips()-1)
+            // otherwise part of the charge is lost
+            fMapA2->AddSignal(k,((Int_t)strip+1),dXCharge2);
+            tav->Add(k,((Int_t)(strip+1)));
+        } // end if
     }else{
-       // gaussian mean is closer to strip on the right
-       strip++;     // move to strip on the rigth
-       b = sup;     // now you know where to stop integrating
-       if((strip-0.5)>=inf) { 
-           // tail of diffusion gaussian on the left goes left of
-           // middle point between strips
-           a = strip - 0.5;        // integration starting point
-           dXCharge1 = F(w, b, sigma) - F(w, a, sigma);
-           dXCharge2 = F(w, a, sigma) - F(w, inf, sigma);
-       }else {
-           a = inf;
-           dXCharge1 = 0.9973;   // gaussian integral at 3 sigmas
-           dXCharge2 = 0.0;
-       } // end if
-    
-       dXCharge1 = par * dXCharge1;    // normalize by means of carriers
-       dXCharge2 = par * dXCharge2;
-
-       // for the time being, signal is the charge
-       // in ChargeToSignal signal is converted in ADC channel
-       fMapA2->AddSignal(k,(Int_t)strip,dXCharge1);
-       if(((Int_t) strip) > 0) {
-           // strip doesn't have to be the first
-           // otherwise part of the charge is lost
-           fMapA2->AddSignal(k,((Int_t)strip-1),dXCharge2);
-       } // end if
-    
-       if(dXCharge1 > 1.) {
-           if (first) {
-               indexRange[k*2+0]=indexRange[k*2+1]=(Int_t) strip;
-               first=kFALSE;
-           } // end if first
-
-           indexRange[k*2+0]=TMath::Min(indexRange[k*2+0],(Int_t) strip);
-           indexRange[k*2+1]=TMath::Max(indexRange[k*2+1],(Int_t) strip);
-       }      // dXCharge > 1 e-
+        // gaussian mean is closer to strip on the right
+        strip++;     // move to strip on the rigth
+        b = sup;     // now you know where to stop integrating
+        if((strip-0.5)>=inf) { 
+            // tail of diffusion gaussian on the left goes left of
+            // middle point between strips
+            a = strip - 0.5;        // integration starting point
+            dXCharge1 = F(w, b, sigma) - F(w, a, sigma);
+            dXCharge2 = F(w, a, sigma) - F(w, inf, sigma);
+        }else {
+            a = inf;
+            dXCharge1 = 0.9973;   // gaussian integral at 3 sigmas
+            dXCharge2 = 0.0;
+        } // end if
+        dXCharge1 = par * dXCharge1;    // normalize by means of carriers
+        dXCharge2 = par * dXCharge2;
+        // for the time being, signal is the charge
+        // in ChargeToSignal signal is converted in ADC channel
+        fMapA2->AddSignal(k,(Int_t)strip,dXCharge1);
+        tav->Add(k,(Int_t)strip);
+        if(((Int_t) strip) > 0) {
+            // strip doesn't have to be the first
+            // otherwise part of the charge is lost
+            fMapA2->AddSignal(k,((Int_t)strip-1),dXCharge2);
+            tav->Add(k,((Int_t)(strip-1)));
+        } // end if
     } // end if
 }
 //______________________________________________________________________
 Int_t AliITSsimulationSSD::NumOfSteps(Double_t x, Double_t y, Double_t z,
-                                Double_t & dex,Double_t & dey,Double_t & dez){
+                                      Double_t &dex,Double_t &dey,
+                                      Double_t &dez){
     // number of steps
     // it also returns steps for each coord
     //AliITSsegmentationSSD *seg = new AliITSsegmentationSSD();
@@ -437,71 +611,103 @@ Int_t AliITSsimulationSSD::NumOfSteps(Double_t x, Double_t y, Double_t z,
     Int_t numOfSteps = (Int_t) (TMath::Sqrt(x*x+y*y+z*z)/step); 
 
     if (numOfSteps < 1) numOfSteps = 1;       // one step, at least
+    //numOfSteps=1;
 
     // we could condition the stepping depending on the incident angle
     // of the track
     dex = x/numOfSteps;
     dey = y/numOfSteps;
     dez = z/numOfSteps;
-
+    
     return numOfSteps;
 }
 //----------------------------------------------------------------------
 void AliITSsimulationSSD::GetList(Int_t label,Int_t hit,Int_t mod,
-                                 AliITSpList *pList,Int_t *indexRange) {
+                                  AliITSpList *pList,AliITSTableSSD *tav) {
     // loop over nonzero digits
     Int_t ix,i;
     Double_t signal=0.;
 
     for(Int_t k=0; k<2; k++) {
-       for(ix=indexRange[k*2+0];ix<indexRange[k*2+1]+1;ix++){
-//         if(indexRange[k*2+0]<indexRange[k*2+1]) 
-               signal = fMapA2->GetSignal(k,ix);
-               if(signal==0.0) continue;
-               // check the signal magnitude
-               for(i=0;i<pList->GetNSignals(k,ix);i++) 
-                   signal -= pList->GetTSignal(k,ix,i);
-               //  compare the new signal with already existing list
-               pList->AddSignal(k,ix,label,hit,mod,signal);
-       } // end of loop pixels in x
-    } // end of loop over pixels in z
+        ix=tav->Use(k);
+        while(ix>-1){
+            signal = fMapA2->GetSignal(k,ix);
+            if(signal==0.0) {
+                ix=tav->Use(k);
+                continue;
+            } // end if signal==0.0
+            // check the signal magnitude
+            for(i=0;i<pList->GetNSignals(k,ix);i++){
+                signal -= pList->GetTSignal(k,ix,i);
+            } // end for i
+            //  compare the new signal with already existing list
+            if(signal>0)pList->AddSignal(k,ix,label,hit,mod,signal);
+            ix=tav->Use(k);
+        } // end of loop on strips
+    } // end of loop on P/N side
+    tav->Clear();
 }
 //----------------------------------------------------------------------
-void AliITSsimulationSSD::ChargeToSignal(AliITSpList *pList) {
+void AliITSsimulationSSD::ChargeToSignal(Int_t module,AliITSpList *pList) {
     // charge to signal
     static AliITS *aliITS = (AliITS*)gAlice->GetModule("ITS");
     Float_t threshold = 0.;
-    Int_t   digits[3], tracks[3],hits[3],j1;
+    Int_t size = AliITSdigitSSD::GetNTracks();
+    Int_t * digits = new Int_t[size];
+    Int_t * tracks = new Int_t[size];
+    Int_t * hits = new Int_t[size];
+    Int_t j1;
     Float_t charges[3] = {0.0,0.0,0.0};
     Float_t signal;
-    Float_t noise[2] = {0.,0.};
-
-    ((AliITSresponseSSD*)fResponse)->GetNoiseParam(noise[0],noise[1]);
+    AliITSCalibrationSSD* res =(AliITSCalibrationSSD*)GetCalibrationModel(module);
+    AliITSSimuParam* simpar = fDetType->GetSimuParam();
 
     for(Int_t k=0;k<2;k++){         // both sides (0=Pside, 1=Nside)
-       // Threshold for zero-suppression
-       // It can be defined in AliITSresponseSSD
-       //             threshold = (Float_t)fResponse->MinVal(k);
-       // I prefer to think adjusting the threshold "manually", looking
-       // at the scope, and considering noise standard deviation
-       threshold = 4.0*noise[k]; // 4 times noise is a choice
-       for(Int_t ix=0;ix<GetNStrips();ix++){     // loop over strips
-           if(fMapA2->GetSignal(k,ix) <= threshold) continue;
-           // convert to ADC signal
-           signal = ((AliITSresponseSSD*)fResponse)->DEvToADC(
-                                                  fMapA2->GetSignal(k,ix));
-           if(signal>1024.) signal = 1024.;//if exceeding, accumulate last one
-           digits[0] = k;
-           digits[1] = ix;
-           digits[2] = (Int_t) signal;
-           for(j1=0;j1<3;j1++){ // only three in digit.
-               tracks[j1]  = pList->GetTrack(k,ix,j1);
-               hits[j1]    = pList->GetHit(k,ix,j1);
-           } // end for j1
-           // finally add digit
-           aliITS->AddSimDigit(2,0,digits,tracks,hits,charges);
-       } // end for ix
+      for(Int_t ix=0;ix<GetNStrips();ix++){     // loop over strips
+
+       // if strip is dead -> gain=0
+       if( ((k==0)&&(res->GetGainP(ix)==0)) || ((k==1)&&(res->GetGainN(ix)==0))) continue;
+       
+       signal = fMapA2->GetSignal(k,ix);
+       // signal has to be uncalibrated
+       // In real life, gains are supposed to be calculated from calibration runs,
+       // stored in the calibration DB and used in the reconstruction
+       // (see AliITSClusterFinderSSD.cxx)
+       if(k==0) signal /= res->GetGainP(ix);
+       else signal /= res->GetGainN(ix);
+
+       // signal is converted in unit of ADC
+       signal = res->GetSSDDEvToADC(signal);
+       if(signal>4095.) signal = 4095.;//if exceeding, accumulate last one
+
+       // threshold for zero suppression is set on the basis of the noise
+       // A good value is 3*sigma_noise
+       if(k==0) threshold = res->GetNoiseP(ix);
+       else threshold = res->GetNoiseN(ix);
+
+       threshold *= simpar->GetSSDZSThreshold(); // threshold at 3 sigma noise
+
+       if(signal < threshold) continue;
+       //cout<<signal<<" "<<threshold<<endl;
+
+       digits[0] = k;
+       digits[1] = ix;
+       digits[2] = TMath::Nint(signal);
+       for(j1=0;j1<size;j1++)if(j1<pList->GetNEntries()){
+         // only three in digit.
+         tracks[j1]  = pList->GetTrack(k,ix,j1);
+         hits[j1]    = pList->GetHit(k,ix,j1);
+       }else{
+         tracks[j1]  = -3;
+         hits[j1]    = -1;
+       } // end for j1
+       // finally add digit
+       aliITS->AddSimDigit(2,0,digits,tracks,hits,charges);
+      } // end for ix
     } // end for k
+    delete [] digits;
+    delete [] tracks;
+    delete [] hits;
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::WriteSDigits(AliITSpList *pList){
@@ -511,12 +717,13 @@ void AliITSsimulationSSD::WriteSDigits(AliITSpList *pList){
 
     pList->GetMaxMapIndex(ni,nj);
     for(i=0;i<ni;i++)for(j=0;j<nj;j++){
-       if(pList->GetSignalOnly(i,j)>0.0){
-           aliITS->AddSumDigit(*(pList->GetpListItem(i,j)));
-//         cout << "pListSSD: " << *(pList->GetpListItem(i,j)) << endl;
-       } // end if
+        if(pList->GetSignalOnly(i,j)>0.0){
+            aliITS->AddSumDigit(*(pList->GetpListItem(i,j)));
+            if(GetDebug(4)) cout << "pListSSD: "<<*(pList->GetpListItem(i,j))
+                                << endl;
+        } // end if
     } // end for i,j
-    return;
+  return;
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITSsimulationSSD::FillMapFrompList(AliITSpList *pList){
@@ -524,7 +731,7 @@ void AliITSsimulationSSD::FillMapFrompList(AliITSpList *pList){
     Int_t k,ix;
 
     for(k=0;k<2;k++)for(ix=0;ix<GetNStrips();ix++) 
-       fMapA2->AddSignal(k,ix,pList->GetSignal(k,ix));
+        fMapA2->AddSignal(k,ix,pList->GetSignal(k,ix));
     return;
 }
 //______________________________________________________________________
@@ -564,3 +771,6 @@ istream &operator>>(istream &os,AliITSsimulationSSD &source){
     return os;
 }
 //______________________________________________________________________
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