]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITStrackerMI.cxx
- Introduce fixed step size for material retrieval from TGeo, default is 1mm,
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITStrackerMI.cxx
index b4a9abb9c8ad8e14466382d7a75ffdbfd49588e1..c20b467e339834470f231df76620678bd7ddf1f5 100644 (file)
@@ -19,6 +19,8 @@
 //    It reads AliITSRecPoint clusters and creates AliITStrackMI tracks
 //                   and fills with them the ESD
 //          Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch 
+//          Current support and development: 
+//                     Andrea Dainese, andrea.dainese@lnl.infn.it
 //     dE/dx analysis by: Boris Batyunya, JINR, Boris.Batiounia@cern.ch
 //     Params moved to AliITSRecoParam by: Andrea Dainese, INFN
 //     Material budget from TGeo by: Ludovic Gaudichet & Andrea Dainese, INFN
@@ -32,6 +34,7 @@
 #include <TRandom.h>
 
 
+#include "AliLog.h"
 #include "AliESDEvent.h"
 #include "AliESDtrack.h"
 #include "AliESDVertex.h"
 #include "AliHelix.h"
 #include "AliITSRecPoint.h"
 #include "AliITSgeomTGeo.h"
-#include "AliITStrackerMI.h"
 #include "AliITSReconstructor.h"
 #include "AliTrackPointArray.h"
 #include "AliAlignObj.h"
 #include "AliITSClusterParam.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+#include "AliCDBEntry.h"
+#include "AliITSsegmentation.h"
+#include "AliITSCalibration.h"
+#include "AliITSCalibrationSPD.h"
+#include "AliITSCalibrationSDD.h"
+#include "AliITSCalibrationSSD.h"
+#include "AliITSPlaneEff.h"
+#include "AliITSPlaneEffSPD.h"
+#include "AliITSPlaneEffSDD.h"
+#include "AliITSPlaneEffSSD.h"
+#include "AliITStrackerMI.h"
 
 ClassImp(AliITStrackerMI)
 
@@ -63,7 +77,7 @@ fLastLayerToTrackTo(0),
 fCoefficients(0),
 fEsd(0),
 fTrackingPhase("Default"),
-fUseTGeo(0),
+fUseTGeo(3),
 fNtracks(0),
 fxOverX0Pipe(-1.),
 fxTimesRhoPipe(-1.),
@@ -73,7 +87,10 @@ fxOverX0ShieldTrks(0),
 fxTimesRhoShieldTrks(0),
 fxOverX0LayerTrks(0),
 fxTimesRhoLayerTrks(0),
-fDebugStreamer(0){
+fDebugStreamer(0),
+fITSChannelStatus(0),
+fDetTypeRec(0),
+fPlaneEff(0) {
   //Default constructor
   Int_t i;
   for(i=0;i<4;i++) fSPDdetzcentre[i]=0.;
@@ -95,7 +112,7 @@ fLastLayerToTrackTo(AliITSRecoParam::GetLastLayerToTrackTo()),
 fCoefficients(0),
 fEsd(0),
 fTrackingPhase("Default"),
-fUseTGeo(0),
+fUseTGeo(3),
 fNtracks(0),
 fxOverX0Pipe(-1.),
 fxTimesRhoPipe(-1.),
@@ -105,7 +122,10 @@ fxOverX0ShieldTrks(0),
 fxTimesRhoShieldTrks(0),
 fxOverX0LayerTrks(0),
 fxTimesRhoLayerTrks(0),
-fDebugStreamer(0){
+fDebugStreamer(0),
+fITSChannelStatus(0),
+fDetTypeRec(0),
+fPlaneEff(0) {
   //--------------------------------------------------------------------
   //This is the AliITStrackerMI constructor
   //--------------------------------------------------------------------
@@ -141,9 +161,10 @@ fDebugStreamer(0){
         TGeoHMatrix m; AliITSgeomTGeo::GetOrigMatrix(i,j,k,m);
         const TGeoHMatrix *tm=AliITSgeomTGeo::GetTracking2LocalMatrix(i,j,k);
         m.Multiply(tm);
-        Double_t txyz[3]={0.}, xyz[3]={0.};
+        Double_t txyz[3]={0.};
+       xyz[0]=0.;xyz[1]=0.;xyz[2]=0.;
         m.LocalToMaster(txyz,xyz);
-        Double_t r=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0] + xyz[1]*xyz[1]);
+        r=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0] + xyz[1]*xyz[1]);
         Double_t phi=TMath::ATan2(xyz[1],xyz[0]);
 
         if (phi<0) phi+=TMath::TwoPi();
@@ -151,10 +172,18 @@ fDebugStreamer(0){
 
         AliITSdetector &det=fgLayers[i-1].GetDetector((j-1)*ndet + k-1); 
         new(&det) AliITSdetector(r,phi); 
-      } 
-    }  
+       // compute the real radius (with misalignment)
+        TGeoHMatrix mmisal(*(AliITSgeomTGeo::GetMatrix(i,j,k)));
+        mmisal.Multiply(tm);
+       xyz[0]=0.;xyz[1]=0.;xyz[2]=0.;
+        mmisal.LocalToMaster(txyz,xyz);
+        Double_t rmisal=TMath::Sqrt(xyz[0]*xyz[0] + xyz[1]*xyz[1]);
+       det.SetRmisal(rmisal);
+       
+      } // end loop on detectors
+    } // end loop on ladders
+  } // end loop on layers
 
-  }
 
   fI=AliITSgeomTGeo::GetNLayers();
 
@@ -187,12 +216,28 @@ fDebugStreamer(0){
   fSPDdetzcentre[3] = tr[2];
 
   fUseTGeo = AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetUseTGeoInTracker();
+  if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetExtendedEtaAcceptance() && fUseTGeo!=1 && fUseTGeo!=3) {
+    AliWarning("fUseTGeo changed to 3 because fExtendedEtaAcceptance is kTRUE");
+    fUseTGeo = 3;
+  }
 
   for(Int_t i=0;i<2;i++) {fxOverX0Shield[i]=-1.;fxTimesRhoShield[i]=-1.;}
   for(Int_t i=0;i<6;i++) {fxOverX0Layer[i]=-1.;fxTimesRhoLayer[i]=-1.;}
   
   fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("ITSdebug.root");
 
+  // only for plane efficiency evaluation
+  if (AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetComputePlaneEff()) {
+    Int_t iplane=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetIPlanePlaneEff();
+    if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetLayersToSkip(iplane))
+      AliWarning(Form("Evaluation of Plane Eff for layer %d will be attempted without removing it from tracker",iplane));
+    if (iplane<2) fPlaneEff = new AliITSPlaneEffSPD();
+    else if (iplane<4) fPlaneEff = new AliITSPlaneEffSDD();
+    else fPlaneEff = new AliITSPlaneEffSSD();
+    if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetReadPlaneEffFromOCDB())
+       if(!fPlaneEff->ReadFromCDB()) {AliWarning("AliITStrackerMI reading of AliITSPlaneEff from OCDB failed") ;}
+    if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetHistoPlaneEff()) fPlaneEff->SetCreateHistos(kTRUE);
+  }
 }
 //------------------------------------------------------------------------
 AliITStrackerMI::AliITStrackerMI(const AliITStrackerMI &tracker):AliTracker(tracker),
@@ -219,7 +264,10 @@ fxOverX0ShieldTrks(0),
 fxTimesRhoShieldTrks(0),
 fxOverX0LayerTrks(0),
 fxTimesRhoLayerTrks(0),
-fDebugStreamer(tracker.fDebugStreamer){
+fDebugStreamer(tracker.fDebugStreamer),
+fITSChannelStatus(tracker.fITSChannelStatus),
+fDetTypeRec(tracker.fDetTypeRec),
+fPlaneEff(tracker.fPlaneEff) {
   //Copy constructor
   Int_t i;
   for(i=0;i<4;i++) {
@@ -253,6 +301,8 @@ AliITStrackerMI::~AliITStrackerMI()
     //fDebugStreamer->Close();
     delete fDebugStreamer;
   }
+  if(fITSChannelStatus) delete fITSChannelStatus;
+  if(fPlaneEff) delete fPlaneEff;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
 void AliITStrackerMI::SetLayersNotToSkip(Int_t *l) {
@@ -262,6 +312,40 @@ void AliITStrackerMI::SetLayersNotToSkip(Int_t *l) {
   for (Int_t i=0; i<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); i++) fLayersNotToSkip[i]=l[i];
 }
 //------------------------------------------------------------------------
+void AliITStrackerMI::ReadBadFromDetTypeRec() {
+  //--------------------------------------------------------------------
+  //This function read ITS bad detectors, chips, channels from AliITSDetTypeRec
+  //i.e. from OCDB
+  //--------------------------------------------------------------------
+
+  if(!AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetUseBadZonesFromOCDB()) return;
+
+  Info("ReadBadFromDetTypeRec","Reading info about bad ITS detectors and channels");
+
+  if(!fDetTypeRec) Error("ReadBadFromDetTypeRec","AliITSDetTypeRec nof found!\n");
+
+  // ITS channels map
+  if(fITSChannelStatus) delete fITSChannelStatus;
+  fITSChannelStatus = new AliITSChannelStatus(fDetTypeRec);
+
+  // ITS detectors and chips
+  Int_t i=0,j=0,k=0,ndet=0;
+  for (i=1; i<AliITSgeomTGeo::GetNLayers()+1; i++) {
+    Int_t nBadDetsPerLayer=0;
+    ndet=AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(i);    
+    for (j=1; j<AliITSgeomTGeo::GetNLadders(i)+1; j++) {
+      for (k=1; k<ndet+1; k++) {
+        AliITSdetector &det=fgLayers[i-1].GetDetector((j-1)*ndet + k-1);  
+       det.ReadBadDetectorAndChips(i-1,(j-1)*ndet + k-1,fDetTypeRec);
+       if(det.IsBad()) {nBadDetsPerLayer++;}
+      } // end loop on detectors
+    } // end loop on ladders
+    Info("ReadBadFromDetTypeRec",Form("Layer %d: %d bad out of %d",i-1,nBadDetsPerLayer,ndet*AliITSgeomTGeo::GetNLadders(i)));
+  } // end loop on layers
+  
+  return;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
 Int_t AliITStrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
   //--------------------------------------------------------------------
   //This function loads ITS clusters
@@ -272,13 +356,13 @@ Int_t AliITStrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
     return 1;
   }
 
-  TClonesArray dummy("AliITSRecPoint",10000), *clusters=&dummy;
+  static TClonesArray dummy("AliITSRecPoint",10000), *clusters=&dummy;
   branch->SetAddress(&clusters);
 
-  Int_t j=0;
+  Int_t i=0,j=0,ndet=0;
   Int_t detector=0;
-  for (Int_t i=0; i<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); i++) {
-    Int_t ndet=fgLayers[i].GetNdetectors();
+  for (i=0; i<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); i++) {
+    ndet=fgLayers[i].GetNdetectors();
     Int_t jmax = j + fgLayers[i].GetNladders()*ndet;
     for (; j<jmax; j++) {           
       if (!cTree->GetEvent(j)) continue;
@@ -300,7 +384,7 @@ Int_t AliITStrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
        for (Float_t xdead = 0; xdead < AliITSRecoParam::GetSPDdetxlength(); xdead += (i+1.)*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetXPassDeadZoneHits()) {
          Int_t lab[4]   = {0,0,0,detector};
          Int_t info[3]  = {0,0,i};
-         Float_t q      = 0.;
+         Float_t q      = 0.; // this identifies virtual clusters
          Float_t hit[5] = {xdead,
                            0.,
                            AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaXDeadZoneHit2(),
@@ -327,7 +411,7 @@ Int_t AliITStrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
          if (TMath::Abs(fgLayers[i].GetDetector(detector).GetZmax()-hit[1])<zwindow) 
            fgLayers[i].InsertCluster(new AliITSRecPoint(lab,hit,info,local));
        }
-      }
+      } // "virtual" clusters in SPD
       
     }
     //
@@ -335,6 +419,8 @@ Int_t AliITStrackerMI::LoadClusters(TTree *cTree) {
     fgLayers[i].SortClusters();
   }
 
+  dummy.Clear();
+
   return 0;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
@@ -345,6 +431,24 @@ void AliITStrackerMI::UnloadClusters() {
   for (Int_t i=0; i<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); i++) fgLayers[i].ResetClusters();
 }
 //------------------------------------------------------------------------
+void AliITStrackerMI::FillClusterArray(TObjArray* array) const {
+  //--------------------------------------------------------------------
+  // Publishes all pointers to clusters known to the tracker into the
+  // passed object array.
+  // The ownership is not transfered - the caller is not expected to delete
+  // the clusters.
+  //--------------------------------------------------------------------
+
+  for(Int_t i=0; i<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); i++) {
+    for(Int_t icl=0; icl<fgLayers[i].GetNumberOfClusters(); icl++) {
+      AliCluster *cl = (AliCluster*)fgLayers[i].GetCluster(icl);
+      array->AddLast(cl);
+    }
+  }
+
+  return;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
 static Int_t CorrectForTPCtoITSDeadZoneMaterial(AliITStrackMI *t) {
   //--------------------------------------------------------------------
   // Correction for the material between the TPC and the ITS
@@ -370,6 +474,8 @@ Int_t AliITStrackerMI::Clusters2Tracks(AliESDEvent *event) {
   // This functions reconstructs ITS tracks
   // The clusters must be already loaded !
   //--------------------------------------------------------------------
+
+
   fTrackingPhase="Clusters2Tracks";
 
   TObjArray itsTracks(15000);
@@ -393,6 +499,8 @@ Int_t AliITStrackerMI::Clusters2Tracks(AliESDEvent *event) {
     Info("Clusters2Tracks", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
     while (nentr--) {
       AliESDtrack *esd=event->GetTrack(nentr);
+      //  ---- for debugging:
+      //if(TMath::Abs(esd->GetX()-83.65)<0.1) { FILE *f=fopen("tpc.dat","a"); fprintf(f,"%f %f %f %f %f %f\n",(Float_t)event->GetEventNumberInFile(),(Float_t)TMath::Abs(esd->GetLabel()),(Float_t)esd->GetX(),(Float_t)esd->GetY(),(Float_t)esd->GetZ(),(Float_t)esd->Pt()); fclose(f); }
 
       if ((esd->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCin)==0) continue;
       if (esd->GetStatus()&AliESDtrack::kTPCout) continue;
@@ -408,6 +516,8 @@ Int_t AliITStrackerMI::Clusters2Tracks(AliESDEvent *event) {
       }
       t->GetDZ(GetX(),GetY(),GetZ(),t->GetDP());              //I.B.
       Double_t vdist = TMath::Sqrt(t->GetD(0)*t->GetD(0)+t->GetD(1)*t->GetD(1));
+
+
       // look at the ESD mass hypothesys !
       if (t->GetMass()<0.9*pimass) t->SetMass(pimass); 
       // write expected q
@@ -445,15 +555,15 @@ Int_t AliITStrackerMI::Clusters2Tracks(AliESDEvent *event) {
   fTrackHypothesys.Expand(nentr);
   fBestHypothesys.Expand(nentr);
   MakeCoefficients(nentr);
-  if(fUseTGeo==3 || fUseTGeo==4) MakeTrksMaterialLUT(nentr);
+  if(fUseTGeo==3 || fUseTGeo==4) MakeTrksMaterialLUT(event->GetNumberOfTracks());
   Int_t ntrk=0;
   // THE TWO TRACKING PASSES
   for (fPass=0; fPass<2; fPass++) {
      Int_t &constraint=fConstraint[fPass]; if (constraint<0) continue;
      for (fCurrentEsdTrack=0; fCurrentEsdTrack<nentr; fCurrentEsdTrack++) {
-       //cerr<<fPass<<"    "<<fCurrentEsdTrack<<'\r';
        AliITStrackMI *t=(AliITStrackMI*)itsTracks.UncheckedAt(fCurrentEsdTrack);
        if (t==0) continue;              //this track has been already tracked
+       //cout<<"========== "<<fPass<<"    "<<fCurrentEsdTrack<<" =========\n";
        if (t->GetReconstructed()&&(t->GetNUsed()<1.5)) continue;  //this track was  already  "succesfully" reconstructed
        Float_t dz[2]; t->GetDZ(GetX(),GetY(),GetZ(),dz);              //I.B.
        if (fConstraint[fPass]) { 
@@ -462,14 +572,17 @@ Int_t AliITStrackerMI::Clusters2Tracks(AliESDEvent *event) {
        }
 
        Int_t tpcLabel=t->GetLabel(); //save the TPC track label       
+       AliDebug(2,Form("LABEL %d pass %d",tpcLabel,fPass));
        fI = 6;
        ResetTrackToFollow(*t);
        ResetBestTrack();
+
        FollowProlongationTree(t,fCurrentEsdTrack,fConstraint[fPass]);
 
        SortTrackHypothesys(fCurrentEsdTrack,20,0);  //MI change
        //
-       AliITStrackMI * besttrack = GetBestHypothesys(fCurrentEsdTrack,t,15);
+       AliITStrackMI *besttrack = GetBestHypothesys(fCurrentEsdTrack,t,15);
        if (!besttrack) continue;
        besttrack->SetLabel(tpcLabel);
        //       besttrack->CookdEdx();
@@ -481,16 +594,15 @@ Int_t AliITStrackerMI::Clusters2Tracks(AliESDEvent *event) {
        if (fConstraint[fPass]&&(!besttrack->IsGoldPrimary())) continue;  //to be tracked also without vertex constrain 
 
        t->SetReconstructed(kTRUE);
-       ntrk++;                     
+       ntrk++;  
+       AliDebug(2,Form("TRACK! (label %d) ncls %d",besttrack->GetLabel(),besttrack->GetNumberOfClusters()));
      }
      GetBestHypothesysMIP(itsTracks); 
   } // end loop on the two tracking passes
 
-  //GetBestHypothesysMIP(itsTracks);
   if(event->GetNumberOfV0s()>0) UpdateTPCV0(event);
   if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetFindV0s()) FindV02(event);
   fAfterV0 = kTRUE;
-  //GetBestHypothesysMIP(itsTracks);
   //
   itsTracks.Delete();
   //
@@ -616,7 +728,10 @@ Int_t AliITStrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event) {
       fTrackToFollow.ResetCovariance(10.);
 
     //Refitting...
-    if (RefitAt(AliITSRecoParam::GetrInsideSPD1(), &fTrackToFollow, t,kTRUE)) {
+    Bool_t pe=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetComputePlaneEff();
+    AliDebug(2,Form("Refit LABEL %d  %d",t->GetLabel(),t->GetNumberOfClusters()));
+    if (RefitAt(AliITSRecoParam::GetrInsideSPD1(),&fTrackToFollow,t,kTRUE,pe)) {
+       AliDebug(2,"  refit OK");
        fTrackToFollow.SetLabel(t->GetLabel());
        //       fTrackToFollow.CookdEdx();
        CookdEdx(&fTrackToFollow);
@@ -625,8 +740,10 @@ Int_t AliITStrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event) {
 
        //The beam pipe
        if (CorrectForPipeMaterial(&fTrackToFollow,"inward")) {
+        fTrackToFollow.UpdateESDtrack(AliESDtrack::kITSrefit);
         AliESDtrack  *esdTrack =fTrackToFollow.GetESDtrack();
-        esdTrack->UpdateTrackParams(&fTrackToFollow,AliESDtrack::kITSrefit);
+        //printf("                                       %d\n",esdTrack->GetITSModuleIndex(0));
+        //esdTrack->UpdateTrackParams(&fTrackToFollow,AliESDtrack::kITSrefit); //original line
         Float_t r[3]={0.,0.,0.};
         Double_t maxD=3.;
         esdTrack->RelateToVertex(event->GetVertex(),GetBz(r),maxD);
@@ -667,7 +784,8 @@ Bool_t AliITStrackerMI::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint& p) const {
   cl->GetGlobalXYZ(xyz);
   cl->GetGlobalCov(cov);
   p.SetXYZ(xyz, cov);
-
+  p.SetCharge(cl->GetQ());
+  p.SetDriftTime(cl->GetDriftTime());
   AliGeomManager::ELayerID iLayer = AliGeomManager::kInvalidLayer; 
   switch (l) {
   case 0:
@@ -708,6 +826,7 @@ Bool_t AliITStrackerMI::GetTrackPointTrackingError(Int_t index,
   Int_t c=(index & 0x0fffffff) >> 00;
   const AliITSRecPoint *cl = fgLayers[l].GetCluster(c);
   Int_t idet = cl->GetDetectorIndex();
+
   const AliITSdetector &det=fgLayers[l].GetDetector(idet);
 
   // tgphi and tglambda of the track in tracking frame with alpha=det.GetPhi
@@ -716,7 +835,7 @@ Bool_t AliITStrackerMI::GetTrackPointTrackingError(Int_t index,
   detxy[1] = det.GetR()*TMath::Sin(det.GetPhi());
   Double_t alpha = t->GetAlpha();
   Double_t xdetintrackframe = detxy[0]*TMath::Cos(alpha)+detxy[1]*TMath::Sin(alpha);
-  Float_t phi = TMath::ASin(t->GetSnpAt(xdetintrackframe,AliTracker::GetBz()));
+  Float_t phi = TMath::ASin(t->GetSnpAt(xdetintrackframe,GetBz()));
   phi += alpha-det.GetPhi();
   Float_t tgphi = TMath::Tan(phi);
 
@@ -724,7 +843,8 @@ Bool_t AliITStrackerMI::GetTrackPointTrackingError(Int_t index,
   Float_t expQ = TMath::Max(0.8*t->GetTPCsignal(),30.);
 
   Float_t errlocalx,errlocalz;
-  AliITSClusterParam::GetError(l,cl,tgl,tgphi,expQ,errlocalx,errlocalz);
+  Bool_t addMisalErr=kFALSE;
+  AliITSClusterParam::GetError(l,cl,tgl,tgphi,expQ,errlocalx,errlocalz,addMisalErr);
 
   Float_t xyz[3];
   Float_t cov[6];
@@ -735,6 +855,8 @@ Bool_t AliITStrackerMI::GetTrackPointTrackingError(Int_t index,
   tmpcl.GetGlobalCov(cov);
 
   p.SetXYZ(xyz, cov);
+  p.SetCharge(cl->GetQ());
+  p.SetDriftTime(cl->GetDriftTime());
 
   AliGeomManager::ELayerID iLayer = AliGeomManager::kInvalidLayer; 
   switch (l) {
@@ -761,6 +883,7 @@ Bool_t AliITStrackerMI::GetTrackPointTrackingError(Int_t index,
     break;
   };
   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(iLayer,idet);
+
   p.SetVolumeID((UShort_t)volid);
   return kTRUE;
 }
@@ -774,6 +897,7 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
   Double_t xyzVtx[]={GetX(),GetY(),GetZ()};
   Double_t ersVtx[]={GetSigmaX(),GetSigmaY(),GetSigmaZ()};
 
+
   AliESDtrack * esd = otrack->GetESDtrack();
   if (esd->GetV0Index(0)>0) {
     // TEMPORARY SOLLUTION: map V0 indexes to point to proper track
@@ -815,18 +939,21 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
   new (&(tracks[6][0])) AliITStrackMI(*otrack);
   ntracks[6]=1;
   for (Int_t i=0;i<7;i++) nindexes[i][0]=0;
+  Int_t modstatus = 1; // found 
+  Float_t xloc,zloc;
   // 
   //
   // follow prolongations
   for (Int_t ilayer=5; ilayer>=0; ilayer--) {
+    AliDebug(2,Form("FollowProlongationTree: layer %d",ilayer));
+    fI = ilayer;
     //
-    AliITSlayer &layer=fgLayers[ilayer]; 
-    Double_t r=layer.GetR();    
-    Double_t deltar=(ilayer<2 ? 0.10*r : 0.05*r);
+    AliITSlayer &layer=fgLayers[ilayer];
+    Double_t r = layer.GetR(); 
     ntracks[ilayer]=0;
     //
     //
-   Int_t nskipped=0;
+    Int_t nskipped=0;
     Float_t nused =0;
     for (Int_t itrack =0; itrack<ntracks[ilayer+1]; itrack++) {
       //set current track
@@ -846,64 +973,56 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
       if (ilayer==1) 
        if(!CorrectForShieldMaterial(&currenttrack1,"SPD","inward")) continue;
 
+      // detector number
       Double_t phi,z;
       if (!currenttrack1.GetPhiZat(r,phi,z)) continue;
-
       Int_t idet=layer.FindDetectorIndex(phi,z);
+
+      Double_t trackGlobXYZ1[3];
+      if (!currenttrack1.GetXYZ(trackGlobXYZ1)) continue;
+
+      // Get the budget to the primary vertex for the current track being prolonged
+      Double_t budgetToPrimVertex = GetEffectiveThickness();
+
+      // check if we allow a prolongation without point
+      Int_t skip = CheckSkipLayer(&currenttrack1,ilayer,idet);
+      if (skip) {
+       AliITStrackMI* vtrack = new (&tracks[ilayer][ntracks[ilayer]]) AliITStrackMI(currenttrack1);
+       // propagate to the layer radius
+       Double_t xToGo; if (!vtrack->GetLocalXat(r,xToGo)) continue;
+       if(!vtrack->Propagate(xToGo)) continue;
+       // apply correction for material of the current layer
+       CorrectForLayerMaterial(vtrack,ilayer,trackGlobXYZ1,"inward");
+       vtrack->SetNDeadZone(vtrack->GetNDeadZone()+1);
+       vtrack->SetClIndex(ilayer,0);
+       modstatus = (skip==1 ? 3 : 4); // skipped : out in z
+       if(LocalModuleCoord(ilayer,idet,vtrack,xloc,zloc)) { // local module coords
+         vtrack->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
+       }
+       if(constrain) vtrack->Improve(budgetToPrimVertex,xyzVtx,ersVtx);
+       ntracks[ilayer]++;
+       continue;
+      }
+
+      // track outside layer acceptance in z
       if (idet<0) continue;
       
-      //propagate to the intersection
+      //propagate to the intersection with the detector plane
       const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
       new(&currenttrack2)  AliITStrackMI(currenttrack1);
-
-      Double_t trackGlobXYZ1[3];
-      currenttrack1.GetXYZ(trackGlobXYZ1);
-
       if (!currenttrack1.Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) continue;
-      currenttrack2.Propagate(det.GetPhi(),det.GetR());
+      if (!currenttrack2.Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) continue;
       currenttrack1.SetDetectorIndex(idet);
       currenttrack2.SetDetectorIndex(idet);
-      
-      fI = ilayer;
-      // Get the budget to the primary vertex and between the two layers
-      // for the current track being prolonged (before searching for clusters
-      // on this layer)
-      Double_t budgetToPrimVertex = GetEffectiveThickness();
+      if(!LocalModuleCoord(ilayer,idet,&currenttrack1,xloc,zloc)) continue; // local module coords
 
       //***************
-      // DEFINITION OF SEARCH ROAD FOR CLUSTERS SELECTION
+      // DEFINITION OF SEARCH ROAD AND CLUSTERS SELECTION
       //
-      Double_t dz=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaRoadZ()*
-                    TMath::Sqrt(currenttrack1.GetSigmaZ2() + 
-                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
-                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
-                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(ilayer));
-      Double_t dy=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaRoadY()*
-                    TMath::Sqrt(currenttrack1.GetSigmaY2() + 
-                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
-                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
-                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(ilayer));
-      
-      // track at boundary between detectors, enlarge road
-      Double_t boundaryWidth=AliITSRecoParam::GetBoundaryWidth();
-      if ( (currenttrack1.GetY()-dy < det.GetYmin()+boundaryWidth) || 
-          (currenttrack1.GetY()+dy > det.GetYmax()-boundaryWidth) || 
-          (currenttrack1.GetZ()-dz < det.GetZmin()+boundaryWidth) ||
-          (currenttrack1.GetZ()+dz > det.GetZmax()-boundaryWidth) ) {
-       Float_t tgl = TMath::Abs(currenttrack1.GetTgl());
-       if (tgl > 1.) tgl=1.;
-       Double_t deltaXNeighbDets=AliITSRecoParam::GetDeltaXNeighbDets();
-       dz = TMath::Sqrt(dz*dz+deltaXNeighbDets*deltaXNeighbDets*tgl*tgl);
-       Float_t snp = TMath::Abs(currenttrack1.GetSnp());
-       if (snp > AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxSnp()) continue;
-       dy = TMath::Sqrt(dy*dy+deltaXNeighbDets*deltaXNeighbDets*snp*snp);
-      } // boundary
-      
-      // road in global (rphi,z)
-      Double_t zmin = currenttrack1.GetZ() - dz; 
-      Double_t zmax = currenttrack1.GetZ() + dz;
-      Double_t ymin = currenttrack1.GetY() + r*det.GetPhi() - dy;
-      Double_t ymax = currenttrack1.GetY() + r*det.GetPhi() + dy;
+      // road in global (rphi,z) [i.e. in tracking ref. system]
+      Double_t zmin,zmax,ymin,ymax;
+      if (!ComputeRoad(&currenttrack1,ilayer,idet,zmin,zmax,ymin,ymax)) continue;
+
       // select clusters in road
       layer.SelectClusters(zmin,zmax,ymin,ymax); 
       //********************
@@ -926,6 +1045,7 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
       }
       msz = 1./msz; // 1/RoadZ^2
       msy = 1./msy; // 1/RoadY^2
+
       //
       //
       // LOOP OVER ALL POSSIBLE TRACK PROLONGATIONS ON THIS LAYER
@@ -933,25 +1053,81 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
       const AliITSRecPoint *cl=0; 
       Int_t clidx=-1;
       Double_t chi2trkcl=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2(); // init with big value
-      Int_t deadzone=0;
+      Bool_t deadzoneSPD=kFALSE;
       currenttrack = &currenttrack1;
-      // loop over selected clusters
+
+      // check if the road contains a dead zone 
+      Bool_t noClusters = kFALSE;
+      if (!layer.GetNextCluster(clidx,kTRUE)) noClusters=kTRUE;
+      if (noClusters) AliDebug(2,"no clusters in road");
+      Double_t dz=0.5*(zmax-zmin);
+      Double_t dy=0.5*(ymax-ymin);
+      Int_t dead = CheckDeadZone(&currenttrack1,ilayer,idet,dz,dy,noClusters); 
+      if(dead) AliDebug(2,Form("DEAD (%d)\n",dead));
+      // create a prolongation without clusters (check also if there are no clusters in the road)
+      if (dead || 
+         (noClusters && 
+          AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetAllowProlongationWithEmptyRoad())) {
+       AliITStrackMI * updatetrack = new (&tracks[ilayer][ntracks[ilayer]]) AliITStrackMI(*currenttrack);
+       updatetrack->SetClIndex(ilayer,0);
+       if (dead==0) {
+         modstatus = 5; // no cls in road
+       } else if (dead==1) {
+         modstatus = 7; // holes in z in SPD
+       } else if (dead==2 || dead==3) {
+         modstatus = 2; // dead from OCDB
+       }
+       updatetrack->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
+       // apply correction for material of the current layer
+       CorrectForLayerMaterial(updatetrack,ilayer,trackGlobXYZ1,"inward");
+       if (constrain) { // apply vertex constrain
+         updatetrack->SetConstrain(constrain);
+         Bool_t isPrim = kTRUE;
+         if (ilayer<4) { // check that it's close to the vertex
+           updatetrack->GetDZ(GetX(),GetY(),GetZ(),updatetrack->GetDP()); //I.B.
+           if (TMath::Abs(updatetrack->GetD(0)/(1.+ilayer)) > // y
+               AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDZforPrimTrk() || 
+               TMath::Abs(updatetrack->GetD(1)/(1.+ilayer)) > // z
+               AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxDZforPrimTrk()) isPrim=kFALSE;
+         }
+         if (isPrim) updatetrack->Improve(budgetToPrimVertex,xyzVtx,ersVtx);
+       }
+       if (dead) {
+         updatetrack->SetNDeadZone(updatetrack->GetNDeadZone()+1);
+         if (dead==1) { // dead zone at z=0,+-7cm in SPD
+           updatetrack->SetDeadZoneProbability(GetSPDDeadZoneProbability(updatetrack->GetZ(),TMath::Sqrt(updatetrack->GetSigmaZ2())));
+           deadzoneSPD=kTRUE;
+         }
+       }
+       ntracks[ilayer]++;
+      }
+
+      clidx=-1;
+      // loop over clusters in the road
       while ((cl=layer.GetNextCluster(clidx))!=0) { 
        if (ntracks[ilayer]>95) break; //space for skipped clusters  
        Bool_t changedet =kFALSE;  
-       if (cl->GetQ()==0 && (deadzone==1)) continue;
-       Int_t idet=cl->GetDetectorIndex();
+       if (cl->GetQ()==0 && deadzoneSPD==kTRUE) continue;
+       Int_t idetc=cl->GetDetectorIndex();
 
-       if (currenttrack->GetDetectorIndex()==idet) { // track already on the cluster's detector
+       if (currenttrack->GetDetectorIndex()==idetc) { // track already on the cluster's detector
+         // take into account misalignment (bring track to real detector plane)
+         Double_t xTrOrig = currenttrack->GetX();
+         if (!currenttrack->Propagate(xTrOrig+cl->GetX())) continue;
          // a first cut on track-cluster distance
          if ( (currenttrack->GetZ()-cl->GetZ())*(currenttrack->GetZ()-cl->GetZ())*msz + 
               (currenttrack->GetY()-cl->GetY())*(currenttrack->GetY()-cl->GetY())*msy > 1. ) 
-           continue; // cluster not associated to track
+           {  // cluster not associated to track
+             AliDebug(2,"not associated");
+             continue;
+           }
+         // bring track back to ideal detector plane
+         if (!currenttrack->Propagate(xTrOrig)) continue;
        } else {                                      // have to move track to cluster's detector
-         const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
+         const AliITSdetector &detc=layer.GetDetector(idetc);
          // a first cut on track-cluster distance
-         Double_t y,z;
-         if (!currenttrack2.GetProlongationFast(det.GetPhi(),det.GetR(),y,z)) continue;
+         Double_t y;
+         if (!currenttrack2.GetProlongationFast(detc.GetPhi(),detc.GetR()+cl->GetX(),y,z)) continue;
          if ( (z-cl->GetZ())*(z-cl->GetZ())*msz + 
               (y-cl->GetY())*(y-cl->GetY())*msy > 1. ) 
            continue; // cluster not associated to track
@@ -959,12 +1135,12 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
          new (&backuptrack) AliITStrackMI(currenttrack2);
          changedet = kTRUE;
          currenttrack =&currenttrack2;
-         if (!currenttrack->Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) {
+         if (!currenttrack->Propagate(detc.GetPhi(),detc.GetR())) {
            new (currenttrack) AliITStrackMI(backuptrack);
            changedet = kFALSE;
            continue;
          }
-         currenttrack->SetDetectorIndex(idet);
+         currenttrack->SetDetectorIndex(idetc);
          // Get again the budget to the primary vertex 
          // for the current track being prolonged, if had to change detector 
          //budgetToPrimVertex = GetEffectiveThickness();// not needed at the moment because anyway we take a mean material for this correction
@@ -973,19 +1149,34 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
        // calculate track-clusters chi2
        chi2trkcl = GetPredictedChi2MI(currenttrack,cl,ilayer); 
        // chi2 cut
+       AliDebug(2,Form("chi2 %f max %f",chi2trkcl,AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2s(ilayer)));
        if (chi2trkcl < AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2s(ilayer)) {
-         if (cl->GetQ()==0) deadzone=1;            // take dead zone only once   
+         if (cl->GetQ()==0) deadzoneSPD=kTRUE; // only 1 prolongation with virtual cluster       
          if (ntracks[ilayer]>=100) continue;
          AliITStrackMI * updatetrack = new (&tracks[ilayer][ntracks[ilayer]]) AliITStrackMI(*currenttrack);
          updatetrack->SetClIndex(ilayer,0);
          if (changedet) new (&currenttrack2) AliITStrackMI(backuptrack);
-         
-         if (cl->GetQ()!=0) {
-           if (!UpdateMI(updatetrack,cl,chi2trkcl,(ilayer<<28)+clidx)) continue; 
+
+         if (cl->GetQ()!=0) { // real cluster
+           if (!UpdateMI(updatetrack,cl,chi2trkcl,(ilayer<<28)+clidx)) {
+             AliDebug(2,"update failed");
+             continue;
+           } 
            updatetrack->SetSampledEdx(cl->GetQ(),updatetrack->GetNumberOfClusters()-1); //b.b.
-         } else { // cluster in dead zone
+           modstatus = 1; // found
+         } else {             // virtual cluster in dead zone
            updatetrack->SetNDeadZone(updatetrack->GetNDeadZone()+1);
-           updatetrack->SetDeadZoneProbability(GetDeadZoneProbability(updatetrack->GetZ(),TMath::Sqrt(updatetrack->GetSigmaZ2())));
+           updatetrack->SetDeadZoneProbability(GetSPDDeadZoneProbability(updatetrack->GetZ(),TMath::Sqrt(updatetrack->GetSigmaZ2())));
+           modstatus = 7; // holes in z in SPD
+         }
+
+         if (changedet) {
+           Float_t xlocnewdet,zlocnewdet;
+           if(LocalModuleCoord(ilayer,idet,updatetrack,xlocnewdet,zlocnewdet)) { // local module coords
+             updatetrack->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xlocnewdet,zlocnewdet);
+           }
+         } else {
+           updatetrack->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
          }
          if (cl->IsUsed()) updatetrack->IncrementNUsed();
 
@@ -1006,22 +1197,33 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
          } //apply vertex constrain              
          ntracks[ilayer]++;
        }  // create new hypothesis
-      } // loop over possible cluster prolongation      
-      if (constrain&&itrack<2&&currenttrack1.GetNSkipped()==0 && deadzone==0&&ntracks[ilayer]<100) {   
-       // Bring the track beyond the material
-       currenttrack1.AliExternalTrackParam::PropagateTo(currenttrack1.GetX()-deltar,GetBz());
+       else {
+         AliDebug(2,"chi2 too large");
+       }
+
+      } // loop over possible prolongations 
+     
+      // allow one prolongation without clusters
+      if (constrain && itrack<=1 && currenttrack1.GetNSkipped()==0 && deadzoneSPD==kFALSE && ntracks[ilayer]<100) {
        AliITStrackMI* vtrack = new (&tracks[ilayer][ntracks[ilayer]]) AliITStrackMI(currenttrack1);
+       // apply correction for material of the current layer
+       CorrectForLayerMaterial(vtrack,ilayer,trackGlobXYZ1,"inward");
        vtrack->SetClIndex(ilayer,0);
+       modstatus = 3; // skipped 
+       vtrack->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
        vtrack->Improve(budgetToPrimVertex,xyzVtx,ersVtx);
        vtrack->IncrementNSkipped();
        ntracks[ilayer]++;
       }
 
-      if (constrain&&itrack<1&&TMath::Abs(currenttrack1.GetTgl())>1.1) {  //big theta - for low flux
-       // Bring the track beyond the material
-       currenttrack1.AliExternalTrackParam::PropagateTo(currenttrack1.GetX()-deltar,GetBz());
+      // allow one prolongation without clusters for tracks with |tgl|>1.1
+      if (constrain && itrack==0 && TMath::Abs(currenttrack1.GetTgl())>1.1) {  //big theta - for low flux
        AliITStrackMI* vtrack = new (&tracks[ilayer][ntracks[ilayer]]) AliITStrackMI(currenttrack1);
+       // apply correction for material of the current layer
+       CorrectForLayerMaterial(vtrack,ilayer,trackGlobXYZ1,"inward");
        vtrack->SetClIndex(ilayer,0);
+       modstatus = 3; // skipped
+       vtrack->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
        vtrack->Improve(budgetToPrimVertex,xyzVtx,ersVtx);
        vtrack->SetNDeadZone(vtrack->GetNDeadZone()+1);
        ntracks[ilayer]++;
@@ -1059,7 +1261,6 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
     if (ntracks[ilayer]>90) ntracks[ilayer]=90; 
   } // end loop over layers
 
-  //printf("%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\n",ntracks[0],ntracks[1],ntracks[2],ntracks[3],ntracks[4],ntracks[5]);
 
   //
   // Now select tracks to be kept
@@ -1071,7 +1272,9 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
     AliITStrackMI & track= tracks[0][nindexes[0][i]];
     if (track.GetNumberOfClusters()<2) continue;
     if (!constrain && track.GetNormChi2(0) >
-       AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxNormChi2NonCForHypothesis()) continue;
+       AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxNormChi2NonCForHypothesis()) {
+      continue;
+    }
     AddTrackHypothesys(new AliITStrackMI(track), esdindex);
   }
 
@@ -1092,7 +1295,7 @@ void AliITStrackerMI::FollowProlongationTree(AliITStrackMI * otrack, Int_t esdin
     AddTrackHypothesys(new AliITStrackMI(track), esdindex);
   }
 
-  // tracks that reack layer 2 (SDD inner), only during non-constrained pass
+  // tracks that reach layer 2 (SDD inner), only during non-constrained pass
   if (!constrain){  
     for (Int_t i=0;i<TMath::Min(2,ntracks[2]);i++) {
       AliITStrackMI & track= tracks[2][nindexes[2][i]];
@@ -1285,7 +1488,7 @@ AliITStrackerMI::AliITSlayer::~AliITSlayer() {
   //--------------------------------------------------------------------
   // AliITSlayer destructor
   //--------------------------------------------------------------------
-  delete[] fDetectors;
+  delete [] fDetectors;
   for (Int_t i=0; i<fN; i++) delete fClusters[i];
   for (Int_t i=0; i<AliITSRecoParam::GetMaxClusterPerLayer(); i++) {
     fClusterWeight[i]=0;
@@ -1453,14 +1656,14 @@ void  AliITStrackerMI::AliITSlayer::SortClusters()
   //
   for (Int_t i=0;i<fN-1;i++){
     if (fZ[i]>fZ[i+1]){
-      printf("Bugg\n");
+      printf("Bug\n");
     }
   }
   //
   for (Int_t slice=0;slice<21;slice++)
   for (Int_t i=0;i<fN20[slice]-1;i++){
     if (fZ20[slice][i]>fZ20[slice][i+1]){
-      printf("Bugg\n");
+      printf("Bug\n");
     }
   }
 
@@ -1492,6 +1695,58 @@ Int_t AliITStrackerMI::AliITSlayer::FindClusterIndex(Float_t z) const {
   return m;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliITStrackerMI::ComputeRoad(AliITStrackMI* track,Int_t ilayer,Int_t idet,Double_t &zmin,Double_t &zmax,Double_t &ymin,Double_t &ymax) const {
+  //--------------------------------------------------------------------
+  // This function computes the rectangular road for this track
+  //--------------------------------------------------------------------
+
+
+  AliITSdetector &det = fgLayers[ilayer].GetDetector(idet);
+  // take into account the misalignment: propagate track to misaligned detector plane
+  if (!track->Propagate(det.GetPhi(),det.GetRmisal())) return kFALSE;
+
+  Double_t dz=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaRoadZ()*
+                    TMath::Sqrt(track->GetSigmaZ2() + 
+                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
+                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
+                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(ilayer));
+  Double_t dy=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaRoadY()*
+                    TMath::Sqrt(track->GetSigmaY2() + 
+                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
+                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
+                   AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(ilayer));
+      
+  // track at boundary between detectors, enlarge road
+  Double_t boundaryWidth=AliITSRecoParam::GetBoundaryWidth();
+  if ( (track->GetY()-dy < det.GetYmin()+boundaryWidth) || 
+       (track->GetY()+dy > det.GetYmax()-boundaryWidth) || 
+       (track->GetZ()-dz < det.GetZmin()+boundaryWidth) ||
+       (track->GetZ()+dz > det.GetZmax()-boundaryWidth) ) {
+    Float_t tgl = TMath::Abs(track->GetTgl());
+    if (tgl > 1.) tgl=1.;
+    Double_t deltaXNeighbDets=AliITSRecoParam::GetDeltaXNeighbDets();
+    dz = TMath::Sqrt(dz*dz+deltaXNeighbDets*deltaXNeighbDets*tgl*tgl);
+    Float_t snp = TMath::Abs(track->GetSnp());
+    if (snp > AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxSnp()) return kFALSE;
+    dy = TMath::Sqrt(dy*dy+deltaXNeighbDets*deltaXNeighbDets*snp*snp);
+  } // boundary
+  
+  // add to the road a term (up to 2-3 mm) to deal with misalignments
+  dy = TMath::Sqrt(dy*dy + AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetRoadMisal()*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetRoadMisal());
+  dz = TMath::Sqrt(dz*dz + AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetRoadMisal()*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetRoadMisal());
+
+  Double_t r = fgLayers[ilayer].GetR();
+  zmin = track->GetZ() - dz; 
+  zmax = track->GetZ() + dz;
+  ymin = track->GetY() + r*det.GetPhi() - dy;
+  ymax = track->GetY() + r*det.GetPhi() + dy;
+
+  // bring track back to idead detector plane
+  if (!track->Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) return kFALSE;
+
+  return kTRUE;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
 void AliITStrackerMI::AliITSlayer::
 SelectClusters(Double_t zmin,Double_t zmax,Double_t ymin, Double_t ymax) {
   //--------------------------------------------------------------------
@@ -1501,10 +1756,12 @@ SelectClusters(Double_t zmin,Double_t zmax,Double_t ymin, Double_t ymax) {
   Double_t circle=2*TMath::Pi()*fR;
   fYmin = ymin; fYmax =ymax;
   Float_t ymiddle = (fYmin+fYmax)*0.5;
-  if (ymiddle<fYB[0]) {fYmin+=circle; fYmax+=circle;ymiddle+=circle;}
-  else{
-    if (ymiddle>fYB[1]) {fYmin-=circle; fYmax-=circle;ymiddle-=circle;}
+  if (ymiddle<fYB[0]) {
+    fYmin+=circle; fYmax+=circle; ymiddle+=circle;
+  } else if (ymiddle>fYB[1]) {
+    fYmin-=circle; fYmax-=circle; ymiddle-=circle;
   }
+  
   //
   fCurrentSlice =-1;
   // defualt take all
@@ -1552,7 +1809,7 @@ SelectClusters(Double_t zmin,Double_t zmax,Double_t ymin, Double_t ymax) {
     if (slice<0) slice=0;
     if (slice>5) slice=5;
     Bool_t isOK = (fYmin>fBy5[slice][0]&&fYmax<fBy5[slice][1]);
-    if ( isOK){
+    if (isOK) {
       fCurrentSlice=slice;
       fClustersCs = fClusters5[fCurrentSlice];
       fClusterIndexCs = fClusterIndex5[fCurrentSlice];
@@ -1566,6 +1823,8 @@ SelectClusters(Double_t zmin,Double_t zmax,Double_t ymin, Double_t ymax) {
   fImax = TMath::Min(FindClusterIndex(zmax)+1,fNcs);
   fSkip = 0;
   fAccepted =0;
+
+  return;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
 Int_t AliITStrackerMI::AliITSlayer::
@@ -1579,26 +1838,41 @@ FindDetectorIndex(Double_t phi, Double_t z) const {
   else                       // new geometry
     dphi = phi-fPhiOffset;
 
+
   if      (dphi <  0) dphi += 2*TMath::Pi();
   else if (dphi >= 2*TMath::Pi()) dphi -= 2*TMath::Pi();
   Int_t np=Int_t(dphi*fNladders*0.5/TMath::Pi()+0.5);
   if (np>=fNladders) np-=fNladders;
   if (np<0)          np+=fNladders;
 
+
   Double_t dz=fZOffset-z;
-  Int_t nz=Int_t(dz*(fNdetectors-1)*0.5/fZOffset+0.5);
+  Double_t nnz = dz*(fNdetectors-1)*0.5/fZOffset+0.5;
+  Int_t nz = (nnz<0 ? -1 : (Int_t)nnz);
   if (nz>=fNdetectors) return -1;
   if (nz<0)            return -1;
 
+  // ad hoc correction for 3rd ladder of SDD inner layer,
+  // which is reversed (rotated by pi around local y)
+  // this correction is OK only from AliITSv11Hybrid onwards
+  if (GetR()>12. && GetR()<20.) { // SDD inner
+    if(np==2) { // 3rd ladder
+      nz = (fNdetectors-1) - nz;
+    } 
+  }
+  //printf("ndet %d phi %f z %f  np %d nz %d\n",fNdetectors,phi,z,np,nz);
+
+
   return np*fNdetectors + nz;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
-const AliITSRecPoint *AliITStrackerMI::AliITSlayer::GetNextCluster(Int_t &ci){
+const AliITSRecPoint *AliITStrackerMI::AliITSlayer::GetNextCluster(Int_t &ci,Bool_t test)
+{
   //--------------------------------------------------------------------
   // This function returns clusters within the "window" 
   //--------------------------------------------------------------------
 
-  if (fCurrentSlice<0){
+  if (fCurrentSlice<0) {
     Double_t rpi2 = 2.*fR*TMath::Pi();
     for (Int_t i=fI; i<fImax; i++) {
       Double_t y = fY[i];
@@ -1608,17 +1882,16 @@ const AliITSRecPoint *AliITStrackerMI::AliITSlayer::GetNextCluster(Int_t &ci){
       if (y>fYmax) continue;
       if (fClusters[i]->GetQ()==0&&fSkip==2) continue;
       ci=i;
-      fI=i+1;
+      if (!test) fI=i+1;
       return fClusters[i];
     }
-  }
-  else{
+  } else {
     for (Int_t i=fI; i<fImax; i++) {
       if (fYcs[i]<fYmin) continue;
       if (fYcs[i]>fYmax) continue;
       if (fClustersCs[i]->GetQ()==0&&fSkip==2) continue;
       ci=fClusterIndexCs[i];
-      fI=i+1;
+      if (!test) fI=i+1;
       return fClustersCs[i];
     }
   }
@@ -1723,6 +1996,76 @@ const {
   return d;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
+AliITStrackerMI::AliITSdetector::AliITSdetector(const AliITSdetector& det):
+fR(det.fR),
+fRmisal(det.fRmisal),
+fPhi(det.fPhi),
+fSinPhi(det.fSinPhi),
+fCosPhi(det.fCosPhi),
+fYmin(det.fYmin),
+fYmax(det.fYmax),
+fZmin(det.fZmin),
+fZmax(det.fZmax),
+fIsBad(det.fIsBad),
+fNChips(det.fNChips),
+fChipIsBad(det.fChipIsBad)
+{
+  //Copy constructor
+}
+//------------------------------------------------------------------------
+void AliITStrackerMI::AliITSdetector::ReadBadDetectorAndChips(Int_t ilayer,Int_t idet,
+                                                AliITSDetTypeRec *detTypeRec)
+{
+  //--------------------------------------------------------------------
+  // Read bad detectors and chips from calibration objects in AliITSDetTypeRec
+  //--------------------------------------------------------------------
+
+  // In AliITSDetTypeRec, detector numbers go from 0 to 2197
+  // while in the tracker they start from 0 for each layer
+  for(Int_t il=0; il<ilayer; il++) 
+    idet += AliITSgeomTGeo::GetNLadders(il+1)*AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(il+1);
+
+  Int_t detType;
+  if (ilayer==0 || ilayer==1) {        // ----------  SPD
+    detType = 0;
+  } else if (ilayer==2 || ilayer==3) { // ----------  SDD
+    detType = 1;
+  } else if (ilayer==4 || ilayer==5) { // ----------  SSD
+    detType = 2;
+  } else {
+    printf("AliITStrackerMI::AliITSdetector::InitBadFromOCDB: Wrong layer number %d\n",ilayer);
+    return;
+  }
+
+  // Get calibration from AliITSDetTypeRec
+  AliITSCalibration *calib = (AliITSCalibration*)detTypeRec->GetCalibrationModel(idet);
+  calib->SetModuleIndex(idet);
+  AliITSCalibration *calibSPDdead = 0;
+  if(detType==0) calibSPDdead = (AliITSCalibration*)detTypeRec->GetSPDDeadModel(idet); // TEMPORARY
+  if (calib->IsBad() ||
+      (detType==0 && calibSPDdead->IsBad())) // TEMPORARY
+    {
+      SetBad();
+      //      printf("lay %d bad %d\n",ilayer,idet);
+    }
+
+  // Get segmentation from AliITSDetTypeRec
+  AliITSsegmentation *segm = (AliITSsegmentation*)detTypeRec->GetSegmentationModel(detType);
+
+  // Read info about bad chips
+  fNChips = segm->GetMaximumChipIndex()+1;
+  //printf("ilayer %d  detType %d idet %d fNChips %d %d  GetNumberOfChips %d\n",ilayer,detType,idet,fNChips,segm->GetMaximumChipIndex(),segm->GetNumberOfChips());
+  if(fChipIsBad) { delete [] fChipIsBad; fChipIsBad=NULL; }
+  fChipIsBad = new Bool_t[fNChips];
+  for (Int_t iCh=0;iCh<fNChips;iCh++) {
+    fChipIsBad[iCh] = calib->IsChipBad(iCh);
+    if (detType==0 && calibSPDdead->IsChipBad(iCh)) fChipIsBad[iCh] = kTRUE; // TEMPORARY
+    //if(fChipIsBad[iCh]) {printf("lay %d det %d bad chip %d\n",ilayer,idet,iCh);}
+  }
+
+  return;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
 Double_t AliITStrackerMI::GetEffectiveThickness()
 {
   //--------------------------------------------------------------------
@@ -1761,7 +2104,7 @@ Double_t AliITStrackerMI::GetEffectiveThickness()
 }
 //------------------------------------------------------------------------
 Int_t AliITStrackerMI::AliITSlayer::InRoad() const {
-  //--------------------------------------------------------------------
+  //-------------------------------------------------------------------
   // This function returns number of clusters within the "window" 
   //--------------------------------------------------------------------
   Int_t ncl=0;
@@ -1782,266 +2125,231 @@ Int_t AliITStrackerMI::AliITSlayer::InRoad() const {
   return ncl;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
-Bool_t AliITStrackerMI::RefitAt(Double_t xx,AliITStrackMI *t,
-                               const AliITStrackMI *c, Bool_t extra) {
+Bool_t AliITStrackerMI::RefitAt(Double_t xx,AliITStrackMI *track,
+                               const AliITStrackMI *clusters,Bool_t extra, Bool_t planeeff) 
+{
   //--------------------------------------------------------------------
-  // This function refits the track "t" at the position "x" using
-  // the clusters from "c"
+  // This function refits the track "track" at the position "x" using
+  // the clusters from "clusters"
   // If "extra"==kTRUE, 
-  //    the clusters from overlapped modules get attached to "t" 
+  //    the clusters from overlapped modules get attached to "track" 
+  // If "planeff"==kTRUE,
+  //    special approach for plane efficiency evaluation is applyed
   //--------------------------------------------------------------------
+
   Int_t index[AliITSgeomTGeo::kNLayers];
   Int_t k;
   for (k=0; k<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); k++) index[k]=-1;
-  Int_t nc=c->GetNumberOfClusters();
+  Int_t nc=clusters->GetNumberOfClusters();
   for (k=0; k<nc; k++) { 
-    Int_t idx=c->GetClusterIndex(k),nl=(idx&0xf0000000)>>28;
-    index[nl]=idx; 
-  }
-
-  // special for cosmics: check which the innermost layer crossed
-  // by the track
-  Int_t innermostlayer=5;
-  Double_t d = TMath::Abs(t->GetD(0.,0.));
-  for(innermostlayer=0; innermostlayer<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); innermostlayer++)
-    if(d<fgLayers[innermostlayer].GetR()) break;
-  //printf(" d  %f  innermost %d\n",d,innermostlayer);
-
-  Int_t from, to, step;
-  if (xx > t->GetX()) {
-      from=innermostlayer; to=AliITSgeomTGeo::GetNLayers();
-      step=+1;
-  } else {
-      from=AliITSgeomTGeo::GetNLayers()-1; to=innermostlayer-1;
-      step=-1;
+    Int_t idx=clusters->GetClusterIndex(k);
+    Int_t ilayer=(idx&0xf0000000)>>28;
+    index[ilayer]=idx; 
   }
-  TString dir=(step>0 ? "outward" : "inward");
 
-  // loop on the layers
-  for (Int_t i=from; i != to; i += step) {
-     AliITSlayer &layer=fgLayers[i];
-     Double_t r=layer.GetR();
-     // material between SSD and SDD, SDD and SPD
-     Double_t hI=i-0.5*step; 
-     if (TMath::Abs(hI-3.5)<0.01) // SDDouter
-       if(!CorrectForShieldMaterial(t,"SDD",dir)) return kFALSE;
-     if (TMath::Abs(hI-1.5)<0.01) // SPDouter
-       if(!CorrectForShieldMaterial(t,"SPD",dir)) return kFALSE;
-     
-     // remember old position [SR, GSI 18.02.2003]
-     Double_t oldX=0., oldY=0., oldZ=0.;
-     if (t->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
-        t->GetGlobalXYZat(t->GetX(),oldX,oldY,oldZ);
-     }
-     //
-
-     Double_t oldGlobXYZ[3];
-     t->GetXYZ(oldGlobXYZ);
-
-     Double_t phi,z;
-     if (!t->GetPhiZat(r,phi,z)) return kFALSE;
-
-     Int_t idet=layer.FindDetectorIndex(phi,z);
-     if (idet<0) return kFALSE;
-
-     const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
-     phi=det.GetPhi();
-     if (!t->Propagate(phi,det.GetR())) return kFALSE;
-     t->SetDetectorIndex(idet);
-
-     const AliITSRecPoint *cl=0;
-     Double_t maxchi2=1000.*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2();
-
-     Int_t idx=index[i];
-     if (idx>=0) {
-        const AliITSRecPoint *c=(AliITSRecPoint *)GetCluster(idx); 
-       if (c){
-         if (idet != c->GetDetectorIndex()) {
-           idet=c->GetDetectorIndex();
-           const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
-           if (!t->Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) {
-             return kFALSE;
-           }
-           t->SetDetectorIndex(idet);
-         }
-         //Double_t chi2=t->GetPredictedChi2(c);
-         Int_t layer = (idx & 0xf0000000) >> 28;;
-         Double_t chi2=GetPredictedChi2MI(t,c,layer);
-         if (chi2<maxchi2) { 
-           cl=c; 
-           maxchi2=chi2; 
-         } else {
-           return kFALSE;
-         }
-       }
-     }
-
-     if (cl) {
-       if (!UpdateMI(t,cl,maxchi2,idx)) return kFALSE;
-       t->SetSampledEdx(cl->GetQ(),t->GetNumberOfClusters()-1);
-     }
-
-     if (extra) { //search for extra clusters
-        AliITStrackV2 tmp(*t);
-        Double_t dz=4*TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaZ2()+AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(i));
-        if (dz < 0.5*TMath::Abs(tmp.GetTgl())) dz=0.5*TMath::Abs(tmp.GetTgl());
-        Double_t dy=4*TMath::Sqrt(t->GetSigmaY2()+AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(i));
-        if (dy < 0.5*TMath::Abs(tmp.GetSnp())) dy=0.5*TMath::Abs(tmp.GetSnp());
-        Double_t zmin=t->GetZ() - dz;
-        Double_t zmax=t->GetZ() + dz;
-        Double_t ymin=t->GetY() + phi*r - dy;
-        Double_t ymax=t->GetY() + phi*r + dy;
-        layer.SelectClusters(zmin,zmax,ymin,ymax);
-
-        const AliITSRecPoint *c=0; Int_t ci=-1,cci=-1;
-        Double_t maxchi2=1000.*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2(), tolerance=0.1;
-        while ((c=layer.GetNextCluster(ci))!=0) {
-           if (idet == c->GetDetectorIndex()) continue;
-
-          const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(c->GetDetectorIndex());
-
-          if (!tmp.Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) continue;
-           
-          if (TMath::Abs(tmp.GetZ() - c->GetZ()) > tolerance) continue;
-           if (TMath::Abs(tmp.GetY() - c->GetY()) > tolerance) continue;
-
-           Double_t chi2=tmp.GetPredictedChi2(c);
-           if (chi2<maxchi2) { maxchi2=chi2; cci=ci; }
-        }
-        if (cci>=0) t->SetExtraCluster(i,(i<<28)+cci);
-     }
-
-     // track time update [SR, GSI 17.02.2003]
-     if (t->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
-        Double_t newX, newY, newZ;
-        t->GetGlobalXYZat(t->GetX(),newX,newY,newZ);
-        Double_t dL2 = (oldX-newX)*(oldX-newX) + (oldY-newY)*(oldY-newY) + 
-                       (oldZ-newZ)*(oldZ-newZ);
-        t->AddTimeStep(TMath::Sqrt(dL2));
-     }
-     //
-
-     // Correct for material of the current layer
-     if(!CorrectForLayerMaterial(t,i,oldGlobXYZ,dir)) return kFALSE;
-
-  } // end loop on the layers
-
-  if (!t->PropagateTo(xx,0.,0.)) return kFALSE;
-  return kTRUE;
+  return RefitAt(xx,track,index,extra,planeeff); // call the method below
 }
 //------------------------------------------------------------------------
-Bool_t 
-AliITStrackerMI::RefitAt(Double_t xx,AliITStrackMI *t,const Int_t *clindex) {
+Bool_t AliITStrackerMI::RefitAt(Double_t xx,AliITStrackMI *track,
+                               const Int_t *clusters,Bool_t extra, Bool_t planeeff) 
+{
   //--------------------------------------------------------------------
-  // This function refits the track "t" at the position "x" using
+  // This function refits the track "track" at the position "x" using
   // the clusters from array
+  // If "extra"==kTRUE, 
+  //    the clusters from overlapped modules get attached to "track" 
+  // If "planeff"==kTRUE,
+  //    special approach for plane efficiency evaluation is applyed
   //--------------------------------------------------------------------
   Int_t index[AliITSgeomTGeo::kNLayers];
   Int_t k;
   for (k=0; k<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); k++) index[k]=-1;
   //
   for (k=0; k<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); k++) { 
-    index[k]=clindex[k]; 
+    index[k]=clusters[k]; 
   }
 
   // special for cosmics: check which the innermost layer crossed
   // by the track
   Int_t innermostlayer=5;
-  Double_t d = TMath::Abs(t->GetD(0.,0.));
-  for(innermostlayer=0; innermostlayer<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); innermostlayer++)
-    if(d<fgLayers[innermostlayer].GetR()) break;
-  //printf(" d  %f  innermost %d\n",d,innermostlayer);
+  Double_t drphi = TMath::Abs(track->GetD(0.,0.));
+  for(innermostlayer=0; innermostlayer<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); innermostlayer++) {
+    if(drphi < fgLayers[innermostlayer].GetR()) break;
+  }
+  //printf(" drphi  %f  innermost %d\n",drphi,innermostlayer);
 
+  Int_t modstatus=1; // found
+  Float_t xloc,zloc;
   Int_t from, to, step;
-  if (xx > t->GetX()) {
+  if (xx > track->GetX()) {
       from=innermostlayer; to=AliITSgeomTGeo::GetNLayers();
       step=+1;
   } else {
       from=AliITSgeomTGeo::GetNLayers()-1; to=innermostlayer-1;
       step=-1;
   }
-  TString dir=(step>0 ? "outward" : "inward");
+  TString dir = (step>0 ? "outward" : "inward");
 
-  for (Int_t i=from; i != to; i += step) {
-     AliITSlayer &layer=fgLayers[i];
+  for (Int_t ilayer = from; ilayer != to; ilayer += step) {
+     AliITSlayer &layer=fgLayers[ilayer];
      Double_t r=layer.GetR();
      if (step<0 && xx>r) break;
 
      // material between SSD and SDD, SDD and SPD
-     Double_t hI=i-0.5*step; 
+     Double_t hI=ilayer-0.5*step; 
      if (TMath::Abs(hI-3.5)<0.01) // SDDouter
-       if(!CorrectForShieldMaterial(t,"SDD",dir)) return kFALSE;
+       if(!CorrectForShieldMaterial(track,"SDD",dir)) return kFALSE;
      if (TMath::Abs(hI-1.5)<0.01) // SPDouter
-       if(!CorrectForShieldMaterial(t,"SPD",dir)) return kFALSE;
+       if(!CorrectForShieldMaterial(track,"SPD",dir)) return kFALSE;
 
      // remember old position [SR, GSI 18.02.2003]
      Double_t oldX=0., oldY=0., oldZ=0.;
-     if (t->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
-        t->GetGlobalXYZat(t->GetX(),oldX,oldY,oldZ);
+     if (track->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
+        if (!track->GetGlobalXYZat(track->GetX(),oldX,oldY,oldZ)) return kFALSE;
      }
      //
+
      Double_t oldGlobXYZ[3];
-     t->GetXYZ(oldGlobXYZ);
+     if (!track->GetXYZ(oldGlobXYZ)) return kFALSE;
+     //TMath::Sqrt(track->GetSigmaY2());
 
      Double_t phi,z;
-     if (!t->GetPhiZat(r,phi,z)) return kFALSE;
+     if (!track->GetPhiZat(r,phi,z)) return kFALSE;
 
      Int_t idet=layer.FindDetectorIndex(phi,z);
+
+     // check if we allow a prolongation without point for large-eta tracks
+     Int_t skip = CheckSkipLayer(track,ilayer,idet);
+     if (skip==2) {
+       // propagate to the layer radius
+       Double_t xToGo; if (!track->GetLocalXat(r,xToGo)) return kFALSE;
+       if (!track->Propagate(xToGo)) return kFALSE;
+       // apply correction for material of the current layer
+       CorrectForLayerMaterial(track,ilayer,oldGlobXYZ,dir);
+       modstatus = 4; // out in z
+       if(LocalModuleCoord(ilayer,idet,track,xloc,zloc)) { // local module coords
+        track->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
+       }
+       // track time update [SR, GSI 17.02.2003]
+       if (track->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
+        Double_t newX, newY, newZ;
+        if (!track->GetGlobalXYZat(track->GetX(),newX,newY,newZ)) return kFALSE;
+        Double_t dL2 = (oldX-newX)*(oldX-newX) + (oldY-newY)*(oldY-newY) + 
+                       (oldZ-newZ)*(oldZ-newZ);
+        track->AddTimeStep(TMath::Sqrt(dL2));
+       }
+       continue;
+     }
+
      if (idet<0) return kFALSE;
+
      const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
-     phi=det.GetPhi();
-     if (!t->Propagate(phi,det.GetR())) return kFALSE;
-     t->SetDetectorIndex(idet);
+     if (!track->Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) return kFALSE;
+
+     track->SetDetectorIndex(idet);
+     if(!LocalModuleCoord(ilayer,idet,track,xloc,zloc)) return kFALSE; // local module coords
+
+     Double_t dz,zmin,zmax,dy,ymin,ymax;
 
-     const AliITSRecPoint *cl=0;
+     const AliITSRecPoint *clAcc=0;
      Double_t maxchi2=1000.*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2();
 
-     Int_t idx=index[i];
-     if (idx>=0) {
-        const AliITSRecPoint *c=(AliITSRecPoint *)GetCluster(idx); 
-       if (c){
-         if (idet != c->GetDetectorIndex()) {
-           idet=c->GetDetectorIndex();
-           const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
-           if (!t->Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) {
-             return kFALSE;
-           }
-           t->SetDetectorIndex(idet);
-         }
-         //Double_t chi2=t->GetPredictedChi2(c);
-         Int_t layer = (idx & 0xf0000000) >> 28;;
-         Double_t chi2=GetPredictedChi2MI(t,c,layer);
-         if (chi2<maxchi2) { 
-           cl=c; 
-           maxchi2=chi2; 
-         } else {
-           return kFALSE;
-         }
-       }
+     Int_t idx=index[ilayer];
+     if (idx>=0) { // cluster in this layer
+       modstatus = 6; // no refit
+       const AliITSRecPoint *cl=(AliITSRecPoint *)GetCluster(idx); 
+       if (cl) {
+        if (idet != cl->GetDetectorIndex()) {
+          idet=cl->GetDetectorIndex();
+          const AliITSdetector &detc=layer.GetDetector(idet);
+          if (!track->Propagate(detc.GetPhi(),detc.GetR())) return kFALSE;
+          track->SetDetectorIndex(idet);
+          if(!LocalModuleCoord(ilayer,idet,track,xloc,zloc)) return kFALSE; // local module coords
+        }
+        Int_t cllayer = (idx & 0xf0000000) >> 28;;
+        Double_t chi2=GetPredictedChi2MI(track,cl,cllayer);
+        if (chi2<maxchi2) { 
+          clAcc=cl; 
+          maxchi2=chi2; 
+          modstatus = 1; // found
+        } else {
+           return kFALSE; //
+        }
+       }
+     } else { // no cluster in this layer
+       if (skip==1) {
+        modstatus = 3; // skipped
+         // Plane Eff determination:
+         if (planeeff && ilayer==AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetIPlanePlaneEff()) {
+           if (IsOKForPlaneEff(track,clusters,ilayer))  // only adequate track for plane eff. evaluation
+              UseTrackForPlaneEff(track,ilayer);
+         }
+       } else {
+        modstatus = 5; // no cls in road
+        // check dead
+        if (!ComputeRoad(track,ilayer,idet,zmin,zmax,ymin,ymax)) return kFALSE;
+        dz = 0.5*(zmax-zmin);
+        dy = 0.5*(ymax-ymin);
+        Int_t dead = CheckDeadZone(track,ilayer,idet,dz,dy,kTRUE);
+        if (dead==1) modstatus = 7; // holes in z in SPD
+        if (dead==2 || dead==3) modstatus = 2; // dead from OCDB
+       }
      }
-
-     if (cl) {
-       if (!UpdateMI(t,cl,maxchi2,idx)) return kFALSE;
-       t->SetSampledEdx(cl->GetQ(),t->GetNumberOfClusters()-1);
+     
+     if (clAcc) {
+       if (!UpdateMI(track,clAcc,maxchi2,idx)) return kFALSE;
+       track->SetSampledEdx(clAcc->GetQ(),track->GetNumberOfClusters()-1);
      }
-
+     track->SetModuleIndexInfo(ilayer,idet,modstatus,xloc,zloc);
+
+
+     if (extra) { // search for extra clusters in overlapped modules
+       AliITStrackV2 tmp(*track);
+       if (!ComputeRoad(track,ilayer,idet,zmin,zmax,ymin,ymax)) return kFALSE;
+       layer.SelectClusters(zmin,zmax,ymin,ymax);
+       
+       const AliITSRecPoint *clExtra=0; Int_t ci=-1,cci=-1;
+       Int_t idetExtra=-1;  
+       maxchi2=1000.*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2();
+       Double_t tolerance=0.1;
+       while ((clExtra=layer.GetNextCluster(ci))!=0) {
+        // only clusters in another module! (overlaps)
+        idetExtra = clExtra->GetDetectorIndex();
+        if (idet == idetExtra) continue;
+        
+        const AliITSdetector &detx=layer.GetDetector(idetExtra);
+        
+        if (!tmp.Propagate(detx.GetPhi(),detx.GetR()+clExtra->GetX())) continue;
+        if (TMath::Abs(tmp.GetZ() - clExtra->GetZ()) > tolerance) continue;
+        if (TMath::Abs(tmp.GetY() - clExtra->GetY()) > tolerance) continue;
+        if (!tmp.Propagate(detx.GetPhi(),detx.GetR())) continue;
+        
+        Double_t chi2=tmp.GetPredictedChi2(clExtra);
+        if (chi2<maxchi2) { maxchi2=chi2; cci=ci; }
+       }
+       if (cci>=0) {
+        track->SetExtraCluster(ilayer,(ilayer<<28)+cci);
+        track->SetExtraModule(ilayer,idetExtra);
+       }
+     } // end search for extra clusters in overlapped modules
+     
      // Correct for material of the current layer
-     if(!CorrectForLayerMaterial(t,i,oldGlobXYZ,dir)) return kFALSE;
+     if(!CorrectForLayerMaterial(track,ilayer,oldGlobXYZ,dir)) return kFALSE;
                  
      // track time update [SR, GSI 17.02.2003]
-     if (t->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
+     if (track->IsStartedTimeIntegral() && step==1) {
         Double_t newX, newY, newZ;
-        t->GetGlobalXYZat(t->GetX(),newX,newY,newZ);
+        if (!track->GetGlobalXYZat(track->GetX(),newX,newY,newZ)) return kFALSE;
         Double_t dL2 = (oldX-newX)*(oldX-newX) + (oldY-newY)*(oldY-newY) + 
                        (oldZ-newZ)*(oldZ-newZ);
-        t->AddTimeStep(TMath::Sqrt(dL2));
+        track->AddTimeStep(TMath::Sqrt(dL2));
      }
      //
 
-  }
+  } // end loop on layers
+
+  if (!track->Propagate(xx)) return kFALSE;
 
-  if (!t->PropagateTo(xx,0.,0.)) return kFALSE;
   return kTRUE;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
@@ -2131,7 +2439,13 @@ Double_t AliITStrackerMI::GetNormalizedChi2(AliITStrackMI * track, Int_t mode)
   //
   Double_t match = TMath::Sqrt(track->GetChi22());
   if (track->GetConstrain())  match/=track->GetNumberOfClusters();
-  if (!track->GetConstrain()) match/=track->GetNumberOfClusters()-2.;
+  if (!track->GetConstrain()) { 
+    if (track->GetNumberOfClusters()>2) {
+      match/=track->GetNumberOfClusters()-2.;
+    } else {
+      match=0;
+    }
+  }
   if (match<0) match=0;
   Float_t deadzonefactor = (track->GetNDeadZone()>0) ? 3*(1.1-track->GetDeadZoneProbability()):0.;
   Double_t normchi2 = 2*track->GetNSkipped()+match+deadzonefactor+(1+(2*track->GetNSkipped()+deadzonefactor)/track->GetNumberOfClusters())*
@@ -2145,8 +2459,10 @@ Double_t AliITStrackerMI::GetMatchingChi2(AliITStrackMI * track1, AliITStrackMI
 {
   //
   // return matching chi2 between two tracks
+  Double_t largeChi2=1000.;
+
   AliITStrackMI track3(*track2);
-  track3.Propagate(track1->GetAlpha(),track1->GetX());
+  if (!track3.Propagate(track1->GetAlpha(),track1->GetX())) return largeChi2;
   TMatrixD vec(5,1);
   vec(0,0)=track1->GetY()   - track3.GetY();
   vec(1,0)=track1->GetZ()   - track3.GetZ();
@@ -2181,7 +2497,7 @@ Double_t AliITStrackerMI::GetMatchingChi2(AliITStrackMI * track1, AliITStrackMI
   return chi2(0,0);
 }
 //------------------------------------------------------------------------
-Double_t  AliITStrackerMI::GetDeadZoneProbability(Double_t zpos, Double_t zerr)
+Double_t  AliITStrackerMI::GetSPDDeadZoneProbability(Double_t zpos, Double_t zerr)
 {
   //
   //  return probability that given point (characterized by z position and error) 
@@ -2421,13 +2737,13 @@ Int_t AliITStrackerMI::GetOverlapTrack(AliITStrackMI *track, Int_t trackID, Int_
     if (trackindex==2) sharedtrack =TMath::Min(tracks[0],tracks[1]);
     else{
       //
-      Int_t track[24], cluster[24];
-      for (Int_t i=0;i<trackindex;i++){ track[i]=-1; cluster[i]=0;}
+      Int_t tracks2[24], cluster[24];
+      for (Int_t i=0;i<trackindex;i++){ tracks2[i]=-1; cluster[i]=0;}
       Int_t index =0;
       //
       for (Int_t i=0;i<trackindex;i++){
        if (tracks[i]<0) continue;
-       track[index] = tracks[i];
+       tracks2[index] = tracks[i];
        cluster[index]++;       
        for (Int_t j=i+1;j<trackindex;j++){
          if (tracks[j]<0) continue;
@@ -2441,7 +2757,7 @@ Int_t AliITStrackerMI::GetOverlapTrack(AliITStrackMI *track, Int_t trackID, Int_
       Int_t max=0;
       for (Int_t i=0;i<index;i++){
        if (cluster[index]>max) {
-         sharedtrack=track[index];
+         sharedtrack=tracks2[index];
          max=cluster[index];
        }
       }
@@ -2588,8 +2904,6 @@ AliITStrackMI *  AliITStrackerMI::GetBest2Tracks(Int_t trackID1, Int_t trackID2,
       //if (track2->fFakeRatio>0) continue;
       Float_t nskipped=0;            
       RegisterClusterTracks(track2,trackID2);
-      Int_t list1[6],list2[6];
-      AliITSRecPoint *clist1[6], *clist2[6] ;
       Float_t cconflict1 = GetNumberOfSharedClusters(track1,trackID1,list1,clist1);
       Float_t cconflict2 = GetNumberOfSharedClusters(track2,trackID2,list2,clist2);
       UnRegisterClusterTracks(track2,trackID2);
@@ -2645,7 +2959,7 @@ AliITStrackMI *  AliITStrackerMI::GetBest2Tracks(Int_t trackID1, Int_t trackID2,
          }       
        }
        //
-       Double_t chi21=0,chi22=0;
+       chi21=0;chi22=0;
        if (TMath::Abs(track1->GetDy(i))>0.) {
          chi21 = (track1->GetDy(i)/track1->GetSigmaY(i))*(track1->GetDy(i)/track1->GetSigmaY(i))+
            (track1->GetDz(i)/track1->GetSigmaZ(i))*(track1->GetDz(i)/track1->GetSigmaZ(i));
@@ -2748,7 +3062,8 @@ void AliITStrackerMI::AddTrackHypothesys(AliITStrackMI * track, Int_t esdindex)
   // add track to the list of hypothesys
   //------------------------------------------------------------------
 
-  if (esdindex>=fTrackHypothesys.GetEntriesFast()) fTrackHypothesys.Expand(esdindex*2+10);
+  if (esdindex>=fTrackHypothesys.GetEntriesFast()) 
+    fTrackHypothesys.Expand(TMath::Max(fTrackHypothesys.GetSize(),esdindex*2+10));
   //
   TObjArray * array = (TObjArray*) fTrackHypothesys.At(esdindex);
   if (!array) {
@@ -2805,12 +3120,12 @@ void AliITStrackerMI::SortTrackHypothesys(Int_t esdindex, Int_t maxcut, Int_t mo
   //take errors of best track as a reference
   Float_t *erry = GetErrY(esdindex), *errz = GetErrZ(esdindex);
   Float_t *ny = GetNy(esdindex), *nz = GetNz(esdindex);
-  for (Int_t i=0;i<6;i++) {
-    if (besttrack->GetClIndex(i)>0){
-      erry[i] = besttrack->GetSigmaY(i); erry[i+6] = besttrack->GetSigmaY(i+6);
-      errz[i] = besttrack->GetSigmaZ(i); errz[i+6] = besttrack->GetSigmaZ(i+6);
-      ny[i]   = besttrack->GetNy(i);
-      nz[i]   = besttrack->GetNz(i);
+  for (Int_t j=0;j<6;j++) {
+    if (besttrack->GetClIndex(j)>0){
+      erry[j] = besttrack->GetSigmaY(j); erry[j+6] = besttrack->GetSigmaY(j+6);
+      errz[j] = besttrack->GetSigmaZ(j); errz[j+6] = besttrack->GetSigmaZ(j+6);
+      ny[j]   = besttrack->GetNy(j);
+      nz[j]   = besttrack->GetNz(j);
     }
   }
   //
@@ -2836,12 +3151,12 @@ void AliITStrackerMI::SortTrackHypothesys(Int_t esdindex, Int_t maxcut, Int_t mo
   TMath::Sort(entries,chi2,index,kFALSE);
   besttrack = (AliITStrackMI*)array->At(index[0]);
   if (besttrack&&besttrack->GetChi2MIP(0)<AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2PerCluster(0)){
-    for (Int_t i=0;i<6;i++){
-      if (besttrack->GetClIndex(i)>0){
-       erry[i] = besttrack->GetSigmaY(i); erry[i+6] = besttrack->GetSigmaY(i+6);
-       errz[i] = besttrack->GetSigmaZ(i); erry[i+6] = besttrack->GetSigmaY(i+6);
-       ny[i]   = besttrack->GetNy(i);
-       nz[i]   = besttrack->GetNz(i);
+    for (Int_t j=0;j<6;j++){
+      if (besttrack->GetClIndex(j)>0){
+       erry[j] = besttrack->GetSigmaY(j); erry[j+6] = besttrack->GetSigmaY(j+6);
+       errz[j] = besttrack->GetSigmaZ(j); erry[j+6] = besttrack->GetSigmaY(j+6);
+       ny[j]   = besttrack->GetNy(j);
+       nz[j]   = besttrack->GetNz(j);
       }
     }
   }
@@ -2871,16 +3186,16 @@ void AliITStrackerMI::SortTrackHypothesys(Int_t esdindex, Int_t maxcut, Int_t mo
     besttrack = (AliITStrackMI*)array->At(index[0]);
     if (besttrack){
       //
-      for (Int_t i=0;i<6;i++){
-       if (besttrack->GetNz(i)>0&&besttrack->GetNy(i)>0){
-         erry[i] = besttrack->GetSigmaY(i); erry[i+6] = besttrack->GetSigmaY(i+6);
-         errz[i] = besttrack->GetSigmaZ(i); errz[i+6] = besttrack->GetSigmaZ(i+6);
-         ny[i]   = besttrack->GetNy(i);
-         nz[i]   = besttrack->GetNz(i);
+      for (Int_t j=0;j<6;j++){
+       if (besttrack->GetNz(j)>0&&besttrack->GetNy(j)>0){
+         erry[j] = besttrack->GetSigmaY(j); erry[j+6] = besttrack->GetSigmaY(j+6);
+         errz[j] = besttrack->GetSigmaZ(j); errz[j+6] = besttrack->GetSigmaZ(j+6);
+         ny[j]   = besttrack->GetNy(j);
+         nz[j]   = besttrack->GetNz(j);
        }
       }
       besttrack->SetChi2MIP(0,GetNormalizedChi2(besttrack,mode));
-      Float_t minchi2 = TMath::Min(besttrack->GetChi2MIP(0)+5.+besttrack->GetNUsed(), double(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2PerCluster(0)));
+      minchi2 = TMath::Min(besttrack->GetChi2MIP(0)+5.+besttrack->GetNUsed(), double(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2PerCluster(0)));
       Float_t minn = besttrack->GetNumberOfClusters()-3;
       Int_t accepted=0;
       for (Int_t i=0;i<entries;i++){
@@ -2899,12 +3214,12 @@ void AliITStrackerMI::SortTrackHypothesys(Int_t esdindex, Int_t maxcut, Int_t mo
          if (!shortbest) accepted++;
          //
          newarray->AddLast(array->RemoveAt(index[i]));      
-         for (Int_t i=0;i<6;i++){
-           if (nz[i]==0){
-             erry[i] = track->GetSigmaY(i); erry[i+6] = track->GetSigmaY(i+6);
-             errz[i] = track->GetSigmaZ(i); errz[i]   = track->GetSigmaZ(i+6);
-             ny[i]   = track->GetNy(i);
-             nz[i]   = track->GetNz(i);
+         for (Int_t j=0;j<6;j++){
+           if (nz[j]==0){
+             erry[j] = track->GetSigmaY(j); erry[j+6] = track->GetSigmaY(j+6);
+             errz[j] = track->GetSigmaZ(j); errz[j]   = track->GetSigmaZ(j+6);
+             ny[j]   = track->GetNy(j);
+             nz[j]   = track->GetNz(j);
            }
          }
        }
@@ -3029,7 +3344,8 @@ AliITStrackMI * AliITStrackerMI::GetBestHypothesys(Int_t esdindex, AliITStrackMI
   delete forwardtrack;
   Int_t accepted=0;
   for (Int_t i=0;i<entries;i++){    
-    AliITStrackMI * track = (AliITStrackMI*)array->At(i);   
+    AliITStrackMI * track = (AliITStrackMI*)array->At(i);
+   
     if (!track) continue;
     
     if (accepted>checkmax || track->GetChi2MIP(3)>AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2PerCluster(3)*6. || 
@@ -3047,6 +3363,7 @@ AliITStrackMI * AliITStrackerMI::GetBestHypothesys(Int_t esdindex, AliITStrackMI
   //
   array->Compress();
   SortTrackHypothesys(esdindex,checkmax,1);
+
   array = (TObjArray*) fTrackHypothesys.At(esdindex);
   if (!array) return 0; // PH What can be the reason? Check SortTrackHypothesys
   besttrack = (AliITStrackMI*)array->At(0);  
@@ -3057,7 +3374,7 @@ AliITStrackMI * AliITStrackerMI::GetBestHypothesys(Int_t esdindex, AliITStrackMI
   AliITStrackMI *longtrack =0;
   minchi2 =1000;
   Float_t minn=besttrack->GetNumberOfClusters()+besttrack->GetNDeadZone();
-  for (Int_t itrack=entries-1;itrack>0;itrack--){
+  for (Int_t itrack=entries-1;itrack>0;itrack--) {
     AliITStrackMI * track = (AliITStrackMI*)array->At(itrack);
     if (!track->GetConstrain()) continue;
     if (track->GetNumberOfClusters()+track->GetNDeadZone()<minn) continue;
@@ -3156,23 +3473,23 @@ void  AliITStrackerMI::GetBestHypothesysMIP(TObjArray &itsTracks)
     Float_t minn=0;
     Float_t maxchi2=1000;
     for (Int_t j=0;j<array->GetEntriesFast();j++){
-      AliITStrackMI* track = (AliITStrackMI*)array->At(j);
-      if (!track) continue;
-      if (track->GetGoldV0()) {
-       longtrack = track;   //gold V0 track taken
+      AliITStrackMI* trackHyp = (AliITStrackMI*)array->At(j);
+      if (!trackHyp) continue;
+      if (trackHyp->GetGoldV0()) {
+       longtrack = trackHyp;   //gold V0 track taken
        break;
       }
-      if (track->GetNumberOfClusters()+track->GetNDeadZone()<minn) continue;
-      Float_t chi2 = track->GetChi2MIP(0);
+      if (trackHyp->GetNumberOfClusters()+trackHyp->GetNDeadZone()<minn) continue;
+      Float_t chi2 = trackHyp->GetChi2MIP(0);
       if (fAfterV0){
-       if (!track->GetGoldV0()&&track->GetConstrain()==kFALSE) chi2+=5;
+       if (!trackHyp->GetGoldV0()&&trackHyp->GetConstrain()==kFALSE) chi2+=5;
       }
-      if (track->GetNumberOfClusters()+track->GetNDeadZone()>minn) maxchi2 = track->GetChi2MIP(0);       
+      if (trackHyp->GetNumberOfClusters()+trackHyp->GetNDeadZone()>minn) maxchi2 = trackHyp->GetChi2MIP(0);       
       //
       if (chi2 > maxchi2) continue;
-      minn= track->GetNumberOfClusters()+track->GetNDeadZone();
+      minn= trackHyp->GetNumberOfClusters()+trackHyp->GetNDeadZone();
       maxchi2 = chi2;
-      longtrack=track;
+      longtrack=trackHyp;
     }    
     //
     //
@@ -3232,6 +3549,7 @@ void AliITStrackerMI::CookLabel(AliITStrackMI *track,Float_t wrong) const {
      for (Int_t ind=0;ind<3;ind++){
        if (tpcLabel>0)
         if (cl->GetLabel(ind)==tpcLabel) isWrong=0;
+       AliDebug(2,Form("icl %d  ilab %d lab %d",i,ind,cl->GetLabel(ind)));
      }
      track->SetChi2MIP(9,track->GetChi2MIP(9)+isWrong*(2<<l));
      nwrong+=isWrong;
@@ -3244,6 +3562,7 @@ void AliITStrackerMI::CookLabel(AliITStrackMI *track,Float_t wrong) const {
      else
        track->SetLabel(tpcLabel);
    }
+   AliDebug(2,Form(" nls %d wrong %d  label %d  tpcLabel %d\n",nclusters,nwrong,track->GetLabel(),tpcLabel));
    
 }
 //------------------------------------------------------------------------
@@ -3314,7 +3633,15 @@ Double_t AliITStrackerMI::GetPredictedChi2MI(AliITStrackMI* track, const AliITSR
   Float_t phi   = track->GetSnp();
   phi = TMath::Sqrt(phi*phi/(1.-phi*phi));
   AliITSClusterParam::GetError(layer,cluster,theta,phi,track->GetExpQ(),erry,errz);
+  AliDebug(2,Form(" chi2: tr-cl   %f  %f   tr X %f cl X %f",track->GetY()-cluster->GetY(),track->GetZ()-cluster->GetZ(),track->GetX(),cluster->GetX()));
+  // Take into account the mis-alignment (bring track to cluster plane)
+  Double_t xTrOrig=track->GetX();
+  if (!track->Propagate(xTrOrig+cluster->GetX())) return 1000.;
+  AliDebug(2,Form(" chi2: tr-cl   %f  %f   tr X %f cl X %f",track->GetY()-cluster->GetY(),track->GetZ()-cluster->GetZ(),track->GetX(),cluster->GetX()));
   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2MI(cluster->GetY(),cluster->GetZ(),erry,errz);
+  // Bring the track back to detector plane in ideal geometry
+  // [mis-alignment will be accounted for in UpdateMI()]
+  if (!track->Propagate(xTrOrig)) return 1000.;
   Float_t ny,nz;
   AliITSClusterParam::GetNTeor(layer,cluster,theta,phi,ny,nz);  
   Double_t delta = cluster->GetNy()+cluster->GetNz()-nz-ny;
@@ -3349,15 +3676,31 @@ Int_t AliITStrackerMI::UpdateMI(AliITStrackMI* track, const AliITSRecPoint* cl,D
 
   if (cl->GetQ()<=0) return 0;  // ingore the "virtual" clusters
 
-  //Float_t clxyz[3]; cl->GetGlobalXYZ(clxyz);Double_t trxyz[3]; track->GetXYZ(trxyz);printf("gtr %f %f %f\n",trxyz[0],trxyz[1],trxyz[2]);printf("gcl %f %f %f\n",clxyz[0],clxyz[1],clxyz[2]);
 
+  // Take into account the mis-alignment (bring track to cluster plane)
+  Double_t xTrOrig=track->GetX();
+  Float_t clxyz[3]; cl->GetGlobalXYZ(clxyz);Double_t trxyz[3]; track->GetXYZ(trxyz);
+  AliDebug(2,Form("gtr %f %f %f",trxyz[0],trxyz[1],trxyz[2]));
+  AliDebug(2,Form("gcl %f %f %f",clxyz[0],clxyz[1],clxyz[2]));
+  AliDebug(2,Form(" xtr %f  xcl %f",track->GetX(),cl->GetX()));
+
+  if (!track->Propagate(xTrOrig+cl->GetX())) return 0;
 
-  // Take into account the mis-alignment
-  Double_t x=track->GetX()+cl->GetX();
-  if (!track->PropagateTo(x,0.,0.)) return 0;
   
-  return track->UpdateMI(cl->GetY(),cl->GetZ(),track->GetSigmaY(layer),track->GetSigmaZ(layer),chi2,index);
+  AliCluster c(*cl);
+  c.SetSigmaY2(track->GetSigmaY(layer)*track->GetSigmaY(layer));
+  c.SetSigmaZ2(track->GetSigmaZ(layer)*track->GetSigmaZ(layer));
+
+
+  Int_t updated = track->UpdateMI(&c,chi2,index);
+
+  // Bring the track back to detector plane in ideal geometry
+  if (!track->Propagate(xTrOrig)) return 0;
+
+  if(!updated) AliDebug(2,"update failed");
+  return updated;
 }
+
 //------------------------------------------------------------------------
 void AliITStrackerMI::GetDCASigma(AliITStrackMI* track, Float_t & sigmarfi, Float_t &sigmaz)
 {
@@ -3454,7 +3797,7 @@ void AliITStrackerMI::UpdateESDtrack(AliITStrackMI* track, ULong_t flags) const
 //------------------------------------------------------------------------
 Int_t AliITStrackerMI::GetNearestLayer(const Double_t *xr) const{
   //
-  //Get nearest upper layer close to the point xr.
+  // Get nearest upper layer close to the point xr.
   // rough approximation 
   //
   const Float_t kRadiuses[6]={4,6.5,15.03,24.,38.5,43.7};
@@ -3715,9 +4058,9 @@ void AliITStrackerMI::FindV02(AliESDEvent *event)
     //I.B. trackat0 = *bestLong;
     new (&trackat0) AliITStrackMI(*bestLong);
     Double_t xx,yy,zz,alpha; 
-    bestLong->GetGlobalXYZat(bestLong->GetX(),xx,yy,zz);
+    if (!bestLong->GetGlobalXYZat(bestLong->GetX(),xx,yy,zz)) continue;
     alpha = TMath::ATan2(yy,xx);    
-    trackat0.Propagate(alpha,0);      
+    if (!trackat0.Propagate(alpha,0)) continue;      
     // calculate normalized distances to the vertex 
     //
     Float_t ptfac  = (1.+100.*TMath::Abs(trackat0.GetC()));
@@ -3932,11 +4275,15 @@ void AliITStrackerMI::FindV02(AliESDEvent *event)
       //
       //
       TObjArray * array0b     = (TObjArray*)fBestHypothesys.At(itrack0);
-      if (!array0b&&pvertex->GetRr()<40 && TMath::Abs(track0->GetTgl())<1.1) 
+      if (!array0b&&pvertex->GetRr()<40 && TMath::Abs(track0->GetTgl())<1.1) {
+       fCurrentEsdTrack = itrack0;
        FollowProlongationTree((AliITStrackMI*)fOriginal.At(itrack0),itrack0, kFALSE);
+      }
       TObjArray * array1b    = (TObjArray*)fBestHypothesys.At(itrack1);
-      if (!array1b&&pvertex->GetRr()<40 && TMath::Abs(track1->GetTgl())<1.1) 
+      if (!array1b&&pvertex->GetRr()<40 && TMath::Abs(track1->GetTgl())<1.1) { 
+       fCurrentEsdTrack = itrack1;
        FollowProlongationTree((AliITStrackMI*)fOriginal.At(itrack1),itrack1, kFALSE);
+      }
       //
       AliITStrackMI * track0b = (AliITStrackMI*)fOriginal.At(itrack0);       
       AliITStrackMI * track1b = (AliITStrackMI*)fOriginal.At(itrack1);
@@ -4079,7 +4426,7 @@ void AliITStrackerMI::FindV02(AliESDEvent *event)
        if (fnorm0<0) fnorm0*=-3;
        Float_t fnorm1 = normdist[itrack1];
        if (fnorm1<0) fnorm1*=-3;
-       if (pvertex->GetAnglep()[2]>0.1 ||  (pvertex->GetRr()<10.5)&& pvertex->GetAnglep()[2]>0.05 || pvertex->GetRr()<3){
+       if ((pvertex->GetAnglep()[2]>0.1) || ( (pvertex->GetRr()<10.5)&& pvertex->GetAnglep()[2]>0.05 ) || (pvertex->GetRr()<3)){
          pb0    =  TMath::Exp(-TMath::Min(fnorm0,Float_t(16.))/12.);
          pb1    =  TMath::Exp(-TMath::Min(fnorm1,Float_t(16.))/12.);
        }
@@ -4298,8 +4645,8 @@ void AliITStrackerMI::BuildMaterialLUT(TString material) {
   Double_t point1[3],point2[3];
   Double_t phi,cosphi,sinphi,z;
   // 0-5 layers, 6 pipe, 7-8 shields 
-  Double_t rmin[9]={ 3.5, 5.5,13.0,22.0,35.0,41.0, 2.0, 7.5,25.0};
-  Double_t rmax[9]={ 5.5, 7.3,17.0,26.0,41.0,47.0, 3.0,10.5,30.0};
+  Double_t rmin[9]={ 3.5, 5.5,13.0,22.0,35.0,41.0, 2.0, 8.0,25.0};
+  Double_t rmax[9]={ 5.5, 8.0,17.0,26.0,41.0,47.0, 3.0,10.5,30.0};
 
   Int_t ifirst=0,ilast=0;  
   if(material.Contains("Pipe")) {
@@ -4366,9 +4713,9 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForPipeMaterial(AliITStrackMI *t,
 
   // Define budget mode:
   // 0: material from AliITSRecoParam (hard coded)
-  // 1: material from TGeo (on the fly)
+  // 1: material from TGeo in one step (on the fly)
   // 2: material from lut
-  // 3: material from TGeo (same for all hypotheses)
+  // 3: material from TGeo in one step (same for all hypotheses)
   Int_t mode;
   switch(fUseTGeo) {
   case 0:
@@ -4398,7 +4745,8 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForPipeMaterial(AliITStrackMI *t,
 
   Float_t  dir = (direction.Contains("inward") ? 1. : -1.);
   Double_t rToGo=(dir>0 ? AliITSRecoParam::GetrInsidePipe() : AliITSRecoParam::GetrOutsidePipe());
-  Double_t xToGo; t->GetLocalXat(rToGo,xToGo);
+  Double_t xToGo;
+  if (!t->GetLocalXat(rToGo,xToGo)) return 0;
 
   Double_t xOverX0,x0,lengthTimesMeanDensity;
   Bool_t anglecorr=kTRUE;
@@ -4408,15 +4756,20 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForPipeMaterial(AliITStrackMI *t,
     xOverX0 = AliITSRecoParam::GetdPipe();
     x0 = AliITSRecoParam::GetX0Be();
     lengthTimesMeanDensity = xOverX0*x0;
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   case 1:
     if (!t->PropagateToTGeo(xToGo,1)) return 0;
-    return 1;
     break;
   case 2:
     if(fxOverX0Pipe<0) BuildMaterialLUT("Pipe");  
     xOverX0 = fxOverX0Pipe;
     lengthTimesMeanDensity = fxTimesRhoPipe;
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   case 3:
     if(!fxOverX0PipeTrks || index<0 || index>=fNtracks) Error("CorrectForPipeMaterial","Incorrect usage of UseTGeo option!\n");
@@ -4430,14 +4783,12 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForPipeMaterial(AliITStrackMI *t,
     }
     xOverX0 = fxOverX0PipeTrks[index];
     lengthTimesMeanDensity = fxTimesRhoPipeTrks[index];
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   }
 
-  lengthTimesMeanDensity *= dir;
-
-  if (!t->AliExternalTrackParam::PropagateTo(xToGo,GetBz())) return 0;
-  if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
-
   return 1;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
@@ -4451,9 +4802,10 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForShieldMaterial(AliITStrackMI *t,
 
   // Define budget mode:
   // 0: material from AliITSRecoParam (hard coded)
-  // 1: material from TGeo (on the fly)
+  // 1: material from TGeo in steps of X cm (on the fly)
+  //    X = AliITSRecoParam::GetStepSizeTGeo()
   // 2: material from lut
-  // 3: material from TGeo (same for all hypotheses)
+  // 3: material from TGeo in one step (same for all hypotheses)
   Int_t mode;
   switch(fUseTGeo) {
   case 0:
@@ -4490,30 +4842,37 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForShieldMaterial(AliITStrackMI *t,
     shieldindex=0;
   } else {
     Error("CorrectForShieldMaterial"," Wrong shield name\n");
-    //    printf("%s\n",shield.Data());
     return 0;
   }
-  Double_t xToGo; t->GetLocalXat(rToGo,xToGo);
+  Double_t xToGo;
+  if (!t->GetLocalXat(rToGo,xToGo)) return 0;
 
   Int_t index=2*fCurrentEsdTrack+shieldindex;
 
   Double_t xOverX0,x0,lengthTimesMeanDensity;
   Bool_t anglecorr=kTRUE;
+  Int_t nsteps=1;
 
   switch(mode) {
   case 0:
     xOverX0 = AliITSRecoParam::Getdshield(shieldindex);
     x0 = AliITSRecoParam::GetX0shield(shieldindex);
     lengthTimesMeanDensity = xOverX0*x0;
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   case 1:
-    if (!t->PropagateToTGeo(xToGo,1)) return 0;
-    return 1;
+    nsteps= (Int_t)(TMath::Abs(t->GetX()-xToGo)/AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetStepSizeTGeo())+1;
+    if (!t->PropagateToTGeo(xToGo,nsteps)) return 0; // cross the material and apply correction
     break;
   case 2:
     if(fxOverX0Shield[shieldindex]<0) BuildMaterialLUT("Shields");  
     xOverX0 = fxOverX0Shield[shieldindex];
     lengthTimesMeanDensity = fxTimesRhoShield[shieldindex];
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   case 3:
     if(!fxOverX0ShieldTrks || index<0 || index>=2*fNtracks) Error("CorrectForShieldMaterial","Incorrect usage of UseTGeo option!\n");
@@ -4527,14 +4886,12 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForShieldMaterial(AliITStrackMI *t,
     }
     xOverX0 = fxOverX0ShieldTrks[index];
     lengthTimesMeanDensity = fxTimesRhoShieldTrks[index];
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   }
 
-  lengthTimesMeanDensity *= dir;
-
-  if (!t->AliExternalTrackParam::PropagateTo(xToGo,GetBz())) return 0;
-  if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
-
   return 1;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
@@ -4549,9 +4906,10 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForLayerMaterial(AliITStrackMI *t,
 
   // Define budget mode:
   // 0: material from AliITSRecoParam (hard coded)
-  // 1: material from TGeo (on the fly)
+  // 1: material from TGeo in stepsof X cm (on the fly)
+  //    X = AliITSRecoParam::GetStepSizeTGeo()
   // 2: material from lut
-  // 3: material from TGeo (same for all hypotheses)
+  // 3: material from TGeo in one step (same for all hypotheses)
   Int_t mode;
   switch(fUseTGeo) {
   case 0:
@@ -4583,39 +4941,50 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForLayerMaterial(AliITStrackMI *t,
   Double_t deltar=(layerindex<2 ? 0.10*r : 0.05*r);
 
   Double_t rToGo=TMath::Sqrt(t->GetX()*t->GetX()+t->GetY()*t->GetY())-deltar*dir;
-  Double_t xToGo; t->GetLocalXat(rToGo,xToGo);
+  Double_t xToGo;
+  if (!t->GetLocalXat(rToGo,xToGo)) return 0;
 
   Int_t index=6*fCurrentEsdTrack+layerindex;
 
-  // Bring the track beyond the material
-  if (!t->AliExternalTrackParam::PropagateTo(xToGo,GetBz())) return 0;
-  Double_t globXYZ[3];
-  t->GetXYZ(globXYZ);
 
   Double_t xOverX0=0.0,x0=0.0,lengthTimesMeanDensity=0.0;
   Double_t mparam[7];
   Bool_t anglecorr=kTRUE;
+  Int_t nsteps=1;
 
   switch(mode) {
   case 0:
     xOverX0 = fgLayers[layerindex].GetThickness(t->GetY(),t->GetZ(),x0);
     lengthTimesMeanDensity = xOverX0*x0;
+    // Bring the track beyond the material
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   case 1:
-    AliTracker::MeanMaterialBudget(oldGlobXYZ,globXYZ,mparam);
-    if(mparam[1]>900000) return 0;
-    xOverX0=mparam[1];
-    lengthTimesMeanDensity=mparam[0]*mparam[4];
-    anglecorr=kFALSE;
+    Double_t rOld=TMath::Sqrt(oldGlobXYZ[0]*oldGlobXYZ[0]+oldGlobXYZ[1]*oldGlobXYZ[1]);
+    Double_t xOld;
+    if (!t->GetLocalXat(rOld,xOld)) return 0;
+    if (!t->Propagate(xOld)) return 0; // back before material (no correction)
+    nsteps = (Int_t)(TMath::Abs(xOld-xToGo)/AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetStepSizeTGeo())+1;
+    if (!t->PropagateToTGeo(xToGo,nsteps)) return 0; // cross the material and apply correction
     break;
   case 2:
     if(fxOverX0Layer[layerindex]<0) BuildMaterialLUT("Layers");  
     xOverX0 = fxOverX0Layer[layerindex];
     lengthTimesMeanDensity = fxTimesRhoLayer[layerindex];
+    // Bring the track beyond the material
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   case 3:
     if(!fxOverX0LayerTrks || index<0 || index>=6*fNtracks) Error("CorrectForLayerMaterial","Incorrect usage of UseTGeo option!\n");
-    if(fxOverX0LayerTrks[index]<0) {
+    // Bring the track beyond the material
+    if (!t->Propagate(xToGo)) return 0;
+    Double_t globXYZ[3];
+    if (!t->GetXYZ(globXYZ)) return 0;
+    if (fxOverX0LayerTrks[index]<0) {
       AliTracker::MeanMaterialBudget(oldGlobXYZ,globXYZ,mparam);
       if(mparam[1]>900000) return 0;
       Double_t angle=TMath::Sqrt((1.+t->GetTgl()*t->GetTgl())/
@@ -4627,13 +4996,11 @@ Int_t AliITStrackerMI::CorrectForLayerMaterial(AliITStrackMI *t,
     }
     xOverX0 = fxOverX0LayerTrks[index];
     lengthTimesMeanDensity = fxTimesRhoLayerTrks[index];
+    lengthTimesMeanDensity *= dir;
+    if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
     break;
   }
 
-  lengthTimesMeanDensity *= dir;
-
-  if (!t->CorrectForMeanMaterial(xOverX0,lengthTimesMeanDensity,anglecorr)) return 0;  
-
   return 1;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
@@ -4692,10 +5059,446 @@ void AliITStrackerMI::DeleteTrksMaterialLUT() {
   return;
 }
 //------------------------------------------------------------------------
+Int_t AliITStrackerMI::CheckSkipLayer(AliITStrackMI *track,
+                                     Int_t ilayer,Int_t idet) const {
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // This method is used to decide whether to allow a prolongation 
+  // without clusters, because we want to skip the layer.
+  // In this case the return value is > 0:
+  // return 1: the user requested to skip a layer
+  // return 2: track outside z acceptance of SSD/SDD and will cross both SPD
+  //-----------------------------------------------------------------
+
+  if (AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetLayersToSkip(ilayer)) return 1;
+
+  if (idet<0 && ilayer>1 && AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetExtendedEtaAcceptance()) {
+    // check if track will cross SPD outer layer
+    Double_t phiAtSPD2,zAtSPD2;
+    if (track->GetPhiZat(fgLayers[1].GetR(),phiAtSPD2,zAtSPD2)) {
+      if (TMath::Abs(zAtSPD2)<2.*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength()) return 2;
+    }
+  }
+
+  return 0;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
+Int_t AliITStrackerMI::CheckDeadZone(AliITStrackMI *track,
+                                    Int_t ilayer,Int_t idet,
+                                    Double_t dz,Double_t dy,
+                                    Bool_t noClusters) const {
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // This method is used to decide whether to allow a prolongation 
+  // without clusters, because there is a dead zone in the road.
+  // In this case the return value is > 0:
+  // return 1: dead zone at z=0,+-7cm in SPD
+  // return 2: all road is "bad" (dead or noisy) from the OCDB
+  // return 3: something "bad" (dead or noisy) from the OCDB
+  //-----------------------------------------------------------------
+
+  // check dead zones at z=0,+-7cm in the SPD
+  if (ilayer<2 && !AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetAddVirtualClustersInDeadZone()) {
+    Double_t zmindead[3]={fSPDdetzcentre[0] + 0.5*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength(),
+                         fSPDdetzcentre[1] + 0.5*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength(),
+                         fSPDdetzcentre[2] + 0.5*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength()};
+    Double_t zmaxdead[3]={fSPDdetzcentre[1] - 0.5*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength(),
+                         fSPDdetzcentre[2] - 0.5*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength(),
+                         fSPDdetzcentre[3] - 0.5*AliITSRecoParam::GetSPDdetzlength()};
+    for (Int_t i=0; i<3; i++)
+      if (track->GetZ()-dz<zmaxdead[i] && track->GetZ()+dz>zmindead[i]) {
+       AliDebug(2,Form("crack SPD %d",ilayer));
+       return 1; 
+      } 
+  }
+
+  // check bad zones from OCDB
+  if (!AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetUseBadZonesFromOCDB()) return 0;
 
+  if (idet<0) return 0;
 
+  AliITSdetector &det=fgLayers[ilayer].GetDetector(idet);  
 
+  Int_t detType=-1;
+  Float_t detSizeFactorX=0.0001,detSizeFactorZ=0.0001;
+  if (ilayer==0 || ilayer==1) {        // ----------  SPD
+    detType = 0;
+  } else if (ilayer==2 || ilayer==3) { // ----------  SDD
+    detType = 1;
+    detSizeFactorX *= 2.;
+  } else if (ilayer==4 || ilayer==5) { // ----------  SSD
+    detType = 2;
+  }
+  AliITSsegmentation *segm = (AliITSsegmentation*)fDetTypeRec->GetSegmentationModel(detType);
+  if (detType==2) segm->SetLayer(ilayer+1);
+  Float_t detSizeX = detSizeFactorX*segm->Dx(); 
+  Float_t detSizeZ = detSizeFactorZ*segm->Dz(); 
+
+  // check if the road overlaps with bad chips
+  Float_t xloc,zloc;
+  LocalModuleCoord(ilayer,idet,track,xloc,zloc);
+  Float_t zlocmin = zloc-dz;
+  Float_t zlocmax = zloc+dz;
+  Float_t xlocmin = xloc-dy;
+  Float_t xlocmax = xloc+dy;
+  Int_t chipsInRoad[100];
+
+  // check if road goes out of detector
+  Bool_t touchNeighbourDet=kFALSE; 
+  if (TMath::Abs(xlocmin)>0.5*detSizeX) {xlocmin=-0.5*detSizeX; touchNeighbourDet=kTRUE;} 
+  if (TMath::Abs(xlocmax)>0.5*detSizeX) {xlocmax=+0.5*detSizeX; touchNeighbourDet=kTRUE;} 
+  if (TMath::Abs(zlocmin)>0.5*detSizeZ) {zlocmin=-0.5*detSizeZ; touchNeighbourDet=kTRUE;} 
+  if (TMath::Abs(zlocmax)>0.5*detSizeZ) {zlocmax=+0.5*detSizeZ; touchNeighbourDet=kTRUE;} 
+  AliDebug(2,Form("layer %d det %d zmim zmax %f %f xmin xmax %f %f   %f %f",ilayer,idet,zlocmin,zlocmax,xlocmin,xlocmax,detSizeZ,detSizeX));
+
+  // check if this detector is bad
+  if (det.IsBad()) {
+    AliDebug(2,Form("lay %d  bad detector %d",ilayer,idet));
+    if(!touchNeighbourDet) {
+      return 2; // all detectors in road are bad
+    } else { 
+      return 3; // at least one is bad
+    }
+  }
+
+  Int_t nChipsInRoad = segm->GetChipsInLocalWindow(chipsInRoad,zlocmin,zlocmax,xlocmin,xlocmax);
+  AliDebug(2,Form("lay %d nChipsInRoad %d",ilayer,nChipsInRoad));
+  if (!nChipsInRoad) return 0;
+
+  Bool_t anyBad=kFALSE,anyGood=kFALSE;
+  for (Int_t iCh=0; iCh<nChipsInRoad; iCh++) {
+    if (chipsInRoad[iCh]<0 || chipsInRoad[iCh]>det.GetNChips()-1) continue;
+    AliDebug(2,Form("  chip %d bad %d",chipsInRoad[iCh],(Int_t)det.IsChipBad(chipsInRoad[iCh])));
+    if (det.IsChipBad(chipsInRoad[iCh])) {
+      anyBad=kTRUE;
+    } else {
+      anyGood=kTRUE;
+    } 
+  }
+
+  if (!anyGood) {
+    if(!touchNeighbourDet) {
+      AliDebug(2,"all bad in road");
+      return 2;  // all chips in road are bad
+    } else {
+      return 3; // at least a bad chip in road
+    }
+  }
+
+  if (anyBad) {
+    AliDebug(2,"at least a bad in road");
+    return 3; // at least a bad chip in road
+  } 
 
 
+  if (!AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetUseSingleBadChannelsFromOCDB()
+      || ilayer==4 || ilayer==5     // SSD
+      || !noClusters) return 0;
 
+  // There are no clusters in road: check if there is at least 
+  // a bad SPD pixel or SDD anode 
 
+  Int_t idetInITS=idet;
+  for(Int_t l=0;l<ilayer;l++) idetInITS+=AliITSgeomTGeo::GetNLadders(l+1)*AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(l+1);
+
+  if (fITSChannelStatus->AnyBadInRoad(idetInITS,zlocmin,zlocmax,xlocmin,xlocmax)) {
+    AliDebug(2,Form("Bad channel in det %d of layer %d\n",idet,ilayer));
+    return 3;
+  }
+  //if (fITSChannelStatus->FractionOfBadInRoad(idet,zlocmin,zlocmax,xlocmin,xlocmax) > AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMinFractionOfBadInRoad()) return 3;
+
+  return 0;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliITStrackerMI::LocalModuleCoord(Int_t ilayer,Int_t idet,
+                                      AliITStrackMI *track,
+                                      Float_t &xloc,Float_t &zloc) const {
+  //-----------------------------------------------------------------
+  // Gives position of track in local module ref. frame
+  //-----------------------------------------------------------------
+
+  xloc=0.; 
+  zloc=0.;
+
+  if(idet<0) return kFALSE;
+
+  Int_t ndet=AliITSgeomTGeo::GetNDetectors(ilayer+1); // layers from 1 to 6 
+
+  Int_t lad = Int_t(idet/ndet) + 1;
+
+  Int_t det = idet - (lad-1)*ndet + 1;
+
+  Double_t xyzGlob[3],xyzLoc[3];
+
+  AliITSdetector &detector = fgLayers[ilayer].GetDetector(idet);
+  // take into account the misalignment: xyz at real detector plane
+  if(!track->GetXYZAt(detector.GetRmisal(),GetBz(),xyzGlob)) return kFALSE;
+
+  if(!AliITSgeomTGeo::GlobalToLocal(ilayer+1,lad,det,xyzGlob,xyzLoc)) return kFALSE;
+
+  xloc = (Float_t)xyzLoc[0];
+  zloc = (Float_t)xyzLoc[2];
+
+  return kTRUE;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliITStrackerMI::IsOKForPlaneEff(AliITStrackMI* track, const Int_t *clusters, Int_t ilayer) const {
+//
+// Method to be optimized further: 
+// Aim: decide whether a track can be used for PlaneEff evaluation
+//      the decision is taken based on the track quality at the layer under study
+//      no information on the clusters on this layer has to be used
+//      The criterium is to reject tracks at boundaries between basic block (e.g. SPD chip)
+//      the cut is done on number of sigmas from the boundaries
+//
+//  Input: Actual track, layer [0,5] under study
+//  Output: none
+//  Return: kTRUE if this is a good track
+//
+// it will apply a pre-selection to obtain good quality tracks.  
+// Here also  you will have the possibility to put a control on the 
+// impact point of the track on the basic block, in order to exclude border regions 
+// this will be done by calling a proper method of the AliITSPlaneEff class.  
+//
+// input: AliITStrackMI* track, ilayer= layer number [0,5]
+// return: Bool_t   -> kTRUE if usable track, kFALSE if not usable. 
+//
+  Int_t index[AliITSgeomTGeo::kNLayers];
+  Int_t k;
+  for (k=0; k<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); k++) index[k]=-1;
+  //
+  for (k=0; k<AliITSgeomTGeo::GetNLayers(); k++) {
+    index[k]=clusters[k];
+  }
+
+  if(!fPlaneEff)
+    {AliWarning("IsOKForPlaneEff: null pointer to AliITSPlaneEff"); return kFALSE;}
+  AliITSlayer &layer=fgLayers[ilayer];
+  Double_t r=layer.GetR();
+  AliITStrackMI tmp(*track);
+
+// require a minimal number of cluster in other layers and eventually clusters in closest layers 
+  Int_t ncl=0; 
+  for(Int_t lay=AliITSgeomTGeo::kNLayers-1;lay>ilayer;lay--) {
+    AliDebug(2,Form("trak=%d  lay=%d  ; index=%d ESD label= %d",tmp.GetLabel(),lay,
+                    tmp.GetClIndex(lay),((AliESDtrack*)tmp.GetESDtrack())->GetLabel())) ;
+    if (tmp.GetClIndex(lay)>0) ncl++;
+  }
+  Bool_t nextout = kFALSE;
+  if(ilayer==AliITSgeomTGeo::kNLayers-1) nextout=kTRUE; // you are already on the outermost layer
+  else nextout = ((tmp.GetClIndex(ilayer+1)>0)? kTRUE : kFALSE );
+  Bool_t nextin = kFALSE;
+  if(ilayer==0) nextin=kTRUE; // you are already on the innermost layer
+  else nextin = ((index[ilayer-1]>=0)? kTRUE : kFALSE );
+  if(ncl<AliITSgeomTGeo::kNLayers-(ilayer+1)-AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxMissingClustersPlaneEff()) 
+     return kFALSE; 
+  if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetRequireClusterInOuterLayerPlaneEff() && !nextout)  return kFALSE;
+  if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetRequireClusterInInnerLayerPlaneEff() && !nextin)   return kFALSE;
+  if(tmp.Pt() < AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMinPtPlaneEff()) return kFALSE;
+ //  if(AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetOnlyConstraintPlaneEff()  && !tmp.GetConstrain()) return kFALSE;
+
+// detector number
+  Double_t phi,z;
+  if (!tmp.GetPhiZat(r,phi,z)) return kFALSE;
+  Int_t idet=layer.FindDetectorIndex(phi,z);
+  if(idet<0) { AliInfo(Form("cannot find detector"));
+    return kFALSE;}
+
+  // here check if it has good Chi Square.
+
+  //propagate to the intersection with the detector plane
+  const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
+  if (!tmp.Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) return kFALSE;
+
+  Float_t locx; //
+  Float_t locz; //
+  if(!LocalModuleCoord(ilayer,idet,&tmp,locx,locz)) return kFALSE;
+  UInt_t key=fPlaneEff->GetKeyFromDetLocCoord(ilayer,idet,locx,locz);
+  if(key>fPlaneEff->Nblock()) return kFALSE;
+  Float_t blockXmn,blockXmx,blockZmn,blockZmx;
+  if (!fPlaneEff->GetBlockBoundaries(key,blockXmn,blockXmx,blockZmn,blockZmx)) return kFALSE;
+  //***************
+  // DEFINITION OF SEARCH ROAD FOR accepting a track
+  //
+  //For the time being they are hard-wired, later on from AliITSRecoParam
+  // Double_t nsigx=AliITSRecoParam::GetNSigXFarFromBoundary();
+  // Double_t nsigz=AliITSRecoParam::GetNSigZFarFromBoundary();
+  Double_t nsigz=4; 
+  Double_t nsigx=4; 
+  Double_t dx=nsigx*TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaY2());  // those are precisions in the tracking reference system
+  Double_t dz=nsigz*TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaZ2());  // Use it also for the module reference system, as it is
+                                                // done for RecPoints
+
+  // exclude tracks at boundary between detectors
+  //Double_t boundaryWidth=AliITSRecoParam::GetBoundaryWidthPlaneEff();
+  Double_t boundaryWidth=0; // for the time being hard-wired, later on from AliITSRecoParam
+  AliDebug(2,Form("Tracking: track impact x=%f, y=%f, z=%f",tmp.GetX(), tmp.GetY(), tmp.GetZ()));
+  AliDebug(2,Form("Local:    track impact x=%f, z=%f",locx,locz));
+  AliDebug(2,Form("Search Road. Tracking: dy=%f , dz=%f",dx,dz));
+
+  if ( (locx-dx < blockXmn+boundaryWidth) ||
+       (locx+dx > blockXmx-boundaryWidth) ||
+       (locz-dz < blockZmn+boundaryWidth) ||
+       (locz+dz > blockZmx-boundaryWidth) ) return kFALSE;
+  return kTRUE;
+}
+//------------------------------------------------------------------------
+void AliITStrackerMI::UseTrackForPlaneEff(AliITStrackMI* track, Int_t ilayer) {
+//
+// This Method has to be optimized! For the time-being it uses the same criteria
+// as those used in the search of extra clusters for overlapping modules.
+//
+// Method Purpose: estabilish whether a track has produced a recpoint or not
+//                 in the layer under study (For Plane efficiency)
+//
+// inputs: AliITStrackMI* track  (pointer to a usable track)
+// outputs: none
+// side effects: update (by 1 count) the Plane Efficiency statistics of the basic block
+//               traversed by this very track. In details:
+//               - if a cluster can be associated to the track then call
+//                  AliITSPlaneEff::UpDatePlaneEff(key,kTRUE);
+//               - if not, the AliITSPlaneEff::UpDatePlaneEff(key,kFALSE) is called
+//
+  if(!fPlaneEff)
+    {AliWarning("UseTrackForPlaneEff: null pointer to AliITSPlaneEff"); return;}
+  AliITSlayer &layer=fgLayers[ilayer];
+  Double_t r=layer.GetR();
+  AliITStrackMI tmp(*track);
+
+// detector number
+  Double_t phi,z;
+  if (!tmp.GetPhiZat(r,phi,z)) return;
+  Int_t idet=layer.FindDetectorIndex(phi,z);
+
+  if(idet<0) { AliInfo(Form("cannot find detector"));
+    return;}
+
+
+//propagate to the intersection with the detector plane
+  const AliITSdetector &det=layer.GetDetector(idet);
+  if (!tmp.Propagate(det.GetPhi(),det.GetR())) return;
+
+
+//***************
+// DEFINITION OF SEARCH ROAD FOR CLUSTERS SELECTION
+//
+  Double_t dz=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaRoadZ()*
+                    TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaZ2() +
+                    AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
+                    AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
+                    AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(ilayer));
+  Double_t dy=AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaRoadY()*
+                    TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaY2() +
+                    AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
+                    AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
+                    AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(ilayer));
+
+// road in global (rphi,z) [i.e. in tracking ref. system]
+  Double_t zmin = tmp.GetZ() - dz;
+  Double_t zmax = tmp.GetZ() + dz;
+  Double_t ymin = tmp.GetY() + r*det.GetPhi() - dy;
+  Double_t ymax = tmp.GetY() + r*det.GetPhi() + dy;
+
+// select clusters in road
+  layer.SelectClusters(zmin,zmax,ymin,ymax);
+
+// Define criteria for track-cluster association
+  Double_t msz = tmp.GetSigmaZ2() +
+  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
+  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaZLayerForRoadZ()*
+  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaZ2(ilayer);
+  Double_t msy = tmp.GetSigmaY2() +
+  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
+  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigmaYLayerForRoadY()*
+  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaY2(ilayer);
+  if (tmp.GetConstrain()) {
+    msz *= AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigma2RoadZC();
+    msy *= AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigma2RoadYC();
+  }  else {
+    msz *= AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigma2RoadZNonC();
+    msy *= AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetNSigma2RoadYNonC();
+  }
+  msz = 1./msz; // 1/RoadZ^2
+  msy = 1./msy; // 1/RoadY^2
+//
+
+  const AliITSRecPoint *cl=0; Int_t clidx=-1, ci=-1;
+  Int_t idetc=-1;
+  Double_t chi2trkcl=1000.*AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2();
+  //Double_t  tolerance=0.2;
+  /*while ((cl=layer.GetNextCluster(clidx))!=0) {
+    idetc = cl->GetDetectorIndex();
+    if(idet!=idetc) continue;
+    //Int_t ilay = cl->GetLayer();
+
+    if (TMath::Abs(tmp.GetZ() - cl->GetZ()) > tolerance) continue;
+    if (TMath::Abs(tmp.GetY() - cl->GetY()) > tolerance) continue;
+
+    Double_t chi2=tmp.GetPredictedChi2(cl);
+    if (chi2<chi2trkcl) { chi2trkcl=chi2; ci=clidx; }
+  }*/
+  Float_t locx; //
+  Float_t locz; //
+  if(!LocalModuleCoord(ilayer,idet,&tmp,locx,locz)) return;
+//
+  AliDebug(2,Form("ilayer= %d, idet=%d, x= %f, z=%f",ilayer,idet,locx,locz));
+  UInt_t key=fPlaneEff->GetKeyFromDetLocCoord(ilayer,idet,locx,locz);
+  if(key>fPlaneEff->Nblock()) return;
+  Bool_t found=kFALSE;
+  //if (ci>=0) {
+  Double_t chi2;
+  while ((cl=layer.GetNextCluster(clidx))!=0) {
+    idetc = cl->GetDetectorIndex();
+    if(idet!=idetc) continue;
+    // here real control to see whether the cluster can be associated to the track.
+    // cluster not associated to track
+    if ( (tmp.GetZ()-cl->GetZ())*(tmp.GetZ()-cl->GetZ())*msz +
+         (tmp.GetY()-cl->GetY())*(tmp.GetY()-cl->GetY())*msy   > 1. ) continue;
+    // calculate track-clusters chi2
+    chi2 = GetPredictedChi2MI(&tmp,cl,ilayer); // note that this method change track tmp
+                                               // in particular, the error associated to the cluster 
+    //Double_t chi2 = tmp.GetPredictedChi(cl); // this method does not change track tmp
+    // chi2 cut
+    if (chi2 > AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxChi2s(ilayer)) continue;
+    found=kTRUE;
+    if (chi2<chi2trkcl) { chi2trkcl=chi2; ci=clidx; } // this just to trace which cluster is selected
+   // track->SetExtraCluster(ilayer,(ilayer<<28)+ci);
+   // track->SetExtraModule(ilayer,idetExtra);
+  }
+  if(!fPlaneEff->UpDatePlaneEff(found,key))
+       AliWarning(Form("UseTrackForPlaneEff: cannot UpDate PlaneEff for key=%d",key));
+  if(fPlaneEff->GetCreateHistos()&&  AliITSReconstructor::GetRecoParam()->GetHistoPlaneEff()) {
+    Float_t tr[4]={99999.,99999.,9999.,9999.};    // initialize to high values 
+    Float_t clu[4]={-99999.,-99999.,9999.,9999.}; // (in some cases GetCov fails) 
+    Int_t cltype[2]={-999,-999};
+
+    tr[0]=locx;
+    tr[1]=locz;
+    tr[2]=TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaY2());  // those are precisions in the tracking reference system
+    tr[3]=TMath::Sqrt(tmp.GetSigmaZ2());  // Use it also for the module reference system, as it is
+
+    if (found){
+      clu[0]=layer.GetCluster(ci)->GetDetLocalX();
+      clu[1]=layer.GetCluster(ci)->GetDetLocalZ();
+      cltype[0]=layer.GetCluster(ci)->GetNy();
+      cltype[1]=layer.GetCluster(ci)->GetNz();
+     
+     // Without the following 6 lines you would retrieve the nominal error of a cluster (e.g. for the SPD:
+     //  X->50/sqrt(12)=14 micron   Z->450/sqrt(12)= 120 micron) 
+     // Within AliTrackerMI/AliTrackMI the error on the cluster is associated to the AliITStrackMI (fSigmaY,Z)
+     // It is computed properly by calling the method 
+     // AliITStrackerMI::GetPredictedChi2MI(AliITStrackMI* track, const AliITSRecPoint *cluster,Int_t layer)
+     // T
+     //Double_t x=0.5*(tmp.GetX()+layer.GetCluster(ci)->GetX()); // Take into account the mis-alignment
+      //if (tmp.PropagateTo(x,0.,0.)) {
+        chi2=GetPredictedChi2MI(&tmp,layer.GetCluster(ci),ilayer);
+        AliCluster c(*layer.GetCluster(ci));
+        c.SetSigmaY2(tmp.GetSigmaY(ilayer)*tmp.GetSigmaY(ilayer));
+        c.SetSigmaZ2(tmp.GetSigmaZ(ilayer)*tmp.GetSigmaZ(ilayer));
+        //if (layer.GetCluster(ci)->GetGlobalCov(cov))  // by using this, instead, you got nominal cluster errors
+        clu[2]=TMath::Sqrt(c.GetSigmaY2());
+        clu[3]=TMath::Sqrt(c.GetSigmaZ2());
+      //}
+    }
+    fPlaneEff->FillHistos(key,found,tr,clu,cltype);
+  }
+return;
+}