]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - STEER/AliAODHandler.cxx
removing obsolete component from libAliHLTTrigger
[u/mrichter/AliRoot.git] / STEER / AliAODHandler.cxx
index 005ccd1d4ba9345eb6c8ac4e0ef74f51f24c3481..ec39319f86e9eaca902e3a592e07f3f44d671045 100644 (file)
@@ -42,8 +42,9 @@
 #include "AliGenDPMjetEventHeader.h"
 #include "AliGenPythiaEventHeader.h"
 #include "AliGenCocktailEventHeader.h"
-
-
+#include "AliCodeTimer.h"
+#include "AliAODBranchReplicator.h"
+#include "Riostream.h"
 
 ClassImp(AliAODHandler)
 
@@ -52,23 +53,28 @@ AliAODHandler::AliAODHandler() :
     AliVEventHandler(),
     fIsStandard(kTRUE),
     fFillAOD(kTRUE),
+    fFillAODRun(kTRUE),
+    fFillExtension(kTRUE),
     fNeedsHeaderReplication(kFALSE),
     fNeedsTracksBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsVerticesBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsV0sBranchReplication(kFALSE),
+    fNeedsCascadesBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsTrackletsBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsPMDClustersBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsJetsBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsFMDClustersBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsCaloClustersBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsMCParticlesBranchReplication(kFALSE),
+    fNeedsDimuonsBranchReplication(kFALSE),
     fAODIsReplicated(kFALSE),
     fAODEvent(NULL),
     fMCEventH(NULL),
     fTreeA(NULL),
     fFileA(NULL),
     fFileName(""),
-    fExtensions(NULL)
+    fExtensions(NULL),
+    fFilters(NULL)
 {
   // default constructor
 }
@@ -78,38 +84,49 @@ AliAODHandler::AliAODHandler(const char* name, const char* title):
     AliVEventHandler(name, title),
     fIsStandard(kTRUE),
     fFillAOD(kTRUE),
+    fFillAODRun(kTRUE),
+    fFillExtension(kTRUE),
     fNeedsHeaderReplication(kFALSE),
     fNeedsTracksBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsVerticesBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsV0sBranchReplication(kFALSE),
+    fNeedsCascadesBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsTrackletsBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsPMDClustersBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsJetsBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsFMDClustersBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsCaloClustersBranchReplication(kFALSE),
     fNeedsMCParticlesBranchReplication(kFALSE),
+    fNeedsDimuonsBranchReplication(kFALSE),
     fAODIsReplicated(kFALSE),
     fAODEvent(NULL),
     fMCEventH(NULL),
     fTreeA(NULL),
     fFileA(NULL),
     fFileName(""),
-    fExtensions(NULL)
+    fExtensions(NULL),
+    fFilters(NULL)
 {
+// Normal constructor.
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 AliAODHandler::~AliAODHandler() 
 {
  // Destructor.
+  
   delete fAODEvent;
-  if(fFileA){
+
+  if (fFileA)
+  {
     // is already handled in TerminateIO
     fFileA->Close();
     delete fFileA;
+    fTreeA = 0;
   }
   delete fTreeA;
-  if (fExtensions) delete fExtensions;
+  delete fExtensions;
+  delete fFilters;
 }
 
 //______________________________________________________________________________
@@ -118,35 +135,80 @@ Bool_t AliAODHandler::Init(Option_t* opt)
   // Initialize IO
   //
   // Create the AODevent object
-  if(!fAODEvent){
+    
+  Bool_t createStdAOD = fIsStandard || fFillAOD;
+  if(!fAODEvent && createStdAOD){
     fAODEvent = new AliAODEvent();
-    if (fIsStandard) fAODEvent->CreateStdContent();
+    if (fIsStandard) 
+      fAODEvent->CreateStdContent();
   }
   //
   // File opening according to execution mode
   TString option(opt);
   option.ToLower();
-  TDirectory *owd = gDirectory;
-  if (option.Contains("proof")) {
-    // proof
-    // Merging via files. Need to access analysis manager via interpreter.
-    gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->OpenProofFile(\"%s\", \"RECREATE\");", fFileName.Data()));
-    gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetCommonOutputContainer()->SetFile((TFile*)0x%lx);", gFile));
-    fFileA = gFile;
-  } else {
-    // local and grid
-    fFileA = new TFile(fFileName.Data(), "RECREATE");
-  }
-  CreateTree(1);
-  owd->cd();
+  if (createStdAOD) {
+    TDirectory *owd = gDirectory;
+    if (option.Contains("proof")) {
+      // proof
+      // Merging via files. Need to access analysis manager via interpreter.
+      gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisDataContainer *c_common_out = AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetCommonOutputContainer();"));
+      gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->OpenProofFile(c_common_out, \"RECREATE\");"));
+      fFileA = gFile;
+    } else {
+      // local and grid
+      fFileA = new TFile(fFileName.Data(), "RECREATE");
+    }
+    CreateTree(1);
+    owd->cd();
+  }  
   if (fExtensions) {
      TIter next(fExtensions);
      AliAODExtension *ext;
      while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->Init(option);
   }   
+  if (fFilters) {
+     TIter nextf(fFilters);
+     AliAODExtension *filteredAOD;
+     while ((filteredAOD=(AliAODExtension*)nextf())) {
+        filteredAOD->SetEvent(fAODEvent);
+        filteredAOD->Init(option);
+     }
+  }   
+  
   return kTRUE;
 }
 
+//______________________________________________________________________________
+void AliAODHandler::Print(Option_t* opt) const
+{
+  // Print info about this object
+
+  cout << opt << Form("IsStandard %d filename=%s",fIsStandard,fFileName.Data()) << endl;
+  
+  if ( fExtensions ) 
+  {
+    cout << opt << fExtensions->GetEntries() << " extensions :" << endl;
+    PrintExtensions(*fExtensions);    
+  }
+  if ( fFilters ) 
+  {
+    cout << opt << fFilters->GetEntries() << " filters :" << endl;
+    PrintExtensions(*fFilters);      
+  }
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliAODHandler::PrintExtensions(const TObjArray& array) const
+{
+  // Show the list of aod extensions
+  TIter next(&array);
+  AliAODExtension* ext(0x0);
+  while ( ( ext = static_cast<AliAODExtension*>(next()) ) )
+  {
+    ext->Print("   ");
+  }
+}
+
 //______________________________________________________________________________
 void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
 
@@ -167,15 +229,13 @@ void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
   // has to passed to the AOD Handler by this task 
   // (doing this in the steering macro would not work on PROOF)
 
+  if (!fAODEvent) return;
   TClonesArray *mcarray = (TClonesArray*)fAODEvent->FindListObject(AliAODMCParticle::StdBranchName()); 
   if(!mcarray)return;
-  mcarray->Delete();
 
   AliAODMCHeader *mcHeader = (AliAODMCHeader*)fAODEvent->FindListObject(AliAODMCHeader::StdBranchName()); 
   if(!mcHeader)return;
 
-  mcHeader->Reset();
-
   // Get the MC Infos.. Handler needs to be set before 
   // while adding the branch
   // This needs to be done, not to depend on the AnalysisManager
@@ -247,6 +307,7 @@ void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
 
          AliAODMCParticle mcpart_tmp(mcpart,i,flag);
          
+         mcpart_tmp.SetStatus(mcpart->Particle()->GetStatusCode());
          // 
          Int_t d0 =  mcpart_tmp.GetDaughter(0);
          Int_t d1 =  mcpart_tmp.GetDaughter(1);
@@ -298,7 +359,7 @@ void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
              if(fMCEventH->IsParticleSelected(m))mcpart_tmp.SetMother(fMCEventH->GetNewLabel(m));
              else AliError(Form("PROBLEM Mother not selected %d \n", m));
          }
-         
+
          new (l[j++]) AliAODMCParticle(mcpart_tmp);
          
       }
@@ -315,32 +376,36 @@ void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
     for(int it = 0; it < fAODEvent->GetNTracks();++it){
       AliAODTrack *track = fAODEvent->GetTrack(it);
       
-      Int_t label = TMath::Abs(track->GetLabel());
+      Int_t sign = 1;
+      Int_t label = track->GetLabel();
+      if(label<0){ // preserve the sign for later usage
+       label *= -1;
+       sign  = -1;
+      }
+
       if (label >= AliMCEvent::BgLabelOffset()) label =  mcEvent->BgLabelToIndex(label);
-      
-      
       if(label > np || track->GetLabel() == 0){
        AliWarning(Form("Wrong ESD track label %5d (%5d)",track->GetLabel(), label));
       }
       if(fMCEventH->GetNewLabel(label) == 0){
        AliWarning(Form("New label not found for %5d (%5d)",track->GetLabel(), label));
       }
-      track->SetLabel(fMCEventH->GetNewLabel(label));
+      track->SetLabel(sign*fMCEventH->GetNewLabel(label));
     }
   }
   
   // AOD calo cluster
   TClonesArray *clusters = fAODEvent->GetCaloClusters();
   if(clusters){
-    for (Int_t iClust = 0;iClust < fAODEvent->GetNCaloClusters(); ++iClust) {
+    for (Int_t iClust = 0;iClust < fAODEvent->GetNumberOfCaloClusters(); ++iClust) {
       AliAODCaloCluster * cluster = fAODEvent->GetCaloCluster(iClust);
-      UInt_t nLabel    = cluster->GetNLabel();
+      UInt_t nLabel    = cluster->GetNLabels();
       // Ugly but do not want to fragment memory by creating 
       // new Int_t (nLabel)
       Int_t* labels    = const_cast<Int_t*>(cluster->GetLabels());
       if (labels){
        for(UInt_t i = 0;i < nLabel;++i){
-         labels[i] = fMCEventH->GetNewLabel(cluster->GetLabel(i));
+         labels[i] = fMCEventH->GetNewLabel(cluster->GetLabelAt(i));
        }
       }
       //      cluster->SetLabels(labels,nLabel);
@@ -366,21 +431,42 @@ void AliAODHandler::StoreMCParticles(){
 Bool_t AliAODHandler::FinishEvent()
 {
   // Fill data structures
-  if(fFillAOD){
-    fAODEvent->MakeEntriesReferencable();
-    StoreMCParticles();
-    FillTree();
+  
+  if(fFillAOD && fFillAODRun && fAODEvent){
+      fAODEvent->MakeEntriesReferencable();
+      fTreeA->BranchRef();
+      FillTree();
+  }
+
+  if ((fFillAOD && fFillAODRun) || fFillExtension) {
     if (fExtensions) {
       TIter next(fExtensions);
       AliAODExtension *ext;
-      while ((ext=(AliAODExtension*)next())) {
-        ext->GetAOD()->MakeEntriesReferencable();
-        ext->GetTree()->Fill();
+      while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->FinishEvent();
+    }
+    if (fFilters) {   
+      TIter nextf(fFilters);
+      AliAODExtension *ext;
+      while ((ext=(AliAODExtension*)nextf())) {
+             ext->FinishEvent();
       }  
     }       
+  }  
+  
+  if (fIsStandard) 
+  {
+    fAODEvent->ResetStd();    
   }
-
-  if (fIsStandard) fAODEvent->ResetStd();
+  
+  if (fAODEvent) 
+  {
+    TClonesArray *mcarray = static_cast<TClonesArray*>(fAODEvent->FindListObject(AliAODMCParticle::StdBranchName()));
+    if(mcarray) mcarray->Delete();
+    
+    AliAODMCHeader *mcHeader = static_cast<AliAODMCHeader*>(fAODEvent->FindListObject(AliAODMCHeader::StdBranchName()));
+    if(mcHeader) mcHeader->Reset();
+  }
+  
   // Reset AOD replication flag
   fAODIsReplicated = kFALSE;
   return kTRUE;
@@ -391,11 +477,20 @@ Bool_t AliAODHandler::Terminate()
 {
   // Terminate 
   AddAODtoTreeUserInfo();
-  if (fExtensions) {
-    TIter next(fExtensions);
-    AliAODExtension *ext;
-    while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->GetTree()->GetUserInfo()->Add(ext->GetAOD());
-  }  
+  
+  TIter nextF(fFilters);
+  AliAODExtension *ext;
+  while ((ext=static_cast<AliAODExtension*>(nextF())))
+  {
+    ext->AddAODtoTreeUserInfo();
+  }
+
+  TIter nextE(fExtensions);
+  while ((ext=static_cast<AliAODExtension*>(nextE())))
+  {
+    ext->AddAODtoTreeUserInfo();
+  }
+  
   return kTRUE;
 }
 
@@ -404,15 +499,27 @@ Bool_t AliAODHandler::TerminateIO()
 {
   // Terminate IO
   if (fFileA) {
+    fFileA->Write();
     fFileA->Close();
     delete fFileA;
     fFileA = 0;
+    // When closing the file, the tree is also deleted.
+    fTreeA = 0;
   }
-  if (fExtensions) {
-    TIter next(fExtensions);
-    AliAODExtension *ext;
-    while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->TerminateIO();
+  
+  TIter nextF(fFilters);
+  AliAODExtension *ext;
+  while ((ext=static_cast<AliAODExtension*>(nextF())))
+  {
+    ext->TerminateIO();
   }  
+
+  TIter nextE(fExtensions);
+  while ((ext=static_cast<AliAODExtension*>(nextE())))
+  {
+    ext->TerminateIO();
+  }  
+  
   return kTRUE;
 }
 
@@ -428,68 +535,117 @@ void AliAODHandler::CreateTree(Int_t flag)
 //______________________________________________________________________________
 void AliAODHandler::FillTree()
 {
     // Fill the AOD Tree
-  fTreeA->Fill();
+    fTreeA->Fill();
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 void AliAODHandler::AddAODtoTreeUserInfo()
 {
   // Add aod event to tree user info
-  fTreeA->GetUserInfo()->Add(fAODEvent);
+  if (fTreeA) fTreeA->GetUserInfo()->Add(fAODEvent);
+  // Now the tree owns our fAODEvent...
+  fAODEvent = 0;
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 void AliAODHandler::AddBranch(const char* cname, void* addobj, const char* filename)
 {
-    // Add a new branch to the aod. Added optional filename parameter if the
-    // branch should be written to a separate file.
-    if (strlen(filename)) {
-       AliAODExtension *ext = AddExtension(filename);
-       ext->AddBranch(cname, addobj);
-       return;
-    }
-    TDirectory *owd = gDirectory;
-    if (fFileA) {
-      fFileA->cd();
-    }
-    char** apointer = (char**) addobj;
-    TObject* obj = (TObject*) *apointer;
-
-    fAODEvent->AddObject(obj);
-    const Int_t kSplitlevel = 99; // default value in TTree::Branch()
-    const Int_t kBufsize = 32000; // default value in TTree::Branch()
+  // Add a new branch to the aod. Added optional filename parameter if the
+  // branch should be written to a separate file.
+  
+  if (strlen(filename)) 
+  {
+    AliAODExtension *ext = AddExtension(filename);
+    ext->AddBranch(cname, addobj);
+    return;
+  } 
+  
+  // Add branch to all filters
+  // Add branch to all filters
+  if (fFilters) {
+    TIter next(fFilters);
+    AliAODExtension *ext;
+    while ((ext=(AliAODExtension*)next())) ext->AddBranch(cname, addobj);
+  }
+  
+  TDirectory *owd = gDirectory;
+  if (fFileA) 
+  {
+    fFileA->cd();
+  }
 
-    if (!fTreeA->FindBranch(obj->GetName())) {
-      // Do the same as if we book via 
-      // TTree::Branch(TCollection*)
-      
-      fTreeA->Bronch(obj->GetName(), cname, fAODEvent->GetList()->GetObjectRef(obj),
-                    kBufsize, kSplitlevel - 1);
-      //    fTreeA->Branch(obj->GetName(), cname, addobj);
-    }
-    owd->cd();
+  char** apointer = (char**) addobj;
+  TObject* obj = (TObject*) *apointer;
+  
+  fAODEvent->AddObject(obj);
+  
+  const Int_t kSplitlevel = 99; // default value in TTree::Branch()
+  const Int_t kBufsize = 32000; // default value in TTree::Branch()
+  
+  if (!fTreeA->FindBranch(obj->GetName())) 
+  {
+    // Do the same as if we book via 
+    // TTree::Branch(TCollection*)
+    
+    fTreeA->Bronch(obj->GetName(), cname, fAODEvent->GetList()->GetObjectRef(obj),
+                   kBufsize, kSplitlevel - 1);
+  }
+  owd->cd();
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 AliAODExtension *AliAODHandler::AddExtension(const char *filename, const char *title)
 {
-// Add an AOD extension with some branches in a different file.
-   TString fname(filename);
-   if (!fname.EndsWith(".root")) fname += ".root";
-   if (!fExtensions) {
-      fExtensions = new TObjArray();
-      fExtensions->SetOwner();
-   }   
-   AliAODExtension *ext = (AliAODExtension*)fExtensions->FindObject(fname);
-   if (!ext) {
-      ext = new AliAODExtension(fname, title);
-      fExtensions->Add(ext);
-   }   
-   return ext;
+  // Add an AOD extension with some branches in a different file.
+  
+  TString fname(filename);
+  if (!fname.EndsWith(".root")) fname += ".root";
+  if (!fExtensions) {
+    fExtensions = new TObjArray();
+    fExtensions->SetOwner();
+  }   
+  AliAODExtension *ext = (AliAODExtension*)fExtensions->FindObject(fname);
+  if (!ext) {
+    ext = new AliAODExtension(fname, title);
+    fExtensions->Add(ext);
+  }   
+  return ext;
 }
-   
+
+//______________________________________________________________________________
+AliAODExtension *AliAODHandler::GetExtension(const char *filename) const
+{
+  // Getter for AOD extensions via file name.
+  if (!fExtensions) return NULL;
+  return (AliAODExtension*)fExtensions->FindObject(filename);
+}   
+
+//______________________________________________________________________________
+AliAODExtension *AliAODHandler::AddFilteredAOD(const char *filename, const char *filtername)
+{
+  // Add an AOD extension that can write only AOD events that pass a user filter.
+  if (!fFilters) {
+    fFilters = new TObjArray();
+    fFilters->SetOwner();
+  } 
+  AliAODExtension *filter = (AliAODExtension*)fFilters->FindObject(filename);
+  if (!filter) {
+    filter = new AliAODExtension(filename, filtername, kTRUE);
+    fFilters->Add(filter);
+  }
+  return filter;
+}      
+
+//______________________________________________________________________________
+AliAODExtension *AliAODHandler::GetFilteredAOD(const char *filename) const
+{
+  // Getter for AOD filters via file name.
+  if (!fFilters) return NULL;
+  return (AliAODExtension*)fFilters->FindObject(filename);
+}   
+
 //______________________________________________________________________________
 void AliAODHandler::SetOutputFileName(const char* fname)
 {
@@ -504,6 +660,40 @@ const char *AliAODHandler::GetOutputFileName()
    return fFileName.Data();
 }
 
+//______________________________________________________________________________
+const char *AliAODHandler::GetExtraOutputs() const
+{
+  // Get extra outputs as a string separated by commas.
+  static TString eoutputs;
+  eoutputs = "";
+  TObject *obj;
+  if (fExtensions) {
+    TIter next1(fExtensions);
+    while ((obj=next1())) {
+      if (!eoutputs.IsNull()) eoutputs += ",";
+      eoutputs += obj->GetName();
+    }
+  }
+  if (fFilters) {
+    TIter next2(fFilters);
+    while ((obj=next2())) {
+      if (!eoutputs.IsNull()) eoutputs += ",";
+      eoutputs += obj->GetName();
+    }
+  }
+  return eoutputs.Data();
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+Bool_t AliAODHandler::HasExtensions() const
+{
+  // Whether or not we manage extensions
+  
+  if ( fExtensions && fExtensions->GetEntries()>0 ) return kTRUE;
+  
+  return kFALSE;
+}
+
 //______________________________________________________________________________
 void  AliAODHandler::SetMCHeaderInfo(AliAODMCHeader *mcHeader,AliGenEventHeader *genHeader){
 
@@ -540,91 +730,3 @@ void  AliAODHandler::SetMCHeaderInfo(AliAODMCHeader *mcHeader,AliGenEventHeader
 
 }
 
-ClassImp(AliAODExtension)
-
-//-------------------------------------------------------------------------
-//     Support class for AOD extensions. This is created by the user analysis
-//     that requires a separate file for some AOD branches. The name of the 
-//     AliAODExtension object is the file name where the AOD branches will be
-//     stored.
-//-------------------------------------------------------------------------
-
-//______________________________________________________________________________
-AliAODExtension::~AliAODExtension()
-{
-// Destructor.
-  delete fAODEvent;
-  if(fFileE){
-    // is already handled in TerminateIO
-    fFileE->Close();
-    delete fFileE;
-  }
-  delete fTreeE;
-}
-
-//______________________________________________________________________________
-void AliAODExtension::AddBranch(const char* cname, void* addobj)
-{
-    // Add a new branch to the aod 
-    if (!fAODEvent) {
-       char type[20];
-       gROOT->ProcessLine(Form("TString s_tmp; AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->GetAnalysisTypeString(s_tmp); sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", s_tmp.Data());", type));
-       Init(type);
-    }
-    TDirectory *owd = gDirectory;
-    if (fFileE) {
-      fFileE->cd();
-    }
-    char** apointer = (char**) addobj;
-    TObject* obj = (TObject*) *apointer;
-
-    fAODEvent->AddObject(obj);
-    const Int_t kSplitlevel = 99; // default value in TTree::Branch()
-    const Int_t kBufsize = 32000; // default value in TTree::Branch()
-
-    if (!fTreeE->FindBranch(obj->GetName())) {
-      // Do the same as if we book via 
-      // TTree::Branch(TCollection*)
-      
-      fTreeE->Bronch(obj->GetName(), cname, fAODEvent->GetList()->GetObjectRef(obj),
-                    kBufsize, kSplitlevel - 1);
-      //    fTreeA->Branch(obj->GetName(), cname, addobj);
-    }
-    owd->cd();
-}
-
-//______________________________________________________________________________
-Bool_t AliAODExtension::Init(Option_t *option)
-{
-// Initialize IO.
-  if(!fAODEvent) fAODEvent = new AliAODEvent();
-  TDirectory *owd = gDirectory;
-  TString opt(option);
-  opt.ToLower();
-  if (opt.Contains("proof")) {
-    // proof
-    // Merging via files. Need to access analysis manager via interpreter.
-    gROOT->ProcessLine(Form("AliAnalysisManager::GetAnalysisManager()->OpenProofFile(\"%s\", \"RECREATE\");", fName.Data()));
-    fFileE = gFile;
-  } else {
-    fFileE = new TFile(GetName(), "RECREATE");
-  }  
-  fTreeE = new TTree("aodTree", "AliAOD tree");
-  fTreeE->Branch(fAODEvent->GetList());
-  owd->cd();
-  return kTRUE;
-}
-
-//______________________________________________________________________________
-Bool_t AliAODExtension::TerminateIO()
-{
-  // Terminate IO
-  if (fFileE) {
-    fFileE->Write();
-    fFileE->Close();
-    delete fFileE;
-    fFileE = 0;
-  }
-  return kTRUE;
-}