]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
Reducing the printout
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 848878b3ceb1dbc4ad3e5fb774ed3f9d334423d9..567cbb1d3c642961895ccd3b5f1fa3c813f985b6 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/*
-$Log$
-Revision 1.29  2001/02/28 16:34:40  kowal2
-Protection against nonphysical values of the avalanche size,
-10**6 is the maximum
-
-Revision 1.28  2001/01/26 19:57:19  hristov
-Major upgrade of AliRoot code
-
-Revision 1.27  2001/01/13 17:29:33  kowal2
-Sun compiler correction
-
-Revision 1.26  2001/01/10 07:59:43  kowal2
-Corrections to load points from the noncompressed hits.
-
-Revision 1.25  2000/11/02 07:25:31  kowal2
-Changes due to the new hit structure.
-Memory leak removed.
-
-Revision 1.24  2000/10/05 16:06:09  kowal2
-Forward declarations. Changes due to a new class AliComplexCluster.
-
-Revision 1.23  2000/10/02 21:28:18  fca
-Removal of useless dependecies via forward declarations
-
-Revision 1.22  2000/07/10 20:57:39  hristov
-Update of TPC code and macros by M.Kowalski
-
-Revision 1.19.2.4  2000/06/26 07:39:42  kowal2
-Changes to obey the coding rules
-
-Revision 1.19.2.3  2000/06/25 08:38:41  kowal2
-Splitted from AliTPCtracking
-
-Revision 1.19.2.2  2000/06/16 12:59:28  kowal2
-Changed parameter settings
-
-Revision 1.19.2.1  2000/06/09 07:15:07  kowal2
-
-Defaults loaded automatically (hard-wired)
-Optional parameters can be set via macro called in the constructor
-
-Revision 1.19  2000/04/18 19:00:59  fca
-Small bug fixes to TPC files
-
-Revision 1.18  2000/04/17 09:37:33  kowal2
-removed obsolete AliTPCDigitsDisplay.C
-
-Revision 1.17.2.2  2000/04/10 08:15:12  kowal2
-
-New, experimental data structure from M. Ivanov
-New tracking algorithm
-Different pad geometry for different sectors
-Digitization rewritten
-
-Revision 1.17.2.1  2000/04/10 07:56:53  kowal2
-Not used anymore - removed
-
-Revision 1.17  2000/01/19 17:17:30  fca
-Introducing a list of lists of hits -- more hits allowed for detector now
-
-Revision 1.16  1999/11/05 09:29:23  fca
-Accept only signals > 0
-
-Revision 1.15  1999/10/08 06:26:53  fca
-Removed ClustersIndex - not used anymore
-
-Revision 1.14  1999/09/29 09:24:33  fca
-Introduction of the Copyright and cvs Log
-
-*/
+/* $Id$ */
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
@@ -103,52 +33,72 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 
 //
 
+#include <Riostream.h>
+#include <stdlib.h>
+
+#include <TFile.h>  
+#include <TGeometry.h>
+#include <TInterpreter.h>
 #include <TMath.h>
-#include <TRandom.h>
-#include <TVector.h>
 #include <TMatrix.h>
-#include <TGeometry.h>
 #include <TNode.h>
-#include <TTUBS.h>
 #include <TObjectTable.h>
-#include "TParticle.h"
-#include "AliTPC.h"
-#include <TFile.h>       
-#include "AliRun.h"
-#include <iostream.h>
-#include <stdlib.h>
-#include <fstream.h>
-#include "AliMC.h"
-#include "AliMagF.h"
-
+#include <TParticle.h>
+#include <TROOT.h>
+#include <TRandom.h>
+#include <TSystem.h>     
+#include <TTUBS.h>
+#include <TTree.h>
+#include <TVirtualMC.h>
+#include <TString.h>
+#include <TF2.h>
+#include <TStopwatch.h>
 
-#include "AliTPCParamSR.h"
-#include "AliTPCPRF2D.h"
-#include "AliTPCRF1D.h"
+#include "AliArrayBranch.h"
 #include "AliDigits.h"
-#include "AliSimDigits.h"
-#include "AliTPCTrackHits.h"
+#include "AliMagF.h"
 #include "AliPoints.h"
-#include "AliArrayBranch.h"
-
-
+#include "AliRun.h"
+#include "AliRunLoader.h"
+#include "AliSimDigits.h"
+#include "AliTPC.h"
+#include "AliTPC.h"
 #include "AliTPCDigitsArray.h"
-#include "AliComplexCluster.h"
-#include "AliClusters.h"
-#include "AliTPCClustersRow.h"
-#include "AliTPCClustersArray.h"
-
-#include "AliTPCcluster.h"
-#include "AliTPCclusterer.h"
-#include "AliTPCtracker.h"
-
-#include <TInterpreter.h>
-#include <TTree.h>
-
+#include "AliTPCLoader.h"
+#include "AliTPCPRF2D.h"
+#include "AliTPCParamSR.h"
+#include "AliTPCRF1D.h"
+#include "AliTPCTrackHits.h"
+#include "AliTPCTrackHitsV2.h"
+#include "AliTrackReference.h"
+#include "AliMC.h"
+#include "AliTPCDigitizer.h"
+#include "AliTPCBuffer.h"
+#include "AliTPCDDLRawData.h"
 
 
 ClassImp(AliTPC) 
 
+//_____________________________________________________________________________
+// helper class for fast matrix and vector manipulation - no range checking
+// origin - Marian Ivanov
+
+class AliTPCFastMatrix : public TMatrix {
+public :
+  AliTPCFastMatrix(Int_t rowlwb, Int_t rowupb, Int_t collwb, Int_t colupb);
+#if ROOT_VERSION_CODE >= ROOT_VERSION(4,0,1)
+  Float_t & UncheckedAt(Int_t rown, Int_t coln) const  {return fElements[(rown-fRowLwb)*fNcols+(coln-fColLwb)];} //fast acces
+  Float_t   UncheckedAtFast(Int_t rown, Int_t coln) const  {return fElements[(rown-fRowLwb)*fNcols+(coln-fColLwb)];} //fast acces
+#else
+  Float_t & UncheckedAt(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
+  Float_t   UncheckedAtFast(Int_t rown, Int_t coln) const  {return  (fIndex[coln])[rown];} //fast acces   
+#endif
+};
+
+AliTPCFastMatrix::AliTPCFastMatrix(Int_t rowlwb, Int_t rowupb, Int_t collwb, Int_t colupb):
+  TMatrix(rowlwb, rowupb,collwb,colupb)
+   {
+   };
 //_____________________________________________________________________________
 AliTPC::AliTPC()
 {
@@ -159,13 +109,15 @@ AliTPC::AliTPC()
   fHits     = 0;
   fDigits   = 0;
   fNsectors = 0;
-  //MI changes
   fDigitsArray = 0;
-  fClustersArray = 0;
-  fTPCParam=0;
-  fTrackHits = 0;  
-  fHitType = 2;  
-  fTPCParam = 0; 
+  fDefaults = 0;
+  fTrackHits = 0; 
+  fTrackHitsOld = 0;   
+  fHitType = 2; //default CONTAINERS - based on ROOT structure 
+  fTPCParam = 0;    
+  fNoiseTable = 0;
+  fActiveSectors =0;
+
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -179,17 +131,24 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //
   // Initialise arrays of hits and digits 
   fHits     = new TClonesArray("AliTPChit",  176);
-  gAlice->AddHitList(fHits);
-  //MI change  
+  gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits); 
   fDigitsArray = 0;
-  fClustersArray= 0;
+  fDefaults = 0;
   //
-  fTrackHits = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  fTrackHits = new AliTPCTrackHitsV2;  
   fTrackHits->SetHitPrecision(0.002);
   fTrackHits->SetStepPrecision(0.003);  
-  fTrackHits->SetMaxDistance(100); 
+  fTrackHits->SetMaxDistance(100);
+
+  fTrackHitsOld = new AliTPCTrackHits;  //MI - 13.09.2000
+  fTrackHitsOld->SetHitPrecision(0.002);
+  fTrackHitsOld->SetStepPrecision(0.003);  
+  fTrackHitsOld->SetMaxDistance(100); 
+
+  fNoiseTable =0;
 
   fHitType = 2;
+  fActiveSectors = 0;
   //
   // Initialise counters
   fNsectors = 0;
@@ -204,8 +163,9 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
   //  Set TPC parameters
   //
 
-  if (!strcmp(title,"Default")) {  
-     fTPCParam = new AliTPCParamSR;
+
+  if (!strcmp(title,"Default")) {       
+    fTPCParam = new AliTPCParamSR;
   } else {
     cerr<<"AliTPC warning: in Config.C you must set non-default parameters\n";
     fTPCParam=0;
@@ -214,6 +174,11 @@ AliTPC::AliTPC(const char *name, const char *title)
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
+AliTPC::AliTPC(const AliTPC& t):AliDetector(t){
+  //
+  // dummy copy constructor
+  //
+}
 AliTPC::~AliTPC()
 {
   //
@@ -225,6 +190,9 @@ AliTPC::~AliTPC()
   delete fDigits;
   delete fTPCParam;
   delete fTrackHits; //MI 15.09.2000
+  delete fTrackHitsOld; //MI 10.12.2001
+  if (fNoiseTable) delete [] fNoiseTable;
+
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -239,10 +207,10 @@ void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
     TClonesArray &lhits = *fHits;
     new(lhits[fNhits++]) AliTPChit(fIshunt,track,vol,hits);
   }
-  if (fHitType&2)
+  if (fHitType>1)
    AddHit2(track,vol,hits);
 }
+
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::BuildGeometry()
 {
@@ -329,7 +297,7 @@ void AliTPC::BuildGeometry()
 }    
 
 //_____________________________________________________________________________
-Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
+Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t ) const
 {
   //
   // Calculate distance from TPC to mouse on the display
@@ -338,12 +306,6 @@ Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
   return 9999;
 }
 
-void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This is a track finder.
-  //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCtracker::Clusters2Tracks(fTPCParam,of);
-}
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::CreateMaterials()
@@ -457,11 +419,11 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   // gases - mixtures, ID >= 20 pure gases, <= 10 ID < 20 -compounds
   //----------------------------------------------------------------
 
-  char namate[21]; 
+  char namate[21]=""
   density = 0.;
   Float_t am=0;
   Int_t nc;
-  Float_t rho,absl,X0,buf[1];
+  Float_t rho,absl,x0,buf[1];
   Int_t nbuf;
   Float_t a,z;
 
@@ -470,7 +432,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
     
       // retrive material constants
       
-      gMC->Gfmate((*fIdmate)[fMixtComp[nc]],namate,a,z,rho,X0,absl,buf,nbuf);
+      gMC->Gfmate((*fIdmate)[fMixtComp[nc]],namate,a,z,rho,x0,absl,buf,nbuf);
 
       amat[nc] = a;
       zmat[nc] = z;
@@ -593,7 +555,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   
   AliMixture(37, "Mylar",amat,zmat,density,-3,wmat); 
 
-  // G10 60% SiO2 + 40% epoxy, I use A and Z for SiO2
+  // SiO2 - used later for the glass fiber
 
   amat[0]=28.086;
   amat[1]=15.9994;
@@ -604,13 +566,8 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   wmat[0]=1.;
   wmat[1]=2.;
 
-  density = 1.7;
-
-  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz
-  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,X0,absl,buf,nbuf); 
 
-  AliMaterial(39,"G10",amat[0],zmat[0],density,999.,999.); 
+  AliMixture(38,"SiO2",amat,zmat,2.2,-2,wmat); //SiO2 - quartz (rho=2.2)
 
   // Al
 
@@ -624,7 +581,7 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   // Si
 
   amat[0] = 28.086;
-  zmat[0] = 14.,
+  zmat[0] = 14.;
 
   density = 2.33;
 
@@ -676,6 +633,58 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
 
   AliMixture(44,"Plexiglas",amat,zmat,density,-3,wmat);
 
+  // Epoxy - C14 H20 O3
+
+  
+  amat[0]=12.011;
+  amat[1]=1.;
+  amat[2]=15.9994;
+
+  zmat[0]=6.;
+  zmat[1]=1.;
+  zmat[2]=8.;
+
+  wmat[0]=14.;
+  wmat[1]=20.;
+  wmat[2]=3.;
+
+  density=1.25;
+
+  AliMixture(45,"Epoxy",amat,zmat,density,-3,wmat);
+
+  // Carbon
+
+  amat[0]=12.011;
+  zmat[0]=6.;
+  density= 2.265;
+
+  AliMaterial(46,"C",amat[0],zmat[0],density,999.,999.);
+
+  // get epoxy
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[45],namate,amat[1],zmat[1],rho,x0,absl,buf,nbuf);
+
+  // Carbon fiber
+
+  wmat[0]=0.644; // by weight!
+  wmat[1]=0.356;
+
+  density=0.5*(1.25+2.265);
+
+  AliMixture(47,"Cfiber",amat,zmat,density,2,wmat);
+
+  // get SiO2
+
+  gMC->Gfmate((*fIdmate)[38],namate,amat[0],zmat[0],rho,x0,absl,buf,nbuf); 
+
+  wmat[0]=0.725; // by weight!
+  wmat[1]=0.275;
+
+  density=1.7;
+
+  AliMixture(39,"G10",amat,zmat,density,2,wmat);
+
 
 
   //----------------------------------------------------------
@@ -701,457 +710,603 @@ void AliTPC::CreateMaterials()
   AliMedium(11,"Si",41,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
   AliMedium(12,"G10",39,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
   AliMedium(13,"Plexiglas",44,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
+  AliMedium(14,"Epoxy",45,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .0005, .001);
+  AliMedium(15,"Cfiber",47,0, iSXFLD, sXMGMX, 10., 999., .1, .001, .001);
     
 }
 
-
-void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of)
+void AliTPC::GenerNoise(Int_t tablesize)
 {
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // This is a simple cluster finder.
-  //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of);
+  //
+  //Generate table with noise
+  //
+  if (fTPCParam==0) {
+    // error message
+    fNoiseDepth=0;
+    return;
+  }
+  if (fNoiseTable)  delete[] fNoiseTable;
+  fNoiseTable = new Float_t[tablesize];
+  fNoiseDepth = tablesize; 
+  fCurrentNoise =0; //!index of the noise in  the noise table 
+  
+  Float_t norm = fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac();
+  for (Int_t i=0;i<tablesize;i++) fNoiseTable[i]= gRandom->Gaus(0,norm);      
 }
 
-extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
-extern Double_t SigmaZ2(Double_t, Double_t);
-//_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of)
+Float_t AliTPC::GetNoise()
 {
-  //--------------------------------------------------------
-  // TPC simple cluster generator from hits
-  // obtained from the TPC Fast Simulator
-  // The point errors are taken from the parametrization
-  //--------------------------------------------------------
+  // get noise from table
+  //  if ((fCurrentNoise%10)==0) 
+  //  fCurrentNoise= gRandom->Rndm()*fNoiseDepth;
+  if (fCurrentNoise>=fNoiseDepth) fCurrentNoise=0;
+  return fNoiseTable[fCurrentNoise++];
+  //gRandom->Gaus(0, fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
+}
 
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Adopted to Marian's cluster data structure by I.Belikov, CERN,
-  // Jouri.Belikov@cern.ch
-  //----------------------------------------------------------------
-  
-  /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-  //
-  //---------------------------------------------------------------------
-  //   ALICE TPC Cluster Parameters
-  //--------------------------------------------------------------------
-       
-  
 
-  // Cluster width in rphi
-  const Float_t kACrphi=0.18322;
-  const Float_t kBCrphi=0.59551e-3;
-  const Float_t kCCrphi=0.60952e-1;
-  // Cluster width in z
-  const Float_t kACz=0.19081;
-  const Float_t kBCz=0.55938e-3;
-  const Float_t kCCz=0.30428;
+Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec) const
+{
+  //
+  // check if the sector is active
+  if (!fActiveSectors) return kTRUE;
+  else return fActiveSectors[sec]; 
+}
 
-  TDirectory *savedir=gDirectory; 
+void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
+{
+  // activate interesting sectors
+  SetTreeAddress();//just for security
+  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
+  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
+  for (Int_t i=0;i<n;i++) 
+    if ((sectors[i]>=0) && sectors[i]<fTPCParam->GetNSector())  fActiveSectors[sectors[i]]=kTRUE;
+    
+}
 
-  if (!of->IsOpen()) {
-     cerr<<"AliTPC::Hits2Clusters(): output file not open !\n";
-     return;
+void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
+{
+  //
+  // activate sectors which were hitted by tracks 
+  //loop over tracks
+  SetTreeAddress();//just for security
+  if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
+  if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
+  fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
+  if (flag) {
+    for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kTRUE;
+    return;
   }
-
-   if(fTPCParam == 0){
-     printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
+  for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
+  TBranch * branch=0;
+  if (TreeH() == 0x0)
+   {
+     Fatal("SetActiveSectors","Can not find TreeH in folder");
      return;
    }
-
-  Float_t sigmaRphi,sigmaZ,clRphi,clZ;
-  //
-  TParticle *particle; // pointer to a given particle
-  AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  Int_t sector;
-  Int_t ipart;
-  Float_t xyz[5];
-  Float_t pl,pt,tanth,rpad,ratio;
-  Float_t cph,sph;
-  
-  //---------------------------------------------------------------
-  //  Get the access to the tracks 
-  //---------------------------------------------------------------
+  if (fHitType>1) branch = TreeH()->GetBranch("TPC2");
+  else branch = TreeH()->GetBranch("TPC");
+  Stat_t ntracks = TreeH()->GetEntries();
+  // loop over all hits
+  if (GetDebug()) cout<<"\nAliTPC::SetActiveSectors():  Got "<<ntracks<<" tracks\n";
   
-  TTree *tH = gAlice->TreeH();
-  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++)
+   {
+    ResetHits();
+    //
+    if (fTrackHits && fHitType&4) {
+      TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+      TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");
+      br1->GetEvent(track);
+      br2->GetEvent(track);
+      Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
+      for (Int_t j=0;j<fTrackHits->GetNVolumes(); j++)
+       fActiveSectors[volumes[j]]=kTRUE;
+    }
+    
+    //
+    if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+      TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+      br->GetEvent(track);
+      AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+       fActiveSectors[((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID] =kTRUE;
+      } 
+    }    
+  }
+}  
 
-  //Switch to the output file
-  of->cd();
 
-  fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
-  AliTPCClustersArray carray;
-  carray.Setup(fTPCParam);
-  carray.SetClusterType("AliTPCcluster");
-  carray.MakeTree();
 
-  Int_t nclusters=0; //cluster counter
-  
-  //------------------------------------------------------------
-  // Loop over all sectors (72 sectors for 20 deg
-  // segmentation for both lower and upper sectors)
-  // Sectors 0-35 are lower sectors, 0-17 z>0, 17-35 z<0
-  // Sectors 36-71 are upper sectors, 36-53 z>0, 54-71 z<0
-  //
-  // First cluster for sector 0 starts at "0"
-  //------------------------------------------------------------
-   
-  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++){
-    //MI change
-    fTPCParam->AdjustCosSin(isec,cph,sph);
-    
-    //------------------------------------------------------------
-    // Loop over tracks
-    //------------------------------------------------------------
-    
-    for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
-      ResetHits();
-      tH->GetEvent(track);
-      //
-      //  Get number of the TPC hits
-      //
-      // nhits=fHits->GetEntriesFast();
-      //
-     
-       tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit(-1);
 
-      // Loop over hits
-      //
-       //   for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-       //tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-
-       while(tpcHit){
-        if (tpcHit->fQ == 0.) {
-           tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
-           continue; //information about track (I.Belikov)
-        }
-       sector=tpcHit->fSector; // sector number
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTPC::Digits2Raw()
+{
+// convert digits of the current event to raw data
 
+  static const Int_t kThreshold = 0;
+  static const Bool_t kCompress = kTRUE;
 
-       //      if(sector != isec) continue; //terminate iteration
+  fLoader->LoadDigits();
+  TTree* digits = fLoader->TreeD();
+  if (!digits) {
+    Error("Digits2Raw", "no digits tree");
+    return;
+  }
 
-       if(sector != isec){
-        tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
-        continue; 
-       }
-       ipart=tpcHit->Track();
-       particle=gAlice->Particle(ipart);
-       pl=particle->Pz();
-       pt=particle->Pt();
-       if(pt < 1.e-9) pt=1.e-9;
-       tanth=pl/pt;
-       tanth = TMath::Abs(tanth);
-       rpad=TMath::Sqrt(tpcHit->X()*tpcHit->X() + tpcHit->Y()*tpcHit->Y());
-       ratio=0.001*rpad/pt; // pt must be in MeV/c - historical reason
-
-       //   space-point resolutions
-       
-       sigmaRphi=SigmaY2(rpad,tanth,pt);
-       sigmaZ   =SigmaZ2(rpad,tanth   );
-       
-       //   cluster widths
-       
-       clRphi=kACrphi-kBCrphi*rpad*tanth+kCCrphi*ratio*ratio;
-       clZ=kACz-kBCz*rpad*tanth+kCCz*tanth*tanth;
-       
-       // temporary protection
-       
-       if(sigmaRphi < 0.) sigmaRphi=0.4e-3;
-       if(sigmaZ < 0.) sigmaZ=0.4e-3;
-       if(clRphi < 0.) clRphi=2.5e-3;
-       if(clZ < 0.) clZ=2.5e-5;
-       
-       //
-       
-       //
-       // smearing --> rotate to the 1 (13) or to the 25 (49) sector,
-       // then the inaccuracy in a X-Y plane is only along Y (pad row)!
-       //
-        Float_t xprim= tpcHit->X()*cph + tpcHit->Y()*sph;
-       Float_t yprim=-tpcHit->X()*sph + tpcHit->Y()*cph;
-       xyz[0]=gRandom->Gaus(yprim,TMath::Sqrt(sigmaRphi));   // y
-          Float_t alpha=(isec < fTPCParam->GetNInnerSector()) ?
-         fTPCParam->GetInnerAngle() : fTPCParam->GetOuterAngle();
-          Float_t ymax=xprim*TMath::Tan(0.5*alpha);
-          if (TMath::Abs(xyz[0])>ymax) xyz[0]=yprim; 
-       xyz[1]=gRandom->Gaus(tpcHit->Z(),TMath::Sqrt(sigmaZ)); // z
-          if (TMath::Abs(xyz[1])>fTPCParam->GetZLength()) xyz[1]=tpcHit->Z(); 
-       xyz[2]=sigmaRphi;                                     // fSigmaY2
-       xyz[3]=sigmaZ;                                        // fSigmaZ2
-       xyz[4]=tpcHit->fQ;                                    // q
-
-        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(sector,tpcHit->fPadRow);
-        if (!clrow) clrow=carray.CreateRow(sector,tpcHit->fPadRow);    
-
-        Int_t tracks[3]={tpcHit->Track(), -1, -1};
-       AliTPCcluster cluster(tracks,xyz);
-
-        clrow->InsertCluster(&cluster); nclusters++;
+  AliSimDigits digarr;
+  AliSimDigits* digrow = &digarr;
+  digits->GetBranch("Segment")->SetAddress(&digrow);
+
+  const char* fileName = "AliTPCDDL.dat";
+  AliTPCBuffer* buffer  = new AliTPCBuffer(fileName);
+  //Verbose level
+  // 0: Silent
+  // 1: cout messages
+  // 2: txt files with digits 
+  //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
+  //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
+  //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
+  //quickly several MB wasting time and disk space.
+  buffer->SetVerbose(0);
+
+  Int_t nEntries = Int_t(digits->GetEntries());
+  Int_t previousSector = -1;
+  Int_t subSector = 0;
+  for (Int_t i = 0; i < nEntries; i++) {
+    digits->GetEntry(i);
+    Int_t sector, row;
+    fTPCParam->AdjustSectorRow(digarr.GetID(), sector, row);
+    if(previousSector != sector) {
+      subSector = 0;
+      previousSector = sector;
+    }
 
-        tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
-        
+    if (sector < 36) { //inner sector [0;35]
+      if (row != 30) {
+       //the whole row is written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 0, 0, 0, 
+                              sector, subSector, row);
+      } else {
+       //only the pads in the range [37;48] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 37, 48, 1, 
+                              sector, subSector, row);
+       subSector = 1;
+       //only the pads outside the range [37;48] are written into the output file
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 37, 48, 2, 
+                              sector, subSector, row);
+      }//end else
+
+    } else { //outer sector [36;71]
+      if (row == 54) subSector = 2;
+      if ((row != 27) && (row != 76)) {
+       buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 0, 0, 0,
+                              sector, subSector, row);
+      } else if (row == 27) {
+         //only the pads outside the range [43;46] are written into the output file
+         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 43, 46, 2,
+                                sector, subSector, row);
+         subSector = 1;
+         //only the pads in the range [43;46] are written into the output file
+         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 43, 46, 1,
+                                sector, subSector, row);
+      } else if (row == 76) {
+         //only the pads outside the range [33;88] are written into the output file
+         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 33, 88, 2,
+                                sector, subSector, row);
+         subSector = 3;
+         //only the pads in the range [33;88] are written into the output file
+         buffer->WriteRowBinary(kThreshold, digrow, 33, 88, 1,
+                                sector, subSector, row);
+      }
+    }//end else
+  }//end for
 
-      } // end of loop over hits
+  delete buffer;
+  fLoader->UnloadDigits();
 
-    }   // end of loop over tracks
+  AliTPCDDLRawData rawWriter;
+  rawWriter.SetVerbose(0);
 
-    Int_t nrows=fTPCParam->GetNRow(isec);
-    for (Int_t irow=0; irow<nrows; irow++) {
-        AliTPCClustersRow *clrow=carray.GetRow(isec,irow);
-        if (!clrow) continue;
-        carray.StoreRow(isec,irow);
-        carray.ClearRow(isec,irow);
-    }
+  rawWriter.RawData(fileName);
+  gSystem->Unlink(fileName);
 
-  } // end of loop over sectors  
+  if (kCompress) {
+    Info("Digits2Raw", "compressing raw data");
+    rawWriter.RawDataCompDecompress(kTRUE);
+    gSystem->Unlink("Statistics");
+  }
+}
 
-  cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
 
-  carray.GetTree()->Write();
 
-  savedir->cd(); //switch back to the input file
+//______________________________________________________________________
+AliDigitizer* AliTPC::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
+{
+  return new AliTPCDigitizer(manager);
+}
+//__
+void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t /*eventnumber*/)  
+{
+  //create digits from summable digits
+  GenerNoise(500000); //create teble with noise
+
+  //conect tree with sSDigits
+  TTree *t = fLoader->TreeS();
+
+  if (t == 0x0) 
+   {
+     fLoader->LoadSDigits("READ");
+     t = fLoader->TreeS();
+     if (t == 0x0)
+      {
+        Error("SDigits2Digits2","Can not get input TreeS");
+        return;
+      }
+   }
   
-} // end of function
+  if (fLoader->TreeD() == 0x0) fLoader->MakeTree("D");
+  
+  AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
+  TBranch* sdb = t->GetBranch("Segment");
+  if (sdb == 0x0)
+   {
+     Error("SDigits2Digits2","Can not find branch with segments in TreeS.");
+     return;
+   }  
 
-//_________________________________________________________________
-void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
-{
-  //--------------------------------------------------------
-  //calculate exact cross point of track and given pad row
-  //resulting values are expressed in "digit" coordinata
-  //--------------------------------------------------------
+  sdb->SetAddress(&dummy);
+      
+  Stat_t nentries = t->GetEntries();
 
-  //-----------------------------------------------------------------
-  // Origin: Marian Ivanov  GSI Darmstadt, m.ivanov@gsi.de
-  //-----------------------------------------------------------------
-  //
-  if (fClustersArray==0){    
-    return;
-  }
-  //
-  TParticle *particle; // pointer to a given particle
-  AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit
-  Int_t sector,nhits;
-  Int_t ipart;
-  const Int_t kcmaxhits=30000;
-  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
-  TVector & xxx = *xxxx;
-  Int_t maxhits = kcmaxhits;
-  //construct array for each padrow
-  for (Int_t i=0; i<fTPCParam->GetNRow(isec);i++) 
-    fClustersArray->CreateRow(isec,i);
+  // set zero suppression
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(2);
+
+  // get zero suppression
+
+  Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
+
+  //make tree with digits 
   
-  //---------------------------------------------------------------
-  //  Get the access to the tracks 
-  //---------------------------------------------------------------
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeD());
   
-  TTree *tH = gAlice->TreeH();
-  Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
-  Int_t npart = gAlice->GetNtrack();
+  AliTPCParam * par = fTPCParam;
+
+  //Loop over segments of the TPC
+
+  for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
+    t->GetEvent(n);
+    Int_t sec, row;
+    if (!par->AdjustSectorRow(digarr.GetID(),sec,row)) {
+      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
+      continue;
+    }
+    if (!IsSectorActive(sec)) 
+     {
+//       cout<<n<<" NOT Active \n";
+       continue;
+     }
+    else
+     {
+//       cout<<n<<" Active \n";
+     }
+    AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
+    Int_t nrows = digrow->GetNRows();
+    Int_t ncols = digrow->GetNCols();
+
+    digrow->ExpandBuffer();
+    digarr.ExpandBuffer();
+    digrow->ExpandTrackBuffer();
+    digarr.ExpandTrackBuffer();
+
     
-  //------------------------------------------------------------
-  // Loop over tracks
-  //------------------------------------------------------------
-  
-  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
-    ResetHits();
-    tH->GetEvent(track);
-    //
-    //  Get number of the TPC hits and a pointer
-    //  to the particles
-    //
-    nhits=fHits->GetEntriesFast();
-    //
-    // Loop over hits
-    //
-    Int_t currentIndex=0;
-    Int_t lastrow=-1;  //last writen row
-    for(Int_t hit=0;hit<nhits;hit++){
-      tpcHit=(AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(hit);
-      if (tpcHit==0) continue;
-      sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      if(sector != isec) continue; 
-      ipart=tpcHit->Track();
-      if (ipart<npart) particle=gAlice->Particle(ipart);
-      
-      //find row number
-
-      Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
-      Int_t    index[3]={1,isec,0};
-      Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;    
-      if (currentrow<0) continue;
-      if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
-      if (currentrow==lastrow){
-       if ( currentIndex>=maxhits){
-         maxhits+=kcmaxhits;
-         xxx.ResizeTo(4*maxhits);
-       }     
-       xxx(currentIndex*4)=x[0];
-       xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
-       xxx(currentIndex*4+2)=x[2];     
-       xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
-       currentIndex++; 
+    Short_t * pamp0 = digarr.GetDigits();
+    Int_t   * ptracks0 = digarr.GetTracks();
+    Short_t * pamp1 = digrow->GetDigits();
+    Int_t   * ptracks1 = digrow->GetTracks();
+    Int_t  nelems =nrows*ncols;
+    Int_t saturation = fTPCParam->GetADCSat();
+    //use internal structure of the AliDigits - for speed reason
+    //if you cahnge implementation
+    //of the Alidigits - it must be rewriten -
+    for (Int_t i= 0; i<nelems; i++){
+      //      Float_t q = *pamp0;
+      //q/=16.;  //conversion faktor
+      //Float_t noise= GetNoise(); 
+      //q+=noise;      
+      //q= TMath::Nint(q);
+      Float_t q = TMath::Nint(Float_t(*pamp0)/16.+GetNoise());
+      if (q>zerosup){
+       if (q>saturation) q=saturation;      
+       *pamp1=(Short_t)q;
+       //if (ptracks0[0]==0)
+       //  ptracks1[0]=1;
+       //else
+       ptracks1[0]=ptracks0[0];        
+       ptracks1[nelems]=ptracks0[nelems];
+       ptracks1[2*nelems]=ptracks0[2*nelems];
       }
-      else 
-       if (currentIndex>2){
-         Float_t sumx=0;
-         Float_t sumx2=0;
-         Float_t sumx3=0;
-         Float_t sumx4=0;
-         Float_t sumy=0;
-         Float_t sumxy=0;
-         Float_t sumx2y=0;
-         Float_t sumz=0;
-         Float_t sumxz=0;
-         Float_t sumx2z=0;
-         Float_t sumq=0;
-         for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
-           Float_t x,x2,x3,x4;
-           x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
-           x2*=x;
-           x3*=x2;
-           x4*=x3;
-           sumx+=x;
-           sumx2+=x2;
-           sumx3+=x3;
-           sumx4+=x4;
-           sumy+=xxx(index*4+1);
-           sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
-           sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
-           sumz+=xxx(index*4+2);
-           sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
-           sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;   
-           sumq+=xxx(index*4+3);
-         }
-         Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(isec,lastrow)-1)/2;
-         Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-           sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
-         
-         Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
-           sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
-         Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
-           sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
-         
-         Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-           sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
-         Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-           sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
-         
-         Float_t y=detay/det+centralPad;
-         Float_t z=detaz/det;  
-         Float_t by=detby/det; //y angle
-         Float_t bz=detbz/det; //z angle
-         sumy/=Float_t(currentIndex);
-         sumz/=Float_t(currentIndex);
-         AliComplexCluster cl;
-         cl.fX=z;
-         cl.fY=y;
-         cl.fQ=sumq;
-         cl.fSigmaX2=bz;
-         cl.fSigmaY2=by;
-         cl.fTracks[0]=ipart;
-         
-         AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(isec,lastrow));
-         if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
-         currentIndex=0;
-         lastrow=currentrow;
-       } //end of calculating cluster for given row
-       
-       
-       
-    } // end of loop over hits
-  }   // end of loop over tracks 
-  //write padrows to tree 
-  for (Int_t ii=0; ii<fTPCParam->GetNRow(isec);ii++) {
-    fClustersArray->StoreRow(isec,ii);    
-    fClustersArray->ClearRow(isec,ii);        
-  }
-  xxxx->Delete();
+      pamp0++;
+      pamp1++;
+      ptracks0++;
+      ptracks1++;       
+    }
+
+    arr->StoreRow(sec,row);
+    arr->ClearRow(sec,row);   
+    // cerr<<sec<<"\t"<<row<<"\n";   
+  }  
+
+    
+  //write results
+  fLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
+   
+  delete arr;
 }
-//___________________________________________
-void AliTPC::SDigits2Digits()
-{
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::SetDefaults(){
+  //
+  // setting the defaults
+  //
+   
+  //   cerr<<"Setting default parameters...\n";
+
+  // Set response functions
+
+  //
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::GetRunLoaderName());
+  rl->CdGAFile();
   AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
+  if(param){
+    printf("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...\n");
+    delete param;
+    param = new AliTPCParamSR();
+  }
+  else {
+    param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60_150x60");
+  }
+  if(!param){
+    printf("No TPC parameters found\n");
+    exit(4);
+  }
+
+
   AliTPCPRF2D    * prfinner   = new AliTPCPRF2D;
-  AliTPCPRF2D    * prfouter   = new AliTPCPRF2D;
+  AliTPCPRF2D    * prfouter1   = new AliTPCPRF2D;
+  AliTPCPRF2D    * prfouter2   = new AliTPCPRF2D;  
   AliTPCRF1D     * rf    = new AliTPCRF1D(kTRUE);
-
-  TDirectory *cwd = gDirectory;
   rf->SetGauss(param->GetZSigma(),param->GetZWidth(),1.);
   rf->SetOffset(3*param->GetZSigma());
   rf->Update();
+  
+  TDirectory *savedir=gDirectory;
   TFile *f=TFile::Open("$ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root");
   if (!f->IsOpen()) { 
-     cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n";
+    cerr<<"Can't open $ALICE_ROOT/TPC/AliTPCprf2d.root !\n" ;
      exit(3);
   }
+
+  TString s;
   prfinner->Read("prf_07504_Gati_056068_d02");
-  prfouter->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
+  //PH Set different names
+  s=prfinner->GetGRF()->GetName();
+  s+="in";
+  prfinner->GetGRF()->SetName(s.Data());
+
+  prfouter1->Read("prf_10006_Gati_047051_d03");
+  s=prfouter1->GetGRF()->GetName();
+  s+="out1";
+  prfouter1->GetGRF()->SetName(s.Data());
+
+  prfouter2->Read("prf_15006_Gati_047051_d03");  
+  s=prfouter2->GetGRF()->GetName();
+  s+="out2";
+  prfouter2->GetGRF()->SetName(s.Data());
+
   f->Close();
-  cwd->cd();
-  
+  savedir->cd();
+
   param->SetInnerPRF(prfinner);
-  param->SetOuterPRF(prfouter); 
+  param->SetOuter1PRF(prfouter1); 
+  param->SetOuter2PRF(prfouter2);
   param->SetTimeRF(rf);
 
+  // set fTPCParam
+
   SetParam(param);
 
-  cerr<<"Digitizing TPC...\n";
+
+  fDefaults = 1;
+
+}
+//__________________________________________________________________  
+void AliTPC::Hits2Digits()  
+{
+  //
+  // creates digits from hits
+  //
+
+  fLoader->LoadHits("read");
+  fLoader->LoadDigits("recreate");
+  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    SetActiveSectors();   
+    Hits2Digits(iEvent);
+  }
+
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadDigits();
+} 
+//__________________________________________________________________  
+void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)  
+{ 
+ //----------------------------------------------------
+ // Loop over all sectors for a single event
+ //----------------------------------------------------
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::GetRunLoaderName());
+  rl->GetEvent(eventnumber);
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
+   {
+     if(fLoader->LoadHits())
+      {
+        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
+      }
+   }
+  SetTreeAddress();
+  
+  if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) 
+   {
+     fLoader->MakeTree("D");
+     if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) 
+      {
+       Error("Hits2Digits","Can not get TreeD");
+       return;
+      }
+   }
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
+  GenerNoise(500000); //create teble with noise
 
   //setup TPCDigitsArray 
+
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
-  arr->Setup(param);
-  SetParam(param);
-  arr->MakeTree(fDigitsFile);
+  arr->Setup(fTPCParam);
 
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeD());
   SetDigitsArray(arr);
 
-  Hits2Digits();
-   
-  // Hits2DigitsSector(1);         
-  // Hits2DigitsSector(2);             
-  // Hits2DigitsSector(3);             
-  // Hits2DigitsSector(1+18);             
-  // Hits2DigitsSector(2+18);             
-  // Hits2DigitsSector(3+18);             
-
-  // Hits2DigitsSector(36+1);             
-  // Hits2DigitsSector(36+2);             
-  // Hits2DigitsSector(36+3);             
-  // Hits2DigitsSector(36+1+18);             
-  // Hits2DigitsSector(36+2+18);             
-  // Hits2DigitsSector(36+3+18); 
-     
-  //write results
+  fDigitsSwitch=0; // standard digits
+
+  //  cerr<<"Digitizing TPC -- normal digits...\n";
 
-  char treeName[100];
-  sprintf(treeName,"TreeD_%s",param->GetTitle());
-  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName,TObject::kOverwrite);
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
+  if (IsSectorActive(isec)) 
+   {
+    if (fDebug) Info("Hits2Digits","Sector %d is active.",isec);
+    Hits2DigitsSector(isec);
+   }
+  else
+   {
+    if (fDebug) Info("Hits2Digits","Sector %d is NOT active.",isec);
+   }
+
+  fLoader->WriteDigits("OVERWRITE"); 
+  
+//this line prevents the crash in the similar one
+//on the beginning of this method
+//destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
+//need to be redesign
+ if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+ SetDigitsArray(0x0);
+  
 }
 
-//__________________________________________________________________  
-void AliTPC::Hits2Digits()  
+//__________________________________________________________________
+void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)  
 { 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
+
  //----------------------------------------------------
- // Loop over all sectors
+ // Loop over all sectors for a single event
  //----------------------------------------------------
+//  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+
+  AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
+
+  rl->GetEvent(eventnumber);
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
+   {
+     if(fLoader->LoadHits())
+      {
+        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
+        return;
+      }
+   }
+  SetTreeAddress();
 
-  if(fTPCParam == 0){
-    printf("AliTPCParam MUST be created firstly\n");
-    return;
-  } 
 
- for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) Hits2DigitsSector(isec);
+  if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) 
+   {
+     fLoader->MakeTree("S");
+   }
+  
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+  
+  GenerNoise(500000); //create table with noise
+  //setup TPCDigitsArray 
 
+  if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+
+  
+  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
+  arr->SetClass("AliSimDigits");
+  arr->Setup(fTPCParam);
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeS());
+
+  SetDigitsArray(arr);
+
+  //  cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
+
+  fDigitsSwitch=1; // summable digits
+  
+    // set zero suppression to "0"
+
+  fTPCParam->SetZeroSup(0);
+
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
+  if (IsSectorActive(isec)) 
+   {
+//    cout<<"Sector "<<isec<<" is active\n";
+    Hits2DigitsSector(isec);
+   }
+
+ fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
+
+//this line prevents the crash in the similar one
+//on the beginning of this method
+//destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
+//need to be redesign
+ if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+ SetDigitsArray(0x0);
 }
+//__________________________________________________________________
+
+void AliTPC::Hits2SDigits()  
+{ 
+
+  //-----------------------------------------------------------
+  //   summable digits - 16 bit "ADC", no noise, no saturation
+  //-----------------------------------------------------------
 
+  fLoader->LoadHits("read");
+  fLoader->LoadSDigits("recreate");
+  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader(); 
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    SetTreeAddress();
+    SetActiveSectors();
+    Hits2SDigits2(iEvent);
+  }
 
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadSDigits();
+}
 //_____________________________________________________________________________
+
 void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 {
   //-------------------------------------------------------------------
@@ -1166,8 +1321,18 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
   //  Get the access to the track hits
   //-------------------------------------------------------
 
+  // check if the parameters are set - important if one calls this method
+  // directly, not from the Hits2Digits
+
+  if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+
+  TTree *tH = TreeH(); // pointer to the hits tree
+  if (tH == 0x0)
+   {
+     Fatal("Hits2DigitsSector","Can not find TreeH in folder");
+     return;
+   }
 
-  TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
 
   if( ntracks > 0){
@@ -1178,24 +1343,27 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
     TObjArray **row;
     
-      printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
+    //printf("*** Processing sector number %d ***\n",isec);
 
       Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
 
-      row= new TObjArray* [nrows];
+      row= new TObjArray* [nrows+2]; // 2 extra rows for cross talk
     
       MakeSector(isec,nrows,tH,ntracks,row);
 
       //--------------------------------------------------------
       //   Digitize this sector, row by row
-      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of TVectors,
+      //   row[i] is the pointer to the TObjArray of AliTPCFastVectors,
       //   each one containing electrons accepted on this
       //   row, assigned into tracks
       //--------------------------------------------------------
 
       Int_t i;
 
-      if (fDigitsArray->GetTree()==0) fDigitsArray->MakeTree(fDigitsFile);
+      if (fDigitsArray->GetTree()==0) 
+       {
+         Fatal("Hits2DigitsSector","Tree not set in fDigitsArray");
+       }
 
       for (i=0;i<nrows;i++){
 
@@ -1206,15 +1374,16 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
        fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
        Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
-       printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);
        
+       if (gDebug > 10) 
+       printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
+       
         fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
 
    
        } // end of the sector digitization
 
-      for(i=0;i<nrows;i++){
+      for(i=0;i<nrows+2;i++){
         row[i]->Delete();  
         delete row[i];   
       }
@@ -1241,7 +1410,7 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
  
 
   Float_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
-  Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
+  //  Int_t nrows =fTPCParam->GetNRow(isec);
   fCurrentIndex[1]= isec;
   
 
@@ -1252,10 +1421,11 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //  Integrated signal for this row
   //  and a single track signal
   //    
-  TMatrix *m1   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
-  TMatrix *m2   = new TMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
+
+  AliTPCFastMatrix *m1 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // integrated
+  AliTPCFastMatrix *m2 = new AliTPCFastMatrix(0,nofPads,0,nofTbins); // single
   //
-  TMatrix &total  = *m1;
+  AliTPCFastMatrix &total  = *m1;
 
   //  Array of pointers to the label-signal list
 
@@ -1268,14 +1438,16 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   //
   //calculate signal 
   //
-  Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
-  Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
+  //Int_t row1 = TMath::Max(irow-fTPCParam->GetNCrossRows(),0);
+  //Int_t row2 = TMath::Min(irow+fTPCParam->GetNCrossRows(),nrows-1);
+  Int_t row1=irow;
+  Int_t row2=irow+2; 
   for (Int_t row= row1;row<=row2;row++){
     Int_t nTracks= rows[row]->GetEntries();
     for (i1=0;i1<nTracks;i1++){
       fCurrentIndex[2]= row;
-      fCurrentIndex[3]=irow;
-      if (row==irow){
+      fCurrentIndex[3]=irow+1;
+      if (row==irow+1){
        m2->Zero();  // clear single track signal matrix
        Float_t trackLabel = GetSignal(rows[row],i1,m2,m1,indexRange); 
        GetList(trackLabel,nofPads,m2,indexRange,pList);
@@ -1287,26 +1459,35 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
   Int_t tracks[3];
 
   AliDigits *dig = fDigitsArray->GetRow(isec,irow);
-  for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
-    for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
-
-      Float_t q = total(ip,it);
+  Int_t gi=-1;
+  Float_t fzerosup = zerosup+0.5;
+  for(Int_t it=0;it<nofTbins;it++){
+    Float_t *pq = &(total.UncheckedAt(0,it));
+    for(Int_t ip=0;ip<nofPads;ip++){
+      gi++;
+      Float_t q=*pq;      
+      pq++;
+      if(fDigitsSwitch == 0){
+       q+=GetNoise();
+        if(q <=fzerosup) continue; // do not fill zeros
+        q = TMath::Nint(q);
+        if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
 
-      Int_t gi =it*nofPads+ip; // global index
-
-      q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()); 
-
-      q = (Int_t)q;
+      }
 
-      if(q <=zerosup) continue; // do not fill zeros
-      if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();  // saturation
+      else {
+       if(q <= 0.) continue; // do not fill zeros
+       if(q>2000.) q=2000.;
+       q *= 16.;
+       q = TMath::Nint(q);
+      }
 
       //
       //  "real" signal or electronic noise (list = -1)?
       //    
 
       for(Int_t j1=0;j1<3;j1++){
-        tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -1;
+       tracks[j1] = (pList[gi]) ?(Int_t)(*(pList[gi]+j1)) : -2;
       }
 
 //Begin_Html
@@ -1345,8 +1526,8 @@ void AliTPC::DigitizeRow(Int_t irow,Int_t isec,TObjArray **rows)
 
 //_____________________________________________________________________________
 
-Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
-                          Int_t *indexRange)
+Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, 
+             AliTPCFastMatrix *m1, AliTPCFastMatrix *m2,Int_t *indexRange)
 {
 
   //---------------------------------------------------------------
@@ -1360,13 +1541,13 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   // Modified: Marian Ivanov 
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  TVector *tv;
-  tv = (TVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
-  TVector &v = *tv;
+  AliTPCFastVector *tv;
+
+  tv = (AliTPCFastVector*)p1->At(ntr); // pointer to a track
+  AliTPCFastVector &v = *tv;
   
   Float_t label = v(0);
-  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3])-1)/2;
+  Int_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]-1)-1)/2;
 
   Int_t nElectrons = (tv->GetNrows()-1)/4;
   indexRange[0]=9999; // min pad
@@ -1374,10 +1555,8 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
   indexRange[2]=9999; //min time
   indexRange[3]=-1; // max time
 
-  //  Float_t IneffFactor = 0.5; // inefficiency in the gain close to the edge, as above
-
-  TMatrix &signal = *m1;
-  TMatrix &total = *m2;
+  AliTPCFastMatrix &signal = *m1;
+  AliTPCFastMatrix &total = *m2;
   //
   //  Loop over all electrons
   //
@@ -1386,22 +1565,28 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
     Float_t aval =  v(idx+4);
     Float_t eltoadcfac=aval*fTPCParam->GetTotalNormFac(); 
     Float_t xyz[3]={v(idx+1),v(idx+2),v(idx+3)};
-    Int_t n = fTPCParam->CalcResponse(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
-    
-    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){
-       Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(i);        
+    Int_t n = ((AliTPCParamSR*)fTPCParam)->CalcResponseFast(xyz,fCurrentIndex,fCurrentIndex[3]);
+
+    Int_t *index = fTPCParam->GetResBin(0);  
+    Float_t *weight = & (fTPCParam->GetResWeight(0));
+
+    if (n>0) for (Int_t i =0; i<n; i++){       
        Int_t pad=index[1]+centralPad;  //in digit coordinates central pad has coordinate 0
-       if ( ( pad<(fTPCParam->GetNPads(fCurrentIndex[1],fCurrentIndex[3]))) && (pad>0)) {
+
+         if (pad>=0){
         Int_t time=index[2];    
-        Float_t weight = fTPCParam->GetResWeight(i); //we normalise response to ADC channel
-        weight *= eltoadcfac;
+         Float_t qweight = *(weight)*eltoadcfac;
         
-        if (m1!=0) signal(pad,time)+=weight; 
-        total(pad,time)+=weight;
-        indexRange[0]=TMath::Min(indexRange[0],pad);
-        indexRange[1]=TMath::Max(indexRange[1],pad);
-        indexRange[2]=TMath::Min(indexRange[2],time);
-        indexRange[3]=TMath::Max(indexRange[3],time); 
+        if (m1!=0) signal.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
+         total.UncheckedAt(pad,time)+=qweight;
+        if (indexRange[0]>pad) indexRange[0]=pad;
+        if (indexRange[1]<pad) indexRange[1]=pad;
+        if (indexRange[2]>time) indexRange[2]=time;
+        if (indexRange[3]<time) indexRange[3]=time;
+
+        index+=3;
+        weight++;      
+
        }        
     }
   } // end of loop over electrons
@@ -1410,8 +1595,8 @@ Float_t AliTPC::GetSignal(TObjArray *p1, Int_t ntr, TMatrix *m1, TMatrix *m2,
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
-                     Float_t **pList)
+void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,AliTPCFastMatrix *m,
+                     Int_t *indexRange, Float_t **pList)
 {
   //----------------------------------------------------------------------
   //  Updates the list of tracks contributing to digits for a given row
@@ -1421,7 +1606,7 @@ void AliTPC::GetList(Float_t label,Int_t np,TMatrix *m,Int_t *indexRange,
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
 
-  TMatrix &signal = *m;
+  AliTPCFastMatrix &signal = *m;
 
   // lop over nonzero digits
 
@@ -1523,19 +1708,20 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   AliTPChit *tpcHit; // pointer to a sigle TPC hit    
   //MI change
   TBranch * branch=0;
-  if (fHitType&2) branch = TH->GetBranch("TPC2");
+  if (fHitType>1) branch = TH->GetBranch("TPC2");
   else branch = TH->GetBranch("TPC");
 
  
   //----------------------------------------------
   // Create TObjArray-s, one for each row,
-  // each TObjArray will store the TVectors
-  // of electrons, one TVector per each track.
+  // each TObjArray will store the AliTPCFastVectors
+  // of electrons, one AliTPCFastVectors per each track.
   //---------------------------------------------- 
     
-  Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows]; // electron counter for each row
-  TVector **tracks = new TVector* [nrows]; //pointers to the track vectors
-  for(i=0; i<nrows; i++){
+  Int_t *nofElectrons = new Int_t [nrows+2]; // electron counter for each row
+  AliTPCFastVector **tracks = new AliTPCFastVector* [nrows+2]; //pointers to the track vectors
+
+  for(i=0; i<nrows+2; i++){
     row[i] = new TObjArray;
     nofElectrons[i]=0;
     tracks[i]=0;
@@ -1553,16 +1739,7 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
   for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
     Bool_t isInSector=kTRUE;
     ResetHits();
-
-    if (fHitType&2) {
-      isInSector=kFALSE;
-      TBranch * br = TH->GetBranch("fTrackHitsInfo");
-      br->GetEvent(track);
-      AliObjectArray * ar = fTrackHits->fTrackHitsInfo;
-      for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
-       if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==isec) isInSector=kTRUE;
-      }
-    }
+    isInSector = TrackInVolume(isec,track);
     if (!isInSector) continue;
     //MI change
     branch->GetEntry(track); // get next track
@@ -1579,7 +1756,6 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     while(tpcHit){
       
       Int_t sector=tpcHit->fSector; // sector number
-      //      if(sector != isec) continue; 
       if(sector != isec){
        tpcHit = (AliTPChit*) NextHit();
        continue; 
@@ -1592,22 +1768,22 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
                           
            // store already filled fTrack
               
-          for(i=0;i<nrows;i++){
+          for(i=0;i<nrows+2;i++){
              if(previousTrack != -1){
               if(nofElectrons[i]>0){
-                TVector &v = *tracks[i];
+                 AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
                 v(0) = previousTrack;
                  tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
                 row[i]->Add(tracks[i]);                     
               }
                else{
-                 delete tracks[i]; // delete empty TVector
+                 delete tracks[i]; // delete empty AliTPCFastVector
                  tracks[i]=0;
               }
             }
 
              nofElectrons[i]=0;
-             tracks[i] = new TVector(481); // TVectors for the next fTrack
+             tracks[i] = new AliTPCFastVector(481); // AliTPCFastVectors for the next fTrack
 
           } // end of loop over rows
               
@@ -1645,13 +1821,29 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
          xyz[3]= (Float_t) (-gasgain*TMath::Log(rn)); 
          index[0]=1;
          
-         TransportElectron(xyz,index); //MI change -august       
+         TransportElectron(xyz,index);    
          Int_t rowNumber;
-         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); //MI change august
-         rowNumber = index[2];
+         fTPCParam->GetPadRow(xyz,index); 
+         // row 0 - cross talk from the innermost row
+         // row fNRow+1 cross talk from the outermost row
+         rowNumber = index[2]+1; 
          //transform position to local digit coordinates
          //relative to nearest pad row 
-         if ((rowNumber<0)||rowNumber>=fTPCParam->GetNRow(isec)) continue;       
+         if ((rowNumber<0)||rowNumber>fTPCParam->GetNRow(isec)+1) continue;
+          Float_t x1,y1;
+         if (isec <fTPCParam->GetNInnerSector()) {
+           x1 = xyz[1]*fTPCParam->GetInnerPadPitchWidth();
+           y1 = fTPCParam->GetYInner(rowNumber);
+         }
+         else{
+           x1=xyz[1]*fTPCParam->GetOuterPadPitchWidth();
+           y1 = fTPCParam->GetYOuter(rowNumber);
+         }
+         // gain inefficiency at the wires edges - linear
+         x1=TMath::Abs(x1);
+         y1-=1.;
+          if(x1>y1) xyz[3]*=TMath::Max(1.e-6,(y1-x1+1.));      
+       
          nofElectrons[rowNumber]++;      
          //----------------------------------
          // Expand vector if necessary
@@ -1664,13 +1856,11 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
            }
          }
          
-         TVector &v = *tracks[rowNumber];
+          AliTPCFastVector &v = *tracks[rowNumber];
          Int_t idx = 4*nofElectrons[rowNumber]-3;
-
-         v(idx)=  xyz[0];   // X - pad row coordinate
-         v(idx+1)=xyz[1];   // Y - pad coordinate (along the pad-row)
-          v(idx+2)=xyz[2];   // Z - time bin coordinate
-         v(idx+3)=xyz[3];   // avalanche size  
+         Real_t * position = &(((AliTPCFastVector&)v).UncheckedAt(idx)); //make code faster
+         memcpy(position,xyz,4*sizeof(Float_t));
        } // end of loop over electrons
 
         tpcHit = (AliTPChit*)NextHit();
@@ -1682,9 +1872,9 @@ void AliTPC::MakeSector(Int_t isec,Int_t nrows,TTree *TH,
     //   store remaining track (the last one) if not empty
     //
 
-     for(i=0;i<nrows;i++){
+     for(i=0;i<nrows+2;i++){
        if(nofElectrons[i]>0){
-          TVector &v = *tracks[i];
+          AliTPCFastVector &v = *tracks[i];
          v(0) = previousTrack;
           tracks[i]->ResizeTo(4*nofElectrons[i]+1); // shrink if necessary
          row[i]->Add(tracks[i]);  
@@ -1710,36 +1900,43 @@ void AliTPC::Init()
   //
   Int_t i;
   //
-  printf("\n");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf(" TPC_INIT ");
-  for(i=0;i<35;i++) printf("*");
-  printf("\n");
-  //
-  for(i=0;i<80;i++) printf("*");
-  printf("\n");
+  if(fDebug) {
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf(" TPC_INIT ");
+    for(i=0;i<35;i++) printf("*");
+    printf("\n%s: ",ClassName());
+    //
+    for(i=0;i<80;i++) printf("*");
+    printf("\n");
+  }
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, char *file)
+void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
 {
   //
   // Create Tree branches for the TPC.
   //
+  if(GetDebug()) Info("MakeBranch","");
   Int_t buffersize = 4000;
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s",GetName());
+  
+  const char *h = strstr(option,"H");
 
-  AliDetector::MakeBranch(option,file);
-
-  char *d = strstr(option,"D");
+  if ( h && (fHitType<=1) && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
+  
+  AliDetector::MakeBranch(option);
 
-  if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
-    gAlice->MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
-                             branchname, &fDigits, buffersize, file) ;
-  }    
+  const char *d = strstr(option,"D");
+  if (fDigits   && fLoader->TreeD() && d) 
+   {
+      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), branchname, &fDigits, buffersize, 0);
+   }   
 
-  if (fHitType&2) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
+  if (fHitType>1) MakeBranch2(option,0); // MI change 14.09.2000
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -1762,7 +1959,6 @@ void AliTPC::SetSecAL(Int_t sec)
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
-
   fSecAL = sec;
 }
 
@@ -1776,7 +1972,6 @@ void AliTPC::SetSecAU(Int_t sec)
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
-
   fSecAU = sec;
 }
 
@@ -1897,32 +2092,12 @@ void AliTPC::TransportElectron(Float_t *xyz, Int_t *index)
   // ExB
   
   if (fTPCParam->GetMWPCReadout()==kTRUE){
-    Float_t x1=xyz[0];
-    fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
-    Float_t dx=xyz[0]-x1;
+    Float_t dx = fTPCParam->Transform2to2NearestWire(xyz,index);
     xyz[1]+=dx*(fTPCParam->GetOmegaTau());
   }
-  //add nonisochronity (not implemented yet)
-  
+  //add nonisochronity (not implemented yet)  
 }
   
-ClassImp(AliTPCdigit)
-//_____________________________________________________________________________
-AliTPCdigit::AliTPCdigit(Int_t *tracks, Int_t *digits):
-  AliDigit(tracks)
-{
-  //
-  // Creates a TPC digit object
-  //
-  fSector     = digits[0];
-  fPadRow     = digits[1];
-  fPad        = digits[2];
-  fTime       = digits[3];
-  fSignal     = digits[4];
-}
-
 ClassImp(AliTPChit)
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -1940,46 +2115,47 @@ AliHit(shunt,track)
   fQ          = hits[3];
 }
  
-
 //________________________________________________________________________
-// Additional code because of the AliTPCTrackHits
+// Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
 
-void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,char *file)
+void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char */*file*/)
 {
   //
   // Create a new branch in the current Root Tree
   // The branch of fHits is automatically split
   // MI change 14.09.2000
-  if (fHitType&2==0) return;
+  if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","");
+  if (fHitType<2) return;
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
   //
   // Get the pointer to the header
-  char *cH = strstr(option,"H");
-  //
-  if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH) {    
-    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHits, 
-                                                  gAlice->TreeH(),fBufferSize,1);
-    gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
-    printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
-    if (file) {
-        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
-        TDirectory *wd = gDirectory;
-        b->SetFile(file);
-        TIter next( b->GetListOfBranches());
-        while ((b=(TBranch*)next())) {
-           b->SetFile(file);
-        }
-        wd->cd(); 
-           cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
-    }
-  }    
+  const char *cH = strstr(option,"H");
+  //
+  if (fTrackHits   && TreeH() && cH && fHitType&4) 
+   {
+    if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","Making branch for Type 4 Hits");
+    TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits,fBufferSize,99);
+   }   
+
+  if (fTrackHitsOld   && TreeH() && cH && fHitType&2) 
+   {    
+    if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","Making branch for Type 2 Hits");
+    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
+                                                   TreeH(),fBufferSize,99);
+    TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+   }   
 }
 
 void AliTPC::SetTreeAddress()
 {
-  if (fHitType&1) AliDetector::SetTreeAddress();
-  if (fHitType&2) SetTreeAddress2();
+//Sets tree address for hits  
+  if (fHitType<=1)
+   {
+     if (fHits == 0x0 ) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
+     AliDetector::SetTreeAddress();
+   }
+  if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
 }
 
 void AliTPC::SetTreeAddress2()
@@ -1987,21 +2163,49 @@ void AliTPC::SetTreeAddress2()
   //
   // Set branch address for the TrackHits Tree
   // 
+  if(GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","");
+  
   TBranch *branch;
   char branchname[20];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());
   //
   // Branch address for hit tree
-  TTree *treeH = gAlice->TreeH();
-  if (treeH) {
+  TTree *treeH = TreeH();
+  if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
+    branch = treeH->GetBranch(branchname);
+    if (branch) 
+     {
+       branch->SetAddress(&fTrackHits);
+       if (GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","fHitType&4 Setting");
+     }
+    else 
+    if (GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","fHitType&4 Failed (can not find branch)");
+    
+  }
+  if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
     branch = treeH->GetBranch(branchname);
-    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHits);
+    if (branch) 
+     {
+       branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
+       if (GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","fHitType&2 Setting");
+     }
+    else if (GetDebug()) 
+      Info("SetTreeAddress2","fHitType&2 Failed (can not find branch)");
   }
+  //set address to TREETR
+
+  TTree *treeTR = TreeTR();
+  if (treeTR && fTrackReferences) {
+    branch = treeTR->GetBranch(GetName());
+    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackReferences);
+  }
+
 }
 
 void AliTPC::FinishPrimary()
 {
-  if (fTrackHits) fTrackHits->FlushHitStack();  
+  if (fTrackHits &&fHitType&4)      fTrackHits->FlushHitStack();  
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2)  fTrackHitsOld->FlushHitStack();  
 }
 
 
@@ -2011,42 +2215,52 @@ void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   // add hit to the list  
   Int_t rtrack;
   if (fIshunt) {
-    int primary = gAlice->GetPrimary(track);
-    gAlice->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
+    int primary = gAlice->GetMCApp()->GetPrimary(track);
+    gAlice->GetMCApp()->Particle(primary)->SetBit(kKeepBit);
     rtrack=primary;
   } else {
     rtrack=track;
-    gAlice->FlagTrack(track);
+    gAlice->GetMCApp()->FlagTrack(track);
   }  
   //AliTPChit *hit = (AliTPChit*)fHits->UncheckedAt(fNhits-1);
   //if (hit->fTrack!=rtrack)
   //  cout<<"bad track number\n";
-  if (fTrackHits) 
+  if (fTrackHits && fHitType&4
     fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
-                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+                             hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+  if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
+    fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
+                                hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+  
 }
 
 void AliTPC::ResetHits()
-{
+{ 
   if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
-  if (fHitType&2) ResetHits2();
+  if (fHitType>1) ResetHits2();
 }
 
 void AliTPC::ResetHits2()
 {
   //
   //reset hits
-  if (fTrackHits) fTrackHits->Clear();
+  if (fTrackHits && fHitType&4) fTrackHits->Clear();
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) fTrackHitsOld->Clear();
+
 }   
 
 AliHit* AliTPC::FirstHit(Int_t track)
 {
-  if (fHitType&2) return FirstHit2(track);
+  if (fHitType>1) return FirstHit2(track);
   return AliDetector::FirstHit(track);
 }
 AliHit* AliTPC::NextHit()
 {
-  if (fHitType&2) return NextHit2();
+  //
+  // gets next hit
+  //
+  if (fHitType>1) return NextHit2();
+  
   return AliDetector::NextHit();
 }
 
@@ -2061,13 +2275,18 @@ AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
   // 
   if(track>=0) {
     gAlice->ResetHits();
-    gAlice->TreeH()->GetEvent(track);
+    TreeH()->GetEvent(track);
   }
   //
-  if (fTrackHits) {
+  if (fTrackHits && fHitType&4) {
     fTrackHits->First();
     return fTrackHits->GetHit();
   }
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    fTrackHitsOld->First();
+    return fTrackHitsOld->GetHit();
+  }
+
   else return 0;
 }
 
@@ -2076,6 +2295,11 @@ AliHit* AliTPC::NextHit2()
   //
   //Return the next hit for the current track
 
+
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    fTrackHitsOld->Next();
+    return fTrackHitsOld->GetHit();
+  }
   if (fTrackHits) {
     fTrackHits->Next();
     return fTrackHits->GetHit();
@@ -2101,15 +2325,68 @@ void AliTPC::LoadPoints(Int_t)
 
 void AliTPC::RemapTrackHitIDs(Int_t *map)
 {
+  //
+  // remapping
+  //
   if (!fTrackHits) return;
-  AliObjectArray * arr = fTrackHits->fTrackHitsInfo;
-  for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
-    AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
-    info->fTrackID = map[info->fTrackID];
-  }
   
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2){
+    AliObjectArray * arr = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+    for (UInt_t i=0;i<arr->GetSize();i++){
+      AliTrackHitsInfo * info = (AliTrackHitsInfo *)(arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&4){
+    TClonesArray * arr = fTrackHits->GetArray();;
+    for (Int_t i=0;i<arr->GetEntriesFast();i++){
+      AliTrackHitsParamV2 * info = (AliTrackHitsParamV2 *)(arr->At(i));
+      info->fTrackID = map[info->fTrackID];
+    }
+  }
 }
 
+Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
+{
+  //return bool information - is track in given volume
+  //load only part of the track information 
+  //return true if current track is in volume
+  //
+  //  return kTRUE;
+  if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
+    TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+    br->GetEvent(track);
+    AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
+    for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
+      if (  ((AliTrackHitsInfo*)ar->At(j))->fVolumeID==id) return kTRUE;
+    } 
+  }
+
+  if (fTrackHits && fHitType&4) {
+    TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+    TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+    br2->GetEvent(track);
+    br1->GetEvent(track);    
+    Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
+    Int_t nvolumes = fTrackHits->GetNVolumes();
+    if (!volumes && nvolumes>0) {
+      printf("Problematic track\t%d\t%d",track,nvolumes);
+      return kFALSE;
+    }
+    for (Int_t j=0;j<nvolumes; j++)
+      if (volumes[j]==id) return kTRUE;    
+  }
+
+  if (fHitType&1) {
+    TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fSector");
+    br->GetEvent(track);
+    for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
+      if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
+    } 
+  }
+  return kFALSE;  
+
+}
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
@@ -2117,11 +2394,14 @@ void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
   //
   // Store x, y, z of all hits in memory
   //
-  if (fTrackHits == 0) return;
+  if (fTrackHits == 0 && fTrackHitsOld==0) return;
   //
-  Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  Int_t nhits =0;
+  if (fHitType&4) nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
+  if (fHitType&2) nhits = fTrackHitsOld->GetEntriesFast();
+  
   if (nhits == 0) return;
-  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(tracks);
   AliHit *ahit;
   //
@@ -2142,9 +2422,7 @@ void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
   // Loop over all the hits and store their position
   //
   ahit = FirstHit2(-1);
-  //for (Int_t hit=0;hit<nhits;hit++) {
   while (ahit){
-    //    ahit = (AliHit*)fHits->UncheckedAt(hit);
     trk=ahit->GetTrack();
     if(ntrk[trk]==limi[trk]) {
       //
@@ -2165,6 +2443,9 @@ void AliTPC::LoadPoints2(Int_t)
     ntrk[trk]++;
     ahit = NextHit2();
   }
+
+
+
   //
   for(trk=0; trk<tracks; ++trk) {
     if(ntrk[trk]) {
@@ -2195,7 +2476,7 @@ void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
   //
   Int_t nhits = fTrackHits->GetEntriesFast();
   if (nhits == 0) return;
-  Int_t tracks = gAlice->GetNtrack();
+  Int_t tracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
   if (fPoints == 0) fPoints = new TObjArray(2*tracks);
   fPoints->Expand(2*tracks);
   AliHit *ahit;
@@ -2273,118 +2554,57 @@ void AliTPC::LoadPoints3(Int_t)
 
 
 
-void AliTPC::FindTrackHitsIntersection(TClonesArray * arr)
+AliLoader* AliTPC::MakeLoader(const char* topfoldername)
 {
+//Makes TPC loader
+ fLoader = new AliTPCLoader(GetName(),topfoldername);
+ return fLoader;
+}
 
-  //
-  //fill clones array with intersection of current point with the
-  //middle of the row
-  Int_t sector;
-  Int_t ipart;
-  
-  const Int_t kcmaxhits=30000;
-  TVector * xxxx = new TVector(kcmaxhits*4);
-  TVector & xxx = *xxxx;
-  Int_t maxhits = kcmaxhits;
-      
-  //
-  AliTPChit * tpcHit=0;
-  tpcHit = (AliTPChit*)FirstHit2(-1);
-  Int_t currentIndex=0;
-  Int_t lastrow=-1;  //last writen row
-
-  while (tpcHit){
-    if (tpcHit==0) continue;
-    sector=tpcHit->fSector; // sector number
-    ipart=tpcHit->Track();
-    
-    //find row number
-    
-    Float_t  x[3]={tpcHit->X(),tpcHit->Y(),tpcHit->Z()};
-    Int_t    index[3]={1,sector,0};
-    Int_t    currentrow = fTPCParam->GetPadRow(x,index) ;      
-    if (currentrow<0) continue;
-    if (lastrow<0) lastrow=currentrow;
-    if (currentrow==lastrow){
-      if ( currentIndex>=maxhits){
-       maxhits+=kcmaxhits;
-       xxx.ResizeTo(4*maxhits);
-      }     
-      xxx(currentIndex*4)=x[0];
-      xxx(currentIndex*4+1)=x[1];
-      xxx(currentIndex*4+2)=x[2];      
-      xxx(currentIndex*4+3)=tpcHit->fQ;
-      currentIndex++;  
-    }
-    else 
-      if (currentIndex>2){
-       Float_t sumx=0;
-       Float_t sumx2=0;
-       Float_t sumx3=0;
-       Float_t sumx4=0;
-       Float_t sumy=0;
-       Float_t sumxy=0;
-       Float_t sumx2y=0;
-       Float_t sumz=0;
-       Float_t sumxz=0;
-       Float_t sumx2z=0;
-       Float_t sumq=0;
-       for (Int_t index=0;index<currentIndex;index++){
-         Float_t x,x2,x3,x4;
-         x=x2=x3=x4=xxx(index*4);
-         x2*=x;
-         x3*=x2;
-         x4*=x3;
-         sumx+=x;
-         sumx2+=x2;
-         sumx3+=x3;
-         sumx4+=x4;
-         sumy+=xxx(index*4+1);
-         sumxy+=xxx(index*4+1)*x;
-         sumx2y+=xxx(index*4+1)*x2;
-         sumz+=xxx(index*4+2);
-         sumxz+=xxx(index*4+2)*x;
-         sumx2z+=xxx(index*4+2)*x2;     
-         sumq+=xxx(index*4+3);
-       }
-       Float_t centralPad = (fTPCParam->GetNPads(sector,lastrow)-1)/2;
-       Float_t det=currentIndex*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-         sumx2*(sumx*sumx3-sumx2*sumx2);
-       
-       Float_t detay=sumy*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)+
-         sumx2*(sumxy*sumx3-sumx2y*sumx2);
-       Float_t detaz=sumz*(sumx2*sumx4-sumx3*sumx3)-sumx*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)+
-         sumx2*(sumxz*sumx3-sumx2z*sumx2);
-       
-       Float_t detby=currentIndex*(sumxy*sumx4-sumx2y*sumx3)-sumy*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-         sumx2*(sumx*sumx2y-sumx2*sumxy);
-       Float_t detbz=currentIndex*(sumxz*sumx4-sumx2z*sumx3)-sumz*(sumx*sumx4-sumx2*sumx3)+
-         sumx2*(sumx*sumx2z-sumx2*sumxz);
-       
-       Float_t y=detay/det+centralPad;
-       Float_t z=detaz/det;    
-       Float_t by=detby/det; //y angle
-       Float_t bz=detbz/det; //z angle
-       sumy/=Float_t(currentIndex);
-       sumz/=Float_t(currentIndex);
-       
-       AliComplexCluster cl;
-       cl.fX=z;
-       cl.fY=y;
-       cl.fQ=sumq;
-       cl.fSigmaX2=bz;
-       cl.fSigmaY2=by;
-       cl.fTracks[0]=ipart;
-       
-       AliTPCClustersRow * row = (fClustersArray->GetRow(sector,lastrow));
-       if (row!=0) row->InsertCluster(&cl);
-       currentIndex=0;
-       lastrow=currentrow;
-      } //end of calculating cluster for given row
-               
-  } // end of loop over hits
-  xxxx->Delete();
+////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
+//
+// load TPC paarmeters from a given file or create new if the object
+// is not found there
+// 12/05/2003 This method should be moved to the AliTPCLoader
+// and one has to decide where to store the TPC parameters
+// M.Kowalski
+  char paramName[50];
+  sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
+  AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)file->Get(paramName);
+  if (paramTPC) {
+    //    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+  } else {
+    cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
+       <<endl;    
+    paramTPC = new AliTPCParamSR;
+  }
+  return paramTPC;
 
+// the older version of parameters can be accessed with this code.
+// In some cases, we have old parameters saved in the file but 
+// digits were created with new parameters, it can be distinguish 
+// by the name of TPC TreeD. The code here is just for the case 
+// we would need to compare with old data, uncomment it if needed.
+//
+//  char paramName[50];
+//  sprintf(paramName,"75x40_100x60");
+//  AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
+//  if (paramTPC) {
+//    cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+//  } else {
+//    sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
+//    paramTPC=(AliTPCParam*)in->Get(paramName);
+//    if (paramTPC) {
+//     cout<<"TPC parameters "<<paramName<<" found."<<endl;
+//    } else {
+//     cerr<<"TPC parameters not found. Create new (they may be incorrect)."
+//         <<endl;    
+//     paramTPC = new AliTPCParamSR;
+//    }
+//  }
+//  return paramTPC;
 
 }
+
+