]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPC.cxx
Transition to NewIO
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPC.cxx
index 24a1d5a490acf4a11d9849a15225556e7fa29ae1..f006ca43ecade53a0b7cea94787c831121e7f747 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/*
-$Log$
-Revision 1.67  2003/03/03 16:36:16  kowal2
-Added LoadTPCParam method
-
-Revision 1.66  2003/02/11 16:54:07  hristov
-Updated AliTrackReference class (S.Radomski)
-
-Revision 1.65  2002/11/21 22:43:32  alibrary
-Removing AliMC and AliMCProcess
-
-Revision 1.64  2002/10/23 07:17:33  alibrary
-Introducing Riostream.h
-
-Revision 1.63  2002/10/14 14:57:42  hristov
-Merging the VirtualMC branch to the main development branch (HEAD)
-
-Revision 1.54.4.3  2002/10/11 08:34:48  hristov
-Updating VirtualMC to v3-09-02
-
-Revision 1.62  2002/09/23 09:22:56  hristov
-The address of the TrackReferences is set (M.Ivanov)
-
-Revision 1.61  2002/09/10 07:06:42  kowal2
-Corrected for the memory leak. Thanks to J. Chudoba and M. Ivanov
-
-Revision 1.60  2002/06/12 14:56:56  kowal2
-Added track length to the reference hits
-
-Revision 1.59  2002/06/05 15:37:31  kowal2
-Added cross-talk from the wires beyond the first and the last rows
-
-Revision 1.58  2002/05/27 14:33:14  hristov
-The new class AliTrackReference used (M.Ivanov)
-
-Revision 1.57  2002/05/07 17:23:11  kowal2
-Linear gain inefficiency instead of the step one at the wire edges.
-
-Revision 1.56  2002/04/04 16:26:33  kowal2
-Digits (Sdigits) go to separate files now.
-
-Revision 1.55  2002/03/29 06:57:45  kowal2
-Restored backward compatibility to use the hits from Dec. 2000 production.
-
-Revision 1.54  2002/03/18 17:59:13  kowal2
-Chnges in the pad geometry - 3 pad lengths introduced.
-
-Revision 1.53  2002/02/25 11:02:56  kowal2
-Changes towards speeding up the code. Thanks to Marian Ivanov.
-
-Revision 1.52  2002/02/18 09:26:09  kowal2
-Removed compiler warning
-
-Revision 1.51  2002/01/21 17:13:21  kowal2
-New track hits using root containers. Setting active sectors added.
-
-Revision 1.50  2001/12/06 14:16:19  kowal2
-meaningfull printouts
-
-Revision 1.49  2001/11/30 11:55:37  hristov
-Noise table created in Hits2SDigits (M.Ivanov)
-
-Revision 1.48  2001/11/24 16:10:21  kowal2
-Faster algorithms.
-
-Revision 1.47  2001/11/19 10:25:34  kowal2
-Nearest integer instead of integer when converting to ADC counts
-
-Revision 1.46  2001/11/07 06:47:12  kowal2
-Removed printouts
-
-Revision 1.45  2001/11/03 13:33:48  kowal2
-Updated algorithms in Hits2SDigits, SDigits2Digits,
-Hits2ExactClusters.
-Added method Merge
-
-Revision 1.44  2001/08/30 09:28:48  hristov
-TTree names are explicitly set via SetName(name) and then Write() is called
-
-Revision 1.43  2001/07/28 12:02:54  hristov
-Branch split level set to 99
-
-Revision 1.42  2001/07/28 11:38:52  hristov
-Loop variable declared once
-
-Revision 1.41  2001/07/28 10:53:50  hristov
-Digitisation done according to the general scheme (M.Ivanov)
-
-Revision 1.40  2001/07/27 13:03:14  hristov
-Default Branch split level set to 99
-
-Revision 1.39  2001/07/26 09:09:34  kowal2
-Hits2Reco method added
-
-Revision 1.38  2001/07/20 14:32:43  kowal2
-Processing of many events possible now
-
-Revision 1.37  2001/06/12 07:17:18  kowal2
-Hits2SDigits method implemented (summable digits)
-
-Revision 1.36  2001/05/16 14:57:25  alibrary
-New files for folders and Stack
-
-Revision 1.35  2001/05/08 16:02:22  kowal2
-Updated material specifications
-
-Revision 1.34  2001/05/08 15:00:15  hristov
-Corrections for tracking in arbitrary magnenetic field. Changes towards a concept of global Alice track. Back propagation of reconstructed tracks (Yu.Belikov)
-
-Revision 1.33  2001/04/03 12:40:43  kowal2
-Removed printouts
-
-Revision 1.32  2001/03/12 17:47:36  hristov
-Changes needed on Sun with CC 5.0
-
-Revision 1.31  2001/03/12 08:21:50  kowal2
-Corrected C++ bug in the material definitions
-
-Revision 1.30  2001/03/01 17:34:47  kowal2
-Correction due to the accuracy problem
-
-Revision 1.29  2001/02/28 16:34:40  kowal2
-Protection against nonphysical values of the avalanche size,
-10**6 is the maximum
-
-Revision 1.28  2001/01/26 19:57:19  hristov
-Major upgrade of AliRoot code
-
-Revision 1.27  2001/01/13 17:29:33  kowal2
-Sun compiler correction
-
-Revision 1.26  2001/01/10 07:59:43  kowal2
-Corrections to load points from the noncompressed hits.
-
-Revision 1.25  2000/11/02 07:25:31  kowal2
-Changes due to the new hit structure.
-Memory leak removed.
-
-Revision 1.24  2000/10/05 16:06:09  kowal2
-Forward declarations. Changes due to a new class AliComplexCluster.
-
-Revision 1.23  2000/10/02 21:28:18  fca
-Removal of useless dependecies via forward declarations
-
-Revision 1.22  2000/07/10 20:57:39  hristov
-Update of TPC code and macros by M.Kowalski
-
-Revision 1.19.2.4  2000/06/26 07:39:42  kowal2
-Changes to obey the coding rules
-
-Revision 1.19.2.3  2000/06/25 08:38:41  kowal2
-Splitted from AliTPCtracking
-
-Revision 1.19.2.2  2000/06/16 12:59:28  kowal2
-Changed parameter settings
-
-Revision 1.19.2.1  2000/06/09 07:15:07  kowal2
-
-Defaults loaded automatically (hard-wired)
-Optional parameters can be set via macro called in the constructor
-
-Revision 1.19  2000/04/18 19:00:59  fca
-Small bug fixes to TPC files
-
-Revision 1.18  2000/04/17 09:37:33  kowal2
-removed obsolete AliTPCDigitsDisplay.C
-
-Revision 1.17.2.2  2000/04/10 08:15:12  kowal2
-
-New, experimental data structure from M. Ivanov
-New tracking algorithm
-Different pad geometry for different sectors
-Digitization rewritten
-
-Revision 1.17.2.1  2000/04/10 07:56:53  kowal2
-Not used anymore - removed
-
-Revision 1.17  2000/01/19 17:17:30  fca
-Introducing a list of lists of hits -- more hits allowed for detector now
-
-Revision 1.16  1999/11/05 09:29:23  fca
-Accept only signals > 0
-
-Revision 1.15  1999/10/08 06:26:53  fca
-Removed ClustersIndex - not used anymore
-
-Revision 1.14  1999/09/29 09:24:33  fca
-Introduction of the Copyright and cvs Log
-
-*/
+/* $Id$ */
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //                                                                           //
@@ -222,51 +33,49 @@ Introduction of the Copyright and cvs Log
 
 //
 
+#include <Riostream.h>
+#include <stdlib.h>
+
+#include <TFile.h>  
+#include <TGeometry.h>
+#include <TInterpreter.h>
 #include <TMath.h>
-#include <TRandom.h>
-#include <TVector.h>
 #include <TMatrix.h>
-#include <TGeometry.h>
 #include <TNode.h>
-#include <TTUBS.h>
 #include <TObjectTable.h>
-#include "TParticle.h"
-#include "AliTPC.h"
-#include <TFile.h>  
+#include <TParticle.h>
 #include <TROOT.h>
+#include <TRandom.h>
 #include <TSystem.h>     
-#include "AliRun.h"
-#include <Riostream.h>
-#include <stdlib.h>
-#include <Riostream.h>
-#include "AliMagF.h"
-#include "AliTrackReference.h"
-
+#include <TTUBS.h>
+#include <TTree.h>
+#include <TVector.h>
+#include <TVirtualMC.h>
 
-#include "AliTPCParamSR.h"
-#include "AliTPCPRF2D.h"
-#include "AliTPCRF1D.h"
+#include "AliArrayBranch.h"
+#include "AliClusters.h"
+#include "AliComplexCluster.h"
 #include "AliDigits.h"
+#include "AliMagF.h"
+#include "AliPoints.h"
+#include "AliRun.h"
+#include "AliRunLoader.h"
 #include "AliSimDigits.h"
+#include "AliTPC.h"
+#include "AliTPC.h"
+#include "AliTPCClustersArray.h"
+#include "AliTPCClustersRow.h"
+#include "AliTPCDigitsArray.h"
+#include "AliTPCLoader.h"
+#include "AliTPCPRF2D.h"
+#include "AliTPCParamSR.h"
+#include "AliTPCRF1D.h"
 #include "AliTPCTrackHits.h"
 #include "AliTPCTrackHitsV2.h"
-#include "AliPoints.h"
-#include "AliArrayBranch.h"
-
-
-#include "AliTPCDigitsArray.h"
-#include "AliComplexCluster.h"
-#include "AliClusters.h"
-#include "AliTPCClustersRow.h"
-#include "AliTPCClustersArray.h"
-
 #include "AliTPCcluster.h"
 #include "AliTPCclusterer.h"
 #include "AliTPCtracker.h"
-
-#include <TInterpreter.h>
-#include <TTree.h>
-
+#include "AliTrackReference.h"
 
 
 ClassImp(AliTPC) 
@@ -406,7 +215,7 @@ void AliTPC::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   if (fHitType>1)
    AddHit2(track,vol,hits);
 }
+
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::BuildGeometry()
 {
@@ -502,13 +311,14 @@ Int_t AliTPC::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
   return 9999;
 }
 
-void AliTPC::Clusters2Tracks(TFile *of) {
+void AliTPC::Clusters2Tracks() 
+ {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a track finder.
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCtracker tracker(fTPCParam);
-  tracker.Clusters2Tracks(gFile,of);
-}
+  AliTPCtracker tracker(fTPCParam,0,fLoader->GetEventFolder()->GetName());
+  tracker.Clusters2Tracks();
+ }
 
 //_____________________________________________________________________________
 void AliTPC::CreateMaterials()
@@ -959,6 +769,7 @@ Bool_t  AliTPC::IsSectorActive(Int_t sec)
 void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t * sectors, Int_t n)
 {
   // activate interesting sectors
+  SetTreeAddress();//just for security
   if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
   fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
@@ -972,6 +783,7 @@ void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
   //
   // activate sectors which were hitted by tracks 
   //loop over tracks
+  SetTreeAddress();//just for security
   if (fHitType==0) return;  // if Clones hit - not short volume ID information
   if (fActiveSectors) delete [] fActiveSectors;
   fActiveSectors = new Bool_t[fTPCParam->GetNSector()];
@@ -981,16 +793,24 @@ void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
   }
   for (Int_t i=0;i<fTPCParam->GetNSector();i++) fActiveSectors[i]=kFALSE;
   TBranch * branch=0;
-  if (fHitType>1) branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC2");
-  else branch = gAlice->TreeH()->GetBranch("TPC");
-  Stat_t ntracks = gAlice->TreeH()->GetEntries();
+  if (TreeH() == 0x0)
+   {
+     Fatal("SetActiveSectors","Can not find TreeH in folder");
+     return;
+   }
+  if (fHitType>1) branch = TreeH()->GetBranch("TPC2");
+  else branch = TreeH()->GetBranch("TPC");
+  Stat_t ntracks = TreeH()->GetEntries();
   // loop over all hits
-  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++){
+  cout<<"\nAliTPC::SetActiveSectors():  Got "<<ntracks<<" tracks\n";
+  
+  for(Int_t track=0;track<ntracks;track++)
+   {
     ResetHits();
     //
     if (fTrackHits && fHitType&4) {
-      TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
-      TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+      TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+      TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");
       br1->GetEvent(track);
       br2->GetEvent(track);
       Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
@@ -1000,7 +820,7 @@ void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
     
     //
     if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
-      TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+      TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
       br->GetEvent(track);
       AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
       for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
@@ -1014,12 +834,12 @@ void    AliTPC::SetActiveSectors(Int_t flag)
 
 
 
-void AliTPC::Digits2Clusters(TFile *of, Int_t eventnumber)
+void AliTPC::Digits2Clusters(Int_t eventnumber)
 {
   //-----------------------------------------------------------------
   // This is a simple cluster finder.
   //-----------------------------------------------------------------
-  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam,of,eventnumber);
+  AliTPCclusterer::Digits2Clusters(fTPCParam, fLoader,eventnumber);
 }
 
 extern Double_t SigmaY2(Double_t, Double_t, Double_t);
@@ -1057,9 +877,8 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of, Int_t eventn)
   const Float_t kBCz=0.55938e-3;
   const Float_t kCCz=0.30428;
 
-  TDirectory *savedir=gDirectory; 
 
-  if (!of->IsOpen()) {
+  if (!fLoader) {
      cerr<<"AliTPC::Hits2Clusters(): output file not open !\n";
      return;
   }
@@ -1080,21 +899,30 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of, Int_t eventn)
   //  Get the access to the tracks 
   //---------------------------------------------------------------
   
-  TTree *tH = gAlice->TreeH();
+  TTree *tH = TreeH();
+  if (tH == 0x0)
+   {
+     Fatal("Hits2Clusters","Can not find TreeH in folder");
+     return;
+   }
+  SetTreeAddress();
+  
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
 
   //Switch to the output file
-  of->cd();
-
-  char   cname[100];
-
-  sprintf(cname,"TreeC_TPC_%d",eventn);
-
+  
+  if (fLoader->TreeR() == 0x0) fLoader->MakeTree("R");
+  
+  cout<<"fTPCParam->GetTitle() = "<<fTPCParam->GetTitle()<<endl;
+  
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+  rl->CdGAFile();
   fTPCParam->Write(fTPCParam->GetTitle());
+
   AliTPCClustersArray carray;
   carray.Setup(fTPCParam);
   carray.SetClusterType("AliTPCcluster");
-  carray.MakeTree();
+  carray.MakeTree(fLoader->TreeR());
 
   Int_t nclusters=0; //cluster counter
   
@@ -1209,10 +1037,8 @@ void AliTPC::Hits2Clusters(TFile *of, Int_t eventn)
   } // end of loop over sectors  
 
   cerr<<"Number of made clusters : "<<nclusters<<"                        \n";
-  carray.GetTree()->SetName(cname);
-  carray.GetTree()->Write();
-
-  savedir->cd(); //switch back to the input file
+  fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
+  
   
 } // end of function
 
@@ -1248,7 +1074,14 @@ void AliTPC::Hits2ExactClustersSector(Int_t isec)
   //  Get the access to the tracks 
   //---------------------------------------------------------------
   
-  TTree *tH = gAlice->TreeH();
+  TTree *tH = TreeH();
+  if (tH == 0x0)
+   {
+     Fatal("Hits2Clusters","Can not find TreeH in folder");
+     return;
+   }
+  SetTreeAddress();
+
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
   Int_t npart = gAlice->GetNtrack();
   //MI change
@@ -1399,24 +1232,33 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)
 {
   //create digits from summable digits
   GenerNoise(500000); //create teble with noise
-  char  sname[100];
-  char  dname[100];
-  sprintf(sname,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
-  sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
 
   //conect tree with sSDigits
-  TTree *t;
-  if (gAlice->GetTreeDFile()) {
-    t = (TTree *)gAlice->GetTreeDFile()->Get(sname); 
-  } else {
-    t = (TTree *)gDirectory->Get(sname); 
-  }
-  if (!t) {
-    cerr<<"TPC tree with sdigits not found"<<endl;
-    return;
-  }
+  TTree *t = fLoader->TreeS();
+
+  if (t == 0x0) 
+   {
+     fLoader->LoadSDigits("READ");
+     t = fLoader->TreeS();
+     if (t == 0x0)
+      {
+        Error("SDigits2Digits2","Can not get input TreeS");
+        return;
+      }
+   }
+  
+  if (fLoader->TreeD() == 0x0) fLoader->MakeTree("D");
+  
   AliSimDigits digarr, *dummy=&digarr;
-  t->GetBranch("Segment")->SetAddress(&dummy);
+  TBranch* sdb = t->GetBranch("Segment");
+  if (sdb == 0x0)
+   {
+     Error("SDigits2Digits2","Can not find branch with segments in TreeS.");
+     return;
+   }  
+
+  sdb->SetAddress(&dummy);
+      
   Stat_t nentries = t->GetEntries();
 
   // set zero suppression
@@ -1432,14 +1274,9 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
   arr->Setup(fTPCParam);
-// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
-  if (gAlice->GetTreeDFile()) {
-    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeDFile());
-  } else {
-    arr->MakeTree(fDigitsFile);
-  }
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeD());
   
-  AliTPCParam * par =fTPCParam;
+  AliTPCParam * par = fTPCParam;
 
   //Loop over segments of the TPC
 
@@ -1450,7 +1287,15 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)
       cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr.GetID()<<endl;
       continue;
     }
-    if (!IsSectorActive(sec)) continue;
+    if (!IsSectorActive(sec)) 
+     {
+//       cout<<n<<" NOT Active \n";
+       continue;
+     }
+    else
+     {
+//       cout<<n<<" Active \n";
+     }
     AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
     Int_t nrows = digrow->GetNRows();
     Int_t ncols = digrow->GetNCols();
@@ -1500,141 +1345,10 @@ void AliTPC::SDigits2Digits2(Int_t eventnumber)
 
     
   //write results
-
-  
-  arr->GetTree()->SetName(dname);  
-  arr->GetTree()->AutoSave();  
-  delete arr;
-}
-//_________________________________________
-void AliTPC::Merge(TTree * intree, Int_t *mask, Int_t nin, Int_t outid)
-{
-  
-  //intree - pointer to array of trees with s digits
-  //mask   - mask for each 
-  //nin    - number of inputs
-  //outid  - event  number of the output event
-
-  //create digits from summable digits 
-  //conect tree with sSDigits
-
-    
-  AliSimDigits ** digarr = new AliSimDigits*[nin];
-  for (Int_t i1=0;i1<nin; i1++){
-    digarr[i1]=0;
-    intree[i1].GetBranch("Segment")->SetAddress(&digarr[i1]);
-  }
-  Stat_t nentries = intree[0].GetEntries();
-  
-  //make tree with digits   
-  char  dname[100];
-  sprintf(dname,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),outid);
-  AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
-  arr->SetClass("AliSimDigits");
-  arr->Setup(fTPCParam);
-  arr->MakeTree(fDigitsFile);  
-
-  // set zero suppression
-
-  fTPCParam->SetZeroSup(2);
-
-  // get zero suppression
-
-  Int_t zerosup = fTPCParam->GetZeroSup();
-
-
-  AliTPCParam * par =fTPCParam;
-
-  //Loop over segments of the TPC
-  for (Int_t n=0; n<nentries; n++) {
-    
-    for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
-      //connect proper digits
-      intree[i].GetEvent(n);      
-      digarr[i]->ExpandBuffer();
-      digarr[i]->ExpandTrackBuffer();
-    }      
-    Int_t sec, row;
-    if (!par->AdjustSectorRow(digarr[0]->GetID(),sec,row)) {
-      cerr<<"AliTPC warning: invalid segment ID ! "<<digarr[0]->GetID()<<endl;
-      continue;
-    }
-
-    AliSimDigits * digrow =(AliSimDigits*) arr->CreateRow(sec,row);
-    Int_t nrows = digrow->GetNRows();
-    Int_t ncols = digrow->GetNCols();
-
-    digrow->ExpandBuffer();
-    digrow->ExpandTrackBuffer();
+  fLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
    
-    for (Int_t rows=0;rows<nrows; rows++){
-      for (Int_t col=0;col<ncols; col++){
-        Float_t q=0;
-        Int_t label[1000]; // i hope no more than 300 events merged
-        Int_t labptr = 0;
-        // looop over digits
-        for (Int_t i=0;i<nin; i++){ 
-          q  += digarr[i]->GetDigitFast(rows,col);
-          for (Int_t tr=0;tr<3;tr++) {
-            Int_t lab = digarr[i]->GetTrackIDFast(rows,col,tr);
-            if ( lab > 1) {
-              label[labptr]=lab+mask[i]-2;
-              labptr++;
-            }
-          }
-        }
-        //add noise
-        q = gRandom->Gaus(q,fTPCParam->GetNoise()*fTPCParam->GetNoiseNormFac()*16); 
-        
-        q/=16;  //conversion faktor
-        q=(Short_t)q;
-
-        if (q> zerosup){
-
-          if(q > fTPCParam->GetADCSat()) q = fTPCParam->GetADCSat();
-          digrow->SetDigitFast((Short_t)q,rows,col);  
-          for (Int_t tr=0;tr<3;tr++){
-            if (tr<labptr)
-              ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(label[tr],rows,col,tr);
-            else
-              ((AliSimDigits*)digrow)->SetTrackIDFast(-1,rows,col,tr);
-          }
-        }
-      } 
-     }         
-      arr->StoreRow(sec,row);
-
-      arr->ClearRow(sec,row);   
-  }  
-  
-  delete digarr;
-  arr->GetTree()->SetName(dname); 
-  arr->GetTree()->Write(); 
-  delete arr;  
-  
-}
-
-/*_________________________________________
-void AliTPC::SDigits2Digits(Int_t eventnumber)
-{
-
-
-  cerr<<"Digitizing TPC...\n";
-
-  Hits2Digits(eventnumber);
-   
-    
-  //write results
-
-  //  char treeName[100];
-
-  //  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
-  
-  //  GetDigitsArray()->GetTree()->Write(treeName);  
+  delete arr;
 }
-*/
 //__________________________________________________________________
 void AliTPC::SetDefaults(){
 
@@ -1643,6 +1357,9 @@ void AliTPC::SetDefaults(){
 
   // Set response functions
 
+  //
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+  rl->CdGAFile();
   AliTPCParamSR *param=(AliTPCParamSR*)gDirectory->Get("75x40_100x60");
   if(param){
     printf("You are using 2 pad-length geom hits with 3 pad-lenght geom digits...\n");
@@ -1697,7 +1414,26 @@ void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)
  //----------------------------------------------------
  // Loop over all sectors for a single event
  //----------------------------------------------------
-
+  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+  rl->GetEvent(eventnumber);
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
+   {
+     if(fLoader->LoadHits())
+      {
+        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
+      }
+   }
+  SetTreeAddress();
+  
+  if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) 
+   {
+     fLoader->MakeTree("D");
+     if (fLoader->TreeD() == 0x0 ) 
+      {
+       Error("Hits2Digits","Can not get TreeD");
+       return;
+      }
+   }
 
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();  // check if the parameters are set
   GenerNoise(500000); //create teble with noise
@@ -1709,30 +1445,26 @@ void AliTPC::Hits2Digits(Int_t eventnumber)
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
   arr->Setup(fTPCParam);
-// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
-  if (gAlice->GetTreeDFile()) {
-    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeDFile());
-  } else {
-    arr->MakeTree(fDigitsFile);
-  }
+
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeD());
   SetDigitsArray(arr);
 
   fDigitsSwitch=0; // standard digits
 
   cerr<<"Digitizing TPC -- normal digits...\n";
 
-  for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec); 
-   
-  // write results
-
-  char treeName[100];
-
-  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
-  
-  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName);  
-  GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave();  
-
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
+  if (IsSectorActive(isec)) 
+   {
+    cout<<"Sector "<<isec<<"is active\n";
+    Hits2DigitsSector(isec);
+   }
+  else
+   {
+    cout<<"Sector "<<isec<<"is NOT active\n";
+   }
 
+  fLoader->WriteDigits("OVERWRITE"); 
 }
 
 
@@ -1748,23 +1480,40 @@ void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)
  //----------------------------------------------------
  // Loop over all sectors for a single event
  //----------------------------------------------------
+//  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+
+  AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader();
+
+  rl->GetEvent(eventnumber);
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
+   {
+     if(fLoader->LoadHits())
+      {
+        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
+        return;
+      }
+   }
+  SetTreeAddress();
 
 
+  if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) 
+   {
+     fLoader->MakeTree("S");
+   }
+  
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
+  
   GenerNoise(500000); //create table with noise
   //setup TPCDigitsArray 
 
   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
 
+  
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
   arr->Setup(fTPCParam);
-// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
-  if (gAlice->GetTreeSFile()) {
-    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeSFile());
-  } else {
-    arr->MakeTree(fDigitsFile);
-  }
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeS());
+
   SetDigitsArray(arr);
 
   cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
@@ -1775,23 +1524,24 @@ void AliTPC::Hits2SDigits2(Int_t eventnumber)
 
   fTPCParam->SetZeroSup(0);
 
- for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
-
-
-  // write results
-
-  char treeName[100];
-
-  sprintf(treeName,"TreeS_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
-  
-  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
-  GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave(); 
-
+ for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) 
+  if (IsSectorActive(isec)) 
+   {
+//    cout<<"Sector "<<isec<<" is active\n";
+    Hits2DigitsSector(isec);
+   }
+
+ fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
+
+//this line prevents the crash in the similar one
+//on the beginning of this method
+//destructor attempts to reset the tree, which is deleted by the loader
+//need to be redesign
+ if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
+ SetDigitsArray(0x0);
 }
-
-
-
 //__________________________________________________________________
+
 void AliTPC::Hits2SDigits()  
 { 
 
@@ -1803,7 +1553,20 @@ void AliTPC::Hits2SDigits()
  // Loop over all sectors for a single event
  //----------------------------------------------------
   //MI change - for pp run
-  Int_t eventnumber = gAlice->GetEvNumber();
+//  Int_t eventnumber = gAlice->GetEvNumber();
+//  AliRunLoader* rl = (AliRunLoader*)fLoader->GetEventFolder()->FindObject(AliRunLoader::fgkRunLoaderName);
+//  rl->GetEvent(eventnumber);
+// 12/05/2003 This method is obsolete and not used. It should be redesingned
+// M.Kowalski
+
+  if (fLoader->TreeH() == 0x0)
+   {
+     if(fLoader->LoadHits())
+      {
+        Error("Hits2Digits","Can not load hits.");
+      }
+   }
+  SetTreeAddress();
 
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
   GenerNoise(500000); //create table with noise
@@ -1812,15 +1575,15 @@ void AliTPC::Hits2SDigits()
 
   if(GetDigitsArray()) delete GetDigitsArray();
 
+  if (fLoader->TreeS() == 0x0 ) 
+   {
+     fLoader->MakeTree("S");
+   }
+  
   AliTPCDigitsArray *arr = new AliTPCDigitsArray; 
   arr->SetClass("AliSimDigits");
   arr->Setup(fTPCParam);
-// Note that methods arr->MakeTree have different signatures
-  if (gAlice->GetTreeSFile()) {
-    arr->MakeTree(gAlice->GetTreeSFile());
-  } else {
-    arr->MakeTree(fDigitsFile);
-  }
+  arr->MakeTree(fLoader->TreeS());
   SetDigitsArray(arr);
 
   cerr<<"Digitizing TPC -- summable digits...\n"; 
@@ -1829,19 +1592,13 @@ void AliTPC::Hits2SDigits()
 
   for(Int_t isec=0;isec<fTPCParam->GetNSector();isec++) if (IsSectorActive(isec)) Hits2DigitsSector(isec);
 
-
   // write results
-  char treeName[100];
-
-  sprintf(treeName,"TreeD_%s_%d",fTPCParam->GetTitle(),eventnumber);
-  
-  GetDigitsArray()->GetTree()->SetName(treeName); 
-  GetDigitsArray()->GetTree()->AutoSave(); 
-
+  //
+  cout<<"Why method TPC::Hits2SDigits writes digits and not sdigits? skowron\n";
+  fLoader->WriteDigits("OVERWRITE");
 }
-
-
 //_____________________________________________________________________________
+
 void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 {
   //-------------------------------------------------------------------
@@ -1861,7 +1618,13 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
   if(fDefaults == 0) SetDefaults();
 
-  TTree *tH = gAlice->TreeH(); // pointer to the hits tree
+  TTree *tH = TreeH(); // pointer to the hits tree
+  if (tH == 0x0)
+   {
+     Fatal("Hits2DigitsSector","Can not find TreeH in folder");
+     return;
+   }
+
   Stat_t ntracks = tH->GetEntries();
 
   if( ntracks > 0){
@@ -1889,7 +1652,10 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
 
       Int_t i;
 
-      if (fDigitsArray->GetTree()==0) fDigitsArray->MakeTree(fDigitsFile);
+      if (fDigitsArray->GetTree()==0) 
+       {
+         Fatal("Hits2DigitsSector","Tree not set in fDigitsArray");
+       }
 
       for (i=0;i<nrows;i++){
 
@@ -1900,7 +1666,9 @@ void AliTPC::Hits2DigitsSector(Int_t isec)
        fDigitsArray->StoreRow(isec,i);
 
        Int_t ndig = dig->GetDigitSize(); 
-       if (gDebug > 10) printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
+       
+       if (gDebug > 10) 
+       printf("*** Sector, row, compressed digits %d %d %d ***\n",isec,i,ndig);        
        
         fDigitsArray->ClearRow(isec,i);  
 
@@ -2437,25 +2205,30 @@ void AliTPC::Init()
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
-void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option, const char *file)
+void AliTPC::MakeBranch(Option_t* option)
 {
   //
   // Create Tree branches for the TPC.
   //
+  if(GetDebug()) Info("MakeBranch","");
   Int_t buffersize = 4000;
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s",GetName());
+  
+  const char *h = strstr(option,"H");
 
-  AliDetector::MakeBranch(option,file);
+  if ( h && (fHitType<=1) && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
+  
+  AliDetector::MakeBranch(option);
 
   const char *d = strstr(option,"D");
+  if (fDigits   && fLoader->TreeD() && d) 
+   {
+      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), branchname, &fDigits, buffersize, 0);
+   }   
 
-  if (fDigits   && gAlice->TreeD() && d) {
-      MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
-                       branchname, &fDigits, buffersize, file);
-  }    
-
-  if (fHitType>1) MakeBranch2(option,file); // MI change 14.09.2000
+  if (fHitType>1) MakeBranch2(option,0); // MI change 14.09.2000
 }
  
 //_____________________________________________________________________________
@@ -2478,7 +2251,6 @@ void AliTPC::SetSecAL(Int_t sec)
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
-
   fSecAL = sec;
 }
 
@@ -2492,7 +2264,6 @@ void AliTPC::SetSecAU(Int_t sec)
   //-----------------------------------------------------------------
   // Origin: Marek Kowalski  IFJ, Krakow, Marek.Kowalski@ifj.edu.pl
   //-----------------------------------------------------------------
-
   fSecAU = sec;
 }
 
@@ -2653,7 +2424,6 @@ AliHit(shunt,track)
   fQ          = hits[3];
 }
  
-
 //________________________________________________________________________
 // Additional code because of the AliTPCTrackHitsV2
 
@@ -2663,6 +2433,7 @@ void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char *file)
   // Create a new branch in the current Root Tree
   // The branch of fHits is automatically split
   // MI change 14.09.2000
+  if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","");
   if (fHitType<2) return;
   char branchname[10];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());  
@@ -2670,65 +2441,29 @@ void AliTPC::MakeBranch2(Option_t *option,const char *file)
   // Get the pointer to the header
   const char *cH = strstr(option,"H");
   //
-  if (fTrackHits   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&4) {    
-    //    AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
-    //                                            gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
-    //TBranch * branch = 
-    gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
-                                                  fBufferSize,99);
-
-    // gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
-    if (GetDebug()>1) 
-      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
-    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
-    if (GetDebug())
-      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
-    Publish(folder,&fTrackHits,branchname);
-    if (file) {
-        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
-        TDirectory *wd = gDirectory;
-        b->SetFile(file);
-        TIter next( b->GetListOfBranches());
-        while ((b=(TBranch*)next())) {
-         b->SetFile(file);
-        }
-        wd->cd(); 
-        if (GetDebug()>1) 
-             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
-    }
-  }    
+  if (fTrackHits   && TreeH() && cH && fHitType&4) 
+   {
+    if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","Making branch for Type 4 Hits");
+    TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits,fBufferSize,99);
+   }   
 
-  if (fTrackHitsOld   && gAlice->TreeH() && cH && fHitType&2) {    
+  if (fTrackHitsOld   && TreeH() && cH && fHitType&2) 
+   {    
+    if(GetDebug()) Info("MakeBranch2","Making branch for Type 2 Hits");
     AliObjectBranch * branch = new AliObjectBranch(branchname,"AliTPCTrackHits",&fTrackHitsOld, 
-                                                  gAlice->TreeH(),fBufferSize,99);
-    //TBranch * branch = gAlice->TreeH()->Branch(branchname,"AliTPCTrackHitsV2",&fTrackHits, 
-    //                                                    fBufferSize,99);
-
-    gAlice->TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
-    if (GetDebug()>1) 
-      printf("* AliDetector::MakeBranch * Making Branch %s for trackhits\n",branchname);
-    const char folder [] = "RunMC/Event/Data";
-    if (GetDebug())
-      printf("%15s: Publishing %s to %s\n",ClassName(),branchname,folder);
-    Publish(folder,&fTrackHitsOld,branchname);
-    if (file) {
-        TBranch *b = gAlice->TreeH()->GetBranch(branchname);
-        TDirectory *wd = gDirectory;
-        b->SetFile(file);
-        TIter next( b->GetListOfBranches());
-        while ((b=(TBranch*)next())) {
-         b->SetFile(file);
-        }
-        wd->cd(); 
-        if (GetDebug()>1) 
-             cout << "Diverting branch " << branchname << " to file " << file << endl;  
-    }
-  }    
+                                                   TreeH(),fBufferSize,99);
+    TreeH()->GetListOfBranches()->Add(branch);
+   }   
 }
 
 void AliTPC::SetTreeAddress()
 {
-  if (fHitType<=1) AliDetector::SetTreeAddress();
+//Sets tree address for hits  
+  if (fHitType<=1)
+   {
+     if (fHits == 0x0 ) fHits = new TClonesArray("AliTPChit", 176);//skowron 20.06.03
+     AliDetector::SetTreeAddress();
+   }
   if (fHitType>1) SetTreeAddress2();
 }
 
@@ -2737,28 +2472,40 @@ void AliTPC::SetTreeAddress2()
   //
   // Set branch address for the TrackHits Tree
   // 
+  if(GetDebug()) Info("SetTreeAddress2","");
+  
   TBranch *branch;
   char branchname[20];
   sprintf(branchname,"%s2",GetName());
   //
   // Branch address for hit tree
-  TTree *treeH = gAlice->TreeH();
+  TTree *treeH = TreeH();
   if ((treeH)&&(fHitType&4)) {
     branch = treeH->GetBranch(branchname);
-    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHits);
+    if (branch) 
+     {
+       branch->SetAddress(&fTrackHits);
+       cout<<"AliTPC::SetTreeAddress2 fHitType&4 Setting"<<endl;       
+     }
+    else cout<<"AliTPC::SetTreeAddress2 fHitType&4  Failed"<<endl;
   }
   if ((treeH)&&(fHitType&2)) {
     branch = treeH->GetBranch(branchname);
-    if (branch) branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
+    if (branch) 
+     {
+       branch->SetAddress(&fTrackHitsOld);
+       cout<<"AliTPC::SetTreeAddress2 fHitType&2 Setting"<<endl;       
+     }
+    else cout<<"AliTPC::SetTreeAddress2 fHitType&2  Failed"<<endl;
   }
   //set address to TREETR
-  TTree *treeTR = gAlice->TreeTR();
+
+  TTree *treeTR = TreeTR();
   if (treeTR && fTrackReferences) {
     branch = treeTR->GetBranch(GetName());
     if (branch) branch->SetAddress(&fTrackReferences);
   }
 
-
 }
 
 void AliTPC::FinishPrimary()
@@ -2786,15 +2533,15 @@ void AliTPC::AddHit2(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
   //  cout<<"bad track number\n";
   if (fTrackHits && fHitType&4) 
     fTrackHits->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
-                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+                             hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
   if (fTrackHitsOld &&fHitType&2 ) 
     fTrackHitsOld->AddHitKartez(vol[0],rtrack, hits[0],
-                            hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
+                                hits[1],hits[2],(Int_t)hits[3]);
   
 }
 
 void AliTPC::ResetHits()
-{
+{ 
   if (fHitType&1) AliDetector::ResetHits();
   if (fHitType>1) ResetHits2();
 }
@@ -2831,7 +2578,7 @@ AliHit* AliTPC::FirstHit2(Int_t track)
   // 
   if(track>=0) {
     gAlice->ResetHits();
-    gAlice->TreeH()->GetEvent(track);
+    TreeH()->GetEvent(track);
   }
   //
   if (fTrackHits && fHitType&4) {
@@ -2907,7 +2654,7 @@ Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
   //
   //  return kTRUE;
   if (fTrackHitsOld && fHitType&2) {
-    TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
+    TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fTrackHitsInfo");
     br->GetEvent(track);
     AliObjectArray * ar = fTrackHitsOld->fTrackHitsInfo;
     for (UInt_t j=0;j<ar->GetSize();j++){
@@ -2916,8 +2663,8 @@ Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
   }
 
   if (fTrackHits && fHitType&4) {
-    TBranch * br1 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fVolumes");
-    TBranch * br2 = gAlice->TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
+    TBranch * br1 = TreeH()->GetBranch("fVolumes");
+    TBranch * br2 = TreeH()->GetBranch("fNVolumes");    
     br2->GetEvent(track);
     br1->GetEvent(track);    
     Int_t *volumes = fTrackHits->GetVolumes();
@@ -2931,7 +2678,7 @@ Bool_t   AliTPC::TrackInVolume(Int_t id,Int_t track)
   }
 
   if (fHitType&1) {
-    TBranch * br = gAlice->TreeH()->GetBranch("fSector");
+    TBranch * br = TreeH()->GetBranch("fSector");
     br->GetEvent(track);
     for (Int_t j=0;j<fHits->GetEntriesFast();j++){
       if (  ((AliTPChit*)fHits->At(j))->fSector==id) return kTRUE;
@@ -3267,7 +3014,7 @@ void AliTPC::Digits2Reco(Int_t firstevent,Int_t lastevent)
   for(Int_t iev=firstevent;iev<lastevent+1;iev++){
 
     printf("Processing event %d\n",iev);
-    Digits2Clusters(out,iev);
+    Digits2Clusters(iev);
   }
   cout<<"AliTPC::Digits2Reco - determination of rec points ended"<<endl;
   timer.Stop();
@@ -3278,12 +3025,32 @@ void AliTPC::Digits2Reco(Int_t firstevent,Int_t lastevent)
 
 }
 
+AliLoader* AliTPC::MakeLoader(const char* topfoldername)
+{
+ cout<<"AliTPC::MakeLoader ";
+ fLoader = new AliTPCLoader(GetName(),topfoldername);
+ if (fLoader)
+  {
+   cout<<"Success"<<endl;
+  }
+ else
+  {
+   cout<<"Failure"<<endl;
+  }
+
+ return fLoader;
+}
+
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 AliTPCParam* AliTPC::LoadTPCParam(TFile *file) {
 //
 // load TPC paarmeters from a given file or create new if the object
 // is not found there
-//
+// 12/05/2003 This method should be moved to the AliTPCLoader
+// and one has to decide where to store the TPC parameters
+// M.Kowalski
   char paramName[50];
   sprintf(paramName,"75x40_100x60_150x60");
   AliTPCParam *paramTPC=(AliTPCParam*)file->Get(paramName);