]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPCcalibDButil.h
Removing non-existing classes
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCcalibDButil.h
index 21cc20f1b7a7dcd402e950ddf3b44f705733b16f..c3a3b699efacc5159e42e77c87451072276e2013 100644 (file)
@@ -1,5 +1,5 @@
-#ifndef AliTPCcalibDButil_H
-#define AliTPCcalibDButil_H
+#ifndef ALITPCCALIBDBUTIL_H
+#define ALITPCCALIBDBUTIL_H
 
 /* Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
  * See cxx source for full Copyright notice                               */
 
 #include <TObject.h>
 #include <TArrayI.h>
+#include <TVectorDfwd.h>
+#include <TVectorFfwd.h>
+#include <TMatrixDfwd.h>
 
+class TGraph;
+class TMap;
 class AliDCSSensorArray;
 class AliTPCcalibDB;
 class AliTPCCalPad;
+class AliTPCCalROC;
 class AliTPCmapper;
 class AliTPCCalibRaw;
-class TGraph;
+class AliCDBEntry;
+class AliDCSSensor;
+class AliDCSSensorArray;
+class AliTPCSensorTempArray;
+class AliTPCdataQA;
 class TGraphErrors;
 class TTreeSRedirector;
+class AliTPCCalROC;
+class AliSplineFit;
 
 class AliTPCcalibDButil : public TObject
 {
@@ -32,43 +44,74 @@ public:
   void UpdateFromCalibDB();
   //data processing functions
   void ProcessCEdata(const char* fitFormula, TVectorD &fitResultsA, TVectorD &fitResultsC,
-                     Int_t &noutliersCE, Double_t & chi2A, Double_t &chi2C, AliTPCCalPad *outCE=0);
+                     Int_t &noutliersCE, Double_t & chi2A, Double_t &chi2C, AliTPCCalPad * const outCE=0);
   void ProcessCEgraphs(TVectorD &vecTEntries, TVectorD &vecTMean, TVectorD &vecTRMS, TVectorD &vecTMedian,
                        TVectorD &vecQEntries, TVectorD &vecQMean, TVectorD &vecQRMS, TVectorD &vecQMedian,
                        Float_t &driftTimeA, Float_t &driftTimeC );
   void ProcessNoiseData(TVectorD &vNoiseMean, TVectorD &vNoiseMeanSenRegions,
                         TVectorD &vNoiseRMS, TVectorD &vNoiseRMSSenRegions,
-                        Int_t &nonMaskedZero);
+                        Int_t &nonMaskedZero, Int_t &nNaN);
+  void ProcessQAData(TVectorD &vQaOcc, TVectorD &vQaQtot, TVectorD &vQaQmax);
   void ProcessPulser(TVectorD &vMeanTime);
   void ProcessALTROConfig(Int_t &nMasked);
   void ProcessGoofie(TVectorD & vecEntries, TVectorD & vecMedian, TVectorD &vecMean, TVectorD &vecRMS);
+  
   //processing functions using reference data
   void ProcessPedestalVariations(TVectorF &pedestalDeviations);
   void ProcessNoiseVariations(TVectorF &noiseDeviations);
   void ProcessPulserVariations(TVectorF &pulserQdeviations, Float_t &varQMean, Int_t &npadsOutOneTB, Int_t &npadsOffAdd);
+  
   //getter preprocess information
   Int_t GetNPulserOutliers() const {return fNpulserOutliers;}
-  Float_t GetMeanAltro(const AliTPCCalROC *roc, const Int_t row, const Int_t pad, AliTPCCalROC *rocOut=0x0);
+  Float_t GetMeanAltro(const AliTPCCalROC *roc, const Int_t row, const Int_t pad, AliTPCCalROC * const rocOut=0x0);
   AliTPCCalPad *GetPulserOutlierMap() const {return fPulserOutlier;}
+
+  //getters ref data
+  TMap *GetReferenceMap() const {return fRefMap;}
+  Int_t GetReferenceRun(const char* type) const;
+  const char* GetRefValidity() const {return fRefValidity.Data();}
+  
+  AliTPCCalPad* GetRefPadNoise() const {return fRefPadNoise;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPedestals() const {return fRefPedestals;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPedestalMasked() const {return fRefPedestalMasked;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPulserTmean() const {return fRefPulserTmean;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPulserTrms() const {return fRefPulserTrms;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPulserQmean() const {return fRefPulserQmean;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPulserOutlier() const {return fRefPulserOutlier;}
+  AliTPCCalPad* GetRefPulserMasked() const {return fRefPulserMasked;}
+  AliTPCCalPad* GetRefCETmean() const {return fRefCETmean;}
+  AliTPCCalPad* GetRefCETrms() const {return fRefCETrms;}
+  AliTPCCalPad* GetRefCEQmean() const {return fRefCEQmean;}
+  AliTPCCalPad* GetRefCEMasked() const {return fRefCEMasked;}
+  AliTPCCalPad* GetRefALTROFPED() const {return fRefALTROFPED;}
+  AliTPCCalPad* GetRefALTROZsThr() const {return fRefALTROZsThr;}
+  AliTPCCalPad* GetRefALTROAcqStart() const {return fRefALTROAcqStart;}
+  AliTPCCalPad* GetRefALTROAcqStop() const {return fRefALTROAcqStop;}
+  AliTPCCalPad* GetRefALTROMasked() const {return fRefALTROMasked;}
+  
+  
   //setters for pad by pad information
-  void SetPulserData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
+  void SetPulserData(AliTPCCalPad * const tmean, AliTPCCalPad * const trms=0x0, AliTPCCalPad * const qmean=0x0)
                 {fPulserTmean=tmean; fPulserTrms=trms; fPulserQmean=qmean;}
-  void SetCEData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
+  void SetCEData(AliTPCCalPad *const tmean, AliTPCCalPad *const trms=0x0, AliTPCCalPad *const qmean=0x0)
                 {fCETmean=tmean; fCETrms=trms; fCEQmean=qmean;}
-  void SetNoisePedestal(AliTPCCalPad *noise, AliTPCCalPad *pedestal=0x0)
+  void SetNoisePedestal(AliTPCCalPad *const noise, AliTPCCalPad *const pedestal=0x0)
                 {fPadNoise=noise; fPedestals=pedestal;}
-  void SetALTROData(AliTPCCalPad *masked)
+  void SetALTROData(AliTPCCalPad *const masked)
                 {fALTROMasked=masked;}
-  void SetGoofieArray(AliDCSSensorArray *arr) {fGoofieArray=arr;}
+  void SetGoofieArray(AliDCSSensorArray *const arr) {fGoofieArray=arr;}
+  
   //setters for pad by pad information
   void SetRefFile(const char* filename);
-  void SetRefPulserData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
+  void SetReferenceRun(Int_t run=-1);
+  void UpdateRefDataFromOCDB();
+  void SetRefPulserData(AliTPCCalPad *const tmean, AliTPCCalPad *const trms=0x0, AliTPCCalPad *const qmean=0x0)
                 {fRefPulserTmean=tmean; fRefPulserTrms=trms; fRefPulserQmean=qmean;}
-  void SetRefCEData(AliTPCCalPad *tmean, AliTPCCalPad *trms=0x0, AliTPCCalPad *qmean=0x0)
+  void SetRefCEData(AliTPCCalPad *const tmean, AliTPCCalPad *const trms=0x0, AliTPCCalPad *const qmean=0x0)
                 {fRefCETmean=tmean; fRefCETrms=trms; fRefCEQmean=qmean;}
-  void SetRefNoisePedestal(AliTPCCalPad *noise, AliTPCCalPad *pedestal=0x0)
+  void SetRefNoisePedestal(AliTPCCalPad *const noise, AliTPCCalPad *const pedestal=0x0)
                 {fRefPadNoise=noise; fRefPedestals=pedestal;}
-  void SetRefALTROData(AliTPCCalPad *masked)
+  void SetRefALTROData(AliTPCCalPad *const masked)
                 {fRefALTROMasked=masked;}
   
   //creation of derived pad by pad calibration data
@@ -76,8 +119,8 @@ public:
   //
   // create outlyer maps
   //
-  AliTPCCalPad *CreateCEOutlyerMap(Int_t &noutliersCE, AliTPCCalPad *ceOut=0, Float_t minSignal=10, Float_t cutTrmsMin=0.9, Float_t cutTrmsMax=1.2, Float_t cutMaxDistT=0.7);
-  AliTPCCalPad *CreatePulserOutlyerMap(Int_t &noutliersPulser, AliTPCCalPad *pulserOut=0, Float_t cutTime=3, Float_t cutnRMSQ=5, Float_t cutnRMSrms=5);
+  AliTPCCalPad *CreateCEOutlyerMap(Int_t &noutliersCE, AliTPCCalPad * const ceOut=0, Float_t minSignal=10, Float_t cutTrmsMin=0.9, Float_t cutTrmsMax=1.2, Float_t cutMaxDistT=0.7);
+  AliTPCCalPad *CreatePulserOutlyerMap(Int_t &noutliersPulser, AliTPCCalPad * const pulserOut=0, Float_t cutTime=3, Float_t cutnRMSQ=5, Float_t cutnRMSrms=5);
   //
   AliTPCCalPad *CreatePadTime0CE(TVectorD &fitResultsA, TVectorD&fitResultsC, Int_t &nOut, Double_t &chi2A, Double_t &chi2C, const char *dumpfile=0);
   //
@@ -86,35 +129,55 @@ public:
   void UpdateRefPulserOutlierMap();
   void PulserOutlierMap(AliTPCCalPad *pulOut, const AliTPCCalPad *pulT, const AliTPCCalPad *pulQ);
 
+  const char* GetGUIRefTreeDefaultName();
+  
+  Bool_t CreateGUIRefTree(const char* filename="");
   //
   // graph tools
   //
   static Double_t GetLaserTime0(Int_t run, Int_t timeStamp, Int_t deltaT, Int_t side);
-  static TGraph* FilterGraphMedian(TGraph * graph, Float_t sigmaCut, Double_t &medianY);
+  static TGraph* FilterGraphMedian(TGraph * const graph, Float_t sigmaCut, Double_t &medianY);
   static TGraph* FilterGraphMedianAbs(TGraph * graph, Float_t cut, Double_t &medianY);
   static TGraphErrors* FilterGraphMedianErr(TGraphErrors * graph, Float_t sigmaCut,Double_t &medianY);
   //
   static void Sort(TGraph *graph);
   static void SmoothGraph(TGraph *graph, Double_t delta);
   static Int_t     GetNearest(TGraph *graph, Double_t xref, Double_t &dx, Double_t &y);
-  static Double_t EvalGraphConst(TGraph *graph, Double_t xref);
+  static Double_t EvalGraphConst(TGraph * const graph, Double_t xref);
+  static Double_t EvalGraphConst(AliSplineFit *graph, Double_t xref);
+
   //
   // Filter sensors
   //
   static Float_t FilterSensor(AliDCSSensor * sensor, Double_t ymin, Double_t ymax, Double_t maxdy, Double_t sigmaCut); 
-
-  
-  static void FilterCE(Double_t deltaT=100, Double_t cutAbs=10, Double_t cutSigma=4., TTreeSRedirector *pcstream=0);
-  static void FilterTracks(Int_t run, Double_t cutSigma=20., TTreeSRedirector *pcstream=0);
+  //
+  // Filter AliRelAlignmentKalman - Alignment/Drift velocity
+  //
+  static TMatrixD* MakeStatRelKalman(TObjArray * const array, Float_t minFraction, Int_t minStat, Float_t maxvd);
+  static TObjArray *SmoothRelKalman(TObjArray * const array,const TMatrixD & stat, Bool_t direction, Float_t sigmaCut);
+  static TObjArray *SmoothRelKalman(TObjArray * const arrayP, TObjArray * const arrayM);
+  static void FilterCE(Double_t deltaT=100, Double_t cutAbs=10, Double_t cutSigma=4., TTreeSRedirector * const pcstream=0);
+  static void FilterTracks(Int_t run, Double_t cutSigma=20., TTreeSRedirector * const pcstream=0);
   static Float_t FilterTemperature(AliTPCSensorTempArray *tempArray, Double_t ymin=15, Double_t ymax=22, Double_t sigmaCut=5); 
 
-  void FilterGoofie(AliDCSSensorArray * goofieArray, Double_t deltaT=2, Double_t cutSigma=4., TTreeSRedirector *pcstream=0);
+  static   void FilterGoofie(AliDCSSensorArray * goofieArray, Double_t deltaT=2, Double_t cutSigma=4.,  Double_t minVdn=8.5, Double_t maxVdn=9.05, TTreeSRedirector * const pcstream=0);
   static Double_t  GetTriggerOffsetTPC(Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=86400, Double_t deltaTLaser=3600, Int_t valType=0);
   static Double_t  GetVDriftTPC(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=86400, Double_t deltaTLaser=3600, Int_t valType=0);
   static Double_t  GetVDriftTPCLaserTracks(Double_t &dist,Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
+  static Double_t  GetVDriftTPCLaserTracksOnline(Double_t &dist, Int_t /*run*/, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
   static Double_t  GetVDriftTPCCE(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp, Double_t deltaT=43200, Int_t side=2);
+  static Double_t  GetVDriftTPCITS(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp);
+  static Double_t  GetTime0TPCITS(Double_t &dist, Int_t run, Int_t timeStamp);
   Int_t MakeRunList(Int_t startRun, Int_t stopRun); // find the list of usable runs
   Int_t FindRunTPC(Int_t    itime, Bool_t debug=kFALSE);
+
+ AliTPCCalPad* GetRefCalPad(AliCDBEntry *entry, const char* objName);
+  AliTPCCalPad* GetRefCalPad(AliCDBEntry *entry);
+  AliTPCCalPad* GetAltroMasked(const char* cdbPath, const char* name);
+  Bool_t HasRefChanged(const char *cdbPath);
+  Int_t GetCurrentReferenceRun(const char* type) const;
+  AliCDBEntry* GetRefEntry(const char* cdbPath);
 private:
   AliTPCcalibDB *fCalibDB;            //pointer to calibDB object
   AliTPCCalPad  *fPadNoise;           //noise information
@@ -129,20 +192,34 @@ private:
   AliTPCCalPad  *fALTROMasked;        //ALTRO masked channels information
   //
   AliTPCCalibRaw *fCalibRaw;          //raw calibration object
+  //
+  AliTPCdataQA   *fDataQA;            //data qa
   //reference data
+  TMap *fRefMap;                        // latest map to reference information
+  TMap *fCurrentRefMap;                 // reference data map of entries currently loaded
+  TString fRefValidity;                 // validity range of reference data
+  //  
   AliTPCCalPad  *fRefPadNoise;           //Reference noise information
   AliTPCCalPad  *fRefPedestals;          //Reference pedestal information
+  AliTPCCalPad  *fRefPedestalMasked;     //Reference masked channels in pedestal run
   AliTPCCalPad  *fRefPulserTmean;        //Reference pulser mean time information
   AliTPCCalPad  *fRefPulserTrms;         //Reference pulser rms time information
   AliTPCCalPad  *fRefPulserQmean;        //Reference pulser mean q information
   AliTPCCalPad  *fRefPulserOutlier;      //Reference pulser outlier map
+  AliTPCCalPad  *fRefPulserMasked;       //Reference masked channels in pulser run
   AliTPCCalPad  *fRefCETmean;            //Reference central electrode mean time information
   AliTPCCalPad  *fRefCETrms;             //Reference central electrode rms time information
   AliTPCCalPad  *fRefCEQmean;            //Reference central electrode mean q information
+  AliTPCCalPad  *fRefCEMasked;           //Reference masked channels in laser run
+  AliTPCCalPad  *fRefALTROFPED;          //Reference fixed pedestal value
+  AliTPCCalPad  *fRefALTROZsThr;         //Reference zero suppression threshol
+  AliTPCCalPad  *fRefALTROAcqStart;      //Reference accquistion start time bin
+  AliTPCCalPad  *fRefALTROAcqStop;       //Reference accquistion stop time bin
   AliTPCCalPad  *fRefALTROMasked;        //Reference ALTRO masked channels information
   //
   AliTPCCalibRaw *fRefCalibRaw;          //Reference raw calibration object
-  
+  //
+  AliTPCdataQA   *fRefDataQA;            //Reference data QA
   //
   AliDCSSensorArray* fGoofieArray;    //Goofie Data
   //
@@ -160,15 +237,17 @@ private:
   //
   // filters  
   
-public:
   TArrayI fRuns;                         // run list with OCDB info
   TArrayI fRunsStart;                    // start time for given run
   TArrayI fRunsStop;                     // stop time for given run
-private:
+  
   AliTPCcalibDButil (const AliTPCcalibDButil& );
   AliTPCcalibDButil& operator= (const AliTPCcalibDButil& );
 
-    
+  
+  static Double_t  GetVDriftTPCLaserTracksCommon(Double_t &dist, Int_t timeStamp, Double_t deltaT, Int_t side, TObjArray * const array);
+  
+  
   ClassDef(AliTPCcalibDButil,0)
 };