]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TPC/AliTPCtrackerMI.cxx
Use symetric Mag field
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCtrackerMI.cxx
index ba6c3b411479438f4a4e5cc46626d8d8c41166cd..0b0f2adcc401d8377eb24b47c83aab609fcabf77 100644 (file)
 //                    To enable them set AliTPCReconstructor::SetStreamLevel(n); where nis bigger 1
 //
 
+//
+// Adding systematic errors to the covariance:
+// 
+// The systematic errors due to the misalignment and miscalibration are added to the covariance matrix
+// of the tracks (not to the clusters as they are dependent):
+// The parameters form AliTPCRecoParam are used AliTPCRecoParam::GetSystematicError
+// The systematic errors are expressed there in RMS - position (cm), angle (rad), curvature (1/cm)
+// The default values are 0. 
+//
+// The sytematic errors are added to the covariance matrix in following places:
+//
+// 1. During fisrt itteration - AliTPCtrackerMI::FillESD
+// 2. Second iteration - 
+//      2.a ITS->TPC   - AliTPCtrackerMI::ReadSeeds 
+//      2.b TPC->TRD   - AliTPCtrackerMI::PropagateBack
+// 3. Third iteration  -
+//      3.a TRD->TPC   - AliTPCtrackerMI::ReadSeeds
+//      3.b TPC->ITS   - AliTPCtrackerMI::RefitInward
+//
+// There are several places in the code which can be numerically debuged
+// This code is keeped in order to enable code development and to check the calibration implementtion
+//
+//      1. ErrParam stream (Log level 9) - dump information about 
+//         1.a) cluster
+//         2.a) cluster error estimate
+//         3.a) cluster shape estimate
+//
+//
 //-------------------------------------------------------
 
 
 #include "AliTPCReconstructor.h"
 #include "AliTPCpolyTrack.h"
 #include "AliTPCreco.h"
-#include "AliTPCseed.h" 
+#include "AliTPCseed.h"
+
+#include "AliTPCtrackerSector.h" 
 #include "AliTPCtrackerMI.h"
 #include "TStopwatch.h"
 #include "AliTPCReconstructor.h"
 #include "TRandom.h"
 #include "AliTPCcalibDB.h"
 #include "AliTPCTransform.h"
+#include "AliTPCClusterParam.h"
 
 //
 
 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
 
 
+
 class AliTPCFastMath {
 public:
   AliTPCFastMath();  
@@ -233,10 +265,10 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
 
   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->GetCurrentCluster());
   //
-  track->SetErrorY2(track->GetErrorY2()*1.3);
-  track->SetErrorY2(track->GetErrorY2()+0.01);    
-  track->SetErrorZ2(track->GetErrorZ2()*1.3);   
-  track->SetErrorZ2(track->GetErrorZ2()+0.005);      
+//   track->SetErrorY2(track->GetErrorY2()*1.3);
+//   track->SetErrorY2(track->GetErrorY2()+0.01);    
+//   track->SetErrorZ2(track->GetErrorZ2()*1.3);   
+//   track->SetErrorZ2(track->GetErrorZ2()+0.005);      
     //}
   if (accept>0) return 0;
   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
@@ -252,16 +284,13 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
 
 
 
-Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor, 
-                                      Float_t cory, Float_t corz)
+Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster)
 {
   //
   // decide according desired precision to accept given 
   // cluster for tracking
-  Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
-  Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
-  //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
-  //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
+  Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster);
+  Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster);
   
   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
@@ -274,17 +303,50 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluste
   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
   //Int_t  accept =0;
   
+  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>5 && seed->GetNumberOfClusters()>20) {
+    Float_t rmsy2 = seed->GetCurrentSigmaY2();
+    Float_t rmsz2 = seed->GetCurrentSigmaZ2();
+    Float_t rmsy2p30 = seed->GetCMeanSigmaY2p30();
+    Float_t rmsz2p30 = seed->GetCMeanSigmaZ2p30();
+    Float_t rmsy2p30R  = seed->GetCMeanSigmaY2p30R();
+    Float_t rmsz2p30R  = seed->GetCMeanSigmaZ2p30R();
+
+    AliExternalTrackParam param(*seed); 
+    static TVectorD gcl(3),gtr(3);
+    Float_t gclf[3];
+    param.GetXYZ(gcl.GetMatrixArray());
+    cluster->GetGlobalXYZ(gclf);
+    gcl[0]=gclf[0];    gcl[1]=gclf[1];    gcl[2]=gclf[2];
+    
+    if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>0) {
+    (*fDebugStreamer)<<"ErrParam"<<
+      "Cl.="<<cluster<<
+      "T.="<<&param<<
+      "gcl.="<<&gcl<<
+      "gtr.="<<&gtr<<
+      "erry2="<<sy2<<
+      "errz2="<<sz2<<
+      "rmsy2="<<rmsy2<<
+      "rmsz2="<<rmsz2<<        
+      "rmsy2p30="<<rmsy2p30<<
+      "rmsz2p30="<<rmsz2p30<<  
+      "rmsy2p30R="<<rmsy2p30R<<
+      "rmsz2p30R="<<rmsz2p30R<<        
+      "\n";
+    }
+  }
+  
   if (rdistance2>16) return 3;
   
   
-  if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)  
+  if ((rdistancey2>9. || rdistancez2>9.) && cluster->GetType()==0)  
     return 2;  //suspisiouce - will be changed
   
-  if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)  
+  if ((rdistancey2>6.25 || rdistancez2>6.25) && cluster->GetType()>0)  
     // strict cut on overlaped cluster
     return  2;  //suspisiouce - will be changed
   
-  if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor ) 
+  if ( (rdistancey2>1. || rdistancez2>6.25 ) 
        && cluster->GetType()<0){
     seed->SetNFoundable(seed->GetNFoundable()-1);
     return 2;    
@@ -320,8 +382,8 @@ AliTracker(),
   //---------------------------------------------------------------------
   // The main TPC tracker constructor
   //---------------------------------------------------------------------
-  fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];         
-  fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
+  fInnerSec=new AliTPCtrackerSector[fkNIS];         
+  fOuterSec=new AliTPCtrackerSector[fkNOS];
  
   Int_t i;
   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
@@ -345,7 +407,9 @@ AliTracker(),
     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
   }
 
-  fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
+  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>0) {
+    fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
+  }
 }
 //________________________________________________________________________
 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
@@ -394,68 +458,6 @@ AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
   if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
 }
 
-void AliTPCtrackerMI::SetIO()
-{
-  //
-  fNewIO   =  kTRUE;
-  fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
-  
-  fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
-  if (fOutput){
-    AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
-    fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
-    delete iotrack;
-  }
-}
-
-
-void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESDEvent * event)
-{
-
-  // set input
-  fNewIO = kFALSE;
-  fInput    = 0;
-  fOutput   = 0;
-  fSeedTree = 0;
-  fTreeDebug =0;
-  fInput = input;
-  if (input==0){
-    return;
-  }  
-  //set output
-  fOutput = output;
-  if (output){
-    AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
-    //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
-    //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");    
-    fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
-    delete iotrack;
-  }
-  if (output && (fDebug&2)){
-    //write the full seed information if specified in debug mode
-    //
-    fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
-    AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
-    //
-    TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
-    arrtr->ExpandCreateFast(160);
-    TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
-    //
-    vseed->SetPoints(arrtr);
-    vseed->SetEPoints(arre);
-    //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
-    fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
-    delete arrtr;
-    delete arre;    
-    fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
-    TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
-    fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
-  }
-
-
-  //set ESD event  
-  fEvent  = event;  
-}
 
 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
 {
@@ -471,6 +473,12 @@ void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
       if (!pt) continue; 
       pt->UpdatePoints();
+      AddCovariance(pt);
+      if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
+       (*fDebugStreamer)<<"Track0"<<
+         "Tr0.="<<pt<<
+         "\n";       
+      }
       //      pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
       if (pt->GetKinkIndex(0)<=0){  //don't propagate daughter tracks 
        pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
@@ -575,226 +583,154 @@ void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
   printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
 }
 
-void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
-{
-  //
-  // write tracks from seed array to selected tree
-  //
-  fOutput  = tree;
-  if (fOutput){
-    AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
-    fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
-  }
-  WriteTracks();
-}
 
-void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
-{
-  //
-  // write tracks to the given output tree -
-  // output specified with SetIO routine
-  if (!fSeeds)  return;
-  if (!fOutput){
-    SetIO();
-  }
-
-  if (fOutput){
-    AliTPCtrack *iotrack= 0;
-    Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
-    //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
-    //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
-    //  if (iotrack) break;      
-    //}    
-    //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
-    TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
-    br->SetAddress(&iotrack);
-    //
-    for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
-      AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
-      if (!pt) continue;    
-      AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
-      iotrack = track;
-      pt->SetLab2(i); 
-      //      br->SetAddress(&iotrack);
-      fOutput->Fill();
-      delete track;
-      iotrack =0;
-    }
-    //fOutput->GetDirectory()->cd();
-    //fOutput->Write();
-  }
-  // delete iotrack;
-  //
-  if (fSeedTree){
-    //write the full seed information if specified in debug mode
-      
-    AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
-    //
-    TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
-    arrtr->ExpandCreateFast(160);
-    //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
-    //arrcl->ExpandCreateFast(160);
-    TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
-    //
-    vseed->SetPoints(arrtr);
-    vseed->SetEPoints(arre);
-    //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
-    //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
-    TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
-    
-    Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
-    
-    for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
-      AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
-      if (!pt) continue;     
-      pt->SetPoints(arrtr);
-      //      pt->fClusterPoints = arrcl;
-      pt->SetEPoints(arre);
-      pt->RebuildSeed();
-      vseed = pt;
-      brseed->SetAddress(&vseed);
-      fSeedTree->Fill();
-      pt->SetPoints(0);
-      pt->SetEPoints(0);
-      //      pt->fClusterPoints = 0;
-    }
-    fSeedTree->Write();
-    if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
-  }
-
-}
-  
 
 
 
 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
   //
   //
-  //seed->SetErrorY2(0.1);
-  //return 0.1;
-  //calculate look-up table at the beginning
-  static Bool_t  ginit = kFALSE;
-  static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
-  static Float_t ggg1[10000];
-  static Float_t ggg2[10000];
-  static Float_t ggg3[10000];
-  static Float_t glandau1[10000];
-  static Float_t glandau2[10000];
-  static Float_t glandau3[10000];
-  //
-  static Float_t gcor01[500];
-  static Float_t gcor02[500];
-  static Float_t gcorp[500];
-  //
-
-  //
-  if (ginit==kFALSE){
-    for (Int_t i=1;i<500;i++){
-      Float_t rsigma = float(i)/100.;
-      gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
-      gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
-      gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
-    }
-
-    //
-    for (Int_t i=3;i<10000;i++){
-      //
-      //
-      // inner sector
-      Float_t amp = float(i);
-      Float_t padlength =0.75;
-      gnoise1 = 0.0004/padlength;
-      Float_t nel     = 0.268*amp;
-      Float_t nprim   = 0.155*amp;
-      ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
-      glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-      if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
-      glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
-      //
-      // outer short
-      padlength =1.;
-      gnoise2   = 0.0004/padlength;
-      nel       = 0.3*amp;
-      nprim     = 0.133*amp;
-      ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
-      glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-      if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
-      glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
-      //
-      //
-      // outer long
-      padlength =1.5;
-      gnoise3   = 0.0004/padlength;
-      nel       = 0.3*amp;
-      nprim     = 0.133*amp;
-      ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
-      glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-      if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
-      glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
-      //
-    }
-    ginit = kTRUE;
-  }
-  //
+  // Use calibrated cluster error from OCDB
   //
+  AliTPCClusterParam * clparam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
   //
-  Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
-  if (amp>9999) {
-    seed->SetErrorY2(1.);
-    return 1.;
-  }
-  Float_t snoise2;
   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ()));
   Int_t ctype = cl->GetType();  
-  Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetRow());
-  Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
-  angle2 = angle2/(1-angle2); 
-  //
-  //cluster "quality"
-  Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->GetCurrentSigmaY2()));
-  Float_t res;
-  //
-  if (fSectors==fInnerSec){
-    snoise2 = gnoise1;
-    res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
-    if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
-    if ((ctype>0)){
-      res+=0.002;
-      res*= gcorp[rsigmay];
-    }
-  }
-  else {
-    if (padlength<1.1){
-      snoise2 = gnoise2;
-      res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
-      if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];      
-      if ((ctype>0)){
-       res+=0.002;
-       res*= gcorp[rsigmay];
-      }
-    }
-    else{
-      snoise2 = gnoise3;      
-      res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
-      if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
-      if ((ctype>0)){
-       res+=0.002;
-       res*= gcorp[rsigmay];
-      }
-    }
-  }  
+  Int_t    type = (cl->GetRow()<63) ? 0: (cl->GetRow()>126) ? 1:2;
+  Double_t angle = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
+  angle = TMath::Sqrt(TMath::Abs(angle/(1.-angle)));
+  Double_t erry2 = clparam->GetError0Par(0,type, z,angle);
+  if (ctype<0) {
+    erry2+=0.5;  // edge cluster
+  }
+  erry2*=erry2;
+  seed->SetErrorY2(erry2);
+  //
+  return erry2;
+
+//calculate look-up table at the beginning
+//   static Bool_t  ginit = kFALSE;
+//   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
+//   static Float_t ggg1[10000];
+//   static Float_t ggg2[10000];
+//   static Float_t ggg3[10000];
+//   static Float_t glandau1[10000];
+//   static Float_t glandau2[10000];
+//   static Float_t glandau3[10000];
+//   //
+//   static Float_t gcor01[500];
+//   static Float_t gcor02[500];
+//   static Float_t gcorp[500];
+//   //
 
-  if (ctype<0){
-    res+=0.005;
-    res*=2.4;  // overestimate error 2 times
-  }
-  res+= snoise2;
+//   //
+//   if (ginit==kFALSE){
+//     for (Int_t i=1;i<500;i++){
+//       Float_t rsigma = float(i)/100.;
+//       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
+//       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
+//       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
+//     }
+
+//     //
+//     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
+//       //
+//       //
+//       // inner sector
+//       Float_t amp = float(i);
+//       Float_t padlength =0.75;
+//       gnoise1 = 0.0004/padlength;
+//       Float_t nel     = 0.268*amp;
+//       Float_t nprim   = 0.155*amp;
+//       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
+//       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
+//       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
+//       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
+//       //
+//       // outer short
+//       padlength =1.;
+//       gnoise2   = 0.0004/padlength;
+//       nel       = 0.3*amp;
+//       nprim     = 0.133*amp;
+//       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
+//       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
+//       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
+//       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
+//       //
+//       //
+//       // outer long
+//       padlength =1.5;
+//       gnoise3   = 0.0004/padlength;
+//       nel       = 0.3*amp;
+//       nprim     = 0.133*amp;
+//       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
+//       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
+//       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
+//       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
+//       //
+//     }
+//     ginit = kTRUE;
+//   }
+//   //
+//   //
+//   //
+//   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
+//   if (amp>9999) {
+//     seed->SetErrorY2(1.);
+//     return 1.;
+//   }
+//   Float_t snoise2;
+//   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ()));
+//   Int_t ctype = cl->GetType();  
+//   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetRow());
+//   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
+//   angle2 = angle2/(1-angle2); 
+//   //
+//   //cluster "quality"
+//   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->GetCurrentSigmaY2()));
+//   Float_t res;
+//   //
+//   if (fSectors==fInnerSec){
+//     snoise2 = gnoise1;
+//     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
+//     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
+//     if ((ctype>0)){
+//       res+=0.002;
+//       res*= gcorp[rsigmay];
+//     }
+//   }
+//   else {
+//     if (padlength<1.1){
+//       snoise2 = gnoise2;
+//       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
+//       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];      
+//       if ((ctype>0)){
+//     res+=0.002;
+//     res*= gcorp[rsigmay];
+//       }
+//     }
+//     else{
+//       snoise2 = gnoise3;      
+//       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
+//       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
+//       if ((ctype>0)){
+//     res+=0.002;
+//     res*= gcorp[rsigmay];
+//       }
+//     }
+//   }  
+
+//   if (ctype<0){
+//     res+=0.005;
+//     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
+//   }
+//   res+= snoise2;
  
-  if (res<2*snoise2)
-    res = 2*snoise2;
+//   if (res<2*snoise2)
+//     res = 2*snoise2;
   
-  seed->SetErrorY2(res);
-  return res;
+//   seed->SetErrorY2(res);
+//   return res;
 
 
 }
@@ -804,216 +740,160 @@ Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
   //
   //
-  //seed->SetErrorY2(0.1);
-  //return 0.1;
-  //calculate look-up table at the beginning
-  static Bool_t  ginit = kFALSE;
-  static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
-  static Float_t ggg1[10000];
-  static Float_t ggg2[10000];
-  static Float_t ggg3[10000];
-  static Float_t glandau1[10000];
-  static Float_t glandau2[10000];
-  static Float_t glandau3[10000];
-  //
-  static Float_t gcor01[1000];
-  static Float_t gcor02[1000];
-  static Float_t gcorp[1000];
-  //
-
-  //
-  if (ginit==kFALSE){
-    for (Int_t i=1;i<1000;i++){
-      Float_t rsigma = float(i)/100.;
-      gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
-      gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
-      gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
-    }
-
-    //
-    for (Int_t i=3;i<10000;i++){
-      //
-      //
-      // inner sector
-      Float_t amp = float(i);
-      Float_t padlength =0.75;
-      gnoise1 = 0.0004/padlength;
-      Float_t nel     = 0.268*amp;
-      Float_t nprim   = 0.155*amp;
-      ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
-      glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-      if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
-      glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
-      //
-      // outer short
-      padlength =1.;
-      gnoise2   = 0.0004/padlength;
-      nel       = 0.3*amp;
-      nprim     = 0.133*amp;
-      ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
-      glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-      if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
-      glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
-      //
-      //
-      // outer long
-      padlength =1.5;
-      gnoise3   = 0.0004/padlength;
-      nel       = 0.3*amp;
-      nprim     = 0.133*amp;
-      ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
-      glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-      if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
-      glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
-      //
-    }
-    ginit = kTRUE;
-  }
-  //
+  // Use calibrated cluster error from OCDB
   //
+  AliTPCClusterParam * clparam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
   //
-  Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
-  if (amp>9999) {
-    seed->SetErrorY2(1.);
-    return 1.;
-  }
-  Float_t snoise2;
   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ()));
   Int_t ctype = cl->GetType();  
-  Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetRow());
+  Int_t    type = (cl->GetRow()<63) ? 0: (cl->GetRow()>126) ? 1:2;
   //
   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
-  //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2)); 
-  //
-  //cluster "quality"
-  Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->GetCurrentSigmaZ2()));
-  Float_t res;
-  //
-  if (fSectors==fInnerSec){
-    snoise2 = gnoise1;
-    res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
-    if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
-    if ((ctype>0)){
-      res+=0.002;
-      res*= gcorp[rsigmaz];
-    }
-  }
-  else {
-    if (padlength<1.1){
-      snoise2 = gnoise2;
-      res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
-      if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];      
-      if ((ctype>0)){
-       res+=0.002;
-       res*= gcorp[rsigmaz];
-      }
-    }
-    else{
-      snoise2 = gnoise3;      
-      res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
-      if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
-      if ((ctype>0)){
-       res+=0.002;
-       res*= gcorp[rsigmaz];
-      }
-    }
-  }  
-
-  if (ctype<0){
-    res+=0.002;
-    res*=1.3;
-  }
-  if ((ctype<0) &&amp<70){
-    res+=0.002;
-    res*=1.3;  
-  }
-  res += snoise2;
-  if (res<2*snoise2)
-     res = 2*snoise2;
-  if (res>3) res =3;
-  seed->SetErrorZ2(res);
-  return res;
-}
-
-
-
-/*
-Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
-  //
-  //
-  //seed->SetErrorZ2(0.1);
-  //return 0.1;
-
-  Float_t snoise2;
-  Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ()));
-  //
-  Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
-  Int_t ctype = cl->GetType();
-  Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
-  
-  Float_t nel;
-  Float_t nprim;
-  //
-  Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
-  Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
-  Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
-  if (fSectors==fInnerSec){
-    snoise2 = 0.0004/padlength;
-    nel     = 0.268*amp;
-    nprim   = 0.155*amp;
-    gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
-    landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-    if (landau>1) landau=1;
+  Double_t angle = TMath::Sqrt(TMath::Abs(angle2));
+  Double_t errz2 = clparam->GetError0Par(1,type, z,angle);
+  if (ctype<0) {
+    errz2+=0.5;  // edge cluster
   }
-  else {
-    snoise2 = 0.0004/padlength;
-    nel     = 0.3*amp;
-    nprim   = 0.133*amp;
-    gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
-    landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
-    if (landau>1) landau=1;
-  }
-  Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
-
+  errz2*=errz2;
+  seed->SetErrorZ2(errz2);
   //
-  Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
-  angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
-  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
-  //angle2 = 1;
+  return errz2;
 
-  Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
-  Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
-  Float_t res = sdiff + angular;
 
-  
-  if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
-    res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
 
-  if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
-    res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
-  
-  if ((ctype>0)){
-    res+=0.005;
-    res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
-  }
-  if (ctype<0){
-    res+=0.002;
-    res*=1.3;
-  }
-  if ((ctype<0) &&amp<70){
-    res+=0.002;
-    res*=1.3;  
-  }
-  res += snoise2;
-  if (res<2*snoise2)
-     res = 2*snoise2;
+//   //seed->SetErrorY2(0.1);
+//   //return 0.1;
+//   //calculate look-up table at the beginning
+//   static Bool_t  ginit = kFALSE;
+//   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
+//   static Float_t ggg1[10000];
+//   static Float_t ggg2[10000];
+//   static Float_t ggg3[10000];
+//   static Float_t glandau1[10000];
+//   static Float_t glandau2[10000];
+//   static Float_t glandau3[10000];
+//   //
+//   static Float_t gcor01[1000];
+//   static Float_t gcor02[1000];
+//   static Float_t gcorp[1000];
+//   //
 
-  seed->SetErrorZ2(res);
-  return res;
+//   //
+//   if (ginit==kFALSE){
+//     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
+//       Float_t rsigma = float(i)/100.;
+//       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
+//       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
+//       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
+//     }
+
+//     //
+//     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
+//       //
+//       //
+//       // inner sector
+//       Float_t amp = float(i);
+//       Float_t padlength =0.75;
+//       gnoise1 = 0.0004/padlength;
+//       Float_t nel     = 0.268*amp;
+//       Float_t nprim   = 0.155*amp;
+//       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
+//       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
+//       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
+//       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
+//       //
+//       // outer short
+//       padlength =1.;
+//       gnoise2   = 0.0004/padlength;
+//       nel       = 0.3*amp;
+//       nprim     = 0.133*amp;
+//       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
+//       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
+//       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
+//       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
+//       //
+//       //
+//       // outer long
+//       padlength =1.5;
+//       gnoise3   = 0.0004/padlength;
+//       nel       = 0.3*amp;
+//       nprim     = 0.133*amp;
+//       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
+//       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
+//       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
+//       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
+//       //
+//     }
+//     ginit = kTRUE;
+//   }
+//   //
+//   //
+//   //
+//   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
+//   if (amp>9999) {
+//     seed->SetErrorY2(1.);
+//     return 1.;
+//   }
+//   Float_t snoise2;
+//   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ()));
+//   Int_t ctype = cl->GetType();  
+//   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetRow());
+//   //
+//   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
+//   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
+//   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2)); 
+//   //
+//   //cluster "quality"
+//   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->GetCurrentSigmaZ2()));
+//   Float_t res;
+//   //
+//   if (fSectors==fInnerSec){
+//     snoise2 = gnoise1;
+//     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
+//     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
+//     if ((ctype>0)){
+//       res+=0.002;
+//       res*= gcorp[rsigmaz];
+//     }
+//   }
+//   else {
+//     if (padlength<1.1){
+//       snoise2 = gnoise2;
+//       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
+//       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];      
+//       if ((ctype>0)){
+//     res+=0.002;
+//     res*= gcorp[rsigmaz];
+//       }
+//     }
+//     else{
+//       snoise2 = gnoise3;      
+//       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
+//       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
+//       if ((ctype>0)){
+//     res+=0.002;
+//     res*= gcorp[rsigmaz];
+//       }
+//     }
+//   }  
+
+//   if (ctype<0){
+//     res+=0.002;
+//     res*=1.3;
+//   }
+//   if ((ctype<0) &&amp<70){
+//     res+=0.002;
+//     res*=1.3;  
+//   }
+//   res += snoise2;
+//   if (res<2*snoise2)
+//      res = 2*snoise2;
+//   if (res>3) res =3;
+//   seed->SetErrorZ2(res);
+//   return res;
 }
-*/
+
 
 
 
@@ -1212,6 +1092,117 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
   return LoadClusters();
 }
 
+
+Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters(TObjArray *arr)
+{
+  //
+  // load clusters to the memory
+  AliTPCClustersRow *clrow = 0x0; 
+  Int_t lower   = arr->LowerBound();
+  Int_t entries = arr->GetEntriesFast();
+
+  for (Int_t i=lower; i<entries; i++) {
+    clrow = (AliTPCClustersRow*) arr->At(i);
+       if(!clrow) continue;
+       if(!clrow->GetArray()) continue;
+
+    //  
+    Int_t sec,row;
+    fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
+
+    for (Int_t icl=0; icl<clrow->GetArray()->GetEntriesFast(); icl++){
+      Transform((AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(icl)));
+    }
+    //
+    if (clrow->GetArray()->GetEntriesFast()<=0) continue;
+    AliTPCtrackerRow * tpcrow=0;
+    Int_t left=0;
+    if (sec<fkNIS*2){
+      tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);    
+      left = sec/fkNIS;
+    }
+    else{
+      tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
+      left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
+    }
+    if (left ==0){
+      tpcrow->SetN1(clrow->GetArray()->GetEntriesFast());
+      tpcrow->SetClusters1(new AliTPCclusterMI[tpcrow->GetN1()]);
+      for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN1();i++) 
+       tpcrow->SetCluster1(i, *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i)));
+    }
+    if (left ==1){
+      tpcrow->SetN2(clrow->GetArray()->GetEntriesFast());
+      tpcrow->SetClusters2(new AliTPCclusterMI[tpcrow->GetN2()]);
+      for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN2();i++) 
+       tpcrow->SetCluster2(i,*(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i)));
+    }
+  }
+  //
+  delete clrow;
+  LoadOuterSectors();
+  LoadInnerSectors();
+  return 0;
+}
+
+Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters(TClonesArray *arr)
+{
+  //
+  // load clusters to the memory from one 
+  // TClonesArray
+  //
+  AliTPCclusterMI *clust=0;
+  Int_t count[72][96] = { {0} , {0} }; 
+
+  // loop over clusters
+  for (Int_t icl=0; icl<arr->GetEntriesFast(); icl++) {
+    clust = (AliTPCclusterMI*)arr->At(icl);
+    if(!clust) continue;
+    //printf("cluster: det %d, row %d \n", clust->GetDetector(),clust->GetRow());
+
+    // transform clusters
+    Transform(clust);
+
+    // count clusters per pad row
+    count[clust->GetDetector()][clust->GetRow()]++;
+  }
+
+  // insert clusters to sectors
+  for (Int_t icl=0; icl<arr->GetEntriesFast(); icl++) {
+    clust = (AliTPCclusterMI*)arr->At(icl);
+    if(!clust) continue;
+
+    Int_t sec = clust->GetDetector();
+    Int_t row = clust->GetRow();
+
+    // filter overlapping pad rows needed by HLT
+    if(sec<fkNIS*2) { //IROCs
+     if(row == 30) continue;
+    }
+    else { // OROCs
+      if(row == 27 || row == 76) continue;
+    }
+
+    Int_t left=0;
+    if (sec<fkNIS*2){
+      left = sec/fkNIS;
+      fInnerSec[sec%fkNIS].InsertCluster(clust, count[sec][row], fParam);    
+    }
+    else{
+      left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
+      fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS].InsertCluster(clust, count[sec][row], fParam);
+    }
+  }
+
+  // Load functions must be called behind LoadCluster(TClonesArray*)
+  // needed by HLT
+  //LoadOuterSectors();
+  //LoadInnerSectors();
+
+  return 0;
+}
+
+
 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
 {
   //
@@ -1237,7 +1228,7 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
       Transform((AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(icl)));
     }
     //
-    AliTPCRow * tpcrow=0;
+    AliTPCtrackerRow * tpcrow=0;
     Int_t left=0;
     if (sec<fkNIS*2){
       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);    
@@ -1276,7 +1267,7 @@ void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
-      AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
+      AliTPCtrackerRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
       //      if (tpcrow){
       //       if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
       //       if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
@@ -1287,7 +1278,7 @@ void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
   nrows = fInnerSec->GetNRows();
   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
-      AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
+      AliTPCtrackerRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
       //if (tpcrow){
       //       if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
@@ -1298,6 +1289,32 @@ void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
   return ;
 }
 
+void AliTPCtrackerMI::FillClusterArray(TObjArray* array) const{
+  //
+  // Filling cluster to the array - For visualization purposes
+  //
+  Int_t nrows=0;
+  nrows = fOuterSec->GetNRows();
+  for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
+    for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
+      AliTPCtrackerRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
+      if (!tpcrow) continue;
+      for (Int_t icl = 0;icl<tpcrow->GetN();icl++){
+       array->AddLast((TObject*)((*tpcrow)[icl]));
+      }
+    } 
+  nrows = fInnerSec->GetNRows();
+  for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
+    for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
+      AliTPCtrackerRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
+      if (!tpcrow) continue;
+      for (Int_t icl = 0;icl<tpcrow->GetN();icl++){
+       array->AddLast((TObject*)(*tpcrow)[icl]);
+      }
+    }
+}
+
+
 void   AliTPCtrackerMI::Transform(AliTPCclusterMI * cluster){
   //
   //
@@ -1309,21 +1326,26 @@ void   AliTPCtrackerMI::Transform(AliTPCclusterMI * cluster){
   Double_t x[3]={cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),cluster->GetTimeBin()};
   Int_t i[1]={cluster->GetDetector()};
   transform->Transform(x,i,0,1);  
-  if (!AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetBYMirror()){
-    if (cluster->GetDetector()%36>17){
-      x[1]*=-1;
-    }
-  }
+  //  if (cluster->GetDetector()%36>17){
+  //  x[1]*=-1;
+  //}
 
   //
   // in debug mode  check the transformation
   //
-  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>-1) {
+  if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
+    Float_t gx[3];
+    cluster->GetGlobalXYZ(gx);
+    Int_t event = (fEvent==NULL)? 0: fEvent->GetEventNumberInFile();
     TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
     cstream<<"Transform"<<
+      "event="<<event<<
       "x0="<<x[0]<<
       "x1="<<x[1]<<
       "x2="<<x[2]<<
+      "gx0="<<gx[0]<<
+      "gx1="<<gx[1]<<
+      "gx2="<<gx[2]<<
       "Cl.="<<cluster<<
       "\n"; 
   }
@@ -1358,7 +1380,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
   UInt_t index=0;
   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
-      AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);  
+      AliTPCtrackerRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);  
       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
       //left
       Int_t ncl = tpcrow->GetN1();
@@ -1406,7 +1428,7 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
   UInt_t index=0;
   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
-      AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
+      AliTPCtrackerRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
       //
       //left
       Int_t ncl = tpcrow->GetN1();
@@ -1458,7 +1480,7 @@ AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16; 
   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
 
-  const AliTPCRow * tpcrow=0;
+  const AliTPCtrackerRow * tpcrow=0;
   AliTPCclusterMI * clrow =0;
 
   if (sec<0 || sec>=fkNIS*4) {
@@ -1537,7 +1559,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
       //
       t.SetCurrentCluster(cl); 
       t.SetRow(nr);
-      Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.GetCurrentCluster(),1.);
+      Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.GetCurrentCluster());
       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
       if (accept<3) { 
        //if founded cluster is acceptible
@@ -1595,7 +1617,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
   
   if (!isActive || !isActive2) return 0;
 
-  const AliTPCRow &krow=GetRow(t.GetRelativeSector(),nr);
+  const AliTPCtrackerRow &krow=GetRow(t.GetRelativeSector(),nr);
   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
   Double_t  roady  =1.;
   Double_t  roadz = 1.;
@@ -1622,7 +1644,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
     t.SetCurrentCluster(cl); 
     t.SetRow(nr);
     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0; 
-    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.GetCurrentCluster(),1.);
+    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.GetCurrentCluster());
     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
       t.SetErrorY2(t.GetErrorY2()+0.03);
       t.SetErrorZ2(t.GetErrorZ2()+0.03); 
@@ -1680,8 +1702,8 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
     t.GetProlongation(x,y,z);
   }
   //
-  // update current shape info every 3 pad-row
-  if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.GetCurrentSigmaY2()<0.0001) ){
+  // update current shape info every 2 pad-row
+  if ( (nr%2==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.GetCurrentSigmaY2()<0.0001) ){
     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
     GetShape(&t,nr);
@@ -1692,7 +1714,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
   
   
   //Int_t nr2 = nr;
-  const AliTPCRow &krow=GetRow(t.GetRelativeSector(),nr);
+  const AliTPCtrackerRow &krow=GetRow(t.GetRelativeSector(),nr);
   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
   Double_t  roady  =1.;
   Double_t  roadz = 1.;
@@ -1718,7 +1740,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
 
   if (cl) {
     t.SetCurrentCluster(cl); 
-    //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);        
+    //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster);        
     //if (accept<3){
       t.SetClusterIndex2(row,index);
       t.SetClusterPointer(row, cl);
@@ -1834,7 +1856,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
   }
   //AliInfo(Form("A - Sector%d phi %f - alpha %f", t.fRelativeSector,y/x, t.GetAlpha()));
 
-  AliTPCRow &krow=GetRow(t.GetRelativeSector(),nr);
+  AliTPCtrackerRow &krow=GetRow(t.GetRelativeSector(),nr);
 
   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.GetDeadZone()){
     t.SetInDead(kTRUE);
@@ -1849,7 +1871,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
     }
 
   // update current
-  if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
+  if ( (nr%2==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
     GetShape(&t,nr);
@@ -1899,7 +1921,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
 
   if (t.GetCurrentCluster()) {
     t.SetRow(nr); 
-    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.GetCurrentCluster(),1.);
+    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.GetCurrentCluster());
     
     if (t.GetCurrentCluster()->IsUsed(10)){
       //
@@ -2620,6 +2642,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event)
 
     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
     seed->UpdatePoints();
+    AddCovariance(seed);
     MakeBitmaps(seed);
     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
@@ -2659,8 +2682,6 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESDEvent *event)
   }
   //FindKinks(fSeeds,event);
   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
-  fEvent =0;
-  //WriteTracks();
   return 0;
 }
 
@@ -2687,6 +2708,7 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESDEvent *event)
     if (!seed) continue;
     if (seed->GetKinkIndex(0)<0)  UpdateKinkQualityM(seed);  // update quality informations for kinks
     seed->UpdatePoints();
+    AddCovariance(seed);
     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
@@ -2701,18 +2723,18 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESDEvent *event)
       ntracks++;
       Int_t eventnumber = event->GetEventNumberInFile();// patch 28 fev 06
       // This is most likely NOT the event number you'd like to use. It has nothing to do with the 'real' event number      
-      if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
+      if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1 && esd) {
        (*fDebugStreamer)<<"Cback"<<
          "Tr0.="<<seed<<
+         "esd.="<<esd<<
          "EventNrInFile="<<eventnumber<<
-         "\n"; // patch 28 fev 06         
+         "\n";       
       }
     }
   }
   //FindKinks(fSeeds,event);
   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
   fEvent =0;
-  //WriteTracks();
   
   return 0;
 }
@@ -2758,6 +2780,7 @@ void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESDEvent *event, Int_t direction)
     //    AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t/*,t.GetAlpha()*/);
     seed->SetUniqueID(esd->GetID());
+    AddCovariance(seed);   //add systematic ucertainty
     for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++) {
       Int_t index = esd->GetKinkIndex(ikink);
       seed->GetKinkIndexes()[ikink] = index;
@@ -2873,11 +2896,11 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
 
   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
-  const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
+  const AliTPCtrackerRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
   //
   Int_t ns =sec;   
 
-  const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
+  const AliTPCtrackerRow& kr1=GetRow(ns,i1);
   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.GetDeadZone()-1.5;  
   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.GetDeadZone()-1.5;  
 
@@ -2929,10 +2952,10 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
       Int_t sec2 = sec + dsec;
       // 
-      //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
-      //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
-      AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
-      AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
+      //      AliTPCtrackerRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
+      //AliTPCtrackerRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
+      AliTPCtrackerRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
+      AliTPCtrackerRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
 
@@ -3185,25 +3208,25 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
 
   // first 3 padrows
   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
-  const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
+  const    AliTPCtrackerRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.GetDeadZone()-1.5;  
   //
   Double_t x1p = GetXrow(i1);
-  const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
+  const    AliTPCtrackerRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
   //
   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
-  const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
+  const    AliTPCtrackerRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
 
   //
   //last 3 padrow for seeding
-  AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
+  AliTPCtrackerRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;  
   //
-  AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
+  AliTPCtrackerRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
   //
-  AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
+  AliTPCtrackerRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
 
   //
@@ -3211,7 +3234,7 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
   // middle padrow
   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
-  const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
+  const AliTPCtrackerRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;  
   //
   //
@@ -3435,8 +3458,8 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
   Int_t drow = (i1-i2)/2;
-  const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
-  AliTPCRow * kr=0;
+  const AliTPCtrackerRow& kr0=fSectors[sec][row0];
+  AliTPCtrackerRow * kr=0;
 
   AliTPCpolyTrack polytrack;
   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
@@ -3449,8 +3472,8 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,
     Int_t nfound =0;
     Int_t nfoundable =0;
     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
-      const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
-      const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];      
+      const AliTPCtrackerRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
+      const AliTPCtrackerRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];      
       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
       
       if (cl->IsUsed(10)) {
@@ -4138,7 +4161,6 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindMultiMC(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int_
     }
     if (ncl>0) xm[i]/=Float_t(ncl);
   }  
-  TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
   //
   for (Int_t i0=0;i0<nentries;i0++){
     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i0);
@@ -4199,6 +4221,8 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindMultiMC(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int_
        }
       }
       //
+      if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>0) {
+      TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
       cstream<<"Multi"<<
        "iter="<<iter<<
        "lab0="<<lab0<<
@@ -4234,6 +4258,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindMultiMC(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int_
        "r1="<<r1<<
        "rc1="<<rc1<<
        "\n";
+       }
     }
   }    
   delete [] helixes;
@@ -4320,7 +4345,6 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindSplitted(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int
     }
     if (ncl>0) xm[i]/=Float_t(ncl);
   }  
-  TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
   //
   for (Int_t is0=0;is0<nentries;is0++){
     Int_t i0 = indexes[is0];
@@ -4402,46 +4426,50 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindSplitted(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int
       //
       Int_t lab0=track0->GetLabel();
       Int_t lab1=track1->GetLabel();
-      cstream<<"Splitted"<<
-       "iter="<<iter<<
-       "lab0="<<lab0<<
-       "lab1="<<lab1<<   
-       "Tr0.="<<track0<<       // seed0
-       "Tr1.="<<track1<<       // seed1
-       "h0.="<<&helixes[i0]<<
-       "h1.="<<&helixes[i1]<<
-       //
-       "sum="<<sum<<           //the sum of rows with cl in both
-       "sum0="<<sum0<<           //the sum of rows with cl in 0 track
-       "sum1="<<sum1<<           //the sum of rows with cl in 1 track
-       "sums="<<sums<<         //the sum of shared clusters
-       "xm0="<<xm[i0]<<        // the center of track
-       "xm1="<<xm[i1]<<        // the x center of track
-       // General cut variables                   
-       "dfi="<<dfi<<           // distance in fi angle
-       "dtheta="<<dtheta<<     // distance int theta angle
-       //
-       //
-       "dist0="<<dist[4][0]<<     //distance x
-       "dist1="<<dist[4][1]<<     //distance y
-       "dist2="<<dist[4][2]<<     //distance z
-       "mdist0="<<mdist[0]<<   //distance x
-       "mdist1="<<mdist[1]<<   //distance y
-       "mdist2="<<mdist[2]<<   //distance z
-
-       "\n";
+      if( AliTPCReconstructor::StreamLevel()>5){
+      TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
+       cstream<<"Splitted"<<
+         "iter="<<iter<<
+         "lab0="<<lab0<<
+         "lab1="<<lab1<<   
+         "Tr0.="<<track0<<       // seed0
+         "Tr1.="<<track1<<       // seed1
+         "h0.="<<&helixes[i0]<<
+         "h1.="<<&helixes[i1]<<
+         //
+         "sum="<<sum<<           //the sum of rows with cl in both
+         "sum0="<<sum0<<           //the sum of rows with cl in 0 track
+         "sum1="<<sum1<<           //the sum of rows with cl in 1 track
+         "sums="<<sums<<         //the sum of shared clusters
+         "xm0="<<xm[i0]<<        // the center of track
+         "xm1="<<xm[i1]<<        // the x center of track
+         // General cut variables                   
+         "dfi="<<dfi<<           // distance in fi angle
+         "dtheta="<<dtheta<<     // distance int theta angle
+         //
+         //
+         "dist0="<<dist[4][0]<<     //distance x
+         "dist1="<<dist[4][1]<<     //distance y
+         "dist2="<<dist[4][2]<<     //distance z
+         "mdist0="<<mdist[0]<<   //distance x
+         "mdist1="<<mdist[1]<<   //distance y
+         "mdist2="<<mdist[2]<<   //distance z    
+         "\n";
+      }
       delete array->RemoveAt(i1);
     }
   }    
   delete [] helixes;
   delete [] xm;
+  delete [] quality;
+  delete [] indexes;
   AliInfo("Time for splitted tracks removal");
   timer.Print();
 }
 
 
 
-void  AliTPCtrackerMI::FindCurling(TObjArray * array, AliESDEvent *esd, Int_t iter)
+void  AliTPCtrackerMI::FindCurling(TObjArray * array, AliESDEvent */*esd*/, Int_t iter)
 {
   //
   //  find Curling tracks
@@ -4506,7 +4534,6 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindCurling(TObjArray * array, AliESDEvent *esd, Int_t it
   //
   // Find tracks
   //
-  TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
   //
   for (Int_t i0=0;i0<nentries;i0++){
     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i0);
@@ -4604,6 +4631,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindCurling(TObjArray * array, AliESDEvent *esd, Int_t it
          //debug stream to tune "fine" cuts      
          Int_t lab0=track0->GetLabel();
          Int_t lab1=track1->GetLabel();
+          TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
          cstream<<"Curling2"<<
            "iter="<<iter<<
            "lab0="<<lab0<<
@@ -4718,7 +4746,6 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
 
   //
   // Find circling track
-  TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
   //
   for (Int_t i0=0;i0<nentries;i0++){
     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i0);
@@ -4805,6 +4832,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
          //debug stream          
          Int_t lab0=track0->GetLabel();
          Int_t lab1=track1->GetLabel();
+          TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
          cstream<<"Curling"<<
            "lab0="<<lab0<<
            "lab1="<<lab1<<   
@@ -5409,7 +5437,6 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
   // 
   //
   // //  
-  TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer; 
   Float_t fprimvertex[3]={GetX(),GetY(),GetZ()};
   AliV0 vertex; 
   Double_t cradius0 = 10*10;
@@ -5424,6 +5451,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
     if (!track0) continue;
     if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1){
+      TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
       cstream<<"Tracks"<<
        "Tr0.="<<track0<<
        "dca="<<dca[i]<<
@@ -5537,6 +5565,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
          Int_t lab1=track1->GetLabel();
          Char_t c0=track0->GetCircular();
          Char_t c1=track1->GetCircular();
+          TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
          cstream<<"V0"<<
          "Event="<<eventNr<<
          "vertex.="<<&vertex<<
@@ -5647,6 +5676,7 @@ void  AliTPCtrackerMI::FindV0s(TObjArray * array, AliESDEvent *esd)
       if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1) {
        Int_t lab0=track0->GetLabel();
        Int_t lab1=track1->GetLabel();
+        TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
        cstream<<"V02"<<
        "Event="<<eventNr<<
        "vertex.="<<v0<<        
@@ -6688,7 +6718,6 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateForward()
   ParallelTracking(fSeeds,fOuterSec->GetNRows()+fInnerSec->GetNRows()-1,fInnerSec->GetNRows());
   fSectors = fInnerSec;
   ParallelTracking(fSeeds,fInnerSec->GetNRows()-1,0);
-  //WriteTracks();
   return 1;
 }
 
@@ -6732,19 +6761,27 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliTPCseed * pt, Int_t row0, Int_t row1)
 void  AliTPCtrackerMI::GetShape(AliTPCseed * seed, Int_t row)
 {
   //
-  //
-  Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
-  //  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
-  Float_t padlength =  GetPadPitchLength(row);
-  //
-  Float_t sresy = (seed->GetSector() < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
+  // 
+  AliTPCClusterParam * clparam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
+  Float_t zdrift = TMath::Abs((fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ())));
+  Int_t type = (seed->GetSector() < fParam->GetNSector()/2) ? 0: (row>126) ? 1:2;
   Double_t angulary  = seed->GetSnp();
-  angulary = angulary*angulary/(1-angulary*angulary);
-  seed->SetCurrentSigmaY2(sd2+padlength*padlength*angulary/12.+sresy*sresy);  
-  //
-  Float_t sresz = fParam->GetZSigma();
-  Float_t angularz  = seed->GetTgl();
-  seed->SetCurrentSigmaZ2(sd2+padlength*padlength*angularz*angularz*(1+angulary)/12.+sresz*sresz);
+  angulary = angulary*angulary/(1.-angulary*angulary);
+  Double_t angularz  = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1.+angulary);
+  
+  Double_t sigmay =  clparam->GetRMS0(0,type,zdrift,TMath::Sqrt(TMath::Abs(angulary)));
+  Double_t sigmaz =  clparam->GetRMS0(1,type,zdrift,TMath::Sqrt(TMath::Abs(angularz)));
+  seed->SetCurrentSigmaY2(sigmay*sigmay);
+  seed->SetCurrentSigmaZ2(sigmaz*sigmaz);
+  // Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
+//   //  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->fSector);
+//   Float_t padlength =  GetPadPitchLength(row);
+//   //
+//   Float_t sresy = (seed->GetSector() < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
+//   seed->SetCurrentSigmaY2(sd2+padlength*padlength*angulary/12.+sresy*sresy);  
+//   //
+//   Float_t sresz = fParam->GetZSigma();
+//   seed->SetCurrentSigmaZ2(sd2+padlength*padlength*angularz*angularz*(1+angulary)/12.+sresz*sresz);
   /*
   Float_t wy = GetSigmaY(seed);
   Float_t wz = GetSigmaZ(seed);
@@ -6757,32 +6794,6 @@ void  AliTPCtrackerMI::GetShape(AliTPCseed * seed, Int_t row)
 }
 
 
-Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaY(AliTPCseed * seed)
-{
-  //
-  //  
-  Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
-  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->GetSector());
-  Float_t sres = (seed->GetSector() < fParam->GetNSector()/2) ? 0.2 :0.3;
-  Float_t angular  = seed->GetSnp();
-  angular = angular*angular/(1-angular*angular);
-  //  angular*=angular;
-  //angular  = TMath::Sqrt(angular/(1-angular));
-  Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular/12.+sres*sres);
-  return res;
-}
-Float_t  AliTPCtrackerMI::GetSigmaZ(AliTPCseed * seed)
-{
-  //
-  //
-  Float_t sd2 = TMath::Abs((fParam->GetZLength(0)-TMath::Abs(seed->GetZ())))*fParam->GetDiffL()*fParam->GetDiffL();
-  Float_t padlength =  fParam->GetPadPitchLength(seed->GetSector());
-  Float_t sres = fParam->GetZSigma();
-  Float_t angular  = seed->GetTgl();
-  Float_t res = TMath::Sqrt(sd2+padlength*padlength*angular*angular/12.+sres*sres);
-  return res;
-}
-
 
 //__________________________________________________________________________
 void AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliKalmanTrack *tk, Float_t wrong) const {
@@ -6957,29 +6968,6 @@ Int_t AliTPCtrackerMI::CookLabel(AliTPCseed *t, Float_t wrong,Int_t first, Int_t
 }
 
 
-Int_t  AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::GetRowNumber(Double_t x) const 
-{
-  //return pad row number for this x
-  Double_t r;
-  if (fN < 64){
-    r=fRow[fN-1].GetX();
-    if (x > r) return fN;
-    r=fRow[0].GetX();
-    if (x < r) return -1;
-    return Int_t((x-r)/fPadPitchLength + 0.5);}
-  else{    
-    r=fRow[fN-1].GetX();
-    if (x > r) return fN;
-    r=fRow[0].GetX();
-    if (x < r) return -1;
-    Double_t r1=fRow[64].GetX();
-    if(x<r1){       
-      return Int_t((x-r)/f1PadPitchLength + 0.5);}
-    else{
-      return (Int_t((x-r1)/f2PadPitchLength + 0.5)+64);} 
-  }
-}
-
 Int_t  AliTPCtrackerMI::GetRowNumber(Double_t x[3]) const 
 {
   //return pad row number for given x vector
@@ -6992,178 +6980,6 @@ Int_t  AliTPCtrackerMI::GetRowNumber(Double_t x[3]) const
   return GetRowNumber(localx);
 }
 
-//_________________________________________________________________________
-void AliTPCtrackerMI::AliTPCSector::Setup(const AliTPCParam *par, Int_t f) {
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Setup inner sector
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  if (f==0) {
-     fAlpha=par->GetInnerAngle();
-     fAlphaShift=par->GetInnerAngleShift();
-     fPadPitchWidth=par->GetInnerPadPitchWidth();
-     fPadPitchLength=par->GetInnerPadPitchLength();
-     fN=par->GetNRowLow();
-     if(fRow)delete [] fRow;fRow = 0;
-     fRow=new AliTPCRow[fN];
-     for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
-       fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiLow(i));
-       fRow[i].SetDeadZone(1.5);  //1.5 cm of dead zone
-     }
-  } else {
-     fAlpha=par->GetOuterAngle();
-     fAlphaShift=par->GetOuterAngleShift();
-     fPadPitchWidth  = par->GetOuterPadPitchWidth();
-     fPadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
-     f1PadPitchLength = par->GetOuter1PadPitchLength();
-     f2PadPitchLength = par->GetOuter2PadPitchLength();
-     fN=par->GetNRowUp();
-     if(fRow)delete [] fRow;fRow = 0;
-     fRow=new AliTPCRow[fN];
-     for (Int_t i=0; i<fN; i++) {
-       fRow[i].SetX(par->GetPadRowRadiiUp(i)); 
-       fRow[i].SetDeadZone(1.5);  // 1.5 cm of dead zone
-     }
-  } 
-}
-
-AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::AliTPCRow():
-  fDeadZone(0.),
-  fClusters1(0),
-  fN1(0),
-  fClusters2(0),
-  fN2(0),
-  fN(0),
-  fX(0.)
-{
-  //
-  // default constructor
-  //
-}
-
-AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::~AliTPCRow(){
-  //
-  for (Int_t i = 0; i < fN1; i++)
-    fClusters1[i].~AliTPCclusterMI();
-  delete [] fClusters1;
-  for (Int_t i = 0; i < fN2; i++)
-    fClusters2[i].~AliTPCclusterMI();
-  delete [] fClusters2;
-}
-
-
-
-//_________________________________________________________________________
-void 
-AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::InsertCluster(const AliTPCclusterMI* c, UInt_t index) {
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Insert a cluster into this pad row in accordence with its y-coordinate
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  if (fN==kMaxClusterPerRow) {
-    cerr<<"AliTPCRow::InsertCluster(): Too many clusters !\n"; return;
-  }
-  if (fN==0) {fIndex[0]=index; fClusters[fN++]=c; return;}
-  Int_t i=Find(c->GetZ());
-  memmove(fClusters+i+1 ,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTPCclusterMI*));
-  memmove(fIndex   +i+1 ,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t));
-  fIndex[i]=index; fClusters[i]=c; fN++;
-}
-
-void AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::ResetClusters() {
-   //
-   // reset clusters
-   // MvL: Need to call destructors for AliTPCclusterMI, to delete fInfo
-   for (Int_t i = 0; i < fN1; i++)
-     fClusters1[i].~AliTPCclusterMI();
-   delete [] fClusters1;  fClusters1=0;
-   for (Int_t i = 0; i < fN2; i++)
-     fClusters2[i].~AliTPCclusterMI();
-   delete [] fClusters2;  fClusters2=0;
-
-   fN  = 0; 
-   fN1 = 0;
-   fN2 = 0;
-   //delete[] fClusterArray; 
-
-   //fClusterArray=0;
-}
-
-
-//___________________________________________________________________
-Int_t AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::Find(Double_t z) const {
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Return the index of the nearest cluster 
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  if (fN==0) return 0;
-  if (z <= fClusters[0]->GetZ()) return 0;
-  if (z > fClusters[fN-1]->GetZ()) return fN;
-  Int_t b=0, e=fN-1, m=(b+e)/2;
-  for (; b<e; m=(b+e)/2) {
-    if (z > fClusters[m]->GetZ()) b=m+1;
-    else e=m; 
-  }
-  return m;
-}
-
-
-
-//___________________________________________________________________
-AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz) const {
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Return the index of the nearest cluster in z y 
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
-
-  AliTPCclusterMI *cl =0;
-  for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
-      AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
-      if (c->GetZ() > z+roadz) break;
-      if ( (c->GetY()-y) >  roady ) continue;
-      Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
-      if (maxdistance>distance) {
-       maxdistance = distance;
-       cl=c;       
-      }
-  }
-  return cl;      
-}
-
-AliTPCclusterMI * AliTPCtrackerMI::AliTPCRow::FindNearest2(Double_t y, Double_t z, Double_t roady, Double_t roadz,UInt_t & index) const 
-{
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  // Return the index of the nearest cluster in z y 
-  //-----------------------------------------------------------------------
-  Float_t maxdistance = roady*roady + roadz*roadz;
-  AliTPCclusterMI *cl =0;
-
-  //PH Check boundaries. 510 is the size of fFastCluster
-  Int_t iz1 = Int_t(z-roadz+254.5);
-  if (iz1<0 || iz1>=510) return cl;
-  iz1 = TMath::Max(GetFastCluster(iz1)-1,0);
-  Int_t iz2 = Int_t(z+roadz+255.5);
-  if (iz2<0 || iz2>=510) return cl;
-  iz2 = TMath::Min(GetFastCluster(iz2)+1,fN);
-  Bool_t skipUsed = !(AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetClusterSharing());
-  //FindNearest3(y,z,roady,roadz,index);
-  //  for (Int_t i=Find(z-roadz); i<fN; i++) {
-  for (Int_t i=iz1; i<iz2; i++) {
-      AliTPCclusterMI *c=(AliTPCclusterMI*)(fClusters[i]);
-      if (c->GetZ() > z+roadz) break;
-      if ( c->GetY()-y >  roady ) continue;
-      if ( y-c->GetY() >  roady ) continue;
-      if (skipUsed && c->IsUsed(11)) continue;
-      Float_t distance = (c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z)+(c->GetY()-y)*(c->GetY()-y);
-      if (maxdistance>distance) {
-       maxdistance = distance;
-       cl=c;       
-       index =i;
-       //roady = TMath::Sqrt(maxdistance);
-      }
-  }
-  return cl;      
-}
-
-
-
 
 
 void AliTPCtrackerMI::MakeBitmaps(AliTPCseed *t)
@@ -7191,3 +7007,27 @@ void AliTPCtrackerMI::MakeBitmaps(AliTPCseed *t)
     }
   }
 }
+
+
+
+void AliTPCtrackerMI::AddCovariance(AliTPCseed * seed){
+  //
+  // Adding systematic error
+  // !!!! the systematic error for element 4 is in 1/cm not in pt 
+
+  const Double_t *param = AliTPCReconstructor::GetRecoParam()->GetSystematicError();
+  Double_t covar[15];
+  for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
+  // 0
+  // 1    2
+  // 3    4    5
+  // 6    7    8    9 
+  // 10   11   12   13   14
+  covar[0] = param[0]*param[0];
+  covar[2] = param[1]*param[1];
+  covar[5] = param[2]*param[2];
+  covar[9] = param[3]*param[3];
+  Double_t facC =  AliTracker::GetBz()*kB2C;
+  covar[14]= param[4]*param[4]*facC*facC;
+  seed->AddCovariance(covar);
+}