]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - TRD/AliTRDtrackerV1.cxx
Bug fix by Theodor
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDtrackerV1.cxx
index d938dc82d926308265164f2b6d343ea3b8bad158..b4ad87e8d0f6628ffae46e6c8dff18ff4f3a0466 100644 (file)
@@ -35,6 +35,8 @@
 #include <TTree.h>  
 #include <TClonesArray.h>
 #include <TTreeStream.h>
+#include <TGeoMatrix.h>
+#include <TGeoManager.h>
 
 #include "AliLog.h"
 #include "AliMathBase.h"
@@ -69,10 +71,12 @@ const  Double_t AliTRDtrackerV1::fgkMaxChi2            = 12.0;  //
 const  Double_t AliTRDtrackerV1::fgkMaxSnp             =  0.95; // Maximum local sine of the azimuthal angle
 const  Double_t AliTRDtrackerV1::fgkMaxStep            =  2.0;  // Maximal step size in propagation 
 Double_t AliTRDtrackerV1::fgTopologicQA[kNConfigs] = {
-  0.1112, 0.1112, 0.1112, 0.0786, 0.0786,
+  0.5112, 0.5112, 0.5112, 0.0786, 0.0786,
   0.0786, 0.0786, 0.0579, 0.0579, 0.0474,
   0.0474, 0.0408, 0.0335, 0.0335, 0.0335
-};
+};  
+const Double_t AliTRDtrackerV1::fgkX0[kNPlanes]    = {
+  300.2, 312.8, 325.4, 338.0, 350.6, 363.2};
 Int_t AliTRDtrackerV1::fgNTimeBins = 0;
 AliRieman* AliTRDtrackerV1::fgRieman = 0x0;
 TLinearFitter* AliTRDtrackerV1::fgTiltedRieman = 0x0;
@@ -82,7 +86,7 @@ TLinearFitter* AliTRDtrackerV1::fgTiltedRiemanConstrained = 0x0;
 AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackerV1(AliTRDReconstructor *rec) 
   :AliTracker()
   ,fReconstructor(0x0)
-  ,fGeom(new AliTRDgeometry())
+  ,fGeom(0x0)
   ,fClusters(0x0)
   ,fTracklets(0x0)
   ,fTracks(0x0)
@@ -91,19 +95,44 @@ AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackerV1(AliTRDReconstructor *rec)
   //
   // Default constructor.
   // 
+  
+  SetReconstructor(rec); // initialize reconstructor
+
+  // initialize geometry
+  if(!AliGeomManager::GetGeometry()){
+    AliFatal("Could not get geometry.");
+  }
+  fGeom = new AliTRDgeometry();
+  fGeom->CreateClusterMatrixArray();
+  TGeoHMatrix *matrix = 0x0;
+  Double_t loc[] = {0., 0., 0.};
+  Double_t glb[] = {0., 0., 0.};
+  for(Int_t ily=kNPlanes; ily--;){
+    Int_t ism = 0;
+    while(!(matrix = fGeom->GetClusterMatrix(AliTRDgeometry::GetDetector(ily, 2, ism)))) ism++;
+    if(!matrix){
+      AliError(Form("Could not get transformation matrix for layer %d. Use default.", ily));
+      fR[ily] = fgkX0[ily];
+      continue;
+    }
+    matrix->LocalToMaster(loc, glb);
+    fR[ily] = glb[0]+ AliTRDgeometry::AnodePos()-.5*AliTRDgeometry::AmThick() - AliTRDgeometry::DrThick();
+  }
+
+  // initialize calibration values
   AliTRDcalibDB *trd = 0x0;
   if (!(trd = AliTRDcalibDB::Instance())) {
-    AliFatal("Could not get calibration object");
+    AliFatal("Could not get calibration.");
   }
-
   if(!fgNTimeBins) fgNTimeBins = trd->GetNumberOfTimeBins();
 
+  // initialize cluster containers
   for (Int_t isector = 0; isector < AliTRDgeometry::kNsector; isector++) new(&fTrSec[isector]) AliTRDtrackingSector(fGeom, isector);
   
-  for(Int_t isl =0; isl<kNSeedPlanes; isl++) fSeedTB[isl] = 0x0;
-
-  // Initialize debug stream
-  if(rec) SetReconstructor(rec);
+  // initialize arrays
+  memset(fTrackQuality, 0, kMaxTracksStack*sizeof(Double_t));
+  memset(fSeedLayer, 0, kMaxTracksStack*sizeof(Int_t));
+  memset(fSeedTB, 0, kNSeedPlanes*sizeof(AliTRDchamberTimeBin*));
 }
 
 //____________________________________________________________________
@@ -171,40 +200,32 @@ Bool_t AliTRDtrackerV1::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint &p) const
   if (!tracklet) return kFALSE;
 
   // get detector for this tracklet
-  Int_t  idet     = tracklet->GetDetector();
-    
+  Int_t det = tracklet->GetDetector();
+  Int_t sec = fGeom->GetSector(det);
+  Double_t alpha = (sec+.5)*AliTRDgeometry::GetAlpha(),
+           sinA  = TMath::Sin(alpha),
+           cosA  = TMath::Cos(alpha);
   Double_t local[3];
-  local[0] = tracklet->GetX0(); 
-  local[1] = tracklet->GetYfit(0);
-  local[2] = tracklet->GetZfit(0);
+  local[0] = tracklet->GetX(); 
+  local[1] = tracklet->GetY();
+  local[2] = tracklet->GetZ();
   Double_t global[3];
-  fGeom->RotateBack(idet, local, global);
-  p.SetXYZ(global[0],global[1],global[2]);
-  
+  fGeom->RotateBack(det, local, global);
+
+  Double_t cov2D[3]; Float_t cov[6];
+  tracklet->GetCovAt(local[0], cov2D);
+  cov[0] = cov2D[0]*sinA*sinA;
+  cov[1] =-cov2D[0]*sinA*cosA;
+  cov[2] =-cov2D[1]*sinA;
+  cov[3] = cov2D[0]*cosA*cosA;
+  cov[4] = cov2D[1]*cosA;
+  cov[5] = cov2D[2];
+  // store the global position of the tracklet and its covariance matrix in the track point 
+  p.SetXYZ(global[0],global[1],global[2], cov);
   
   // setting volume id
-  AliGeomManager::ELayerID iLayer = AliGeomManager::kTRD1;
-  switch (fGeom->GetLayer(idet)) {
-  case 0:
-    iLayer = AliGeomManager::kTRD1;
-    break;
-  case 1:
-    iLayer = AliGeomManager::kTRD2;
-    break;
-  case 2:
-    iLayer = AliGeomManager::kTRD3;
-    break;
-  case 3:
-    iLayer = AliGeomManager::kTRD4;
-    break;
-  case 4:
-    iLayer = AliGeomManager::kTRD5;
-    break;
-  case 5:
-    iLayer = AliGeomManager::kTRD6;
-    break;
-  };
-  Int_t    modId = fGeom->GetSector(idet) * fGeom->Nstack() + fGeom->GetStack(idet);
+  AliGeomManager::ELayerID iLayer = AliGeomManager::ELayerID(AliGeomManager::kTRD1+fGeom->GetLayer(det));
+  Int_t    modId = fGeom->GetSector(det) * AliTRDgeometry::kNstack + fGeom->GetStack(det);
   UShort_t volid = AliGeomManager::LayerToVolUID(iLayer, modId);
   p.SetVolumeID(volid);
     
@@ -235,74 +256,110 @@ AliRieman* AliTRDtrackerV1::GetRiemanFitter()
 //_____________________________________________________________________________
 Int_t AliTRDtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent *event) 
 {
-  //
-  // Gets seeds from ESD event. The seeds are AliTPCtrack's found and
-  // backpropagated by the TPC tracker. Each seed is first propagated 
-  // to the TRD, and then its prolongation is searched in the TRD.
-  // If sufficiently long continuation of the track is found in the TRD
-  // the track is updated, otherwise it's stored as originaly defined 
-  // by the TPC tracker.   
-  //  
-
-  // Calibration monitor
-  AliTRDCalibraFillHisto *calibra = AliTRDCalibraFillHisto::Instance();
+// Propagation of ESD tracks from TPC to TOF detectors and building of the TRD track. For building
+// a TRD track an ESD track is used as seed. The informations obtained on the TRD track (measured points,
+// covariance, PID, etc.) are than used to update the corresponding ESD track.
+// Each track seed is first propagated to the geometrical limit of the TRD detector. 
+// Its prolongation is searched in the TRD and if corresponding clusters are found tracklets are 
+// constructed out of them (see AliTRDseedV1::AttachClusters()) and the track is updated. 
+// Otherwise the ESD track is left unchanged.
+// 
+// The following steps are performed:
+// 1. Selection of tracks based on the variance in the y-z plane.
+// 2. Propagation to the geometrical limit of the TRD volume. If track propagation fails the AliESDtrack::kTRDStop is set.
+// 3. Prolongation inside the fiducial volume (see AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation()) and marking
+// the following status bits:
+//   - AliESDtrack::kTRDin - if the tracks enters the TRD fiducial volume
+//   - AliESDtrack::kTRDStop - if the tracks fails propagation
+//   - AliESDtrack::kTRDbackup - if the tracks fulfills chi2 conditions and qualify for refitting
+// 4. Writting to friends, PID, MC label, quality etc. Setting status bit AliESDtrack::kTRDout.
+// 5. Propagation to TOF. If track propagation fails the AliESDtrack::kTRDStop is set.
+//  
+
+  AliTRDCalibraFillHisto *calibra = AliTRDCalibraFillHisto::Instance(); // Calibration monitor
   if (!calibra) AliInfo("Could not get Calibra instance\n");
   
-  Int_t   found    = 0;     // number of tracks found
+  // Define scalers
+  Int_t nFound   = 0, // number of tracks found
+        nSeeds   = 0, // total number of ESD seeds
+        nTRDseeds= 0, // number of seeds in the TRD acceptance
+        nTPCseeds= 0; // number of TPC seeds
   Float_t foundMin = 20.0;
   
   Float_t *quality = 0x0;
   Int_t   *index   = 0x0;
-  Int_t    nSeed   = event->GetNumberOfTracks();
-  if(nSeed){  
-    quality = new Float_t[nSeed];
-    index   = new Int_t[nSeed];
-    for (Int_t iSeed = 0; iSeed < nSeed; iSeed++) {
+  nSeeds   = event->GetNumberOfTracks();
+  // Sort tracks according to quality 
+  // (covariance in the yz plane)
+  if(nSeeds){  
+    quality = new Float_t[nSeeds];
+    index   = new Int_t[nSeeds];
+    for (Int_t iSeed = nSeeds; iSeed--;) {
       AliESDtrack *seed = event->GetTrack(iSeed);
       Double_t covariance[15];
       seed->GetExternalCovariance(covariance);
       quality[iSeed] = covariance[0] + covariance[2];
     }
-    // Sort tracks according to covariance of local Y and Z
-    TMath::Sort(nSeed, quality, index,kFALSE);
+    TMath::Sort(nSeeds, quality, index,kFALSE);
   }
   
-  // Backpropagate all seeds
+  // Propagate all seeds
   Int_t   expectedClr;
   AliTRDtrackV1 track;
-  for (Int_t iSeed = 0; iSeed < nSeed; iSeed++) {
+  for (Int_t iSeed = 0; iSeed < nSeeds; iSeed++) {
   
     // Get the seeds in sorted sequence
     AliESDtrack *seed = event->GetTrack(index[iSeed]);
+    Float_t p4  = seed->GetC(seed->GetBz());
   
     // Check the seed status
     ULong_t status = seed->GetStatus();
     if ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) continue;
     if ((status & AliESDtrack::kTRDout) != 0) continue;
-  
-    // Do the back prolongation
+
+    // Propagate to the entrance in the TRD mother volume
     new(&track) AliTRDtrackV1(*seed);
-    track.SetReconstructor(fReconstructor);
-    track.SetKink(Bool_t(seed->GetKinkIndex(0)));
-    //Int_t   lbl         = seed->GetLabel();
-    //track.SetSeedLabel(lbl);
+    if(AliTRDgeometry::GetXtrdBeg() > (fgkMaxStep + track.GetX()) && !PropagateToX(track, AliTRDgeometry::GetXtrdBeg(), fgkMaxStep)){ 
+      seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+      continue;
+    }    
+    if(!AdjustSector(&track)){
+      seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+      continue;
+    }
+    if(TMath::Abs(track.GetSnp()) > fgkMaxSnp) {
+      seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+      continue;
+    }
 
-    // Make backup and mark entrance in the TRD
-    seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDin);
+    nTPCseeds++;
+
+    // store track status at TRD entrance
     seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDbackup);
-    Float_t p4  = track.GetC(track.GetBz());
-    expectedClr = FollowBackProlongation(track);
 
-    if (expectedClr<0) continue; // Back prolongation failed
+    // prepare track and do propagation in the TRD
+    track.SetReconstructor(fReconstructor);
+    track.SetKink(Bool_t(seed->GetKinkIndex(0)));
+    expectedClr = FollowBackProlongation(track);
+    // check if track entered the TRD fiducial volume
+    if(track.GetTrackLow()){ 
+      seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDin);
+      nTRDseeds++;
+    }
+    // check if track was stopped in the TRD
+    if (expectedClr<0){      
+      seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+      continue;
+    }
 
     if(expectedClr){
-      found++;  
+      nFound++;  
       // computes PID for track
       track.CookPID();
       // update calibration references using this track
       if(calibra->GetHisto2d()) calibra->UpdateHistogramsV1(&track);
       // save calibration object
-      if (fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 0 /*&& quality TODO*/){ 
+      if (fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 0){ 
         AliTRDtrackV1 *calibTrack = new AliTRDtrackV1(track);
         calibTrack->SetOwner();
         seed->AddCalibObject(calibTrack);
@@ -349,64 +406,54 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::PropagateBack(AliESDEvent *event)
             isGold = kTRUE;
           }
         }
-  
-        //if ((track->StatusForTOF() > 0) && (track->GetNCross() == 0) && (Float_t(track->GetNumberOfClusters()) / Float_t(track->GetNExpected())  > 0.4)) {
-        //seed->UpdateTrackParams(track->GetBackupTrack(), AliESDtrack::kTRDbackup);
-        //}
       }
     }
     
-    // Propagation to the TOF (I.Belikov)
-    if (track.IsStopped() == kFALSE) {
-      Double_t xtof  = 371.0;
-      Double_t xTOF0 = 370.0;
-    
-      Double_t c2    = track.GetSnp() + track.GetC(track.GetBz()) * (xtof - track.GetX());
-      if (TMath::Abs(c2) >= 0.99) continue;
-      
-      if (!PropagateToX(track, xTOF0, fgkMaxStep)) continue;
-  
-      // Energy losses taken to the account - check one more time
-      c2 = track.GetSnp() + track.GetC(track.GetBz()) * (xtof - track.GetX());
-      if (TMath::Abs(c2) >= 0.99) continue;
-      
-      //if (!PropagateToX(*track,xTOF0,fgkMaxStep)) {
-      //       fHBackfit->Fill(7);
-      //delete track;
-      //       continue;
-      //}
-  
-      Double_t ymax = xtof * TMath::Tan(0.5 * AliTRDgeometry::GetAlpha());
-      Double_t y;
-      track.GetYAt(xtof,GetBz(),y);
-      if (y >  ymax) {
-        if (!track.Rotate( AliTRDgeometry::GetAlpha())) continue;      
-      }else if (y < -ymax) {
-        if (!track.Rotate(-AliTRDgeometry::GetAlpha())) continue;
+    // Propagation to the TOF
+    if(!(seed->GetStatus()&AliESDtrack::kTRDStop)) {
+      Int_t sm = track.GetSector();
+      // default value in case we have problems with the geometry.
+      Double_t xtof  = 371.; 
+      //Calculate radial position of the beginning of the TOF
+      //mother volume. In order to avoid mixing of the TRD 
+      //and TOF modules some hard values are needed. This are:
+      //1. The path to the TOF module.
+      //2. The width of the TOF (29.05 cm)
+      //(with the help of Annalisa de Caro Mar-17-2009)
+      if(gGeoManager){
+        gGeoManager->cd(Form("/ALIC_1/B077_1/BSEGMO%d_1/BTOF%d_1", sm, sm));
+        TGeoHMatrix *m = 0x0;
+        Double_t loc[]={0., 0., -.5*29.05}, glob[3];
+        
+        if((m=gGeoManager->GetCurrentMatrix())){
+          m->LocalToMaster(loc, glob);
+          xtof = TMath::Sqrt(glob[0]*glob[0]+glob[1]*glob[1]);
+        }
       }
-          
-      if (track.PropagateTo(xtof)) {
-        seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDout);
-        track.UpdateESDtrack(seed);
+      if(xtof > (fgkMaxStep + track.GetX()) && !PropagateToX(track, xtof, fgkMaxStep)){ 
+        seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+        continue;
       }
-    } else {                   
-      if ((track.GetNumberOfClusters() > 15) && (track.GetNumberOfClusters() > 0.5*expectedClr)) {
-        seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDout);
-  
-        track.UpdateESDtrack(seed);
+      if(!AdjustSector(&track)){ 
+        seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+        continue;
+      }
+      if(TMath::Abs(track.GetSnp()) > fgkMaxSnp){ 
+        seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDStop);
+        continue;
       }
+      seed->UpdateTrackParams(&track, AliESDtrack::kTRDout);
+      // TODO obsolete - delete
+      seed->SetTRDQuality(track.StatusForTOF()); 
     }
-  
-    seed->SetTRDQuality(track.StatusForTOF());
     seed->SetTRDBudget(track.GetBudget(0));
   }
   if(index) delete [] index;
   if(quality) delete [] quality;
-  
 
-  AliInfo(Form("Number of seeds: %d", nSeed));
-  AliInfo(Form("Number of back propagated TRD tracks: %d", found));
-      
+  AliInfo(Form("Number of seeds: TPCout[%d] TRDin[%d]", nTPCseeds, nTRDseeds));
+  AliInfo(Form("Number of tracks: TRDout[%d]", nFound));
+
   // run stand alone tracking
   if (fReconstructor->IsSeeding()) Clusters2Tracks(event);
   
@@ -560,8 +607,10 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::FollowProlongation(AliTRDtrackV1 &t)
       kStoreIn = kFALSE;
     }
 
-    Double_t maxChi2 = t.GetPredictedChi2(tracklet);
-    if (maxChi2 < 1e+10 && t.Update(tracklet, maxChi2)){ 
+    Double_t cov[3]; tracklet->GetCovAt(x, cov);
+    Double_t p[2] = { tracklet->GetY(), tracklet->GetZ()};
+    Double_t chi2 = ((AliExternalTrackParam)t).GetPredictedChi2(p, cov);
+    if (chi2 < 1e+10 && t.Update(p, cov, chi2)){ 
       nClustersExpected += tracklet->GetN();
     }
   }
@@ -576,10 +625,12 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::FollowProlongation(AliTRDtrackV1 &t)
 
     Int_t eventNumber = AliTRDtrackerDebug::GetEventNumber();
     TTreeSRedirector &cstreamer = *fReconstructor->GetDebugStream(AliTRDReconstructor::kTracker);
+    AliTRDtrackV1 track(t);
+    track.SetOwner();
     cstreamer << "FollowProlongation"
         << "EventNumber="      << eventNumber
         << "ncl="                                      << nClustersExpected
-        //<< "track.="                 << &t
+        << "track.="                   << &track
         << "\n";
   }
 
@@ -590,32 +641,47 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::FollowProlongation(AliTRDtrackV1 &t)
 //_____________________________________________________________________________
 Int_t AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation(AliTRDtrackV1 &t)
 {
-  // Extrapolates the TRD track in the TOF direction.
-  //
-  // Parameters
-  //   t : the TRD track which has to be extrapolated
-  // 
-  // Output
-  //   number of clusters attached to the track
-  //
-  // Detailed description
-  //
-  // Starting from current radial position of track <t> this function
-  // extrapolates the track through the 6 TRD layers. The following steps
-  // are being performed for each plane:
-  // 1. prepare track:
-  //   a. get plane limits in the local x direction
-  //   b. check crossing sectors 
-  //   c. check track inclination
-  // 2. build tracklet (see AliTRDseed::AttachClusters() for details)
-  // 3. evaluate material budget using the geo manager
-  // 4. propagate and update track using the tracklet information.
-  //
-  // Debug level 2
-  //
-
-  Int_t nClustersExpected = 0;
-  Double_t clength = .5*AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick();
+// Extrapolates/Build the TRD track in the TOF direction.
+//
+// Parameters
+//   t : the TRD track which has to be extrapolated
+// 
+// Output
+//   number of clusters attached to the track
+//
+// Starting from current radial position of track <t> this function
+// extrapolates the track through the 6 TRD layers. The following steps
+// are being performed for each plane:
+// 1. Propagate track to the entrance of the next chamber:
+//   - get chamber limits in the radial direction
+//   - check crossing sectors 
+//   - check track inclination
+//   - check track prolongation against boundary conditions (see exclusion boundaries on AliTRDgeometry::IsOnBoundary())
+// 2. Build tracklet (see AliTRDseed::AttachClusters() for details) for this layer if needed. If only 
+//    Kalman filter is needed and tracklets are already linked to the track this step is skipped.
+// 3. Fit tracklet using the information from the Kalman filter.
+// 4. Propagate and update track at reference radial position of the tracklet.
+// 5. Register tracklet with the tracker and track; update pulls monitoring.
+//
+// Observation
+//   1. During the propagation a bit map is filled detailing the status of the track in each TRD chamber. The following errors are being registered for each tracklet:
+// - AliTRDtrackV1::kProlongation : track prolongation failed
+// - AliTRDtrackV1::kPropagation : track prolongation failed
+// - AliTRDtrackV1::kAdjustSector : failed during sector crossing
+// - AliTRDtrackV1::kSnp : too large bending
+// - AliTRDtrackV1::kTrackletInit : fail to initialize tracklet
+// - AliTRDtrackV1::kUpdate : fail to attach clusters or fit the tracklet
+// - AliTRDtrackV1::kUnknown : anything which is not covered before
+//   2. By default the status of the track before first TRD update is saved. 
+// 
+// Debug level 2
+//
+// Author
+//   Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
+//
+
+  Int_t n = 0;
+  Double_t driftLength = .5*AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick();
   AliTRDtrackingChamber *chamber = 0x0;
   
   AliTRDseedV1 tracklet, *ptrTracklet = 0x0;
@@ -626,137 +692,235 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation(AliTRDtrackV1 &t)
     tracklets[ip] = t.GetTracklet(ip);
     t.UnsetTracklet(ip);
   } 
-  Bool_t kStoreIn = kTRUE;
-
+  Bool_t kStoreIn = kTRUE, kPropagateIn = kTRUE;
 
   // Loop through the TRD layers
-  for (Int_t ilayer = 0; ilayer < kNPlanes; ilayer++) {
-    // BUILD TRACKLET IF NOT ALREADY BUILT
-    Double_t x = 0., x0, y, z, alpha;
-    ptrTracklet  = tracklets[ilayer];
-    if(!ptrTracklet){
-      ptrTracklet = new(&tracklet) AliTRDseedV1(ilayer);
-      ptrTracklet->SetReconstructor(fReconstructor);
-      ptrTracklet->SetKink(t.IsKink());
-      alpha = t.GetAlpha();
-      Int_t sector = Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha() + (alpha>0. ? 0 : AliTRDgeometry::kNsector));
+  TGeoHMatrix *matrix = 0x0;
+  Double_t x, y, z;
+  for (Int_t ily=0, sm=-1, stk=-1, det=-1; ily < AliTRDgeometry::kNlayer; ily++) {
+    // rough estimate of the entry point
+    if (!t.GetProlongation(fR[ily], y, z)){
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kProlongation);
+      break;
+    }
 
-      if(!fTrSec[sector].GetNChambers()) continue;
-      
-      if((x = fTrSec[sector].GetX(ilayer)) < 1.) continue;
-    
-      // Propagate closer to the current layer
-      x0 = x - 1.5*clength;
-      if (x0 > (fgkMaxStep + t.GetX()) && !PropagateToX(t, x0-fgkMaxStep, fgkMaxStep)) return -1/*nClustersExpected*/;
-      if (!AdjustSector(&t)) return -1/*nClustersExpected*/;
-      if (TMath::Abs(t.GetSnp()) > fgkMaxSnp) return -1/*nClustersExpected*/;
-
-      if (!t.GetProlongation(x, y, z)) return -1/*nClustersExpected*/;
-      Int_t stack = fGeom->GetStack(z, ilayer);
-      Int_t nCandidates = stack >= 0 ? 1 : 2;
-      z -= stack >= 0 ? 0. : 4.; 
-      
-      for(int icham=0; icham<nCandidates; icham++, z+=8){
-        if((stack = fGeom->GetStack(z, ilayer)) < 0) continue;
-      
-        if(!(chamber = fTrSec[sector].GetChamber(stack, ilayer))) continue;
-      
-        if(chamber->GetNClusters() < fgNTimeBins*fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()) continue;
-      
-        x = chamber->GetX();
-      
-        AliTRDpadPlane *pp = fGeom->GetPadPlane(ilayer, stack);
-        tracklet.SetTilt(TMath::Tan(TMath::DegToRad()*pp->GetTiltingAngle()));
-        tracklet.SetPadLength(pp->GetLengthIPad());
-        tracklet.SetDetector(chamber->GetDetector());
-        tracklet.SetX0(x);
-        tracklet.UpDate(&t);
-//         if(!tracklet.Init(&t)){
-//           t.SetStopped(kTRUE);
-//           return nClustersExpected;
-//         }
-        if(!tracklet.AttachClusters(chamber, kTRUE)) continue;
-        //if(!tracklet.AttachClustersIter(chamber, 1000.)) continue;
-        //tracklet.Init(&t);
-        
-        if(tracklet.GetN() < fgNTimeBins*fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()) continue;
-      
+    // find sector / stack / detector
+    sm = t.GetSector();
+    // TODO cross check with y value !
+    stk = fGeom->GetStack(z, ily);
+    det = stk>=0 ? AliTRDgeometry::GetDetector(ily, stk, sm) : -1;
+    matrix = det>=0 ? fGeom->GetClusterMatrix(det) : 0x0;
+
+    // check if supermodule/chamber is installed
+    if( !fGeom->GetSMstatus(sm) ||
+        stk<0. ||
+        fGeom->IsHole(ily, stk, sm) ||
+        !matrix ){ 
+      // propagate to the default radial position
+      if(fR[ily] > (fgkMaxStep + t.GetX()) && !PropagateToX(t, fR[ily], fgkMaxStep)){
+        n=-1; 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kPropagation);
         break;
       }
-      ptrTracklet->UpdateUsed();
-    }
-    if(!ptrTracklet->IsOK()){
-      ptrTracklet->Reset();
-      if(x < 1.) continue; //temporary
-      if(!PropagateToX(t, x-fgkMaxStep, fgkMaxStep)) return -1/*nClustersExpected*/;
-      if(!AdjustSector(&t)) return -1/*nClustersExpected*/;
-      if(TMath::Abs(t.GetSnp()) > fgkMaxSnp) return -1/*nClustersExpected*/;
+      if(!AdjustSector(&t)){
+        n=-1; 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kAdjustSector);
+        break;
+      }
+      if(TMath::Abs(t.GetSnp()) > fgkMaxSnp){
+        n=-1; 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kSnp);
+        break;
+      }
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kGeometry, ily);
       continue;
     }
-    
-    // Propagate closer to the current chamber if neccessary 
-    x -= clength;
-    if (x > (fgkMaxStep + t.GetX()) && !PropagateToX(t, x-fgkMaxStep, fgkMaxStep)) return -1/*nClustersExpected*/;
-    if (!AdjustSector(&t)) return -1/*nClustersExpected*/;
-    if (TMath::Abs(t.GetSnp()) > fgkMaxSnp) return -1/*nClustersExpected*/;
-    
-    // load tracklet to the tracker and the track
-    ptrTracklet->UseClusters();
-    ptrTracklet->Fit(kFALSE); // no tilt correction
-    ptrTracklet = SetTracklet(ptrTracklet);
-    t.SetTracklet(ptrTracklet, fTracklets->GetEntriesFast()-1);
-  
-  
-    // Calculate the mean material budget along the path inside the chamber
-    //Calculate global entry and exit positions of the track in chamber (only track prolongation)
-    Double_t xyz0[3]; // entry point 
-    t.GetXYZ(xyz0);
-    alpha = t.GetAlpha();
-    x = ptrTracklet->GetX(); //GetX0();
-    if (!t.GetProlongation(x, y, z)) return -1/*nClustersExpected*/;
-    Double_t xyz1[3]; // exit point
-    xyz1[0] =  x * TMath::Cos(alpha) - y * TMath::Sin(alpha); 
-    xyz1[1] = +x * TMath::Sin(alpha) + y * TMath::Cos(alpha);
-    xyz1[2] =  z;
-    Double_t param[7];
-    if(AliTracker::MeanMaterialBudget(xyz0, xyz1, param)<=0.) return -1;       
-    // The mean propagation parameters
-    Double_t xrho = param[0]*param[4]; // density*length
-    Double_t xx0  = param[1]; // radiation length
-    
-    // Propagate and update track
-    if (!t.PropagateTo(x, xx0, xrho)) return -1/*nClustersExpected*/;
-    if (!AdjustSector(&t)) return -1/*nClustersExpected*/;
 
+    // retrieve rotation matrix for the current chamber
+    Double_t loc[] = {AliTRDgeometry::AnodePos()- driftLength, 0., 0.};
+    Double_t glb[] = {0., 0., 0.};
+    matrix->LocalToMaster(loc, glb);
+
+    // Propagate to the radial distance of the current layer
+    x = glb[0] - fgkMaxStep;
+    if(x > (fgkMaxStep + t.GetX()) && !PropagateToX(t, x, fgkMaxStep)){
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kPropagation);
+      break;
+    }
+    if(!AdjustSector(&t)){
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kAdjustSector);
+      break;
+    }
+    if(TMath::Abs(t.GetSnp()) > fgkMaxSnp) {
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kSnp);
+      break;
+    }
+    Bool_t RECALCULATE = kFALSE;
+    if(sm != t.GetSector()){
+      sm = t.GetSector(); 
+      RECALCULATE = kTRUE;
+    }
+    if(stk != fGeom->GetStack(z, ily)){
+      stk = fGeom->GetStack(z, ily);
+      RECALCULATE = kTRUE;
+    }
+    if(RECALCULATE){
+      det = AliTRDgeometry::GetDetector(ily, stk, sm);
+      if(!(matrix = fGeom->GetClusterMatrix(det))){ 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kGeometry, ily);
+        continue;
+      }
+      matrix->LocalToMaster(loc, glb);
+      x = glb[0] - fgkMaxStep;
+    }
+
+    // check if track is well inside fiducial volume 
+    if (!t.GetProlongation(x+fgkMaxStep, y, z)) {
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kProlongation);
+      break;
+    }
+    if(fGeom->IsOnBoundary(det, y, z, .5)){ 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kBoundary, ily);
+      continue;
+    }
+    // mark track as entering the FIDUCIAL volume of TRD
     if(kStoreIn){
       t.SetTrackLow(); 
       kStoreIn = kFALSE;
     }
-    Double_t maxChi2 = t.GetPredictedChi2(ptrTracklet);
-    if (!t.Update(ptrTracklet, maxChi2)) return -1/*nClustersExpected*/;
-    ptrTracklet->UpDate(&t);
 
-    if (maxChi2<1e+10) { 
-      nClustersExpected += ptrTracklet->GetN();
-      //t.SetTracklet(&tracklet, index);
+    ptrTracklet  = tracklets[ily];
+    if(!ptrTracklet){ // BUILD TRACKLET
+      // check data in supermodule
+      if(!fTrSec[sm].GetNChambers()){ 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoClusters, ily);
+        continue;
+      }
+      if(fTrSec[sm].GetX(ily) < 1.){ 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoClusters, ily);
+        continue;
+      }
+      
+      // check data in chamber
+      if(!(chamber = fTrSec[sm].GetChamber(stk, ily))){ 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoClusters, ily);
+        continue;
+      }
+      if(chamber->GetNClusters() < fgNTimeBins*fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()){ 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoClusters, ily);
+        continue;
+      }      
+      // build tracklet
+      ptrTracklet = new(&tracklet) AliTRDseedV1(det);
+      ptrTracklet->SetReconstructor(fReconstructor);
+      ptrTracklet->SetKink(t.IsKink());
+      ptrTracklet->SetPadPlane(fGeom->GetPadPlane(ily, stk));
+      ptrTracklet->SetX0(glb[0]+driftLength);
+      if(!tracklet.Init(&t)){
+        n=-1; 
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kTrackletInit);
+        break;
+      }
+      if(!tracklet.AttachClusters(chamber, kTRUE)){   
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoAttach, ily);
+        continue;
+      }
+      if(tracklet.GetN() < fgNTimeBins*fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()){
+        t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoClustersTracklet, ily);
+        continue;
+      }
+      ptrTracklet->UpdateUsed();
+    }
+    // propagate track to the radial position of the tracklet
+    ptrTracklet->UseClusters(); // TODO ? do we need this here ?
+    // fit tracklet no tilt correction
+    if(!ptrTracklet->Fit(kFALSE)){
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kNoFit, ily);
+      continue;
+    } 
+    x = ptrTracklet->GetX(); //GetX0();
+    if(x > (fgkMaxStep + t.GetX()) && !PropagateToX(t, x, fgkMaxStep)) {
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kPropagation);
+      break;
+    }
+    if(!AdjustSector(&t)) {
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kAdjustSector);
+      break;
+    }
+    if(TMath::Abs(t.GetSnp()) > fgkMaxSnp) {
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kSnp);
+      break;
+    }
+    if(kPropagateIn){
+      t.SetTrackLow(); 
+      kPropagateIn = kFALSE;
+    }
+    Double_t cov[3]; ptrTracklet->GetCovAt(x, cov);
+    Double_t p[2] = { ptrTracklet->GetY(), ptrTracklet->GetZ()};
+    Double_t chi2 = ((AliExternalTrackParam)t).GetPredictedChi2(p, cov);
+    if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 2){
+      Double_t ytrack = ptrTracklet->GetYref(0);
+      Double_t ztrack = ptrTracklet->GetZref(0);
+      Double_t ytracklet = ptrTracklet->GetYfit(0);
+      Double_t ztracklet = ptrTracklet->GetZfit(0);
+      Double_t phitrack = ptrTracklet->GetYref(1);
+      Double_t phitracklet = ptrTracklet->GetYfit(1);
+      Double_t thetatrack = ptrTracklet->GetZref(1);
+      Double_t thetatracklet = ptrTracklet->GetZfit(1);
+   
+      TTreeSRedirector &mystreamer = *fReconstructor->GetDebugStream(AliTRDReconstructor::kTracker);
+      mystreamer << "FollowBackProlongation1"
+        << "il="              << ily
+        << "x="               << x
+        << "ytrack="          << ytrack
+        << "ztrack="          << ztrack
+        << "ytracklet="       << ytracklet
+        << "ztracklet="       << ztracklet
+        << "phitrack="        << phitrack
+        << "thetatrack="      << thetatrack
+        << "phitracklet="     << phitracklet
+        << "thetatracklet="   << thetatracklet
+        << "chi2="            << chi2
+        << "\n";
+    }
+    // update Kalman with the TRD measurement
+    if(chi2>1e+10){ // TODO
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kChi2, ily);
+      continue; 
+    }
+    if(!t.Update(p, cov, chi2)) {
+      n=-1; 
+      t.SetStatus(AliTRDtrackV1::kUpdate);
+      break;
     }
+    // fill residuals ?!
+    AliTracker::FillResiduals(&t, p, cov, ptrTracklet->GetVolumeId());
+  
+
+    // load tracklet to the tracker
+    ptrTracklet->Update(&t);
+    ptrTracklet = SetTracklet(ptrTracklet);
+    t.SetTracklet(ptrTracklet, fTracklets->GetEntriesFast()-1);
+    n += ptrTracklet->GetN();
+
     // Reset material budget if 2 consecutive gold
-    if(ilayer>0 && t.GetTracklet(ilayer-1) && ptrTracklet->GetN() + t.GetTracklet(ilayer-1)->GetN() > 20) t.SetBudget(2, 0.);
+//     if(ilayer>0 && t.GetTracklet(ilayer-1) && ptrTracklet->GetN() + t.GetTracklet(ilayer-1)->GetN() > 20) t.SetBudget(2, 0.);
 
     // Make backup of the track until is gold
     // TO DO update quality check of the track.
     // consider comparison with fTimeBinsRange
     Float_t ratio0 = ptrTracklet->GetN() / Float_t(fgNTimeBins);
     //Float_t ratio1 = Float_t(t.GetNumberOfClusters()+1) / Float_t(t.GetNExpected()+1);       
-    //printf("tracklet.GetChi2() %f     [< 18.0]\n", tracklet.GetChi2()); 
-    //printf("ratio0    %f              [>   0.8]\n", ratio0);
-    //printf("ratio1     %f             [>   0.6]\n", ratio1); 
-    //printf("ratio0+ratio1 %f          [>   1.5]\n", ratio0+ratio1); 
-    //printf("t.GetNCross()  %d         [==    0]\n", t.GetNCross()); 
-    //printf("TMath::Abs(t.GetSnp()) %f [<  0.85]\n", TMath::Abs(t.GetSnp()));
-    //printf("t.GetNumberOfClusters() %d [>    20]\n", t.GetNumberOfClusters());
     
-    if (//(tracklet.GetChi2()      <  18.0) && TO DO check with FindClusters and move it to AliTRDseed::Update 
+    if( (chi2                    <  18.0) &&  
         (ratio0                  >   0.8) && 
         //(ratio1                  >   0.6) && 
         //(ratio0+ratio1           >   1.5) && 
@@ -766,20 +930,22 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation(AliTRDtrackV1 &t)
       t.MakeBackupTrack();
     }
   } // end layers loop
+  //printf("clusters[%d] chi2[%f] x[%f] status[%d ", n, t.GetChi2(), t.GetX(), t.GetStatusTRD());
+  //for(int i=0; i<6; i++) printf("%d ", t.GetStatusTRD(i)); printf("]\n");
 
   if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 1){
     TTreeSRedirector &cstreamer = *fReconstructor->GetDebugStream(AliTRDReconstructor::kTracker);
     Int_t eventNumber = AliTRDtrackerDebug::GetEventNumber();
-    //AliTRDtrackV1 *debugTrack = new AliTRDtrackV1(t);
-    //debugTrack->SetOwner();
+    AliTRDtrackV1 track(t);
+    track.SetOwner();
     cstreamer << "FollowBackProlongation"
-        << "EventNumber="                      << eventNumber
-        << "ncl="                                                      << nClustersExpected
-        //<< "track.="                                 << debugTrack
+        << "EventNumber=" << eventNumber
+        << "ncl="         << n
+        << "track.="      << &track
         << "\n";
   }
   
-  return nClustersExpected;
+  return n;
 }
 
 //_________________________________________________________________________
@@ -839,8 +1005,9 @@ void AliTRDtrackerV1::FitRieman(AliTRDcluster **seedcl, Double_t chi2[2])
   //
   AliRieman *fitter = AliTRDtrackerV1::GetRiemanFitter();
   fitter->Reset();
-  for(Int_t i = 0; i < 4; i++)
-    fitter->AddPoint(seedcl[i]->GetX(), seedcl[i]->GetY(), seedcl[i]->GetZ(), 1, 10);
+  for(Int_t i = 0; i < 4; i++){
+    fitter->AddPoint(seedcl[i]->GetX(), seedcl[i]->GetY(), seedcl[i]->GetZ(), 1., 10.);
+  }
   fitter->Update();
   
   
@@ -893,9 +1060,10 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRiemanConstraint(AliTRDseedV1 *tracklets, Doub
   Int_t nPoints = 0;
   for(Int_t ilr = 0; ilr < AliTRDgeometry::kNlayer; ilr++){
     if(!tracklets[ilr].IsOK()) continue;
-    for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNTimeBins; itb++){
+    for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNclusters; itb++){
       if(!tracklets[ilr].IsUsable(itb)) continue;
       cl = tracklets[ilr].GetClusters(itb);
+      if(!cl->IsInChamber()) continue;
       x = cl->GetX();
       y = cl->GetY();
       z = cl->GetZ();
@@ -905,7 +1073,7 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRiemanConstraint(AliTRDseedV1 *tracklets, Doub
       uvt[0] = 2. * x * t;
       uvt[1] = 2. * x * t * tilt ;
       w = 2. * (y + tilt * (z - zVertex)) * t;
-      error = 2. * TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()) * t;
+      error = 2. * TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+tilt*tilt*cl->GetSigmaZ2()) * t;
       fitter->AddPoint(uvt, w, error);
       nPoints++;
     }
@@ -981,19 +1149,22 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRieman(AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigErro
   AliTRDcluster *cl = 0x0;
 
   Double_t xref = CalculateReferenceX(tracklets);
-  Double_t x, y, z, t, tilt, dx, w, we;
-  Double_t uvt[4];
+  Double_t x, y, z, t, tilt, dx, w, we, erry, errz;
+  Double_t uvt[4], sumPolY[5], sumPolZ[3];
+  memset(sumPolY, 0, sizeof(Double_t) * 5);
+  memset(sumPolZ, 0, sizeof(Double_t) * 3);
   Int_t nPoints = 0;
   // Containers for Least-square fitter
   for(Int_t ipl = 0; ipl < kNPlanes; ipl++){
     if(!tracklets[ipl].IsOK()) continue;
-    for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNTimeBins; itb++){
+    tilt = tracklets[ipl].GetTilt();
+    for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNclusters; itb++){
       if(!(cl = tracklets[ipl].GetClusters(itb))) continue;
+      if(!cl->IsInChamber()) continue;
       if (!tracklets[ipl].IsUsable(itb)) continue;
       x = cl->GetX();
       y = cl->GetY();
       z = cl->GetZ();
-      tilt = tracklets[ipl].GetTilt();
       dx = x - xref;
       // Transformation
       t = 1./(x*x + y*y);
@@ -1004,9 +1175,21 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRieman(AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigErro
       w = 2. * (y + tilt*z) * t;
       // error definition changes for the different calls
       we = 2. * t;
-      we *= sigError ? TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()) : 0.2;
+      we *= sigError ? TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+tilt*tilt*cl->GetSigmaZ2()) : 0.2;
       fitter->AddPoint(uvt, w, we);
       zfitter.AddPoint(&x, z, static_cast<Double_t>(TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2())));
+      // adding points for covariance matrix estimation
+      erry = 1./(TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()) + 0.1);  // 0.1 is a systematic error (due to misalignment and miscalibration)
+      erry *= erry;
+      errz = 1./cl->GetSigmaZ2();
+      for(Int_t ipol = 0; ipol < 5; ipol++){
+        sumPolY[ipol] += erry;
+        erry *= x;
+        if(ipol < 3){
+          sumPolZ[ipol] += errz;
+          errz *= x;
+        }
+      }
       nPoints++;
     }
   }
@@ -1048,16 +1231,45 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRieman(AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigErro
 
   Double_t chi2track = fitter->GetChisquare()/Double_t(nPoints);
 
+  // Prepare error calculation
+  TMatrixD covarPolY(3,3);
+  covarPolY(0,0) = sumPolY[0]; covarPolY(1,1) = sumPolY[2]; covarPolY(2,2) = sumPolY[4];
+  covarPolY(0,1) = covarPolY(1,0) = sumPolY[1];
+  covarPolY(0,2) = covarPolY(2,0) = sumPolY[2];
+  covarPolY(2,1) = covarPolY(1,2) = sumPolY[3];
+  covarPolY.Invert();
+  TMatrixD covarPolZ(2,2);
+  covarPolZ(0,0) = sumPolZ[0]; covarPolZ(1,1) = sumPolZ[2];
+  covarPolZ(1,0) = covarPolZ(0,1) = sumPolZ[1];
+  covarPolZ.Invert();
+
   // Update the tracklets
-  Double_t dy, dz;
+  Double_t x1, dy, dz;
+  Double_t cov[15];
+  memset(cov, 0, sizeof(Double_t) * 15);
   for(Int_t iLayer = 0; iLayer < AliTRDtrackerV1::kNPlanes; iLayer++) {
 
     x  = tracklets[iLayer].GetX0();
+    x1 = x - xref;
     y  = 0;
     z  = 0;
     dy = 0;
     dz = 0;
-
+    memset(cov, 0, sizeof(Double_t) * 3);
+    TMatrixD transform(3,3);
+    transform(0,0) = 1;
+    transform(0,1) = x;
+    transform(0,2) = x*x;
+    transform(1,1) = 1;
+    transform(1,2) = x;
+    transform(2,2) = 1;
+    TMatrixD covariance(transform, TMatrixD::kMult, covarPolY);
+    covariance *= transform.T();
+    TMatrixD transformZ(2,2);
+    transformZ(0,0) = transformZ(1,1) = 1;
+    transformZ(0,1) = x;
+    TMatrixD covarZ(transformZ, TMatrixD::kMult, covarPolZ);
+    covarZ *= transformZ.T();
     // y:     R^2 = (x - x0)^2 + (y - y0)^2
     //     =>   y = y0 +/- Sqrt(R^2 - (x - x0)^2)
     //          R = Sqrt() = 1/Curvature
@@ -1069,6 +1281,9 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRieman(AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigErro
       res = TMath::Sqrt(res);
       y    = (1.0 - res) / a;
     }
+    cov[0] = covariance(0,0);
+    cov[2] = covarZ(0,0);
+    cov[1] = 0.;
 
     // dy:      R^2 = (x - x0)^2 + (y - y0)^2
     //     =>     y = +/- Sqrt(R^2 - (x - x0)^2) + y0
@@ -1078,9 +1293,9 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRieman(AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigErro
     Double_t x0 = -b / a;
     if (-c * a + b * b + 1 > 0) {
       if (1.0/(curvature * curvature) - (x - x0) * (x - x0) > 0.0) {
-  Double_t yderiv = (x - x0) / TMath::Sqrt(1.0/(curvature * curvature) - (x - x0) * (x - x0));
-  if (a < 0) yderiv *= -1.0;
-  dy = yderiv;
+       Double_t yderiv = (x - x0) / TMath::Sqrt(1.0/(curvature * curvature) - (x - x0) * (x - x0));
+        if (a < 0) yderiv *= -1.0;
+        dy = yderiv;
       }
     }
     z  = offset + slope * (x - xref);
@@ -1090,6 +1305,7 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRieman(AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigErro
     tracklets[iLayer].SetZref(0, z);
     tracklets[iLayer].SetZref(1, dz);
     tracklets[iLayer].SetC(curvature);
+    tracklets[iLayer].SetCovRef(cov);
     tracklets[iLayer].SetChi2(chi2track);
   }
   
@@ -1180,35 +1396,56 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::FitLine(const AliTRDtrackV1 *track, AliTRDseedV1 *trac
 //_________________________________________________________________________
 Double_t AliTRDtrackerV1::FitRiemanTilt(const AliTRDtrackV1 *track, AliTRDseedV1 *tracklets, Bool_t sigError, Int_t np, AliTrackPoint *points)
 {
-  //
-  // Performs a Riemann fit taking tilting pad correction into account
-  // The equation of a Riemann circle, where the y position is substituted by the 
-  // measured y-position taking pad tilting into account, has to be transformed
-  // into a 4-dimensional hyperplane equation
-  // Riemann circle: (x-x0)^2 + (y-y0)^2 -R^2 = 0
-  // Measured y-Position: ymeas = y - tan(phiT)(zc - zt)
-  //          zc: center of the pad row
-  //          zt: z-position of the track
-  // The z-position of the track is assumed to be linear dependent on the x-position
-  // Transformed equation: a + b * u + c * t + d * v  + e * w - 2 * (ymeas + tan(phiT) * zc) * t = 0
-  // Transformation:       u = 2 * x * t
-  //                       v = 2 * tan(phiT) * t
-  //                       w = 2 * tan(phiT) * (x - xref) * t
-  //                       t = 1 / (x^2 + ymeas^2)
-  // Parameters:           a = -1/y0
-  //                       b = x0/y0
-  //                       c = (R^2 -x0^2 - y0^2)/y0
-  //                       d = offset
-  //                       e = dz/dx
-  // If the offset respectively the slope in z-position is impossible, the parameters are fixed using 
-  // results from the simple riemann fit. Afterwards the fit is redone.
-  // The curvature is calculated according to the formula:
-  //                       curv = a/(1 + b^2 + c*a) = 1/R
-  //
-  // Paramters:   - Array of tracklets (connected to the track candidate)
-  //              - Flag selecting the error definition
-  // Output:      - Chi2 values of the track (in Parameter list)
-  //
+//
+// Performs a Riemann fit taking tilting pad correction into account
+//
+// Paramters:   - Array of tracklets (connected to the track candidate)
+//              - Flag selecting the error definition
+// Output:      - Chi2 values of the track (in Parameter list)
+//
+// The equations which has to be solved simultaneously are:
+// BEGIN_LATEX
+// R^{2} = (x-x_{0})^{2} + (y^{*}-y_{0})^{2}
+// y^{*} = y - tg(h)(z - z_{t})
+// z_{t} = z_{0}+dzdx*(x-x_{r})
+// END_LATEX
+// with (x, y, z) the coordinate of the cluster, (x_0, y_0, z_0) the coordinate of the center of the Riemann circle,
+// R its radius, x_r a constant refrence radial position in the middle of the TRD stack  and dzdx the slope of the 
+// track in the x-z plane. Using the following transformations
+// BEGIN_LATEX
+// t = 1 / (x^{2} + y^{2})
+// u = 2 * x * t
+// v = 2 * tan(h) * t
+// w = 2 * tan(h) * (x - x_{r}) * t
+// END_LATEX
+// One gets the following linear equation
+// BEGIN_LATEX
+// a + b * u + c * t + d * v  + e * w = 2 * (y + tg(h) * z) * t
+// END_LATEX
+// where the coefficients have the following meaning 
+// BEGIN_LATEX
+// a = -1/y_{0}
+// b = x_{0}/y_{0}
+// c = (R^{2} -x_{0}^{2} - y_{0}^{2})/y_{0}
+// d = z_{0}
+// e = dz/dx
+// END_LATEX
+// The error calculation for the free term is thus
+// BEGIN_LATEX
+// #sigma = 2 * #sqrt{#sigma^{2}_{y} + (tilt corr ...) + tg^{2}(h) * #sigma^{2}_{z}} * t
+// END_LATEX
+//
+// From this simple model one can compute chi^2 estimates and a rough approximation of pt from the curvature according 
+// to the formula:
+// BEGIN_LATEX
+// C = 1/R = a/(1 + b^{2} + c*a)
+// END_LATEX
+//
+// Authors
+//   M.Ivanov <M.Ivanov@gsi.de>
+//   A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
+//   M.Fasel <M.Fasel@gsi.de>
+
   TLinearFitter *fitter = GetTiltedRiemanFitter();
   fitter->StoreData(kTRUE);
   fitter->ClearPoints();
@@ -1232,7 +1469,7 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::FitRiemanTilt(const AliTRDtrackV1 *track, AliTRDseedV1
   // Containers for Least-square fitter
   for(Int_t ipl = 0; ipl < kNPlanes; ipl++){
     if(!tracklets[ipl].IsOK()) continue;
-    for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNTimeBins; itb++){
+    for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNclusters; itb++){
       if(!(cl = tracklets[ipl].GetClusters(itb))) continue;
       if (!tracklets[ipl].IsUsable(itb)) continue;
       x = cl->GetX();
@@ -1428,8 +1665,10 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::FitKalman(AliTRDtrackV1 *track, AliTRDseedV1 *tracklet
     if (!AdjustSector(track)) break;
   
     //Update track
-    Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(ptrTracklet);
-    if(chi2<1e+10) track->Update(ptrTracklet, chi2);
+    Double_t cov[3]; ptrTracklet->GetCovAt(x, cov);
+    Double_t p[2] = { ptrTracklet->GetY(), ptrTracklet->GetZ()};
+    Double_t chi2 = ((AliExternalTrackParam*)track)->GetPredictedChi2(p, cov);
+    if(chi2<1e+10) track->Update(p, cov, chi2);
     if(!up) continue;
 
                //Reset material budget if 2 consecutive gold
@@ -1510,9 +1749,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::PropagateToX(AliTRDtrackV1 &t, Double_t xToGo, Double_t m
     x = xpos + step;
 
     // Get local Y and Z at the X-position of the next step
-    if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
-      return 0; // No prolongation possible
-    }
+    if(t.GetProlongation(x,y,z)<0) return 0; // No prolongation possible
 
     // The global position of the end point of this prolongation step
     xyz1[0] =  x * TMath::Cos(t.GetAlpha()) - y * TMath::Sin(t.GetAlpha()); 
@@ -1578,7 +1815,6 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::ReadClusters(TClonesArray* &array, TTree *clusterTree) co
     Int_t nCluster = clusterArray->GetEntriesFast();  
     for (Int_t iCluster = 0; iCluster < nCluster; iCluster++) { 
       if(!(c = (AliTRDcluster *) clusterArray->UncheckedAt(iCluster))) continue;
-      c->SetInChamber();
       new((*fClusters)[ncl++]) AliTRDcluster(*c);
       delete (clusterArray->RemoveAt(iCluster)); 
     }
@@ -1676,12 +1912,19 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::BuildTrackingContainers()
 //____________________________________________________________________
 void AliTRDtrackerV1::UnloadClusters() 
 { 
-  //
-  // Clears the arrays of clusters and tracks. Resets sectors and timebins 
-  //
+//
+// Clears the arrays of clusters and tracks. Resets sectors and timebins 
+// If option "force" is also set the containers are also deleted. This is useful 
+// in case of HLT
 
-  if(fTracks) fTracks->Delete(); 
-  if(fTracklets) fTracklets->Delete();
+  if(fTracks){ 
+    fTracks->Delete(); 
+    if(HasRemoveContainers()){delete fTracks; fTracks = 0x0;}
+  }
+  if(fTracklets){ 
+    fTracklets->Delete();
+    if(HasRemoveContainers()){delete fTracklets; fTracklets = 0x0;}
+  }
   if(fClusters){ 
     if(IsClustersOwner()) fClusters->Delete();
     
@@ -1708,7 +1951,7 @@ void AliTRDtrackerV1::UnloadClusters()
 //   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 //     if(!(tracklet = track->GetTracklet(ily))) continue;
 //     AliTRDcluster *c = 0x0;
-//     for(Int_t ic=AliTRDseed::knTimebins; ic--;){
+//     for(Int_t ic=AliTRDseed::kNclusters; ic--;){
 //       if(!(c=tracklet->GetClusters(ic))) continue;
 //       c->Use();
 //     }
@@ -1912,7 +2155,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::Clusters2TracksStack(AliTRDtrackingChamber **stack, TClon
 
   // Build initial seeding configurations
   Double_t quality = BuildSeedingConfigs(stack, configs);
-  if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 1){
+  if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 10){
     AliInfo(Form("Plane config %d %d %d Quality %f"
     , configs[0], configs[1], configs[2], quality));
   }
@@ -1938,6 +2181,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::Clusters2TracksStack(AliTRDtrackingChamber **stack, TClon
       pars[1] = ntracks;
       pars[2] = istack;
       ntracks = MakeSeeds(stack, &sseed[6*ntracks], pars);
+      //AliInfo(Form("Number of Tracks after iteration step %d: %d\n", iconf, ntracks));
       if(ntracks == kMaxTracksStack) break;
     }
     if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 1) AliInfo(Form("Candidate TRD tracks %d in iteration %d.", ntracks, fSieveSeeding));
@@ -1981,7 +2225,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::Clusters2TracksStack(AliTRDtrackingChamber **stack, TClon
           Int_t jseed = kNPlanes*trackIndex+jLayer;
           if(!sseed[jseed].IsOK()) continue;
           if (TMath::Abs(sseed[jseed].GetYref(0) / sseed[jseed].GetX0()) < 0.158) findable++;
-        
+          // TODO here we get a sig fault which should never happen !
           sseed[jseed].UpdateUsed();
           ncl   += sseed[jseed].GetN2();
           nused += sseed[jseed].GetNUsed();
@@ -2052,13 +2296,12 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::Clusters2TracksStack(AliTRDtrackingChamber **stack, TClon
         trackParams[6] = fGeom->GetSector(chamber->GetDetector());/* *alpha+shift;     // Supermodule*/
 
         if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 1){
-          AliInfo(Form("Track %d [%d] nlayers %d trackQuality = %e nused %d, yref = %3.3f", itrack, trackIndex, nlayers, fTrackQuality[trackIndex], nused, trackParams[1]));
+          //AliInfo(Form("Track %d [%d] nlayers %d trackQuality = %e nused %d, yref = %3.3f", itrack, trackIndex, nlayers, fTrackQuality[trackIndex], nused, trackParams[1]));
 
           AliTRDseedV1 *dseed[6];
-          memcpy(dseed, lseed, 6*sizeof(AliTRDseedV1*));
+          for(Int_t iseed = AliTRDgeometry::kNlayer; iseed--;) dseed[iseed] = new AliTRDseedV1(lseed[iseed]);
 
           //Int_t eventNrInFile = esd->GetEventNumberInFile();
-          //AliInfo(Form("Number of clusters %d.", nclusters));
           Int_t eventNumber = AliTRDtrackerDebug::GetEventNumber();
           Int_t trackNumber = AliTRDtrackerDebug::GetTrackNumber();
           Int_t candidateNumber = AliTRDtrackerDebug::GetCandidateNumber();
@@ -2129,7 +2372,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::Clusters2TracksStack(AliTRDtrackingChamber **stack, TClon
       chamber->Build(fGeom, cal);//Indices(fSieveSeeding);
     }
 
-    if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 1){ 
+    if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 10){ 
       AliInfo(Form("Sieve level %d Plane config %d %d %d Quality %f", fSieveSeeding, configs[0], configs[1], configs[2], quality));
     }
   } while(fSieveSeeding<10); // end stack clusters sieve
@@ -2168,15 +2411,15 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::BuildSeedingConfigs(AliTRDtrackingChamber **stack, Int
   // The overall chamber quality is given by the product of this 2 contributions.
   // 
 
-  Double_t chamberQ[kNPlanes];
+  Double_t chamberQ[kNPlanes];memset(chamberQ, 0, kNPlanes*sizeof(Double_t));
   AliTRDtrackingChamber *chamber = 0x0;
   for(int iplane=0; iplane<kNPlanes; iplane++){
     if(!(chamber = stack[iplane])) continue;
     chamberQ[iplane] = (chamber = stack[iplane]) ?  chamber->GetQuality() : 0.;
   }
 
-  Double_t tconfig[kNConfigs];
-  Int_t planes[4];
+  Double_t tconfig[kNConfigs];memset(tconfig, 0, kNConfigs*sizeof(Double_t));
+  Int_t planes[] = {0, 0, 0, 0};
   for(int iconf=0; iconf<kNConfigs; iconf++){
     GetSeedingConfig(iconf, planes);
     tconfig[iconf] = fgTopologicQA[iconf];
@@ -2194,54 +2437,65 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::BuildSeedingConfigs(AliTRDtrackingChamber **stack, Int
 //____________________________________________________________________
 Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *sseed, Int_t *ipar)
 {
-  //
-  // Make tracklet seeds in the TRD stack.
-  //
-  // Parameters :
-  //   layers : Array of stack propagation layers containing clusters
-  //   sseed  : Array of empty tracklet seeds. On exit they are filled.
-  //   ipar   : Control parameters:
-  //       ipar[0] -> seeding chambers configuration
-  //       ipar[1] -> stack index
-  //       ipar[2] -> number of track candidates found so far
-  //
-  // Output :
-  //   Number of tracks candidates found.
-  // 
-  // Detailed description
-  //
-  // The following steps are performed:
-  // 1. Select seeding layers from seeding chambers
-  // 2. Select seeding clusters from the seeding AliTRDpropagationLayerStack.
-  //   The clusters are taken from layer 3, layer 0, layer 1 and layer 2, in
-  //   this order. The parameters controling the range of accepted clusters in
-  //   layer 0, 1, and 2 are defined in AliTRDchamberTimeBin::BuildCond().
-  // 3. Helix fit of the cluster set. (see AliTRDtrackerFitter::FitRieman(AliTRDcluster**))
-  // 4. Initialize seeding tracklets in the seeding chambers.
-  // 5. Filter 0.
-  //   Chi2 in the Y direction less than threshold ... (1./(3. - sLayer))
-  //   Chi2 in the Z direction less than threshold ... (1./(3. - sLayer))
-  // 6. Attach clusters to seeding tracklets and find linear approximation of
-  //   the tracklet (see AliTRDseedV1::AttachClustersIter()). The number of used
-  //   clusters used by current seeds should not exceed ... (25).
-  // 7. Filter 1.
-  //   All 4 seeding tracklets should be correctly constructed (see
-  //   AliTRDseedV1::AttachClustersIter())
-  // 8. Helix fit of the seeding tracklets
-  // 9. Filter 2.
-  //   Likelihood calculation of the fit. (See AliTRDtrackerV1::CookLikelihood() for details)
-  // 10. Extrapolation of the helix fit to the other 2 chambers:
-  //    a) Initialization of extrapolation tracklet with fit parameters
-  //    b) Helix fit of tracklets
-  //    c) Attach clusters and linear interpolation to extrapolated tracklets
-  //    d) Helix fit of tracklets
-  // 11. Improve seeding tracklets quality by reassigning clusters.
-  //      See AliTRDtrackerV1::ImproveSeedQuality() for details.
-  // 12. Helix fit of all 6 seeding tracklets and chi2 calculation
-  // 13. Hyperplane fit and track quality calculation. See AliTRDtrackerFitter::FitHyperplane() for details.
-  // 14. Cooking labels for tracklets. Should be done only for MC
-  // 15. Register seeds.
-  //
+//
+// Seed tracklets and build candidate TRD tracks. The procedure is used during barrel tracking to account for tracks which are 
+// either missed by TPC prolongation or conversions inside the TRD volume. 
+// For stand alone tracking the procedure is used to estimate all tracks measured by TRD. 
+//
+// Parameters :
+//   layers : Array of stack propagation layers containing clusters
+//   sseed  : Array of empty tracklet seeds. On exit they are filled.
+//   ipar   : Control parameters:
+//       ipar[0] -> seeding chambers configuration
+//       ipar[1] -> stack index
+//       ipar[2] -> number of track candidates found so far
+//
+// Output :
+//   Number of tracks candidates found.
+// 
+// The following steps are performed:
+// 1. Build seeding layers by collapsing all time bins from each of the four seeding chambers along the 
+// radial coordinate. See AliTRDtrackingChamber::GetSeedingLayer() for details. The chambers selection for seeding
+// is described in AliTRDtrackerV1::Clusters2TracksStack().
+// 2. Using the seeding clusters from the seeding layer (step 1) build combinatorics using the following algorithm:
+// - for each seeding cluster in the lower seeding layer find
+// - all seeding clusters in the upper seeding layer inside a road defined by a given phi angle. The angle 
+//   is calculated on the minimum pt of tracks from vertex accesible to the stand alone tracker.
+// - for each pair of two extreme seeding clusters select middle upper cluster using roads defined externally by the 
+//   reco params
+// - select last seeding cluster as the nearest to the linear approximation of the track described by the first three
+//   seeding clusters.
+//   The implementation of road calculation and cluster selection can be found in the functions AliTRDchamberTimeBin::BuildCond()
+//   and AliTRDchamberTimeBin::GetClusters().   
+// 3. Helix fit of the seeding clusters set. (see AliTRDtrackerFitter::FitRieman(AliTRDcluster**)). No tilt correction is 
+//    performed at this level 
+// 4. Initialize seeding tracklets in the seeding chambers.
+// 5. *Filter 0* Chi2 cut on the Y and Z directions. The threshold is set externally by the reco params.
+// 6. Attach (true) clusters to seeding tracklets (see AliTRDseedV1::AttachClusters()) and fit tracklet (see 
+//    AliTRDseedV1::Fit()). The number of used clusters used by current seeds should not exceed ... (25).
+// 7. *Filter 1* Check if all 4 seeding tracklets are correctly constructed.
+// 8. Helix fit of the clusters from the seeding tracklets with tilt correction. Refit tracklets using the new 
+//    approximation of the track.
+// 9. *Filter 2* Calculate likelihood of the track. (See AliTRDtrackerV1::CookLikelihood()). The following quantities are
+//    checked against the Riemann fit:
+//      - position resolution in y
+//      - angular resolution in the bending plane
+//      - likelihood of the number of clusters attached to the tracklet
+// 10. Extrapolation of the helix fit to the other 2 chambers *non seeding* chambers:
+//      - Initialization of extrapolation tracklets with the fit parameters
+//      - Attach clusters to extrapolated tracklets
+//      - Helix fit of tracklets
+// 11. Improve seeding tracklets quality by reassigning clusters based on the last parameters of the track
+//      See AliTRDtrackerV1::ImproveSeedQuality() for details.
+// 12. Helix fit of all 6 seeding tracklets and chi2 calculation
+// 13. Hyperplane fit and track quality calculation. See AliTRDtrackerFitter::FitHyperplane() for details.
+// 14. Cooking labels for tracklets. Should be done only for MC
+// 15. Register seeds.
+//
+// Authors:
+//   Marian Ivanov <M.Ivanov@gsi.de>
+//   Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
+//   Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>
 
   AliTRDtrackingChamber *chamber = 0x0;
   AliTRDcluster *c[kNSeedPlanes] = {0x0, 0x0, 0x0, 0x0}; // initilize seeding clusters
@@ -2253,11 +2507,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
   // chi2[1] = tracklet chi2 on the R direction
   Double_t chi2[4];
 
-       // Default positions for the anode wire in all 6 Layers in case of a stack with missing clusters
-       // Positions taken using cosmic data taken with SM3 after rebuild
-  Double_t x_def[kNPlanes] = {300.2, 312.8, 325.4, 338.0, 350.6, 363.2};
-
-  // this should be data member of AliTRDtrack
+  // this should be data member of AliTRDtrack TODO
   Double_t seedQuality[kMaxTracksStack];
   
   // unpack control parameters
@@ -2265,20 +2515,39 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
   Int_t ntracks = ipar[1];
   Int_t istack  = ipar[2];
   Int_t planes[kNSeedPlanes]; GetSeedingConfig(config, planes);        
-  Int_t planesExt[kNPlanes-kNSeedPlanes];         GetExtrapolationConfig(config, planesExt);
+  Int_t planesExt[kNPlanes-kNSeedPlanes]; GetExtrapolationConfig(config, planesExt);
 
 
   // Init chambers geometry
   Double_t hL[kNPlanes];       // Tilting angle
   Float_t padlength[kNPlanes]; // pad lenghts
+  Float_t padwidth[kNPlanes];  // pad widths
   AliTRDpadPlane *pp = 0x0;
   for(int iplane=0; iplane<kNPlanes; iplane++){
     pp                = fGeom->GetPadPlane(iplane, istack);
     hL[iplane]        = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*pp->GetTiltingAngle());
     padlength[iplane] = pp->GetLengthIPad();
+    padwidth[iplane] = pp->GetWidthIPad();
+  }
+  
+  // Init anode wire position for chambers
+  Double_t x0[kNPlanes],       // anode wire position
+           driftLength = .5*AliTRDgeometry::AmThick() - AliTRDgeometry::DrThick(); // drift length
+  TGeoHMatrix *matrix = 0x0;
+  Double_t loc[] = {AliTRDgeometry::AnodePos(), 0., 0.};
+  Double_t glb[] = {0., 0., 0.};
+  AliTRDtrackingChamber **cIter = &stack[0];
+  for(int iLayer=0; iLayer<kNPlanes; iLayer++,cIter++){
+    if(!(*cIter)) continue;
+    if(!(matrix = fGeom->GetClusterMatrix((*cIter)->GetDetector()))){ 
+      continue;
+      x0[iLayer] = fgkX0[iLayer];
+    }
+    matrix->LocalToMaster(loc, glb);
+    x0[iLayer] = glb[0];
   }
-  
-  if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 1){
+
+  if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) > 2){
     AliInfo(Form("Making seeds Stack[%d] Config[%d] Tracks[%d]...", istack, config, ntracks));
   }
 
@@ -2290,7 +2559,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
     if(!chamber->GetSeedingLayer(fSeedTB[isl], fGeom, fReconstructor)) continue;
     nlayers++;
   }
-  if(nlayers < 4) return ntracks;
+  if(nlayers < kNSeedPlanes) return ntracks;
   
   
   // Start finding seeds
@@ -2306,9 +2575,9 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
       c[0] = (*fSeedTB[0])[index[jcl++]];
       if(!c[0]) continue;
       Double_t dx    = c[3]->GetX() - c[0]->GetX();
-      Double_t theta = (c[3]->GetZ() - c[0]->GetZ())/dx;
-      Double_t phi   = (c[3]->GetY() - c[0]->GetY())/dx;
-      fSeedTB[1]->BuildCond(c[0], cond1, 1, theta, phi);
+      Double_t dzdx = (c[3]->GetZ() - c[0]->GetZ())/dx;
+      Double_t dydx   = (c[3]->GetY() - c[0]->GetY())/dx;
+      fSeedTB[1]->BuildCond(c[0], cond1, 1, dzdx, dydx);
       fSeedTB[1]->GetClusters(cond1, jndex, mcl);
       //printf("Found c[0] candidates 1 %d\n", mcl);
 
@@ -2316,26 +2585,28 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
       while(kcl<mcl) {
         c[1] = (*fSeedTB[1])[jndex[kcl++]];
         if(!c[1]) continue;
-        fSeedTB[2]->BuildCond(c[1], cond2, 2, theta, phi);
+        fSeedTB[2]->BuildCond(c[1], cond2, 2, dzdx, dydx);
         c[2] = fSeedTB[2]->GetNearestCluster(cond2);
         //printf("Found c[1] candidate 2 %p\n", c[2]);
         if(!c[2]) continue;
               
-        //                             AliInfo("Seeding clusters found. Building seeds ...");
-        //                             for(Int_t i = 0; i < kNSeedPlanes; i++) printf("%i. coordinates: x = %6.3f, y = %6.3f, z = %6.3f\n", i, c[i]->GetX(), c[i]->GetY(), c[i]->GetZ());
+               //AliInfo("Seeding clusters found. Building seeds ...");
+               //for(Int_t i = 0; i < kNSeedPlanes; i++) printf("%i. coordinates: x = %6.3f, y = %6.3f, z = %6.3f\n", i, c[i]->GetX(), c[i]->GetY(), c[i]->GetZ());
               
         for (Int_t il = 0; il < kNPlanes; il++) cseed[il].Reset();
       
         FitRieman(c, chi2);
       
         AliTRDseedV1 *tseed = &cseed[0];
-        AliTRDtrackingChamber **cIter = &stack[0];
+        cIter = &stack[0];
         for(int iLayer=0; iLayer<kNPlanes; iLayer++, tseed++, cIter++){
-          tseed->SetDetector((*cIter) ? (*cIter)->GetDetector() : -1);
+          Int_t det = (*cIter) ? (*cIter)->GetDetector() : -1;
+          tseed->SetDetector(det);
           tseed->SetTilt(hL[iLayer]);
           tseed->SetPadLength(padlength[iLayer]);
+          tseed->SetPadWidth(padwidth[iLayer]);
           tseed->SetReconstructor(fReconstructor);
-          tseed->SetX0((*cIter) ? (*cIter)->GetX() : x_def[iLayer]);
+          tseed->SetX0(det<0 ? fR[iLayer]+driftLength : x0[iLayer]);
           tseed->Init(GetRiemanFitter());
           tseed->SetStandAlone(kTRUE);
         }
@@ -2385,24 +2656,32 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
               <<"\n";
         }
         if(chi2[0] > fReconstructor->GetRecoParam() ->GetChi2Z()/*7./(3. - sLayer)*//*iter*/){
-//          //AliInfo(Form("Failed chi2 filter on chi2Z [%f].", chi2[0]));
+          //AliInfo(Form("Failed chi2 filter on chi2Z [%f].", chi2[0]));
           AliTRDtrackerDebug::SetCandidateNumber(AliTRDtrackerDebug::GetCandidateNumber() + 1);
           continue;
         }
         if(chi2[1] > fReconstructor->GetRecoParam() ->GetChi2Y()/*1./(3. - sLayer)*//*iter*/){
-//          //AliInfo(Form("Failed chi2 filter on chi2Y [%f].", chi2[1]));
+          //AliInfo(Form("Failed chi2 filter on chi2Y [%f].", chi2[1]));
           AliTRDtrackerDebug::SetCandidateNumber(AliTRDtrackerDebug::GetCandidateNumber() + 1);
           continue;
         }
         //AliInfo("Passed chi2 filter.");
       
         // try attaching clusters to tracklets
-        Int_t mlayers = 0;
+        Int_t mlayers = 0; 
+             AliTRDcluster *cl = NULL;
         for(int iLayer=0; iLayer<kNSeedPlanes; iLayer++){
           Int_t jLayer = planes[iLayer];
+               Int_t nNotInChamber = 0;
           if(!cseed[jLayer].AttachClusters(stack[jLayer], kTRUE)) continue;
+          cseed[jLayer].Fit();
           cseed[jLayer].UpdateUsed();
-          if(!cseed[jLayer].IsOK()) continue;
+               cseed[jLayer].ResetClusterIter();
+               while((cl = cseed[jLayer].NextCluster())){
+                     if(!cl->IsInChamber()) nNotInChamber++;
+               }
+          //printf("clusters[%d], used[%d], not in chamber[%d]\n", cseed[jLayer].GetN(), cseed[jLayer].GetNUsed(), nNotInChamber);
+               if(cseed[jLayer].GetN() - (cseed[jLayer].GetNUsed() + nNotInChamber) < 5) continue; // checking for Cluster which are not in chamber is a much stronger restriction on real data
           mlayers++;
         }
 
@@ -2419,6 +2698,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
             Int_t jLayer = planesExt[iLayer];
             if(!(chamber = stack[jLayer])) continue;
             cseed[jLayer].AttachClusters(chamber, kTRUE);
+            cseed[jLayer].Fit();
           }
           fTrackQuality[ntracks] = 1.; // dummy value
           ntracks++;
@@ -2484,7 +2764,7 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
               << "\n";
         }
               
-        if(fReconstructor->GetRecoParam()->HasImproveTracklets() && ImproveSeedQuality(stack, cseed) < 4){
+        if(fReconstructor->HasImproveTracklets() && ImproveSeedQuality(stack, cseed) < 4){
           AliTRDtrackerDebug::SetCandidateNumber(AliTRDtrackerDebug::GetCandidateNumber() + 1);
           continue;
         }
@@ -2497,8 +2777,8 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
       
         // do the final track fitting (Once with vertex constraint and once without vertex constraint)
         Double_t chi2Vals[3];
-        chi2Vals[0] = FitTiltedRieman(&cseed[0], kFALSE);
-        if(fReconstructor->GetRecoParam()->IsVertexConstrained())
+        chi2Vals[0] = FitTiltedRieman(&cseed[0], kTRUE);
+        if(fReconstructor->HasVertexConstrained())
           chi2Vals[1] = FitTiltedRiemanConstraint(&cseed[0], GetZ()); // Do Vertex Constrained fit if desired
         else
           chi2Vals[1] = 1.;
@@ -2554,50 +2834,58 @@ Int_t AliTRDtrackerV1::MakeSeeds(AliTRDtrackingChamber **stack, AliTRDseedV1 *ss
 //_____________________________________________________________________________
 AliTRDtrackV1* AliTRDtrackerV1::MakeTrack(AliTRDseedV1 *seeds, Double_t *params)
 {
-  //
-  // Build a TRD track out of tracklet candidates
-  //
-  // Parameters :
-  //   seeds  : array of tracklets
-  //   params : track parameters (see MakeSeeds() function body for a detailed description)
-  //
-  // Output :
-  //   The TRD track.
-  //
-  // Detailed description
-  //
-  // To be discussed with Marian !!
-  //
-
+//
+// Build a TRD track out of tracklet candidates
+//
+// Parameters :
+//   seeds  : array of tracklets
+//   params : array of track parameters as they are estimated by stand alone tracker. 7 elements.
+//     [0] - radial position of the track at reference point
+//     [1] - y position of the fit at [0]
+//     [2] - z position of the fit at [0]
+//     [3] - snp of the first tracklet
+//     [4] - tgl of the first tracklet
+//     [5] - curvature of the Riemann fit - 1/pt
+//     [6] - sector rotation angle
+//
+// Output :
+//   The TRD track.
+//
+// Initialize the TRD track based on the parameters of the fit and a parametric covariance matrix 
+// (diagonal with constant variance terms TODO - correct parameterization) 
+// 
+// In case of HLT just register the tracklets in the tracker and return values of the Riemann fit. For the
+// offline case perform a full Kalman filter on the already found tracklets (see AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation() 
+// for details). Do also MC label calculation and PID if propagation successfully.
 
   Double_t alpha = AliTRDgeometry::GetAlpha();
   Double_t shift = AliTRDgeometry::GetAlpha()/2.0;
   Double_t c[15];
 
-  c[ 0] = 0.2;
-  c[ 1] = 0.0; c[ 2] = 2.0;
-  c[ 3] = 0.0; c[ 4] = 0.0; c[ 5] = 0.02;
-  c[ 6] = 0.0; c[ 7] = 0.0; c[ 8] = 0.0;  c[ 9] = 0.1;
-  c[10] = 0.0; c[11] = 0.0; c[12] = 0.0;  c[13] = 0.0; c[14] = params[5]*params[5]*0.01;
+  c[ 0] = 0.2; // s^2_y
+  c[ 1] = 0.0; c[ 2] = 2.0; // s^2_z
+  c[ 3] = 0.0; c[ 4] = 0.0; c[ 5] = 0.02; // s^2_snp
+  c[ 6] = 0.0; c[ 7] = 0.0; c[ 8] = 0.0;  c[ 9] = 0.1; // s^2_tgl
+  c[10] = 0.0; c[11] = 0.0; c[12] = 0.0;  c[13] = 0.0; c[14] = params[5]*params[5]*0.01; // s^2_1/pt
 
   AliTRDtrackV1 track(seeds, &params[1], c, params[0], params[6]*alpha+shift);
   track.PropagateTo(params[0]-5.0);
   AliTRDseedV1 *ptrTracklet = 0x0;
-  // Sign clusters
-  for (Int_t jLayer = 0; jLayer < AliTRDgeometry::kNlayer; jLayer++) {
-    ptrTracklet = &seeds[jLayer];
-    if(!ptrTracklet->IsOK()) continue;
-    if(TMath::Abs(ptrTracklet->GetYref(1) - ptrTracklet->GetYfit(1)) >= .2) continue; // check this condition with Marian
-  }
-  // 
+
+  // skip Kalman filter for HLT
   if(fReconstructor->IsHLT()){ 
-    for(Int_t ip=0; ip<kNPlanes; ip++){
-      track.UnsetTracklet(ip);
-      ptrTracklet = SetTracklet(&seeds[ip]);
+    for (Int_t jLayer = 0; jLayer < AliTRDgeometry::kNlayer; jLayer++) {
+      track.UnsetTracklet(jLayer);
+      ptrTracklet = &seeds[jLayer];
+      if(!ptrTracklet->IsOK()) continue;
+      if(TMath::Abs(ptrTracklet->GetYref(1) - ptrTracklet->GetYfit(1)) >= .2) continue; // check this condition with Marian
+      ptrTracklet = SetTracklet(ptrTracklet);
       ptrTracklet->UseClusters();
       track.SetTracklet(ptrTracklet, fTracklets->GetEntriesFast()-1);
     }
     AliTRDtrackV1 *ptrTrack = SetTrack(&track);
+    ptrTrack->CookPID();
     ptrTrack->SetReconstructor(fReconstructor);
     return ptrTrack;
   }
@@ -2756,10 +3044,10 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::CalculateTrackLikelihood(AliTRDseedV1 *tracklets, Doub
   chi2phi /= Float_t (nLayers - 2.0);
   
   Double_t likeChi2Z  = TMath::Exp(-chi2[2] * 0.14);                   // Chi2Z 
-  Double_t likeChi2TC = (fReconstructor->GetRecoParam() ->IsVertexConstrained()) ? 
+  Double_t likeChi2TC = (fReconstructor->HasVertexConstrained()) ? 
                                                                                        TMath::Exp(-chi2[1] * 0.677) : 1;                       // Constrained Tilted Riemann
-  Double_t likeChi2TR = TMath::Exp(-chi2[0] * 0.78);                   // Non-constrained Tilted Riemann
-  Double_t likeChi2Phi= TMath::Exp(-chi2phi * 3.23);
+  Double_t likeChi2TR = TMath::Exp(-chi2[0] * 0.0078);                 // Non-constrained Tilted Riemann
+  Double_t likeChi2Phi= TMath::Exp(-chi2phi * 3.23);//3.23
   Double_t trackLikelihood     = likeChi2Z * likeChi2TR * likeChi2Phi;
 
   if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) >= 2){
@@ -2776,7 +3064,7 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::CalculateTrackLikelihood(AliTRDseedV1 *tracklets, Doub
         << "TrackLikelihood=" << trackLikelihood
         << "\n";
   }
-
+  
   return trackLikelihood;
 }
 
@@ -2829,7 +3117,6 @@ Double_t AliTRDtrackerV1::CookLikelihood(AliTRDseedV1 *cseed, Int_t planes[4])
   Double_t likeN     = TMath::Exp(-(fRecoPars->GetNMeanClusters() - nclusters) / fRecoPars->GetNSigmaClusters());
   Double_t like      = likea * likechi2y * likechi2z * likeN;
 
-  //   AliInfo(Form("sumda(%f) chi2[0](%f) chi2[1](%f) likea(%f) likechi2y(%f) likechi2z(%f) nclusters(%d) likeN(%f)", sumda, chi2[0], chi2[1], likea, likechi2y, likechi2z, nclusters, likeN));
   if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) >= 2){
     Int_t eventNumber = AliTRDtrackerDebug::GetEventNumber();
     Int_t candidateNumber = AliTRDtrackerDebug::GetCandidateNumber();
@@ -3109,58 +3396,7 @@ AliKalmanTrack* AliTRDtrackerV1::GetTrack(Int_t idx) const
   return idx >= 0 && idx < ntrk ? (AliKalmanTrack*)fTracks->UncheckedAt(idx) : 0x0;
 }
 
-//____________________________________________________________________
-Float_t AliTRDtrackerV1::CalculateReferenceX(AliTRDseedV1 *tracklets){
-  //
-  // Calculates the reference x-position for the tilted Rieman fit defined as middle
-  // of the stack (middle between layers 2 and 3). For the calculation all the tracklets
-  // are taken into account
-  // 
-  // Parameters:       - Array of tracklets(AliTRDseedV1)
-  //
-  // Output:           - The reference x-position(Float_t)
-  //
-  Int_t nDistances = 0;
-  Float_t meanDistance = 0.;
-  Int_t startIndex = 5;
-  for(Int_t il =5; il > 0; il--){
-    if(tracklets[il].IsOK() && tracklets[il -1].IsOK()){
-      Float_t xdiff = tracklets[il].GetX0() - tracklets[il -1].GetX0();
-      meanDistance += xdiff;
-      nDistances++;
-    }
-    if(tracklets[il].IsOK()) startIndex = il;
-  }
-  if(tracklets[0].IsOK()) startIndex = 0;
-  if(!nDistances){
-    // We should normally never get here
-    Float_t xpos[2]; memset(xpos, 0, sizeof(Float_t) * 2);
-    Int_t iok = 0, idiff = 0;
-    // This attempt is worse and should be avoided:
-    // check for two chambers which are OK and repeat this without taking the mean value
-    // Strategy avoids a division by 0;
-    for(Int_t il = 5; il >= 0; il--){
-      if(tracklets[il].IsOK()){
-  xpos[iok] = tracklets[il].GetX0();
-  iok++;
-  startIndex = il;
-      }
-      if(iok) idiff++; // to get the right difference;
-      if(iok > 1) break;
-    }
-    if(iok > 1){
-      meanDistance = (xpos[0] - xpos[1])/idiff;
-    }
-    else{
-      // we have do not even have 2 layers which are OK? The we do not need to fit at all
-      return 331.;
-    }
-  }
-  else{
-    meanDistance /= nDistances;
-  }
-  return tracklets[startIndex].GetX0() + (2.5 - startIndex) * meanDistance - 0.5 * (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
-}
+
 
 // //_____________________________________________________________________________
 // Int_t AliTRDtrackerV1::Freq(Int_t n, const Int_t *inlist
@@ -3265,6 +3501,88 @@ Float_t AliTRDtrackerV1::GetChi2Z(AliTRDseedV1 *tracklets) const
   return n ? chi2/n : 0.;
 }
 
+//____________________________________________________________________
+Float_t AliTRDtrackerV1::CalculateReferenceX(AliTRDseedV1 *tracklets){
+       //
+       // Calculates the reference x-position for the tilted Rieman fit defined as middle
+       // of the stack (middle between layers 2 and 3). For the calculation all the tracklets
+       // are taken into account
+       //
+       // Parameters: - Array of tracklets(AliTRDseedV1)
+       //
+       // Output: - The reference x-position(Float_t)
+  // Only kept for compatibility with the old code
+       //
+       Int_t nDistances = 0;
+       Float_t meanDistance = 0.;
+       Int_t startIndex = 5;
+       for(Int_t il =5; il > 0; il--){
+       if(tracklets[il].IsOK() && tracklets[il -1].IsOK()){
+       Float_t xdiff = tracklets[il].GetX0() - tracklets[il -1].GetX0();
+           meanDistance += xdiff;
+           nDistances++;
+         }
+         if(tracklets[il].IsOK()) startIndex = il;
+       }
+       if(tracklets[0].IsOK()) startIndex = 0;
+       if(!nDistances){
+         // We should normally never get here
+         Float_t xpos[2]; memset(xpos, 0, sizeof(Float_t) * 2);
+         Int_t iok = 0, idiff = 0;
+         // This attempt is worse and should be avoided:
+         // check for two chambers which are OK and repeat this without taking the mean value
+         // Strategy avoids a division by 0;
+         for(Int_t il = 5; il >= 0; il--){
+           if(tracklets[il].IsOK()){
+             xpos[iok] = tracklets[il].GetX0();
+             iok++;
+             startIndex = il;
+           }
+           if(iok) idiff++; // to get the right difference;
+           if(iok > 1) break;
+         }
+         if(iok > 1){
+           meanDistance = (xpos[0] - xpos[1])/idiff;
+         }
+         else{
+           // we have do not even have 2 layers which are OK? The we do not need to fit at all
+           return 331.;
+       }
+       }
+       else{
+         meanDistance /= nDistances;
+       }
+       return tracklets[startIndex].GetX0() + (2.5 - startIndex) * meanDistance - 0.5 * (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::FitTiltedRiemanV1(AliTRDseedV1 *tracklets){
+  //
+  // Track Fitter Function using the new class implementation of 
+  // the Rieman fit
+  //
+  AliTRDtrackFitterRieman fitter;
+  fitter.SetRiemanFitter(GetTiltedRiemanFitter());
+  fitter.Reset();
+  for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++) fitter.SetTracklet(il, &tracklets[il]);
+  Double_t chi2 = fitter.Eval();
+  // Update the tracklets
+  Double_t cov[15]; Double_t x0;
+  memset(cov, 0, sizeof(Double_t) * 15);
+  for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
+    x0 = tracklets[il].GetX0();
+    tracklets[il].SetYref(0, fitter.GetYat(x0));
+    tracklets[il].SetZref(0, fitter.GetZat(x0));
+    tracklets[il].SetYref(1, fitter.GetDyDxAt(x0));
+    tracklets[il].SetZref(1, fitter.GetDzDx());
+    tracklets[il].SetC(fitter.GetCurvature());
+    fitter.GetCovAt(x0, cov);
+    tracklets[il].SetCovRef(cov);
+    tracklets[il].SetChi2(chi2);
+  }
+  return chi2;
+}
+
 ///////////////////////////////////////////////////////
 //                                                   //
 // Resources of class AliTRDLeastSquare              //
@@ -3287,7 +3605,8 @@ void AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare::AddPoint(Double_t *x, Double_t y, Doubl
   //
   // Adding Point to the fitter
   //
-  Double_t weight = 1/(sigmaY * sigmaY);
+  Double_t weight = 1/(sigmaY > 1e-9 ? sigmaY : 1e-9);
+  weight *= weight;
   Double_t &xpt = *x;
   //   printf("Adding point x = %f, y = %f, sigma = %f\n", xpt, y, sigmaY);
   fSums[0] += weight;
@@ -3303,7 +3622,9 @@ void AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare::RemovePoint(Double_t *x, Double_t y, Do
   //
   // Remove Point from the sample
   //
-  Double_t weight = 1/(sigmaY * sigmaY);
+  
+  Double_t weight = 1/(sigmaY > 1e-9 ? sigmaY : 1e-9);
+  weight *= weight;
   Double_t &xpt = *x; 
   fSums[0] -= weight;
   fSums[1] -= weight * xpt;
@@ -3332,9 +3653,9 @@ void AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare::Eval(){
   //   printf("fParams[0] = %f, fParams[1] = %f\n", fParams[0], fParams[1]);
   
   // Covariance matrix
-  fCovarianceMatrix[0] = fSums[4] - fSums[1] * fSums[1] / fSums[0];
-  fCovarianceMatrix[1] = fSums[5] - fSums[2] * fSums[2] / fSums[0];
-  fCovarianceMatrix[2] = fSums[3] - fSums[1] * fSums[2] / fSums[0];
+  fCovarianceMatrix[0] = fSums[4] / fSums[0] - fSums[1] * fSums[1] / (fSums[0] * fSums[0]);
+  fCovarianceMatrix[1] = fSums[5] / fSums[0] - fSums[2] * fSums[2] / (fSums[0] * fSums[0]);
+  fCovarianceMatrix[2] = fSums[3] / fSums[0] - fSums[1] * fSums[2] / (fSums[0] * fSums[0]);
 }
 
 //_____________________________________________________________________________
@@ -3353,3 +3674,335 @@ void AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare::GetCovarianceMatrix(Double_t *storage)
   memcpy(storage, fCovarianceMatrix, sizeof(Double_t) * 3);
 }
 
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare::Reset(){
+  //
+  // Reset the fitter
+  //
+  memset(fParams, 0, sizeof(Double_t) * 2);
+  memset(fCovarianceMatrix, 0, sizeof(Double_t) * 3);
+  memset(fSums, 0, sizeof(Double_t) * 6);
+}
+
+///////////////////////////////////////////////////////
+//                                                   //
+// Resources of class AliTRDtrackFitterRieman        //
+//                                                   //
+///////////////////////////////////////////////////////
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::AliTRDtrackFitterRieman():
+  fTrackFitter(NULL),
+  fZfitter(NULL),
+  fCovarPolY(NULL),
+  fCovarPolZ(NULL),
+  fXref(0.),
+  fSysClusterError(0.)
+{
+  //
+  // Default constructor
+  //
+  fZfitter = new AliTRDLeastSquare;
+  fCovarPolY = new TMatrixD(3,3);
+  fCovarPolZ = new TMatrixD(2,2);
+  memset(fTracklets, 0, sizeof(AliTRDseedV1 *) * 6);
+  memset(fParameters, 0, sizeof(Double_t) * 5);
+  memset(fSumPolY, 0, sizeof(Double_t) * 5);
+  memset(fSumPolZ, 0, sizeof(Double_t) * 2);
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::~AliTRDtrackFitterRieman(){
+  //
+  // Destructor
+  //
+  if(fZfitter) delete fZfitter;
+  if(fCovarPolY) delete fCovarPolY;
+  if(fCovarPolZ) delete fCovarPolZ;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::Reset(){
+  //
+  // Reset the Fitter
+  //
+  if(fTrackFitter){
+    fTrackFitter->StoreData(kTRUE);
+    fTrackFitter->ClearPoints();
+  }
+  if(fZfitter){
+    fZfitter->Reset();
+  }
+  fXref = 0.;
+  memset(fTracklets, 0, sizeof(AliTRDseedV1 *) * AliTRDgeometry::kNlayer);
+  memset(fParameters, 0, sizeof(Double_t) * 5);
+  memset(fSumPolY, 0, sizeof(Double_t) * 5);
+  memset(fSumPolZ, 0, sizeof(Double_t) * 2);
+  for(Int_t irow = 0; irow < fCovarPolY->GetNrows(); irow++)
+    for(Int_t icol = 0; icol < fCovarPolY->GetNcols(); icol++){
+      (*fCovarPolY)(irow, icol) = 0.;
+      if(irow < 2 && icol < 2)
+        (*fCovarPolZ)(irow, icol) = 0.;
+    }
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::SetTracklet(Int_t itr, AliTRDseedV1 *tracklet){ 
+  //
+  // Add tracklet into the fitter
+  //
+  if(itr >= AliTRDgeometry::kNlayer) return;
+  fTracklets[itr] = tracklet; 
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::Eval(){
+  //
+  // Perform the fit
+  // 1. Apply linear transformation and store points in the fitter
+  // 2. Evaluate the fit
+  // 3. Check if the result of the fit in z-direction is reasonable
+  // if not
+  // 3a. Fix the parameters 3 and 4 with the results of a simple least
+  //     square fit
+  // 3b. Redo the fit with the fixed parameters
+  // 4. Store fit results (parameters and errors)
+  //
+  if(!fTrackFitter){
+    return 1e10;
+  }
+  fXref = CalculateReferenceX();
+  for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++) UpdateFitters(fTracklets[il]);
+  if(!fTrackFitter->GetNpoints()) return 1e10;
+  // perform the fit
+  fTrackFitter->Eval();
+  fZfitter->Eval();
+  fParameters[3] = fTrackFitter->GetParameter(3);
+  fParameters[4] = fTrackFitter->GetParameter(4);
+  if(!CheckAcceptable(fParameters[3], fParameters[4])) {
+    fTrackFitter->FixParameter(3, fZfitter->GetFunctionValue(&fXref));
+    fTrackFitter->FixParameter(4, fZfitter->GetFunctionParameter(1));
+    fTrackFitter->Eval();
+    fTrackFitter->ReleaseParameter(3);
+    fTrackFitter->ReleaseParameter(4);
+    fParameters[3] = fTrackFitter->GetParameter(3);
+    fParameters[4] = fTrackFitter->GetParameter(4);
+  }
+  // Update the Fit Parameters and the errors
+  fParameters[0] = fTrackFitter->GetParameter(0);
+  fParameters[1] = fTrackFitter->GetParameter(1);
+  fParameters[2] = fTrackFitter->GetParameter(2);
+
+  // Prepare Covariance estimation
+  (*fCovarPolY)(0,0) = fSumPolY[0]; (*fCovarPolY)(1,1) = fSumPolY[2]; (*fCovarPolY)(2,2) = fSumPolY[4];
+  (*fCovarPolY)(1,0) = (*fCovarPolY)(0,1) = fSumPolY[1];
+  (*fCovarPolY)(2,0) = (*fCovarPolY)(0,2) = fSumPolY[2];
+  (*fCovarPolY)(2,1) = (*fCovarPolY)(1,2) = fSumPolY[3];
+  fCovarPolY->Invert();
+  (*fCovarPolZ)(0,0) = fSumPolZ[0]; (*fCovarPolZ)(1,1) = fSumPolZ[2];
+  (*fCovarPolZ)(1,0) = (*fCovarPolZ)(0,1) = fSumPolZ[1];
+  fCovarPolZ->Invert();
+  return fTrackFitter->GetChisquare() / fTrackFitter->GetNpoints();
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::UpdateFitters(AliTRDseedV1 *tracklet){
+  //
+  // Does the transformations and updates the fitters
+  // The following transformation is applied
+  //
+  AliTRDcluster *cl = NULL;
+  Double_t x, y, z, dx, t, w, we, yerr, zerr;
+  Double_t uvt[4];
+  if(!tracklet || !tracklet->IsOK()) return; 
+  Double_t tilt = tracklet->GetTilt();
+  for(Int_t itb = 0; itb < AliTRDseedV1::kNclusters; itb++){
+    if(!(cl = tracklet->GetClusters(itb))) continue;
+    if(!cl->IsInChamber()) continue;
+    if (!tracklet->IsUsable(itb)) continue;
+    x = cl->GetX();
+    y = cl->GetY();
+    z = cl->GetZ();
+    dx = x - fXref;
+    // Transformation
+    t = 1./(x*x + y*y);
+    uvt[0] = 2. * x * t;
+    uvt[1] = t;
+    uvt[2] = 2. * tilt * t;
+    uvt[3] = 2. * tilt * dx * t;
+    w = 2. * (y + tilt*z) * t;
+    // error definition changes for the different calls
+    we = 2. * t;
+    we *= TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+tilt*tilt*cl->GetSigmaZ2());
+    // Update sums for error calculation
+    yerr = 1./(TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()) + fSysClusterError);
+    yerr *= yerr;
+    zerr = 1./cl->GetSigmaZ2();
+    for(Int_t ipol = 0; ipol < 5; ipol++){
+      fSumPolY[ipol] += yerr;
+      yerr *= x;
+      if(ipol < 3){
+        fSumPolZ[ipol] += zerr;
+        zerr *= x;
+      }
+    }
+    fTrackFitter->AddPoint(uvt, w, we);
+    fZfitter->AddPoint(&x, z, static_cast<Double_t>(TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2())));
+  }
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::CheckAcceptable(Double_t offset, Double_t slope){
+  // 
+  // Check whether z-results are acceptable
+  // Definition: Distance between tracklet fit and track fit has to be
+  // less then half a padlength
+  // Point of comparision is at the anode wire
+  //
+  Bool_t acceptablez = kTRUE;
+  Double_t zref = 0.0;
+  for (Int_t iLayer = 0; iLayer < kNPlanes; iLayer++) {
+    if(!fTracklets[iLayer]->IsOK()) continue;
+    zref = offset + slope * (fTracklets[iLayer]->GetX0() - fXref);
+    if (TMath::Abs(fTracklets[iLayer]->GetZfit(0) - zref) > fTracklets[iLayer]->GetPadLength() * 0.5 + 1.0) 
+      acceptablez = kFALSE;
+  }
+  return acceptablez;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::GetYat(Double_t x) const {
+  //
+  // Calculate y position out of the track parameters
+  // y:     R^2 = (x - x0)^2 + (y - y0)^2
+  //     =>   y = y0 +/- Sqrt(R^2 - (x - x0)^2)
+  //          R = Sqrt() = 1/Curvature
+  //     =>   y = y0 +/- Sqrt(1/Curvature^2 - (x - x0)^2)
+  //
+  Double_t y = 0;
+  Double_t disc = (x * fParameters[0] + fParameters[1]);
+  disc = 1 - fParameters[0]*fParameters[2] + fParameters[1]*fParameters[1] - disc*disc;
+  if (disc >= 0) {
+    disc = TMath::Sqrt(disc);
+    y    = (1.0 - disc) / fParameters[0];
+  }
+  return y;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::GetZat(Double_t x) const {
+  //
+  // Return z position for a given x position
+  // Simple linear function
+  //
+  return fParameters[3] + fParameters[4] * (x - fXref);
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::GetDyDxAt(Double_t x) const {
+  //
+  // Calculate dydx at a given radial position out of the track parameters
+  // dy:      R^2 = (x - x0)^2 + (y - y0)^2
+  //     =>     y = +/- Sqrt(R^2 - (x - x0)^2) + y0
+  //     => dy/dx = (x - x0)/Sqrt(R^2 - (x - x0)^2) 
+  // Curvature: cr = 1/R = a/Sqrt(1 + b^2 - c*a)
+  //     => dy/dx =  (x - x0)/(1/(cr^2) - (x - x0)^2) 
+  //
+  Double_t x0 = -fParameters[1] / fParameters[0];
+  Double_t curvature = GetCurvature();
+  Double_t dy = 0;
+  if (-fParameters[2] * fParameters[0] + fParameters[1] * fParameters[1] + 1 > 0) {
+    if (1.0/(curvature * curvature) - (x - x0) * (x - x0) > 0.0) {
+     Double_t yderiv = (x - x0) / TMath::Sqrt(1.0/(curvature * curvature) - (x - x0) * (x - x0));
+      if (fParameters[0] < 0) yderiv *= -1.0;
+      dy = yderiv;
+    }
+  }
+  return dy;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::GetCurvature() const {
+  //
+  // Calculate track curvature
+  //
+  //
+  Double_t curvature =  1.0 + fParameters[1]*fParameters[1] - fParameters[2]*fParameters[0];
+  if (curvature > 0.0) 
+    curvature  =  fParameters[0] / TMath::Sqrt(curvature);
+  return curvature;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::GetCovAt(Double_t x, Double_t *cov) const {
+  //
+  // Error Definition according to gauss error propagation
+  //  
+  TMatrixD transform(3,3);
+  transform(0,0) = transform(1,1) = transform(2,2) = 1;
+  transform(0,1) = transform(1,2) = x;
+  transform(0,2) = x*x;
+  TMatrixD covariance(transform, TMatrixD::kMult, *fCovarPolY);
+  covariance *= transform.T();
+  cov[0] = covariance(0,0);
+  TMatrixD transformZ(2,2);
+  transformZ(0,0) = transformZ(1,1) = 1;
+  transformZ(0,1) = x;
+  TMatrixD covarZ(transformZ, TMatrixD::kMult, *fCovarPolZ);
+  covarZ *= transformZ.T();
+  cov[1] = covarZ(0,0);
+  cov[2] = 0;
+}
+
+//____________________________________________________________________
+Double_t AliTRDtrackerV1::AliTRDtrackFitterRieman::CalculateReferenceX(){
+  //
+  // Calculates the reference x-position for the tilted Rieman fit defined as middle
+  // of the stack (middle between layers 2 and 3). For the calculation all the tracklets
+  // are taken into account
+  // 
+  // Parameters:       - Array of tracklets(AliTRDseedV1)
+  //
+  // Output:           - The reference x-position(Float_t)
+  //
+  Int_t nDistances = 0;
+  Float_t meanDistance = 0.;
+  Int_t startIndex = 5;
+  for(Int_t il =5; il > 0; il--){
+    if(fTracklets[il]->IsOK() && fTracklets[il -1]->IsOK()){
+      Float_t xdiff = fTracklets[il]->GetX0() - fTracklets[il -1]->GetX0();
+      meanDistance += xdiff;
+      nDistances++;
+    }
+    if(fTracklets[il]->IsOK()) startIndex = il;
+  }
+  if(fTracklets[0]->IsOK()) startIndex = 0;
+  if(!nDistances){
+    // We should normally never get here
+    Float_t xpos[2]; memset(xpos, 0, sizeof(Float_t) * 2);
+    Int_t iok = 0, idiff = 0;
+    // This attempt is worse and should be avoided:
+    // check for two chambers which are OK and repeat this without taking the mean value
+    // Strategy avoids a division by 0;
+    for(Int_t il = 5; il >= 0; il--){
+      if(fTracklets[il]->IsOK()){
+        xpos[iok] = fTracklets[il]->GetX0();
+        iok++;
+        startIndex = il;
+      }
+      if(iok) idiff++; // to get the right difference;
+      if(iok > 1) break;
+    }
+    if(iok > 1){
+      meanDistance = (xpos[0] - xpos[1])/idiff;
+    }
+    else{
+      // we have do not even have 2 layers which are OK? The we do not need to fit at all
+      return 331.;
+    }
+  }
+  else{
+    meanDistance /= nDistances;
+  }
+  return fTracklets[startIndex]->GetX0() + (2.5 - startIndex) * meanDistance - 0.5 * (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
+}