Apply manu mask to motifPositionID

Updating MpId only

- Reordering includes and/or
- Moving ClassImp() after static data definition (needed for Doxygen)
(Laurent)

Implementations of VCalibParam for 2 floats (used by pedestals and gains)
and 1 integer (used by dead channels)
(Laurent)

New base class for calibration parameters (manu-wide)
(Laurent)

Fatal error replaced with Error
(Laurent)

Implementing the new methods of the interface class
(Laurent)

Adding abstract methods to get:
a) the electronic card number handled by this segmentation
b) the plane type of this segmentation
c) the physical dimension of the underlying DE (usefull for display)
(Laurent)

Adding offset to manuIds when reading non-bending planes.
(Laurent)

Implementing methods needed by the new methods in AliMpVSegmentation:
(Laurent)

Added AliMpVSegmentation* CreateMpSegmentationByElectronics(Int_t detElemId, Int_t FEMId);
method to fetch segmentation using manuIds.
(Laurent)

Added method GetAllMotifPositionsIDs(TArrayI& enc)
(Laurent)

Removing useless ifs
(Laurent)

Adding a GetCathod(Int_t detElemId, AliMpPlaneType planeType) method
(Laurent)

Defining the manuId offset for non-bending planes
(Laurent)

Updating info about the test script, including stuff about the CDB
(Laurent)

Changes related to added/removed classes.
(Laurent)

- Adding MUONsdigits() method.
- Using AliMUONDigit::Print() method
(Laurent)

Enhancements:
Now builds fake dead channel store too (random case not really tested though)
(Laurent)

Changing the default way to create AliMUON object.
(Laurent)

Must set the CDB path, as now both simulation and reconstruction make use of it.
(Laurent)

Now the full chain includes raw data.
(Laurent)

Adding comments
(Laurent)

Changing default ctor parameters.
(Laurent)

Removed a non-informative warning.
(Laurent)

Rescaling the energy loss corrections in the absorber to get quarkonia peaks positions
closer to the table value.'
(Laurent)

Removed unneeded if in dtor
(Laurent)

- Remove integer offset of 1 (wrt AliMpSlatSegmentation).
- Changed the way the warning is presented for SetHit(x,y,z) where x and/or y are
  outside slat limit, as this may be valid depending on clustering algorithm/fitting.
(Laurent)

Take into account that manuIds for non-bending planes now have an offset.
(Laurent)

Avoids a copy.
(Laurent)

Adding a comment.
(Laurent)

Make FactoryV4 the default.
(Laurent)

- Adding handling of track info in digits.
- Adding more comments.
(Laurent)

- Adding more comments.
- Adding error message to spot cases when hit gives invalid pad
  (to be investigated)
(Laurent)

- During reco from RAW, digits are no longer re-written.
- Adding timers.
- Few syntax changes. Getting the reconstructed vertex and correcting track parameters
  at the vertex at the ESD level.
(Laurent)

Adding timers and making few simplifications.
(Laurent)

Changed 10 to Digit::Ntracks()
(Laurent)

Cache the InversePitch instead of computing it each time.
(Laurent)

Simplified a bit the DrawView method, thanks to new
AliMpVSegmentation::Dimensions() method
(Laurent)

Changed kMAXTRACKS to Digit::NTracks().
But anyway this class is deprecated...
(Laurent)

- Added handling of tracks and file mask (used when merging different files).
- Changed handling of saturation (can now depends on the channel).
- Simplified trigger handling (basically does not touch anything for it ;-) ).
- Changes related to changes in AliMUONCalibrationData format.
- Fixed a bug in AddOrUpdateDigit.
(Laurent)

Moved kMAXTRACKS from AliMUONDigit.h to here.
Anyway this class is now deprecated...
(Laurent)

Changed related to the changes in AliMUONCalibrationData, and added treatment of
dead channels'
(Laurent)

Major changes:
- Can now handle any number of tracks (from 0 to infinite)
  instead of a fixed number of 10. Fixed a bug in the Copy method.
- Added a Clear method to delete internal track arrays.
- Added a PatchTracks method.
- Changed the Compare method to get almost full ordering.
- Added a fFlags data member, which is currently only used to mark a digit as saturated,
  but which is ought to be used to mark a bad digit too, when we will use the deadchannels
  really.'
(Laurent)

Rewriting of Digits2Clusters method to minimize the number of loops
(Laurent)

Changed the way we clear digits, as now AliMUONDigit class does allocate memory
(Laurent)

Changed the handled objects from per-channel to per-manu, in order to speed up
the whole process. Also added the handling of dead channels
(Laurent)

Changed the defaults.
Can now use a very compact ctor which takes care of geometry builders
(see ResetGeometryBuilder comments to use the old behavior).
The RawWriter is now a data member to avoid recreating it at each event.
(Laurent)

Reordering, correcting includes
(Laurent)

Adding comments
(Laurent)

Correted for overlaps

Adding libEMCALjet

Corrected files to be consistent with special_zone_outer.dat
(To be reviewed by Mamu)

Added material for the TPC electronics/cables (40% of X0)

Corrected CalibData method, useless RETURN eliminated

Corrected DigitizeEnergy, amplitud calculation put outside calibration parameters IF

Corrected DigitizeEnergy, if calibration no loaded, default pedestal and channel parameters used

Removing overlaps. Using assemblies for the alignable voulmes (L.Gaudichet)

Correct initialization of data members (A.Gheata)

Bug fix after sect renamed to sector

Updated for changing units mm->cm

suppress compiler warnings by correcting some hidden virtual methods

Tuning of EMCAL cluster finder for TRD1 geometry

Using the new (TGeo) geometry of TPC

CurrentMedium is the new name of GetMedium

Corrected mapping management group definition

Bug fix - initializing some arrays;
caused crashes for some compiler versions.
(Sasha)

Fix to retrieve correctly the sign of the Bz field component (Yu.Belikov)

Simulation and reconstruction of laser tracks (G.Renault)

Updated version (B.Nandi)

new classes added

esd variables modified

one more method to get sigmay added

base class for discrimination

base class for clustering

cellx and celly methods added

one more branch added to TreeR

discrimination based on PRE-CPV matching

clustering version one

stores hit info of a cluster

DIgits for 2nd ZDC set included

Minor correction

Protection against memory leaks

Several modifications to the alignment object classes

Some protections against 0-pointers returned for media assigned to
volume assemblies.

Calibration macros directory

Test Trigger macro

Test Digit macro

Updated recess dimensions.

New recess dimensions and use of assemblies to avoid overlaps with MUON.

Correct loading of geometry in Digitize method and add new calibration in DigitizeEnergy method

Correct loading of geometry in Digitize method and add new calibration in DigitizeEnergy method

Correct number of rows in smaller modules

add package files for jetfinder code

remove obsolete test script

removing obsolete macros. new ones should go in the macros directory

reconstructioner write commented out

moving jetfinder code to subdirectory

add histogram utilities class, correct package definitions

removing jetfinder classes from main body of EMCAL code to subdirectory