EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  19 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
  20 //                           of new  IO (à la PHOS)
  21 //  Mar 2007, Aleksei Pavlinov - new algoritmh of pseudo clusters
  22 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  23 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  24 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  25 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
  26 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all
  27 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  28 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  29 //  standalone mode.
  30 // Use Case:
  31 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")
  32 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  33 //               //reads gAlice from header file "..."
  34 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  35 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  36 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  37 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  38 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  39 //               //sets another title four output branches
  40 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)
  41 //               //set clusterization parameters
  42 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  43 //               //once more finds RecPoints options are
  44 //               // deb - print number of found rec points
  45 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  46 //               // time - print benchmarking results
  47
  48 // --- ROOT system ---
  49 #include <cassert>
  50
  51 class TROOT;
  52 #include <TH1.h>
  53 #include <TFile.h>
  54 class TFolder;
  55 #include <TMath.h>
  56 #include <TMinuit.h>
  57 #include <TTree.h>
  58 class TSystem;
  59 #include <TBenchmark.h>
  60 #include <TBrowser.h>
  61 #include <TROOT.h>
  62
  63 // --- Standard library ---
  64
  65
  66 // --- AliRoot header files ---
  67 #include "AliRunLoader.h"
  68 #include "AliRun.h"
  69 #include "AliESD.h"
  70 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  71 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  72 #include "AliEMCALDigit.h"
  73 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  74 #include "AliEMCAL.h"
  75 #include "AliEMCALGeometry.h"
  76 #include "AliEMCALHistoUtilities.h"
  77 #include "AliEMCALRecParam.h"
  78 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  79 #include "AliCDBManager.h"
  80
  81 class AliCDBStorage;
  82 #include "AliCDBEntry.h"
  83
  84 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
  85
  86 //____________________________________________________________________________
  87 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1()
  88   : AliEMCALClusterizer(),
  89     fHists(0),fPointE(0),fPointL1(0),fPointL2(0),
  90     fPointDis(0),fPointMult(0),fDigitAmp(0),fMaxE(0),
  91     fMaxL1(0),fMaxL2(0),fMaxDis(0),fGeom(0),
  92     fDefaultInit(kFALSE),
  93     fToUnfold(kFALSE),
  94     fNumberOfECAClusters(0),fNTowerInGroup(0),fCalibData(0),
  95     fADCchannelECA(0.),fADCpedestalECA(0.),fECAClusteringThreshold(0.),fECALocMaxCut(0.),
  96     fECAW0(0.),fTimeCut(0.),fMinECut(0.)
  97 {
  98   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
  99
 100   InitParameters() ;
 101   Init() ;
 102 }
 103
 104 //____________________________________________________________________________
 105   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
 106 {
 107   // dtor
 108 }
 109
 110 //____________________________________________________________________________
 111 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp, Int_t AbsId)
 112 {
 113
 114   // Convert digitized amplitude into energy.
 115   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
 116   // or from digitizer parameters for simulated data.
 117
 118   if(fCalibData){
 119
 120     if (fGeom==0)
 121       AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader") ;
 122
 123     Int_t iSupMod = -1;
 124     Int_t nModule  = -1;
 125     Int_t nIphi   = -1;
 126     Int_t nIeta   = -1;
 127     Int_t iphi    = -1;
 128     Int_t ieta    = -1;
 129
 130     Bool_t bCell = fGeom->GetCellIndex(AbsId, iSupMod, nModule, nIphi, nIeta) ;
 131     if(!bCell) {
 132       fGeom->PrintGeometry();
 133       Error("Calibrate()"," Wrong cell id number : %i", AbsId);
 134       assert(0);
 135     }
 136
 137     fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nModule,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
 138
 139     fADCchannelECA  = fCalibData->GetADCchannel (iSupMod,ieta,iphi);
 140     fADCpedestalECA = fCalibData->GetADCpedestal(iSupMod,ieta,iphi);
 141
 142    return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 143
 144   }
 145   else //Return energy with default parameters if calibration is not available
 146     return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 147
 148 }
 149
 150 //____________________________________________________________________________
 151 void AliEMCALClusterizerv1::Digits2Clusters(Option_t * option)
 152 {
 153   // Steering method to perform clusterization for the current event
 154   // in AliEMCALLoader
 155
 156   if(strstr(option,"tim"))
 157     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer");
 158
 159   if(strstr(option,"print"))
 160     Print("") ;
 161
 162   //Get calibration parameters from file or digitizer default values.
 163   GetCalibrationParameters() ;
 164
 165
 166   fNumberOfECAClusters = 0;
 167
 168   if(strstr(option,"pseudo"))
 169     MakeClusters("pseudo") ;  //both types
 170   else
 171     MakeClusters("") ;  //only the real clusters
 172
 173   if(fToUnfold)
 174     MakeUnfolding() ;
 175
 176   fTreeR->Fill();
 177
 178   if(strstr(option,"deb") || strstr(option,"all"))
 179     PrintRecPoints(option) ;
 180
 181   AliDebug(1,Form("EMCAL Clusterizer found %d Rec Points",fRecPoints->GetEntriesFast()));
 182
 183   if(strstr(option,"tim")){
 184     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
 185     printf("Exec took %f seconds for Clusterizing",
 186            gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer"));
 187   }
 188 }
 189
 190 //____________________________________________________________________________
 191 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 192                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 193 {
 194   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 195   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 196   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 197
 198   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 199   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 200   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 201                                          // To set the address of the minimization function
 202   TList * toMinuit = new TList();
 203   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 204   toMinuit->AddAt(fDigitsArr,1) ;
 205
 206   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 207
 208   // filling initial values for fit parameters
 209   AliEMCALDigit * digit ;
 210
 211   Int_t ierflg  = 0;
 212   Int_t index   = 0 ;
 213   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 214
 215   Int_t iDigit ;
 216
 217   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 218     digit = maxAt[iDigit];
 219
 220     Float_t x = 0.;
 221     Float_t z = 0.;
 222     //   have to be tune for TRD1; May 31,06
 223     //   Int_t relid[2] ;
 224     //   fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ; // obsolete method
 225     //   fGeom->PosInAlice(relid, x, z) ;                  // obsolete method
 226
 227     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 228
 229     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 230     index++ ;
 231     if(ierflg != 0){
 232       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : x = %f",  x ) ;
 233       return kFALSE;
 234     }
 235     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 236     index++ ;
 237     if(ierflg != 0){
 238        Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : z = %f", z) ;
 239       return kFALSE;
 240     }
 241     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 242     index++ ;
 243     if(ierflg != 0){
 244      Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : energy = %f", energy) ;
 245       return kFALSE;
 246     }
 247   }
 248
 249   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 250                       //  depends on it.
 251   Double_t p1 = 1.0 ;
 252   Double_t p2 = 0.0 ;
 253
 254   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 255   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 256   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 257   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 258
 259   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 260
 261   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 262     Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Fit not converged, cluster abandoned " ) ;
 263     return kFALSE ;
 264   }
 265   for(index = 0; index < nPar; index++){
 266     Double_t err ;
 267     Double_t val ;
 268     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 269     fitparameters[index] = val ;
 270    }
 271
 272   delete toMinuit ;
 273   return kTRUE;
 274
 275 }
 276
 277 //____________________________________________________________________________
 278 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 279 {
 280   // Set calibration parameters:
 281   // if calibration database exists, they are read from database,
 282   // otherwise, they are taken from digitizer.
 283   //
 284   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction,
 285   // for example:
 286   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
 287
 288   //Check if calibration is stored in data base
 289
 290   if(!fCalibData && (AliCDBManager::Instance()->IsDefaultStorageSet()))
 291     {
 292       AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 293         AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Data");
 294       if (entry) fCalibData =  (AliEMCALCalibData*) entry->GetObject();
 295     }
 296
 297   if(!fCalibData)
 298     AliFatal("Calibration parameters not found in CDB!");
 299
 300   //  Please fix it!! Or better just remove it...
 301 //    if(!fCalibData)
 302 //      {
 303 //        //If calibration is not available use default parameters
 304 //        //Loader
 305 //        if ( !emcalLoader->Digitizer() )
 306 //       emcalLoader->LoadDigitizer();
 307 //        AliEMCALDigitizer * dig = dynamic_cast<AliEMCALDigitizer*>(emcalLoader->Digitizer());
 308
 309 //        fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
 310 //        fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
 311 //      }
 312 }
 313
 314 //____________________________________________________________________________
 315 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
 316 {
 317   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 318   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 319
 320   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::GetRunLoader();
 321   if (rl->GetAliRun() && rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))
 322     fGeom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
 323   else
 324     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaulGeometryName());
 325
 326   fGeom->GetTransformationForSM(); // Global <-> Local
 327   AliInfo(Form("geom 0x%x",fGeom));
 328
 329   if(!gMinuit)
 330     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 331
 332   fHists = BookHists();
 333 }
 334
 335 //____________________________________________________________________________
 336 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
 337 {
 338   // Initializes the parameters for the Clusterizer
 339   fNumberOfECAClusters = 0;
 340
 341   fNTowerInGroup = 36;  //Produces maximum of 80 pseudoclusters per event
 342
 343   fECALocMaxCut = 0.03; // ??
 344
 345   fTimeCut = 300e-9 ; // 300 ns time cut (to be tuned)
 346   fToUnfold = kFALSE ;
 347
 348   fCalibData               = 0 ;
 349
 350   const AliEMCALRecParam* recParam = AliEMCALReconstructor::GetRecParam();
 351   if(!recParam) {
 352     AliFatal("Reconstruction parameters for EMCAL not set!");
 353   }
 354   else {
 355     fECAClusteringThreshold = recParam->GetClusteringThreshold();
 356     fECAW0                  = recParam->GetW0();
 357     fMinECut                = recParam->GetMinECut();
 358     AliDebug(1,Form("Reconstruction parameters: fECAClusteringThreshold=%.3f, fECAW=%.3f, fMinECut=%.3f",
 359                  fECAClusteringThreshold,fECAW0,fMinECut));
 360   }
 361
 362 }
 363
 364 //____________________________________________________________________________
 365 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2) const
 366 {
 367   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour ; continue searching
 368   //                                       = 1 are neighbour
 369   //                                       = 2 is in different SM; continue searching
 370   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 371   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 372   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 373
 374   static Int_t rv;
 375   static Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0, iphi1=0, ieta1=0;
 376   static Int_t nSupMod2=0, nModule2=0, nIphi2=0, nIeta2=0, iphi2=0, ieta2=0;
 377   static Int_t rowdiff, coldiff;
 378   rv = 0 ;
 379
 380   fGeom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 381   fGeom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod2,nModule2,nIphi2,nIeta2);
 382   if(nSupMod1 != nSupMod2) return 2; // different SM
 383
 384   fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
 385   fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod2,nModule2,nIphi2,nIeta2, iphi2,ieta2);
 386
 387   rowdiff = TMath::Abs(iphi1 - iphi2);
 388   coldiff = TMath::Abs(ieta1 - ieta2) ;
 389
 390   // neighbours with at least commom side; May 11, 2007
 391   if ((coldiff==0 && abs(rowdiff)==1) || (rowdiff==0 && abs(coldiff)==1)) rv = 1;
 392
 393   if (gDebug == 2 && rv==1)
 394   printf("AreNeighbours: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
 395          rv, d1->GetId(), iphi1,ieta1, d2->GetId(), iphi2,ieta2);
 396
 397   return rv ;
 398 }
 399
 400 //____________________________________________________________________________
 401 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreInGroup(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2) const
 402 {
 403   // Tells whether two digits fall within the same supermodule and
 404   // tower grouping.  The number of towers in a group is controlled by
 405   // the parameter nTowersInGroup
 406   //    = 0 are not in same group but continue searching
 407   //    = 1 same group
 408   //    = 2 is in different SM, quit from searching
 409   //    = 3 different tower group, quit from searching
 410   //
 411   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit
 412   // already in a cluster which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 413
 414   //JLK Question: does the quit from searching assume that the digits
 415   //are ordered, so that once you are in a different SM, you'll not
 416   //find another in the list that will match?  How about my TowerGroup search?
 417
 418   static Int_t rv;
 419   static Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0, iphi1=0, ieta1=0;
 420   static Int_t nSupMod2=0, nModule2=0, nIphi2=0, nIeta2=0, iphi2=0, ieta2=0;
 421   static Int_t towerGroup1 = -1, towerGroup2 = -1;
 422   rv = 0 ;
 423
 424   fGeom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
 425   fGeom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod2,nModule2,nIphi2,nIeta2);
 426   if(nSupMod1 != nSupMod2) return 2; // different SM
 427
 428   static Int_t nTowerInSM = fGeom->GetNCellsInSupMod()/fGeom->GetNCellsInModule();
 429
 430   //figure out which tower grouping each digit belongs to
 431   for(int it = 0; it < nTowerInSM/fNTowerInGroup; it++) {
 432     if(nModule1 <= nTowerInSM - it*fNTowerInGroup) towerGroup1 = it;
 433     if(nModule2 <= nTowerInSM - it*fNTowerInGroup) towerGroup2 = it;
 434   }
 435   if(towerGroup1 != towerGroup2) return 3; //different Towergroup
 436
 437   //same SM, same towergroup, we're happy
 438   if(towerGroup1 == towerGroup2 && towerGroup2 >= 0)
 439     rv = 1;
 440
 441   if (gDebug == 2 && rv==1)
 442   printf("AreInGroup: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
 443          rv, d1->GetId(), iphi1,ieta1, d2->GetId(), iphi2,ieta2);
 444
 445   return rv ;
 446 }
 447
 448 //____________________________________________________________________________
 449 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters(char* option)
 450 {
 451   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 452   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 453   // Mar 03, 2007 by PAI
 454
 455   if (fGeom==0) AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader");
 456
 457   fRecPoints->Clear();
 458
 459   // Set up TObjArray with pointers to digits to work on
 460   TObjArray *digitsC = new TObjArray();
 461   TIter nextdigit(fDigitsArr);
 462   AliEMCALDigit *digit;
 463   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(nextdigit())) ) {
 464     digitsC->AddLast(digit);
 465   }
 466
 467   //Start with pseudoclusters, if option
 468   if(strstr(option,"pseudo")) {
 469     //
 470     // New algorithm : will be created one pseudo cluster per module
 471     //
 472     AliDebug(1,Form("Pseudo clustering #digits : %i ",fDigitsArr->GetEntries()));
 473
 474     AliEMCALRecPoint *recPoints[12]; // max size is 12 : see fGeom->GetNumberOfSuperModules();
 475     for(int i=0; i<12; i++) recPoints[i] = 0;
 476     TIter nextdigitC(digitsC) ;
 477
 478     // PseudoClusterization starts
 479     int nSM = 0; // # of SM
 480     while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigitC())) ) { // scan over the list of digitsC
 481       if(fGeom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) ) { //Is this an EMCAL digit? Just maing sure...
 482         nSM = fGeom->GetSuperModuleNumber(digit->GetId());
 483         if(recPoints[nSM] == 0) {
 484           recPoints[nSM] = new AliEMCALRecPoint(Form("PC%2.2i", nSM));
 485           recPoints[nSM]->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kPseudoCluster);
 486         }
 487         recPoints[nSM]->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId()));
 488       }
 489     }
 490     fNumberOfECAClusters = 0;
 491     for(int i=0; i<fGeom->GetNumberOfSuperModules(); i++) { // put non empty rec.points to container
 492       if(recPoints[i]) fRecPoints->AddAt(recPoints[i], fNumberOfECAClusters++);
 493     }
 494     AliDebug(1,Form(" Number of PC %d ", fNumberOfECAClusters));
 495   }
 496
 497   //
 498   // Now do real clusters
 499   //
 500
 501   double e = 0.0, ehs = 0.0;
 502   TIter nextdigitC(digitsC);
 503
 504   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigitC())) ) { // clean up digits
 505     e = Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId());
 506     AliEMCALHistoUtilities::FillH1(fHists, 10, digit->GetAmp());
 507     AliEMCALHistoUtilities::FillH1(fHists, 11, e);
 508     if ( e < fMinECut || digit->GetTimeR() > fTimeCut )
 509       digitsC->Remove(digit);
 510     else
 511       ehs += e;
 512   }
 513   AliDebug(1,Form("MakeClusters: Number of digits %d  -> (e %f), ehs %d\n",
 514                   fDigitsArr->GetEntries(),fMinECut,ehs));
 515
 516   nextdigitC.Reset();
 517
 518   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigitC())) ) { // scan over the list of digitsC
 519     TArrayI clusterECAdigitslist(fDigitsArr->GetEntries());
 520
 521     if(fGeom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 522       // start a new Tower RecPoint
 523       if(fNumberOfECAClusters >= fRecPoints->GetSize()) fRecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
 524       AliEMCALRecPoint *recPoint = new  AliEMCALRecPoint("") ;
 525       fRecPoints->AddAt(recPoint, fNumberOfECAClusters) ;
 526       recPoint = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(fRecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ;
 527       fNumberOfECAClusters++ ;
 528
 529       recPoint->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kClusterv1);
 530
 531       recPoint->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp(), digit->GetId())) ;
 532       TObjArray clusterDigits;
 533       clusterDigits.AddLast(digit);
 534       digitsC->Remove(digit) ;
 535
 536       AliDebug(1,Form("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , cell.th. = %f \n", digit->GetId(),
 537       Calibrate(digit->GetAmp(),digit->GetId()), fECAClusteringThreshold));
 538
 539       // Grow cluster by finding neighbours
 540       TIter nextClusterDigit(&clusterDigits);
 541       while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit*>(nextClusterDigit())) ) { // scan over digits in cluster
 542         TIter nextdigitN(digitsC);
 543         AliEMCALDigit *digitN = 0; // digi neighbor
 544         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigitN()) ) { // scan over all digits to look for neighbours
 545           if (AreNeighbours(digit, digitN)==1) {      // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 546             recPoint->AddDigit(*digitN, Calibrate(digitN->GetAmp(),digitN->GetId()) ) ;
 547             clusterDigits.AddLast(digitN) ;
 548             digitsC->Remove(digitN) ;
 549           } // if(ineb==1)
 550         } // scan over digits
 551       } // scan over digits already in cluster
 552       if(recPoint)
 553         AliDebug(2,Form("MakeClusters: %d digitd, energy %f \n", clusterDigits.GetEntries(), recPoint->GetEnergy()));
 554     } // If seed found
 555   } // while digit
 556
 557   delete digitsC ;
 558
 559   AliDebug(1,Form("total no of clusters %d from %d digits",fNumberOfECAClusters,fDigitsArr->GetEntriesFast()));
 560 }
 561
 562 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding() const
 563 {
 564   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding", "--> Unfolding not implemented") ;
 565 }
 566
 567 //____________________________________________________________________________
 568 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 569 {
 570   // Shape of the shower (see EMCAL TDR)
 571   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 572
 573   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 574   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 575   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 576   return shape ;
 577 }
 578
 579 //____________________________________________________________________________
 580 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALRecPoint * /*iniTower*/,
 581                                            Int_t /*nMax*/,
 582                                            AliEMCALDigit ** /*maxAt*/,
 583                                            Float_t * /*maxAtEnergy*/) const
 584 {
 585   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 586
 587   Fatal("UnfoldCluster", "--> Unfolding not implemented") ;
 588
 589 }
 590
 591 //_____________________________________________________________________________
 592 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & /*nPar*/, Double_t * /*Grad*/,
 593                                                Double_t & /*fret*/,
 594                                                Double_t * /*x*/, Int_t /*iflag*/)
 595 {
 596   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 597   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 598
 599   ::Fatal("UnfoldingChiSquare","Unfolding not implemented") ;
 600 }
 601 //____________________________________________________________________________
 602 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * /*option*/)const
 603 {
 604   // Print clusterizer parameters
 605
 606   TString message("\n") ;
 607
 608   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 609
 610     // Print parameters
 611
 612     TString taskName(Version()) ;
 613
 614     printf("--------------- ");
 615     printf(taskName.Data()) ;
 616     printf(" ");
 617     printf("Clusterizing digits: ");
 618     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut);
 619     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0);
 620     if(fToUnfold)
 621       printf("\nUnfolding on\n");
 622     else
 623       printf("\nUnfolding off\n");
 624
 625     printf("------------------------------------------------------------------");
 626   }
 627   else
 628     printf("AliEMCALClusterizerv1 not initialized ") ;
 629 }
 630
 631 //____________________________________________________________________________
 632 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 633 {
 634   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
 635   if(strstr(option,"deb")) {
 636     printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ;
 637
 638     printf("           Found %d ECA Rec Points\n ",
 639          fRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 640   }
 641
 642   if(strstr(option,"all")) {
 643     if(strstr(option,"deb")) {
 644       printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
 645       printf("Clusters in ECAL section\n") ;
 646       printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     GX    GY   GZ  lX    lY   lZ   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;
 647     }
 648    Int_t index =0;
 649    Float_t maxE=0;
 650    Float_t maxL1=0;
 651    Float_t maxL2=0;
 652    Float_t maxDis=0;
 653
 654     AliEMCALHistoUtilities::FillH1(fHists, 12, double(fRecPoints->GetEntries()));
 655
 656     for (index = 0 ; index < fRecPoints->GetEntries() ; index++) {
 657       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(fRecPoints->At(index)) ;
 658       TVector3  globalpos;
 659       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
 660       TVector3  localpos;
 661       rp->GetLocalPosition(localpos);
 662       Float_t lambda[2];
 663       rp->GetElipsAxis(lambda);
 664       Int_t * primaries;
 665       Int_t nprimaries;
 666       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
 667       if(strstr(option,"deb"))
 668       printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
 669              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
 670              globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(),
 671              rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
 672   /////////////
 673       if(rp->GetEnergy()>maxE){
 674               maxE=rp->GetEnergy();
 675               maxL1=lambda[0];
 676               maxL2=lambda[1];
 677               maxDis=rp->GetDispersion();
 678       }
 679       fPointE->Fill(rp->GetEnergy());
 680       fPointL1->Fill(lambda[0]);
 681       fPointL2->Fill(lambda[1]);
 682       fPointDis->Fill(rp->GetDispersion());
 683       fPointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
 684       /////////////
 685       if(strstr(option,"deb")){
 686         for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
 687           printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
 688         }
 689       }
 690     }
 691
 692       fMaxE->Fill(maxE);
 693       fMaxL1->Fill(maxL1);
 694       fMaxL2->Fill(maxL2);
 695       fMaxDis->Fill(maxDis);
 696
 697     if(strstr(option,"deb"))
 698     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
 699   }
 700 }
 701 TList* AliEMCALClusterizerv1::BookHists()
 702 {
 703   //set up histograms for monitoring clusterizer performance
 704
 705   gROOT->cd();
 706
 707         fPointE = new TH1F("00_pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
 708         fPointL1 = new TH1F("01_pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
 709         fPointL2 = new TH1F("02_pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
 710         fPointDis = new TH1F("03_pointDisp","point dispersion", 1000, 0.0, 10.);
 711         fPointMult = new TH1F("04_pointMult","#cell in point(cluster)", 101, -0.5, 100.5);
 712         fDigitAmp = new TH1F("05_digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
 713         fMaxE = new TH1F("06_maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
 714         fMaxL1 = new TH1F("07_maxL1","Largest (first) of eigenvalue of covariance matrix", 1000, 0.0, 3.);
 715         fMaxL2 = new TH1F("08_maxL2","Smalest (second) of eigenvalue of covariace matrix", 1000, 0.0, 3.);
 716         fMaxDis = new TH1F("09_maxDis","Point dispersion", 1000, 0.0, 10.); // 9
 717         //
 718         new TH1F("10_adcOfDigits","adc of digits(threshold control)", 1001, -0.5, 1000.5);   // 10
 719         new TH1F("11_energyOfDigits","energy of digits(threshold control)", 1000, 0.0, 1.);  // 11
 720         new TH1F("12_numberOfPoints","number of points(clusters)", 101, -0.5, 100.5);        // 12
 721
 722   return AliEMCALHistoUtilities::MoveHistsToList("EmcalClusterizerv1ControlHists", kFALSE);
 723 }
 724
 725 void AliEMCALClusterizerv1::SaveHists(const char *fn)
 726 {
 727   AliEMCALHistoUtilities::SaveListOfHists(fHists, fn, kTRUE);
 728 }
 729
 730 void  AliEMCALClusterizerv1::PrintRecoInfo()
 731 {
 732   printf(" AliEMCALClusterizerv1::PrintRecoInfo() : version %s \n", Version() );
 733   TH1F *h = (TH1F*)fHists->At(12);
 734   if(h) {
 735     printf(" ## Multiplicity of RecPoints ## \n");
 736     for(int i=1; i<=h->GetNbinsX(); i++) {
 737       int nbin = int((*h)[i]);
 738       int mult = int(h->GetBinCenter(i));
 739       if(nbin > 0) printf(" %i : %5.5i %6.3f %% \n", mult, nbin, 100.*nbin/h->GetEntries());
 740     }
 741   }
 742 }
 743
 744 void AliEMCALClusterizerv1::DrawLambdasHists()
 745 {
 746   if(fMaxL1) {
 747     fMaxL1->Draw();
 748     if(fMaxL2) fMaxL2->Draw("same");
 749     if(fMaxDis) {
 750       fMaxDis->Draw("same");
 751     }
 752   }
 753 }