PWG1/TRD/AliTRDcheckDET.cxx

   1 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
   2 //                                                                        //
   3 //                                                                        //
   4 //  Basic checks for tracking and detector performance                    //
   5 //
   6 //     For the moment (15.10.2009) the following checks are implemented    //
   7 //       - Number of clusters/track
   8 //       - Number of clusters/tracklet
   9 //       - Number of tracklets/track from different sources (Barrel, StandAlone)
  10 //       - Number of findable tracklets
  11 //       - Number of tracks per event and TRD sector
  12 //       - <PH>
  13 //       - Chi2 distribution for tracks
  14 //       - Charge distribution per cluster and tracklet
  15 //       - Number of events and tracks per trigger source
  16 //       - Trigger purity
  17 //       - Track and Tracklet propagation status
  18 //
  19 //  Authors:                                                              //
  20 //    Anton Andronic <A.Andronic@gsi.de>                                  //
  21 //    Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                //
  22 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
  23 //                                                                        //
  24 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  25
  26 #include <TAxis.h>
  27 #include <TCanvas.h>
  28 #include <TFile.h>
  29 #include <TH1F.h>
  30 #include <TH1I.h>
  31 #include <TH2F.h>
  32 #include <TF1.h>
  33 #include <TGaxis.h>
  34 #include <TGraph.h>
  35 #include <TGraphErrors.h>
  36 #include <TLegend.h>
  37 #include <TLinearFitter.h>
  38 #include <TMath.h>
  39 #include <TMap.h>
  40 #include <TProfile2D.h>
  41 #include <TObjArray.h>
  42 #include <TObject.h>
  43 #include <TObjString.h>
  44
  45 #include <TPad.h>
  46 #include <TProfile.h>
  47 #include <TProfile2D.h>
  48 #include <TROOT.h>
  49 #include <TChain.h>
  50
  51 #include "AliLog.h"
  52 #include "AliTRDcluster.h"
  53 #include "AliESDHeader.h"
  54 #include "AliESDRun.h"
  55 #include "AliESDtrack.h"
  56 #include "AliExternalTrackParam.h"
  57 #include "AliTRDgeometry.h"
  58 #include "AliTRDpadPlane.h"
  59 #include "AliTRDSimParam.h"
  60 #include "AliTRDseedV1.h"
  61 #include "AliTRDtrackV1.h"
  62 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  63 #include "AliTRDReconstructor.h"
  64 #include "AliTrackReference.h"
  65 #include "AliTrackPointArray.h"
  66 #include "AliTracker.h"
  67 #include "TTreeStream.h"
  68
  69 #include "info/AliTRDtrackInfo.h"
  70 #include "info/AliTRDeventInfo.h"
  71 #include "AliTRDinfoGen.h"
  72 #include "AliTRDcheckDET.h"
  73
  74 #include <cstdio>
  75 #include <iostream>
  76
  77 ClassImp(AliTRDcheckDET)
  78
  79 //_______________________________________________________
  80 AliTRDcheckDET::AliTRDcheckDET():
  81   AliTRDrecoTask()
  82   ,fEventInfo(NULL)
  83   ,fTriggerNames(NULL)
  84   ,fFlags(0)
  85 {
  86   //
  87   // Default constructor
  88   //
  89   SetNameTitle("TRDcheckDET", "Basic TRD data checker");
  90 }
  91
  92 //_______________________________________________________
  93 AliTRDcheckDET::AliTRDcheckDET(char* name):
  94   AliTRDrecoTask(name, "Basic TRD data checker")
  95   ,fEventInfo(NULL)
  96   ,fTriggerNames(NULL)
  97   ,fFlags(0)
  98 {
  99   //
 100   // Default constructor
 101   //
 102   DefineInput(2, AliTRDeventInfo::Class());
 103
 104   InitFunctorList();
 105 }
 106
 107
 108 //_______________________________________________________
 109 AliTRDcheckDET::~AliTRDcheckDET(){
 110   //
 111   // Destructor
 112   //
 113   if(fTriggerNames) delete fTriggerNames;
 114 }
 115
 116 //_______________________________________________________
 117 void AliTRDcheckDET::UserCreateOutputObjects(){
 118   //
 119   // Create Output Objects
 120   //
 121   AliTRDrecoTask::UserCreateOutputObjects();
 122   if(!fTriggerNames) fTriggerNames = new TMap();
 123 }
 124
 125 //_______________________________________________________
 126 void AliTRDcheckDET::UserExec(Option_t *opt){
 127   //
 128   // Execution function
 129   // Filling TRD quality histos
 130   //
 131   fEventInfo = dynamic_cast<AliTRDeventInfo *>(GetInputData(2));
 132   AliDebug(2, Form("EventInfo[%p] Header[%p]", (void*)fEventInfo, (void*)(fEventInfo?fEventInfo->GetEventHeader():NULL)));
 133
 134   AliTRDrecoTask::UserExec(opt);
 135
 136   TH1F *histo(NULL); AliTRDtrackInfo *fTrackInfo(NULL); Int_t nTracks(0);               // Count the number of tracks per event
 137   for(Int_t iti = 0; iti < fTracks->GetEntriesFast(); iti++){
 138     if(!fTracks->UncheckedAt(iti)) continue;
 139     if(!(fTrackInfo = dynamic_cast<AliTRDtrackInfo *>(fTracks->UncheckedAt(iti)))) continue;
 140     if(!fTrackInfo->GetTrack()) continue;
 141     nTracks++;
 142   }
 143   if(nTracks)
 144     dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNtracksEvent))->Fill(nTracks);
 145
 146   if(!fEventInfo->GetEventHeader()) return; // For trigger statistics event header is essential
 147   Int_t triggermask = fEventInfo->GetEventHeader()->GetTriggerMask();
 148   TString triggername =  fEventInfo->GetRunInfo()->GetFiredTriggerClasses(triggermask);
 149   AliDebug(6, Form("Trigger cluster: %d, Trigger class: %s\n", triggermask, triggername.Data()));
 150   if((histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTrigger)))) histo->Fill(triggermask);
 151
 152   if(nTracks){
 153     if((histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTriggerTracks)))) histo->Fill(triggermask);
 154   }
 155   if(triggermask <= 20 && !fTriggerNames->FindObject(Form("%d", triggermask))){
 156     fTriggerNames->Add(new TObjString(Form("%d", triggermask)), new TObjString(triggername));
 157     // also set the label for both histograms
 158     if((histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTriggerTracks))))
 159       histo->GetXaxis()->SetBinLabel(histo->FindBin(triggermask), triggername);
 160     if((histo = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kNeventsTrigger))))
 161       histo->GetXaxis()->SetBinLabel(histo->FindBin(triggermask), triggername);
 162   }
 163 }
 164
 165
 166 //_______________________________________________________
 167 Bool_t AliTRDcheckDET::PostProcess(){
 168   //
 169   // Do Postprocessing (for the moment set the number of Reference histograms)
 170   //
 171
 172   TH1F *h(NULL), *h1(NULL);
 173
 174   // Calculate of the trigger clusters purity
 175   if((h  = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->FindObject("hEventsTrigger"))) &&
 176      (h1 = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->FindObject("hEventsTriggerTracks")))) {
 177     h1->Divide(h);
 178     Float_t purities[20], val = 0; memset(purities, 0, 20*sizeof(Float_t));
 179     TString triggernames[20];
 180     Int_t nTriggerClasses = 0;
 181     for(Int_t ibin = 1; ibin <= h->GetNbinsX(); ibin++){
 182       if((val = h1->GetBinContent(ibin))){
 183         purities[nTriggerClasses] = val;
 184         triggernames[nTriggerClasses] = h1->GetXaxis()->GetBinLabel(ibin);
 185         nTriggerClasses++;
 186       }
 187     }
 188
 189     if((h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->UncheckedAt(kTriggerPurity)))){
 190       TAxis *ax = h->GetXaxis();
 191       for(Int_t itrg = 0; itrg < nTriggerClasses; itrg++){
 192         h->Fill(itrg, purities[itrg]);
 193         ax->SetBinLabel(itrg+1, triggernames[itrg].Data());
 194       }
 195       ax->SetRangeUser(-0.5, nTriggerClasses+.5);
 196       h->GetYaxis()->SetRangeUser(0,1);
 197     }
 198   }
 199
 200   // track status
 201   if((h=dynamic_cast<TH1F*>(fContainer->At(kTrackStatus)))){
 202     Float_t ok = h->GetBinContent(1);
 203     Int_t nerr = h->GetNbinsX();
 204     for(Int_t ierr=nerr; ierr--;){
 205       h->SetBinContent(ierr+1, ok>0.?1.e2*h->GetBinContent(ierr+1)/ok:0.);
 206     }
 207     h->SetBinContent(1, 0.);
 208   }
 209   // tracklet status
 210
 211   TObjArray *arr(NULL);
 212   if(( arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->UncheckedAt(kTrackletStatus)))){
 213     for(Int_t ily = AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 214       if(!(h=dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))) continue;
 215       Float_t okB = h->GetBinContent(1);
 216       Int_t nerrB = h->GetNbinsX();
 217       for(Int_t ierr=nerrB; ierr--;){
 218         h->SetBinContent(ierr+1, okB>0.?1.e2*h->GetBinContent(ierr+1)/okB:0.);
 219       }
 220       h->SetBinContent(1, 0.);
 221     }
 222   }
 223   fNRefFigures = 17;
 224
 225   return kTRUE;
 226 }
 227
 228 //_______________________________________________________
 229 void AliTRDcheckDET::MakeSummary(){
 230   //
 231   // Create summary plots for TRD check DET
 232   // This function creates 2 summary plots:
 233   // - General Quantities
 234   // - PHS
 235   // The function will reuse GetRefFigure
 236   //
 237
 238   TCanvas *cOut = new TCanvas(Form("summary%s1", GetName()), Form("Summary 1 for task %s", GetName()), 1024, 768);
 239   cOut->Divide(3,3);
 240
 241   // Create figures using GetRefFigure
 242   cOut->cd(1); GetRefFigure(kFigNtracksEvent);
 243   cOut->cd(2); GetRefFigure(kFigNtracksSector);
 244   cOut->cd(3); GetRefFigure(kFigNclustersTrack);
 245   cOut->cd(4); GetRefFigure(kFigNclustersTracklet);
 246   cOut->cd(5); GetRefFigure(kFigNtrackletsTrack);
 247   cOut->cd(6); GetRefFigure(kFigNTrackletsP);
 248   cOut->cd(7); GetRefFigure(kFigChargeCluster);
 249   cOut->cd(8); GetRefFigure(kFigChargeTracklet);
 250   cOut->SaveAs("TRD_TrackQuality.gif");
 251   delete cOut;
 252
 253   // Second Plot: PHS
 254   cOut = new TCanvas(Form("summary%s2", GetName()), Form("Summary 2 for task %s", GetName()), 1024, 512);
 255   cOut->cd(); GetRefFigure(kFigPH);
 256   cOut->SaveAs("TRD_PH.gif");
 257   delete cOut;
 258
 259   // Third Plot: Mean Number of clusters as function of eta, phi and layer
 260    cOut = new TCanvas(Form("summary%s3", GetName()), Form("Summary 3 for task %s", GetName()), 1024, 768);
 261   cOut->cd(); MakePlotMeanClustersLayer();
 262   cOut->SaveAs("TRD_MeanNclusters.gif");
 263   delete cOut;
 264
 265 }
 266
 267 //_______________________________________________________
 268 Bool_t AliTRDcheckDET::GetRefFigure(Int_t ifig){
 269   //
 270   // Setting Reference Figures
 271   //
 272   gPad->SetLogy(0);
 273   gPad->SetLogx(0);
 274   TH1 *h = NULL; TObjArray *arr=NULL;
 275   TLegend *leg = NULL;
 276   Bool_t kFIRST(1);
 277   switch(ifig){
 278   case kFigNclustersTrack:
 279     (h=(TH1F*)fContainer->FindObject("hNcls"))->Draw("pl");
 280     PutTrendValue("NClustersTrack", h->GetMean());
 281     PutTrendValue("NClustersTrackRMS", h->GetRMS());
 282     return kTRUE;
 283   case kFigNclustersTracklet:
 284     (h =(TH1F*)fContainer->FindObject("hNclTls"))->Draw("pc");
 285     PutTrendValue("NClustersTracklet", h->GetMean());
 286     PutTrendValue("NClustersTrackletRMS", h->GetRMS());
 287     return kTRUE;
 288   case kFigNtrackletsTrack:
 289     h=MakePlotNTracklets();
 290     if(h){
 291       PutTrendValue("NTrackletsTrack", h->GetMean());
 292       PutTrendValue("NTrackletsTrackRMS", h->GetRMS());
 293     }
 294     return kTRUE;
 295   case kFigNTrackletsP:
 296     MakePlotnTrackletsVsP();
 297     return kTRUE;
 298   case kFigNtrackletsCross:
 299     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtlsCross");
 300     if(!MakeBarPlot(h, kRed)) break;
 301     PutTrendValue("NTrackletsCross", h->GetMean());
 302     PutTrendValue("NTrackletsCrossRMS", h->GetRMS());
 303     return kTRUE;
 304   case kFigNtrackletsFindable:
 305     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtlsFindable");
 306     if(!MakeBarPlot(h, kGreen)) break;
 307     PutTrendValue("NTrackletsFindable", h->GetMean());
 308     PutTrendValue("NTrackletsFindableRMS", h->GetRMS());
 309     return kTRUE;
 310   case kFigNtracksEvent:
 311     (h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtrks"))->Draw("pl");
 312     PutTrendValue("NTracksEvent", h->GetMean());
 313     PutTrendValue("NTracksEventRMS", h->GetRMS());
 314     return kTRUE;
 315   case kFigNtracksSector:
 316     h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hNtrksSector");
 317     if(!MakeBarPlot(h, kGreen)) break;
 318     PutTrendValue("NTracksSector", h->Integral()/h->GetNbinsX());
 319     return kTRUE;
 320   case kFigTrackStatus:
 321     if(!(h=(TH1F *)fContainer->FindObject("hTrackStatus"))) break;
 322     h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.5, -1);
 323     h->GetYaxis()->CenterTitle();
 324     h->Draw("c");
 325     PutTrendValue("TrackStatus", h->Integral());
 326     gPad->SetLogy(0);
 327     return kTRUE;
 328   case kFigTrackletStatus:
 329     if(!(arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->At(kTrackletStatus)))) break;
 330     leg = new TLegend(.68, .7, .97, .97);
 331     leg->SetBorderSize(0);leg->SetFillStyle(0);
 332     leg->SetHeader("TRD layer");
 333     for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 334       if(!(h=dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))) continue;
 335       if(kFIRST){
 336         h->Draw("pl");
 337         h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.5, -1);
 338         h->GetYaxis()->CenterTitle();
 339         kFIRST = kFALSE;
 340       } else h->Draw("samepl");
 341       leg->AddEntry(h, Form("ly = %d", ily), "l");
 342       PutTrendValue(Form("TrackletStatus%d", ily), h->Integral());
 343     }
 344     leg->Draw();
 345     gPad->SetLogy(0);
 346     return kTRUE;
 347   case kFigChi2:
 348     MakePlotChi2();
 349     return kTRUE;
 350   case kFigPH:
 351     gPad->SetMargin(0.125, 0.015, 0.1, 0.1);
 352     MakePlotPulseHeight();
 353     gPad->SetLogy(0);
 354     return kTRUE;
 355   case kFigChargeCluster:
 356     (h = (TH1F*)fContainer->FindObject("hQcl"))->Draw("c");
 357     gPad->SetLogy(1);
 358     PutTrendValue("ChargeCluster", h->GetMaximumBin());
 359     PutTrendValue("ChargeClusterRMS", h->GetRMS());
 360     return kTRUE;
 361   case kFigChargeTracklet:
 362     (h=(TH1F*)fContainer->FindObject("hQtrklt"))->Draw("c");
 363     PutTrendValue("ChargeTracklet", h->GetMaximumBin());
 364     PutTrendValue("ChargeTrackletRMS", h->GetRMS());
 365     return kTRUE;
 366   case kFigNeventsTrigger:
 367     ((TH1F*)fContainer->FindObject("hEventsTrigger"))->Draw("");
 368     return kTRUE;
 369   case kFigNeventsTriggerTracks:
 370     ((TH1F*)fContainer->FindObject("hEventsTriggerTracks"))->Draw("");
 371     return kTRUE;
 372   case kFigTriggerPurity:
 373     if(!MakeBarPlot((TH1F*)fContainer->FindObject("hTriggerPurity"), kGreen)) break;
 374     break;
 375   default:
 376     break;
 377   }
 378   AliInfo(Form("Reference plot [%d] missing result", ifig));
 379   return kFALSE;
 380 }
 381
 382 //_______________________________________________________
 383 TObjArray *AliTRDcheckDET::Histos(){
 384   //
 385   // Create QA histograms
 386   //
 387
 388   if(fContainer) return fContainer;
 389
 390   fContainer = new TObjArray(20);
 391   //fContainer->SetOwner(kTRUE);
 392
 393   // Register Histograms
 394   TH1 * h = NULL;
 395   TAxis *ax = NULL;
 396   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNcls"))){
 397     h = new TH1F("hNcls", "N_{clusters} / track", 181, -0.5, 180.5);
 398     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{clusters}");
 399     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 400   } else h->Reset();
 401   fContainer->AddAt(h, kNclustersTrack);
 402
 403   TObjArray *arr = new TObjArray(AliTRDgeometry::kNlayer);
 404   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("clusters");
 405   fContainer->AddAt(arr, kNclustersLayer);
 406   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 407     if(!(h = (TProfile2D *)gROOT->FindObject(Form("hNcl%d", ily)))){
 408       h = new TProfile2D(Form("hNcl%d", ily), Form("Mean Number of clusters in Layer %d", ily), 100, -1.0, 1.0, 50, -1.1*TMath::Pi(), 1.1*TMath::Pi());
 409       h->GetXaxis()->SetTitle("#eta");
 410       h->GetYaxis()->SetTitle("#phi");
 411     } else h->Reset();
 412     arr->AddAt(h, ily);
 413   }
 414
 415   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNclTls"))){
 416     h = new TH1F("hNclTls","N_{clusters} / tracklet", 51, -0.5, 50.5);
 417     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{clusters}");
 418     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 419   } else h->Reset();
 420   fContainer->AddAt(h, kNclustersTracklet);
 421
 422   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtls"))){
 423     h = new TH1F("hNtls", "N_{tracklets} / track", AliTRDgeometry::kNlayer, 0.5, 6.5);
 424     h->GetXaxis()->SetTitle("N^{tracklet}");
 425     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 426   } else h->Reset();
 427   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsTrack);
 428
 429   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("htlsSTA"))){
 430     h = new TH1F("hNtlsSTA", "N_{tracklets} / track (Stand Alone)", AliTRDgeometry::kNlayer, 0.5, 6.5);
 431     h->GetXaxis()->SetTitle("N^{tracklet}");
 432     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 433   }
 434   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsSTA);
 435
 436   // Binning for momentum dependent tracklet Plots
 437   const Int_t kNp(30);
 438   Float_t p=0.2;
 439   Float_t binsP[kNp+1], binsTrklt[AliTRDgeometry::kNlayer+1];
 440   for(Int_t i=0;i<kNp+1; i++,p+=(TMath::Exp(i*i*.001)-1.)) binsP[i]=p;
 441   for(Int_t il = 0; il <= AliTRDgeometry::kNlayer; il++) binsTrklt[il] = 0.5 + il;
 442   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("htlsBAR"))){
 443     // Make tracklets for barrel tracks momentum dependent (if we do not exceed min and max values)
 444     h = new TH2F("hNtlsBAR",
 445     "N_{tracklets} / track;p [GeV/c];N^{tracklet};freq. [%]",
 446     kNp, binsP, AliTRDgeometry::kNlayer, binsTrklt);
 447   }
 448   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsBAR);
 449
 450   //
 451   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtlsCross"))){
 452     h = new TH1F("hNtlsCross", "N_{tracklets}^{cross} / track", 7, -0.5, 6.5);
 453     h->GetXaxis()->SetTitle("n_{row cross}");
 454     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 455   } else h->Reset();
 456   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsCross);
 457
 458   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtlsFindable"))){
 459     h = new TH1F("hNtlsFindable", "Found/Findable Tracklets" , 101, -0.005, 1.005);
 460     h->GetXaxis()->SetTitle("r [a.u]");
 461     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 462   } else h->Reset();
 463   fContainer->AddAt(h, kNtrackletsFindable);
 464
 465   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtrks"))){
 466     h = new TH1F("hNtrks", "N_{tracks} / event", 100, 0, 100);
 467     h->GetXaxis()->SetTitle("N_{tracks}");
 468     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 469   } else h->Reset();
 470   fContainer->AddAt(h, kNtracksEvent);
 471
 472   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hNtrksSector"))){
 473     h = new TH1F("hNtrksSector", "N_{tracks} / sector", AliTRDgeometry::kNsector, -0.5, 17.5);
 474     h->GetXaxis()->SetTitle("sector");
 475     h->GetYaxis()->SetTitle("freq. [%]");
 476   } else h->Reset();
 477   fContainer->AddAt(h, kNtracksSector);
 478
 479   if(!(h = (TH1F*)gROOT->FindObject("hTrackStatus"))){
 480     const Int_t nerr = 7;
 481     h = new TH1F("hTrackStatus", "Track Status", nerr, -0.5, nerr-0.5);
 482     const Char_t *label[nerr] = {"OK", "PROL", "PROP", "AJST", "SNP", "TINI", "UPDT"};
 483     ax = h->GetXaxis();
 484     for(Int_t ierr=nerr; ierr--;) ax->SetBinLabel(ierr+1, label[ierr]);
 485     h->SetYTitle("Relative Error to Good [%]");
 486   }
 487   fContainer->AddAt(h, kTrackStatus);
 488
 489   arr = new TObjArray(AliTRDgeometry::kNlayer);
 490   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("TrackletStatus");
 491   fContainer->AddAt(arr, kTrackletStatus);
 492   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 493     if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject(Form("hTrackletStatus%d", ily)))){
 494       const Int_t nerr = 8;
 495       h = new TH1F(Form("hTrackletStatus%d", ily), "Tracklet status", nerr, -0.5, nerr-0.5);
 496       h->SetLineColor(ily+1);
 497       const Char_t *label[nerr] = {"OK", "Geom", "Bound", "NoCl", "NoAttach", "NoClTr", "NoFit", "Chi2"};
 498       ax = h->GetXaxis();
 499       for(Int_t ierr=nerr; ierr--;) ax->SetBinLabel(ierr+1, label[ierr]);
 500       h->SetYTitle("Relative Error to Good [%]");
 501     } else h->Reset();
 502     arr->AddAt(h, ily);
 503   }
 504
 505   // <PH> histos
 506   arr = new TObjArray(3);
 507   arr->SetOwner(kTRUE);  arr->SetName("<PH>");
 508   fContainer->AddAt(arr, kPH);
 509   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hPHt"))){
 510     h = new TProfile("hPHt", "<PH>", 31, -0.5, 30.5);
 511     h->GetXaxis()->SetTitle("Time / 100ns");
 512     h->GetYaxis()->SetTitle("<PH> [a.u]");
 513   } else h->Reset();
 514   arr->AddAt(h, 0);
 515   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hPHx")))
 516     h = new TProfile("hPHx", "<PH>", 31, -0.08, 4.88);
 517   else h->Reset();
 518   arr->AddAt(h, 1);
 519   if(!(h = (TH2F *)gROOT->FindObject("hPH2D"))){
 520     h = new TH2F("hPH2D", "Charge Distribution / time", 31, -0.5, 30.5, 100, 0, 1024);
 521     h->GetXaxis()->SetTitle("Time / 100ns");
 522     h->GetYaxis()->SetTitle("Charge / a.u.");
 523   } else h->Reset();
 524   arr->AddAt(h, 2);
 525
 526   // Chi2 histos
 527   if(!(h = (TH2S*)gROOT->FindObject("hChi2"))){
 528     h = new TH2S("hChi2", "#chi^{2} per track", AliTRDgeometry::kNlayer, .5, AliTRDgeometry::kNlayer+.5, 100, 0, 50);
 529     h->SetXTitle("ndf");
 530     h->SetYTitle("#chi^{2}/ndf");
 531     h->SetZTitle("entries");
 532   } else h->Reset();
 533   fContainer->AddAt(h, kChi2);
 534
 535   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hQcl"))){
 536     h = new TH1F("hQcl", "Q_{cluster}", 200, 0, 1200);
 537     h->GetXaxis()->SetTitle("Q_{cluster} [a.u.]");
 538     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 539   }else h->Reset();
 540   fContainer->AddAt(h, kChargeCluster);
 541
 542   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hQtrklt"))){
 543     h = new TH1F("hQtrklt", "Q_{tracklet}", 6000, 0, 6000);
 544     h->GetXaxis()->SetTitle("Q_{tracklet} [a.u.]");
 545     h->GetYaxis()->SetTitle("Entries");
 546   }else h->Reset();
 547   fContainer->AddAt(h, kChargeTracklet);
 548
 549
 550   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hEventsTrigger")))
 551     h = new TH1F("hEventsTrigger", "Trigger Class", 100, 0, 100);
 552   else h->Reset();
 553
 554   fContainer->AddAt(h, kNeventsTrigger);
 555
 556   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hEventsTriggerTracks")))
 557     h = new TH1F("hEventsTriggerTracks", "Trigger Class (Tracks)", 100, 0, 100);
 558   else h->Reset();
 559   fContainer->AddAt(h, kNeventsTriggerTracks);
 560
 561   if(!(h = (TH1F *)gROOT->FindObject("hTriggerPurity"))){
 562     h = new TH1F("hTriggerPurity", "Trigger Purity", 10, -0.5, 9.5);
 563     h->GetXaxis()->SetTitle("Trigger Cluster");
 564     h->GetYaxis()->SetTitle("freq.");
 565   } else h->Reset();
 566   fContainer->AddAt(h, kTriggerPurity);
 567
 568   return fContainer;
 569 }
 570
 571 /*
 572 * Plotting Functions
 573 */
 574
 575 //_______________________________________________________
 576 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotTrackStatus(const AliTRDtrackV1 *track)
 577 {
 578 //
 579 // Plot the track propagation status. The following errors are defined (see AliTRDtrackV1::ETRDtrackError)
 580 //   PROL - track prolongation failure
 581 //   PROP - track propagation failure
 582 //   AJST - crossing sectors failure
 583 //   SNP  - too large bending
 584 //   TINI - tracklet initialization failure
 585 //   UPDT - track position/covariance update failure
 586 //
 587 // Performance plot looks as below:
 588 //Begin_Html
 589 //<img src="TRD/trackStatus.gif">
 590 //End_Html
 591 //
 592   if(track) fkTrack = track;
 593   if(!fkTrack){
 594     AliDebug(4, "No Track defined.");
 595     return NULL;
 596   }
 597   TH1 *h = NULL;
 598   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kTrackStatus)))){
 599     AliWarning("No Histogram defined.");
 600     return NULL;
 601   }
 602   h->Fill(fkTrack->GetStatusTRD());
 603   return h;
 604 }
 605
 606 //_______________________________________________________
 607 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotTrackletStatus(const AliTRDtrackV1 *track)
 608 {
 609 //
 610 // Plot the tracklet propagation status. The following errors are defined for tracklet (see AliTRDtrackV1::ETRDlayerError)
 611 //   Geom   -
 612 //   Bound  - tracklet too close to chamber walls
 613 //   NoCl   - no clusters in the track roads
 614 //   NoAttach - fail to attach clusters
 615 //   NoClTr - fail to use clusters for fit
 616 //   NoFit  - tracklet fit failled
 617 //   Chi2   - chi2 tracklet-track over threshold
 618 //
 619 // Performance plot looks as below:
 620 //Begin_Html
 621 //<img src="TRD/trackletStatus.gif">
 622 //End_Html
 623 //
 624   if(track) fkTrack = track;
 625   if(!fkTrack){
 626     AliDebug(4, "No Track defined.");
 627     return NULL;
 628   }
 629   TObjArray *arr =NULL;
 630   if(!(arr = dynamic_cast<TObjArray*>(fContainer->At(kTrackletStatus)))){
 631     AliWarning("Histograms not defined.");
 632     return NULL;
 633   }
 634
 635   TH1 *h = NULL;
 636   for(Int_t ily=AliTRDgeometry::kNlayer; ily--;){
 637     if(!(h = dynamic_cast<TH1F*>(arr->At(ily)))){
 638       AliWarning(Form("Missing histo for layer %d.", ily));
 639       continue;
 640     }
 641     h->Fill(fkTrack->GetStatusTRD(ily));
 642   }
 643   return h;
 644 }
 645
 646 //_______________________________________________________
 647 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNClustersTracklet(const AliTRDtrackV1 *track){
 648   //
 649   // Plot the mean number of clusters per tracklet
 650   //
 651   if(track) fkTrack = track;
 652   if(!fkTrack){
 653     AliDebug(4, "No Track defined.");
 654     return NULL;
 655   }
 656   AliExternalTrackParam *par = fkTrack->GetTrackIn() ? fkTrack->GetTrackIn() : fkTrack->GetTrackOut();
 657   TH1 *h = NULL;
 658   TProfile2D *hlayer = NULL;
 659   Double_t eta = 0., phi = 0.;
 660   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNclustersTracklet)))){
 661     AliWarning("No Histogram defined.");
 662     return NULL;
 663   }
 664   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 665   TObjArray *histosLayer = dynamic_cast<TObjArray *>(fContainer->At(kNclustersLayer));
 666   if(!histosLayer){
 667     AliWarning("No Histograms for single layer defined");
 668   }
 669   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 670     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 671     h->Fill(tracklet->GetN2());
 672     if(histosLayer && par){
 673       if((hlayer = dynamic_cast<TProfile2D *>(histosLayer->At(itl)))){
 674         GetEtaPhiAt(par, tracklet->GetX0(), eta, phi);
 675         hlayer->Fill(eta, phi, tracklet->GetN2());
 676       }
 677     }
 678   }
 679   return h;
 680 }
 681
 682 //_______________________________________________________
 683 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNClustersTrack(const AliTRDtrackV1 *track){
 684   //
 685   // Plot the number of clusters in one track
 686   //
 687   if(track) fkTrack = track;
 688   if(!fkTrack){
 689     AliDebug(4, "No Track defined.");
 690     return NULL;
 691   }
 692   TH1 *h = NULL;
 693   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNclustersTrack)))){
 694     AliWarning("No Histogram defined.");
 695     return NULL;
 696   }
 697
 698   Int_t nclusters = 0;
 699   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 700   AliExternalTrackParam *par = fkTrack->GetTrackOut() ? fkTrack->GetTrackOut() : fkTrack->GetTrackIn();
 701   if(!par) return NULL;
 702   Double_t momentumRec = par->P();
 703   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 704     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 705     Int_t n(tracklet->GetN());
 706     nclusters += n;
 707     if(DebugLevel() > 2){
 708       Int_t crossing = Int_t(tracklet->IsRowCross());
 709       Int_t detector = tracklet->GetDetector();
 710       Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZref(1));
 711       Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYref(1));
 712       Float_t momentumMC = 0.;
 713       Int_t pdg = 0;
 714       Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
 715       UShort_t nclsTPC = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
 716       if(fkMC){
 717         if(fkMC->GetTrackRef()) momentumMC = fkMC->GetTrackRef()->P();
 718         pdg = fkMC->GetPDG();
 719       }
 720       (*DebugStream()) << "NClustersTrack"
 721         << "Detector="  << detector
 722         << "crossing="  << crossing
 723         << "momentumMC="<< momentumMC
 724         << "momentumRec=" << momentumRec
 725         << "pdg="                               << pdg
 726         << "theta="                     << theta
 727         << "phi="                               << phi
 728         << "kinkIndex=" << kinkIndex
 729         << "TPCncls="           << nclsTPC
 730         << "TRDncls="   << n
 731         << "\n";
 732     }
 733   }
 734   h->Fill(nclusters);
 735   return h;
 736 }
 737
 738
 739 //_______________________________________________________
 740 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTrackletsTrack(const AliTRDtrackV1 *track){
 741   //
 742   // Plot the number of tracklets
 743   //
 744   if(track) fkTrack = track;
 745   if(!fkTrack){
 746     AliDebug(4, "No Track defined.");
 747     return NULL;
 748   }
 749   TH1 *h = NULL, *hSta = NULL; TH2 *hBarrel = NULL;
 750   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsTrack)))){
 751     AliWarning("No Histogram defined.");
 752     return NULL;
 753   }
 754   Int_t nTracklets = fkTrack->GetNumberOfTracklets();
 755   h->Fill(nTracklets);
 756   if(!fkESD) return h;
 757   Int_t status = fkESD->GetStatus();
 758
 759 /*  printf("in/out/refit/pid: TRD[%d|%d|%d|%d]\n", status &AliESDtrack::kTRDin ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDout ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDrefit ? 1 : 0, status &AliESDtrack::kTRDpid ? 1 : 0);*/
 760   Double_t p = 0.;
 761   Int_t method = -1;    // to distinguish between stand alone and full barrel tracks in the debugging
 762   if((status & AliESDtrack::kTRDin) != 0){
 763     method = 1;
 764     // Full Barrel Track: Save momentum dependence
 765     if(!(hBarrel = dynamic_cast<TH2F *>(fContainer->At(kNtrackletsBAR)))){
 766       AliWarning("Method: Barrel.  Histogram not processed!");
 767       return NULL;
 768     }
 769     AliExternalTrackParam *par(fkTrack->GetTrackIn());
 770     if(!par){
 771       AliError("Input track params missing");
 772       return NULL;
 773     }
 774     p = par->P(); // p needed later in the debug streaming
 775     hBarrel->Fill(p, nTracklets);
 776   } else {
 777     // Stand alone Track: momentum dependence not usefull
 778     method = 0;
 779     if(!(hSta = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsSTA)))) {
 780       AliWarning("Method: StandAlone.  Histogram not processed!");
 781       return NULL;
 782     }
 783     hSta->Fill(nTracklets);
 784   }
 785
 786   if(DebugLevel() > 2){
 787     AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 788     AliTRDgeometry *geo(AliTRDinfoGen::Geometry());
 789     Int_t sector = -1, stack = -1, detector;
 790     for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
 791       if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !(tracklet->IsOK())) continue;
 792       detector = tracklet->GetDetector();
 793       sector = geo->GetSector(detector);
 794       stack = geo->GetStack(detector);
 795       break;
 796     }
 797     (*DebugStream()) << "NTrackletsTrack"
 798       << "Sector="      << sector
 799       << "Stack="        << stack
 800       << "NTracklets="  << nTracklets
 801       << "Method="      << method
 802       << "p="           << p
 803       << "\n";
 804   }
 805   if(DebugLevel() > 3){
 806     AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 807     for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 808       if((tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) && tracklet->IsOK()){
 809         (*DebugStream()) << "NTrackletsLayer"
 810         << "Layer=" << il
 811         << "p=" << p
 812         << "\n";
 813       }
 814     }
 815   }
 816   return h;
 817 }
 818
 819
 820 //_______________________________________________________
 821 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTrackletsRowCross(const AliTRDtrackV1 *track){
 822   //
 823   // Plot the number of tracklets
 824   //
 825   if(track) fkTrack = track;
 826   if(!fkTrack){
 827     AliDebug(4, "No Track defined.");
 828     return NULL;
 829   }
 830   TH1 *h = NULL;
 831   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsCross)))){
 832     AliWarning("No Histogram defined.");
 833     return NULL;
 834   }
 835
 836   Int_t ncross = 0;
 837   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 838   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 839     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) || !tracklet->IsOK()) continue;
 840
 841     if(tracklet->IsRowCross()) ncross++;
 842   }
 843   h->Fill(ncross);
 844   return h;
 845 }
 846
 847 //_______________________________________________________
 848 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotFindableTracklets(const AliTRDtrackV1 *track){
 849   //
 850   // Plots the ratio of number of tracklets vs.
 851   // number of findable tracklets
 852   //
 853   // Findable tracklets are defined as track prolongation
 854   // to layer i does not hit the dead area +- epsilon
 855   //
 856   // In order to check whether tracklet hist active area in Layer i,
 857   // the track is refitted and the fitted position + an uncertainty
 858   // range is compared to the chamber border (also with a different
 859   // uncertainty)
 860   //
 861   // For the track fit two cases are distinguished:
 862   // If the track is a stand alone track (defined by the status bit
 863   // encoding, then the track is fitted with the tilted Rieman model
 864   // Otherwise the track is fitted with the Kalman fitter in two steps:
 865   // Since the track parameters are give at the outer point, we first
 866   // fit in direction inwards. Afterwards we fit again in direction outwards
 867   // to extrapolate the track to layers which are not reached by the track
 868   // For the Kalman model, the radial track points have to be shifted by
 869   // a distance epsilon in the direction that we want to fit
 870   //
 871   const Float_t epsilon = 0.01;   // dead area tolerance
 872   const Float_t epsilonR = 1;    // shift in radial direction of the anode wire position (Kalman filter only)
 873   const Float_t deltaY = 0.7;    // Tolerance in the track position in y-direction
 874   const Float_t deltaZ = 7.0;    // Tolerance in the track position in z-direction (Padlength)
 875   Double_t xAnode[AliTRDgeometry::kNlayer] = {300.2, 312.8, 325.4, 338.0, 350.6, 363.2}; // Take the default X0
 876
 877   if(track) fkTrack = track;
 878   if(!fkTrack){
 879     AliDebug(4, "No Track defined.");
 880     return NULL;
 881   }
 882   TH1 *h = NULL;
 883   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtrackletsFindable)))){
 884     AliWarning("No Histogram defined.");
 885     return NULL;
 886   }
 887   Int_t nFound = 0, nFindable = 0;
 888   Int_t stack = -1;
 889   Double_t ymin = 0., ymax = 0., zmin = 0., zmax = 0.;
 890   Double_t y = 0., z = 0.;
 891   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
 892   AliTRDpadPlane *pp;
 893   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 894     if((tracklet = fkTrack->GetTracklet(il)) && tracklet->IsOK()){
 895       tracklet->SetReconstructor(AliTRDinfoGen::Reconstructor());
 896       nFound++;
 897     }
 898   }
 899   // 2 Different cases:
 900   // 1st stand alone: here we cannot propagate, but be can do a Tilted Rieman Fit
 901   // 2nd barrel track: here we propagate the track to the layers
 902   AliTrackPoint points[6];
 903   Float_t xyz[3];
 904   memset(xyz, 0, sizeof(Float_t) * 3);
 905   if(((fkESD->GetStatus() & AliESDtrack::kTRDout) > 0) && !((fkESD->GetStatus() & AliESDtrack::kTRDin) > 0)){
 906     // stand alone track
 907     for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 908       xyz[0] = xAnode[il];
 909       points[il].SetXYZ(xyz);
 910     }
 911     AliTRDtrackerV1::FitRiemanTilt(const_cast<AliTRDtrackV1 *>(fkTrack), NULL, kTRUE, 6, points);
 912   } else {
 913     // barrel track
 914     //
 915     // 2 Steps:
 916     // -> Kalman inwards
 917     // -> Kalman outwards
 918     AliTRDtrackV1 copyTrack(*fkTrack);  // Do Kalman on a (non-constant) copy of the track
 919     AliTrackPoint pointsInward[6], pointsOutward[6];
 920     for(Int_t il = AliTRDgeometry::kNlayer; il--;){
 921       // In order to avoid complications in the Kalman filter if the track points have the same radial
 922       // position like the tracklets, we have to shift the radial postion of the anode wire by epsilon
 923       // in the direction we want to go
 924       // The track points have to be in reverse order for the Kalman Filter inwards
 925       xyz[0] = xAnode[AliTRDgeometry::kNlayer - il - 1] - epsilonR;
 926       pointsInward[il].SetXYZ(xyz);
 927       xyz[0] = xAnode[il] + epsilonR;
 928       pointsOutward[il].SetXYZ(xyz);
 929     }
 930     /*for(Int_t ipt = 0; ipt < AliTRDgeometry::kNlayer; ipt++)
 931       printf("%d. X = %f\n", ipt, points[ipt].GetX());*/
 932     // Kalman inwards
 933     AliTRDtrackerV1::FitKalman(&copyTrack, NULL, kFALSE, 6, pointsInward);
 934     memcpy(points, pointsInward, sizeof(AliTrackPoint) * 6); // Preliminary store the inward results in the Array points
 935     // Kalman outwards
 936     AliTRDtrackerV1::FitKalman(&copyTrack, NULL, kTRUE, 6, pointsInward);
 937     memcpy(points, pointsOutward, sizeof(AliTrackPoint) * AliTRDgeometry::kNlayer);
 938   }
 939   AliTRDgeometry *geo(AliTRDinfoGen::Geometry());
 940   for(Int_t il = 0; il < AliTRDgeometry::kNlayer; il++){
 941     y = points[il].GetY();
 942     z = points[il].GetZ();
 943     if((stack = geo->GetStack(z, il)) < 0) continue; // Not findable
 944     pp = geo->GetPadPlane(il, stack);
 945     ymin = pp->GetCol0() + epsilon;
 946     ymax = pp->GetColEnd() - epsilon;
 947     zmin = pp->GetRowEnd() + epsilon;
 948     zmax = pp->GetRow0() - epsilon;
 949     // ignore y-crossing (material)
 950     if((z + deltaZ > zmin && z - deltaZ < zmax) && (y + deltaY > ymin && y - deltaY < ymax)) nFindable++;
 951       if(DebugLevel() > 3){
 952         Double_t posTracklet[2] = {tracklet ? tracklet->GetYfit(0) : 0, tracklet ? tracklet->GetZfit(0) : 0};
 953         Int_t hasTracklet = tracklet ? 1 : 0;
 954         (*DebugStream())   << "FindableTracklets"
 955           << "layer="     << il
 956           << "ytracklet=" << posTracklet[0]
 957           << "ytrack="    << y
 958           << "ztracklet=" << posTracklet[1]
 959           << "ztrack="    << z
 960           << "tracklet="  << hasTracklet
 961           << "\n";
 962       }
 963   }
 964
 965   h->Fill(nFindable > 0 ? TMath::Min(nFound/static_cast<Double_t>(nFindable), 1.) : 1);
 966   AliDebug(2, Form("Findable[Found]: %d[%d|%f]", nFindable, nFound, nFound/static_cast<Float_t>(nFindable > 0 ? nFindable : 1)));
 967   return h;
 968 }
 969
 970
 971 //_______________________________________________________
 972 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChi2(const AliTRDtrackV1 *track){
 973   //
 974   // Plot the chi2 of the track
 975   //
 976   if(track) fkTrack = track;
 977   if(!fkTrack){
 978     AliDebug(4, "No Track defined.");
 979     return NULL;
 980   }
 981   TH1 *h = NULL;
 982   if(!(h = dynamic_cast<TH2S*>(fContainer->At(kChi2)))) {
 983     AliWarning("No Histogram defined.");
 984     return NULL;
 985   }
 986   Int_t n = fkTrack->GetNumberOfTracklets();
 987   if(!n) return NULL;
 988
 989   h->Fill(n, fkTrack->GetChi2()/n);
 990   return h;
 991 }
 992
 993
 994 //_______________________________________________________
 995 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotPHt(const AliTRDtrackV1 *track){
 996   //
 997   // Plot the average pulse height
 998   //
 999   if(track) fkTrack = track;
1000   if(!fkTrack){
1001     AliDebug(4, "No Track defined.");
1002     return NULL;
1003   }
1004   TProfile *h = NULL; TH2F *phs2D = NULL;
1005   if(!(h = dynamic_cast<TProfile *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(0)))){
1006     AliWarning("No Histogram defined.");
1007     return NULL;
1008   }
1009   if(!(phs2D = dynamic_cast<TH2F *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(2)))){
1010     AliWarning("2D Pulse Height histogram not defined. Histogramm cannot be filled");
1011   }
1012   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1013   AliTRDcluster *c = NULL;
1014   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1015     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK())continue;
1016     Int_t crossing = Int_t(tracklet->IsRowCross());
1017     Int_t detector = tracklet->GetDetector();
1018     tracklet->ResetClusterIter();
1019     while((c = tracklet->NextCluster())){
1020       if(!IsUsingClustersOutsideChamber() && !c->IsInChamber()) continue;
1021       Int_t localtime        = c->GetLocalTimeBin();
1022       Double_t absoluteCharge = TMath::Abs(c->GetQ());
1023       h->Fill(localtime, absoluteCharge);
1024       phs2D->Fill(localtime, absoluteCharge);
1025       if(DebugLevel() > 3){
1026         Int_t inChamber = c->IsInChamber() ? 1 : 0;
1027         Double_t distance[2];
1028         GetDistanceToTracklet(distance, tracklet, c);
1029         Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZref(1));
1030         Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYref(1));
1031         AliExternalTrackParam *trdPar = fkTrack->GetTrackIn();
1032         Float_t momentumMC = 0, momentumRec = trdPar ? trdPar->P() : fkTrack->P(); // prefer Track Low
1033         Int_t pdg = 0;
1034         Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
1035         UShort_t tpcNCLS = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
1036         if(fkMC){
1037           if(fkMC->GetTrackRef()) momentumMC = fkMC->GetTrackRef()->P();
1038           pdg = fkMC->GetPDG();
1039         }
1040         (*DebugStream()) << "PHt"
1041           << "Detector="        << detector
1042           << "crossing="        << crossing
1043           << "inChamber=" << inChamber
1044           << "Timebin="         << localtime
1045           << "Charge="          << absoluteCharge
1046           << "momentumMC="      << momentumMC
1047           << "momentumRec="     << momentumRec
1048           << "pdg="                             << pdg
1049           << "theta="                   << theta
1050           << "phi="                             << phi
1051           << "kinkIndex="       << kinkIndex
1052           << "TPCncls="         << tpcNCLS
1053           << "dy="        << distance[0]
1054           << "dz="        << distance[1]
1055           << "c.="        << c
1056           << "\n";
1057       }
1058     }
1059   }
1060   return h;
1061 }
1062
1063 //_______________________________________________________
1064 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotPHx(const AliTRDtrackV1 *track){
1065   //
1066   // Plots the average pulse height vs the distance from the anode wire
1067   // (plus const anode wire offset)
1068   //
1069   if(track) fkTrack = track;
1070   if(!fkTrack){
1071      AliDebug(4, "No Track defined.");
1072      return NULL;
1073   }
1074   TProfile *h = NULL;
1075   if(!(h = dynamic_cast<TProfile *>(((TObjArray*)(fContainer->At(kPH)))->At(1)))){
1076     AliWarning("No Histogram defined.");
1077     return NULL;
1078   }
1079   AliTRDseedV1 *tracklet(NULL);
1080   AliTRDcluster *c(NULL);
1081   Double_t xd(0.), dqdl(0.);
1082   TVectorD vq(AliTRDseedV1::kNtb), vxd(AliTRDseedV1::kNtb), vdqdl(AliTRDseedV1::kNtb);
1083   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1084     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !(tracklet->IsOK())) continue;
1085     Int_t det(tracklet->GetDetector());
1086     Bool_t rc(tracklet->IsRowCross());
1087     for(Int_t ic(0); ic<AliTRDseedV1::kNtb; ic++){
1088       Bool_t kFIRST(kFALSE);
1089       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))){
1090          if(!(c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) continue;
1091       } else kFIRST=kTRUE;
1092       if(!IsUsingClustersOutsideChamber() && !c->IsInChamber()) continue;
1093       xd = tracklet->GetX0() - c->GetX(); vxd[ic] = xd;
1094       dqdl=tracklet->GetdQdl(ic); vdqdl[ic] = dqdl;
1095       vq[ic]=c->GetQ();
1096       if(kFIRST && (c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) vq[ic]+=c->GetQ();
1097       h->Fill(xd, dqdl);
1098     }
1099     if(DebugLevel() > 3){
1100       (*DebugStream()) << "PHx"
1101         << "det="  << det
1102         << "rc="   << rc
1103         << "xd="   << &vxd
1104         << "q="    << &vq
1105         << "dqdl=" << &vdqdl
1106         << "\n";
1107     }
1108   }
1109   return h;
1110 }
1111
1112 //_______________________________________________________
1113 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChargeCluster(const AliTRDtrackV1 *track){
1114   //
1115   // Plot the cluster charge
1116   //
1117   if(track) fkTrack = track;
1118   if(!fkTrack){
1119     AliDebug(4, "No Track defined.");
1120     return NULL;
1121   }
1122   TH1 *h = NULL;
1123   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kChargeCluster)))){
1124     AliWarning("No Histogram defined.");
1125     return NULL;
1126   }
1127   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1128   AliTRDcluster *c = NULL;
1129   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1130     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK())continue;
1131     for(Int_t ic(0); ic < AliTRDseedV1::kNtb; ic++){
1132       Bool_t kFIRST(kFALSE);
1133       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))) {
1134         if(!(c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) continue;
1135       } else kFIRST = kTRUE;
1136       Float_t q(c->GetQ());
1137       if(kFIRST && (c = tracklet->GetClusters(AliTRDseedV1::kNtb+ic))) q+=c->GetQ();
1138       h->Fill(q);
1139     }
1140   }
1141   return h;
1142 }
1143
1144 //_______________________________________________________
1145 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotChargeTracklet(const AliTRDtrackV1 *track){
1146   //
1147   // Plot the charge deposit per chamber
1148   //
1149   if(track) fkTrack = track;
1150   if(!fkTrack){
1151     AliDebug(4, "No Track defined.");
1152     return NULL;
1153   }
1154   TH1 *h = NULL;
1155   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kChargeTracklet)))){
1156     AliWarning("No Histogram defined.");
1157     return NULL;
1158   }
1159   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1160   AliTRDcluster *c = NULL;
1161   Double_t qTot = 0;
1162   Int_t nTracklets =fkTrack->GetNumberOfTracklets();
1163   for(Int_t itl(0); itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1164     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
1165     qTot = 0.;
1166     for(Int_t ic = AliTRDseedV1::kNclusters; ic--;){
1167       if(!(c = tracklet->GetClusters(ic))) continue;
1168       qTot += TMath::Abs(c->GetQ());
1169     }
1170     h->Fill(qTot);
1171     if(DebugLevel() > 3){
1172       Int_t crossing = (Int_t)tracklet->IsRowCross();
1173       Int_t detector = tracklet->GetDetector();
1174       Float_t theta = TMath::ATan(tracklet->GetZfit(1));
1175       Float_t phi = TMath::ATan(tracklet->GetYfit(1));
1176       Float_t momentum = 0.;
1177       Int_t pdg = 0;
1178       Int_t kinkIndex = fkESD ? fkESD->GetKinkIndex() : 0;
1179       UShort_t nclsTPC = fkESD ? fkESD->GetTPCncls() : 0;
1180       if(fkMC){
1181               if(fkMC->GetTrackRef()) momentum = fkMC->GetTrackRef()->P();
1182         pdg = fkMC->GetPDG();
1183       }
1184       (*DebugStream()) << "ChargeTracklet"
1185         << "Detector="  << detector
1186         << "crossing="  << crossing
1187         << "momentum="  << momentum
1188         << "nTracklets="<< nTracklets
1189         << "pdg="                               << pdg
1190         << "theta="                     << theta
1191         << "phi="                               << phi
1192         << "kinkIndex=" << kinkIndex
1193         << "TPCncls="           << nclsTPC
1194         << "QT="        << qTot
1195         << "\n";
1196     }
1197   }
1198   return h;
1199 }
1200
1201 //_______________________________________________________
1202 TH1 *AliTRDcheckDET::PlotNTracksSector(const AliTRDtrackV1 *track){
1203   //
1204   // Plot the number of tracks per Sector
1205   //
1206   if(track) fkTrack = track;
1207   if(!fkTrack){
1208     AliDebug(4, "No Track defined.");
1209     return NULL;
1210   }
1211   TH1 *h = NULL;
1212   if(!(h = dynamic_cast<TH1F *>(fContainer->At(kNtracksSector)))){
1213     AliWarning("No Histogram defined.");
1214     return NULL;
1215   }
1216
1217   // TODO we should compare with
1218   // sector = Int_t(track->GetAlpha() / AliTRDgeometry::GetAlpha());
1219
1220   AliTRDseedV1 *tracklet = NULL;
1221   Int_t sector = -1;
1222   for(Int_t itl = 0; itl < AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1223     if(!(tracklet = fkTrack->GetTracklet(itl)) || !tracklet->IsOK()) continue;
1224     sector = static_cast<Int_t>(tracklet->GetDetector()/AliTRDgeometry::kNdets);
1225     break;
1226   }
1227   h->Fill(sector);
1228   return h;
1229 }
1230
1231
1232 //________________________________________________________
1233 void AliTRDcheckDET::GetDistanceToTracklet(Double_t *dist, AliTRDseedV1 * const tracklet, AliTRDcluster * const c)
1234 {
1235   Float_t x = c->GetX();
1236   dist[0] = c->GetY() - tracklet->GetYat(x);
1237   dist[1] = c->GetZ() - tracklet->GetZat(x);
1238 }
1239
1240 //________________________________________________________
1241 void AliTRDcheckDET::GetEtaPhiAt(const AliExternalTrackParam *track, Double_t x, Double_t &eta, Double_t &phi){
1242   //
1243   // Get phi and eta at a given radial position
1244   //
1245   AliExternalTrackParam workpar(*track);
1246
1247   Double_t posLocal[3];
1248   Bool_t sucPos = workpar.GetXYZAt(x, fEventInfo->GetRunInfo()->GetMagneticField(), posLocal);
1249   Double_t sagPhi = sucPos ? TMath::ATan2(posLocal[1], posLocal[0]) : 0.;
1250   phi = sagPhi;
1251   eta = workpar.Eta();
1252 }
1253
1254
1255 //_______________________________________________________
1256 TH1* AliTRDcheckDET::MakePlotChi2()
1257 {
1258 // Plot chi2/track normalized to number of degree of freedom
1259 // (tracklets) and compare with the theoretical distribution.
1260 //
1261 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1262
1263   return NULL;
1264
1265 /*  TH2S *h2 = (TH2S*)fContainer->At(kChi2);
1266   TF1 f("fChi2", "[0]*pow(x, [1]-1)*exp(-0.5*x)", 0., 50.);
1267   f.SetParLimits(1,1, 1e100);
1268   TLegend *leg = new TLegend(.7,.7,.95,.95);
1269   leg->SetBorderSize(1); leg->SetHeader("Tracklets per Track");
1270   TH1D *h1 = NULL;
1271   Bool_t kFIRST = kTRUE;
1272   for(Int_t il=1; il<=h2->GetNbinsX(); il++){
1273     h1 = h2->ProjectionY(Form("pyChi2%d", il), il, il);
1274     if(h1->Integral()<50) continue;
1275     h1->Scale(1./h1->Integral());
1276     h1->SetMarkerStyle(7);h1->SetMarkerColor(il);
1277     h1->SetLineColor(il);h1->SetLineStyle(2);
1278     f.SetParameter(1, .5*il);f.SetLineColor(il);
1279     h1->Fit(&f, "QW+", kFIRST ? "pc": "pcsame");
1280     leg->AddEntry(h1, Form("%d", il), "l");
1281     if(kFIRST){
1282       h1->GetXaxis()->SetRangeUser(0., 25.);
1283     }
1284     kFIRST = kFALSE;
1285   }
1286   leg->Draw();
1287   gPad->SetLogy();
1288   return h1;*/
1289 }
1290
1291
1292 //________________________________________________________
1293 TH1* AliTRDcheckDET::MakePlotNTracklets(){
1294   //
1295   // Make nice bar plot of the number of tracklets in each method
1296   //
1297   TH2F *tmp = (TH2F *)fContainer->FindObject("hNtlsBAR");
1298   TH1D *hBAR = tmp->ProjectionY();
1299   TH1F *hSTA = (TH1F *)fContainer->FindObject("hNtlsSTA");
1300   TH1F *hCON = (TH1F *)fContainer->FindObject("hNtls");
1301   TLegend *leg = new TLegend(0.13, 0.75, 0.39, 0.89);
1302   leg->SetBorderSize(1);
1303   leg->SetFillColor(0);
1304
1305   Float_t scale = hCON->Integral();
1306   if(scale) hCON->Scale(100./scale);
1307   hCON->SetFillColor(kRed);hCON->SetLineColor(kRed);
1308   hCON->SetBarWidth(0.2);
1309   hCON->SetBarOffset(0.6);
1310   hCON->SetStats(kFALSE);
1311   hCON->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1312   hCON->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1313   hCON->Draw("bar1"); leg->AddEntry(hCON, "Total", "f");
1314   hCON->SetMaximum(55.);
1315
1316   if(scale) hBAR->Scale(100./scale);
1317   hBAR->SetFillColor(kGreen);hBAR->SetLineColor(kGreen);
1318   hBAR->SetBarWidth(0.2);
1319   hBAR->SetBarOffset(0.2);
1320   hBAR->SetTitle("");
1321   hBAR->SetStats(kFALSE);
1322   hBAR->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1323   hBAR->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1324   hBAR->Draw("bar1same"); leg->AddEntry(hBAR, "Barrel", "f");
1325
1326   if(scale) hSTA->Scale(100./scale);
1327   hSTA->SetFillColor(kBlue);hSTA->SetLineColor(kBlue);
1328   hSTA->SetBarWidth(0.2);
1329   hSTA->SetBarOffset(0.4);
1330   hSTA->SetTitle("");
1331   hSTA->SetStats(kFALSE);
1332   hSTA->GetYaxis()->SetRangeUser(0.,40.);
1333   hSTA->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1334   hSTA->Draw("bar1same"); leg->AddEntry(hSTA, "Stand Alone", "f");
1335   leg->Draw();
1336   gPad->Update();
1337   return hCON;
1338 }
1339
1340 //________________________________________________________
1341 void AliTRDcheckDET::MakePlotnTrackletsVsP(){
1342   //
1343   // Plot abundance of tracks with number of tracklets as function of momentum
1344   //
1345
1346
1347
1348
1349   Color_t color[AliTRDgeometry::kNlayer] = {kBlue, kOrange, kBlack, kGreen, kCyan, kRed};
1350   TH1 *h(NULL); TGraphErrors *g[AliTRDgeometry::kNlayer];
1351   for(Int_t itl(0); itl<AliTRDgeometry::kNlayer; itl++){
1352     g[itl] = new TGraphErrors();
1353     g[itl]->SetLineColor(color[itl]);
1354     g[itl]->SetMarkerColor(color[itl]);
1355     g[itl]->SetMarkerStyle(20 + itl);
1356   }
1357
1358   TH2 *hBar = (TH2F *)fContainer->FindObject("hNtlsBAR");
1359   TAxis *ax(hBar->GetXaxis());
1360   Int_t np(ax->GetNbins());
1361   for(Int_t ipBin(1); ipBin<np; ipBin++){
1362     h = hBar->ProjectionY("npBin", ipBin, ipBin);
1363     if(!Int_t(h->Integral())) continue;
1364     h->Scale(100./h->Integral());
1365     Float_t p(ax->GetBinCenter(ipBin));
1366     Float_t dp(ax->GetBinWidth(ipBin));
1367     Int_t ip(g[0]->GetN());
1368     for(Int_t itl(AliTRDgeometry::kNlayer); itl--;){
1369       g[itl]->SetPoint(ip, p, h->GetBinContent(itl+1));
1370       g[itl]->SetPointError(ip, dp/3.46, h->GetBinError(itl+1));
1371     }
1372   }
1373
1374   TLegend *leg = new TLegend(0.76, 0.6, 1., 0.9);
1375   leg->SetBorderSize(0);
1376   leg->SetHeader("Tracklet/Track");
1377   leg->SetFillStyle(0);
1378   h = hBar->ProjectionX("npxBin"); h->Reset();
1379   h->SetTitle("");
1380   h->GetYaxis()->SetRangeUser(1., 99.);
1381   h->GetYaxis()->SetMoreLogLabels();
1382   h->GetYaxis()->CenterTitle();
1383   h->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.2);
1384   h->SetYTitle("Prob. [%]");
1385   h->GetXaxis()->SetRangeUser(0.4, 12.);
1386   h->GetXaxis()->SetMoreLogLabels();
1387   h->GetXaxis()->CenterTitle();
1388   h->Draw("p");
1389   for(Int_t itl(AliTRDgeometry::kNlayer); itl--;){
1390     g[itl]->Draw("pc");
1391     leg->AddEntry(g[itl], Form("n = %d", itl+1),"pl");
1392   }
1393
1394   leg->Draw();
1395   gPad->SetLogx();gPad->SetLogy();
1396 }
1397
1398 //________________________________________________________
1399 Bool_t AliTRDcheckDET::MakePlotPulseHeight(){
1400   //
1401   // Create Plot of the Pluse Height Spectrum
1402   //
1403   TCanvas *output = gPad->GetCanvas();
1404   output->Divide(2);
1405   output->cd(1);
1406   TH1 *h, *h1, *h2;
1407   TObjArray *arr = (TObjArray*)fContainer->FindObject("<PH>");
1408   h = (TH1F*)arr->At(0);
1409   if((Int_t)h->GetEntries()){
1410     h->SetMarkerStyle(24);
1411     h->SetMarkerColor(kBlack);
1412     h->SetLineColor(kBlack);
1413     h->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.5);
1414     h->Draw("e1");
1415     // Trending for the pulse height: plateau value, slope and timebin of the maximum
1416     TLinearFitter fit(1,"pol1");
1417     Double_t time = 0.;
1418     for(Int_t itime = 10; itime <= 20; itime++){
1419       time = Double_t(itime);
1420       Double_t err(h->GetBinError(itime + 1));
1421       if(err>1.e-10) fit.AddPoint(&time, h->GetBinContent(itime + 1), err);
1422     }
1423     if(!fit.Eval()){
1424       Double_t plateau = fit.GetParameter(0) + 12 * fit.GetParameter(1);
1425       Double_t slope = fit.GetParameter(1);
1426       PutTrendValue("PHplateau", plateau);
1427       PutTrendValue("PHslope", slope);
1428       PutTrendValue("PHamplificationPeak", static_cast<Double_t>(h->GetMaximumBin()-1));
1429       AliDebug(1, Form("plateau %f, slope %f, MaxTime %f", plateau, slope, static_cast<Double_t>(h->GetMaximumBin()-1)));
1430     }
1431   }
1432   //   copy the second histogram in a new one with the same x-dimension as the phs with respect to time
1433   h1 = (TH1F *)arr->At(1);
1434   h2 = new TH1F("hphs1","Average PH", 31, -0.5, 30.5);
1435   for(Int_t ibin = h1->GetXaxis()->GetFirst(); ibin < h1->GetNbinsX(); ibin++)
1436     h2->SetBinContent(ibin, h1->GetBinContent(ibin));
1437   h2->SetMarkerStyle(22);
1438   h2->SetMarkerColor(kBlue);
1439   h2->SetLineColor(kBlue);
1440   h2->Draw("e1same");
1441   gPad->Update();
1442
1443 //   create axis according to the histogram dimensions of the original second histogram
1444   TGaxis *axis = new TGaxis(gPad->GetUxmin(),
1445                     gPad->GetUymax(),
1446                     gPad->GetUxmax(),
1447                     gPad->GetUymax(),
1448                     -0.08, 4.88, 510,"-L");
1449   axis->SetLineColor(kBlue);
1450   axis->SetLabelColor(kBlue);
1451   axis->SetTextColor(kBlue);
1452   axis->SetTitle("x_{0}-x_{c} [cm]");
1453   axis->Draw();
1454
1455   output->cd(2);
1456   TH2 *ph2d = (TH2F *)arr->At(2);
1457   ph2d->GetYaxis()->SetTitleOffset(1.8);
1458   ph2d->SetStats(kFALSE);
1459   ph2d->Draw("colz");
1460   return kTRUE;
1461 }
1462
1463 //________________________________________________________
1464 void AliTRDcheckDET::MakePlotMeanClustersLayer(){
1465   //
1466   // Create Summary plot for the mean number of clusters per layer
1467   //
1468   TCanvas *output = gPad->GetCanvas();
1469   output->Divide(3,2);
1470   TObjArray *histos = (TObjArray *)fContainer->At(kNclustersLayer);
1471   if(!histos){
1472     AliWarning("Histos for each layer not found");
1473     return;
1474   }
1475   TProfile2D *hlayer = NULL;
1476   for(Int_t ily = 0; ily < AliTRDgeometry::kNlayer; ily++){
1477     if(!(hlayer = dynamic_cast<TProfile2D *>(histos->At(ily)))) continue;
1478     output->cd(ily + 1);
1479     gPad->SetGrid(0,0);
1480     hlayer->Draw("colz");
1481   }
1482 }
1483
1484 //________________________________________________________
1485 Bool_t AliTRDcheckDET::MakeBarPlot(TH1 *histo, Int_t color){
1486   //
1487   // Draw nice bar plots
1488   //
1489   if(!histo->GetEntries()) return kFALSE;
1490   histo->Scale(100./histo->Integral());
1491   histo->SetFillColor(color);
1492   histo->SetBarOffset(.2);
1493   histo->SetBarWidth(.6);
1494   histo->Draw("bar1");
1495   return kTRUE;
1496 }