TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27
  28 ClassImp(AliTPCseed)
  29
  30
  31
  32 AliTPCseed::AliTPCseed():
  33   AliTPCtrack(),
  34   fEsd(0x0),
  35   fClusterOwner(kFALSE),
  36   fPoints(0x0),
  37   fEPoints(0x0),
  38   fRow(0),
  39   fSector(-1),
  40   fRelativeSector(-1),
  41   fCurrentSigmaY2(1e10),
  42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  43   fErrorY2(1e10),
  44   fErrorZ2(1e10),
  45   fCurrentCluster(0x0),
  46   fCurrentClusterIndex1(-1),
  47   fInDead(kFALSE),
  48   fIsSeeding(kFALSE),
  49   fNoCluster(0),
  50   fSort(0),
  51   fBSigned(kFALSE),
  52   fSeedType(0),
  53   fSeed1(-1),
  54   fSeed2(-1),
  55   fMAngular(0),
  56   fCircular(0),
  57   fClusterMap(159),
  58   fSharedMap(159)
  59 {
  60   //
  61   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  62   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  63   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  64   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  65   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  66     fDEDX[i] = 0.;
  67     fSDEDX[i] = 1e10;
  68     fNCDEDX[i] = 0;
  69   }
  70   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  71   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
  72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
  73 }
  74
  75 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  76   AliTPCtrack(s),
  77   fEsd(0x0),
  78   fClusterOwner(clusterOwner),
  79   fPoints(0x0),
  80   fEPoints(0x0),
  81   fRow(0),
  82   fSector(-1),
  83   fRelativeSector(-1),
  84   fCurrentSigmaY2(1e10),
  85   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  86   fErrorY2(1e10),
  87   fErrorZ2(1e10),
  88   fCurrentCluster(0x0),
  89   fCurrentClusterIndex1(-1),
  90   fInDead(kFALSE),
  91   fIsSeeding(kFALSE),
  92   fNoCluster(0),
  93   fSort(0),
  94   fBSigned(kFALSE),
  95   fSeedType(0),
  96   fSeed1(-1),
  97   fSeed2(-1),
  98   fMAngular(0),
  99   fCircular(0),
 100   fClusterMap(s.fClusterMap),
 101   fSharedMap(s.fSharedMap)
 102 {
 103   //---------------------
 104   // dummy copy constructor
 105   //-------------------------
 106   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 107     fClusterPointer[i]=0;
 108     if (fClusterOwner){
 109       if (s.fClusterPointer[i])
 110         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 111     }else{
 112       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 113     }
 114     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 115   }
 116   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 117   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 118   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 119     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 120     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 121     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 122   }
 123   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 124
 125 }
 126
 127
 128 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 129   AliTPCtrack(t),
 130   fEsd(0x0),
 131   fClusterOwner(kFALSE),
 132   fPoints(0x0),
 133   fEPoints(0x0),
 134   fRow(0),
 135   fSector(-1),
 136   fRelativeSector(-1),
 137   fCurrentSigmaY2(1e10),
 138   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 139   fErrorY2(1e10),
 140   fErrorZ2(1e10),
 141   fCurrentCluster(0x0),
 142   fCurrentClusterIndex1(-1),
 143   fInDead(kFALSE),
 144   fIsSeeding(kFALSE),
 145   fNoCluster(0),
 146   fSort(0),
 147   fBSigned(kFALSE),
 148   fSeedType(0),
 149   fSeed1(-1),
 150   fSeed2(-1),
 151   fMAngular(0),
 152   fCircular(0),
 153   fClusterMap(159),
 154   fSharedMap(159)
 155 {
 156   //
 157   // Constructor from AliTPCtrack
 158   //
 159   fFirstPoint =0;
 160   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 161   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 162     fClusterPointer[i] = 0;
 163     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 164     if (index>=-1){
 165       SetClusterIndex2(i,index);
 166     }
 167     else{
 168       SetClusterIndex2(i,-3);
 169     }
 170   }
 171   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 172     fDEDX[i] = 0.;
 173     fSDEDX[i] = 1e10;
 174     fNCDEDX[i] = 0;
 175   }
 176   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 177   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
 178   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
 179 }
 180
 181 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 182                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 183   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 184   fEsd(0x0),
 185   fClusterOwner(kFALSE),
 186   fPoints(0x0),
 187   fEPoints(0x0),
 188   fRow(0),
 189   fSector(-1),
 190   fRelativeSector(-1),
 191   fCurrentSigmaY2(1e10),
 192   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 193   fErrorY2(1e10),
 194   fErrorZ2(1e10),
 195   fCurrentCluster(0x0),
 196   fCurrentClusterIndex1(-1),
 197   fInDead(kFALSE),
 198   fIsSeeding(kFALSE),
 199   fNoCluster(0),
 200   fSort(0),
 201   fBSigned(kFALSE),
 202   fSeedType(0),
 203   fSeed1(-1),
 204   fSeed2(-1),
 205   fMAngular(0),
 206   fCircular(0),
 207   fClusterMap(159),
 208   fSharedMap(159)
 209 {
 210   //
 211   // Constructor
 212   //
 213   fFirstPoint =0;
 214   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 215   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 216   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 217   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 218     fDEDX[i] = 0.;
 219     fSDEDX[i] = 1e10;
 220     fNCDEDX[i] = 0;
 221   }
 222   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 223 }
 224
 225 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 226   //
 227   // destructor
 228   if (fPoints) delete fPoints;
 229   fPoints =0;
 230   if (fEPoints) delete fEPoints;
 231   fEPoints = 0;
 232   fNoCluster =0;
 233   if (fClusterOwner){
 234     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 235       delete fClusterPointer[icluster];
 236     }
 237   }
 238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
 239   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
 240 }
 241 //_________________________________________________
 242 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 243 {
 244   //
 245   // assignment operator
 246   //
 247   if(this!=&param){
 248     AliTPCtrack::operator=(param);
 249     fEsd =param.fEsd;
 250     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
 251     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 252     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 253     // but deleted in the dtor... strange...
 254     // fPoints =
 255     // fEPoints =
 256     fRow            = param.fRow;
 257     fSector         = param.fSector;
 258     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 259     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 260     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 261     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 262     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 263     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 264     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 265     fInDead         = param.fInDead;
 266     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 267     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 268     fSort           = param.fSort;
 269     fBSigned        = param.fBSigned;
 270     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 271       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 272       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 273       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 274     }
 275     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 276
 277     fSeedType = param.fSeedType;
 278     fSeed1    = param.fSeed1;
 279     fSeed2    = param.fSeed2;
 280     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 281     fMAngular = param.fMAngular;
 282     fCircular = param.fCircular;
 283     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 284     fClusterMap = param.fClusterMap;
 285     fSharedMap = param.fSharedMap;
 286   }
 287   return (*this);
 288 }
 289 //____________________________________________________
 290 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 291 {
 292   //
 293   //
 294   return &fTrackPoints[i];
 295 }
 296
 297 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 298 {
 299   //
 300   // rebuild seed to be ready for storing
 301   AliTPCclusterMI cldummy;
 302   cldummy.SetQ(0);
 303   AliTPCTrackPoint pdummy;
 304   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
 305   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 306     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 307     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 308     if (cl0){
 309       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 310       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 311       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 312     }
 313     else{
 314       *trpoint = pdummy;
 315       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 316     }
 317
 318   }
 319
 320 }
 321
 322
 323 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 324 {
 325   //
 326   //
 327   // return cluster for n rows bellow first point
 328   Int_t nfoundable = 1;
 329   Int_t nfound      = 1;
 330   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 331     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 332     if (index!=-1) nfoundable++;
 333     if (index>0) nfound++;
 334   }
 335   if (nfoundable<n) return 0;
 336   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 337
 338 }
 339
 340
 341 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 342 {
 343   // get cluster stat.  on given region
 344   //
 345   found       = 0;
 346   foundable   = 0;
 347   shared      =0;
 348   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 349     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 350     if (index!=-1) foundable++;
 351     if (fClusterPointer[i]) {
 352       found++;
 353     }
 354     else
 355       continue;
 356
 357     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 358       shared++;
 359       continue;
 360     }
 361     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 362     //
 363     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 364       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 365         shared++;
 366         continue;
 367       }
 368     }
 369     if ( fClusterPointer[i+1]){
 370       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 371         shared++;
 372         continue;
 373       }
 374     }
 375
 376   }
 377   //if (shared>found){
 378     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 379   //}
 380 }
 381
 382
 383
 384
 385
 386 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 387 {
 388   //
 389   //
 390   SetNumberOfClusters(0);
 391   fNFoundable = 0;
 392   SetChi2(0);
 393   ResetCovariance(10.);
 394   /*
 395   if (fTrackPoints){
 396     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 397       delete [] fTrackPoints[i];
 398     }
 399     delete fTrackPoints;
 400     fTrackPoints =0;
 401   }
 402   */
 403
 404   if (all){
 405     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 406     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 407   }
 408
 409 }
 410
 411
 412 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 413 {
 414
 415   //------------------------------------------------------------------
 416   //This function makes a track forget its history :)
 417   //------------------------------------------------------------------
 418   if (factor<=0) {
 419     ResetCovariance(10.);
 420     return;
 421   }
 422   ResetCovariance(factor);
 423
 424   SetNumberOfClusters(0);
 425   fNFoundable =0;
 426   SetChi2(0);
 427   fRemoval = 0;
 428   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 429   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 430   fNoCluster     = 0;
 431   //fFirstPoint = 160;
 432   //fLastPoint  = 0;
 433 }
 434
 435
 436
 437
 438 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 439 {
 440   //-----------------------------------------------------------------
 441   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 442   // doesn't change internal state of the track
 443   //-----------------------------------------------------------------
 444
 445   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 446
 447   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 448     return 0;
 449   }
 450
 451   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 452   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
 453   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 454
 455   y = GetY();
 456   z = GetZ();
 457   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 458   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 459
 460   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 461   Double_t dz = 0;
 462   //
 463   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 464   /*
 465   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 466     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 467   }else{
 468     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 469   }
 470   */
 471   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 472   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 473   //
 474   y+=dy;
 475   z+=dz;
 476
 477
 478   return 1;
 479 }
 480
 481
 482 //_____________________________________________________________________________
 483 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 484 {
 485   //-----------------------------------------------------------------
 486   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 487   //-----------------------------------------------------------------
 488   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 489   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 490   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 491 }
 492
 493 //_________________________________________________________________________________________
 494
 495
 496 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 497   //-----------------------------------------------------------------
 498   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 499   //-----------------------------------------------------------------
 500   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 501
 502   if (fSort == 0){
 503     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 504     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 505     Double_t z2 = t->GetZ();
 506     Double_t z1 = GetZ();
 507     if (z2>z1) return 1;
 508     if (z2<z1) return -1;
 509     return 0;
 510   }
 511   else {
 512     Float_t f2 =1;
 513     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 514     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 515
 516     Float_t f1 =1;
 517     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 518
 519     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 520
 521     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 522     else return +1;
 523   }
 524 }
 525
 526
 527
 528
 529 //_____________________________________________________________________________
 530 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
 531 {
 532   //-----------------------------------------------------------------
 533   // This function associates a cluster with this track.
 534   //-----------------------------------------------------------------
 535   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 536   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 537
 538   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
 539
 540   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 541   //  fIndex[n]=index;
 542   SetNumberOfClusters(n+1);
 543   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 544
 545   return kTRUE;
 546 }
 547
 548
 549
 550 //_____________________________________________________________________________
 551 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 552   //-----------------------------------------------------------------
 553   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 554   //-----------------------------------------------------------------
 555
 556   Float_t amp[200];
 557   Float_t angular[200];
 558   Float_t weight[200];
 559   Int_t index[200];
 560   //Int_t nc = 0;
 561   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 562   Float_t meanlog = 100.;
 563
 564   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 565   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 566   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 567   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 568   //
 569   //
 570   fNShared =0;
 571
 572   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 573     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 574       {
 575         Int_t index = fIndex[i];
 576         if (index<0||index&0x8000) continue;
 577
 578         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 579         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 580         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 581         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 582         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 583
 584         if (point==0) continue;
 585         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 586         if (cl==0) continue;
 587         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 588         if (cl->IsUsed(11)) {
 589           fNShared++;
 590           continue;
 591         }
 592         Int_t   type   = cl->GetType();
 593         //if (point->fIsShared){
 594         //  fNShared++;
 595         //  continue;
 596         //}
 597         //if (pointm)
 598         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 599         //if (pointp)
 600         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 601
 602         if (type<0) continue;
 603         //if (type>10) continue;
 604         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 605         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 606
 607         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 608         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 609         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 610
 611
 612         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 613         if (cl->GetMax()<5) continue;
 614         Float_t angley = point->GetAngleY();
 615         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 616
 617         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 618         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 619         /*
 620         Float_t ns = 1.;
 621         if (pointm){
 622           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 623           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 624           ns+=1.;
 625         }
 626         if (pointp){
 627           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 628           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 629           ns+=1.;
 630         }
 631         rsigmay/=ns;
 632         rsigmaz/=ns;
 633         */
 634
 635         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 636
 637         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 638         if (i>64){
 639           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 640           ampc = 1.*cl->GetMax();
 641           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 642           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 643           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 644           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 645           //Float_t dz =
 646           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 647           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 648           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 649           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 650           //ampc               *=zfactor;
 651         }
 652         else{
 653           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 654           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 655           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 656           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 657           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 658           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 659           //Float_t dz =
 660           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 661
 662           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 663           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 664           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 665           //ampc               *=zfactor;
 666
 667         }
 668         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 669         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 670         Float_t w      =  1.;
 671         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 672         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 673         if (i<64) {
 674           ampc /= 0.6;
 675           //ampc /= (1+0.0008*z);
 676         } else
 677           if (i>128){
 678             ampc /=1.5;
 679             //ampc /= (1+0.0008*z);
 680           }else{
 681             //ampc /= (1+0.0008*z);
 682           }
 683
 684         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 685           // w*= 2.;
 686
 687           continue;
 688         }
 689         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 690         amp[nc[of]]        = ampc;
 691         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 692         weight[nc[of]]     = w;
 693         nc[of]++;
 694       }
 695
 696     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 697     Float_t sumamp=0;
 698     Float_t sumamp2=0;
 699     Float_t sumw=0;
 700     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 701     meanlog = 50;
 702     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 703       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 704       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 705       //
 706       sumw    += weight[index[i]];
 707       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 708       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 709       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 710     }
 711     if (sumw<1){
 712       SetdEdx(0);
 713     }
 714     else {
 715       norm[of] /= sumw;
 716       mean[of]  = sumamp/sumw;
 717       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 718       if (sigma[of]>0.1)
 719         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 720       else
 721         sigma[of] = 1000;
 722
 723     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 724     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 725     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 726     }
 727   }
 728
 729   Float_t dedx =0;
 730   fSdEdx =0;
 731   fMAngular =0;
 732   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 733   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 734
 735
 736   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 737   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 738
 739   Int_t norm2 = 0;
 740   Int_t norm3 = 0;
 741   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 742     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 743       dedx      += mean[i] *nc[i];
 744       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 745       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 746       norm2     += nc[i];
 747       norm3     += nc[i]-2;
 748     }
 749     fDEDX[i]  = mean[i];
 750     fSDEDX[i] = sigma[i];
 751     fNCDEDX[i]= nc[i];
 752   }
 753
 754   if (norm3>0){
 755     dedx   /=norm2;
 756     fSdEdx /=norm3;
 757     fMAngular/=norm2;
 758   }
 759   else{
 760     SetdEdx(0);
 761     return 0;
 762   }
 763   //  Float_t dedx1 =dedx;
 764   /*
 765   dedx =0;
 766   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 767     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 768       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 769       dedx      += mean[i] *nc[i];
 770     }
 771     fDEDX[i]  = mean[i];
 772   }
 773   dedx /= norm2;
 774   */
 775
 776
 777   SetdEdx(dedx);
 778   return dedx;
 779 }
 780 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 781   //
 782   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 783   //
 784   Double_t bg2=bg*bg;
 785   Double_t bethe;
 786   if (bg<3.5e1)
 787     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 788   else // Density effect ( approximately :)
 789     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 790   return bethe/11.091;
 791 }
 792
 793 void AliTPCseed::CookPID()
 794 {
 795   //
 796   // cook PID information according dEdx
 797   //
 798   Double_t fRange = 10.;
 799   Double_t fRes   = 0.1;
 800   Double_t fMIP   = 47.;
 801   //
 802   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 803   Double_t sumr =0;
 804   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 805     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 806     Double_t mom=GetP();
 807     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 808     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 809     Double_t sigma=fRes*bethe;
 810     if (sigma>0.001){
 811       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 812         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 813         sumr+=fTPCr[j];
 814         continue;
 815       }
 816       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 817       sumr+=fTPCr[j];
 818     }
 819     else{
 820       fTPCr[j]=1.;
 821       sumr+=fTPCr[j];
 822     }
 823   }
 824   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 825     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 826   }
 827 }
 828
 829 /*
 830 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 831   //-----------------------------------------------------------------
 832   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 833   //-----------------------------------------------------------------
 834
 835   Float_t amp[200];
 836   Float_t angular[200];
 837   Float_t weight[200];
 838   Int_t index[200];
 839   Bool_t inlimit[200];
 840   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 841   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 842   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 843
 844
 845   //
 846   Float_t meanlog = 100.;
 847   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 848
 849   Float_t amean     =0;
 850   Float_t asigma    =0;
 851   Float_t anc       =0;
 852   Float_t anorm     =0;
 853
 854   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 855   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 856   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 857   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 858   //
 859   //
 860   fNShared =0;
 861
 862   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 863   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 864   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 865     {
 866         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 867         if (point==0) continue;
 868         if (point->fIsShared){
 869           fNShared++;
 870           continue;
 871         }
 872         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 873         if (type<0) continue;
 874         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 875         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 876         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 877         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 878         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 879         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 880
 881         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 882         if (i>64){
 883           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 884         }
 885         else{
 886           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 887         }
 888         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 889         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 890
 891         Float_t w      =  1.;
 892         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 893         if (i<64) {
 894           ampc /= 0.63;
 895         } else
 896           if (i>128){
 897             ampc /=1.51;
 898           }
 899         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 900           continue;
 901         }
 902         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 903         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 904         amp[i]        = ampc/angular[i];
 905         weight[i]     = w;
 906         anc++;
 907     }
 908
 909   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 910   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 911     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 912   }
 913
 914   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 915   meanlog =10000.;
 916   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 917     Float_t sumamp=0;
 918     Float_t sumamp2=0;
 919     Float_t sumw=0;
 920    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 921       {
 922         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 923         Float_t ampl      = amp[i];
 924         ///angular[i];
 925         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 926         //
 927         sumw    += weight[i];
 928         sumamp  += weight[i]*ampl;
 929         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 930         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 931         nc[of]++;
 932       }
 933    if (sumw<1){
 934      SetdEdx(0);
 935    }
 936    else {
 937      norm[of] /= sumw;
 938      mean[of]  = sumamp/sumw;
 939      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 940      if (sigma[of]>0.1)
 941        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 942      else
 943        sigma[of] = 1000;
 944      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 945    }
 946   }
 947
 948   Float_t dedx =0;
 949   fSdEdx =0;
 950   fMAngular =0;
 951   //
 952   Int_t norm2 = 0;
 953   Int_t norm3 = 0;
 954   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 955   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 956
 957   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 958     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 959       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 960       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 961       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 962       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 963       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 964     }
 965     fDEDX[i]  = mean[i];
 966     fSDEDX[i] = sigma[i];
 967     fNCDEDX[i]= nc[i];
 968   }
 969
 970   if (norm3>0){
 971     dedx   /=norm2;
 972     fSdEdx /=norm3;
 973     fMAngular/=norm2;
 974   }
 975   else{
 976     SetdEdx(0);
 977     return;
 978   }
 979   //  Float_t dedx1 =dedx;
 980
 981   dedx =0;
 982   Float_t norm4 = 0;
 983   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 984     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 985       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 986       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 987       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 988     }
 989     fDEDX[i]  = mean[i];
 990   }
 991   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 992
 993
 994
 995   SetdEdx(dedx);
 996
 997   //mi deDX
 998
 999 }
1000 */
1001 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1002 //-----------------------------------------------------------------
1003 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1004 //-----------------------------------------------------------------
1005   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1006     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1007     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1008     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1009     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1010     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1011 }
1012
1013 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1014 {
1015   fClusterMap[ibit] = state;
1016 }
1017 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1018 {
1019   return fClusterMap[ibit];
1020 }
1021 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1022 {
1023   fSharedMap[ibit] = state;
1024 }
1025 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1026 {
1027   return fSharedMap[ibit];
1028 }