TPC/scripts/OCDBscan/jdl/HowTo-CalibSummary.txt

   1 NOTE: for all the steps, you need a valid alien certificate (obviously ;-) )
   2 alien-token-init
   3 source /tmp/gclient_env_$USERID
   4
   5
   6 +++++++ STEP 1 +++++++++++++
   7
   8 Create a run.list file which contains the run number in which you
   9 are interested in:
  10
  11 see for example: $ALICE_ROOT/TPC/scripts/OCDBscan/makeRunList.sh
  12
  13 ####################
  14 #!/bin/sh
  15 # find a list of runs which have the following OCDB entries
  16 # GRP, HV, ALTRO
  17
  18 prefix=/alice/data/2010/OCDB/
  19
  20 alien_find $prefix/GRP/GRP/Data Run > grpAlien.txt
  21 alien_find $prefix/TPC/Calib/HighVoltage Run > hvAlien.txt
  22 alien_find $prefix/TPC/Calib/AltroConfig Run > altroAlien.txt
  23
  24 cat grpAlien.txt | sed s/_/\ /g | gawk '{ print $2}' | sort > grp.txt
  25 cat hvAlien.txt | sed s/_/\ /g | gawk '{ print $2}'  | sort > hv.txt
  26 cat altroAlien.txt | sed s/_/\ /g | gawk '{ print $2}'  | sort > altro.txt
  27
  28 for run in `cat hv.txt | sort`; do
  29    grun=`cat grp.txt | grep -c $run`
  30    arun=`cat altro.txt | grep -c $run`
  31    if [ $grun -gt 0 ] && [ $arun -gt 0 ]; then
  32       echo $run
  33    fi
  34 done > runList.txt
  35 # clean up
  36 rm grpAlien.txt hvAlien.txt altroAlien.txt grp.txt hv.txt altro.txt
  37
  38 ###################
  39
  40 +++++++ STEP 2 +++++++++++++
  41
  42 Submit the alienjobs (one job per run)
  43 but skip already existing entries ...
  44 Note1: PATHtoOUTPUT is usually defined in your jdl!
  45
  46 Note2: check your job status with e.g. `alien_ps`
  47
  48
  49 ####################
  50 #!/bin/sh
  51 # submit an alienjob per entry in the runList.txt
  52
  53 PATHtoOUTPUT="/alice/cern.ch/user/s/srossegg/CalibSummary/output/"
  54
  55 for RUN in `cat runList.txt`; do
  56 alien_find $PATHtoOUTPUT run$RUN
  57     entry=`alien_find $PATHtoOUTPUT run$RUN`
  58     if [ "$entry" = "" ]
  59        then
  60        echo "Submitting job to produce the calib summary for run $RUN"
  61        alien_submit CalibSummary.jdl $RUN
  62     else
  63        echo "The calib summary for run $RUN was already created! Skipping entry ..."
  64     fi
  65
  66 done;
  67
  68 ###################
  69
  70 +++++++ STEP 3 +++++++++++++
  71
  72 print a list of all the produced calibSummary entries and copy them to
  73 a local directory (if wished)
  74
  75 ###################
  76 #!/bin/sh
  77 # list and copy the created calibSummary files ...
  78
  79 PATHtoOUTPUT="/alice/cern.ch/user/s/srossegg/CalibSummary/output/"
  80 alien_find $PATHtoOUTPUT calibSum
  81
  82 # copy them to one direcotory
  83 ENTRIES=`alien_find $PATHtoOUTPUT calibSum | grep calibSum`
  84 COPYPATH="./"
  85 for ENTRY in $ENTRIES; do
  86     alien_cp alien:$ENTRY $COPYPATH
  87 done;
  88
  89 ##### don't do the following if you are not sure #######
  90
  91 # or delete the entries on alien
  92 ENTRIES=`alien_find $PATHtoOUTPUT calibSum | grep calibSum`
  93 for ENTRY in $ENTRIES; do
  94     alien_erase $ENTRY
  95 done;
  96
  97 ###################