EMCAL/AliEMCALClusterizer.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id$ */
  17
  18 //_________________________________________________________________________
  19 //  Base class for the clusterization algorithm (pure abstract)
  20 //*--
  21 //*-- Author: Yves Schutz  SUBATECH
  22 //
  23 //   Clusterization mother class. Contains common methods/data members of different
  24 //   clusterizers. GCB 2010
  25 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  26
  27 // --- ROOT system ---
  28 #include "TClonesArray.h"
  29 #include "TTree.h"
  30 #include <TFile.h>
  31 class TFolder;
  32 #include <TMath.h>
  33 #include <TMinuit.h>
  34 #include <TTree.h>
  35 class TSystem;
  36 #include <TBenchmark.h>
  37 #include <TBrowser.h>
  38 #include <TROOT.h>
  39
  40 // --- Standard library ---
  41 #include <cassert>
  42
  43 // --- AliRoot header files ---
  44 #include "AliEMCALClusterizer.h"
  45 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  46 #include "AliRunLoader.h"
  47 #include "AliRun.h"
  48 #include "AliLog.h"
  49 #include "AliEMCAL.h"
  50 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  51 #include "AliEMCALRecParam.h"
  52 #include "AliEMCALGeometry.h"
  53 #include "AliEMCALRecParam.h"
  54 #include "AliCDBManager.h"
  55 #include "AliCaloCalibPedestal.h"
  56 #include "AliEMCALCalibData.h"
  57 class AliCDBStorage;
  58 #include "AliCDBEntry.h"
  59
  60 ClassImp(AliEMCALClusterizer)
  61
  62 //____________________________________________________________________________
  63 AliEMCALClusterizer::AliEMCALClusterizer():
  64   fDigitsArr(NULL),
  65   fTreeR(NULL),
  66   fRecPoints(NULL),
  67   fGeom(NULL),
  68   fCalibData(NULL),
  69   fCaloPed(NULL),
  70   fADCchannelECA(0.),fADCpedestalECA(0.),
  71   fTimeMin(-1.),fTimeMax(1.),fTimeCut(1.),
  72   fDefaultInit(kFALSE),fToUnfold(kFALSE),
  73   fNumberOfECAClusters(0), fECAClusteringThreshold(0.),
  74   fECALocMaxCut(0.),fECAW0(0.),fMinECut(0.)
  75 {
  76   // ctor
  77
  78   Init();
  79
  80 }
  81
  82 //____________________________________________________________________________
  83 AliEMCALClusterizer::AliEMCALClusterizer(AliEMCALGeometry* geometry):
  84   fDigitsArr(NULL),
  85   fTreeR(NULL),
  86   fRecPoints(NULL),
  87   fGeom(geometry),
  88   fCalibData(NULL),
  89   fCaloPed(NULL),
  90   fADCchannelECA(0.),fADCpedestalECA(0.),
  91   fTimeMin(-1.),fTimeMax(1.),fTimeCut(1.),
  92   fDefaultInit(kFALSE),fToUnfold(kFALSE),
  93   fNumberOfECAClusters(0), fECAClusteringThreshold(0.),
  94   fECALocMaxCut(0.),fECAW0(0.),fMinECut(0.)
  95 {
  96   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
  97   // use this contructor to avoid usage of Init() which uses runloader
  98   // change needed by HLT - MP
  99
 100   // Note for the future: the use on runloader should be avoided or optional at least
 101   // another way is to make Init virtual and protected at least such that the deriving classes can overload
 102   // Init() ;
 103   //
 104
 105   if (!fGeom)
 106   {
 107     AliFatal("Geometry not initialized.");
 108   }
 109
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________________________________
 113 AliEMCALClusterizer::AliEMCALClusterizer(AliEMCALGeometry* geometry, AliEMCALCalibData * calib, AliCaloCalibPedestal * caloped):
 114   fDigitsArr(NULL),
 115   fTreeR(NULL),
 116   fRecPoints(NULL),
 117   fGeom(geometry),
 118   fCalibData(calib),
 119   fCaloPed(caloped),
 120   fADCchannelECA(0.),fADCpedestalECA(0.),
 121   fTimeMin(-1.),fTimeMax(1.),fTimeCut(1.),
 122   fDefaultInit(kFALSE),fToUnfold(kFALSE),
 123   fNumberOfECAClusters(0), fECAClusteringThreshold(0.),
 124   fECALocMaxCut(0.),fECAW0(0.),fMinECut(0.)
 125 {
 126         // ctor, geometry and calibration are initialized elsewhere.
 127
 128         if (!fGeom)
 129                 AliFatal("Geometry not initialized.");
 130
 131 }
 132
 133
 134 //____________________________________________________________________________
 135 AliEMCALClusterizer::~AliEMCALClusterizer()
 136 {
 137   // dtor
 138   if (fDigitsArr) {
 139     fDigitsArr->Delete();
 140     delete fDigitsArr;
 141   }
 142   if (fRecPoints) {
 143     fRecPoints->Delete();
 144     delete fRecPoints;
 145   }
 146 }
 147
 148 //____________________________________________________________________________
 149 Float_t  AliEMCALClusterizer::Calibrate(const Float_t amp, const Float_t time, const Int_t absId)
 150 {
 151
 152   // Convert digitized amplitude into energy.
 153   // Calibration parameters are taken from calibration data base for raw data,
 154   // or from digitizer parameters for simulated data.
 155   if(fCalibData){
 156
 157     if (fGeom==0)
 158       AliFatal("Did not get geometry from EMCALLoader") ;
 159
 160     Int_t iSupMod = -1;
 161     Int_t nModule = -1;
 162     Int_t nIphi   = -1;
 163     Int_t nIeta   = -1;
 164     Int_t iphi    = -1;
 165     Int_t ieta    = -1;
 166
 167     Bool_t bCell = fGeom->GetCellIndex(absId, iSupMod, nModule, nIphi, nIeta) ;
 168     if(!bCell) {
 169       fGeom->PrintGeometry();
 170       Error("Calibrate()"," Wrong cell id number : %i", absId);
 171       assert(0);
 172     }
 173
 174     fGeom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nModule,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
 175
 176     // Check if channel is bad (dead or hot), in this case return 0.
 177     // Gustavo: 15-12-09 In case of RAW data this selection is already done, but not in simulation.
 178     // for the moment keep it here but remember to do the selection at the sdigitizer level
 179     // and remove it from here
 180     Int_t channelStatus = (Int_t)(fCaloPed->GetDeadMap(iSupMod))->GetBinContent(ieta,iphi);
 181     if(channelStatus == AliCaloCalibPedestal::kHot || channelStatus == AliCaloCalibPedestal::kDead) {
 182                   AliDebug(2,Form("Tower from SM %d, ieta %d, iphi %d is BAD : status %d !!!",iSupMod,ieta,iphi, channelStatus));
 183                   return 0;
 184     }
 185     //Check if time is too large or too small, indication of a noisy channel, remove in this case
 186     if(time > fTimeMax || time < fTimeMin) return 0;
 187
 188     fADCchannelECA  = fCalibData->GetADCchannel (iSupMod,ieta,iphi);
 189     fADCpedestalECA = fCalibData->GetADCpedestal(iSupMod,ieta,iphi);
 190
 191     return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 192
 193   }
 194   else //Return energy with default parameters if calibration is not available
 195     return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 196
 197 }
 198
 199 //____________________________________________________________________________
 200 void AliEMCALClusterizer::GetCalibrationParameters()
 201 {
 202   // Set calibration parameters:
 203   // if calibration database exists, they are read from database,
 204   // otherwise, they are taken from digitizer.
 205   //
 206   // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction,
 207   // for example:
 208   // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
 209
 210   //Check if calibration is stored in data base
 211
 212   if(!fCalibData)
 213   {
 214     AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 215     AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Data");
 216     if (entry) fCalibData =  (AliEMCALCalibData*) entry->GetObject();
 217   }
 218
 219   if(!fCalibData)
 220     AliFatal("Calibration parameters not found in CDB!");
 221
 222 }
 223
 224 //____________________________________________________________________________
 225 void AliEMCALClusterizer::GetCaloCalibPedestal()
 226 {
 227         // Set calibration parameters:
 228         // if calibration database exists, they are read from database,
 229         // otherwise, they are taken from digitizer.
 230         //
 231         // It is a user responsilibity to open CDB before reconstruction,
 232         // for example:
 233         // AliCDBStorage* storage = AliCDBManager::Instance()->GetStorage("local://CalibDB");
 234
 235         //Check if calibration is stored in data base
 236
 237         if(!fCaloPed)
 238   {
 239                 AliCDBEntry *entry = (AliCDBEntry*)
 240                 AliCDBManager::Instance()->Get("EMCAL/Calib/Pedestals");
 241                 if (entry) fCaloPed =  (AliCaloCalibPedestal*) entry->GetObject();
 242   }
 243
 244         if(!fCaloPed)
 245                 AliFatal("Pedestal info not found in CDB!");
 246
 247 }
 248
 249 //____________________________________________________________________________
 250 void AliEMCALClusterizer::Init()
 251 {
 252   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 253   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 254
 255   AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
 256   if (rl->GetAliRun() && rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))
 257     fGeom = dynamic_cast<AliEMCAL*>(rl->GetAliRun()->GetDetector("EMCAL"))->GetGeometry();
 258   else
 259     fGeom =  AliEMCALGeometry::GetInstance(AliEMCALGeometry::GetDefaultGeometryName());
 260
 261   AliDebug(1,Form("geom %p",fGeom));
 262
 263   if(!gMinuit)
 264     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 265
 266 }
 267
 268 //____________________________________________________________________________
 269 void AliEMCALClusterizer::InitParameters()
 270 {
 271   // Initializes the parameters for the Clusterizer
 272   fNumberOfECAClusters = 0 ;
 273   fCalibData           = 0 ;
 274   fCaloPed             = 0 ;
 275
 276   const AliEMCALRecParam* recParam = AliEMCALReconstructor::GetRecParam();
 277   if(!recParam) {
 278     AliFatal("Reconstruction parameters for EMCAL not set!");
 279   } else {
 280     fECAClusteringThreshold = recParam->GetClusteringThreshold();
 281     fECAW0                  = recParam->GetW0();
 282     fMinECut                = recParam->GetMinECut();
 283     fToUnfold               = recParam->GetUnfold();
 284     if(fToUnfold) AliWarning("Cluster Unfolding ON. Implementing only for eta=0 case!!!");
 285     fECALocMaxCut           = recParam->GetLocMaxCut();
 286     fTimeCut                = recParam->GetTimeCut();
 287     fTimeMin                = recParam->GetTimeMin();
 288     fTimeMax                = recParam->GetTimeMax();
 289
 290     AliDebug(1,Form("Reconstruction parameters: fECAClusteringThreshold=%.3f GeV, fECAW=%.3f, fMinECut=%.3f GeV, fToUnfold=%d, fECALocMaxCut=%.3f GeV, fTimeCut=%e s,fTimeMin=%e s,fTimeMax=%e s",
 291                     fECAClusteringThreshold,fECAW0,fMinECut,fToUnfold,fECALocMaxCut,fTimeCut, fTimeMin, fTimeMax));
 292   }
 293
 294 }
 295
 296
 297 //____________________________________________________________________________
 298 void AliEMCALClusterizer::Print(Option_t * /*option*/)const
 299 {
 300   // Print clusterizer parameters
 301
 302   TString message("\n") ;
 303
 304   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 305
 306     // Print parameters
 307
 308     TString taskName(Version()) ;
 309
 310     printf("--------------- ");
 311     printf("%s",taskName.Data()) ;
 312     printf(" ");
 313     printf("Clusterizing digits: ");
 314     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut);
 315     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0);
 316     if(fToUnfold)
 317       printf("\nUnfolding on\n");
 318     else
 319       printf("\nUnfolding off\n");
 320
 321     printf("------------------------------------------------------------------");
 322   }
 323   else
 324     printf("AliEMCALClusterizer not initialized ") ;
 325 }
 326
 327 //____________________________________________________________________________
 328 void AliEMCALClusterizer::PrintRecPoints(Option_t * option)
 329 {
 330   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
 331   if(strstr(option,"deb")) {
 332     printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ;
 333
 334     printf("           Found %d ECA Rec Points\n ",
 335            fRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 336   }
 337
 338   if(strstr(option,"all")) {
 339     if(strstr(option,"deb")) {
 340       printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
 341       printf("Clusters in ECAL section\n") ;
 342       printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     GX    GY   GZ  lX    lY   lZ   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;
 343     }
 344     Int_t index;
 345     for (index =  0 ; index < fRecPoints->GetEntries() ; index++) {
 346       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(fRecPoints->At(index)) ;
 347       TVector3  globalpos;
 348       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
 349       TVector3  localpos;
 350       rp->GetLocalPosition(localpos);
 351       Float_t lambda[2];
 352       rp->GetElipsAxis(lambda);
 353
 354       Int_t nprimaries=0;
 355       Int_t * primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
 356
 357       if(strstr(option,"deb"))
 358         printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
 359                rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
 360                globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(),
 361                rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
 362       if(strstr(option,"deb")){
 363         for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
 364           printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
 365         }
 366       }
 367     }
 368
 369     if(strstr(option,"deb"))
 370       printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
 371   }
 372 }
 373
 374 //___________________________________________________________________
 375 void  AliEMCALClusterizer::PrintRecoInfo()
 376 {
 377   //print reco version
 378   printf(" AliEMCALClusterizer::PrintRecoInfo() : version %s \n", Version() );
 379
 380 }
 381
 382 //____________________________________________________________________________
 383 void AliEMCALClusterizer::SetInput(TTree *digitsTree)
 384 {
 385   // Read the digits from the input tree
 386   TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("EMCAL");
 387   if (!branch) {
 388     AliError("can't get the branch with the EMCAL digits !");
 389     return;
 390   }
 391   if (!fDigitsArr)
 392     fDigitsArr = new TClonesArray("AliEMCALDigit",100);
 393   branch->SetAddress(&fDigitsArr);
 394   branch->GetEntry(0);
 395 }
 396
 397 //____________________________________________________________________________
 398 void AliEMCALClusterizer::SetOutput(TTree *clustersTree)
 399 {
 400   // Read the digits from the input tree
 401   fTreeR = clustersTree;
 402
 403   AliDebug(9, "Making array for EMCAL clusters");
 404   fRecPoints = new TObjArray(100) ;
 405   Int_t split = 0;
 406   Int_t bufsize = 32000;
 407   fTreeR->Branch("EMCALECARP", "TObjArray", &fRecPoints, bufsize, split);
 408 }
 409
 410
 411