EMCAL/AliEMCALClusterizerv1.cxx

   1
   2 /**************************************************************************
   3  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   4  *                                                                        *
   5  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   6  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   7  *                                                                        *
   8  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   9  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
  10  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  11  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  12  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  13  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  14  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  15  **************************************************************************/
  16
  17 /* $Id$ */
  18
  19 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
  20 //  August 2002 Yves Schutz: clone PHOS as closely as possible and intoduction
  21 //                           of new  IO (à la PHOS)
  22 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  23 //  Clusterization class. Performs clusterization (collects neighbouring active cells) and
  24 //  unfolds the clusters having several local maxima.
  25 //  Results are stored in TreeR#, branches EMCALTowerRP (EMC recPoints),
  26 //  EMCALPreShoRP (CPV RecPoints) and AliEMCALClusterizer (Clusterizer with all
  27 //  parameters including input digits branch title, thresholds etc.)
  28 //  This TTask is normally called from Reconstructioner, but can as well be used in
  29 //  standalone mode.
  30 // Use Case:
  31 //  root [0] AliEMCALClusterizerv1 * cl = new AliEMCALClusterizerv1("galice.root")
  32 //  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
  33 //               //reads gAlice from header file "..."
  34 //  root [1] cl->ExecuteTask()
  35 //               //finds RecPoints in all events stored in galice.root
  36 //  root [2] cl->SetDigitsBranch("digits2")
  37 //               //sets another title for Digitis (input) branch
  38 //  root [3] cl->SetRecPointsBranch("recp2")
  39 //               //sets another title four output branches
  40 //  root [4] cl->SetTowerLocalMaxCut(0.03)
  41 //               //set clusterization parameters
  42 //  root [5] cl->ExecuteTask("deb all time")
  43 //               //once more finds RecPoints options are
  44 //               // deb - print number of found rec points
  45 //               // deb all - print number of found RecPoints and some their characteristics
  46 //               // time - print benchmarking results
  47
  48 // --- ROOT system ---
  49
  50 #include "TROOT.h"
  51 #include "TFile.h"
  52 #include "TFolder.h"
  53 #include "TMath.h"
  54 #include "TMinuit.h"
  55 #include "TTree.h"
  56 #include "TSystem.h"
  57 #include "TBenchmark.h"
  58
  59 // --- Standard library ---
  60
  61
  62 // --- AliRoot header files ---
  63 #include "AliEMCALGetter.h"
  64 #include "AliEMCALClusterizerv1.h"
  65 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  66 #include "AliEMCALDigit.h"
  67 #include "AliEMCALDigitizer.h"
  68 #include "AliEMCAL.h"
  69 #include "AliEMCALGeometry.h"
  70
  71 ClassImp(AliEMCALClusterizerv1)
  72
  73 Int_t addOn[20][60][60];
  74
  75 //____________________________________________________________________________
  76   AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1() : AliEMCALClusterizer()
  77 {
  78   // default ctor (to be used mainly by Streamer)
  79
  80   InitParameters() ;
  81   fDefaultInit = kTRUE ;
  82   cout<<"file to read 1"<<endl;
  83   ReadFile();
  84   cout<<"file read 1"<<endl;
  85 }
  86
  87 //____________________________________________________________________________
  88 AliEMCALClusterizerv1::AliEMCALClusterizerv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName)
  89 :AliEMCALClusterizer(alirunFileName, eventFolderName)
  90 {
  91   // ctor with the indication of the file where header Tree and digits Tree are stored
  92
  93   InitParameters() ;
  94   Init() ;
  95   fDefaultInit = kFALSE ;
  96   for(Int_t is=0;is<20;is++){
  97   for(Int_t i=0;i<60;i++){
  98    for(Int_t j=0;j<60;j++){
  99            addOn[is][i][j]=0;
 100    }
 101    }
 102  }
 103   cout<<"file to read 2"<<endl;
 104   ReadFile();
 105   cout<<"file read 2"<<endl;
 106
 107 }
 108
 109 //____________________________________________________________________________
 110   AliEMCALClusterizerv1::~AliEMCALClusterizerv1()
 111 {
 112   // dtor
 113
 114 }
 115
 116 //____________________________________________________________________________
 117 const TString AliEMCALClusterizerv1::BranchName() const
 118 {
 119    return GetName();
 120
 121 }
 122
 123 //____________________________________________________________________________
 124 Float_t  AliEMCALClusterizerv1::Calibrate(Int_t amp) const
 125 {
 126   //To be replased later by the method, reading individual parameters from the database
 127   return -fADCpedestalECA + amp * fADCchannelECA ;
 128 }
 129
 130 //____________________________________________________________________________
 131 void AliEMCALClusterizerv1::Exec(Option_t * option)
 132 {
 133   // Steering method to perform clusterization for events
 134   // in the range from fFirstEvent to fLastEvent.
 135   // This range is optionally set by SetEventRange().
 136   // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
 137
 138   if(strstr(option,"tim"))
 139     gBenchmark->Start("EMCALClusterizer");
 140
 141   if(strstr(option,"print"))
 142     Print("") ;
 143
 144   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 145
 146   if (fLastEvent == -1)
 147     //fLastEvent = gime->MaxEvent() - 1;
 148     fLastEvent = 1000 - 1;
 149   Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
 150
 151   Int_t ievent ;
 152   for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
 153     gime->Event(ievent,"D") ;
 154     GetCalibrationParameters() ;
 155
 156     fNumberOfECAClusters = 0;
 157
 158     MakeClusters() ;
 159
 160     if(fToUnfold)
 161       MakeUnfolding() ;
 162
 163     WriteRecPoints() ;
 164
 165     if(strstr(option,"deb"))
 166       PrintRecPoints(option) ;
 167
 168     //increment the total number of recpoints per run
 169     fRecPointsInRun += gime->ECARecPoints()->GetEntriesFast() ;
 170   }
 171
 172   Unload();
 173
 174   if(strstr(option,"tim")){
 175     gBenchmark->Stop("EMCALClusterizer");
 176     printf("Exec took %f seconds for Clusterizing %f seconds per event",
 177          gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer"), gBenchmark->GetCpuTime("EMCALClusterizer")/nEvents ) ;
 178   }
 179
 180   SaveHists();
 181
 182 }
 183
 184 //____________________________________________________________________________
 185 Bool_t AliEMCALClusterizerv1::FindFit(AliEMCALRecPoint * emcRP, AliEMCALDigit ** maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
 186                                     Int_t nPar, Float_t * fitparameters) const
 187 {
 188   // Calls TMinuit to fit the energy distribution of a cluster with several maxima
 189   // The initial values for fitting procedure are set equal to the positions of local maxima.
 190   // Cluster will be fitted as a superposition of nPar/3 electromagnetic showers
 191
 192   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 193   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 194
 195   gMinuit->mncler();                     // Reset Minuit's list of paramters
 196   gMinuit->SetPrintLevel(-1) ;           // No Printout
 197   gMinuit->SetFCN(AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare) ;
 198                                          // To set the address of the minimization function
 199   TList * toMinuit = new TList();
 200   toMinuit->AddAt(emcRP,0) ;
 201   toMinuit->AddAt(digits,1) ;
 202
 203   gMinuit->SetObjectFit(toMinuit) ;         // To tranfer pointer to UnfoldingChiSquare
 204
 205   // filling initial values for fit parameters
 206   AliEMCALDigit * digit ;
 207
 208   Int_t ierflg  = 0;
 209   Int_t index   = 0 ;
 210   Int_t nDigits = (Int_t) nPar / 3 ;
 211
 212   Int_t iDigit ;
 213
 214   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 215
 216   for(iDigit = 0; iDigit < nDigits; iDigit++){
 217     digit = maxAt[iDigit];
 218
 219     Int_t relid[2] ;
 220     Float_t x = 0.;
 221     Float_t z = 0.;
 222     geom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
 223     geom->PosInAlice(relid, x, z) ;
 224
 225     Float_t energy = maxAtEnergy[iDigit] ;
 226
 227     gMinuit->mnparm(index, "x",  x, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 228     index++ ;
 229     if(ierflg != 0){
 230       Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : x = %f",  x ) ;
 231       return kFALSE;
 232     }
 233     gMinuit->mnparm(index, "z",  z, 0.1, 0, 0, ierflg) ;
 234     index++ ;
 235     if(ierflg != 0){
 236        Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : z = %f", z) ;
 237       return kFALSE;
 238     }
 239     gMinuit->mnparm(index, "Energy",  energy , 0.05*energy, 0., 4.*energy, ierflg) ;
 240     index++ ;
 241     if(ierflg != 0){
 242      Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Unable to set initial value for fit procedure : energy = %f", energy) ;
 243       return kFALSE;
 244     }
 245   }
 246
 247   Double_t p0 = 0.1 ; // "Tolerance" Evaluation stops when EDM = 0.0001*p0 ; The number of function call slightly
 248                       //  depends on it.
 249   Double_t p1 = 1.0 ;
 250   Double_t p2 = 0.0 ;
 251
 252   gMinuit->mnexcm("SET STR", &p2, 0, ierflg) ;   // force TMinuit to reduce function calls
 253   gMinuit->mnexcm("SET GRA", &p1, 1, ierflg) ;   // force TMinuit to use my gradient
 254   gMinuit->SetMaxIterations(5);
 255   gMinuit->mnexcm("SET NOW", &p2 , 0, ierflg) ;  // No Warnings
 256
 257   gMinuit->mnexcm("MIGRAD", &p0, 0, ierflg) ;    // minimize
 258
 259   if(ierflg == 4){  // Minimum not found
 260     Error("FindFit", "EMCAL Unfolding  Fit not converged, cluster abandoned " ) ;
 261     return kFALSE ;
 262   }
 263   for(index = 0; index < nPar; index++){
 264     Double_t err ;
 265     Double_t val ;
 266     gMinuit->GetParameter(index, val, err) ;    // Returns value and error of parameter index
 267     fitparameters[index] = val ;
 268    }
 269
 270   delete toMinuit ;
 271   return kTRUE;
 272
 273 }
 274
 275 //____________________________________________________________________________
 276 void AliEMCALClusterizerv1::GetCalibrationParameters()
 277 {
 278   // Gets the parameters for the calibration from the digitizer
 279   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 280
 281   if ( !gime->Digitizer() )
 282     gime->LoadDigitizer();
 283   AliEMCALDigitizer * dig = gime->Digitizer();
 284
 285   fADCchannelECA   = dig->GetECAchannel() ;
 286   fADCpedestalECA  = dig->GetECApedestal();
 287   cout<<"ChannelECA, peds "<<fADCchannelECA<<" "<<fADCpedestalECA<<endl;
 288 }
 289
 290 //____________________________________________________________________________
 291 void AliEMCALClusterizerv1::Init()
 292 {
 293   // Make all memory allocations which can not be done in default constructor.
 294   // Attach the Clusterizer task to the list of EMCAL tasks
 295
 296   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance();
 297   if(!gime)
 298     gime = AliEMCALGetter::Instance(GetTitle(), fEventFolderName.Data());
 299
 300   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 301   cout<<"gime,geom "<<gime<<" "<<geom<<endl;
 302
 303 //Sub  fNTowers = geom->GetNZ() *  geom->GetNPhi() ;
 304   fNTowers =400;
 305   if(!gMinuit)
 306     gMinuit = new TMinuit(100) ;
 307  //Sub if ( !gime->Clusterizer() )
 308  //Sub   gime->PostClusterizer(this);
 309  BookHists();
 310   cout<<"hists booked "<<endl;
 311 }
 312
 313 //____________________________________________________________________________
 314 void AliEMCALClusterizerv1::InitParameters()
 315 {
 316   // Initializes the parameters for the Clusterizer
 317   fNumberOfECAClusters = 0;
 318
 319   fECAClusteringThreshold   = 0.5;  // value obtained from Alexei
 320   fECALocMaxCut = 0.03;
 321
 322   fECAW0     = 4.5 ;
 323   fTimeGate = 1.e-8 ;
 324   fToUnfold = kFALSE ;
 325   fRecPointsInRun  = 0 ;
 326   fMinECut = 0.3;
 327 }
 328
 329 //____________________________________________________________________________
 330 Int_t AliEMCALClusterizerv1::AreNeighbours(AliEMCALDigit * d1, AliEMCALDigit * d2)const
 331 {
 332   // Gives the neighbourness of two digits = 0 are not neighbour but continue searching
 333   //                                       = 1 are neighbour
 334   //                                       = 2 are not neighbour but do not continue searching
 335   // neighbours are defined as digits having at least a common vertex
 336   // The order of d1 and d2 is important: first (d1) should be a digit already in a cluster
 337   //                                      which is compared to a digit (d2)  not yet in a cluster
 338
 339    AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGetter::Instance()->EMCALGeometry() ;
 340
 341   Int_t rv = 0 ;
 342
 343   Int_t relid1[2] ;
 344  //Sub geom->AbsToRelNumbering(d1->GetId(), relid1) ;
 345     Int_t nSupMod=0;
 346     Int_t nTower=0;
 347     Int_t nIphi=0;
 348     Int_t nIeta=0;
 349     Int_t iphi=0;
 350     Int_t ieta=0;
 351    geom->GetCellIndex(d1->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 352    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 353    relid1[0]=ieta;
 354    relid1[1]=iphi;
 355
 356
 357     Int_t nSupMod1=0;
 358     Int_t nTower1=0;
 359     Int_t nIphi1=0;
 360     Int_t nIeta1=0;
 361     Int_t iphi1=0;
 362     Int_t ieta1=0;
 363    geom->GetCellIndex(d2->GetId(), nSupMod1,nTower1,nIphi1,nIeta1);
 364    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nTower1,nIphi1,nIeta1, iphi1,ieta1);
 365    Int_t relid2[2] ;
 366    relid2[0]=ieta1;
 367    relid2[1]=iphi1;
 368
 369   //Sub  geom->AbsToRelNumbering(d2->GetId(), relid2) ;
 370
 371
 372   Int_t rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;
 373   Int_t coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;
 374
 375   if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 )){
 376       rv = 1 ;
 377   }
 378   else {
 379     if((relid2[0] > relid1[0]) && (relid2[1] > relid1[1]+1))
 380       rv = 2; //  Difference in row numbers is too large to look further
 381   }
 382
 383   if (gDebug == 2 )
 384 if(rv==1)printf("AreNeighbours: neighbours=%d, id1=%d, relid1=%d,%d \n id2=%d, relid2=%d,%d \n",
 385          rv, d1->GetId(), relid1[0], relid1[1],
 386          d2->GetId(), relid2[0], relid2[1]) ;
 387
 388   return rv ;
 389 }
 390
 391 //____________________________________________________________________________
 392 void AliEMCALClusterizerv1::Unload()
 393 {
 394   // Unloads the Digits and RecPoints
 395   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 396   gime->EmcalLoader()->UnloadDigits() ;
 397   gime->EmcalLoader()->UnloadRecPoints() ;
 398 }
 399
 400 //____________________________________________________________________________
 401 void AliEMCALClusterizerv1::WriteRecPoints()
 402 {
 403
 404   // Creates new branches with given title
 405   // fills and writes into TreeR.
 406
 407   AliEMCALGetter *gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 408
 409   TObjArray * aECARecPoints = gime->ECARecPoints() ;
 410
 411   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 412   TTree * treeR = gime->TreeR(); ;
 413
 414   Int_t index ;
 415
 416   //Evaluate position, dispersion and other RecPoint properties for EC section
 417   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
 418     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->EvalAll(fECAW0,digits) ;
 419
 420   aECARecPoints->Sort() ;
 421
 422   for(index = 0; index < aECARecPoints->GetEntries(); index++)
 423     (dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(index)))->SetIndexInList(index) ;
 424
 425   aECARecPoints->Expand(aECARecPoints->GetEntriesFast()) ;
 426
 427   Int_t bufferSize = 32000 ;
 428   Int_t splitlevel = 0 ;
 429
 430   //EC section branch
 431   TBranch * branchECA = treeR->Branch("EMCALECARP","TObjArray",&aECARecPoints,bufferSize,splitlevel);
 432   branchECA->SetTitle(BranchName());
 433
 434   branchECA->Fill() ;
 435
 436 //Sub  gime->WriteRecPoints("OVERWRITE");
 437 //Sub  gime->WriteClusterizer("OVERWRITE");
 438 }
 439
 440 //____________________________________________________________________________
 441 void AliEMCALClusterizerv1::MakeClusters()
 442 {
 443   // Steering method to construct the clusters stored in a list of Reconstructed Points
 444   // A cluster is defined as a list of neighbour digits
 445
 446   AliEMCALGetter * gime = AliEMCALGetter::Instance() ;
 447
 448   AliEMCALGeometry * geom = gime->EMCALGeometry() ;
 449
 450   TObjArray * aECARecPoints  = gime->ECARecPoints() ;
 451
 452   aECARecPoints->Delete() ;
 453
 454   TClonesArray * digits = gime->Digits() ;
 455   TClonesArray * digitsC =  dynamic_cast<TClonesArray*>(digits->Clone()) ;
 456
 457   // Clusterization starts
 458   TIter nextdigit(digitsC) ;
 459   AliEMCALDigit * digit;
 460
 461 //just for hist
 462 /*
 463   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
 464           digitAmp->Fill(digit->GetAmp());
 465   }
 466   */
 467 ///////////
 468
 469   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(nextdigit())) ) { // scan over the list of digitsC
 470     AliEMCALRecPoint * clu = 0 ;
 471
 472     TArrayI clusterECAdigitslist(50000);
 473
 474 //Sub    if (gDebug == 2) {
 475    //  printf("MakeClusters: id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()),
 476 //         fECAClusteringThreshold) ;
 477 //    }
 478 ////////////////////////temp solution, embedding///////////////////
 479    int nSupMod=0, nTower=0, nIphi=0, nIeta=0;
 480    int iphi=0, ieta=0;
 481           geom->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 482           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 483
 484          ///////////////////////////////////
 485
 486 //cout<<ieta<<" "<<iphi<<endl;
 487
 488 //    if ( geom->IsInECA(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 489     if (geom->CheckAbsCellId(digit->GetId()) && (Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) > fECAClusteringThreshold  ) ){
 490 if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"11 digit, add "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 491 //          cout<<"crossed the threshold "<<endl;
 492       Int_t iDigitInECACluster = 0;
 493       // start a new Tower RecPoint
 494       if(fNumberOfECAClusters >= aECARecPoints->GetSize())
 495           aECARecPoints->Expand(2*fNumberOfECAClusters+1) ;
 496       AliEMCALRecPoint * rp = new  AliEMCALRecPoint("") ;
 497       aECARecPoints->AddAt(rp, fNumberOfECAClusters) ;
 498       clu = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(aECARecPoints->At(fNumberOfECAClusters)) ;
 499       fNumberOfECAClusters++ ;
 500       clu->AddDigit(*digit, Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1])) ;
 501       clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digit->GetIndexInList() ;
 502       iDigitInECACluster++ ;
 503 //    cout<<" 1st setp:cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 504       digitsC->Remove(digit) ;
 505       if (gDebug == 2 )
 506         printf("MakeClusters: OK id = %d, ene = %f , thre = %f \n", digit->GetId(),Calibrate(digit->GetAmp()), fECAClusteringThreshold) ;
 507       nextdigit.Reset() ;
 508
 509       AliEMCALDigit * digitN ;
 510       Int_t index = 0 ;
 511
 512       // Find the neighbours
 513       while (index < iDigitInECACluster){ // scan over digits already in cluster
 514         digit =  (AliEMCALDigit*)digits->At(clusterECAdigitslist[index])  ;
 515         index++ ;
 516         while ( (digitN = (AliEMCALDigit *)nextdigit())) { // scan over the reduced list of digits
 517 //      cout<<"we have new digit "<<endl;
 518           // check that the digit is above the min E Cut
 519          ////////////////////
 520           geom->GetCellIndex(digitN->GetId(), nSupMod,nTower,nIphi,nIeta);
 521           geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nTower,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
 522           ////////////////
 523           if(Calibrate(digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  )  digitsC->Remove(digitN);
 524 //      cout<<" new digit above ECut "<<endl;
 525           Int_t ineb = AreNeighbours(digit, digitN);       // call (digit,digitN) in THAT oder !!!!!
 526 //      cout<<" new digit neighbour?? "<<ineb<<endl;
 527          switch (ineb ) {
 528           case 0 :   // not a neighbour
 529             break ;
 530           case 1 :   // are neighbours
 531 if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"22 digit, add "<<nSupMod<<" "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 532             clu->AddDigit(*digitN, Calibrate( digitN->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) ) ;
 533             clusterECAdigitslist[iDigitInECACluster] = digitN->GetIndexInList() ;
 534             iDigitInECACluster++ ;
 535 //    cout<<"when neighbour: cluno, digNo "<<digit->GetId()<<" "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 536             digitsC->Remove(digitN) ;
 537 //          break ;
 538 //          case 2 :   // too far from each other
 539 //Subh      goto endofloop1;
 540 //          cout<<"earlier go to end of loop"<<endl;
 541           } // switch
 542     //cout<<"in nextDigit loop "<<fNumberOfECAClusters<<" "<<iDigitInECACluster<<endl;
 543         } // while digitN
 544
 545 //Sub      endofloop1: ;
 546         nextdigit.Reset() ;
 547       } // loop over ECA cluster
 548     } // energy threshold
 549     else if(Calibrate(digit->GetAmp()+addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]) < fMinECut  ){
 550 if(addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]>0)cout<<"33 digit, add  "<<ieta<<" "<<iphi<<" "<<addOn[nSupMod-1][ieta-1][iphi-1]<<" "<<digit->GetAmp()<<endl;
 551       digitsC->Remove(digit);
 552     }
 553     //cout<<"after endofloop: cluno, digNo "<<fNumberOfECAClusters<<endl;
 554   } // while digit
 555   delete digitsC ;
 556 cout<<"total no of clusters "<<fNumberOfECAClusters<<"from "<<digits->GetEntriesFast()<<" digits"<<endl;
 557 }
 558
 559 //____________________________________________________________________________
 560 void AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding() const
 561 {
 562   Fatal("AliEMCALClusterizerv1::MakeUnfolding", "--> Unfolding not implemented") ;
 563
 564 }
 565
 566 //____________________________________________________________________________
 567 Double_t  AliEMCALClusterizerv1::ShowerShape(Double_t r)
 568 {
 569   // Shape of the shower (see EMCAL TDR)
 570   // If you change this function, change also the gradient evaluation in ChiSquare()
 571
 572   Double_t r4    = r*r*r*r ;
 573   Double_t r295  = TMath::Power(r, 2.95) ;
 574   Double_t shape = TMath::Exp( -r4 * (1. / (2.32 + 0.26 * r4) + 0.0316 / (1 + 0.0652 * r295) ) ) ;
 575   return shape ;
 576 }
 577
 578 //____________________________________________________________________________
 579 void  AliEMCALClusterizerv1::UnfoldCluster(AliEMCALRecPoint * /*iniTower*/,
 580                                            Int_t /*nMax*/,
 581                                            AliEMCALDigit ** /*maxAt*/,
 582                                            Float_t * /*maxAtEnergy*/) const
 583 {
 584   // Performs the unfolding of a cluster with nMax overlapping showers
 585
 586   Fatal("UnfoldCluster", "--> Unfolding not implemented") ;
 587
 588 }
 589
 590 //_____________________________________________________________________________
 591 void AliEMCALClusterizerv1::UnfoldingChiSquare(Int_t & /*nPar*/, Double_t * /*Grad*/,
 592                                                Double_t & /*fret*/,
 593                                                Double_t * /*x*/, Int_t /*iflag*/)
 594 {
 595   // Calculates the Chi square for the cluster unfolding minimization
 596   // Number of parameters, Gradient, Chi squared, parameters, what to do
 597
 598   ::Fatal("UnfoldingChiSquare","Unfolding not implemented") ;
 599 }
 600 //____________________________________________________________________________
 601 void AliEMCALClusterizerv1::Print(Option_t * /*option*/)const
 602 {
 603   // Print clusterizer parameters
 604
 605   TString message("\n") ;
 606
 607   if( strcmp(GetName(), "") !=0 ){
 608
 609     // Print parameters
 610
 611     TString taskName(GetName()) ;
 612     taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
 613
 614     printf("--------------- ");
 615     printf(taskName.Data()) ;
 616     printf(" ");
 617     printf(GetTitle()) ;
 618     printf("-----------\n");
 619     printf("Clusterizing digits from the file: ");
 620     printf(taskName.Data());
 621     printf("\n                           Branch: ");
 622     printf(GetName());
 623     printf("\n                       ECA Local Maximum cut    = %f", fECALocMaxCut);
 624     printf("\n                       ECA Logarithmic weight   = %f", fECAW0);
 625     if(fToUnfold)
 626       printf("\nUnfolding on\n");
 627     else
 628       printf("\nUnfolding off\n");
 629
 630     printf("------------------------------------------------------------------");
 631   }
 632   else
 633     printf("AliEMCALClusterizerv1 not initialized ") ;
 634 }
 635
 636 //____________________________________________________________________________
 637 void AliEMCALClusterizerv1::PrintRecPoints(Option_t * option)
 638 {
 639   // Prints list of RecPoints produced at the current pass of AliEMCALClusterizer
 640
 641   TObjArray * aECARecPoints = AliEMCALGetter::Instance()->ECARecPoints() ;
 642   printf("PrintRecPoints: Clusterization result:") ;
 643
 644   printf("event # %d\n", gAlice->GetEvNumber() ) ;
 645   printf("           Found %d ECA Rec Points\n ",
 646          aECARecPoints->GetEntriesFast()) ;
 647
 648   fRecPointsInRun +=  aECARecPoints->GetEntriesFast() ;
 649
 650   if(strstr(option,"all")) {
 651     Int_t index =0;
 652     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n") ;
 653     printf("Clusters in ECAL section\n") ;
 654     printf("Index    Ene(GeV) Multi Module     phi     r   theta    X    Y      Z   Dispersion Lambda 1   Lambda 2  # of prim  Primaries list\n") ;
 655    Float_t maxE=0;
 656    Float_t maxL1=0;
 657    Float_t maxL2=0;
 658    Float_t maxDis=0;
 659
 660     for (index = 0 ; index < aECARecPoints->GetEntries() ; index++) {
 661       AliEMCALRecPoint * rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint * >(aECARecPoints->At(index)) ;
 662       TVector3  globalpos;
 663       //rp->GetGlobalPosition(globalpos);
 664       TVector3  localpos;
 665       rp->GetLocalPosition(localpos);
 666       Float_t lambda[2];
 667       rp->GetElipsAxis(lambda);
 668       Int_t * primaries;
 669       Int_t nprimaries;
 670       primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
 671       printf("\n%6d  %8.4f  %3d     %4.1f    %4.1f %4.1f  %4.1f %4.1f %4.1f    %4.1f   %4f  %4f    %2d     : ",
 672              rp->GetIndexInList(), rp->GetEnergy(), rp->GetMultiplicity(),
 673              globalpos.X(), globalpos.Y(), globalpos.Z(), localpos.X(), localpos.Y(), localpos.Z(),
 674              rp->GetDispersion(), lambda[0], lambda[1], nprimaries) ;
 675   /////////////
 676       if(rp->GetEnergy()>maxE){
 677               maxE=rp->GetEnergy();
 678               maxL1=lambda[0];
 679               maxL2=lambda[1];
 680               maxDis=rp->GetDispersion();
 681       }
 682       pointE->Fill(rp->GetEnergy());
 683       pointL1->Fill(lambda[0]);
 684       pointL2->Fill(lambda[1]);
 685       pointDis->Fill(rp->GetDispersion());
 686       pointMult->Fill(rp->GetMultiplicity());
 687       /////////////
 688       for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++) {
 689         printf("%d ", primaries[iprimary] ) ;
 690       }
 691     }
 692
 693       MaxE->Fill(maxE);
 694       MaxL1->Fill(maxL1);
 695       MaxL2->Fill(maxL2);
 696       MaxDis->Fill(maxDis);
 697
 698
 699     printf("\n-----------------------------------------------------------------------\n");
 700   }
 701 }
 702   void AliEMCALClusterizerv1::BookHists()
 703 {
 704         pointE = new TH1F("pointE","point energy", 2000, 0.0, 150.);
 705         pointL1 = new TH1F("pointL1","point L1", 1000, 0.0, 3.);
 706         pointL2 = new TH1F("pointL2","point L2", 1000, 0.0, 3.);
 707         pointDis = new TH1F("pointDis","point Dis", 1000, 0.0, 3.);
 708         pointMult = new TH1F("pointMult","point Mult", 100, 0.0, 100.);
 709         digitAmp = new TH1F("digitAmp","Digit Amplitude", 2000, 0.0, 5000.);
 710         MaxE = new TH1F("maxE","Max point energy", 2000, 0.0, 150.);
 711         MaxL1 = new TH1F("maxL1","Max point L1", 1000, 0.0, 3.);
 712         MaxL2 = new TH1F("maxL2","Max point L2", 1000, 0.0, 3.);
 713         MaxDis = new TH1F("maxDis","Max point Dis", 1000, 0.0, 3.);
 714 }
 715 void AliEMCALClusterizerv1::SaveHists()
 716 {
 717  recofile=new TFile("reco.root","RECREATE");
 718         pointE->Write();
 719         pointL1->Write();
 720         pointL2->Write();
 721         pointDis->Write();
 722         pointMult->Write();
 723         digitAmp->Write();
 724       MaxE->Write();
 725       MaxL1->Write();
 726       MaxL2->Write();
 727       MaxDis->Write();
 728 recofile->Close();
 729 }
 730
 731 void AliEMCALClusterizerv1::ReadFile()
 732 {
 733   return; // 3-jan-05
 734         FILE *fp = fopen("hijing1.dat","r");
 735         for(Int_t line=0;line<9113;line++){
 736          Int_t eg,l1,l2,sm;
 737          Int_t ncols0;
 738          ncols0 = fscanf(fp,"%d %d %d %d",&sm,&l1,&l2,&eg);
 739         // cout<<eg<<" "<<l1<<" "<<l2<<endl;
 740          addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=eg;
 741          //addOn[sm-1][l1-1][l2-1]=0;
 742         }
 743 }
 744