EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
  22 The idea:average counts for all the towers should be flat
  23 Change all existing histograms as experts
  24
  25 Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
  26 Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
  27 Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system
  28
  29 */
  30
  31 // --- ROOT system ---
  32 #include <TClonesArray.h>
  33 #include <TFile.h>
  34 #include <TH1F.h>
  35 #include <TH1I.h>
  36 #include <TH2F.h>
  37 #include <TLine.h>
  38 #include <TText.h>
  39 #include <TProfile.h>
  40 #include <TProfile2D.h>
  41 #include <TStyle.h>
  42 // --- Standard library ---
  43
  44
  45 // --- AliRoot header files ---
  46 #include "AliDAQ.h"
  47 #include "AliESDCaloCluster.h"
  48 #include "AliESDCaloCells.h"
  49 #include "AliESDEvent.h"
  50 #include "AliLog.h"
  51 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  52 #include "AliQAChecker.h"
  53 #include "AliEMCALDigit.h"
  54 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  55 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  56 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  57 #include "AliEMCALRecParam.h"
  58 #include "AliRawReader.h"
  59 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  60 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  61 #include "AliRawEventHeaderBase.h"
  62 #include "AliQAManager.h"
  63 #include "AliCDBEntry.h"
  64
  65 #include "AliCaloBunchInfo.h"
  66 #include "AliCaloFitResults.h"
  67 #include "AliCaloRawAnalyzer.h"
  68 #include "AliCaloRawAnalyzerFactory.h"
  69
  70 #include "AliEMCALGeometry.h"
  71 #include "AliEMCALTriggerSTURawStream.h"
  72
  73
  74 using namespace std;
  75
  76 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  77
  78 //____________________________________________________________________________
  79 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(Int_t fitAlgo) :
  80   AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  81   fFittingAlgorithm(0),
  82   fRawAnalyzer(0),
  83   fRawAnalyzerTRU(0),
  84   fGeom(0),
  85   fSuperModules(20), // number of SuperModules; updated to 20 for EMCal + DCal
  86   fFirstPedestalSample(0),
  87   fLastPedestalSample(3),
  88   fFirstPedestalSampleTRU(0),
  89   fLastPedestalSampleTRU(3),
  90   fMinSignalLG(0),
  91   fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  92   fMinSignalHG(0),
  93   fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  94   fMinSignalTRU(0),
  95   fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  96   fMinSignalLGLEDMon(0),
  97   fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
  98   fMinSignalHGLEDMon(0),
  99   fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
 100   fCalibRefHistoPro(NULL),
 101   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 102   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 103   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 104 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 105 //  fLineCol(NULL),
 106 //  fLineRow(NULL)
 107
 108 {
 109   // ctor
 110   SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
 111
 112   fGeom = new AliEMCALGeometry("EMCAL_COMPLETE12SMV1_DCAL_8SM", "EMCAL");
 113 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 114 //    fTextSM[sm] = NULL ;
 115 //  }
 116 }
 117
 118 //____________________________________________________________________________
 119 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
 120   AliQADataMakerRec(),
 121   fFittingAlgorithm(0),
 122   fRawAnalyzer(0),
 123   fRawAnalyzerTRU(0),
 124         fGeom(0),
 125   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()),
 126   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()),
 127   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),
 128   fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()),
 129   fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),
 130   fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
 131   fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
 132   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
 133   fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
 134   fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
 135   fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
 136   fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
 137   fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
 138   fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
 139   fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
 140   fCalibRefHistoPro(NULL),
 141   fCalibRefHistoH2F(NULL),
 142   fLEDMonRefHistoPro(NULL),
 143   fHighEmcHistoH2F(NULL)
 144 //  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
 145 //  fLineCol(NULL),
 146 //  fLineRow(NULL)
 147 {
 148   //copy ctor
 149   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
 150   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
 151   SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
 152
 153 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 154 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 155 //  }
 156 }
 157
 158 //__________________________________________________________________
 159 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
 160 {
 161   // Equal operator.
 162   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
 163   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
 164 //  fLineCol = NULL;
 165 //  fLineRow = NULL;
 166 //  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
 167 //    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
 168 //  }
 169   return *this;
 170 }
 171
 172 //____________________________________________________________________________
 173 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
 174 {
 175   //Detector specific actions at end of cycle
 176
 177 //  if(fCycleCounter)
 178 //        GetRawsData(kNEventsPerTower)->Scale(1./fCycleCounter);
 179
 180   // do the QA checking
 181   ResetEventTrigClasses(); // reset triggers list to select all histos
 182   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
 183 }
 184
 185 //____________________________________________________________________________
 186 void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
 187 {
 188   //Get the reference histogram from OCDB
 189   TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
 190   TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
 191   sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 192   sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ;
 193
 194   TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 195   if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
 196     AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ;
 197   } else {
 198     AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;
 199     AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
 200     if ( ! manQA->GetLock() ) {
 201       manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 202       manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
 203       manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ;
 204       manQA->SetLock() ;
 205     }
 206     char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ;
 207     AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
 208     if (entry) {
 209       TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
 210       if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
 211         AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ;
 212         listDetQAD = NULL ;
 213       }
 214       TObjArray * dirOCDB= NULL ;
 215       if ( listDetQAD )
 216         dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;
 217       if (dirOCDB){
 218         fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ;
 219         fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ;
 220       }
 221     }
 222   }
 223
 224   if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
 225
 226     //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 227     Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 228     Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 229     Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 230
 231     if(!fCalibRefHistoH2F)
 232       fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
 233     ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ;
 234   } else {
 235     AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ;
 236   }
 237 }
 238 //____________________________________________________________________________
 239 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
 240 {
 241   //Create histograms to controll ESD
 242   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 243   const Bool_t image    = kTRUE ;
 244
 245   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    200, 0., 100.) ;
 246   h1->Sumw2() ;
 247   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
 248
 249   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
 250   h2->Sumw2() ;
 251   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 252
 253   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [GeV];Counts",    500, 0., 50.) ;
 254   h3->Sumw2() ;
 255   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 256
 257   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 258   h4->Sumw2() ;
 259   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 260   //
 261   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kESDS); // this should be the last line
 262 }
 263
 264 //____________________________________________________________________________
 265 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 266 {
 267   // create Digits histograms in Digits subdir
 268   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 269   const Bool_t image    = kTRUE ;
 270
 271   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 272   h0->Sumw2() ;
 273   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 274   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 275   h1->Sumw2() ;
 276   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 277   //
 278   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kDIGITS); // this should be the last line
 279 }
 280
 281 //____________________________________________________________________________
 282 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 283 {
 284   // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
 285   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 286   const Bool_t image    = kTRUE ;
 287
 288   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [GeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 289   h0->Sumw2();
 290   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 291
 292   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 293   h1->Sumw2();
 294   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 295
 296   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 297   h2->Sumw2();
 298   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 299   //
 300   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRECPOINTS); // this should be the last line
 301 }
 302
 303 //____________________________________________________________________________
 304 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 305 {
 306   // create Raws histograms in Raws subdir
 307   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 308   const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 309   const Bool_t image    = kTRUE ;
 310   const Option_t *profileOption = "s";
 311
 312   Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 313   Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 314
 315   //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
 316   Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
 317   Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
 318   Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
 319
 320   Int_t nTRUCols = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUCols; //total TRU columns for 2D TRU histos
 321   Int_t nTRURows = nSMSectors*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRURows; //total TRU rows for 2D TRU histos
 322    // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 323   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 324                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 325   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 326   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 327                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 328   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 329
 330   // where did max sample occur? (bins are towers)
 331   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 332                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 333   Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 334   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 335                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 336   Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 337
 338   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 339   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 340                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 341   Add2RawsList(h4, kSigLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 342   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 343                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 344   Add2RawsList(h5, kSigHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 345
 346   // total counter: channels per event
 347   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 348   h6->Sumw2() ;
 349   Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 350   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 351   h7->Sumw2() ;
 352   Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 353
 354   // pedestal (bins are towers)
 355   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 356                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 357   Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
 358   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 359                                nTot, -0.5, nTot-0.5, profileOption) ;
 360   Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 361
 362
 363   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 364   Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 365
 366   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 367   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 368                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 369   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 370
 371   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 372   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 373                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5, profileOption) ;
 374   Add2RawsList(hT1, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 375
 376   // total counter: channels per event
 377   TH1I * hT2 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 378   hT2->Sumw2() ;
 379   Add2RawsList(hT2, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 380
 381   // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
 382   TH2I * hT3 = new TH2I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated",  nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5);
 383   hT3->SetOption("COLZ");
 384   //hT3->Sumw2();
 385   Add2RawsList(hT3, kNL0TRU, expert, image, !saveCorr);
 386
 387   // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
 388   TProfile2D * hT4 = new TProfile2D("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTRUCols, -0.5, nTRUCols - 0.5, nTRURows, -0.5, nTRURows-0.5, profileOption);
 389   hT4->SetOption("COLZ");
 390   Add2RawsList(hT4, kTimeL0TRU, expert, image, !saveCorr);
 391
 392   // L0 trigger hits: first in the event (bins are TRU channels)
 393   TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hitsFirst", "L0 trigger hits: First hit in the event", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
 394   hT5->Sumw2();
 395   Add2RawsList(hT5, kNL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
 396
 397   // L0 trigger hits: average time of first hit in the event (bins are TRU channels)
 398   TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsFirstAvgTime", "L0 trigger hits: average time of first hit", nTot2x2, -0.5, nTot2x2, profileOption);
 399   Add2RawsList(hT6, kTimeL0FirstTRU, expert, !image, !saveCorr);
 400
 401   // and also LED Mon..
 402   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 403   Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 404
 405   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 406   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 407                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 408   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 409   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 410                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5, profileOption) ;
 411   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 412
 413   // where did max sample occur? (bins are strips)
 414   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 415                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 416   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 417   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 418                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 419   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 420
 421   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 422   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 423                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 424   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 425   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 426                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 427   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 428
 429     // total counter: channels per event
 430   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 431   hL6->Sumw2() ;
 432   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 433   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 434   hL7->Sumw2() ;
 435   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 436
 437   // pedestal (bins are strips)
 438   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 439                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 440   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 441   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 442                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5, profileOption) ;
 443   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 444
 445   //temp 2D amplitude histogram for the current run
 446   fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 447    fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
 448   //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data
 449   TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5,
 450                         nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
 451   //settings for display in amore
 452   h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}");
 453   h15->SetMaximum(2.0);
 454   h15->SetMinimum(0.1);
 455   h15->SetOption("COLZ");
 456   gStyle->SetOptStat(0);
 457   Int_t color[] = {4,3,2} ;
 458   gStyle->SetPalette(3,color);
 459   h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
 460   h15->UseCurrentStyle();
 461   h15->SetDirectory(0);
 462   Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, expert, image, !saveCorr) ;
 463
 464   TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
 465   // h16->SetMinimum(0.1);
 466   // h16->SetMaximum(100.);
 467   gStyle->SetOptStat(0);
 468   h16->UseCurrentStyle();
 469   h16->SetDirectory(0);
 470   Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
 471
 472   //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
 473   //to be used for decision whether we need to change reference data
 474   TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 475   //settings for display in amore
 476   hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}");
 477   hL10->SetMaximum(2.0);
 478   hL10->SetMinimum(0.1);
 479   gStyle->SetOptStat(0);
 480   hL10->UseCurrentStyle();
 481   hL10->SetDirectory(0);
 482 //  hL10->SetOption("E");
 483   Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, expert, image, !saveCorr) ;
 484
 485   TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTotLEDMon, 0, 2);
 486   // hL11->SetMinimum(0.1) ;
 487   gStyle->SetOptStat(0);
 488   hL11->UseCurrentStyle();
 489   hL11->SetDirectory(0);
 490   Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, expert, image, !saveCorr) ;
 491
 492   GetCalibRefFromOCDB();
 493
 494
 495         //STU histgrams
 496
 497  //histos
 498  Int_t nSTUCols = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols;
 499  Int_t nSTURows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows;
 500 //              kAmpL1, kGL1, kJL1,
 501 //              kGL1V0, kJL1V0, kSTUTRU
 502
 503  TProfile2D *hS0 = new TProfile2D("hL1Amp", "Mean STU signal per Row and Column", nSTUCols, -0.5, nSTUCols-0.5, nSTURows, -0.5, nSTURows-0.5);
 504  Add2RawsList(hS0, kAmpL1, expert, !image, !saveCorr) ;
 505
 506  TH2F *hS1 = new TH2F("hL1Gamma", "L1 Gamma patch position (FastOR top-left)", nSTUCols, -0.50, nSTUCols-0.5, nSTURows + 5, -0.5, nSTURows-0.5 + 5); //+5 for better visible error box
 507  Add2RawsList(hS1, kGL1, !expert, image, !saveCorr) ;
 508
 509  TH2F *hS2 = new TH2F("hL1Jet", "L1 Jet patch position (FastOR top-left)", 12, -0.5, nSTUCols-0.5, 16, 0, nSTURows-0.5);
 510  Add2RawsList(hS2, kJL1, !expert, image, !saveCorr) ;
 511
 512  TH2I *hS3 = new TH2I("hL1GV0", "L1 Gamma patch amplitude versus V0 signal", 500, 0, 50000, 1500, 0, 1500);
 513  Add2RawsList(hS3, kGL1V0, expert, image, !saveCorr) ;
 514
 515  TH2I *hS4 = new TH2I("hL1JV0", "L1 Jet patch amplitude versus V0 signal", 500, 0, 50000, 1000, 0, 1000);
 516  Add2RawsList(hS4, kJL1V0, expert, !image, !saveCorr) ;
 517
 518  TH1I *hS5 = new TH1I("hFrameR","Link between TRU and STU", 32, 0, 32);
 519  Add2RawsList(hS5, kSTUTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 520
 521  hS0->SetOption("COLZ");
 522  hS1->SetOption("COLZ");
 523  hS2->SetOption("COLZ");
 524  hS3->SetOption("COLZ");
 525  hS4->SetOption("COLZ");
 526
 527   //
 528   ClonePerTrigClass(AliQAv1::kRAWS); // this should be the last line
 529 }
 530
 531 //____________________________________________________________________________
 532 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 533 {
 534   // make QA data from ESDs
 535
 536   Int_t nTot = 0 ;
 537   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 538     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 539     if( clu->IsEMCAL() ) {
 540       FillESDsData(kESDCaloClusE,clu->E()) ;
 541       nTot++ ;
 542     }
 543   }
 544   FillESDsData(kESDCaloClusM,nTot) ;
 545
 546   //fill calo cells
 547   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 548   FillESDsData(kESDCaloCellM,cells->GetNumberOfCells()) ;
 549
 550   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 551     FillESDsData(kESDCaloCellA,cells->GetAmplitude(index)) ;
 552   }
 553   //
 554   IncEvCountCycleESDs();
 555   IncEvCountTotalESDs();
 556 }
 557
 558 //____________________________________________________________________________
 559 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 560 {
 561   // Check that all the reference histograms exist before we try to use them - otherwise call InitRaws
 562   // RS: Attention: the counters are increments after custom modification of eventSpecie
 563   if (!fCalibRefHistoPro || !fCalibRefHistoH2F || !fLEDMonRefHistoPro || !fHighEmcHistoH2F) {
 564     InitRaws();
 565   }
 566
 567   // make sure EMCal was readout during the event
 568   Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
 569   const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern();
 570   UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
 571   if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
 572
 573   // setup
 574   rawReader->Reset() ;
 575   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 576   rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's
 577
 578   AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
 579   if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) {
 580     SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
 581   }
 582
 583   const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 584   const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 585   const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 586   const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 587   const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
 588   const Int_t nTot2x2      = fSuperModules * n2x2PerSM; // total TRU channel
 589
 590   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 591   Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 592   Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
 593   Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
 594   Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 595   Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 596
 597   const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
 598         int firstL0TimeBin = 999;
 599   int triggers[nTot2x2][24]; //auxiliary array for L0 trigger - TODO remove hardcoded 24
 600         memset(triggers, 0, sizeof(int) * 24 * nTot2x2);
 601
 602   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
 603   // start loop over input stream
 604   while (in.NextDDL()) {
 605     Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
 606     Int_t iDDL = in.GetDDLNumber();
 607     fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() );
 608
 609     while (in.NextChannel()) {
 610       Int_t iBranch = in.GetBranch();
 611
 612       iSM = in.GetModule(); // SuperModule
 613       //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber());
 614       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
 615
 616         Int_t nsamples = 0;
 617         vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist;
 618         while (in.NextBunch()) {
 619           nsamples += in.GetBunchLength();
 620           bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
 621         }
 622
 623         if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
 624           Float_t time = 0.;
 625           Float_t amp  = 0.;
 626           // indices for pedestal calc.
 627           Int_t firstPedSample = 0;
 628           Int_t lastPedSample  = 0;
 629           bool isTRUL0IdData   = false;
 630
 631           if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling
 632             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 633             amp  = fitResults.GetAmp();
 634             time = fitResults.GetTof();
 635             firstPedSample = fFirstPedestalSample;
 636             lastPedSample  = fLastPedestalSample;
 637           }
 638           else { // TRU data is special, needs its own analyzer
 639             AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2());
 640             amp  = fitResults.GetAmp();
 641             time = fitResults.GetTof();
 642             firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
 643             lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
 644             if (in.GetColumn() >= n2x2PerTRU) {
 645               isTRUL0IdData = true;
 646             }
 647           }
 648
 649           // pedestal samples
 650           Int_t nPed = 0;
 651           vector<Int_t> pedSamples;
 652
 653           // select earliest bunch
 654           unsigned int bunchIndex = 0;
 655           unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
 656           if (bunchlist.size() > 0) {
 657             for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
 658               if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
 659                 startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
 660                 bunchIndex = ui;
 661               }
 662             }
 663           }
 664
 665           // check bunch for entries in the pedestal sample range
 666           Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength();
 667           const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
 668           Int_t timebin = 0;
 669
 670           if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
 671             for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
 672               timebin = startBin--;
 673               if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
 674                 pedSamples.push_back( sig[i] );
 675                 nPed++;
 676               }
 677             } // i
 678           }
 679           else { // TRU L0 Id Data
 680             // which TRU the channel belongs to?
 681             Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
 682
 683             for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
 684               for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
 685                 // check if the bit j is 1
 686                 if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
 687                   Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
 688                   if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
 689                     Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
 690                     // Fill the histograms
 691                     Int_t globTRUCol, globTRURow;
 692                     GetTruChannelPosition(globTRURow, globTRUCol, iSM, iDDL, iBranch, iTRUIdInSM );
 693
 694                     FillRawsData(kNL0TRU, globTRUCol, globTRURow);
 695                     FillRawsData(kTimeL0TRU, globTRUCol, globTRURow, startBin);
 696                     triggers[iTRUAbsId][startBin] = 1;
 697
 698                     if((int)startBin < firstL0TimeBin) firstL0TimeBin = startBin;
 699                   }
 700                 }
 701               }
 702               startBin--;
 703             } // i
 704           } // TRU L0 Id data
 705
 706           // fill histograms
 707           if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 708             Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 709             if ( in.IsLowGain() ) {
 710               nTotalSMLG[iSM]++;
 711               if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) {
 712                 FillRawsData(kSigLG,towerId, amp);
 713                 FillRawsData(kTimeLG,towerId, time);
 714               }
 715               if (nPed > 0) {
 716                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 717                   FillRawsData(kPedLG,towerId, pedSamples[i]);
 718                 }
 719               }
 720             } // gain==0
 721             else if ( in.IsHighGain() ) {
 722               nTotalSMHG[iSM]++;
 723               if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) {
 724                 FillRawsData(kSigHG,towerId, amp);
 725                 FillRawsData(kTimeHG,towerId, time);
 726               }
 727               if (nPed > 0) {
 728                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 729                   FillRawsData(kPedHG,towerId, pedSamples[i]);
 730                 }
 731               }
 732             } // gain==1
 733           } // low or high gain
 734           // TRU
 735           else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
 736             // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
 737             Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
 738             Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU
 739               + in.GetColumn();
 740             nTotalSMTRU[iSM]++;
 741             if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) {
 742               FillRawsData(kSigTRU,iTRU2x2Id, amp);
 743               //FillRawsData(kTimeTRU,iTRU2x2Id, time);
 744             }
 745             //if (nPed > 0) {
 746               //for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 747                 //FillRawsData(kPedTRU,iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
 748               //}
 749             //}
 750           }
 751           // LED Mon
 752           else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 753             // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 754             // and the Strip number in the Column..
 755             Int_t gain = in.GetRow();
 756             Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 757
 758             if ( gain == 0 ) {
 759               nTotalSMLGLEDMon[iSM]++;
 760               if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) {
 761                 FillRawsData(kSigLGLEDMon,stripId, amp);
 762                 FillRawsData(kTimeLGLEDMon,stripId, time);
 763               }
 764               if (nPed > 0) {
 765                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 766                   FillRawsData(kPedLGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 767                 }
 768               }
 769             } // gain==0
 770             else if ( gain == 1 ) {
 771               nTotalSMHGLEDMon[iSM]++;
 772               if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) {
 773                 FillRawsData(kSigHGLEDMon,stripId, amp);
 774                 FillRawsData(kTimeHGLEDMon,stripId, time);
 775               }
 776               if (nPed > 0) {
 777                 for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
 778                   FillRawsData(kPedHGLEDMon,stripId, pedSamples[i]);
 779                 }
 780               }
 781             } // low or high gain
 782           } // LEDMon
 783
 784         } // SM index OK
 785
 786       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
 787     }// end while over channel
 788
 789   }//end while over DDL's, of input stream
 790   //filling some L0 trigger histos
 791   if( firstL0TimeBin < 999 ){
 792     for(Int_t i = 0; i < nTot2x2; i++) {
 793       if( triggers[i][firstL0TimeBin] > 0 ) {
 794         //histo->Fill(i,j);
 795         FillRawsData(kNL0FirstTRU, i);
 796         FillRawsData(kTimeL0FirstTRU, i, firstL0TimeBin);
 797       }
 798     }
 799   }
 800
 801   //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
 802   // RS: operation on the group of histos kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatio,kSigLGLEDMon
 803   const int hGrp[] = {kSigHG,k2DRatioAmp,kRatioDist,kLEDMonRatio,kLEDMonRatioDist,kSigLGLEDMon};
 804   if ( rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent &&
 805        CheckCloningConsistency(fRawsQAList, hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int)) ) {  // RS converting original code to loop over all matching triggers
 806     int nTrig =IsClonedPerTrigClass(kSigHG,fRawsQAList) ? GetNEventTrigClasses() : 0; // loop over triggers only if histos were cloned
 807     //
 808     for (int itr=-1;itr<nTrig;itr++) { // start from -1 to acknowledge original histos if they were kept
 809       TObjArray* trArr = GetMatchingRawsHistosSet(hGrp, sizeof(hGrp)/sizeof(int) ,itr);
 810       if (!trArr) continue;  // no histos for current trigger
 811       //
 812       Double_t binContent = 0.;
 813       TProfile* prSigHG      = (TProfile *)trArr->At(0); //kSigHG
 814       TH1* th2DRatioAmp      = (TH1*) trArr->At(1); //k2DRatioAmp
 815       TH1* thRatioDist       = (TH1*) trArr->At(2); //kRatioDist
 816       TH1* thLEDMonRatio     = (TH1*) trArr->At(3); //kLEDMonRatio
 817       TH1* thLEDMonRatioDist = (TH1*) trArr->At(4); //kLEDMonRatio
 818       TH1* hSigLGLEDMon      = (TH1*) trArr->At(5); //kSigLGLEDMon
 819       th2DRatioAmp->Reset("ICE");
 820       thRatioDist->Reset("ICE");
 821       thLEDMonRatio->Reset("ICE");
 822       thLEDMonRatioDist->Reset("ICE");
 823       th2DRatioAmp->ResetStats();
 824       thRatioDist->ResetStats();
 825       thLEDMonRatio->ResetStats();
 826       thLEDMonRatioDist->ResetStats();
 827       ConvertProfile2H(prSigHG, fHighEmcHistoH2F);
 828       //
 829       for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
 830         for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
 831           if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))
 832             binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy);
 833           th2DRatioAmp->SetBinContent(ix, iy, binContent);
 834           thRatioDist->Fill(binContent);
 835         }
 836       }
 837       //
 838       //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
 839       Double_t binError = 0. ;
 840       // for the binError, we add the relative errors, squared
 841       Double_t relativeErrorSqr = 0. ;
 842       //
 843       for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
 844         //
 845         if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) {
 846           binContent = hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
 847
 848           relativeErrorSqr = TMath::Power( (fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib)), 2);
 849           if( hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib) != 0) {
 850             relativeErrorSqr += TMath::Power( (hSigLGLEDMon->GetBinError(ib)/hSigLGLEDMon->GetBinContent(ib)), 2);
 851           }
 852         }
 853         else { // ref. run info is zero
 854           binContent = -1;
 855           relativeErrorSqr = 1;
 856         }
 857         thLEDMonRatio->SetBinContent(ib, binContent);
 858
 859         binError = sqrt(relativeErrorSqr) * binContent;
 860         thLEDMonRatio->SetBinError(ib, binError);
 861         thLEDMonRatioDist->Fill(thLEDMonRatio->GetBinContent(ib));
 862       }
 863     } // loop over eventual trigger clones
 864   }
 865   // let's also fill the SM and event counter histograms
 866   Int_t nTotalHG = 0;
 867   Int_t nTotalLG = 0;
 868   Int_t nTotalTRU = 0;
 869   Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
 870   Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
 871   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 872     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 873     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 874     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 875     nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 876     nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 877     FillRawsData(kNsmodLG,iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 878     FillRawsData(kNsmodHG,iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 879     FillRawsData(kNsmodTRU,iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 880     FillRawsData(kNsmodLGLEDMon,iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 881     FillRawsData(kNsmodHGLEDMon,iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 882   }
 883
 884   FillRawsData(kNtotLG,nTotalLG);
 885   FillRawsData(kNtotHG,nTotalHG);
 886   FillRawsData(kNtotTRU,nTotalTRU);
 887   FillRawsData(kNtotLGLEDMon,nTotalLGLEDMon);
 888   FillRawsData(kNtotHGLEDMon,nTotalHGLEDMon);
 889
 890   IncEvCountCycleESDs();
 891   IncEvCountTotalESDs();
 892   SetEventSpecie(saveSpecie) ;
 893
 894         MakeRawsSTU(rawReader);
 895
 896   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 897   rawReader->Reset() ;
 898   return;
 899 }
 900
 901 //____________________________________________________________________________
 902 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 903 {
 904   // makes data from Digits
 905   FillDigitsData(1,fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 906   TIter next(fDigitsArray) ;
 907   AliEMCALDigit * digit ;
 908   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 909     FillDigitsData(0, digit->GetAmplitude()) ;
 910   }
 911   //
 912 }
 913
 914 //____________________________________________________________________________
 915 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 916 {
 917   // makes data from Digit Tree
 918   // RS: Attention: the counters are increments in the MakeDigits()
 919   if (fDigitsArray)
 920     fDigitsArray->Clear("C") ;
 921   else
 922     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 923
 924   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 925   if ( ! branch ) { AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found"); return; }
 926   //
 927   branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 928   branch->GetEntry(0) ;
 929   MakeDigits() ;
 930   //
 931   IncEvCountCycleDigits();
 932   IncEvCountTotalDigits();
 933   //
 934 }
 935
 936 //____________________________________________________________________________
 937 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 938 {
 939   // makes data from RecPoints
 940   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 941   if (!emcbranch) {
 942     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 943     return;
 944   }
 945
 946   TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
 947   emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
 948   emcbranch->GetEntry(0);
 949
 950   FillRecPointsData(kRecPM,emcRecPoints->GetEntriesFast()) ;
 951   TIter next(emcRecPoints) ;
 952   AliEMCALRecPoint * rp ;
 953   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 954     FillRecPointsData(kRecPE,rp->GetEnergy()) ;
 955     FillRecPointsData(kRecPDigM,rp->GetMultiplicity());
 956   }
 957   emcRecPoints->Delete();
 958   delete emcRecPoints;
 959   IncEvCountCycleRecPoints();
 960   IncEvCountTotalRecPoints();
 961 }
 962
 963 //____________________________________________________________________________
 964 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 965 {
 966   //Detector specific actions at start of cycle
 967
 968 }
 969
 970 //____________________________________________________________________________
 971 void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)
 972 {
 973   //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
 974
 975   fFittingAlgorithm = fitAlgo; // Not sure we need this
 976
 977   fRawAnalyzer    =  AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(fitAlgo);
 978
 979   // Init also here the TRU algo, even if it is fixed type.
 980   fRawAnalyzerTRU = AliCaloRawAnalyzerFactory::CreateAnalyzer(Algo::kFakeAltro);
 981   fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE);
 982   fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
 983 }
 984
 985 //_____________________________________________________________________________________
 986 void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo)
 987 {
 988   // reset histogram
 989   histo->Reset("ICE") ;
 990   histo->ResetStats();
 991
 992   Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
 993
 994   // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo
 995   Int_t row = 0;
 996   Int_t col = 0;
 997   Double_t binContent = 0;
 998   Int_t towerNum = 0; // global tower Id
 999   //  i = 0; // tower Id within SuperModule
1000   Int_t iSM = 0; // SuperModule index
1001   Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
1002   Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
1003
1004   // indices for 2D plots
1005   Int_t col2d = 0;
1006   Int_t row2d = 0;
1007
1008   for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
1009     towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
1010     binContent = p->GetBinContent(ibin);
1011
1012     // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
1013     iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1014     col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
1015     row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
1016
1017     //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
1018     // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM
1019     // we are in
1020     iSMSector = iSM / 2;
1021     iSMSide = iSM % 2;
1022
1023     if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
1024       col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
1025     }
1026     else { // A side, shown to the left
1027       col2d = col;
1028     }
1029
1030     row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
1031
1032     histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
1033   }
1034 }
1035 //____________________________________________________________________________
1036 void AliEMCALQADataMakerRec::GetTruChannelPosition( Int_t &globRow, Int_t &globColumn, Int_t module, Int_t ddl, Int_t branch, Int_t column ) const
1037 { // from local to global indices
1038   Int_t mrow;
1039   Int_t mcol;
1040   Int_t trow;
1041   Int_t tcol;
1042   Int_t drow;
1043   Int_t rcu;
1044   // RCU 0 or 1
1045   rcu = ddl % 2;
1046
1047   // 12 rows of 2x2s in a module (3 TRUs by 4 rows)
1048   mrow = (module/2) * 12;
1049   // 24 columns per module, odd module numbers increased by 24
1050   mcol = (module%2) * 24;
1051
1052   // position within TRU coordinates
1053   tcol = column / 4;
1054   trow = column % 4;
1055
1056   //.combine
1057   if( module%2 == 0 ){   // A side
1058     // mirror rows
1059     trow = 3 - trow;
1060
1061     // TRU in module row addition
1062     drow = (rcu*branch+rcu) * 4;
1063
1064   }
1065   else{   // C side
1066     // mirror columns
1067     tcol = 23 - tcol;
1068
1069     // TRU in module row addition
1070     drow = (2 - (rcu*branch+rcu)) * 4;
1071   }
1072
1073   // output global row/collumn position (0,0 = SMA0, phi = 0, |eta| = max)
1074   globRow = mrow + drow + trow;
1075   globColumn = mcol + tcol;
1076   return;
1077
1078 }
1079 //____________________________________________________________________________
1080 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRawsSTU(AliRawReader* rawReader)
1081 { // STU specifics
1082   AliEMCALTriggerSTURawStream* inSTU = new AliEMCALTriggerSTURawStream(rawReader);
1083
1084   rawReader->Reset();
1085   rawReader->Select("EMCAL", 44);
1086
1087   //L1 segmentation
1088   Int_t sizeL1gsubr = 1;
1089   Int_t sizeL1gpatch = 2;
1090   Int_t sizeL1jsubr = 4;
1091
1092   Int_t iEMCALtrig[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols][AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows];
1093   memset(iEMCALtrig, 0, sizeof(int) * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTUCols * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALSTURows);
1094
1095   if (inSTU->ReadPayLoad())
1096     {
1097       //Fw version (use in case of change in L1 jet
1098       Int_t fw = inSTU->GetFwVersion();
1099       Int_t sizeL1jpatch = 2+(fw >> 16);
1100
1101       //To check link
1102       Int_t mask = inSTU->GetFrameReceived() ^ inSTU->GetRegionEnable();
1103
1104       for (int i = 0; i < 32; i++)
1105         {
1106                 if (!((mask >> i) &  0x1)) FillRawsData(kSTUTRU, i);
1107         }
1108
1109       //V0 signal in STU
1110       Int_t iV0Sig = inSTU->GetV0A()+inSTU->GetV0C();
1111
1112       //FastOR amplitude receive from TRU
1113       for (Int_t i = 0; i < 32; i++)
1114         {
1115           UInt_t adc[96];
1116           for (Int_t j = 0; j < 96; j++) adc[j] = 0;
1117
1118           inSTU->GetADC(i, adc);
1119
1120           Int_t iTRU = fGeom->GetTRUIndexFromSTUIndex(i);
1121
1122           for (Int_t j = 0; j < 96; j++)
1123             {
1124               Int_t idx;
1125               fGeom->GetAbsFastORIndexFromTRU(iTRU, j, idx);
1126
1127               Int_t px, py;
1128               fGeom->GetPositionInEMCALFromAbsFastORIndex(idx, px, py);
1129
1130               iEMCALtrig[px][py] = adc[j];
1131             }
1132         }
1133
1134       //L1 Gamma patches
1135       Int_t iTRUSTU, x, y;
1136       for (Int_t i = 0; i < inSTU->GetNL1GammaPatch(0); i++)
1137         {
1138           if (inSTU->GetL1GammaPatch(i, 0, iTRUSTU, x, y)) // col (0..23), row (0..3)
1139             {
1140               Int_t iTRU;
1141               iTRU = fGeom->GetTRUIndexFromSTUIndex(iTRUSTU);
1142
1143               Int_t etaG = 23-x, phiG = y + 4 * int(iTRU/2); //position in EMCal
1144               if (iTRU%2) etaG += 24; //C-side
1145
1146               etaG = etaG - sizeL1gsubr * sizeL1gpatch + 1;
1147
1148               //Position of patch L1G (bottom-left FastOR of the patch)
1149               FillRawsData(kGL1, etaG, phiG);
1150
1151               //loop to sum amplitude of FOR in the gamma patch
1152               Int_t iL1GPatchAmp = 0;
1153               for (Int_t L1Gx = 0; L1Gx < sizeL1gpatch; L1Gx ++)
1154                 {
1155                   for (Int_t L1Gy = 0; L1Gy < sizeL1gpatch; L1Gy ++)
1156                     {
1157                       if (etaG+L1Gx < 48 && phiG+L1Gy < 64) iL1GPatchAmp += iEMCALtrig[etaG+L1Gx][phiG+L1Gy];
1158                       //cout << iEMCALtrig[etaG+L1Gx][phiG+L1Gy] << endl;
1159                     }
1160                 }
1161
1162               //if (iL1GPatchAmp > 500) cout << "L1G amp =" << iL1GPatchAmp << endl;
1163               FillRawsData(kGL1V0, iV0Sig, iL1GPatchAmp);
1164
1165             }
1166         }
1167
1168       //L1 Jet patches
1169       for (Int_t i = 0; i < inSTU->GetNL1JetPatch(0); i++)
1170         {
1171           if (inSTU->GetL1JetPatch(i, 0, x, y)) // col (0,15), row (0,11)
1172             {
1173
1174               Int_t etaJ = sizeL1jsubr * (11-y-sizeL1jpatch + 1);
1175               Int_t phiJ = sizeL1jsubr * (15-x-sizeL1jpatch + 1);
1176
1177               //position of patch L1J (FOR bottom-left)
1178               FillRawsData(kJL1, etaJ, phiJ);
1179
1180               //loop the sum aplitude of FOR in the jet patch
1181               Int_t iL1JPatchAmp = 0;
1182               for (Int_t L1Jx = 0; L1Jx < sizeL1jpatch*4; L1Jx ++)
1183                 {
1184                   for (Int_t L1Jy = 0; L1Jy < sizeL1jpatch*4; L1Jy ++)
1185                     {
1186                       if (etaJ+L1Jx < 48 && phiJ+L1Jy < 64) iL1JPatchAmp += iEMCALtrig[etaJ+L1Jx][phiJ+L1Jy];
1187                     }
1188                 }
1189
1190               //cout << "L1J amp =" << iL1JPatchAmp << endl;
1191               FillRawsData(kJL1V0, iV0Sig, iL1JPatchAmp);
1192             }
1193         }
1194     }
1195
1196   //Fill FOR amplitude histo
1197   for (Int_t i = 0; i < 48; i++)
1198     {
1199       for (Int_t j = 0; j < 60; j++)
1200         {
1201           if (iEMCALtrig[i][j] != 0) FillRawsData(kAmpL1, i, j, iEMCALtrig[i][j]);
1202         }
1203     }
1204
1205   delete inSTU;
1206   return;
1207 }
1208
1209