EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15 /*
  16 Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
  17
  18 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
  19           S. Salur LBL April 2008
  20
  21 */
  22
  23 // --- ROOT system ---
  24 #include <TClonesArray.h>
  25 #include <TFile.h>
  26 #include <TH1F.h>
  27 #include <TH1I.h>
  28 #include <TH2F.h>
  29 #include <TProfile.h>
  30
  31 // --- Standard library ---
  32
  33
  34 // --- AliRoot header files ---
  35 #include "AliESDCaloCluster.h"
  36 #include "AliESDCaloCells.h"
  37 #include "AliESDEvent.h"
  38 #include "AliLog.h"
  39 #include "AliEMCALQADataMakerRec.h"
  40 #include "AliQAChecker.h"
  41 #include "AliEMCALDigit.h"
  42 #include "AliEMCALRecPoint.h"
  43 #include "AliEMCALRawUtils.h"
  44 #include "AliEMCALReconstructor.h"
  45 #include "AliEMCALRecParam.h"
  46 #include "AliRawReader.h"
  47 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
  48 #include "AliEMCALGeoParams.h"
  49
  50 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
  51
  52 //____________________________________________________________________________
  53   AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec() :
  54     AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
  55     fSuperModules(4) // FIXME!!! number of SuperModules; 4 for 2009; update default to 12 for later runs..
  56 {
  57   // ctor
  58 }
  59
  60 //____________________________________________________________________________
  61 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
  62   AliQADataMakerRec(), fSuperModules()
  63 {
  64   //copy ctor
  65   SetName((const char*)qadm.GetName()) ;
  66   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle());
  67   fSuperModules = qadm.GetSuperModules();
  68 }
  69
  70 //__________________________________________________________________
  71 AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQADataMakerRec& qadm )
  72 {
  73   // Equal operator.
  74   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
  75   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
  76   return *this;
  77 }
  78
  79 //____________________________________________________________________________
  80 void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjArray ** list)
  81 {
  82   //Detector specific actions at end of cycle
  83   // do the QA checking
  84   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;
  85 }
  86
  87 //____________________________________________________________________________
  88 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
  89 {
  90   //Create histograms to controll ESD
  91   const Bool_t expert   = kTRUE ;
  92   const Bool_t image    = kTRUE ;
  93
  94   TH1F * h1 = new TH1F("hESDCaloClusterE",  "ESDs CaloCluster energy in EMCAL;Energy [MeV];Counts",    200, 0., 20.) ;
  95   h1->Sumw2() ;
  96   Add2ESDsList(h1, kESDCaloClusE, !expert, image)  ;
  97
  98   TH1I * h2 = new TH1I("hESDCaloClusterM", "ESDs CaloCluster multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 100, 0,  100) ;
  99   h2->Sumw2() ;
 100   Add2ESDsList(h2, kESDCaloClusM, !expert, image)  ;
 101
 102   TH1F * h3 = new TH1F("hESDCaloCellA",  "ESDs CaloCell amplitude in EMCAL;Energy [MeV];Counts",    500, 0., 250.) ;
 103   h3->Sumw2() ;
 104   Add2ESDsList(h3, kESDCaloCellA, !expert, image)  ;
 105
 106   TH1I * h4 = new TH1I("hESDCaloCellM", "ESDs CaloCell multiplicity in EMCAL;# of Clusters;Entries", 200, 0,  1000) ;
 107   h4->Sumw2() ;
 108   Add2ESDsList(h4, kESDCaloCellM, !expert, image) ;
 109
 110 }
 111
 112 //____________________________________________________________________________
 113 void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 114 {
 115   // create Digits histograms in Digits subdir
 116   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 117   const Bool_t image    = kTRUE ;
 118
 119   TH1I * h0 = new TH1I("hEmcalDigits",    "Digits amplitude distribution in EMCAL;Amplitude [ADC counts];Counts",    500, 0, 500) ;
 120   h0->Sumw2() ;
 121   Add2DigitsList(h0, 0, !expert, image) ;
 122   TH1I * h1 = new TH1I("hEmcalDigitsMul", "Digits multiplicity distribution in EMCAL;# of Digits;Entries", 200, 0, 2000) ;
 123   h1->Sumw2() ;
 124   Add2DigitsList(h1, 1, !expert, image) ;
 125 }
 126
 127 //____________________________________________________________________________
 128 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 129 {
 130   // create Reconstructed Points histograms in RecPoints subdir
 131   const Bool_t expert   = kTRUE ;
 132   const Bool_t image    = kTRUE ;
 133
 134   TH1F* h0 = new TH1F("hEMCALRpE","EMCAL RecPoint energies;Energy [MeV];Counts",200, 0.,20.); //GeV
 135   h0->Sumw2();
 136   Add2RecPointsList(h0,kRecPE, !expert, image);
 137
 138   TH1I* h1 = new TH1I("hEMCALRpM","EMCAL RecPoint multiplicities;# of Clusters;Entries",100,0,100);
 139   h1->Sumw2();
 140   Add2RecPointsList(h1,kRecPM, !expert, image);
 141
 142   TH1I* h2 = new TH1I("hEMCALRpDigM","EMCAL RecPoint Digit Multiplicities;# of Digits;Entries",20,0,20);
 143   h2->Sumw2();
 144   Add2RecPointsList(h2,kRecPDigM, !expert, image);
 145
 146 }
 147
 148 //____________________________________________________________________________
 149 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
 150 {
 151   // create Raws histograms in Raws subdir
 152    const Bool_t expert   = kTRUE ;
 153    const Bool_t saveCorr = kTRUE ;
 154    const Bool_t image    = kTRUE ;
 155
 156   int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 157   int nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
 158
 159   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 160   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 161                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 162   Add2RawsList(h0, kNsmodLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 163   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
 164                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 165   Add2RawsList(h1, kNsmodHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 166
 167   // where did max sample occur? (bins are towers)
 168   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 169                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 170   Add2RawsList(h2, kTimeLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 171   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]",
 172                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 173   Add2RawsList(h3, kTimeHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 174
 175   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
 176   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 177                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 178   Add2RawsList(h4, kSigLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 179   TProfile * h5 = new TProfile("hHighEmcalRawMaxMinusMin", "High Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]",
 180                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 181   Add2RawsList(h5, kSigHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 182
 183   // total counter: channels per event
 184   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
 185   h6->Sumw2() ;
 186   Add2RawsList(h6, kNtotLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 187   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
 188   h7->Sumw2() ;
 189   Add2RawsList(h7, kNtotHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 190
 191   // pedestal (bins are towers)
 192   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 193                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 194   Add2RawsList(h8, kPedLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 195   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
 196                                nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 197   Add2RawsList(h9, kPedHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 198
 199   // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are towers)
 200   TProfile * h10 = new TProfile("hLowEmcalRawPedRMS", "Low Gain EMC: Pedestal RMS vs towerId;Tower Id;Width [ADC counts]",
 201                                 nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 202   Add2RawsList(h10, kPedRMSLG, !expert, image, !saveCorr) ;
 203   TProfile * h11 = new TProfile("hHighEmcalRawPedRMS", "High Gain EMC: Pedestal RMS vs towerId;Tower Id;Width [ADC counts]",
 204                                 nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
 205   Add2RawsList(h11, kPedRMSHG, !expert, image, !saveCorr) ;
 206
 207
 208   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
 209   int nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 210
 211   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 212   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
 213                                 fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 214   Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 215
 216   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
 217   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]",
 218                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 219   Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 220
 221   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
 222   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]",
 223                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 224   Add2RawsList(hT2, kSigTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 225
 226   // total counter: channels per event
 227   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
 228   hT3->Sumw2() ;
 229   Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 230
 231   // pedestal (bins are TRU channels)
 232   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]",
 233                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 234   Add2RawsList(hT4, kPedTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 235
 236   // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are TRU channels)
 237   TProfile * hT5 = new TProfile("hTRUEmcalRawPedRMS", "TRU EMC: Pedestal RMS vs 2x2Id;2x2 Id;Width [ADC counts]",
 238                                 nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
 239   Add2RawsList(hT5, kPedRMSTRU, !expert, image, !saveCorr) ;
 240
 241   // and also LED Mon..
 242   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
 243   int nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 244
 245   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
 246   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalSupermodules", "LowLEDMON Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 247                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 248   Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 249   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
 250                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
 251   Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 252
 253   // where did max sample occur? (bins are strips)
 254   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawtime", "LowLEDMON Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 255                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 256   Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 257   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]",
 258                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 259   Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 260
 261   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
 262   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMON Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 263                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 264   Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 265   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
 266                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 267   Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 268
 269   // total counter: channels per event
 270   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMONNtot", "LowLEDMON Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
 271   hL6->Sumw2() ;
 272   Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 273   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
 274   hL7->Sumw2() ;
 275   Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 276
 277   // pedestal (bins are strips)
 278   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawPed", "LowLEDMON Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 279                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 280   Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 281   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
 282                                nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 283   Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 284
 285   // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are strips)
 286   TProfile * hL10 = new TProfile("hLowLEDMONEmcalRawPedRMS", "LowLEDMON Gain EMC: Pedestal RMS vs stripId;Strip Id;Width [ADC counts]",
 287                                 nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 288   Add2RawsList(hL10, kPedRMSLGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 289   TProfile * hL11 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPedRMS", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal RMS vs stripId;Strip Id;Width [ADC counts]",
 290                                 nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
 291   Add2RawsList(hL11, kPedRMSHGLEDMon, !expert, image, !saveCorr) ;
 292
 293 }
 294
 295 //____________________________________________________________________________
 296 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 297 {
 298   // make QA data from ESDs
 299
 300   Int_t nTot = 0 ;
 301   for ( Int_t index = 0; index < esd->GetNumberOfCaloClusters() ; index++ ) {
 302     AliESDCaloCluster * clu = esd->GetCaloCluster(index) ;
 303     if( clu->IsEMCAL() ) {
 304       GetESDsData(kESDCaloClusE)->Fill(clu->E()) ;
 305       nTot++ ;
 306     }
 307   }
 308   GetESDsData(kESDCaloClusM)->Fill(nTot) ;
 309
 310   //fill calo cells
 311   AliESDCaloCells* cells = esd->GetEMCALCells();
 312   GetESDsData(kESDCaloCellM)->Fill(cells->GetNumberOfCells()) ;
 313
 314   for ( Int_t index = 0; index < cells->GetNumberOfCells() ; index++ ) {
 315     GetESDsData(kESDCaloCellA)->Fill(cells->GetAmplitude(index)) ;
 316   }
 317
 318 }
 319
 320 //____________________________________________________________________________
 321 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 322 {
 323   //Fill prepared histograms with Raw digit properties
 324
 325   //Raw histogram filling not yet implemented
 326   //
 327   //Need to figure out how to get the info we want without having to
 328   //actually run Raw2Digits twice.
 329   //I suspect what we actually want is a raw digits method, not a true
 330   //emcal raw data method, but this doesn't seem to be allowed in
 331   //AliQADataMakerRec.h
 332
 333   // For now, to avoid redoing the expensive signal fits we just
 334   // look at max vs min of the signal spextra, a la online usage in
 335   // AliCaloCalibPedestal
 336
 337   rawReader->Reset() ;
 338   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL");
 339
 340   // setup
 341   int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
 342   int nRows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
 343   int nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
 344   int n2x2PerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
 345
 346   int sampleMin = 0;
 347   int sampleMax = 0x3ff; // 1023 = 10-bit range
 348
 349   // for the pedestal calculation
 350   Bool_t selectPedestalSamples = kTRUE;
 351   int firstPedestalSample = 0;
 352   int lastPedestalSample = 15;
 353
 354   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
 355   int nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 356   int nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 357   int nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 358   int nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 359   int nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
 360
 361   // indices for the reading
 362   int iSM = 0;
 363   int sample = 0;
 364   int time = 0;
 365   // counters, on sample level
 366   int i = 0; // the sample number in current event.
 367   int maxTime = 0;
 368   int startBin = 0;
 369
 370   // calc. quantities
 371   double meanPed = 0, squaredMean = 0, rmsPed = 0;
 372
 373   // start loop over input stream
 374   while (in.NextDDL()) {
 375     while (in.NextChannel()) {
 376
 377       // counters
 378       int max = sampleMin, min = sampleMax; // min and max sample values
 379
 380       // for the pedestal calculation
 381       int sampleSum = 0; // sum of samples
 382       int squaredSampleSum = 0; // sum of samples squared
 383       int nSum = 0; // number of samples in sum
 384
 385       while (in.NextBunch()) {
 386         const UShort_t *sig = in.GetSignals();
 387         startBin = in.GetStartTimeBin();
 388         for (i = 0; i < in.GetBunchLength(); i++) {
 389           sample = sig[i];
 390           time = startBin--;
 391
 392           // check if it's a min or max value
 393           if (sample < min) min = sample;
 394           if (sample > max) {
 395             max = sample;
 396             maxTime = time;
 397           }
 398
 399           // should we add it for the pedestal calculation?
 400           if ( (firstPedestalSample<=time && time<=lastPedestalSample) || // sample time in range
 401                !selectPedestalSamples ) { // or we don't restrict the sample range.. - then we'll take all
 402             sampleSum += sample;
 403             squaredSampleSum += sample*sample;
 404             nSum++;
 405           }
 406
 407         } // loop over samples in bunch
 408       } // loop over bunches
 409
 410       // calculate pedesstal estimate: mean of possibly selected samples
 411       if (nSum > 0) {
 412         meanPed = sampleSum / (1.0 * nSum);
 413         squaredMean = squaredSampleSum / (1.0 * nSum);
 414         // The variance (rms squared) is equal to the mean of the squares minus the square of the mean..
 415         rmsPed = sqrt(squaredMean - meanPed*meanPed);
 416       }
 417       else {
 418         meanPed = 0;
 419         squaredMean = 0;
 420         rmsPed  = 0;
 421       }
 422
 423       // it should be enough to check the SuperModule info for each DDL really, but let's keep it here for now
 424       iSM = in.GetModule(); //The modules are numbered starting from 0
 425
 426       if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading, can go on with filling
 427
 428         if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
 429           int towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
 430
 431           if ( in.IsLowGain() ) {
 432             //fill the low gain histograms, and counters
 433             nTotalSMLG[iSM]++; // one more channel found
 434             GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, max - min);
 435             GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, maxTime);
 436             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 437               GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, meanPed);
 438               GetRawsData(kPedRMSLG)->Fill(towerId, rmsPed);
 439             }
 440           } // gain==0
 441           else if ( in.IsHighGain() ) {
 442             //fill the high gain ones
 443             nTotalSMHG[iSM]++; // one more channel found
 444             GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, max - min);
 445             GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, maxTime);
 446             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 447               GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, meanPed);
 448               GetRawsData(kPedRMSHG)->Fill(towerId, rmsPed);
 449             }
 450           }
 451         } // low or high gain
 452         // TRU
 453         else if ( in.IsTRUData() ) {
 454           // for TRU data, the mapping class holds the channel info in the Column..
 455           int TRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + in.GetColumn();
 456
 457           //fill the low gain histograms, and counters
 458           nTotalSMTRU[iSM]++; // one more channel found
 459           GetRawsData(kSigTRU)->Fill(TRU2x2Id, max - min);
 460           GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(TRU2x2Id, maxTime);
 461           if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 462             GetRawsData(kPedTRU)->Fill(TRU2x2Id, meanPed);
 463             GetRawsData(kPedRMSTRU)->Fill(TRU2x2Id, rmsPed);
 464           }
 465         }
 466         // LED Mon
 467         else if ( in.IsLEDMonData() ) {
 468           // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
 469           // and the Strip number in the Column..
 470           int gain = in.GetRow();
 471           int stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
 472
 473           if ( gain == 0 ) {
 474             //fill the low gain histograms, and counters
 475             nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; // one more channel found
 476             GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, max - min);
 477             GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, maxTime);
 478             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 479               GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, meanPed);
 480               GetRawsData(kPedRMSLGLEDMon)->Fill(stripId, rmsPed);
 481             }
 482           } // gain==0
 483           else if ( gain == 1 ) {
 484             //fill the high gain ones
 485             nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; // one more channel found
 486             GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, max - min);
 487             GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, maxTime);
 488             if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
 489               GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, meanPed);
 490               GetRawsData(kPedRMSHGLEDMon)->Fill(stripId, rmsPed);
 491             }
 492           } // low or high gain
 493         } // LEDMon
 494
 495       } // SM index OK
 496
 497     }// end while over channel
 498
 499   }//end while over DDL's, of input stream
 500
 501   // let's also fill the SM and event counter histograms
 502   int nTotalHG = 0;
 503   int nTotalLG = 0;
 504   int nTotalTRU = 0;
 505   int nTotalHGLEDMon = 0;
 506   int nTotalLGLEDMon = 0;
 507   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {
 508     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM];
 509     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM];
 510     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM];
 511     nTotalLG += nTotalSMLGLEDMon[iSM];
 512     nTotalHG += nTotalSMHGLEDMon[iSM];
 513     GetRawsData(kNsmodLG)->Fill(iSM, nTotalSMLG[iSM]);
 514     GetRawsData(kNsmodHG)->Fill(iSM, nTotalSMHG[iSM]);
 515     GetRawsData(kNsmodTRU)->Fill(iSM, nTotalSMTRU[iSM]);
 516     GetRawsData(kNsmodLGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]);
 517     GetRawsData(kNsmodHGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]);
 518   }
 519   GetRawsData(kNtotLG)->Fill(nTotalLG);
 520   GetRawsData(kNtotHG)->Fill(nTotalHG);
 521   GetRawsData(kNtotTRU)->Fill(nTotalTRU);
 522   GetRawsData(kNtotLGLEDMon)->Fill(nTotalLGLEDMon);
 523   GetRawsData(kNtotHGLEDMon)->Fill(nTotalHGLEDMon);
 524
 525   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
 526   rawReader->Reset() ;
 527
 528   return;
 529 }
 530
 531 //____________________________________________________________________________
 532 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
 533 {
 534   // makes data from Digits
 535
 536   GetDigitsData(1)->Fill(fDigitsArray->GetEntriesFast()) ;
 537   TIter next(fDigitsArray) ;
 538   AliEMCALDigit * digit ;
 539   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
 540     GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmp()) ;
 541   }
 542
 543 }
 544
 545 //____________________________________________________________________________
 546 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits(TTree * digitTree)
 547 {
 548   // makes data from Digit Tree
 549   if (fDigitsArray)
 550     fDigitsArray->Clear() ;
 551   else
 552     fDigitsArray = new TClonesArray("AliEMCALDigit", 1000) ;
 553
 554   TBranch * branch = digitTree->GetBranch("EMCAL") ;
 555   if ( ! branch ) {
 556     AliWarning("EMCAL branch in Digit Tree not found") ;
 557   } else {
 558     branch->SetAddress(&fDigitsArray) ;
 559     branch->GetEntry(0) ;
 560     MakeDigits() ;
 561   }
 562
 563 }
 564
 565 //____________________________________________________________________________
 566 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
 567 {
 568   // makes data from RecPoints
 569   TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("EMCALECARP");
 570   if (!emcbranch) {
 571     AliError("can't get the branch with the EMCAL clusters !");
 572     return;
 573   }
 574
 575   TObjArray * emcrecpoints = new TObjArray(100) ;
 576   emcbranch->SetAddress(&emcrecpoints);
 577   emcbranch->GetEntry(0);
 578
 579   GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcrecpoints->GetEntriesFast()) ;
 580   TIter next(emcrecpoints) ;
 581   AliEMCALRecPoint * rp ;
 582   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
 583     GetRecPointsData(kRecPE)->Fill( rp->GetEnergy()) ;
 584     GetRecPointsData(kRecPDigM)->Fill(rp->GetMultiplicity());
 585   }
 586   emcrecpoints->Delete();
 587   delete emcrecpoints;
 588
 589 }
 590
 591 //____________________________________________________________________________
 592 void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
 593 {
 594   //Detector specific actions at start of cycle
 595
 596 }
 597